Home
Who am I
Technology
EST Assembly
Contact

These datas are free for academic use only, please contact me for any other use.

Schistosoma mansoni
cluster # 10150 cluster # 10150       Sequences # 13       consensus # 2


see consensus multiple alignment with clustalw

Direct access to contigs :
consensus_10150#0 length = 1754 sequences # 12  
consensus_10150#1 length = 577 sequences # 1  

consensusID : consensus_10150#0
NCBI blastX ! send the sequence to the NCBI site !
NCBI blastN ! send the sequence to the NCBI site !
Sequences nbr = 12
consensus length = 1754
fasta sequence
                              [ACTACTAGTAGTAGTATTAGTAGTACTGTTTAAATGATTGGCATGATTCATACAACTTACTTCTGATTTTGTCACTGTTATAGTCTTACATAATAAAGTTGATGGTATTGAAGCTGATGGTAAACAATCTAAATCAACAATATCAGGTAATGTTTTTTGAGTAGGCGTATCAATTTTTTGAATAATTACCATTGATTCCGATGATAAATTATAATTGGAATTGATACATTGTTGTGAAATAACATAATGTTTATTAGGGGGTACAGGTGTAGTAAGCGGACTATCAGTTGTAGCAGTGATGATAGGTTTATCAAGATTAGTAATTGAATTTGTTGTGAAGTGATTGACAAGATTTTCATATACACCACTTCTATAATCATCTATTTGTTCGTGCTGTTCACATGAATCAAAATAGTCATGTCTATTACTTAAATGTGGCAAATCTGGAGGTCCAAGTTTGAAAGCTAGTTCAGGTTCCATATTCACTGAGGAGGTTAGATTTGTATTCAATACATTTTGATTAGAATGATTATTGGATACAACAGATGATAAAATAAATAAAGGTTGGTCAACTTTTAAATCTTGGGTATATGGTGTTGGTGTTAATAATGTACACTGCTTTTGGCCTGTGTTATTAATAGGAGAAAAATTTTCCGAAGTATTTGAATTTATAACAGTTGTATGCGGGAAAGAATGATTTAACGATGTATTCATATAAGTATTATTGTCAACTAAATGTGTATCATTCAAATTTGCACAATCCACCGGTAATGTTATTTGATTATTAGATGAATGTTGAATAATGTAGGGCATAGAAGATTGTTTTGATACTAAAATATTATTTACGTGATCAGGAGGATGGCTAGTTGATTTTGGTAAATTAGTAAATATTGCCTTTGAGTTTATAACACTATTATTACAGGTGAATGGGGCAACTGAGGAGGAGCACAGACTTGGTTGATGTGATGATCTGGGATAATGAATTAGTTGGGAATTAGAGGGGGAATTAGGTTTTGTAGCTGATGATATGTGAGAAACAAGAACAGGTTGGATATGAGGCAAATATTCATTTTCCACTGAGTTTATCGATGAAATTAATGAATTAGGTGGTAAACTCATTGAGCTTACCGGTCTCATATGAGTTTCTGTTACGGTATTTATTGAATTTCGAGGATGAATACCAAATGTAGACTGCGGTTCAACGACAAATCTCACATTTGATTG-AATATCAATTTGATCAAATTTCTGTTTATCATCGTCAGTTGGTTGACAAATTTGATCACAACCATTGTTATTGTTTATATTTTTTATATTTGCAATGGGAGATTGATCCACATCATTCTCATCATCATCGTCTTCATCATCTTCGTCGACACCACCATCGTTCTCGTTTTCTTCGCTTCTCATATTTGAGCAAGGCTGTGACGGGATAACGCCAGATCCGTCATTACAATTCGATCTCATGCGGCGATTTGTTAACCTTTCCATATCAGAATTGCTAAGGAATTCATTTGCACGATGATG-TTTTTTTAATCTTTGTAAAGCATGCTCCACCGTAACACTAGCATACTGATAAAGACGATTGCTGCGTGTGAATACTAGTAAAGCGATTTCGCATTCACACAATACGCTCAACTCGTATGCCTTTTTAAATAGACCACTTTTACGCTTTGCAAATGTGACCAGTCGATTCTTTTCATCTTTGATAAATTTTATCTCGATTTTTTTACGTCCCATTTCCAAGGCAAAGATTC]

