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Schistosoma mansoni
cluster # 10147 cluster # 10147       Sequences # 13       consensus # 3


see consensus multiple alignment with clustalw

Direct access to contigs :
consensus_10147#0 length = 1043 sequences # 7  
consensus_10147#1 length = 490 sequences # 2  
consensus_10147#2 length = 348 sequences # 4  

consensusID : consensus_10147#0
NCBI blastX ! send the sequence to the NCBI site !
NCBI blastN ! send the sequence to the NCBI site !
Sequences nbr = 7
consensus length = 1043
fasta sequence
                              [GAGGCGTGACGTTACGGATATATTGGGGAGCCCTCAAAAAACAATAGGATTCCAGATAGACAACTCTAAGGACACTGATATTTCCCAGCCACATTATCAACGAAGCGATCAACCATCGTTAGACTCCCAGAAGCTGTTCATGCCTGAAAATGATGATAATGATAAGTATAAACGACATCTAACATTGTCATGGTTCACGCGC-TCCTTCGGAGGCATGCATCATACTTTACACGTTTATCGGTTATTCGACGAAATCGTCTTACTCTATTAATTATGGGTTGTATAATATCTATTTTCCTACTGGGTTTCTATGGTTCTCAACCGGATATCACTGGTGACCCATTATTAGATCCTCATATGAATCCAAATATTCGTTTTAATTTGGAACCTATAGATTCAATAAAAGGAGCCTTAAATAATGATAATAATAATAATCTTAATAACCATAGAGATAGAGGTGTTATTGATGGGTTGAATGAAGTCTAATTCTATAGTAAGATGGTATTTCTTCTAAACACTATCTTCCTTATTGTGATTCGAACCAATGAACACTTTAGCTCGATGTAACTCGTCATTTTATCTTTTATTGTCTAGTTTATAATTTTTCTTATTTCTTGTTATTCAAATCGTTAGACGTTTTCAAACTTTCAATGGATGACTTGTTGTTCATCTTCTGTTTAGTTAGATTCGAATGTGCATGTCTGATCGTCTGTTAATCGTATATTTTGATAATTTTTATATTTTTCCTACTCACTCCTGATTATCACCAATGTAATACTATCTTTGTATAACCTTATTTTAATGACTGTATGCTGGTGAATAGTGGTTAATTCGCCTTCCTTTATGTTTTAATAAATCCCTGTAACTTATTATCCAATAAAAACTGATATTCAAGTTTATGCTTCTGTCCCTGAGTTCCTTCCTTAGCTAATATATAGTAACCAACATTCGCTTAGGTTTTGTATTAGTGATCAGATATGTACAAGATATTTTACACTATTTAAAAAAAAAAAAAAAAAAAAAAAAAAACATGCCATGCAGCT]

