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Schistosoma mansoni
cluster # 10091 cluster # 10091       Sequences # 13       consensus # 1


see consensus multiple alignment with clustalw

Direct access to contigs :
consensus_10091#0 length = 681 sequences # 13  

consensusID : consensus_10091#0
NCBI blastX ! send the sequence to the NCBI site !
NCBI blastN ! send the sequence to the NCBI site !
Sequences nbr = 13
consensus length = 681
fasta sequence
                              [GGTAATACCAGCTTCCGAAATACAGTATATGGCATACCATGTCCCATACCCTTTTCACCAAGATCCCAACTTCTTCTACTTCACA-GGGTTGAATGAACCAAATGGAATTCTGTTATTTTGCACAGATAAAACAGAAGAACGTGACGATCAAAGTGACCTTAACTGGTCGACCCATCTTTTCGTGGAGACTCGGAACAAACATGCTGAGATCTGGAATGGTCCATCCTTGACGTTATCAGAAGCTTCTTTGGCAACTGGGGTTGATAATTCCCATCCTTTGAGTGAA-TTTAGTAAATTTTTGGACCATCAAGCTTTATCTACACAATCCATATGTGTTTGGTATAGTCCATTATCATCC-AAAAATTTTGTTGAGCGCCCCTTGAATAAGTTTGTTTTGAAAA-AGATTGTAGAATTCTCCCGGCAAATTAACGAC-AAAAGAATTAG-TTTTGAAAATCCAGACTACTTAATCGACAGCATTCGCCT--TATAAAATCAAATTATGAAATCAAACAACTTAAAACTTCGGTTATTGCAGCGGTTGAGTCTCTTAAGTCGGCTATGCAAATTACACAACCAGGAATAACTGAAACTGCTTTACAAAGTTACATAGAATACCAAATGCGCAGCCGAGGCTGCTCTGTTGGGTATCCACCTGTTGTCGCTGGTGGGGACAGAACAAACAT]