[+] EMBL CD062016             [ACTACTAGTAGTAGTATTAGTAGTACTGTTTAAATGATTGGCATGATTCATACAACTTACTTCTGATTTTGTCACTGTTATAGTCTTACATAATAAAGTTGATGGTATTGAAGCTGATGGTAAACAATCTAAATCAACAATATCAGGTAATGTTTTTTGAGTAGGCGTATCAATTTTTTGAATAATTACCATTGATTCCGATGATAAATTATAATTGGAATTGATACATTGTTGTGAAATAACATAATGTTTATTAGGGGGTACAGGTGTAGTAAGCGGACTATCAGTTGTAGCAGTGATGATAGGTTTATCAAGATTAGTAATTGAATTTGTTGTGAAGTGATTGACAAGATTTTCATATACACCACTTCTATAATCATCTATTTGTTCGTGCTGTTCACATGAATCAAAATAGTCATGTCTATTACTTAAATGTGGCAAATCTGGAGGTCCAAGTTTGAAAGCTAGTTCAGGTTCCATATTCACTGAGGAGGTTAGATTTGTATTCAATACATTTTGATTAGAATGATTATTGGATACAACAGATGATAAAATAAA                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                              ]
[-] EMBL CD096385             [                                                                                                                                                                                                                                                                                        CTATCAGTTGTAGCAGTGATGATAGGTTTATCAAGATTAGTAATTGAATTTGTCGTGAAGTGATTGACAAGATTTTCATATACACCACTTCTATAATCATCTATTTGTTCGTGCTGTTCACATGAATCAGAATAGTCATGTCTATTACTTAAATGTGGCAAATCTGGAGGTCCAAGTTTGAAAGCTAGTTCAGGTTCCATATTCACTGAGGAGGTTAGATTTGTATTCAATACATTTTGATTGGAATGATTATTGGATACAACAGATGATAAAATAAATAAAGGTTGGTCAACTTTTAAATCTTGGGTATATGGTGTTGGTGTTAATAATGTACACTGCTTTTGGCCTGTGTTATTAATAGGAGAAAAATTTTCCGAAGTATTTGAATTTATAACAGTTGTATGCGGGAAAG                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                        ]
[-] EMBL CD159551             [                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                              TAATGTACACTGCATTTGGCCTGTGTTATTAATAGGAGAAAAATTTTCCGAAGTATTTGAATTTATAACAGTTGTATGCGGGAAAGAATGATTTAACGATGTATTCATATAAGTATTATTGTCAACTAAATGTGTATCATTCAAATTTGCACAATCCACCGGTAATGTTATCTGATTATTAGATGAATGTTGAATAATGTAGGGCATAGAAGATTGTTTTGATACTAAAATATTATTTACGTGATCAGGAGGATGGCTAGTTGATTTTGGTGAATTAGTAAATATTGCCTTTGAGTTTATAACACTATTATTACAGGTGAATGGGGCAACTGAGGAGGAGCACAGACTTGGTTGATGTGATGATCTGGGATAATG                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                       ]
[+] EMBL CD066864             [                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                            TCCGAAGTATTTGAATTTATAACAGTTGTATGCGGGAAAGAATGATTTAACGATGTATTCATATAAGTATTATTGTCAACTAAATGTGTATCATTCAAATTTGCACAATCCACCGGTAATGTTATTTGATTATTAGATGAATGTTGAATAATGTAGGGCATAGAAGATTGTTTTGATACTAAAATATTATTTACGTGATCAGGAGGATGGCTAGTTGATTTTGGTAAATTAGTAAATATTGCCTTTGAGTTTATAACACTATTATTACAGGTGAATGGGGCAACTGAGGAGGAGCACAGACTTGGTTGATGTGATGATCTGGGATAATGAATTAGTTGGGAATTAGAGGGGGAATTAGGTTTTGTAGCTGATGATATGTGAGAAACAAGAACAGGTTGGATATGAGGCAAATATTCATTTTCCACTGAGTTTATCGATGAA                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                       ]
[+] EMBL CD066928             [                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                            TCCGAAGTATTTGAATTTATAACAGTTGTATGCGGGAAAGAATGATTTAACGATGTATTCATATAAGTATTATTGTCAACTAAATGTGTATCATTCAAATTTGCACAATCCACCGGTAATGTTATTTGATTATTAGATGAATGTTGAATAATGTAGGGCATAGAAGATTGTTTTGATACTAAAATATTATTTACGTGATCAGGAGGATGGCTAGTTGATTTTGGTAAATTAGTAAATATTGCCTTTGAGTTTATAACACTATTATTACAGGTGAATGGGGCAACTGAGGAG                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                             ]
[-] EMBL CD149503             [                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                      GACTTGGTTGATGTGATGATCTGGGATAAAGAATTAGTTGGG ATTAGAGGGGGGAATAGGTTTTGTAGCTGATGATATGTGAGAAACAAGAACAGGTTGGATATGAGGCAAATATTCATTTTCCACTGAGTTTATCGATGAAATTAATGAATTAGGTGGTAAACTCATTGAGCTTACCGGTCTCATATGAGTTTCTGTTACGGTATTTATTGAATTTCGAGGATGAATACCAAATGTAGACTGCGGTTCAACGACAAATCTCACATTTGATTG AATATCAATTTGATCAAATTTCTGTTTATCATCGTCAGTTGGTTGACAAATTTGATCACAACCATTGTTATTGTTTATATTTTTTATATTTGCAATGGGAGATTGATCCACATCATTCTCATCATCATCGTCTTCATCATCTTCGTCGACACCACCATCGTTCTCGTTTTCTTCGCTTCTCATATTTGAGCAAGGCTGTGACGGGATAACGCCAGATCCGTCATT                                                                                                                                                                                                                                                                                                                  ]
