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These datas are free for academic use only, please contact me for any other use. Schistosoma mansoni see consensus multiple alignment with clustalw Direct access to contigs :
consensusID : consensus_10083#0 NCBI blastX ! send the sequence to the NCBI site ! NCBI blastN ! send the sequence to the NCBI site ! Sequences nbr = 13 consensus length = 985 fasta sequence
[AATAGTTTTCAGTTATTTTCTCTAATATAACATATAAACATATGTACTTAGATATAAAAGTATAACAAACTTAAAAGGCTTGATTATCTCTCATTCGTTTTACGTGCTGGTTGATAAGTCTACCAAACTGTCAAACTAGTAATATATTAACTATAAATGAGTTCTTTCACTATCATCTGCGTTTTTGTCGTCAACATTGTTGTAAAAGGATTGGCCAGCAGTCTGCCTGAAGAATATGAAACTCAGGTGAAAAACTATCCAGATATTATACAATCTAAAGAAAAATGTCTGCCTCAACAAGGCAATTATGAATTTGCGAGTACACTCGTCTGTGATCCGGATGGCTTGTTATCTGTTGCACAAATTAACATGTTAAACACCAAACTGCATCACATCAGAACATCTGTTAACTTCGATAAACCTAGCTGTGATGTAAATAATCCACGACCAGTAATAGGAGT-GGCGATAGTTAAAAAGATAGAAGTTGATAATATGGACAAGGATCGACTATTAAGTTATGCTGC-AATATTC---TCATATCGTCTATTCGATAAATGGA---A-CCTACAATCTCATTGTCATTCTGAATCTGGTAAAATTATTCTGCTATACTCGAAAGATGATGGAGTGTTATATACAATCG-CTGGGAATCTGCTGAGACGAAAACTTACAACTAAACAAATCATAAACATTGCCATACGGTCTCGAGAACAATTTTCTACCAGTATAAGTGACGGCATTGCTTATATCATAGAGAGGTATAGGGAGGCAGTTGAATCGAGATCAGTGGATTTATTTGACAAAGCCAAATAACACAGAATCGCAAATTTTGATTTATTAAAGCTGCATGATTACGATATGTGCTATGTTTAATTTTATTTTTACGCAAGTCGTACTATTTCTCCATACTATTAGTTCACTTAAAACAACTTTATTCTATAGATAAATTTGTTGTAATCAATCCACTANNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNN]
[+] EMBL CD179362 [AATAGTTTTCAGTTATTTTCTCTAATATAACATATAAACATATGTACTTAGATATAAAAGTATAACAAACTTAAAAGGCTTGATTATCTCTCATTCGTTTTACGTGCTGGTTGATAAGTCTACCAAACTGTCAAACTAGTAATATATTAACTATAAATGAGTTCTTTCACTATCATCTGCGTTTTTGTCGTCAACATTGTTGTAAAAGGATTGGCCAGCAGTCTGCCTGAAGAATATGAAACTCAGGTGAAAAACTATCCAGATATTATACAATCTAAAGAAAA ]
[+] EMBL CD200987 [AATAGTTTTCAGTTATTTTCTCTAATATAACATATAAACATATGTACTTAGATATAAAAGTATAACAAACTTAAAAGGCTTGATTATCTCTCATTCGTTTTACGTGCTGGTTGATAAGTCTACCAAACTGTCAAACTAGTAATATATTAACTATAAATGAGTTCTTTCACTATCATCTGCGTTTTTGTCGTCAACATTGTTGTAAAAGGATTGGCCAGCAGTCTGCCTGAAGAATATGAAACTCAGGTGAAAAACTATCCAGATATTATACAATCTAAGGAAAAATGTCTGCCTCAACAAGGCAATTACGAATTTGCGAGTACACTCGTCTGTGATCCGGATGGCTTGTTATCTGTTGCACAAATTAACATGTTAAACACCAAACTGCATCACATCAGAACATCTGTTAA ]
[-] EMBL CD185768 [AATAGTTTTCAGTTATTTTCTCTAATATAACATATAAACATATGTACTTAGATATAAAAGTATAACAAACTTAAAAGGCTTGATTATCTCTCATTCGTTTTACGTGCTGGTTGATAAGTCTACCAAg ]
