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Schistosoma mansoni
cluster # 10097 cluster # 10097       Sequences # 13       consensus # 1


see consensus multiple alignment with clustalw

Direct access to contigs :
consensus_10097#0 length = 1281 sequences # 13  

consensusID : consensus_10097#0
NCBI blastX ! send the sequence to the NCBI site !
NCBI blastN ! send the sequence to the NCBI site !
Sequences nbr = 13
consensus length = 1281
fasta sequence
                              [CATTGAAAATTCCACGTTTCATTTTAAAAAGTATTCATTCTATATCATCAGATGGTGAAATAATTCCTAATAGTCATTGGCATGAAGATGTTGAAAATCATGTTGTTTATTTTATGCAATGTTGTCGTGAAGATAAAACTTTACTGTTACGTGTACCACCATCAAAAGATGGTTTTTATTTAGCTAGTAGTTCTGGTCTATGTTCTAGTGTACCAGGGACTGTATTGGATAGAGAGAAAATTACTACCTATCTTACATCACCATTACATAGTAATAGTAATGCTATGAATAATAATCGTAAATCAACTGTATTAAGTGAAAAAGATATGTTATTATATCGTGAAACACTTGCTCAACGTGAAGGTCTTCTCTATTTATGCTATTATCATCCAGCTAAAGGAATTGATTATACTACATCAATACTTGGTACACGTTATTCTATAAGTCAAAATATTTCAGAAAAAGATATTGATGAAATAGCTAGACTATGTGGTTGTGCACCGAATGCATTTTGTTTATTAAATAAACAAGCTGAATGTATTTGTAAACCAGGTTATTACGGTGATGGACGTTACGTATGTGCACCAATTACCCCGCTAACAGATGAATGTGCTGACTTATGTGACCCATC-AGCTGTATGCGCTG-AACATTTGGGTGTTAGTTTAAAGAAAAAGCGGTTACTCAGTCATATGTGTATTTGTCGTCCAGGATTTGTTGGTGATGGTTTTTCATGTAAATCAGATTGTGTTGCACGAGAATGTCAACCATTCAGTAGATGTATACATAATATCCCAAGAGGTATCACTGAATGTGTTTGTATTGAAGGAACAATACTATCTGGTACACGTTGTCACTTGGATGTATATAAAACA-TTGGAACAAGAAAAAGACTTACCTCAATTCATTATAGATCATGATCATTGTCTTTCATCAGAAACACAATTAGCTTTAAGAACATTGAATCCACCAAAATACTTTTATATATTTGTCCCATCCAGTATAATTACAAGTTGCACAGATGTTAAAGAGCATATAGTTGTACGATCGAAACCTTTAACTATGAATGAACTTAAATATGCTACAGTTCAGTCACCTATTAAATTAATCACTGAAAATAATACTGTGATTGAAGTTTATCCCATGAATGGTACACTTATGATTGATGGTCACCTAGCTCAATTTGAAACTGTGAAATTTGTCAAT-GGCGAA-TTATA-CTATTTATCTAATCCATTAAAACG-TACAGTGTATATTTACAAACTGAACAGTTACGTTTTTATANTTG]

