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Schistosoma mansoni
cluster # 10139 cluster # 10139       Sequences # 13       consensus # 1


see consensus multiple alignment with clustalw

Direct access to contigs :
consensus_10139#0 length = 1151 sequences # 13  

consensusID : consensus_10139#0
NCBI blastX ! send the sequence to the NCBI site !
NCBI blastN ! send the sequence to the NCBI site !
Sequences nbr = 13
consensus length = 1151
fasta sequence
                              [GTCTGATTTGTGCTTTTTGTTATTCTCTAACTAAACACATCAGTAATGGACTCAGCAGATAACCCTTTTGCTTCGCTTGTAAAAAATTCATCAGTCGGTCTGGGTCCGGCAATTTTTGGTGCCTGTGAAACTGAAGTTACTAAAATCTTGGAGAACATACTACTCATTACCCATGATAAAGATCTTGTTTTTGGTGAATCAGGTAGACCCAGTCATCTACTTTACATACAACCGTTCTCGTGTGGTAATGTACATATTTCGGGGAGCAGTTTAGATGAACTTATATTTGACCGAACCCAAATGAGAAAATTTAACGATTATGATGTTGTCAGCATTAACACAGGGGCGGCCACGGATATCAATGACGTTTTGGCTTCCAACCCAATTAGTTATTTGGTCTCTTCTTATCACCGTGCGTGTGTAATTAAACAAACAAACGCTCTTTCACAGATCGTTGAAGATTGTCGCAAAAGTATTGTAAGACAAATTGTACTTCTATTGCTTGTTGATGCTGAGTCTGATAATCCGGAAAGCAGCACGAACCTATTTGATATCGTTTATCAAGCTCTCTGCACAGATGACTGCGATCAAATTGCTTATATTCAAAAAATGTTTGATGAAGTCCTTAGTCATCTGGAGTCGGAATCTCTATCGGATGTAAGTATATTAGAATCCTGTCCTCAGTCCGCATTAAACAGTTTACGGCCGTTGGTTAATCGCCTTCTAATTCAGTTAAGGAACATTTATTACTCCTCAGTGCAGTCACCAACAGTAGTAAATAGCTTCCTAAATAAACAGTTAGTTGGTGCTAGAGAACGTGTCTTGTTCTGTCCTCAACGCCGTCCTCTGCTGATCATGACAATTTGGTTATCTAAGTATGCAGTCACTGCTCAGCTTCTTATTGAGTTGTCGTTTCCTCAGAATTTCTCCAGTGGTTCATTTAGACCTGATGAATTCGAAGGTGGTCTTTTGGGTCGACTTCTAGTTTCCAGTCATTTACATTCACCTCAAGCAGCGGAAACAATTTTCCTAACTAATCAGGCCCCAATCGGTGAATTTTTCACCGAAGAAGTACCTCTAAAATCTGTTGTGGAGTCCGAACAACGTACAATATGGCAGTTAACTGAACAAATGGATTTGGCATTGAACAC]

