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Schistosoma mansoni
cluster # 10130 cluster # 10130       Sequences # 13       consensus # 1


see consensus multiple alignment with clustalw

Direct access to contigs :
consensus_10130#0 length = 1202 sequences # 13  

consensusID : consensus_10130#0
NCBI blastX ! send the sequence to the NCBI site !
NCBI blastN ! send the sequence to the NCBI site !
Sequences nbr = 13
consensus length = 1202
fasta sequence
                              [ATCCGTGGATCCTAAGCTCTTCAGATGATCAGACAATTCGTATTTGGAATTGGCAGTCACGAGCTATAGTATCTATTTTAACTGGACATAGCCATTATGTTATGTGTGCTCAATTCCATCCAAGAGAAGATCTTATTGTATCAGCATCTTTAGATCAAACTGTGCGCGTTTGGGATATGTCAGGTCTGCGGAAGAAAAGTGTAGCTCCGTCGTCATTGTCAAGTATTGAGGACCACTCGCGACATTTCACAGGGTCTTCTGGTTCTGGTGTTTCTGGTTCAAATCTATTTGGTCCAAGTCATACAGAGTTGTTTGGAACAACTGAAGTAATTGTTCGTCATGTGCTTGAAGGTCACGACCGTGGGGTGAATTGGGTAGCTTTTCATCCAACTTTACCAATAGTTGTATCTGCAGCAGATGATCGACTTATTAAAATTTGGAGAATGACTGAATCAAAAGCTTGGGAATTGGATACACTTCGTGGTCATTTTAACAATGTTAGCTGTGTTGTGTTTCATCCCAGACAAGACTTGTTACTTTCTGATTCTGAGGATAAATCTATCAGAATATGGGATTTAGCCAAACGAACTTGTGTGTCAACTATTCGTCGAGATTCAGATAGATTTTGGGTTTTAAACGCTCATCCGAAACTAAATTTATTTGCTGCTGGTCATGATACAGGATTTGTTGTTTTCAAGTTGGAACGTGAGAGACCTGCATTTACAGTATATAAAGATTATATGTTCTATGTGAAGCTTCCTCATTTAAGACGAGTTGACTTTGCTGTTACGAAAGATGTTCCCGTTATTCAATTACGAGAAGGTCGTGGTCAAGCTGTAAGTGTTGGTTACAATCCAATTGAGAATGCCATGTTAGTCTT-AAGTCGGCCACGTCAAAGTGAACTAAACGCATCAGCTAATATGTCCATAACAAGTGGAACTAGTATGGTCTATGATTTGTATATGTTACCTAAAACAATGGGTAGTAGTAATAGTCAACCTGAACATGTTGAAAGTCGGTCAGGTAGCGGAATCGCTGTCGCTTGGATTGGTCGTAATAGATTCGCAGTTTTGGAAAGTTCTGGATCAATTGTTATACAAAATCTTTCAAATGAAAATGTTAAAAAAGTATCTTATTCTGGTGTTGATCAATTTTTTTATGCTGGAACTGGTAATTTATTAATTCGTGATTCTAATGGGATC]

[-] EMBL CD124659             [ATCCGTGGATCCTAAGCTCTTCAGATGATCAGACAATTCGTATTTGGAATTGGCAGTCACGAGCTATAGTATCTATTTTAACTGGACATAGCCATTATGTTATGTGTGCTCAATTCCATCCAAGAGAAGATCTTATTGTATCAGCATCTTTAGATCAAACTGTGCGCGTTTGGGATATGTCAGGTCTGCGGAAGAAAAGTGTAGCTCCGTCGTCATTGTCAAGTATTGAGGACCACTCGCGACATTTCACAGGGTCTTCTGGTTCTGGTGTTTCTGGTTCAAATCTATTTGGTCCAAGTCATACAGAGTTGTTTGGAACAACTGAAGTAATTGTTCGTCATGTGCTT                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                        ]
[+] EMBL CD115630             [                                                                                                                                                                                                                                                               CTTCTGGTTCTGGTGTTTCTGGTTCAAATCTATTTGGTCCAAGTCATACAGAGTTGTTTGGAACAACTGAA TTTTTGTTCGTCATGTGCTTGAATGTCACGACCGTAAGGTGAATTGGGTAGCTTTTCATCCAACTTTACCAATAGTAATATATGCAGCACACCCCCGACTTATTAAAATTTGGAGAATGACTGAATCAAAAGCTTGGGAATTGGATACACTTCGTGGTCATTTTAACAATGTTACCTGTGTTGTGTTTCATCCCACACAAGACTTGCTACTTTCTGATTCTGAGGATAAATCTAACAGAA                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                            ]
