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Schistosoma mansoni
cluster # 10154 cluster # 10154       Sequences # 14       consensus # 1


see consensus multiple alignment with clustalw

Direct access to contigs :
consensus_10154#0 length = 1220 sequences # 14  

consensusID : consensus_10154#0
NCBI blastX ! send the sequence to the NCBI site !
NCBI blastN ! send the sequence to the NCBI site !
Sequences nbr = 14
consensus length = 1220
fasta sequence
                              [TGCTCTTGGGTTATAAATGAGTCTAATTGAAATTCATTACATAATGAAAATATGTAGTATTATATAGCATTATCTTTTTGTATATTCCATCTAAATGTTTCAAATGAATTTGAAAGAGCCTAGAATATTCTTCCTTTTACTTTTTCTAACTAATTTGTGCGGTCAAATATTGGCTAGCAATTATGATCAGTACATAGATAGATTGATAAATGATGGAAAACTATTGTATGATGATTATATAAAACAGAATCCTGGTTTAGAATCAACATTAGAACGTTTATATTCACCGGAACATCCAA-TTTTTCAAGAAGATTATCCAGAAAATTATGAAATTACTGATCGACAATGGAATGCATTATTAAATGAAATCAATCAAGCTAAATTAGGCAGACTACAAGAAGATGATATTGATAAACTAAAATTGATGTATTCAAATTTCGACCAAAAATCAAATGATAATTACGAATTGAATCCAAATAAAAATAATAATGATAAAGTTTTACATGAACCAGGTTTAACAGAACGTCGAAATGAAATTGCTTATCAAAATCCCCTATGGGGCGAACATAAAGTTTCTGGAGGTTCCAGTGAAACAGGTCAGTGGATAGATTATGCCTTAGTGGGAGCTGGAGCACAAGATACATCAGCTGATAATTTAAATCTATCTAGTGAGCTAGAATCATCTCATATAGAATCCAAACTTGATAATTTACCTGCTTATTGTGATCCACCTAATCCATGTCCATTAAATTATAAGTCAAATGATTTACCAACACCTTGTGATCAAGATATTGAAGATACCATTGAATTTAATCGACATTGGATAATAAGAAAAATGCAAAATGGTGAATGTTCATGTGATAATGAACATATGGATAATTGTCCAGTTGAATCAAATGAAAATGGACATAAAA-CTGATTTTGTCTCGGGACAAAAGA-CTGATGGGAAAATTTTCTTGGTAAATCCATATCTACGAGGAGAAAGTCGTAAAAGGCTGGTAGCTAAAAAACGAGTTAAACGTTCACATATTCCTCGTTACAATCCTTATTTATTGGGTAGTATTCATAAAACTGCAGTGAAAAAAATTGGACCATATAAACCATCACAAGAGAAATATATGTAATAAAATTAATATAATTATAATTTGGATCATTGTAATAAATTATACTTTAAGTTCAATATAGTAAATGATACAATTTGACATTCATAATAAATTGAAT]

[+] EMBL CD188262             [TGCTCTTGGGTTATAAATGAGTCTAATTGAAATTCATTACATAATGAAAATATGTAGTATTATATAGCATTATCTTTTTGTATATTCCATCTAAATGTTTCAAATGAATTTGAAAGAGCCTAGAATATTCTTCCTTTTACTTTTTCTAGCTAATTTGTGCGGCCAAATATTGGCTAGCAATTATGATCAGTACATAGATAGATTGATAAATGATGGAAAACTATTGTATGATGATTATATAAAACAGAATCCTGGTTTAGAATCAACATTAGAACGTTTATATTCACCGGAACATCCAA TTTTTCAAGAAGATTATCCAGAAAATTATGAAATTACTGATCGACAATGGAATGCATTATTAAATGAAATCAATCAAGCTAAATTAGGCAGACTACAAGAA                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                      ]