[+] EMBL CD202365 [ CTCATTCGTTTTACGTGCTGGTTGATAAGTCTACCAAACTGTCAAACTAGTAATATATTAACTATAAATGAGTTCTTTCACTATCATCTGCGTTTTTGTCGTCAACATTGTTGTAAAAGGATTGGCCAGCAGTCTGCCTGAAGAATATGAAACTCAGGTGAAAAACTATCCAGATATTATACAATCTAAAGAAAAATGTCTGCCTCAACAAGGCAATTATGAATTTGCGAGTACACTCGTCTGTGATCCGGACGGCTTGTTATCTGTTGCACAAATTAACATGTTAAACACCAAACTGCATCACATCAGAACATCTGTTAACTTCGATAAACCTAGCTGTGATGTAAATAATCCACGACCAGTAATAGGAGT GGCGATAGTTAAAAAGATAGAAGTTGATAATATGGACAAGGATCGACTATTAAGTTATGCTGC AATATTC TCATATCGTCTATTCGATAAATGGA A CCTACAATCTCATTGTCATTCTGAATCTGGTAAAATTATTCTGCTATACTCGAAAGATGATGGAGTGTTATATACAATCG CTGGGAATCTGCTGAGACGAANACTT ]
[+] EMBL CD078650 [ GTTTTACGTGCTGGTTGATAAGTCTACCAAACTGTCAAACTAGTAATATATTAACTATAAATGAGTTCTTTCACTATCATCTGCGTTTTTGTCGTCAACATTGTTGTAAAAGGATTGGCCAGCAGTCTGCCTGAAGAATATGAAACTCAGGTGAAAAACTATCCAGATATTATACAATCTAAAGAAAAATGTCTGCCTCAACAAGGCAATTATGAATTTGCGAGTACACTCGTCTGTGATCCGGATGGCTTGTTATCTGTTGCACAAATTAACATGTTAAACACCAAACTGCATCACATCAGAACATCTGTTAACTTCGATAAACCTAGCTGTGATGTAAATAATCCACGACCAGTAATAGGAGT GGCGATAGTTAAAAAGATAGAAGTTGATAATATGGACAAGGATCGACTATTAAGTTATGCTGC AATATTC TCATATCGTCTATTCGATAAATGGA A CCTACAATCTCATTGTCATTCTGAATCTGGTAAAATTATTCTGCTATACTCGAAAGATGATGGAGTGNTATATACAATCG CTGGGAATCTGCTGAGACGAAn ]
[+] EMBL AI976022 [ ATTGTTGTAAAAGGATTGGCCAGCAGTCTGCCTGAAGAATATGAAACTCAGGTGAAAAACTATCCAGATATTATACAATCTAAAGAAAAATGTCTGCCTCAACAAGGCAATTATGAATTTGCGAGTACACTCGTCTGTGATCCGGATGGCTTGTTATCTGTTGCACAAATTAACATGTTAAACACCAAACTGCATCACATCAGAACATCTGTTAACTTCGATAAACCTAGCTGTGATGTAAATAATCCACGACCAGTAATAGGAGT GGCGATAGTTAAAAAGATAGAAGTTGATAATATGGACAAGGATCGACTATTAAGTTATGCTGC AATATTC TCATATCGTCTATTCGATAAATGGA A CCTACAATCTCATTGTCATTCTGAATCTGGTAAAATTATTCTGCTATACTCGAAAGATGATGGAGTGTTATATACAATCGNCT GGAATCTGCTGAGACGAAAACTTACAACTAAACAAATCATAAACATTGCCATACGGTCTCGAGAACAATTTTCTACCAGTATAAGTGACGGCATT ]
[+] EMBL SMAA8308 [ GGTGAAAAACTATCCAGATATTATACAATCTAAAGAAAAATGTCTGCCTCAACAAGGCAATTATGAATTTGCGAGTACACTCGTCTGTGATCCGGATGGCTTGTTATCTGTTGCACAAATTAACATGTTAAACACCAAACTGCATCACATCAGAACATCTGTTAACTTCGATAAACCTAGCTGTGATGTAAATAATCCACGACCAGTAATAGGAGTGGGCGATATTTAAAAAa ]