[+] EMBL CD157001             [                                                                                                                                                                                                                                                                                                                    TTGTTTGGAACAACTGAAGTAATTGTTCGTCATGTGCTTGAAGGTCACGACCGTGGGGTGAATTGGGTAGCTTTTCATCCAACTTTACCAATAGTTGTATCTGCAGCAGATGATCGACTTATTAAAATTTGGAGAATGACTGAATCAAAAGCTTGGGAATTGGATACACTTCGTGGTCATTTTAACAATGTTAGCTGTGTTGTGTTTCATCCCAGACAAGACTTGTTACTTTCTGATTCTGAGGATAAATCTATCAGAATATGGGATTTAGCCAAACGAACTTGTGTGTCAACTATTCGTCGAGATTCAGATAGATTTTGGGTTTTAAACGCTCATCCGAAACTAAATTTATTTGCTGCTGGTCATGATACAGGATTTGTTGTTTTCAAGTTGGAACGTGAGAGACCTGCATTTACAGTATATAAAGATTATATGTTCTATGTGAAGCTTCCTCATTTAAGACGAGTTGACTTTGCTGTTACGAAAGATGTTCCCGTTATTCAATTACGAGAAGGTCGTGGTCAAGCTGTAAGTGTTGGTTACAATCCAATTGAGAATGCCATGTTAGTCTTAAAGTCGt                                                                                                                                                                                                                                                                                                                           ]
[+] EMBL CD156935             [                                                                                                                                                                                                                                                                                                                    TTGTTTGGAACAACTGAAGTAATTGTTCGTCATGTGCTTGAAGGTCACGACCGTGGGGTGAATTGGGTAGCTTTTCATCCAACTTTACCAATAGTTGTATCTGCAGCAGATGATCGACTTATTAAAATTTGGAGAATGACTGAGTCAAAAGCTTGGGAATTGGATACACTTCGTGGTCATTTTAACAATGTTAGCTGTGTTGTGTTTCATCCCAGACAAGACTTGTTACTTTCTGGTTCTGAGGATAAATCTATCAGAATATGGGATTTAGCCAAACGAACTTGTGTGTCAACTATTCGTCGAGATTCAGATAGATTTTGGGTTTTAAACGCTCATCCGAAACTAAATTTATTTGCTGCTGGTCATGATACAGGATTTGTTGTTTTCAAGTTGGAACGTGAGAGACCTGCATTTACAGTATATAAAGATTATATGTTCTATGTGAAGCTTCCTCATTTAAGACGAGTTGACTTTGCTGTTACGAAAGATGTTCCCGTTATTCAATTACGAGAAGGTCGTGGTCAAGCTGTAAGTGTTGGTAACAATCCAATTGAGAATGCCATG                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                           ]