[+] EMBL CD082424             [                     TCTAATTGAAATTCATTACATAATGAAAATATGTAGTATTATATAGCATTATCTTTTTGTATATTCCATCTAAATGTTTCAAATGAATTTGAAAGAGCCTAGAATATTCTTCCTTTTACTTTTTCTAACTAATTTGTGCGGTCAAATATTGGCTAGCAATTATGATCAGTACATAGATAGATTGATAAATGATGGAAAACTATTGTATGATGATTATATAAAACAGAATCCTGGTTTAGAATCAACATTAGAACGTTTATATTCACCGGAACATCCAA TTTTTCAAGAAGATTATCCAGAAAATTATGAAATTACTGATCGACAATGGAATGCATTATTAAATGAAATCAATCAAGCTAAATTAGGCAGACTACAAGAAGATGATATTGATAAACTAAAATTGATGTATTCAAATTTCGACCAAAAATCAAATGATAATTACGAATTGAATCCAAATAAAAATAATAATGATAAAGTTTTACATGAACCAGGTTTAACAGAACGTCGAAATGAAATTGCTTATCAAAATCCCCTATGGGGCGAACATAAAGTTTCTGGAGGTTCCAGTGAAACAGGTCAGTGGATAGATTATGCCTTAGTGGGAGCTGGAGCACAAGATACATCAGCTGATAATTTANATCTATCTAGTGAGCTAGAATCAT                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                           ]
[-] EMBL CD190184             [                                                   ATGTAGTATTATATAGCATTATCTTTTTGTATATTCCATCTAAATGTTTCAAATGAATTTGAAAGAGCCTAGAATATTCTTCCTTTTACTTTTTCTAACTAATTTGTGCGGTCAAATATTGGCTAGCAATTATGATCAGTACATAGATAGATTGATAAATGATGGAAAACTATTGTATGATGATTATATAAAACAGAATCCTGGTTTAGAATCAACATTAGAACGTTTATATTCACCGGAACATCCAA TTTTTCAAGAAGATTATCCAGAAAATTATGAAATTACTGATCGACAATGGAATGCATTATTAAATGAAATCAATCAAGC                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                            ]
[+] EMBL CD161717             [                                                                                                                                     CTTTTACTTTTTCTAACTAATTTGTGCGGTCAAATATTGGCTAGCAATTATGATCAGTACATAGATAGATTGATAAATGATGGAAAACTATTGTATGATGATTATATAAAACAGAATCCTGGTTTAGAATCAACATTAGAACGTTTATATTCACCGGAACATCCAA TTTTTCAAGAAGATTATCCAGAAAATTATGAAATTACTGATCGACAATGGAATGCATTATTAAATGAAA                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                      ]
[+] EMBL CD083788             [                                                                                                                                                                                                                                    gGATGATTATATAAAACAGAATCCTGGTTTAGAATCAACATTAGAACGTTTATATTCACCGGAACATCCAA TTTTTCAAGAAGATTATCCAGAAAATTATGAAATTACTGATCGACAATGGAATGCATTATTAAATGAAATCAATCAAGCTAAATTAGGCAGACTACAAGAAGATGATATTGATAAACTAAAATTGATGTATTCAAATTTCGACCAAAAATCAAATGATAATTACGAATTGAATCCAAATAAAAATAATAATGATAAAGTTTTACATGAACCAGGTTTAACAGAACGTCGAAATGAAATTGCTTATCAAAATCCCCTATGGGGCGAACATAAAGTTTCTGGAGGTTCCAGTGAAACAGGTCAGTGGATAGATTATGCCTTAGTGGGAGCTGGAGCACAAGATACATCAGCTGATAATTTAAATCTATCTAGTGAGCTAGAATCATCTCATATAGAATCCAAACTTGATAATTTACCTGCTTATTGTGATCCACCTAATCCATGT                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                ]