[-] EMBL CD128945             [CATTGAAAATTCCACGTTTCATTTTAAAAAGTATTCATTCTATATCATCAGATGGTGAAATAATTCCTAATAGTCATTGGCATGAAGATGTTGAAAATCATGTTGTTTATTTTATGCAATGTTGTCGTGAAGATAAAACTTTACTGTTACGTGTACCACCATCAAAAGATGGTTTTTATTTAGCTAGTAGTTCTGGTCTATGTTCTAGTGTACCAGGGACTGTATTGGATAGAGAGAAAATTACTACCTATCTTACATCGCCATTACATAGTAATAGTAATGCTATGAATAATAATCGTAAATCAACTGTATTAAGTGAAAAAGATATGTTATTATATCGTGAAACACTTGCTCAACGTGAAGGTCTTCTCTATTTGTGCTATTATCATCCAGCTAAAGGAATTGATTATACTACATCAATACTTGGTACACGTTATTCTATAAGTCAAAATATTTCAGAAAAAGATATTGATGAAATAGCTAGACTATGTGGTTGTGCACCGAATGCATTTTGTTTATTGAATAAACAAGCTGAATGTATTTGTAAACCA                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                 ]
[+] EMBL CD167555             [                                                                                                                                                                             acacttgTAGCTAGTAGTTCTGGTCTATGTTCTAGTGTACCAGGGACTGTATTGGATAGAGAGAAAATTACTACCTATCTTACATCACCATTACATAGTAATAGTAATGCTATGAATAATAATCGTAAATCAACTGTATTAAGTGAAAAAGATATGTTATTATATCGTGAAACACTTGCTCAACGTGAAGGTCTTCTCTATTTATGCTATTATCATCCAGCTAAAGGAATTGATTATACTACATCAATACTTGGTACACGTTATTCTATAAGTCAAAATATTTCAGAAAAAGATATTGATGAAATAGCTAGACTATGTGGTTGTGCACCGAATGCATTTTGTTTATTACATAAACAAGCTGAATGTAT                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                           ]
[-] EMBL CD065831             [                                                                                                                                                                                                                                        AGAGAAAATTACTACCTATCGTACATCACCATTACATAGTAATAGTAATGCTATGAATAATAATCGTAAATCAACTGTATTAAGTGAAAAAGATATGTTATTATATCGTGAAACACTTGCTCAACGTGAAGGTCTTCTCTATTTATGCTATTATCATCCAGCTAAAGGAATTGATTATACTACATCAATACTAGGTACACGTTATTCTATAAGTCAAAATATTTCAGAAAAAGATATTGATGAAATAGCTAGACTATGTGGTTGTGCACCGAATGCATTTTGTTTATTAAATAAACAAGAGGTATGTATTTGTCAACCAGGTTATTACGGTG                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                    ]
[-] EMBL CD167536             [                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                       TGTTATTATATCGTGAGACACTTGCTCAACGTGAAGGTCTTCTCTATTTATGCTATTATCATCCAGCTAAAGGAATTGATTATACTACATCAATACTTGGTACACGTTATTCTATAAGTCAAAATATTTCAGAAAAAGATATTGATGAAATAGCTAGACTATGTGGTTGTGCACCGAATGCATTTTGTTTATTAAATAAACAAGCTGAATGTATTTGTAAACCAGGTTATTACGGTGATGGACGTTACGTATGTGCACCAATTACCCCGCTAACAGATGAATGTGCTGACTTATGTGACCCATC AGCTGTATGCGCTG AACATTTGGGTGTTAGTTTAAAGAAAAAGCGGTTACTCAGTCATATGTGTATTTGTCGTCCAGGATTTGTTGGTGATGGTTTTTCATGTAAATCAGATTGTGTTGCACGAGAATGTCAACCATTCAGTAGATGTATACATAATATCCCAAGAGGTATCACTGAATGTGTTTGTATTGAAGGAACAATACTATCT GTACACGTTGTCACTTGGATGTATAT AAACATTTGGAACAAGAAAAAGAat                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                          ]
[-] EMBL CD167513             [                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                               TATCGTGAAACACTTGCTCAACGTGAAGGTCTTCTCTATTTATGCTATTATCATCCAGCTAAAGGAATTGATTATACTACATCAATACTTGGTACACGTTATTCTATAAGTCAAAATATTTCAGAAAAAGATATTGATGAAATAGCTAGACTATGTGGTTGTGCACCGAATGCATTTTGTTTATTAAATAAACAAGCTGAATGTATTTGTAAACCAGGTTATTACGGTGATGGACGTTACGTATGTGCACCAATTACCCCGCTAACAGATGAATGTGCTGACTTATGTGACCCATC AGCTGTATGCGCTG AACATTTGGGTGTTAGTTTAAAGAAAAAGCGGTTACTCAGTCATATGTGTATTTGTCGTCCAGGATTTGTTGGTGATGGTTTTTCATGTAAATCAGATTGTGTTGCACGAGAATGTCAACCATTCAGTAGATGTATACATAATATCCCAAGAGGTATCACTGAATGTGTTTGTATTGAAGGAAC ATACTATCTGGTACACGTTGTCACTTGGATGTATAT AAACA TTGGAACAA                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                    ]
[-] EMBL CD167493             [                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                   TATTTCAGAAAAAGATATTGATGAAATAGCTAGACTATGTGGTTGTGCACCGAATGCATTTTGTTTATTAAATAAACAAGCTGAATGTATTTGTAAACCAGGTTATTACGGTGATGGACGTTACGTATGTGCACCAATTACCCCGCTAACAGATGAATGTGCTGACTTATGTGACCCATCAAGCTGTATGCGCTGCAACATCTGGGT                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                      ]