[+] EMBL AI068018             [GTCTGATTTGTGCTTTTTGTTATTCTCTAACTAAACACATCAGTAATGGACTCAGCAGATAACCCTTTTGCTTCGCTTGTAAAAAATTCATCAGTCGGTCTGGGTCCGGCAATTTTTGGTGCCTGTGAAACTGAAGTTACTAAAATCTTGGAGAACATACTACTCATTACCCATGATAAAGATCTTGTTTTTGGTGAATCAGGTAGACCCAGTCATCTACTTTACATACAACCGTTCTCGTGTGGTAATGTACATATTTCGGGGAGCAGTTTAGATGAACTTATATTTGACCGAACCCAAATGAGAAAATTTAACGATTATGATGTTGTCAGCATTAACACAGGGGCGGCCACGGATATCAATGACGTTTTGGCTTCCAACCCAATTAGTTATTTGGTCTCTTCTTATCACCGTGCGTGTGTAATTAAACAAACAAACGCTCTTTCACAGATCGTTGAAGATTGTCGCAAAAGTATTGTAAGACAAATTGTACTTCTATTGCTTGTTGATGCTGAGTCTGATAATCCGGAAAGCAGCACGAACCTATTTGATATCGTTTATCAAGCTCTCTGCACAGATGACTGCGATCAAATTGCTTATATTCAAAAAATGTTTGATGAAGTCCTTAGTC                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                        ]
[+] EMBL CD112071             [                                                                                                                 TTTTGGTGCCTGTGAAACTGAAGTTACTAAAATCTTGGAGAACATACTACTCATTACCCATGATAAAGATCTTGTTTTTGGTGAATCAGGTAGACCCAGTCATCTACTTTACATACAACCGTTCTCGTGTGGTAATGTACATATTTCGGGGAGCAGTTTAGATGAACTTATATTTGACCGAACCCAAATGAGAAAATTTAACGATTATGATGTTGTCAGCATTAACACAGGGGCGGCCACGGATATCAATGACGTTTTGGCTTCCAACCCAATTAGTTATTTGGTCTCTTCTTATCACCGTGCGTGTGTAATTAAACAAACAAACGCTCTTTCACAGATCGTTGAAGATTGTCGCAAAAGTATTGTAAGACAAATTGTACTTCTATTGCTTGTTGATGCTGAGTCTGATAATCCGGAAAGCAGCACGA                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                  ]
[+] EMBL CD112578             [                                                                                                                 TTTTGGTGCCTGTGAAACTGAAGTTACTAAAATCTTGGAGAACATACTACTCATTACCCATGATAAAGATCTTGTTTTTGGTGAATCAGGTAGACCCAGTCATCTACTTTACATACAACCGTTCTCGTGTGGTAATGTACATATTTCGGGGAGCAGTTTAGATGAACTTATATTTGACCGAACCCAAATGAGAAAATTTAGCGATTATGATGTTGTCAGCATT                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                               ]
[+] EMBL CD157299             [                                                                                                                                                                          CCATGATAAAGATCTTGTTTTTGGTGAATCAGGTAGACCCAGTCATCTACTTTACATACAACCGTTCTCGTGTGGTAATGTACATATTTCGGGGAGCAGTTTAGATGAACTTATATTTGACCGAACCCAAATGAGAAAATTTAACGATTATGATGTTGTCAGCATTAACACAGGGGCGGCCACGGATATCAATGACGTTTTGGCTTCCAACCCAATTAGTTATTTGGTCTCTTCTTATCACCGTGCGTGTGTAATTAAACAAACAAACGCTCTTTCACAGATCGTTGAAGATTGTCGCAAAAGTATTGTAAGACAAATTGTACTTCTATTGCTTGTTGATGCTGAGTCTGATAATCCGGAAAGCAGCACGAACCTATTTGATATCGTTTATCAAGCTCTCTGC                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                  ]
[-] EMBL CD112422             [                                                                                                                                                                                                      TCAGGTAGACCCAGTCATCTACTTTACATACAACCGTTCTCGTGTGGTAATGTACACATTTCGGGGAGCAGTTTAGATGAACTTATATTTGACCGAACCCAAATGAGAAAATTTAACGATTATGACGTTGTCAGCATTAACACAGGGGCGGCCACGGATATCAATGACGTTTTGGCTTCCAACCCAATTAGTTATTTGGTCTCTTCTTATCACCGTGCGTGTGTAATTAAACAAACAAACGCTCTTTCACAGATCGTTGAAGATTGTCGCAAAAGTATTGTAAGACAAATTGTACTTCTATTGCTTGTTGATGCTGAGTCTGATAATCCGGAAAGCAGCACGAACCTATTTGATATCGTTTATCAAGCTCTCTGCACAGATGACTGCGATCAAATTGCTTATATTCAAAAAATGTTTGATGAAGTCCTTAGTCATCTGGAGTCGGAATCTCTATCGGATGTAAGTATATTAG                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                 ]
[-] EMBL CD112193             [                                                                                                                                                                                                               cgCAGTCATCTACTTTACATACAACCGTTCTCGTGTGGTAATGTACATATTTCGGGGAGCAGTTTAGATGAACTTATATTTGACCGAACCCAAATGAGAAAATTTAACGATTATGATGTTGTCAGCATTAACACAGGGGCGGCCACGGATATCAATGACGTTTTGGCTTCCAACCCAATTAGTTATTTGGTCTCTTCTTATCACCGTGCGTGTGTAATTAAACAAACAAACGCTCTTTCACAGATCGTTGAAGATTGTCGCAAAAGTATTGTAAGACAAATTGTACTTCTATTGCTTGTTGATGCTGAGTCTGATAATCCGGAAAGCAGCACGAACCTATTTGATATCGTTTATCAAGCTCTCTGCACAGATGACTGCGATCAAATTGCTTATATTCAAAAAATGTTTGATGAAGTCCTTAGTCATCTGGGGTCGGAATCTCTATCGGATGTAAGTATATTAG                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                 ]