[+] EMBL CD078974             [                                                                                                                                                                                                                                                              GTTTAGAATCAACATTAGAACGTTTATATTCACCGGAACATCCAA TTTTTCAAGAAGATTATCCAGAAAATTATGAAATTACTGATCGACAATGGAATGCATTATTAAATGAAATCAATCAAGCTAAATTAGGCAGACTACAAGAAGATGATATTGATAAACTAAAATTGATGTATTCAAATTTCGACCAAAAATCAAATGATAATTACGAATTGAATCCAAATAAAAATAATAATGATAAAGTTTTACATGAACCAGGTTTAACAGAACGTCGAAATGAAATTGCTTATCAAAATCCCCTATGGGGCGAACATAAAGTTTCTGGAGGTTCCAGTGAAACAGGTCAGTGGATAGATTATGCCTTAGTGGGAGCTGGAGCACAAGATACATCAGCTGATAATTTAAATCTATCTAGTGAGCTAGAATCATCTCATATAGAATCCAAACTTGATAATTTACCTGCTTATTGTGATCCACCTAATCCATGTCCATTAAATTATAAGTCAAATGATTTACCAACACCTTGTGATCAAGATATTGAAGATACCATTGAATTTAATCGACATTGGATAATAAG AAAATGCAAAATGGTGAATGTTCATGTGATAATGAACA                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                ]
[+] EMBL CD083797             [                                                                                                                                                                                                                                                                  AGAATCAACATTAGAACGTTTAT TTCACCGGAACATCCAANTTTTTCAAGAAGATTATCCAGAAAATTATGAAATTACTGATCGACAATGGAATGCATTATTAAATGAAATCAATCAAGCTAAATTAGGCAGACTACAAGAAGATGATATTGATAAACTAAAATTGATGTATTCAAATTTCGACCAAAAATCAAATGATAATTACGAATTGAATCCAAATAAAAATAATAATGATAAAGTTTTACATGAACCAGGTTTAACAGAACGTCGAAATGAAATTGCTTATCAAAATCCCCTATGGGGCGAACATAAAGTTTCTGGAGGTTCCAGTGAAACAGGTCAGTGGATAGATTATGCCTTAGTGGGAGCTGGAGCACAAGATACATCAGCTGATAATTTAAATCTATCTAGTGAGCTAGAATCATCTCATATAGAATCCAAACTTGATAATTTACCTGCTTATTGTGATCCACCTAATCCATGTCCA                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                             ]
[+] EMBL CD116011             [                                                                                                                                                                                                                                                                                                                          TATCCAGAAAATTATGAAATTACTGATCGACAATGGAATGCATTATTAAATGAAATCAATCAAGCTAAATTAGGCAGACTACAAGAAGATGATATTGATAAACTAAAATTGATGTATTCAAATTTCGACCAAAAATCAAACGATAATTACGAATTGAATCCAAATAAAAATAATAATGATAAAGTTTTACATGAACCAGGTTTAACAGAACGTCGAAATGAAATTGCTTATCAAAATCCCCTATGGGGCGAACATAAAGTTTCTGGAGGTTCCAGTGAAACAGGTCAGTGGATAGATTATGCCTTAGTGGGAGCTGGAGCACAAGATACATCAGCTGATAATTTAAATCTATCTAGTGAGCTAGAATCATCTCATATAGAATCCANACTTGATAATTTACCTGCTTATTGNGATC                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                              ]
