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Schistosoma mansoni
cluster # 10164 cluster # 10164       Sequences # 14       consensus # 1


see consensus multiple alignment with clustalw

Direct access to contigs :
consensus_10164#0 length = 1263 sequences # 14  

consensusID : consensus_10164#0
NCBI blastX ! send the sequence to the NCBI site !
NCBI blastN ! send the sequence to the NCBI site !
Sequences nbr = 14
consensus length = 1263
fasta sequence
                              [TGGAACTTAGCGCAGAAGAGTATATATTCGGGGCTTTACAATTATACTTGGATGTTGTCAATTTATTCTTAATTATTCTATCATTTTTTGGTAATAGAGATTCATAAAGATAATAAGAATGATATTCTGAATAATTTCCAAAAACATTAAAAGACAAAACACAGTTGCATCACACACATATACATATAATGTGTATTACAATGAATCAAGTATTATTATTATTATTCCCGTCTCTCTTTTTATGTGTCTCCGTGTGTTTA--TGTGTGTGTGTGTGCGCGTTGTTGATCATCCCTACTCTTCTCTTCAGTTTTTTTATTCATTAATACAAATGAAAACTGTTTGTGAATATATCAACTTTGACCACTCTGTTATCCATGCATCTATGTATGAATGGATATGATGAATAAAAATTGAGGTACTTCAAAGCTAGAATATAAAGGAAATATCATCTGAAAAGTTATTCGTTCATCAAATTCACATTCTTTCATCATTTGGTCTATCATTTATAAGAGTTATCATCTCAGTGAGCCCCTATATATCTATATCAGACTTAGACTTCACGAATCATCGACCTATAATTGTTGTTGTTGTTATGATGATATATTCTGTTTAACATTACGATAACACTTATTATTCATCCTTAAAAAGTAACTATACATCTCTTAGTAAGGAGTAACATTTCTTGCTTTGATGCTGATATGTTAATGATTCTCTTCAAATTACATTTCTATCCTTTCAAGTTGTCCATAGCATACATATGACAGTATTTATCATATTTGAATTTCTTATGTTATATAACATACGAGAACTCATCGAATCCGTATCCATAATCATTTGGATTTTTATTCTAAGGCG-AAAAAAAAGAATAGGGCATTACTGTTTCGTACTTTCGATCCACCCNCCCACACTGCCTTACATATACACACACACGCACATACCTTTTTTCATGTAATCTTCTCTTGTTTATTCGATTTTGTTCATTCATCATTCGTCAATGCATAAAGTTGAAAAAAAAGGATACAAACTAATAACAAATGGATCTTCAGTGTGTGTATTTTGATTTTTGGAATAATCGTCGCTTGTTTGTTTATTGTTTTCCAATTCAATTTATTATCATATTTTGTGTGTATCTGTTAAGGTTACAATGAATCATTACTGAAATATTTACTACTGATTTATTTTATGTGTTTTGTTGCTTCTTTAAAATGATTTAACAATGATTTCATTGTATTATGTAATTGTGCACAAAATATACAGTCATAA]