[+] EMBL CD079771             [GAGGCGTGACGTTACGGATATATTGGGGAGCCCTCAAAAAACAATAGGATTCCAGATAGACAACTCTAAGGACACTGATATTTCCCAGCTACATTATCAACGAAGCGATCAACCATCGTTAGACTCCCAGAAGCTGTTCATGCCTGAAAATGATGATAATGATAAGTATAAACGACATCTAACATTGTCATGGTTCACGCGC TCCTTCGGAGGCATGCATCATACTTTACACGTTTATCGGTTATTCGACGAAATCGTCTTACTCTATTAATTATGGGTTGTATAATATCTATTTTCCTACTGGGTTTCTATGGTTCTCAACCGGATATCACTGGTGACCCATTATTAGATCCTCATATGAATCCAAATATTCGTTTTAATTTGGAACCTATAGATTCAATAAAAGGAGCCTTAAATAATGATAATAATAATAATCTTAATAACCATAGAGATAGAGGTGTTATTGATGGGTTGAATGAAGTCTAATTCTATAGTAAGATGGTATTTCTTCTAAACACTATCTTCCTTATTGTGATTCGAACCAATGAACACTTTAGCTCGATGTAACTCGTCATTTTATCTTTTATTGTCTAGTTTATAATTTTTCTTATTTCTTGTTATTCAAATCGTTAGACGTTNTCAAACTTTCAATGGATGACTTGTTGTTCATCTTCTGTTTAGTTAGATTCGAATGTGCATGTCTGATCGTCTGTT                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                         ]
[+] EMBL CD165711             [                                                   CCAGATAGACAACTCTAAGGACACTGATATTTCCCAGCCACATTATCAACGAAGCGATCAACCATCGTTAGACTCCCAGAAGCTGTTCATGCCTGAAAATGATGATAATGATAAGTATAAACGACATCTAACATTGTCATGGTTCACGCGCTTCCTTCGGAGGCATGCATCATACTTTACACGTTTATCGGTTATTCGACGAAATCGTCTTACTCTATTAATTATGGGTTGTATAATATCTATTTTCCTACTGGGTTTCTATGGTTCTCAACCGGATATCACTGGTGACCCATTATTAGATCCTCATATGAATCCAAATATTCGTTTTAATTT                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                    ]
[-] EMBL CD165631             [                                                    CAGATAGACAACTCTAAGGACACTGATATTTCCCAGCCACATTATCAACGAAGTGATCAACCATCGTTAGACTCCCAGAAGCTGTTCATGCCTGAAAATGATGATAATGATAAGTATAAACGACATCTAACATTGTCATGGTTCACGCGCTTCCTTCGGAGGCATGCATCATACTTTACACGTTTATCGGTTATTCGACGAAATCGTCTTACTCTATCAATTATGGGTTGTATAATATCTATTTTCCTACTGGGTTTCTATGGTTCTCAACCGGATATCACTGGTGACCCATTATTAGATCCTCATATGAATCCAAATATTCGTTTTAATTTG                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                   ]
[-] EMBL CD074030             [                                                                                                                                                                                          GTCATGG TCACGCGC TCC TCGNAGGCATGCATCATACTTTACACGTTTATCGG TATTCGACGAAATCGTCTTACTCTATTAATTATGGGTTGTATAATATCTATTTTCCTACTGGGTTTCTATGGTTCTCAACCGGATATCACTGGTGACCCATTATTAGATCCTCATATGAATCCAAATATTCGTTTTAATTTGGAACCTATAGATTCAATAAAAGGAGCCTTAAATAATGATAATAATAATAATCTTAATAACCATAGAGATAGAGGTGTTATTGATGGGTTGAATGAAGTCTAATTCTATAGTAAGATGGTATTTCTTCTAAACACTATCTTCCTTATTGTGATTCGAACCAATGAACACTTTAGCTCGATGTAACTCGTCATTTTATCTTTTATTGTCTAGTTTATAATTTTTCTTATTTCTTGTTATTCAAATCGTTAGACGTTTTCAAACTTTCAATGGATGACTTGTTGTTCATCTTCTGTTTAGTTAGATTCGAATGTGCATGTCTGATCGTCTGTTAATCGTATATTTTGATAATTTTTATATTTTTCCTACTCACTCCTGATTATCACCAATGTAATACTATCTTTGTATAACCTTATTTTAATGACTGTATGCTGGTGAATAGTGGTTAATTCGCCTTCCTTTATGTTTTAATAAATCCCTGTAACTTATTATCCAATAAAAA                                                                                                                                                                ]
[-] EMBL CD076947             [                                                                                                                                                                                                                                                                                  ATGGGTTGTATAATATCTATTTTCCTACTGGGTTTCTATGGTTCTCAACCGGATATCACTGGTGACCCATTATTAGATCCTCATATGAATCCAAATATTCGTTTTAATTTGGAACCTATAGATTCAATAAAAGGAGCCTTAAATAATGATAATAATAATAATCTTAATAACCATAGAGATAGAGGTGTTATTGATGGGTTGAATGAAGTCTAATTCTATAGTAAGATGGTATTTCTTCTAAACACTATCTTCCTTATTGTGATTCGAACCAATGAACACTTTAGCTCGATGTAACTCGTCATTTTATCTTTTATTGTCTAGTTTGTAATTTTTCTTATTTCTTGTTATTCAAATCGTTAGACGTTTTCAAACTTTCAATGGACGACTTGTTGTTCATCTTCTGTTTAGTTAGATTCGAATGTACATGTCTGATCGTCTGTTAATCGTATATTTTGATAATTTTTATATTTTTCCTACTCACTCCTGATTATCACTAATGTAATACTATCTTTGTATAACCTTATTTTAATGACTGTATGCTGGTGAATAGTGGTTAATTCGCCTTCCTTTATGTTTTAATAAATCCCTGTAACTTATTATCCAATAAAAA                                                                                                                                                                ]
[-] EMBL AI067886             [                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                          TTAGATCCTCATATGAATCCAAATATTCGTNTTAATTTGGAACCTATAGATTCAATAAAAGGAGCCTTAAATAATGATAATAATAATAATCTTAATAACCATAGAGATAGAGGTGTTATTGATGGGTTGAATGAAGTCTAATTCTATAGTAAGATGGTATTTCTTCTAAACACTATCTTCCTTATTGTGATTCGAACCAATGAACACTTTAGCTCGATGTAACTCGTCATTTTATCTTTTATTGTCTAGTTTATAATTTTTCTTATTTCTTGTTATTCAAATCGTTAGACGTTTTCAAACTTTCAATGGATGACTTGTTGTTCATCTTCTGTTTAGTTAGATTCGAATGTGCATGTCTGATCGTCTGTTAATCGTATATTTTGATAATTTTTATATTTTTCCTACTCACTCCTGATTATCACCAATGTAATACTATCTTTGTATAACCTTATTTTAATGACTGTATGCTGGTGAATAGTGGTTAATTCGCCTTCCTTTATGTTTTAATAAATCCCTGTAACTTATTATCCAATAAAAACTGATATTCAAGTTTATGCTTCTGTCCCTGAGTTCCTTCCTTAGCTAATATATAGTAACCAACATTCGCTTAGGTTTTGTATTAGTGATCAGATATGTACAAGATATTTTACACTATTTAAAAAAAAAAAAAAAAAAAAAAAAAAACATGCCAT      ]
[-] EMBL AI067492             [                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                         GACGTTTTCAAACTTTCAATGGATGACTTGTTGTTCATCTTCTGTTTAGTTAGATTCGAATGTGCATGTCTGATCGTCTGTTAATCGTATATTTTGATAATTTTTATATTTTTCCTACTCACTCCTGATTATCACCAATGTAATACTATCTTTGTATAACCTTATTTTAATGACTGTATGCTGGTGAATAGTGGTTAATTCGCCTTCCTTTATGTTTTAATAAATCCCTGTAACTTATTATCCAATAAAAACTGATATTCAAGTTTATGCTTCTGTCCCTGAGTTCCTTCCTTAGCTAATATATAGTAACCAACATTCGCTTAGGTTTTGTATTAGTGATCAGATATGTACAAGATATTTTACACTATTT AAAAAAAAAAAAAAAAAAAAAAAAAACATGCCATGCAGCT]