[+] EMBL CD095877             [                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                          TGGTTGATGTGATGATCTGGGATAATGAATTAGTTGGGAATTAGAGGGGGAATTAGGTTTTGTAGCTGATGATATGTGAGAAACAAGAACAGGTTGGATATGAGGCAAATATTCATTTTCCACTGAGTTTATCGATGAAATTAATGAATTAGGTGGTAAACTCATTGAGCTTACCGATCTCATATGAGTTTCTGTTACGGTATTTATTGAATTTCGAGGATGAATACCAAATGTAGACTGCGGTTCAACGACAAATCTCACATTTGATTG AATATCAATTTGATCAAATTTCTGTTTATCATCGTCAGTTGGTTGACAAATTTGATCACAACCATTGTTATTGTTTATATTTTTTATATTTGCAATGGGAGATTGATCCACATCATTCTCATCATCATCGTCTTCATCATCTTCGTCGACACCACCATCGTTCTCGTTTTCTTCGCTTCTCATATTTGAGCAAGGCTGTGACGGGATAACGCCAGATCCGTCATTACAATTCGATCTCATGCGGCGATTTGTTAACCTTTCCATATCAGAATTGCTAAGGAATTCATTTGCACGATGATGTTTTTTTTAATCTTTG                                                                                                                                                                                                                       ]
[+] EMBL CD166093             [                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                 AACAGGTTGGATATGAGGCAAATATTCATTTTCCACTGAGTTTATCGATGAAATTAATGAATTAGGTGGTAAACTCATTGAGCTTACCGGTCTCATATGAGTTTCTGTTACGGTATTTATTGAATTTCGAGGATGAATACCANATGTAGACTGCGGTTCAACGACAAATCTCACATTTGATTGAAATATC ATTTGATCAAATTTCTGTTTATCATCGTCAGTTGGTTGACAAAT                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                ]
[-] EMBL CD152327             [                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                    AACCATTGTTATTGTTTATATTTTTTATATTTGCAATGGGAGATTGATCCACATCATTCTCATCATCATCGTCTTCATCATCTTCGTCGACACCACCATCGTTCTCGTTTTCTTCGCTTCTCATATTTGAGCAAGGCTGTGACGGGATAACGCCAGATCCGTCATTACAATTCGATCTCATGCGGCGATTTGTTAACCTTTCCATATCAGAATTGCTAAGGAATTCATTTGCACGATGATGTTTTTTTTAATCTTTGTAGAGCATGCTCCACCGTAACACTAGCATACTGATAAAGACGATTGCTGCGTGTGAATACTAGTAAAGCGATTTCGCATTCACACAATACGCTCAACTCGTATGCCTTTTTAAATAGACCACTTTTACGCTTTGCAAATGTGACCAGTCGATTCTTTTCATCTTTGATAAATTTTATCTCGAT                                ]
[-] EMBL AI976213             [                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                  ATCCACATCATTCTCATCATCATCGTCTTCATCATCTTCGTCGACACCACCATCGTTCTCGTTTTCTTCGCTTCTCATATTTGAGCAAGGCTGTGACGGGATAACGCCAGATCCGTCATAACAATTCGATCTCATGCGGCGATTTGATAACCTTTCCAGATCAGAATTGCTAAGGAATTCATTTGCACGAGGATG TTTTTATAATCTTTGTAAAGCATGCTCCACGGTAACTCTAGCATACTGATAAAGACGATTGCTGCGTGTGAATACTAGTAAAGCGATTTCGCATTCACACAATACGCTCAACTCGTATGCCTTTTTAAATAGACCACTTTTACGCTTTGCAAATGTGACCAGTCGATTCTTTTCATCTTTGATAAATTTTATCTAGATTTTTTTACGTCCCATTTCCAAGGCAAAGATTC]
[-] EMBL CD066933             [                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                        GTTCTCGTNTTCTTCGCTTCTCATATTTGAGCAAGGCTGTGACGGGATAACGCCAGATCCGTCATTACAATTCGATCTCATGCGGCGATTTGTTAACCTTTCCATATCAGAATTGCTAAGGAATTCATTTGCCCGATGATG TTTTTTTAATCTTTGTAAAGCATGCTCCACCGTAACACTAGCATACTGATAAAGACGATTGCTGCGTGTGAATACTAGTAAAGCGATTTCGCATTCACACAATACGCTCAACTCGTATGCCTTTTTAAATAGACCACTTTTACGCTTTGCAAATGTGACCAGTCGATTCTTTTCATCTTTGATAAATTTTATCTCGATTTTTTTACGTCCCATTTCCAA           ]
[-] EMBL CD066858             [                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                    GGATAACGCCAGATCCGTCATTACAATTCGATCTCATGCGGCGATTTGTTAACCTTTCCATATCAGAATTGCTAAGGAATTCATTTGCACGATGATG TTTTTTTAATCTTTGTAAAGCATGCTCCACCGTAACACTAGCATACTGATAAAGACGATTGCTGCGTGTGAATACTAGTAAAGCGATTTCGCATTCACACAATACGCTCAACTCGTATGCCTTTTTAAATAGACCACTTTTACGCTTTGCAAATGTGACCAGTCGATTCTTTTCATCTTTGATAAATTTTATCTCGATTTTTTTACGTCCCATTTCCAA           ]