[+] EMBL CD152596             [TGGAACTTAGCGCAGAAGAGTATATATTCGGGGCTTTACAATTATACTTGGATGTTGTCAATTTATTCTTAATTATTCTATCATTTTTTGGTAATAGAGATTCATAAAGATAATAAGAATGATATTCTGAATAATTTCCAAAAACATTAAAAGACAAAACACAGTTGCATCACACACATATACATATAATGTGTATTAC                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                           ]
[+] EMBL CD152576             [TGGAACTTAGCGCAGAAGAGTATATATTCGGGGCTTTACAATTATACTTGGATGTTGTCAATTTATTCTTAATTATTCTATCATTTTTTGGTAATAGAGATTCATAAAGATAATAAGAATGATATTCTGAATAATTTCCAAAAACATTAAAAGACAAAACACAGTTGCATCACACACATATACATATAATGTGTATTAC                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                           ]
[+] EMBL BG931914             [                                                        GTCAATTTATTCTTAATTATTCTATCATTTTTTGGTAATAGAGATTCATAAAGATAATAAGAATGATATTCTGAATAATTTCCAAAAACATTAAAAGACAAAACACAGTTGCATCACACACATATACATATAATGTGTATTACAATGAATCAAGTATTATTATTATTATTCCCGTCTCTCTTTTTATGTGTCTCCGTGTGTTTATGTGTGTGTGTGTGTGCGCGTTGTTGATCATCCCTACTCTTCTCTTCAGTTTTTTTATTCATTAATACAAATGAAAACTGTTTGTGAATATATCAACTTTGA                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                        ]
[+] EMBL CD080224             [                                                                                                                                                                                                                                           CTTTTTATGTGTCTCCGTGTGTTTA  TGTGTGTGTGTGTGCGCGTTGTTGATCATCCCTACTCTTCTCCTCAGTTTTTTTATTCATTAATACAAATGAAAACTGTTTGTGAATATATCAACTTTGACCACTCTGTTATCCATGCATCTATGTATGAATGGATATGATGAATAAAAATTGAGGTACTTCAAAGCTAGAATATAAAGGAAATATCATCTGAAAAGTTATTCGTTCATCAAATTCACATTCTTTCATCATTTGGTCTATCATTTATAAGAGTTATCATCTCAGTGAGCCCCTATATATCTATATCAGACTTAGACTTCACGAATCATCGACCTATAATTGTTGTTGTTGTTATGATGATATATTCTGTTTAACATTACGATAACACTTATTATTCATCCTTAAAAAGTAACTATACATCTCTTAGTAAGGAGTAACATTTCTTGCTTTGATGCTGATATGTTAATGATTCTCTTCAAATTACATTTCTATCCTTTCAAGTTGTCCATAGCATACATATGACAGTATTTATCATATTTGAATTTCTTATGTTATATAACATACGAGAACTCATCGAATCCGTATCCATA                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                   ]
[+] EMBL AI975452             [                                                                                                                                                                                                                                           CTTTTTATGTGTCTCCGTGTGTTTATGTGTGTGTGTGTGTGCGCGTTGTTGATCATCCCTACTCTTCTCTTCAGTTATTTTATTCATTAATACAAATGAAAACTGTTTGTGAATATATCAACTTTGACCACTCTGTTATCCATGCATCTATGTATGAATGGATATGATGAATAAAAATTGAGGTACTTCAAAGCTAGAATATAAAGGAAATATCATCTGAAAAGTTATTCGTTCATCAAATTCACATTCTTTCATCATTTGGTCTATCATTTATAAGAGTTATCATCTCAGTGAGCCCCTATATATCTATATCAGACTTAGACTTCACGAATCATCGACCTATAATTGGTGTTGTTGGTATGATG                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                          ]
[+] EMBL CD196727             [                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                     TTGTGAATATATCAACTTTGACCACTCTGTTATCCATGCATCTATGTATGAATGGATATGATGAATAAAAATTGAGGTACTTCAAAGCTAGAATATAAAGGAAATATCATCTGAAAAGTTATTCGTTCATCAAATTCACATTCTTTCATCATTTGGTCTATCATTTATAAGAGTTATCATCTCAGTGAGCCCCTATATATCTATATCAGACTTAGACTTCACGAATCATCGACCTATAATTGTTGTTGTTGTTATGATGATATATTCTGTTTAACATTACGATAACACTTATTATTCATCCTTAAAAAGTAACTATACATCTCTTAGTAAGGAGTAACATTTCTTGCTTTGATGCTGATATGTTAATGATTCTCTTCAAATTACATTTCTATCCTTTCAAGTTGTCCATAGCATACATATGACAGTATTTATCAT                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                          ]
[+] EMBL CD083689             [                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                 cgACTTTGACCACTCTGTTATCCATGCATCTATGTATGAATGGATATGATGAATAAAAATTGAGGTACTTCAAAGCTAGAATATAAAGGAAATATCATCTGAAAAGTTATTCGTTCATCAAATTCACATTCTTTCATCATTTGGTCTATCATTTATAAGAGTTATCATCTCAGTGAGCCCCTATATATCTATATCAGACTTAGACTTCACGAATCATCGACCTATAATTGTTGTTGTTGTTATGATGATATATTCTGTTTAACATTACGATAACACTTATTATTCATCCTTAAAAAGTAACTATACATCTCTTAGTAAGGAGTAACATTTCTTGCTTTGATGCTGATATGTTAATGATTCTCTTCAAATTACATTTCTATCCTTTCAAGTTGTCCATAGCATACATATGACAGTATTTATCATATTTGAATTTCTTATGTTATATAACATACGAGAACTCATCGAATCCGTATCCATAATCATTTGGATTTCTATTCTAAGGCG AAAAAAA                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                 ]