[-] EMBL CD112518             [                                                                                                                                                                                                                 gcaTCATCTACTGTACATACAACCGTTCTCGTGTGGTAATGTACATATTTCGGGGAGCAGTCTAGATGAACTTATATTTGACCGAACCCAAATGAGCAAATTTAACGATTATGATGTTGTCAGCATTAACACAGGGGCGGCCACGGATATCAATGACGTTTTGGCTTCCAACCCAATTAGTTATTTGGTCTCTTCTTATCACCGTGCGTGTGTAATTAAACAAACAAACGCTCTTTCACAGATCGTTGAAGATTGTCGCAAAAGTATTGTAAGACAAATTGTACTTCTATTGCTTGTTGATGCTGAGTCTGATAATCCGGAAAGCAGCACGAACCTATTTGATATCGTTTATCAAGCTCTCTGCACAGATGACTGCGATCAAATTGCTTATATTCAAAAAATGTTTGATGAAGTCCTTAGTCATCTGGAGTCGGAATCTCTATCGGATGTAAGTATATTAG                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                 ]
[+] EMBL CD125787             [                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                              GTTCTGGCTTCCAACCCAATTAGTTATTGGGTCTCTTCTTATCACCGTGCGTGTGTAATTAAACGAACAAACGCTCTTTCACAGATCG TGAAGA TGTCGCAAAAGTATTGTAAGACAAATTGTACTTCTATTGCTTGTTGATGCTGAGTCTGATAATCCGGAAAGCAGCACGAACCTATTTGATATCGTTTATCAAGCTCTCTGCACAGATGACTGCGATCAAATGGCTTATATTCAAAAAGTGTTTGATGAAGTCCTTAGTCATCTGGAGTCGGAATCTCTATCGGATGTAAGTATATTAGAATCCTGTCCTCAGTCCGCATTAAACAGTTTACGGCCGTTGGTTAATCGCCTTCTAATTCAGTTAAGGAACATTTATTACTCCTCAGTGCAGTCACCAACAGTAGTAAATAGCTTCCTAAATAAACAGTTAGTTGGTGCTAGAG                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                 ]
[-] EMBL CD182192             [                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                               TTTTGGCTTCCAACCCAATTAGTTATTTGGTCTCTTCTTATCACCGTGCGTGTGTAATTAAACAAACAAACGCTCTTTCACAGATCGTTGAAGATTGTCGCAAAAGTATTGTAAGACAAATTGTACTTCTATTGCTTGTTGATGCTG                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                             ]
[+] EMBL CD201604             [                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                     TTATTTGGTCTCTTCTTATCACCGTGCGTGTGTAATTAAACAAACAAACGCTCTTTCACAGATCGTTGAAGATTGTCGCAAAAGTATTGTAAGACAAATTGTACTTCTATTGCTTGTTGATGCTGAGTCTGATAATCCGGAAAGCAGCACGAACCTATTTGATATCGTTTATCAAGCTCTCTGCACAGATGACTGCGATCAAATTGCTTATATTCAAAAAATGTTTGATGAAGTCCTTAGTCATCTGGAGTCGGAATCTCTATCGGATGTAAGTATATTAGAATCCTGTCCTCAGTCCGCATTAAACAGTTTACGGCCGTTGGTTAATC                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                 ]
[+] EMBL CD181742             [                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                            TCCGGAAAGCAGCACGAACCTATTTGATATCGTTTATCAAGCTCTCTGCACAGATGACTGCGATCAAATTGCTTATATTCAAAAAATGTTTGATGAAGTCCTTAGTCATCTGGAGCCGGAATCTCTATCGGATGTAAGTATATTAGAATCCTGTCCTCAGTCCGCATTAAACAGTTTACGGCCGTTGGTTAATCGCCTTCTAATTCAGTTAAGGAACATTTATTACTCCTCAGTGCAGTCACCAACAGTAGTAAATAGCTTCCTANATAAACAGTTAGTTGGTGCTAGAGAACGTGTCTTGTTCTGTCCTCAACGCCGTCCTCCGCTGATCATGACAATTTGGTTATCTAAGTATG                                                                                                                                                                                                                                                                               ]
[-] EMBL CD163595             [                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                  TTAAACAGTTTACGGCCGTTGGTTAATCGCCTTCTAATTCAGTTAAGGAACATTTATTACTCCTCAGTGCAGTCACCAACAGTAGTAAATAGCTTCCTAAATAAACAGTTAGTTGGTGCTAGAGAACGTGTCTTGTTCTGTCCTCAACGCCGTCCTCTGCTGATCATGACAATTTGGTTATCTAAGTATGCAGTCACTGCTCAGCTTCTTATTGAGTTGTCGTTTCCTCAGAATTTCTCCAGTGGTTCATTTAGACCTGATGAATTCGAAGGTGGTCTTTTGGGTCGACTTCTAGTTTCCAGTCATTTACATTCA                                                                                                                                                  ]
[+] EMBL CD188011             [                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                          ACAGTTAGTTGGTGCTAGAGAACGTGTCTTGTTCTGTCCTCAACGCCGTCCTCTGCTGATCATGACAATTTGGTTATCTAAGTATGCAGTCACTGCTCAGCTTCTTATTGAGTTGTCGTTTCCTCAGAATTTCTCCAGTGGTTCATTTAGACCTGATGAATTCGAAGGTGGTCTTTTGGGTCGACTTCTAGTTTCCAGTCATTTACATTCACCTCAAGCAGCGGAAACAATTTTCCTAACTAATCAGGCCCCAATCGGTGAATTTTTCACCGAAGAAGTACCTCTAAAATCTGTTGTGGAGTCCGAACAACGTACAATATGGCAGTTAACTGAACAAATGGATTTGGCATTGAACAC]