[+] EMBL CD078415             [                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                               AAAAGCAGTTACTCAGTCATATGTGTATTTGTCGTCCAGGATTTGTTGGTGATGGTTTTTCATGTAAATCAGATTGTGTTGCACGAGAATGTCAACCATTCAGTAGATGTATACATAATATCCCAAGAGGTATCACTGAATGTGTTTGTATTGAAGGAACAATACTATCTGGTACACGTTGTCACTTGGATGTATATAAAACA TTGGAACAAGAAAAAGACTTACCTCAATTCATTATAGATCATGATCATTGTCTTTCATCAGAAACACAATTAGCTTTAAGAACATTGAATCCACCAAAATACTTTTATATATTTGTCCCATCCAGTATAATTACAAGTTGCACAGATGTTAAAGAGCATATAGTTGTACGATCGAAACCTTTAACTATGAATGAACTTAAATATGCTACAGTTCAGTCACCTATTAAATTAATCACTGAAAATAATACTGCGATTGAAGTTTATCCCATGAATGGTACACTTATGATTGATGGTCACCTAGCTCAATTTGAAACTGTGAAATTTGTCAAT GGCGAA TTATA CTATTTATCTAATCCATTANAACG TACAGTGTATATTTACAAACTGAACAGTTACGTTTTTATANTTG]
[+] EMBL CD061388             [                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                AAAGCAGTTACTCAGTCATATGTGTATTTGTCGTCCAGGATTTGTTGGTGATGGTTTTTCATGTAAATCAGATTGTGTTGCACGAGAATGTCAACCATTCAGTAGATGTATACATAATATCCCAAGAGGTATCACTGAATGTGTTTGTATTGAAGGAACAATACTATCTGGTACACGTTGTCACTTGGATGTATATAAAACA TTGGAACAAGAAAAAGACTTACCTCAATTCATTATAGATCATGATCATTGTCTTTCATCAGAAACACAATTAGCTTTAAGAACATTGAATCCACCAAAATACTTTTATATATTTGTCCCATCCAGTAT                                                                                                                                                                                                                                                                                             ]
[+] EMBL CD167519             [                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                       gaTGTGTCGC CGAGAATGTCAACCATTCAGTAGATGTATACATAATATCCCAAGAGGTATCACTGAATGTG TTGTATTGAAGGAACAATACTATCTGGTACACG TGTCACTTGGATGTATATAAAACA TTGGA                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                        ]
[+] EMBL CD195664             [                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                           TGTTGCACGAGAATGTCAACCATTCAGTAGATGTATACATAATATCCCAAGAGGTATCACTGAATGTGTTTGTATTGAAGGAACAATACTATCTGGTACACGTTGTCACTTGGATGTATATAAAACA TTGGAACAAGAAAAAGATTTACCTCAATTCATTATAGATCATGATCATTGTCTTTCATTAGAAACACAATTAGCTTTAAGAACATTGAATCCACCAAAATACTTTTATATATTTGTCCCATCCAGTATAATTACAAGTTGCACAGATGTCAAAGAGCATATAGTTGTACGGTC AAAACTTTACCTATGA                                                                                                                                                                                                                               ]
[+] EMBL CD064082             [                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                             gcnATTCAGTAGATGTATACATAATATCCCAAGAGGTATCACTGAATGTGTTTGTATTGAAGGAACAATACTATCTGGTACACGTTGTCACTTGGATGTATATAAAACA TTGGAACAAGAAAAAGATTTACCTCAATTCGTTATAGATCATGATCATTGTCTTTCATTAGAAACACAATTAGCTTTAAGAACATTGAATCCACCAAAATACTTTTATATATTTGTCCCATCCAGTATAATTACAAGTTGCACAGATGTCAAAGAGCATATAGTTGTACGGTCAAAACCTTTACCTATGAATGAACT                                                                                                                                                                                                                        ]
[+] EMBL AI764831             [                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                              AGATCATGATCATTGTCTTTCATCAGAAACACAATTAGCTTTAAGAACATTGAATCCACCAAAATACTTTTATATATTTGTCCCATCCAGTATAATTACAAGTTGCACAGATGTTAAAGAGCATATAGTTGTACGATCGAAACCTTTAACTATGAATGAACTTAAATATGCTACAGTTCAGTCACCTATTAAATTAATCACTGAAAATAATACTGTGATTGAAGTTTATCCCATGAATGGTACACTTATGATTGATGGTCACCTAGCTCAATTTG AACTGTGAAATTTGTCAAT GGCGAA TTATA CTATTTATCTAATCCATTAAAACG TACAGTGTATATTTACAAACTGAACAGTTACGTTTTTA      ]
[+] EMBL AI764794             [                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                              AGATCATGATCATTGTCTTTCATCAGAAACACAATTAGCTTTAAGAACATTGAATCCACCAAAATACTTTTATATATTTGTCCCATCCAGTATAATTACAAGTTGCACAGATGTTAAAGAGCATATAGTTGTACGATCGAAACCTTTAACTATGAATGAACTTAAATATGCTACAGTTCAGTCACCTATTAAATTAATCACTGAAAATAATACTGTGATTGAAGTTTATCCCATGAATGGTACACTTATGATTGATGGTCACCTAGCTCAATTTGAAACTGTGAAATTTGTCAATGGGCGAATTTTTACCTATTTATCTAATCCATTAAAACGTTACAGTNTATATTT                              ]