[+] EMBL CD156828             [                                                                                                                                                                                                                                                                                                                    TTGTTTGGAACAACTGAAGTAATTGTTCGTCATGTGCTTGAAGGTCACGACCGTGGGGTGAATTGGGTAGCTTTTCATCCAACTTTACCAATAGTTGTATCTGCAGCAGATGATCGACTTATTAAAATTTGGAGAATGACTGAATCAAAAGCTTGGGAATTGGATACACTTCGTGGTCATTTTAACAATGTTAGCTGTGTTGTGTTTCATCCCAGACAAGACTTGTTACTTTCTGATTCTGAGGATAAATCTATCAGAATATGGGATTTAGCCAAACGAACTTGTGTGTCAACTATTCGTCGAGATTCAGATAGATTTTGGGTTTTAAACGCTCATCCGAAACTAAATTTATTTGCTGCTGGTCATGATACAGGATTTGTTGTTTTCAAGTTGGAACGTGAGAGACCTGCATTTACAGTATATAAAGATTATATGTTCTATGTGAAGCTTCCTCATTTAAGACGAGTTGACTTTGCTGTTACGAAAGATGTTCCCGTTATTCAATTACGAGAAGGTCGTGGTCAAGCTGTAAGTGTTGGTTACAATCCAATTGAGAATGCCATG                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                           ]
[+] EMBL CD158969             [                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                               GACTTGTTACTTTCTGATTCTGAGGATAAATCTATCAGAATATGGGATTTAGCCAAACGAACTTGTGTGTCAACTATTCGTCGAGATTCAGATAGATTTTGGGTTTTAAACGCTCATCCGAAACTAAATTTATTTGCTGCTGGTCATGATACAGGATTTGTTGTTTTCAAGTTGGAACGTGAGAGACCTGCATTTACAGTATATAGAGATTATATGTTCTATGTGAAGCTTCCTCATTTAAGACGAGTTGACTTTGCTGTTACGAAAGATGTTCCCGTTATTCAATTACGAGAAGGTCGTGGTCAAGCTGTAAGTGTTGGTTACAATCCAATTGAGAATGCCATGTTAGTCTT AAGTCGGCCACGTCAAAGTGAACTAAACGCATCAGCTAATATGTCCATAACAAGTGGAACTAGTATGGTCTATGATTTGTATATGTTACCTAAAACAATGGGTGGTAGTAATAGTCAACCTGAACATGTTGAAAGTCGGTCAGGTAGCGGAATCGCTGTCGCTTGGATTGGTCGTAATAGATTCGCAGT                                                                                                                                     ]
[+] EMBL CD158946             [                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                               GACTTGTTACTTTCTGATTCTGAGGATAAATCTATCAGAATATGGGATTTAGCCAAACGAACTTGTGTGTCAACTATTCGTCGAGATTCAGATAGATTTTGGGTTTTAAACGCTCATCCGAAACTAAATTTATTTGCTGCTGGTCATGATACAGGATTTGTTGTTTTCAAGTTGGAACGTGAGAGACCTGCATTTACAGTATATAAAGATTATATGTTCTATGTGAAGCTTCCTCATTTAAGACGAGTTGACTTTGCTGTTACGAAAGATGTTCCCGTTATTCAATTACGAGAAGGTCGTGGTCAAGCTGTAAGTGTTGGTTACAATCCAATTGAGAATGCCATGTTAGTCTT AAGTCGGCCACGTCAAAGTGAACTAAACGCATCAGCTAATATGTCCATAACAAGTGGAACTAGTATGGTCTATGATTTGTATATGTTACCTAAAACAATGGGTAGTAGTAATAGTCAACCTGAACATGTTGAAAGTCGGTCAGGTAGCGGAATCGCTGTCGCTTGGATTGGTCGTAATAGATTC                                                                                                                                          ]