>consensus_10147#0 GAGGCGTGACGTTACGGATATATTGGGGAGCCCTCAAAAAACAATAGGATTCCAGATAGA CAACTCTAAGGACACTGATATTTCCCAGCCACATTATCAACGAAGCGATCAACCATCGTT AGACTCCCAGAAGCTGTTCATGCCTGAAAATGATGATAATGATAAGTATAAACGACATCT AACATTGTCATGGTTCACGCGCTCCTTCGGAGGCATGCATCATACTTTACACGTTTATCG GTTATTCGACGAAATCGTCTTACTCTATTAATTATGGGTTGTATAATATCTATTTTCCTA CTGGGTTTCTATGGTTCTCAACCGGATATCACTGGTGACCCATTATTAGATCCTCATATG AATCCAAATATTCGTTTTAATTTGGAACCTATAGATTCAATAAAAGGAGCCTTAAATAAT GATAATAATAATAATCTTAATAACCATAGAGATAGAGGTGTTATTGATGGGTTGAATGAA GTCTAATTCTATAGTAAGATGGTATTTCTTCTAAACACTATCTTCCTTATTGTGATTCGA ACCAATGAACACTTTAGCTCGATGTAACTCGTCATTTTATCTTTTATTGTCTAGTTTATA ATTTTTCTTATTTCTTGTTATTCAAATCGTTAGACGTTTTCAAACTTTCAATGGATGACT TGTTGTTCATCTTCTGTTTAGTTAGATTCGAATGTGCATGTCTGATCGTCTGTTAATCGT ATATTTTGATAATTTTTATATTTTTCCTACTCACTCCTGATTATCACCAATGTAATACTA TCTTTGTATAACCTTATTTTAATGACTGTATGCTGGTGAATAGTGGTTAATTCGCCTTCC TTTATGTTTTAATAAATCCCTGTAACTTATTATCCAATAAAAACTGATATTCAAGTTTAT GCTTCTGTCCCTGAGTTCCTTCCTTAGCTAATATATAGTAACCAACATTCGCTTAGGTTT TGTATTAGTGATCAGATATGTACAAGATATTTTACACTATTTAAAAAAAAAAAAAAAAAA AAAAAAAAACATGCCATGCAGCT