[+] EMBL CD137091             [GGTAATACCAGCTTCCGAAATACAGTATATGGCATACCATGTCCCATACCCTTTTCACCAAGATCCCAACTTCTTCTACTTCACA GGGTTGAATGAACCAAATGGAATTCTGTTATTTTGCACAGATAAAACAGAAGAACGTGACGATCAAAGTGACCTTAACTGGTCGACCCATCTTTTCGTGGAGACTCGGAACAAACATGCTGAGATCTGGAATGGTCCATCCTTGACGTTATCAGAAGCTTCTTTGGCAACTGGGGTTGATAATTCCCATCCTTTGAGTGAA TTTAGTAAATTTTTGGACCATCAAGCTTTATCTACACAATCCATATGTGTTTGGTATAGTCCATTATCATCC AAAAATTTTGTTGAGCGCCCCTTGAATAAGTTTGTTTTGAAAA AGATTGTAGAATTCTCCCGGCAAATTAACGAC AAAAGAATTAG TTTTGAAAATCCAGACTACTTAATCGACAGCATTCGCCT  TATAAAATCAAATTATGAAATCAAACAACTTANAACTTCGGTTATTGCAGCGGTTGAGTCTCTTAAGTCGGCTATGCAAATTACACAACCAGGAATAACTGAAACTGCTTTACAAAGTTACATAGAATACC                                                                   ]
[+] EMBL CD136648             [GGTAATACCAGCTTCCGAAATACAGTATATGGCATACCATGTCCCATACCCTTTTCACCAAGATCCCAACTTCTTCTACTTCACA GGGTTGAATGAACCAAATGGAATTCTGTTATTTTGCACAGATAAAACAGAAGAACGTGACGATCAAAGTGACCTTAACTGGTCGACCCATCTTTTCGTGGAGACTCGGAACAAACATGCTGAGATCTGGAATGGTCCATCCTTGACGTTATCAGAAGCTTCTTTGGCAACTGGGGTTGATAATTCCCATCCTTTGAGTGAA TTTAGTAAATTTTTGGACCATCAAGCTTTATCTACACAATCCATATGTGTTTGGTATAGTCCATTATCATCC AAAAATTTTGTTGAGCGCCCCTTGAATAAGTTTGTTTTGAAAA AGATTGTAGAATTCTCCCGGCAAATTAACGAC AAAAGAATTAG TTTTGAAAATCCAGACTACTTAATCGACAGCATTCGCCT  TATAAAATCAAATTATGAAATCAAACAACTTANAACTTNCGTTATTGCAGCGGTTGAGTCTCT                                                                                                                                       ]
[+] EMBL CD120269             [GGTAATACCTGCTTCCGAAATACAGTATATGGCATACCATGTCCCATACCCTTTTCACCAAGATCCCAACTTCTTCTACTTCACA GGGTTGAATGAACCAAATGGAATTCTGTTATTTTGCACAGATAAAACAGAAGAACGTGACGATCAAAGTGACCTTAACTGGTCGACCCATCTTTTCGTGGAGACTCGGAACAAACATGCTGAGATCTGGAATGGTCCATCCTTGACGTTATCAGAAGCTTCTTTGGCAACTGGGGTTGATAATTCCCATCCTTTGAGTGAA TTTAGNTAATTTTTGGACCATCAAGCTTTATCTACACAATCCATATGTGTTTGGTATAGTCCATTATCATCC AAAAATTNTGTTGAGCGCCCCTTGAATAAAGTTGNTTTGAAAANNGA TGTAGAATTCTCCCGGNCAATTAACGAC NAAAGAATTAGTTTTTGAAAATCAAGACTACTTAATCGACAGCATTCGCCT  TA                                                                                                                                                                                                    ]
[+] EMBL CD120294             [GGAAATACCAGCTTCCGAAATACAGTATATGGCATACCATGTCCCATACCCTTTTCACCAAGATCCCAACTTCTTCTACTTCACA GGGTTGAATGAACCAAATGGAATTCTGTTATTTTGCACAGATAAAACAGAAGAACGTGACGATCAAAGTGACCTTAACTGGTCGACCCATCTTTTCGTGG                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                       ]
[+] EMBL CD120461             [GGTAATACCAGCTTCCGAAATACAGTATATGGCATACCATGTCCCATACCCTTTTCACCAAGATCCCAACTTCTTCTAATTCACA GGGTTGAA GAACCAAATGGAATTCTGTTATTTTGCACAGATAAAACAGAAGAACGTGACGATCAAAGGGACCTTAACTGGTCGACCCATCTTTTCGTGGAGACTCGGAACAAACATGCTGAGATCTGGAATGGTCCATCCTTGACGTTATCAGAAGCTTCTTTGGCAACTGGGGTTGATAATTCCCATCCTTTGAGTGAA TTTAGTAAATTTTTGGACCATCAAGCTTTATCTACACAATCCATATGTGTTTGGTATAGTCCATTATCATCC AAAAATTTTGTTGAGCGCCCCTTGAATAAGTTTGTTTTGAAAA AGATTGTAGAATTCTCCCGGCAAATTAACGAN CAAAGAATTAG TTTTGAAAATCCAGACTACTTAATCGACAGCATTCGCCT  TAT AAATCAAATTAT                                                                                                                                                                                      ]
[+] EMBL CD120347             [GGTAATACCAGCTTCCGAAATACAGTATATGGCATACCATGTCCCATACCCTTTTCACCAAGATCCCAACTTCTTCTACTTCACA GGGTTGAATGAACCAAATGGAATTCTGTTATTTTGCACAGATAAAACAGAAGAACGTGACGATCAAAGTGACCTTAACTGGTCGACCCATCTTTTCGTGGAGACTCGGAACAAACATGCTGAGATCTGGAATGGTCCATCCTTGACGTTATCAGAAGCTTCTTTGGCAACTGGGGTTGATAATTCCCATCCTTTGAGTGAA TTTAGTAAATTTTTGGACCATCAAGCTTTATCTACACAATCCATATGTGTTTGGTATAGTCCATTATCATCCAAAAAATTTTGTTGAGCGCCCCTTGAATAAGTTTGTTTTGAAAA AGATTGTAGAATTCTCCCGGCAAATT ACGAC AAAAGAATTAG NTTTGAAAATCCAGACTACTTAATCGACAGCATTCGCTTNNNATAAA                                                                                                                                                                                                ]
[+] EMBL CD120417             [GGTAATACCAGCTTCCGAAATACAGTATATGGCATACCATGTCCCATACCCTTTTCACCAAGATCCCAACTTCTTCTACTTCACA GGGTTGAATGAACCAAATGGAATTCTGTTATTTTGCACAGATAAAACAGAAGAACGTGACGATCAAAGTGACCTTAACTGGTCGACCCATCTTTTCGTGGAGACTCGGAACAAACATGCTGAGATCTGGAATGGTCCATCCTTGACGTTATCAGAAGCTTCTTTGGCAACTGGGGTTGATAATTCCCATCCTTTGAGTGAA TTTAGTAAATTTTTGGACCATCAAGCTTTATCTACACAATCCATATGTGTTTGGTATAGTCCATTATCATCC AAAAATTTTGTTGAGCGCCCCTTGAATAAGTTTGTTTTGAAAA AGATTGTAGAATTCTCCCGGCAAATTAACGACNAAAAGAATTAG TTTTGAAAATCCAGACTACTTAATCGACAGCATTCGCCT  TAT                                                                                                                                                                                                   ]