>consensus_10150#0 ACTACTAGTAGTAGTATTAGTAGTACTGTTTAAATGATTGGCATGATTCATACAACTTAC TTCTGATTTTGTCACTGTTATAGTCTTACATAATAAAGTTGATGGTATTGAAGCTGATGG TAAACAATCTAAATCAACAATATCAGGTAATGTTTTTTGAGTAGGCGTATCAATTTTTTG AATAATTACCATTGATTCCGATGATAAATTATAATTGGAATTGATACATTGTTGTGAAAT AACATAATGTTTATTAGGGGGTACAGGTGTAGTAAGCGGACTATCAGTTGTAGCAGTGAT GATAGGTTTATCAAGATTAGTAATTGAATTTGTTGTGAAGTGATTGACAAGATTTTCATA TACACCACTTCTATAATCATCTATTTGTTCGTGCTGTTCACATGAATCAAAATAGTCATG TCTATTACTTAAATGTGGCAAATCTGGAGGTCCAAGTTTGAAAGCTAGTTCAGGTTCCAT ATTCACTGAGGAGGTTAGATTTGTATTCAATACATTTTGATTAGAATGATTATTGGATAC AACAGATGATAAAATAAATAAAGGTTGGTCAACTTTTAAATCTTGGGTATATGGTGTTGG TGTTAATAATGTACACTGCTTTTGGCCTGTGTTATTAATAGGAGAAAAATTTTCCGAAGT ATTTGAATTTATAACAGTTGTATGCGGGAAAGAATGATTTAACGATGTATTCATATAAGT ATTATTGTCAACTAAATGTGTATCATTCAAATTTGCACAATCCACCGGTAATGTTATTTG ATTATTAGATGAATGTTGAATAATGTAGGGCATAGAAGATTGTTTTGATACTAAAATATT ATTTACGTGATCAGGAGGATGGCTAGTTGATTTTGGTAAATTAGTAAATATTGCCTTTGA GTTTATAACACTATTATTACAGGTGAATGGGGCAACTGAGGAGGAGCACAGACTTGGTTG ATGTGATGATCTGGGATAATGAATTAGTTGGGAATTAGAGGGGGAATTAGGTTTTGTAGC TGATGATATGTGAGAAACAAGAACAGGTTGGATATGAGGCAAATATTCATTTTCCACTGA GTTTATCGATGAAATTAATGAATTAGGTGGTAAACTCATTGAGCTTACCGGTCTCATATG AGTTTCTGTTACGGTATTTATTGAATTTCGAGGATGAATACCAAATGTAGACTGCGGTTC AACGACAAATCTCACATTTGATTGAATATCAATTTGATCAAATTTCTGTTTATCATCGTC AGTTGGTTGACAAATTTGATCACAACCATTGTTATTGTTTATATTTTTTATATTTGCAAT GGGAGATTGATCCACATCATTCTCATCATCATCGTCTTCATCATCTTCGTCGACACCACC ATCGTTCTCGTTTTCTTCGCTTCTCATATTTGAGCAAGGCTGTGACGGGATAACGCCAGA TCCGTCATTACAATTCGATCTCATGCGGCGATTTGTTAACCTTTCCATATCAGAATTGCT AAGGAATTCATTTGCACGATGATGTTTTTTTAATCTTTGTAAAGCATGCTCCACCGTAAC ACTAGCATACTGATAAAGACGATTGCTGCGTGTGAATACTAGTAAAGCGATTTCGCATTC ACACAATACGCTCAACTCGTATGCCTTTTTAAATAGACCACTTTTACGCTTTGCAAATGT GACCAGTCGATTCTTTTCATCTTTGATAAATTTTATCTCGATTTTTTTACGTCCCATTTC CAAGGCAAAGATTC