consensusID : consensus_10147#1
NCBI blastX ! send the sequence to the NCBI site !
NCBI blastN ! send the sequence to the NCBI site !
Sequences nbr = 2
consensus length = 490
fasta sequence
                              [TGGGTTGAATGAAGTCTAATTCTATAGTAAGATGGTATTTCTTCTAAACACTATCTTCCTTATTGTGATTCGAACCAATGAACACTTTAGCTCGATGTAACTCGTCATTTTATCTTTTATTGTCTAGTTTGTAATTTTTCTTATTTCTTGTTATTCAAATCGTTAGACGTTTTCAAACTTTCAATGGACGACTTGTTGTTCATCTTCTGTTTAGTTAGATTCGAATGTACATGTCTGATCGTCTGTTAATCGTATATTTTGATAATTTTTATATTTTTCCTACTCACTCCTGATTATCACTAATGTAATACTATCTTTGTATAACCTTATTTTAATGACTGTATGCTGGTGAATAGTGGTTAATTCGCCTTCCTTTATGTTTTAATAAATCCCTGTAACTTATTATCCAATAAAAACTGATATTCAAAAAAAAAAAAAAAAAAAAAAAAAAAAAAAAAACTGCCATGCAGCTGCATTACCGTACTGCGTA]

[-] EMBL AI977192             [TGGGTTGAATGAAGTCTAATTCTATAGTAAGATGGTATTTCTTCTAAACACTATCTTCCTTATTGTGATTCGAACCAATGAACACTTTAGCTCGATGTAACTCGTCATTTTATCTTTTATTGTCTAGTTTGTAATTTTTCTTATTTCTTGTTATTCAAATCGTTAGACGTTTTCAAACTTTCAATGGACGACTTGTTGTTCATCTTCTGTTTAGTTAGATTCGAATGTACATGTCTGATCGTCTGTTAATCGTATATTTTGATAATTTTTATATTTTTCCTACTCACTCCTGATTATCACTAATGTAATACTATCTTTGTATAACCTTATTTTAATGACTGTATGCTGGTGAATAGTGGTTAATTCGCCTTCCTTTATGTTTTAATAAATCCCTGTAACTTATTATCCAATAAAAACTGATATTCAAAAAAAAAAAAAAAAAAAAAAAAAAAAAAAAAACTGCCATGCAGCTGCATTACCGTACTGCGTA]
[+] EMBL CD141362             [TGGGTTGAATGAAGTCTAATTCTATAGTAAGATGGTATTTCTTCTAAACACTATCTTCCTTATTGTGACTCGAACCAATGAACACTTTAGCTCGATGTAACTCGTCATTTTATCTTTTATTGTCTAGTTTGTAATTTTTCTTATTTCTTGTTATTCAAATCGTTAGACGTTTTCAAACTTTCAATGGACGACTTGTTGTTCATCTTCTGTTTAGNTAGATTCGAATGTACATGTCTGATCGNCTG                                                                                                                                                                                                                                                     ]