>consensus_10139#0 GTCTGATTTGTGCTTTTTGTTATTCTCTAACTAAACACATCAGTAATGGACTCAGCAGAT AACCCTTTTGCTTCGCTTGTAAAAAATTCATCAGTCGGTCTGGGTCCGGCAATTTTTGGT GCCTGTGAAACTGAAGTTACTAAAATCTTGGAGAACATACTACTCATTACCCATGATAAA GATCTTGTTTTTGGTGAATCAGGTAGACCCAGTCATCTACTTTACATACAACCGTTCTCG TGTGGTAATGTACATATTTCGGGGAGCAGTTTAGATGAACTTATATTTGACCGAACCCAA ATGAGAAAATTTAACGATTATGATGTTGTCAGCATTAACACAGGGGCGGCCACGGATATC AATGACGTTTTGGCTTCCAACCCAATTAGTTATTTGGTCTCTTCTTATCACCGTGCGTGT GTAATTAAACAAACAAACGCTCTTTCACAGATCGTTGAAGATTGTCGCAAAAGTATTGTA AGACAAATTGTACTTCTATTGCTTGTTGATGCTGAGTCTGATAATCCGGAAAGCAGCACG AACCTATTTGATATCGTTTATCAAGCTCTCTGCACAGATGACTGCGATCAAATTGCTTAT ATTCAAAAAATGTTTGATGAAGTCCTTAGTCATCTGGAGTCGGAATCTCTATCGGATGTA AGTATATTAGAATCCTGTCCTCAGTCCGCATTAAACAGTTTACGGCCGTTGGTTAATCGC CTTCTAATTCAGTTAAGGAACATTTATTACTCCTCAGTGCAGTCACCAACAGTAGTAAAT AGCTTCCTAAATAAACAGTTAGTTGGTGCTAGAGAACGTGTCTTGTTCTGTCCTCAACGC CGTCCTCTGCTGATCATGACAATTTGGTTATCTAAGTATGCAGTCACTGCTCAGCTTCTT ATTGAGTTGTCGTTTCCTCAGAATTTCTCCAGTGGTTCATTTAGACCTGATGAATTCGAA GGTGGTCTTTTGGGTCGACTTCTAGTTTCCAGTCATTTACATTCACCTCAAGCAGCGGAA ACAATTTTCCTAACTAATCAGGCCCCAATCGGTGAATTTTTCACCGAAGAAGTACCTCTA AAATCTGTTGTGGAGTCCGAACAACGTACAATATGGCAGTTAACTGAACAAATGGATTTG GCATTGAACAC



clustalw multiple alignements is not computed in this case


Copyright Thu Nov 6 12:32:27 CET 2003 Hubert Wassner    (hubert.wassner@noos.fr)