consensusID : consensus_10150#1
NCBI blastX ! send the sequence to the NCBI site !
NCBI blastN ! send the sequence to the NCBI site !
Sequences nbr = 1
consensus length = 577
fasta sequence
                              [TTTTGATACTAAAATATTATTTACGTGATCAGGAGGATGGCTAGTTGATTTTGGTAAATTAGTAAATATTGCGTTCAGGTTCCATATTCACTGAGGAGGTTAGATTTGTATTCAATACATTTTGATTAGAATGATTATTGGATACAACAGATGATAAAATAAATAAAGGTTGGTCAACTTTTAAATCTTGGGTATATGGTGTTGGTGTTAATAATGTACACTGCATTTGGCCTGTGTTATTAATAGGAGAAAAATTTTCCGAAGTATTTGAATTTATAACAGTTGTATGCGGGAAAGAATGATTTAACGATGTATTCATATAAGTATTATTGTCAACTAAATGTGTATCATTCAAATTTGCACAATCCACCGGTAATGTTATTTGATTATTAGATGAATGTTGAATAATGTAGGGCATAGAAGATTGTTTTGATACTAAAATATTATTTACGTGATCAGGAGGATGGCTAGTTGATTTTGGTAAATTAGTAAATATTGCGTTCAGGTTCCATATTCACTGAGGAGGTTAGATTTGTATTCAATACATTTTGATTAGAATGATTATTGGATACANCAG]