[+] EMBL CD086265 [ AACTATCCAGATATTATACAATCTAAAGAAAAATGTCTGCCTCAACAAGGCAATTATGAATTTGCGAGTACACTCGTCTGTGATCCGGATGGCTTGTTATCTGGCGCACAAATTAACATGTTAAACACCAAACTGCATCACATCAGAACATCTGTTAACTTCGATAAACCTAGCTGTGATGTAAATAATCCACGACCAGTAATAGGAGT GGCGATAGTTAAAAAGATAGAAGTTGATAATATGGACAAGGATCGACTATTAAGTTATGCTGC AATATTC TCATATCGTCTATTCGATAAATGGA A CCTACAATCTCATTGTCATTCTGAATCTGGTAAAATTATTCTGCTATACTCGAAAGATGATGGAGTGTT ]
[+] EMBL CD135119 [ TAGCTGTGATGTAAATAATCCACGACCAGTAATAGGAGT GGCGATAGTTAAAAAGATAGAAGTTGATAATATGGACAAGGATCG CT TTAGGTT TCCCCCGCATTTTCTATTCATATCGTCTATTCGATAAATGGAGCTACCCTACAATCTCATTGTCATTCTGAATCTGGTAAAATTATTCTGCTATACTCGAAAGATGATGGAGTGTTATATACAATCG CTGGGAATCTGCTGAGACGAAAACTTACAACTAA ]
[-] EMBL CD077119 [ AATAGGAGT GGCGATAGTTANAAAGATAGAAGTTGATAATATGGACAAGGATCGACTATTAAGTTATGCTGC AATATTC TCATATCGTCTATTCGATAAATGGA A CCTACAATCTCATTGTCATTCTGAATCTGGTAAAATTATTCTGCTATACTCGAAAGATGATGGAGTGTTATATACAATCG CTGGGAATCTGCTGAGACGAAAACTTACAACTAAACAAATCATAAACATTGCCATACGGTCTCGAGAACAATTTTCTACCAGTATAAGTGACGGCATTGCTTATATCATAGAGAGGTATAGGGAGGCAGTTGAATCGAGATCAGTGGATTTATTTGACAAAGCCAAATAACACAGAATCGCAAATTTTGATTTATTAAAGCTGCATGATTACGATATGTGCTATGTTTAATTTTATTTTTACGCAAGTCGTACTATTTCTCCATACTATTAGTTCACTTAAAACAACTTTATTCTATAGATAAATTTGTTGTAAT ]
[-] EMBL CD073114 [ TGATAATATGGACAAGGATCGACTATTAAGTTATGCTGC AATATTC TCATATCGTCTATTCGATAAATGGA A CCTACAATCTCATTGTCATTCTGAATCTGGTAAAATTATTCTGCTATACTCGAAAGATGATGGAGTGTTATATACAATCG CTGGGAATCTGCTGAGACGAAAACTTACAACTAAACAAATCATAAACATTGCCATACGGTCTCGAGAACAATTTTCTACCAGTATAAGTGACGGCATTGCTTATATCATAGAGAGGTATAGGGAGGCAGTTGAATCGAGATCAGTGGATTTATTTGACAAAGCCAAATAACACAGAATCGCAAATTTTGATTTATTAAAGCTGCATGATTACGATATGTGCTATGTTTAATTTTATTTTTACGCAAGTCGTACTATTTCTCCATACTATTAGTTCACTTAAAACAACTTTATTCTATAGATAAATTT ]
[-] EMBL AI394807 [ CTCATTGTCATTCTGAATCTGGTAAAATTATTCTGCTATACTCGAAAGATGATGGAGTGTTATATACAATCG CTGGGAATCTGCTGAGACGAAAACTTACAACTAAACAAATCATAAACATTGCCATACGGTCTCGAGAACAATTTTCTACCAGTATAAGTGACGGCATTGCTTATATCATAGAGAGGTATAGGGAGGCAGTTGAATCGAGATCAGTGGATTTATTTGACAAAGCCAAATAACACAGAATCGCAAATTTTGATTTATTAAAGCTGCATGATTACGATATGTGCTATGTTTAATTTTATTTTTACGCAAGTCGTACTATTTCTCCATACTATTAGTTCACTTAAAACAACTTTATTCTATAGATAAATTTGTTGTAATCAATCCACTANNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNN]
[+] EMBL BG932179 [ gcgCGAGATCAGTGGATTTATTTGACAAAGCCAAATAACACACAATCGCAAATTTTGATTTATTAAAGCTGCATGATTACGATATGTGCTATGTTTAATTTTATTTTTACG ]
clustalw multiple alignements is not computed in this case |
| Copyright Thu Nov 6 12:32:27 CET 2003 Hubert Wassner (hubert.wassner@noos.fr) | ||||