[-] EMBL CD137313             [ GTAATACCAGCTTCCGAAATACAGTATATGGCATACCATGTCCCATACCCTTTTCACCAAGATCCCAACTTCTTCTACTTCACA GGGTTGAATGAACCAAATGGAATTCTGTTATTTTGCACAGATAAAACAGAAGAACGTGACGATCAAAGTGACCTTAACTGGTCGACCCATCTTTTCGTGGAGACTCGGAACAAACATGCTGAGATCTGGAATGGTCCATCCTTGACGTTATCAGAAGCTTCTTTGGCAACTGGGGTTGATAATTCCCATCCTTTGAGTGAA TTTAGTAAATTTTTGGACCATCAAGCTTTATCTACACAATCCATATGTGTTTGGTATAGTCCATTATCATCC AAAAATTTTGTTGAGCGCCCCTTGAATAAGTTTGTTTTGAAAA AGATTGTAGAATTCTCCCGGCAAATTAACGAC GAAAGAATTAG TTTTGAAAATCCAGACTACTTAATCGACAGCATTCGCCT  TATAAAATCAAATTATGAAATCAAACAACTTAAAACTTCGGTTATTGCAGCGGT                                                                                                                                                ]
[-] EMBL CD137043             [ GTAATACCAGCTTCCGAAATACAGTATATGGCATACCATGTCCCATACCCTTTTCACCAAGATCCCAACTTCTTCTACTTCACAGGGGTTGAATGAACCAAATGGAATTCTGTTATTTTGCACAGATAAAACAGAAGAACGTGACGATCAAAGTGACCTTAACTGGTCGACCCATCTTTTCGTGGAGACTCGGAACAAACATGCTGAGATCTGGAATGGTCCATCCTTGACGTTATCAGAAGCTTCTTTGGCAACTGGGGTTGATAATTCCCATCCTTTGAGTGAA TTTAGTAAATTTTTGGACCATCAAGCCTTATCTGCACAATCCATATGTGTTTGGTATAGTCCATTATCATCC AAAAATTTTGTTGAGCGCCCCTTGAATAAGTTTGTTTTGAAAA AGATTGTAGAATTCTCCCGGCAAATTAACGAC AAAAGAATTAG TTTTGAAAATCCAGATTACTTAATCGACAGCATTCGCCT  TATAAAGTCAAATTATGAAggg                                                                                                                                                                                ]
[-] EMBL CD137261             [ GTAATACCAGCTTCCGAAATACAGTATATGGCATACCATGTCCCATACCCTTTTCACCAAGATCCCAACTTCTTCTACTTCACA GGGTTGAATGAACCAAATGGAATTCTGTTATTTTGCACAGATAAAACAGAAGAACGTGACGATCAAAGTGACCTTAACTGGTCGACCCATCTTTTCGTGGAGACTCGGAACAAACATGCTGAGATCTGGAATGGTCCATCCTTGACGTTATCAGAAGCTTCTTTGGCAACTGGGGTTGATAATTCCCATCCTTTGAGTGAA TTTAGTAAATTTTTGGACCATCAAGCTTTATCTACACAATCCATATGTGTTTGGTATAGTCCATTATCATCC AAAAATTTTGTTGAGCGCCCCTTGAATAAGTTTGTTTTGAAAA AGATTGTAGAATTCTCCCGGCAAATTAACGAC AAAAGAATTAG TTTTGAAAATCCAGACTACTTAATCGACAGCATTCGCCT  TATA                                                                                                                                                                                                  ]
[-] EMBL CD120280             [                                                                                    A GGGTTGAATGAACCAAATGGAATTCTGTTATTTTGCACAGATAAAACAGAAGAACGTGACGATCAAAGTGACCTTAACTGGTCGACCCATCTTTTCGTGGAGACTCGGAACAAACATGCTGAGATCTGGAATGGTCCATCCTTGACGTTATCAGAAGCTTCTTTGGCAACTGGGGTTGATAATTCCCATCCTTTGAGTGAA TTTAGTAAATTTTTGGACCATCAAGCTTTATCTACACAATCCATATGTGTTTGGTATAGTCCATTATCATCC AAAAATTTTGTTGAGCGCCCCTTGAATAAGTTTGTTTTGAAAA AGATTGTAGAATTCTCCCGGCAAATTAACGAC AAAAGAATTAG TTTTGAAAATCCAGACTACTTAATCGACAGCATTCGCCT  TATA                                                                                                                                                                                                  ]
[+] EMBL CD067335             [                                                                                                              CTGTTATTTTGCACAGATAAAACAGAAGAACGTGACGATCAAAGTGACCTTAACTGGTCGACCCATCTTTTCGTGGAGACTCGGAACAAACATGCTGAGATCTGGAATGGTCCATCCTTGACGTTATCAGAAGCTTCTTTGGCAACTGGGGTTGATAATTCCCATCCTTTGAGTGAA TTTAGTAAATTTTTGGACCATCAAGCTTTATCTACACAATCCATATGTGTTTGGTATAGTCCATTATCATCC AAAAATTTTGTTGAGCGCCCCTTGAATAAGTTTGTTTTGAAAA AGATTGTAGAATTCTCCCGGCAAATTAACGAC AAAAGAATTAG TTTTGAAAATCCAGACTACTTAATCGACAGCATTCGCCT  TATAAAATCAAATTATGGAATCAAACAACTTAAAACTTCGGTTATTGCAGCTGTTGAGTCTCTTAAGTCGGCTATGCAAATTACACA                                                                                                               ]
[-] EMBL CD120028             [                                                                                                                                                                                                                                                                      TGATAATTCCCATCC TTGAGTGAATTTTAGTAAATTTTTGGACCATCAAGCTTTATCTACACAATCCATATGTGTTTGGTATAGTCCATTATCATCC AAAAATTTTGTTGAGCGCCCCTTGAATAAGTTTGTTTTGAAAA AGATTGTAGAATTCTCCCGGCAAATTAACGAC AAAAGAATTAG TTTTGAAAATCCAGACTACTTAATCGACAGCATTCGCCT  TATAAAATCAAATTATGAAATCAAACAACTTAAAACTTCGGTTATTGCAGCTGTTGAGTCTCTTAAGTCGGCTATGCAAATTACACAACCAGGAATAACTGAAACTGCTTTACAAAGTTACATAGAATACCAAATGCGCAGCCGAGGCTGCTCTGTTGGGTATCCACCTGTTGTCGCTGGTGGGGACAGAACAAACAT]