[+] EMBL CD159022             [                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                               GACTTGTTACTTTCTGATTCTGAGGATAAATCTATCAGAATATGGGATTTAGCCAAACGAACTTGGGTGGCAACTATTCGACGAGATTCAGATAGATTTTGGGTTTTAAACGCTCATCCGAAACTAAATTTATTTGCTGCTGGTCATGATACAGGATTTGTTGTTTTCAAGTTGGAACGTGAGAGACCTGCATTTACAGTATATAAAGATTATATGTTCTATGTGAAGCTTCCTCATTTAAGACGAGTTGACTTTGCTGTTACGAAAGATGTTCCCGTTATTCAATTACGAGAAGGGCGTGGCCAAGCTGTAAGCGTTGGTTACAATCCAATTGAGAA GCCATGCTAGTCTT AAGTCGGCCACGTCAAAGTGAACTAAACGCATCAGCTAATATGTCCATAGCAAGCGGAACTAGCATGGTCTATGATTTGTATATGTTACCTAAAACAATGGGTAGTAGTAATAGTCAACCTGAACATGTTGAAAGTCGGTCAGGTAGCGGAATCGCTGTCGCTTGGAT                                                                                                                                                          ]
[+] EMBL CD120781             [                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                               GACTTGTTACTTTCTGATTCTGAGGATAAATCTATCAGAATATGGGATTTAGCCAAACGAACTTGTGTGTCAACTATTCGTCGAGATTCAGATAGATTTTGGGTTTTAAACGCTCATCCGAAACTAAATTTATTTGCTGCTGGTCATGATACAGGATTTGTTGTTTTCAAGTTGGAACGTGAGAGACCTGCATTTACAGTATATAAAGATTATATGTTCTATGTGAAGCTTCCTCATTTAAGACGAGTTGACTTTGCTGTTACGAAAGATGTTCCCGTTATTCAATTACGAGAAGGTCGTGGTCAAGCTGTAAGTGTTGGTTACAATCCAATTGAGAATGCCATGTTAGTCTT AAGTCGGCCACGTCAAAGTGAACTAAACGCATCAGCTAATACGTCCATAACAAGTGGAACTAGTATGGTCTATGATTTGTATATGTTACCTANAACAATGGGTAGTAGTAATAGTCAACCTGAACATGTTGAAAGTCGGTCAGGTAGCGGAATCGCTG                                                                                                                                                                    ]
[+] EMBL CD158921             [                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                               GACTTGTTACTTTCTGATTCTGAGGATAAATCTATCAGAATATGGGATTTAGCCAAACGAACTTGTGTGTCAACTATTCGTCGAGATTCAGATAGATTTTGGGTTTTAAACGCTCATCCGAAACTAAATTTATTTGCTGCTGGTCATGATACAGGATTTGTTGTTTTCAAGTTGGAACGTGAGAGACCTGCATTTACAGTATATAAAGATTATATGTTCTATGTGAAGCTTCCTCATTTAAGACGAGTTGACTTTGCTGTTACGAAAGATGTTCCCGTTATTCAATTACGAGAAGGTCGTGGTCAAGCTGTAAGTGTTGGTTACAATCCAATTGAGAATGCCATGTTAGTCTT AAGTCGGCCACGTCAAAGTGAACTAAACGCATCAGCTAATATGTCCATAACAAGTGGAACTAGTATGGTCTATGATTTGTATATGTTACCTAAAACAATGGGTAGTAGTAATAGTCAACCTGAACATGTTGAAAGTCGGTCAGGTAGCGGAATCGCTGTCGCTTGGATTGGTCGTAATAGATTCGCAGTTTTGGAAAGTTCTGGATCAATTGTTATAC                                                                                                        ]
[+] EMBL CD158970             [                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                               GACTTGTTACTTTCTGATTCTGAGGATAAATCTATCAGAATATGGGATTTAGCCAAACGGACTTGTGTGTCAACTATTCGTCGAGATTCAGATAGATTTTGGGTTTTAAACGCTCATCCGAAACTAAATTTATTTGCTGCTGGTCATGATACAGGATTTGTTGTTTTCAAGTTGGAACGTGAGAGACCTGCACTTACAGTATATAAAGATTATATGTTCTATGTGAAGCTTCCTCATTTAAGACGAGTTGACTTTGCTGTTACGAAAGATGTTCCCGTTATTCAATTACGAGAAGGTCGTGGTCAAGCAGTAAGTGTTGGTTACAATCCAATTGAGAATGCCATGTTAGTCTT AAGTCGGCCACGTCAAAGTGAACTAAACGCATCAGCTAATATGTCCATAACAAGTGGAACTAGTATGGTCTATGATTTGTATATGTTACCTAAAACAATGGGTAGTAGTAATAGTCAACCTGAACATGTTGAAAGTCGGTCAGGTAGCGGAATCGCTGTCGCTTGGATTGGTCGTAATAGATTCGCAGTTTTGGAAAGTTCTGGATCAA                                                                                                                 ]