[+] EMBL CD116201             [TTTTGATACTAAAATATTATTTACGTGATCAGGAGGATGGCTAGTTGATTTTGGTAAATTAGTAAATATTGCGTTCAGGTTCCATATTCACTGAGGAGGTTAGATTTGTATTCAATACATTTTGATTAGAATGATTATTGGATACAACAGATGATAAAATAAATAAAGGTTGGTCAACTTTTAAATCTTGGGTATATGGTGTTGGTGTTAATAATGTACACTGCATTTGGCCTGTGTTATTAATAGGAGAAAAATTTTCCGAAGTATTTGAATTTATAACAGTTGTATGCGGGAAAGAATGATTTAACGATGTATTCATATAAGTATTATTGTCAACTAAATGTGTATCATTCAAATTTGCACAATCCACCGGTAATGTTATTTGATTATTAGATGAATGTTGAATAATGTAGGGCATAGAAGATTGTTTTGATACTAAAATATTATTTACGTGATCAGGAGGATGGCTAGTTGATTTTGGTAAATTAGTAAATATTGCGTTCAGGTTCCATATTCACTGAGGAGGTTAGATTTGTATTCAATACATTTTGATTAGAATGATTATTGGATACANCAG]


>consensus_10150#1 TTTTGATACTAAAATATTATTTACGTGATCAGGAGGATGGCTAGTTGATTTTGGTAAATT AGTAAATATTGCGTTCAGGTTCCATATTCACTGAGGAGGTTAGATTTGTATTCAATACAT TTTGATTAGAATGATTATTGGATACAACAGATGATAAAATAAATAAAGGTTGGTCAACTT TTAAATCTTGGGTATATGGTGTTGGTGTTAATAATGTACACTGCATTTGGCCTGTGTTAT TAATAGGAGAAAAATTTTCCGAAGTATTTGAATTTATAACAGTTGTATGCGGGAAAGAAT GATTTAACGATGTATTCATATAAGTATTATTGTCAACTAAATGTGTATCATTCAAATTTG CACAATCCACCGGTAATGTTATTTGATTATTAGATGAATGTTGAATAATGTAGGGCATAG AAGATTGTTTTGATACTAAAATATTATTTACGTGATCAGGAGGATGGCTAGTTGATTTTG GTAAATTAGTAAATATTGCGTTCAGGTTCCATATTCACTGAGGAGGTTAGATTTGTATTC AATACATTTTGATTAGAATGATTATTGGATACANCAG



consensus multiple alignement with clustalw

CLUSTAL W (1.82) multiple sequence alignment


consensus_10150#0      ACTACTAGTAGTAGTATTAGTAGTACTGTTTAAATGATTGGCATGATTCATACAACTTAC 60
consensus_10150#1      ------------------------------------------------------------
                                                                                   