[-] EMBL CD169975             [                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                           ATAAACTAAAATTGATGTATTCAAATTTCGACCAAAAATCAAATGATAATTACGAATTGAATCCAAATAAAAATAATAATGATAAAGTTTTACATGAACCAGGTTTAACAGAACGTCGAAATGAAATTGCTTATCAAAATCCCCTATGGGGCGAACATAAAGTTTCTGGAGGTTCCAGTGAAACAGGTCAGTGGATAGATTATGCCTTAGTGGGAGCTGGAGCACAAGACACATCAGCTGATAATTTAAATCTATCTAGTGAGCTAGAATCATCTCATAAAGAATCCAAACTTGATAATTTACCTGCTTATTGTGATCCACCTAATCCATGTCCATTAAATTATAAGTCAAATGATTTACCAACACCTTG                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                          ]
[-] EMBL CD073426             [                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                            AAGATACATCAGCTGATAATTTAAATCTATCTAGTGAGCTAGAATCATCTCATATAGAATCCAAACTTGATAATTTACCTGCTTATTGTGATCCACCTAATCCATGTCCATTAAATTATAAGTCAAATGATTTACCAACACCTTGTGATCAAGATATTGAAGATACCATTGAATTTAATCGACATTGGATAATAAGAAAAATGCAAAATGGTGAATGTTCATGTGATAATGAACATATGGATAATTGTCCAGTTGAATCAAATGAAAATGGACATAAAA CTGATTTTGTCTCGGGACAAAAGA CTGATGGGAAAATTTTCTTGGTAAATCCATATCTACGAGGAGAAAGTCGTAAAAGGCTGGTAGCTAAAAAACGAGTTAAACGTTCACATATTCCTCGTTACAATCCTTATTTATTGGGTAGTATTCATAAAACTGCAGTGAAAAAAATTGGACCATATAAACCATCACAAGAGAAATATATGTAATAAAATTAATATAATTATAATTTGGATCATTGTAATAAATTATACTTTAAGTTCAATATAGTAAATGATACAATTTGACATTCATAATAAATTGAAT]
[-] EMBL CD076023             [                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                      CTATCTAGTGAGCTAGAATCATCTCATATAGAATCCAAACTTGATAATTTACCTGCTTATTGTGATCCACCTAATCCATGTCCATTAAATTATAAGTCAAATGATTTACCAACACCTTGTGATCAAGATATTGAAGATACCATTGAATTTAATCGACATTGGATAATAAGAAAAATGCAAAATGGTGAATGTTCATGTGATAATGAACATATGGATAATTGTCCAGTTGAATCAAATGAAAATGGACATAAAA CTGATTTTGTCTCGGGACAAAAGA CTGATGGGAAAATTTTCTTGGTAAATCCATATCTACGAGGAGAAAGTCGTAAAAGGCTGGTAGTTAAAAAACGAGTTAAACGTTCACATATTCCTCGTTACAATCCTTATTTATTGGGTAGTATTCATAAAACTGCAGTGAAAAAAATTGGACCATATAAACCATCACAAGAGAAATATATGTAATAAAATTAATATAATTATAATTTGGATCATTGTAATAAATTATACTTTAAGTTCAATATAGTAAATGATACAATTTGACATTCATAATAAATTGAAT]
[-] EMBL CD075667             [                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                        ATCTAGTGAGCTAGAATCATCTCATATAGAATCCAAACTTGATAATTTACCTGCTTATTGTGATCCACCTAATCCATGTCCATTAAATTATAAGTCAAATGATTTACCAACACCTTGTGATCAAGATATTGAAGATACCATTGAATTTAATCGACATTGGATAATAAGAAAAATGCAAAATGGTGAATGTTCATGTGATAATGAACATATGGATAATTGTCCAGTTGAATCAAATGAAAATGGACATAAAA CTGATTTTGTTTCGGGACAAAAGA CTGATGGGAAAATTTTTTTGGTAAATCCATATCTACGAGGAAAAAGTCGTAAAAGGCTGGTAGCTAAAAAACGAGTTAAACGTTCACATATTCCTCGTTACAATCCTTATTTATTGGGTAGTATTCATAAAACTGCAGTGAAAAAAATTGGACCATATAAACCATCCCAAGAGAAATATATGTAATAAAATTAATATAATTATAATTTGGATCATTGTAATAAATTATACTTTAAGTTCAATATAGTAAATGATACAATTTGACATTCATAATAAATTGAAT]