>consensus_10097#0 CATTGAAAATTCCACGTTTCATTTTAAAAAGTATTCATTCTATATCATCAGATGGTGAAA TAATTCCTAATAGTCATTGGCATGAAGATGTTGAAAATCATGTTGTTTATTTTATGCAAT GTTGTCGTGAAGATAAAACTTTACTGTTACGTGTACCACCATCAAAAGATGGTTTTTATT TAGCTAGTAGTTCTGGTCTATGTTCTAGTGTACCAGGGACTGTATTGGATAGAGAGAAAA TTACTACCTATCTTACATCACCATTACATAGTAATAGTAATGCTATGAATAATAATCGTA AATCAACTGTATTAAGTGAAAAAGATATGTTATTATATCGTGAAACACTTGCTCAACGTG AAGGTCTTCTCTATTTATGCTATTATCATCCAGCTAAAGGAATTGATTATACTACATCAA TACTTGGTACACGTTATTCTATAAGTCAAAATATTTCAGAAAAAGATATTGATGAAATAG CTAGACTATGTGGTTGTGCACCGAATGCATTTTGTTTATTAAATAAACAAGCTGAATGTA TTTGTAAACCAGGTTATTACGGTGATGGACGTTACGTATGTGCACCAATTACCCCGCTAA CAGATGAATGTGCTGACTTATGTGACCCATCAGCTGTATGCGCTGAACATTTGGGTGTTA GTTTAAAGAAAAAGCGGTTACTCAGTCATATGTGTATTTGTCGTCCAGGATTTGTTGGTG ATGGTTTTTCATGTAAATCAGATTGTGTTGCACGAGAATGTCAACCATTCAGTAGATGTA TACATAATATCCCAAGAGGTATCACTGAATGTGTTTGTATTGAAGGAACAATACTATCTG GTACACGTTGTCACTTGGATGTATATAAAACATTGGAACAAGAAAAAGACTTACCTCAAT TCATTATAGATCATGATCATTGTCTTTCATCAGAAACACAATTAGCTTTAAGAACATTGA ATCCACCAAAATACTTTTATATATTTGTCCCATCCAGTATAATTACAAGTTGCACAGATG TTAAAGAGCATATAGTTGTACGATCGAAACCTTTAACTATGAATGAACTTAAATATGCTA CAGTTCAGTCACCTATTAAATTAATCACTGAAAATAATACTGTGATTGAAGTTTATCCCA TGAATGGTACACTTATGATTGATGGTCACCTAGCTCAATTTGAAACTGTGAAATTTGTCA ATGGCGAATTATACTATTTATCTAATCCATTAAAACGTACAGTGTATATTTACAAACTGA ACAGTTACGTTTTTATANTTG



clustalw multiple alignements is not computed in this case


Copyright Thu Nov 6 12:32:27 CET 2003 Hubert Wassner    (hubert.wassner@noos.fr)