consensus_10150#0      TTCTGATTTTGTCACTGTTATAGTCTTACATAATAAAGTTGATGGTATTGAAGCTGATGG 120
consensus_10150#1      ------------------------------------------------------------
                                                                                   

consensus_10150#0      TAAACAATCTAAATCAACAATATCAGGTAATGTTTTTTGAGTAGGCGTATCAATTTTTTG 180
consensus_10150#1      ------------------------------------------------------------
                                                                                   

consensus_10150#0      AATAATTACCATTGATTCCGATGATAAATTATAATTGGAATTGATACATTGTTGTGAAAT 240
consensus_10150#1      ------------------------------------------------------------
                                                                                   

consensus_10150#0      AACATAATGTTTATTAGGGGGTACAGGTGTAGTAAGCGGACTATCAGTTGTAGCAGTGAT 300
consensus_10150#1      ------------------------------------------------------------
                                                                                   

consensus_10150#0      GATAGGTTTATCAAGATTAGTAATTGAATTTGTTGTGAAGTGATTGACAAGATTTTCATA 360
consensus_10150#1      ------------------------------------------------------------
                                                                                   

consensus_10150#0      TACACCACTTCTATAATCATCTATTTGTTCGTGCTGTTCACATGAATCAAAATAGTCATG 420
consensus_10150#1      -----------------TTTTGATACTAAAATATTATTTACGTGA-TCAGGAGGATGG-- 40
                                          *  **       *  * ** ** *** ***  *   *    

consensus_10150#0      TCTATTACTTAAATGTGGCAAATCTGGAGGTCCAAGTTTGAAAGCTAGTTCAGGTTCCAT 480
consensus_10150#1      ----CTAGTTGATTTTGGTAAATTAGTAAAT-----------ATTGCGTTCAGGTTCCAT 85
                            ** ** * * *** ****  * *  *           *    *************

consensus_10150#0      ATTCACTGAGGAGGTTAGATTTGTATTCAATACATTTTGATTAGAATGATTATTGGATAC 540
consensus_10150#1      ATTCACTGAGGAGGTTAGATTTGTATTCAATACATTTTGATTAGAATGATTATTGGATAC 145
                       ************************************************************

consensus_10150#0      AACAGATGATAAAATAAATAAAGGTTGGTCAACTTTTAAATCTTGGGTATATGGTGTTGG 600
consensus_10150#1      AACAGATGATAAAATAAATAAAGGTTGGTCAACTTTTAAATCTTGGGTATATGGTGTTGG 205
                       ************************************************************

consensus_10150#0      TGTTAATAATGTACACTGCTTTTGGCCTGTGTTATTAATAGGAGAAAAATTTTCCGAAGT 660
consensus_10150#1      TGTTAATAATGTACACTGCATTTGGCCTGTGTTATTAATAGGAGAAAAATTTTCCGAAGT 265
                       ******************* ****************************************

consensus_10150#0      ATTTGAATTTATAACAGTTGTATGCGGGAAAGAATGATTTAACGATGTATTCATATAAGT 720
consensus_10150#1      ATTTGAATTTATAACAGTTGTATGCGGGAAAGAATGATTTAACGATGTATTCATATAAGT 325
                       ************************************************************

consensus_10150#0      ATTATTGTCAACTAAATGTGTATCATTCAAATTTGCACAATCCACCGGTAATGTTATTTG 780
consensus_10150#1      ATTATTGTCAACTAAATGTGTATCATTCAAATTTGCACAATCCACCGGTAATGTTATTTG 385
                       ************************************************************

consensus_10150#0      ATTATTAGATGAATGTTGAATAATGTAGGGCATAGAAGATTGTTTTGATACTAAAATATT 840
consensus_10150#1      ATTATTAGATGAATGTTGAATAATGTAGGGCATAGAAGATTGTTTTGATACTAAAATATT 445
                       ************************************************************