[+] EMBL CD158093             [                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                      GTTGTTGTTGTTATGATGATATATTCTGTTTAACATTACGATAACACTTATTATTCATCCTTAAAAAGTAACTATACATCTCTTAGTAAGGAGTAACATTTCTTGCTTTGATGCTGATATGTTAATGATTCTCTTCAAATTACATTTCTATCCTTTCAAGTTGTCCATAGCATACATATGACAGTATTTATCATATTTGAATTTCTTATGTTATATAACATACGAGAACTCATCGAATCCGTATCCATAATCATTTGGATTTTTATTCTAAGGCG AAAAAAAAGAATAGGGCATTACTG                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                ]
[+] EMBL CD158166             [                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                      GTTGTTGTTGTTATGATGATATATTCTGTTTAACATTACGATAACACTTATTATTCATCCTTAAAAAGTAACTATACATCTCTTAGTAAGGAGTAACATTTCTTGCTTTGATGCTGATATGTTAATGATTCTCTTCAAATTACATTTCTATCCTTTCAAGTTGTCCATAGCATACATATGACAGTATTTATCATATTTGAATTTCTTATGTTATATAACATACGAGAACTCATCGAATCCGTATCCATAATCATTTGGATTTTTATTCTAAGGCG AAAAAAAAGAATAGGGCATTACTG                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                ]
[+] EMBL CD193467             [                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                      GTTGTTGTTGTTATGATGATATATTCTGTTTAACATTACGATAACACTTATTATTCATCCTTAAAAAGTAACTATACATCTCTTAGTAAGGAGTAACATTTCTTGCTTTGATGCTGATATGTTAATGACTCTCTTCAAATTACATTTCTATCCTTTCAAGTTGTCCATAGCATACATATGACAGTATTTATCATATTTGAATTTCTTATGTTATATAACATACGAGAACTCATCGAATCCGTATCCATAATCATTTGGATTTTTATTCTAAGGCG AAAAAAAAGAATAGGGCATTACTG                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                ]
[+] EMBL CD193508             [                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                      GTTGTTGTTGTTATGATGATATATTCTGTTTAACATTACGATAACACTTATTATTCATCCTTAAAAAGTAACTATACATCTCTTAGTAAGGAGTAACATTTCTTGCTTTGATGCTGATATGTTAATGATTCTCTTCAAATTACATTTCTATCCTTTCAAGTTGTCCATAGCATACATATGACAGTATTTATCATATTTGAATTTCTTATGTTATATAACATACGAGAACTCATCGAATCCGTATCCATAATCATTTGGATTTTTATTCTAAGGCGAAAAAAAAAGAATAGGGCATTACTG                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                ]
[-] EMBL CD158049             [                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                        gtTTGTTGTTATGATGATATATTCTGTTTAACATTACGATAACACTTATTATTCATCCTTAAAAAGTAACTATACATCTCTTAGTAAGGAGTAACATTTCTTGCTTTGATGCTGATATGTTAATGATTCTCTTCAAATTACATTTCTATCCTTTCAAGTTGTCCATAGCATACATATGACAGTATTTATCATATTTGAATTTCTTATGTTATATAACATAC                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                             ]
[-] EMBL AI975861             [                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                   ACATTTCTAACCTTTCAAGTTGTCCATAGCATACATATGACAGTATTTATCATATTTGAATTTCTTATGTTATATAACATACGAGAACTCATCGAATCCGTATCCATAATCATTTGGATTTTTATTCTAAGGCG AAAAAAAAGAATAGGGCATTACTGTTTCGTACTTTCGATCCACCCNCCCACACTGCCTTACATATACACACACACGCACATACCTTTTTTCATGTAATCTTCTCTTGTTTATTCGATTTTGTTCATTCATCATTCGTCAATGCATAAAGTTGAAAAAAAAGGATACAAACTAATAACAAATGGATCTTCAGTGTGTGTATTTTGATTTTTGGAATAATCGTCGCTTGTTTGTTTATTGTTTTCCAATTCAATTTATTATCATATTTTGTGTGTATCTGTTAAGGTTACAATGAATCATTACTGAAATATTTACTACTGATTTATTTTATGTGTTTTGTTGCTTCTTTAAAATGATTTAACAATGATTTCATTGTATTATGTAATTGTGCACAAAATATACAGTCATAA]
[+] EMBL AA566189             [                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                tcacCCCCCCCACACTGCCTTACATATACACACACACGCACATACCTTTTTTCATGTAATCTTCTCTTGTTTATTCGATTTTGTTCATTCATCATTCGTCAATGCATAAAGTTG  AAAAAAGGATACAAACT                                                                                                                                                                                                                                             ]