>consensus_10147#1 TGGGTTGAATGAAGTCTAATTCTATAGTAAGATGGTATTTCTTCTAAACACTATCTTCCT TATTGTGATTCGAACCAATGAACACTTTAGCTCGATGTAACTCGTCATTTTATCTTTTAT TGTCTAGTTTGTAATTTTTCTTATTTCTTGTTATTCAAATCGTTAGACGTTTTCAAACTT TCAATGGACGACTTGTTGTTCATCTTCTGTTTAGTTAGATTCGAATGTACATGTCTGATC GTCTGTTAATCGTATATTTTGATAATTTTTATATTTTTCCTACTCACTCCTGATTATCAC TAATGTAATACTATCTTTGTATAACCTTATTTTAATGACTGTATGCTGGTGAATAGTGGT TAATTCGCCTTCCTTTATGTTTTAATAAATCCCTGTAACTTATTATCCAATAAAAACTGA TATTCAAAAAAAAAAAAAAAAAAAAAAAAAAAAAAAAAACTGCCATGCAGCTGCATTACC GTACTGCGTA



consensusID : consensus_10147#2
NCBI blastX ! send the sequence to the NCBI site !
NCBI blastN ! send the sequence to the NCBI site !
Sequences nbr = 4
consensus length = 348
fasta sequence
                              [TTCGAAACGTAACCAAAATGATTCTCGATTTATTCTGAGGATTTCATTTCTATATACACAAAAACTACGTCAGAAGTTGAAAGAATATTTGAGCCCCTGTATGTCTTAAAACTAGCAATCTTTTCATTTAAAAATCAACATAGTATAAAATAACTTTCCTCGTATGTATGTACAGTTATTATTTATATTATTATGGCTATTTATCTTCTTCTCCAGGAGGCATGCATCATACTTTACACGTTTATCGGTTATTCGACGAAATCGTCTTACTCTATTAATTATGGGTTGTATAATATCTATTTTCCTACTGGGTTTCTATGGTTCTCAACCGGATATCACTGGTGACCC]

[-] EMBL CD070136             [TTCGAAACGTAACCAAAATGATTCTCGATTTATTCTGAGGATTTCATTTCTATATACACAAAAACTACGTCAGAAGTTGAAAGAATATTTGAGCCCCTGTATGTCTTAAAACTAGCAATCTTTTCATTTAAAAATCAACATAGTATAAAATAACTTTCCTCGTATGTATGTACAGTTATTATTTATATTATTATGGCTATTTATCTTCTTCTCCAGGAGGCATGCATCATACTTTACACGTTTATCGGTTATTCGACGAAATCGTCTTACTCTATTAATTATGGGTTGTATAATATCTATTTTCCTACTGGGTTTCTATGGTTCTCAACCGGATATCACTGGTGACCC]
[-] EMBL CD070073             [      ACGTAACCAAAATGATTCTCGATTTATTCTGAGGATTTCATTTCTATATACACAAAAACTACGTCAGAAGTTGAAAGAATATTTGAGCCNCTGTATGTCTTAAAACTAGCAATCTTTTCATTTAAAAATCAACATAGTATAAAATAACTTTCCTCGTATGTATGTACAGTTATTATTTATATTATTATGGCTATTTATCTTCTTCTCCAGGAGGCATGCATCATACTTTACACGTTTATCGGTTATTCGACGAAATCGTCTTACTCTATTAATTATGGGTTGTATAATATCTATTTTCCTACTGGGTTTCTATGGTTCTCAACCGGATATCACTGGTGACCC]
[-] EMBL CD070077             [          AACCAAAATGATTCTCGATTATTTCTGAGGATTTCATTTCTATATACACAAAAACTACGTCAGAAGTTGAAAGAATATNTGAGCCCCTGTATGTCTTAAAACTAGCAATCTTTTCATTTAAAAATCAACACAGTATAAAATAACTTTCCTCGTATGTATGTACAGTTATTATTTATATTATTATGGCTATTTATCTTCTTCTCCAGGAGGCATGCATCATACTTTACACGTTTATCGGTTATTCGACGAAATCGTCTTACTCTATTAATTATGGGTTGTATAATATCTATTTTCCTACTGGGTTTCTATGGTTCTCAACCGGATATCACTGGTGACCC]
[-] EMBL CD070141             [           nCCAAAATGATTCTCGATTATTTCTGAGGATTTCATTTCTATATACACAAAANCTACGTCAGAAGTTGAAAGAATATTTGAGCCCCTGTATGTCTTAAAACTAGCAATCTTTTCATTTAAAAATCAACACAGTATAAAATAACTTTCCTCGTATGTATGTACAGTTATTATTTATATTATTATGGCTATTTATCTTCTTCTCCAGGAGGCATGCATCATACTTTACACGTTTATCGGTTATTCGACGAAATCGTCTTACTCTATTAATTATGGGTTGTATAATATCTATTTTCCTACTGGGTTTCTATGGTTCTCAACCGGATATCACTGGTGACCC]