>consensus_10091#0 GGTAATACCAGCTTCCGAAATACAGTATATGGCATACCATGTCCCATACCCTTTTCACCA AGATCCCAACTTCTTCTACTTCACAGGGTTGAATGAACCAAATGGAATTCTGTTATTTTG CACAGATAAAACAGAAGAACGTGACGATCAAAGTGACCTTAACTGGTCGACCCATCTTTT CGTGGAGACTCGGAACAAACATGCTGAGATCTGGAATGGTCCATCCTTGACGTTATCAGA AGCTTCTTTGGCAACTGGGGTTGATAATTCCCATCCTTTGAGTGAATTTAGTAAATTTTT GGACCATCAAGCTTTATCTACACAATCCATATGTGTTTGGTATAGTCCATTATCATCCAA AAATTTTGTTGAGCGCCCCTTGAATAAGTTTGTTTTGAAAAAGATTGTAGAATTCTCCCG GCAAATTAACGACAAAAGAATTAGTTTTGAAAATCCAGACTACTTAATCGACAGCATTCG CCTTATAAAATCAAATTATGAAATCAAACAACTTAAAACTTCGGTTATTGCAGCGGTTGA GTCTCTTAAGTCGGCTATGCAAATTACACAACCAGGAATAACTGAAACTGCTTTACAAAG TTACATAGAATACCAAATGCGCAGCCGAGGCTGCTCTGTTGGGTATCCACCTGTTGTCGC TGGTGGGGACAGAACAAACAT



clustalw multiple alignements is not computed in this case


Copyright Thu Nov 6 12:32:27 CET 2003 Hubert Wassner    (hubert.wassner@noos.fr)