consensus_10150#0      ATTTACGTGATCAGGAGGATGGCTAGTTGATTTTGGTAAATTAGTAAATATTGCCTTTGA 900
consensus_10150#1      ATTTACGTGATCAGGAGGATGGCTAGTTGATTTTGGTAAATTAGTAAATATTGCGTTCAG 505
                       ****************************************************** **   

consensus_10150#0      GTTTATAACACTATTATTACAGGTGAATGGGGCAACTGAGGAGGAGCACAGACTTGGTTG 960
consensus_10150#1      GTT-------CCATATTCACTGAGGA--GGTTAGATTTGTATTCAATACAT-TTTGATTA 555
                       ***       * **  * ** *  **  **    * *       *  ***   *** ** 

consensus_10150#0      ATGTGATGATCTGGGATAATGAATTAGTTGGGAATTAGAGGGGGAATTAGGTTTTGTAGC 1020
consensus_10150#1      GAATGATTATTGGATACANCAG-------------------------------------- 577
                          **** **  *  * *                                          

consensus_10150#0      TGATGATATGTGAGAAACAAGAACAGGTTGGATATGAGGCAAATATTCATTTTCCACTGA 1080
consensus_10150#1      ------------------------------------------------------------
                                                                                   

consensus_10150#0      GTTTATCGATGAAATTAATGAATTAGGTGGTAAACTCATTGAGCTTACCGGTCTCATATG 1140
consensus_10150#1      ------------------------------------------------------------
                                                                                   

consensus_10150#0      AGTTTCTGTTACGGTATTTATTGAATTTCGAGGATGAATACCAAATGTAGACTGCGGTTC 1200
consensus_10150#1      ------------------------------------------------------------
                                                                                   

consensus_10150#0      AACGACAAATCTCACATTTGATTGAATATCAATTTGATCAAATTTCTGTTTATCATCGTC 1260
consensus_10150#1      ------------------------------------------------------------
                                                                                   

consensus_10150#0      AGTTGGTTGACAAATTTGATCACAACCATTGTTATTGTTTATATTTTTTATATTTGCAAT 1320
consensus_10150#1      ------------------------------------------------------------
                                                                                   

consensus_10150#0      GGGAGATTGATCCACATCATTCTCATCATCATCGTCTTCATCATCTTCGTCGACACCACC 1380
consensus_10150#1      ------------------------------------------------------------
                                                                                   

consensus_10150#0      ATCGTTCTCGTTTTCTTCGCTTCTCATATTTGAGCAAGGCTGTGACGGGATAACGCCAGA 1440
consensus_10150#1      ------------------------------------------------------------
                                                                                   

consensus_10150#0      TCCGTCATTACAATTCGATCTCATGCGGCGATTTGTTAACCTTTCCATATCAGAATTGCT 1500
consensus_10150#1      ------------------------------------------------------------
                                                                                   

consensus_10150#0      AAGGAATTCATTTGCACGATGATGTTTTTTTAATCTTTGTAAAGCATGCTCCACCGTAAC 1560
consensus_10150#1      ------------------------------------------------------------
                                                                                   

consensus_10150#0      ACTAGCATACTGATAAAGACGATTGCTGCGTGTGAATACTAGTAAAGCGATTTCGCATTC 1620
consensus_10150#1      ------------------------------------------------------------
                                                                                   

consensus_10150#0      ACACAATACGCTCAACTCGTATGCCTTTTTAAATAGACCACTTTTACGCTTTGCAAATGT 1680
consensus_10150#1      ------------------------------------------------------------
                                                                                   

consensus_10150#0      GACCAGTCGATTCTTTTCATCTTTGATAAATTTTATCTCGATTTTTTTACGTCCCATTTC 1740
consensus_10150#1      ------------------------------------------------------------
                                                                                   

consensus_10150#0      CAAGGCAAAGATTC 1754
consensus_10150#1      --------------
                                     




Copyright Thu Nov 6 12:32:27 CET 2003 Hubert Wassner    (hubert.wassner@noos.fr)