>consensus_10147#2 TTCGAAACGTAACCAAAATGATTCTCGATTTATTCTGAGGATTTCATTTCTATATACACA AAAACTACGTCAGAAGTTGAAAGAATATTTGAGCCCCTGTATGTCTTAAAACTAGCAATC TTTTCATTTAAAAATCAACATAGTATAAAATAACTTTCCTCGTATGTATGTACAGTTATT ATTTATATTATTATGGCTATTTATCTTCTTCTCCAGGAGGCATGCATCATACTTTACACG TTTATCGGTTATTCGACGAAATCGTCTTACTCTATTAATTATGGGTTGTATAATATCTAT TTTCCTACTGGGTTTCTATGGTTCTCAACCGGATATCACTGGTGACCC



consensus multiple alignement with clustalw

CLUSTAL W (1.82) multiple sequence alignment


consensus_10147#0      GAGGCGTGACGTTACGGATATATTGGGGAGCCCTCAAAAAACAATAGGATTCCAGATAGA 60
consensus_10147#1      ------------------------------------------------------------
consensus_10147#2      ------------------------------------------------------------
                                                                                   

consensus_10147#0      CAACTCTAAGGACACTGATATTTCCCAGCCACATTATCAACGAAGCGATCAACCATCGTT 120
consensus_10147#1      ------------------------------------------------------------
consensus_10147#2      ------------------------------------------------------------
                                                                                   

consensus_10147#0      AGACTCCCAGAAGCTGTTCATGCCTGAAAATGATGATAATGATAAGTATAAACGACATCT 180
consensus_10147#1      ------------------------------------------------------------
consensus_10147#2      ------------------------------------------------------------
                                                                                   

consensus_10147#0      AACATTGTCATGGTTCACGCGCTCCTTCGGAGGCATGCATCATACTTTACACGTTTATCG 240
consensus_10147#1      ------------------------------------------------------------
consensus_10147#2      ------------------------------------------------------------
                                                                                   

consensus_10147#0      GTTATTCGACGAAATCGTCTTACTCTATTAATTATGGGTTGTATAATATCTATTTTCCTA 300
consensus_10147#1      ------------------------------------------------------------
consensus_10147#2      ------------------------------------------------------------
                                                                                   

consensus_10147#0      CTGGGTTTCTATGGTTCTCAACCGGATATCACTGGTGACCCATTATTAGATCCTCATATG 360
consensus_10147#1      ------------------------------------------------------------
consensus_10147#2      ------------------------------------------------------------
                                                                                   

consensus_10147#0      AATCCAAATATTCGTTTTAATTTGGAACCTATAGATTCAATAAAAGGAGCCTTAAATAAT 420
consensus_10147#1      ------------------------------------------------------------
consensus_10147#2      ------------------------------------------------------------
                                                                                   

consensus_10147#0      GATAATAATAATAATCTTAATAACCATAGAGATAGAGGTGTTATTGATGGGTTGAATGAA 480
consensus_10147#1      -----------------------------------------------TGGGTTGAATGAA 13
consensus_10147#2      ------------------------------------------------------------
                                                                                   

consensus_10147#0      GTCTAATTCTATAGTAAGATGGTATTTCTTCTAAACACTATCTTCCTTATTGTGATTCGA 540
consensus_10147#1      GTCTAATTCTATAGTAAGATGGTATTTCTTCTAAACACTATCTTCCTTATTGTGATTCGA 73
consensus_10147#2      ----------------------------TTCGAAACGTAACCAAAATGATTCTCGATTTA 32
                                                   *** ****   * *    * *** *   *  *