[-] EMBL CD119188             [                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                               CGAGAAGGTCGTGGTCAAGCTGTAAGTGTTGGTTACAATCCAATTGAGAATGCCATGTTAGTCCT AAGTCGGCCACGTCAAAGTGAACTAAACGCATCAGCTAATATGTCCATAACAAGTGGAACTAGTATGGTCTATGATTTGTATATGTTACCTAAAACAATGGGTAGTAGTAATAGTCAACCTGAACATGTTGAAAGTCGGTCAGGTAGCGGAATCGCTGTCGCTTGGATTGGTCGTAATAGATTCGCAGTTTTGGAAAGTTCTGGATCAATTGTTATAAAAAATCTTTCAAATGAAAATGTTAAAAAAGTATCTTATTCTGGTGTTGATCAATTTTTTTATGCTGGAACTGGTAATTTATTAATTCGTGATTCTAATGGGATC]
[-] EMBL CD127019             [                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                              TT AAGTCGGCCACGTCAAAGTGAACTAAACGCATCAGCTAATATGTCCATAACAAGTGGAACTAGTATGGTCTATGATTTGTATATGTTACCTAAAACAATGGGTAGTAGTAATAGTCAACCTGAACATGTTGAAAGTCGGTCAGGTAGCGGAAT                                                                                                                                                                         ]


>consensus_10130#0 ATCCGTGGATCCTAAGCTCTTCAGATGATCAGACAATTCGTATTTGGAATTGGCAGTCAC GAGCTATAGTATCTATTTTAACTGGACATAGCCATTATGTTATGTGTGCTCAATTCCATC CAAGAGAAGATCTTATTGTATCAGCATCTTTAGATCAAACTGTGCGCGTTTGGGATATGT CAGGTCTGCGGAAGAAAAGTGTAGCTCCGTCGTCATTGTCAAGTATTGAGGACCACTCGC GACATTTCACAGGGTCTTCTGGTTCTGGTGTTTCTGGTTCAAATCTATTTGGTCCAAGTC ATACAGAGTTGTTTGGAACAACTGAAGTAATTGTTCGTCATGTGCTTGAAGGTCACGACC GTGGGGTGAATTGGGTAGCTTTTCATCCAACTTTACCAATAGTTGTATCTGCAGCAGATG ATCGACTTATTAAAATTTGGAGAATGACTGAATCAAAAGCTTGGGAATTGGATACACTTC GTGGTCATTTTAACAATGTTAGCTGTGTTGTGTTTCATCCCAGACAAGACTTGTTACTTT CTGATTCTGAGGATAAATCTATCAGAATATGGGATTTAGCCAAACGAACTTGTGTGTCAA CTATTCGTCGAGATTCAGATAGATTTTGGGTTTTAAACGCTCATCCGAAACTAAATTTAT TTGCTGCTGGTCATGATACAGGATTTGTTGTTTTCAAGTTGGAACGTGAGAGACCTGCAT TTACAGTATATAAAGATTATATGTTCTATGTGAAGCTTCCTCATTTAAGACGAGTTGACT TTGCTGTTACGAAAGATGTTCCCGTTATTCAATTACGAGAAGGTCGTGGTCAAGCTGTAA GTGTTGGTTACAATCCAATTGAGAATGCCATGTTAGTCTTAAGTCGGCCACGTCAAAGTG AACTAAACGCATCAGCTAATATGTCCATAACAAGTGGAACTAGTATGGTCTATGATTTGT ATATGTTACCTAAAACAATGGGTAGTAGTAATAGTCAACCTGAACATGTTGAAAGTCGGT CAGGTAGCGGAATCGCTGTCGCTTGGATTGGTCGTAATAGATTCGCAGTTTTGGAAAGTT CTGGATCAATTGTTATACAAAATCTTTCAAATGAAAATGTTAAAAAAGTATCTTATTCTG GTGTTGATCAATTTTTTTATGCTGGAACTGGTAATTTATTAATTCGTGATTCTAATGGGA TC



clustalw multiple alignements is not computed in this case


Copyright Thu Nov 6 12:32:27 CET 2003 Hubert Wassner    (hubert.wassner@noos.fr)