These datas are free for academic use only, please contact me for any other use. Schistosoma mansoni see consensus multiple alignment with clustalw Direct access to contigs :
consensusID : consensus_10164#0 NCBI blastX ! send the sequence to the NCBI site ! NCBI blastN ! send the sequence to the NCBI site ! Sequences nbr = 14 consensus length = 1263 fasta sequence [TGGAACTTAGCGCAGAAGAGTATATATTCGGGGCTTTACAATTATACTTGGATGTTGTCAATTTATTCTTAATTATTCTATCATTTTTTGGTAATAGAGATTCATAAAGATAATAAGAATGATATTCTGAATAATTTCCAAAAACATTAAAAGACAAAACACAGTTGCATCACACACATATACATATAATGTGTATTACAATGAATCAAGTATTATTATTATTATTCCCGTCTCTCTTTTTATGTGTCTCCGTGTGTTTA--TGTGTGTGTGTGTGCGCGTTGTTGATCATCCCTACTCTTCTCTTCAGTTTTTTTATTCATTAATACAAATGAAAACTGTTTGTGAATATATCAACTTTGACCACTCTGTTATCCATGCATCTATGTATGAATGGATATGATGAATAAAAATTGAGGTACTTCAAAGCTAGAATATAAAGGAAATATCATCTGAAAAGTTATTCGTTCATCAAATTCACATTCTTTCATCATTTGGTCTATCATTTATAAGAGTTATCATCTCAGTGAGCCCCTATATATCTATATCAGACTTAGACTTCACGAATCATCGACCTATAATTGTTGTTGTTGTTATGATGATATATTCTGTTTAACATTACGATAACACTTATTATTCATCCTTAAAAAGTAACTATACATCTCTTAGTAAGGAGTAACATTTCTTGCTTTGATGCTGATATGTTAATGATTCTCTTCAAATTACATTTCTATCCTTTCAAGTTGTCCATAGCATACATATGACAGTATTTATCATATTTGAATTTCTTATGTTATATAACATACGAGAACTCATCGAATCCGTATCCATAATCATTTGGATTTTTATTCTAAGGCG-AAAAAAAAGAATAGGGCATTACTGTTTCGTACTTTCGATCCACCCNCCCACACTGCCTTACATATACACACACACGCACATACCTTTTTTCATGTAATCTTCTCTTGTTTATTCGATTTTGTTCATTCATCATTCGTCAATGCATAAAGTTGAAAAAAAAGGATACAAACTAATAACAAATGGATCTTCAGTGTGTGTATTTTGATTTTTGGAATAATCGTCGCTTGTTTGTTTATTGTTTTCCAATTCAATTTATTATCATATTTTGTGTGTATCTGTTAAGGTTACAATGAATCATTACTGAAATATTTACTACTGATTTATTTTATGTGTTTTGTTGCTTCTTTAAAATGATTTAACAATGATTTCATTGTATTATGTAATTGTGCACAAAATATACAGTCATAA] [+] EMBL CD152596 [TGGAACTTAGCGCAGAAGAGTATATATTCGGGGCTTTACAATTATACTTGGATGTTGTCAATTTATTCTTAATTATTCTATCATTTTTTGGTAATAGAGATTCATAAAGATAATAAGAATGATATTCTGAATAATTTCCAAAAACATTAAAAGACAAAACACAGTTGCATCACACACATATACATATAATGTGTATTAC ] [+] EMBL CD152576 [TGGAACTTAGCGCAGAAGAGTATATATTCGGGGCTTTACAATTATACTTGGATGTTGTCAATTTATTCTTAATTATTCTATCATTTTTTGGTAATAGAGATTCATAAAGATAATAAGAATGATATTCTGAATAATTTCCAAAAACATTAAAAGACAAAACACAGTTGCATCACACACATATACATATAATGTGTATTAC ] [+] EMBL BG931914 [ GTCAATTTATTCTTAATTATTCTATCATTTTTTGGTAATAGAGATTCATAAAGATAATAAGAATGATATTCTGAATAATTTCCAAAAACATTAAAAGACAAAACACAGTTGCATCACACACATATACATATAATGTGTATTACAATGAATCAAGTATTATTATTATTATTCCCGTCTCTCTTTTTATGTGTCTCCGTGTGTTTATGTGTGTGTGTGTGTGCGCGTTGTTGATCATCCCTACTCTTCTCTTCAGTTTTTTTATTCATTAATACAAATGAAAACTGTTTGTGAATATATCAACTTTGA ] [+] EMBL CD080224 [ CTTTTTATGTGTCTCCGTGTGTTTA TGTGTGTGTGTGTGCGCGTTGTTGATCATCCCTACTCTTCTCCTCAGTTTTTTTATTCATTAATACAAATGAAAACTGTTTGTGAATATATCAACTTTGACCACTCTGTTATCCATGCATCTATGTATGAATGGATATGATGAATAAAAATTGAGGTACTTCAAAGCTAGAATATAAAGGAAATATCATCTGAAAAGTTATTCGTTCATCAAATTCACATTCTTTCATCATTTGGTCTATCATTTATAAGAGTTATCATCTCAGTGAGCCCCTATATATCTATATCAGACTTAGACTTCACGAATCATCGACCTATAATTGTTGTTGTTGTTATGATGATATATTCTGTTTAACATTACGATAACACTTATTATTCATCCTTAAAAAGTAACTATACATCTCTTAGTAAGGAGTAACATTTCTTGCTTTGATGCTGATATGTTAATGATTCTCTTCAAATTACATTTCTATCCTTTCAAGTTGTCCATAGCATACATATGACAGTATTTATCATATTTGAATTTCTTATGTTATATAACATACGAGAACTCATCGAATCCGTATCCATA ] [+] EMBL AI975452 [ CTTTTTATGTGTCTCCGTGTGTTTATGTGTGTGTGTGTGTGCGCGTTGTTGATCATCCCTACTCTTCTCTTCAGTTATTTTATTCATTAATACAAATGAAAACTGTTTGTGAATATATCAACTTTGACCACTCTGTTATCCATGCATCTATGTATGAATGGATATGATGAATAAAAATTGAGGTACTTCAAAGCTAGAATATAAAGGAAATATCATCTGAAAAGTTATTCGTTCATCAAATTCACATTCTTTCATCATTTGGTCTATCATTTATAAGAGTTATCATCTCAGTGAGCCCCTATATATCTATATCAGACTTAGACTTCACGAATCATCGACCTATAATTGGTGTTGTTGGTATGATG ] [+] EMBL CD196727 [ TTGTGAATATATCAACTTTGACCACTCTGTTATCCATGCATCTATGTATGAATGGATATGATGAATAAAAATTGAGGTACTTCAAAGCTAGAATATAAAGGAAATATCATCTGAAAAGTTATTCGTTCATCAAATTCACATTCTTTCATCATTTGGTCTATCATTTATAAGAGTTATCATCTCAGTGAGCCCCTATATATCTATATCAGACTTAGACTTCACGAATCATCGACCTATAATTGTTGTTGTTGTTATGATGATATATTCTGTTTAACATTACGATAACACTTATTATTCATCCTTAAAAAGTAACTATACATCTCTTAGTAAGGAGTAACATTTCTTGCTTTGATGCTGATATGTTAATGATTCTCTTCAAATTACATTTCTATCCTTTCAAGTTGTCCATAGCATACATATGACAGTATTTATCAT ] [+] EMBL CD083689 [ cgACTTTGACCACTCTGTTATCCATGCATCTATGTATGAATGGATATGATGAATAAAAATTGAGGTACTTCAAAGCTAGAATATAAAGGAAATATCATCTGAAAAGTTATTCGTTCATCAAATTCACATTCTTTCATCATTTGGTCTATCATTTATAAGAGTTATCATCTCAGTGAGCCCCTATATATCTATATCAGACTTAGACTTCACGAATCATCGACCTATAATTGTTGTTGTTGTTATGATGATATATTCTGTTTAACATTACGATAACACTTATTATTCATCCTTAAAAAGTAACTATACATCTCTTAGTAAGGAGTAACATTTCTTGCTTTGATGCTGATATGTTAATGATTCTCTTCAAATTACATTTCTATCCTTTCAAGTTGTCCATAGCATACATATGACAGTATTTATCATATTTGAATTTCTTATGTTATATAACATACGAGAACTCATCGAATCCGTATCCATAATCATTTGGATTTCTATTCTAAGGCG AAAAAAA ] [+] EMBL CD158093 [ GTTGTTGTTGTTATGATGATATATTCTGTTTAACATTACGATAACACTTATTATTCATCCTTAAAAAGTAACTATACATCTCTTAGTAAGGAGTAACATTTCTTGCTTTGATGCTGATATGTTAATGATTCTCTTCAAATTACATTTCTATCCTTTCAAGTTGTCCATAGCATACATATGACAGTATTTATCATATTTGAATTTCTTATGTTATATAACATACGAGAACTCATCGAATCCGTATCCATAATCATTTGGATTTTTATTCTAAGGCG AAAAAAAAGAATAGGGCATTACTG ] [+] EMBL CD158166 [ GTTGTTGTTGTTATGATGATATATTCTGTTTAACATTACGATAACACTTATTATTCATCCTTAAAAAGTAACTATACATCTCTTAGTAAGGAGTAACATTTCTTGCTTTGATGCTGATATGTTAATGATTCTCTTCAAATTACATTTCTATCCTTTCAAGTTGTCCATAGCATACATATGACAGTATTTATCATATTTGAATTTCTTATGTTATATAACATACGAGAACTCATCGAATCCGTATCCATAATCATTTGGATTTTTATTCTAAGGCG AAAAAAAAGAATAGGGCATTACTG ] [+] EMBL CD193467 [ GTTGTTGTTGTTATGATGATATATTCTGTTTAACATTACGATAACACTTATTATTCATCCTTAAAAAGTAACTATACATCTCTTAGTAAGGAGTAACATTTCTTGCTTTGATGCTGATATGTTAATGACTCTCTTCAAATTACATTTCTATCCTTTCAAGTTGTCCATAGCATACATATGACAGTATTTATCATATTTGAATTTCTTATGTTATATAACATACGAGAACTCATCGAATCCGTATCCATAATCATTTGGATTTTTATTCTAAGGCG AAAAAAAAGAATAGGGCATTACTG ] [+] EMBL CD193508 [ GTTGTTGTTGTTATGATGATATATTCTGTTTAACATTACGATAACACTTATTATTCATCCTTAAAAAGTAACTATACATCTCTTAGTAAGGAGTAACATTTCTTGCTTTGATGCTGATATGTTAATGATTCTCTTCAAATTACATTTCTATCCTTTCAAGTTGTCCATAGCATACATATGACAGTATTTATCATATTTGAATTTCTTATGTTATATAACATACGAGAACTCATCGAATCCGTATCCATAATCATTTGGATTTTTATTCTAAGGCGAAAAAAAAAGAATAGGGCATTACTG ] [-] EMBL CD158049 [ gtTTGTTGTTATGATGATATATTCTGTTTAACATTACGATAACACTTATTATTCATCCTTAAAAAGTAACTATACATCTCTTAGTAAGGAGTAACATTTCTTGCTTTGATGCTGATATGTTAATGATTCTCTTCAAATTACATTTCTATCCTTTCAAGTTGTCCATAGCATACATATGACAGTATTTATCATATTTGAATTTCTTATGTTATATAACATAC ] [-] EMBL AI975861 [ ACATTTCTAACCTTTCAAGTTGTCCATAGCATACATATGACAGTATTTATCATATTTGAATTTCTTATGTTATATAACATACGAGAACTCATCGAATCCGTATCCATAATCATTTGGATTTTTATTCTAAGGCG AAAAAAAAGAATAGGGCATTACTGTTTCGTACTTTCGATCCACCCNCCCACACTGCCTTACATATACACACACACGCACATACCTTTTTTCATGTAATCTTCTCTTGTTTATTCGATTTTGTTCATTCATCATTCGTCAATGCATAAAGTTGAAAAAAAAGGATACAAACTAATAACAAATGGATCTTCAGTGTGTGTATTTTGATTTTTGGAATAATCGTCGCTTGTTTGTTTATTGTTTTCCAATTCAATTTATTATCATATTTTGTGTGTATCTGTTAAGGTTACAATGAATCATTACTGAAATATTTACTACTGATTTATTTTATGTGTTTTGTTGCTTCTTTAAAATGATTTAACAATGATTTCATTGTATTATGTAATTGTGCACAAAATATACAGTCATAA] [+] EMBL AA566189 [ tcacCCCCCCCACACTGCCTTACATATACACACACACGCACATACCTTTTTTCATGTAATCTTCTCTTGTTTATTCGATTTTGTTCATTCATCATTCGTCAATGCATAAAGTTG AAAAAAGGATACAAACT ] clustalw multiple alignements is not computed in this case |
Copyright Thu Nov 6 12:32:27 CET 2003 Hubert Wassner (hubert.wassner@noos.fr) | ||||