consensus_10147#0      ACCAATGAACACTTTAGCTCGATGTAACTCGTCATTTTATCTTTTATTGTCT-AGTTTAT 599
consensus_10147#1      ACCAATGAACACTTTAGCTCGATGTAACTCGTCATTTTATCTTTTATTGTCT-AGTTTGT 132
consensus_10147#2      TTC--TGAGGATTTCATTTCTATATACACAAAAACTACGTCAGAAGTTGAAAGAATATTT 90
                         *  ***  * ** *  ** ** **       * *   **     ***    * * * *

consensus_10147#0      AATTTTTCTTATTTCTTGTTATTCA-AATCGTTAGACGTTTTCAAACTTTCAATGGATGA 658
consensus_10147#1      AATTTTTCTTATTTCTTGTTATTCA-AATCGTTAGACGTTTTCAAACTTTCAATGGACGA 191
consensus_10147#2      GAGCCCCTGTATGTCTTAAAACTAGCAATCTTT--TCATTTAAAAATCAACATAGTATAA 148
                        *       *** ****   * *   **** **   * ***  ***    **  * *  *

consensus_10147#0      CTTGTTGTTCATCTTCTGTTTAGTTAGATTCGAATGTGCATGTCTGATCGTCTGTTAATC 718
consensus_10147#1      CTTGTTGTTCATCTTCTGTTTAGTTAGATTCGAATGTACATGTCTGATCGTCTGTTAATC 251
consensus_10147#2      AATAACTTTCCTCGTATGTATGTACAGTT---ATTATTTATATTATTATGGCTATTTATC 205
                         *    *** ** * *** *    ** *   * * *  ** *      * ** ** ***

consensus_10147#0      GTATATTTTGATAATTTTTATATTTTTCCTACTCACTCCTGATTATCACCAATGTAATAC 778
consensus_10147#1      GTATATTTTGATAATTTTTATATTTTTCCTACTCACTCCTGATTATCACTAATGTAATAC 311
consensus_10147#2      TTCTTCTCCAGGAG-----GCATGCATCATACTT-TACACGTTTATCGGTTATTCGACGA 259
                        * *  *     *        **   ** ****    *  * *****    **   *   

consensus_10147#0      TATCTTTGTATAACCTTATTTTAATGACTGTATGCTGGTGAATAGTGGTTAATTCGCCTT 838
consensus_10147#1      TATCTTTGTATAACCTTATTTTAATGACTGTATGCTGGTGAATAGTGGTTAATTCGCCTT 371
consensus_10147#2      AATCGT--------CTTACTCTATTAATTATGGGTTGTATAATA----TCTATTTTCCTA 307
                        *** *        **** * ** * * * *  * **   ****    *  ***  *** 

consensus_10147#0      CCTTTATGTTTTAATAAATCCCTGTAACTTATTATCCAATAAAAACTGATATTCAAGTTT 898
consensus_10147#1      CCTTTATGTTTTAATAAATCCCTGTAACTTATTATCCAATAAAAACTGATATTCAAAAAA 431
consensus_10147#2      C---TGGGTTTCTATGGTTCTC---AACCGGATATC-ACTGGTGACCC------------ 348
                       *   *  ****  **   ** *   ***    **** * *    **              

consensus_10147#0      ATGCTTCTGTCCCTGAGTTCCTTCCTTAGCTAATATATAGTAACCAACATTCGCTTAGGT 958
consensus_10147#1      AAAAAAAAA-----AAA----------AAAAAAAAAAAAAAAACTGCCATGCAGCTGCAT 476
consensus_10147#2      ------------------------------------------------------------
                                                                                   

consensus_10147#0      T-TTGTATTAGTGATCAGATATGTACAAGATATTTTACACTATTTAAAAAAAAAAAAAAA 1017
consensus_10147#1      TACCGTACTGCGTA---------------------------------------------- 490
consensus_10147#2      ------------------------------------------------------------
                                                                                   

consensus_10147#0      AAAAAAAAAAAACATGCCATGCAGCT 1043
consensus_10147#1      --------------------------
consensus_10147#2      --------------------------
                                                 




Copyright Thu Nov 6 12:32:27 CET 2003 Hubert Wassner    (hubert.wassner@noos.fr)