>consensus_10164#0 TGGAACTTAGCGCAGAAGAGTATATATTCGGGGCTTTACAATTATACTTGGATGTTGTCA ATTTATTCTTAATTATTCTATCATTTTTTGGTAATAGAGATTCATAAAGATAATAAGAAT GATATTCTGAATAATTTCCAAAAACATTAAAAGACAAAACACAGTTGCATCACACACATA TACATATAATGTGTATTACAATGAATCAAGTATTATTATTATTATTCCCGTCTCTCTTTT TATGTGTCTCCGTGTGTTTATGTGTGTGTGTGTGCGCGTTGTTGATCATCCCTACTCTTC TCTTCAGTTTTTTTATTCATTAATACAAATGAAAACTGTTTGTGAATATATCAACTTTGA CCACTCTGTTATCCATGCATCTATGTATGAATGGATATGATGAATAAAAATTGAGGTACT TCAAAGCTAGAATATAAAGGAAATATCATCTGAAAAGTTATTCGTTCATCAAATTCACAT TCTTTCATCATTTGGTCTATCATTTATAAGAGTTATCATCTCAGTGAGCCCCTATATATC TATATCAGACTTAGACTTCACGAATCATCGACCTATAATTGTTGTTGTTGTTATGATGAT ATATTCTGTTTAACATTACGATAACACTTATTATTCATCCTTAAAAAGTAACTATACATC TCTTAGTAAGGAGTAACATTTCTTGCTTTGATGCTGATATGTTAATGATTCTCTTCAAAT TACATTTCTATCCTTTCAAGTTGTCCATAGCATACATATGACAGTATTTATCATATTTGA ATTTCTTATGTTATATAACATACGAGAACTCATCGAATCCGTATCCATAATCATTTGGAT TTTTATTCTAAGGCGAAAAAAAAGAATAGGGCATTACTGTTTCGTACTTTCGATCCACCC NCCCACACTGCCTTACATATACACACACACGCACATACCTTTTTTCATGTAATCTTCTCT TGTTTATTCGATTTTGTTCATTCATCATTCGTCAATGCATAAAGTTGAAAAAAAAGGATA CAAACTAATAACAAATGGATCTTCAGTGTGTGTATTTTGATTTTTGGAATAATCGTCGCT TGTTTGTTTATTGTTTTCCAATTCAATTTATTATCATATTTTGTGTGTATCTGTTAAGGT TACAATGAATCATTACTGAAATATTTACTACTGATTTATTTTATGTGTTTTGTTGCTTCT TTAAAATGATTTAACAATGATTTCATTGTATTATGTAATTGTGCACAAAATATACAGTCA TAA



clustalw multiple alignements is not computed in this case


Copyright Thu Nov 6 12:32:27 CET 2003 Hubert Wassner    (hubert.wassner@noos.fr)