[-] EMBL CD187119             [                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                TATAGAATCCAAACTTGATAATTTACCTGCTTATTGTGATCCACCTAATCCATGTCCATTAAATTATAAGTCAAATGATTCACCAACACCTTGTGATCAAGATATTGAAGATACCATTGAATTTAATCGACATTGGATAATAAGAAAAATGCAAAATGGTGAATGTTCATGTGATAATGAACATATGGATAATTGTCCAGTTGAATCAAATGAAAATGGACATAAAA CTGATTTTGTCTCGGGACAAAAGA CTGATGGGAAAATTTTCTTGGT AATCCATATCTACGAGGAGAAAGTCGTAAAAGGCTGGTAGCTAAAAAACGAGTTAAACGTTCACATATTCCTCGTTACAATCCTTATTTATTGGGTAGTATTC                                                                                                                                                            ]
[-] EMBL AI026197             [                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                      AATGGACATAAAACCTGATTTTGTCCCGGGGCCAAAGACCTGATGGGAAAATTTTCTTGGTAAATCCATATCTACGAGGAGAAAGTCGTAAAAGGCTGGTAGCTAAAAAACGAGTTAAACGTTCACATATTCCTCGTTACAATCCTTATTTATTGGGTAGTATTCATAAAACTGCAGTGAAAAAAATTGGACCATATAAACCATCACAAGAGAAATATATGTAATAAAATTAA                                                                                        ]


>consensus_10154#0 TGCTCTTGGGTTATAAATGAGTCTAATTGAAATTCATTACATAATGAAAATATGTAGTAT TATATAGCATTATCTTTTTGTATATTCCATCTAAATGTTTCAAATGAATTTGAAAGAGCC TAGAATATTCTTCCTTTTACTTTTTCTAACTAATTTGTGCGGTCAAATATTGGCTAGCAA TTATGATCAGTACATAGATAGATTGATAAATGATGGAAAACTATTGTATGATGATTATAT AAAACAGAATCCTGGTTTAGAATCAACATTAGAACGTTTATATTCACCGGAACATCCAAT TTTTCAAGAAGATTATCCAGAAAATTATGAAATTACTGATCGACAATGGAATGCATTATT AAATGAAATCAATCAAGCTAAATTAGGCAGACTACAAGAAGATGATATTGATAAACTAAA ATTGATGTATTCAAATTTCGACCAAAAATCAAATGATAATTACGAATTGAATCCAAATAA AAATAATAATGATAAAGTTTTACATGAACCAGGTTTAACAGAACGTCGAAATGAAATTGC TTATCAAAATCCCCTATGGGGCGAACATAAAGTTTCTGGAGGTTCCAGTGAAACAGGTCA GTGGATAGATTATGCCTTAGTGGGAGCTGGAGCACAAGATACATCAGCTGATAATTTAAA TCTATCTAGTGAGCTAGAATCATCTCATATAGAATCCAAACTTGATAATTTACCTGCTTA TTGTGATCCACCTAATCCATGTCCATTAAATTATAAGTCAAATGATTTACCAACACCTTG TGATCAAGATATTGAAGATACCATTGAATTTAATCGACATTGGATAATAAGAAAAATGCA AAATGGTGAATGTTCATGTGATAATGAACATATGGATAATTGTCCAGTTGAATCAAATGA AAATGGACATAAAACTGATTTTGTCTCGGGACAAAAGACTGATGGGAAAATTTTCTTGGT AAATCCATATCTACGAGGAGAAAGTCGTAAAAGGCTGGTAGCTAAAAAACGAGTTAAACG TTCACATATTCCTCGTTACAATCCTTATTTATTGGGTAGTATTCATAAAACTGCAGTGAA AAAAATTGGACCATATAAACCATCACAAGAGAAATATATGTAATAAAATTAATATAATTA TAATTTGGATCATTGTAATAAATTATACTTTAAGTTCAATATAGTAAATGATACAATTTG ACATTCATAATAAATTGAAT



clustalw multiple alignements is not computed in this case


Copyright Thu Nov 6 12:32:27 CET 2003 Hubert Wassner    (hubert.wassner@noos.fr)