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Schistosoma mansoni
cluster # 10176 cluster # 10176       Sequences # 14       consensus # 3


see consensus multiple alignment with clustalw

Direct access to contigs :
consensus_10176#0 length = 1259 sequences # 7  
consensus_10176#1 length = 1227 sequences # 3  
consensus_10176#2 length = 648 sequences # 4  

consensusID : consensus_10176#0
NCBI blastX ! send the sequence to the NCBI site !
NCBI blastN ! send the sequence to the NCBI site !
Sequences nbr = 7
consensus length = 1259
fasta sequence
                              [AGGCCTCGAGCCATATTCGGCACGAGGAATGCAGAAAGACAATAAAGGACTTGTACTGGTAACCGGTGGTTCCGGATTCATTGGAAGTCATACAATTGTGGAACTGGTCAATAATGGCTACTCAGTTATCGCTTTGGATAACTTAAGTAATTCAAGTATTAATTGTATAGAACGTATTGAAAAAATAATTAATGAAAAATTACTCTTCTATGAAGTGAACTTACTAGATGAAAAAGCTGTAAATGATATCTTTGAAAAACATAAAATTGATTACGTCATACACTTTGCTGCTTTAAAATCCGTATCAGAATCAACTCAAAAGCCTATACAATATTACAACAATAATTTAGTGGGTATATTAAATTTATTGAAGGTGATGATTGAGCATAATGTTAAAAATTTCGTTCTATCCAGTTCTGCTACTGTCTATGGTGAACCGCAATTTTTACCACTTACGGAAAAACATCCAATTGGAAATTGTCAAAATTCATATGGTAATACAAAACTTTGTTGTGAATTAATCTTGAAGGATTTATATACATCTGATCCTACATGGAATATTATAAGTTTACGGTATTTTAATCCAGTCGGTGCACATGCCAGTGGATTAATTGGTGAAGATCCACAAGGAATTCCAAATAATCTAATGCCTTATGTAACTCAAGTAGCCAGTGGTTTATTACCTTACGTAAATGTTTATGGAAATGATTATTCAACAGTCGATGGGACAGGTGTTCGAGATTATATTCACGTTGTTGATCTAGCTGAAGCCCATACTAAATCATTGGATAAAGTCAAACAGAATTGTGGTTTTAAGGTATATAATTTAGGTACAGGACAAGGATATTCTGTATTACAAATGATCCAAGCGATGGAAAAAGCAAGTGGTAAAACCATTCCTTATACAATATGTCCAAGACGACCTGGTGACTGTGCAACTGTTTATTCAGATGCATCATTAGCTCAACAAGAGTTAGGATGGAAGGCAAAATATGACATTGATAAAATGTGTGAAGATTTATGGAATTGGCAGGTGAAAAATCCACAAGGTTATCTTACTTCAATCCATTTTAATAATTGATGAATTGATTTTTTCAGGTTTTACTTAATTTGTACTTTTTTCTTTCATTTTCTACTTTATATAATATCTATGATTGCGAAATTATGTTTTATTTTATGGGCTTTCTCTTAAATTAATTTGTTTTTATCAGGTATTTTGTATAGCGATTTCGCTTAATTTAATATGTGAATAAAGTTTT]

[+] EMBL CD081620             [AGGCCTCGAGCCATATTCGGCACGAGGAATGCAGAAAGACAATAAAGGACTTGTACTGGTAACCGGTGGTTCCGGATTCATTGGAAGTCATACAATTGTGGAACTGGTCAATAATGGCTACTCAGTTATCGCTTTGGATAACTTAAGTAATTCAAGTATTAATTGTATAGAACGTATTGAAAAAATAATTAATGAAAAATTACTCTTCTATGAAGTGAACTTACTAGATGAAAAAGCTGTAAATGATATCTTTGAAAAACATAAAATTGATTACGTCATACACTTTGCTGCTTTAAAATCCGTATCAGAATCAACTCAAAAGCCTATACAATATTACAACAATAATTTAGTGGGTATATTAAATTTATTGAAGGTGATGATTGAGCATAATGTTAAAAATTTCGTTCTATCCAGTTCTGCTACTGTCTATGGTGAACCGCAATTTTTACCACTTACGGAAAAACATCCAATTGGAAATTGTCAAAATTCATATGGTAATACAAAACTTTGTTGTGAATTAATCTTGAAGGATTTATATACATCTGATCCTACATGGAATATTATAAGTTTACGGTATTTTAATCCAGTCGGTGCACATGCCAGTGGATTAATTGGTGAAGATCCACAAGGAATTCCAAATAATCTAATGCCTTATGTAACTCAAGTAGCCAGTGGTTTATTACCTTACGTAAATGTTTATGGAAATGATTATTCAACAGTCGATGGGACAGGTGTTCGAGATTATATTCACGTTGTTGATCTAGCTGAAGCCCATACTAAATCATTGGATAAAGTCAAACAGAATTGTGGTTNTAAGGTATAT                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                    ]
[+] EMBL CD077507             [                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                    gaggAAATTTATTGAAGGTGATGATTGAGCATAATGTTAAAAATTTCGTTCTATCCAGTTCTGCTACTGTCTATGGTGAACCGCAATTTTTACCACTTACGGAAAAACATCCAATTGGAAATTGTCAAAATTCATATGGTAATACAAAACTTTGTTGTGAATTAATCTTGAAGGATTTATATACATCTGATCCTACATGGAATATTATAAGTTTACGGTATTTTAATCCAGTCGGTGCACATGCCAGTGGATTAATTGGTGAAGATCCACAAGGAATTCCAAATAATCTAATGCCTTATGTAACTCA                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                    ]
[+] EMBL CD078597             [                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                               GTGAACCGCAATTTTTACCACTTACGGAAAAACATCCAATTGGAAATTGTCAAAATTCATATGGTAATACAAAACTTTGTTGTGAATTAATCTTGAAGGATTTATATACATCTGATCCTACATGGAATATTATAAGTTTACGGTATTTTAATCCAGTCGGTGCACATGCCAGTGGATTAATTGGTGAAGATCCACAAGGAATTCCTAATAATCTAATGCCTTATGTAACTCAAGTAGCCAGTGGTTTATTACCTTACGT AATGTTTATGGAAATGATTATTCAACAGTCGATGGGACAGGTGTTCGAGATTATATTCACGTTGTTGATCTAGCTGAAGCCCATACTAAATCATTGGATAAAGTCAAACAGAATTGTGGTTTTAAGGTATATAATTTAGGTACAGGACAAGGATATTCTGTATTACAAATGATCCAAGCGATGGAAAAAGCAAGTGGTAAAACCATTCCTTATACAATATGTCCAAGACGACCTGGTGACTGTGCAACTGTTTATTCAGATGCATCATTAGCTCAACAAGAGTTAGGATGGAAGGCANAATATGACATTGATAAAATGTGTGAAGATTTATGGAATTGGCAGGTGAAAAATCCACAAGGTTATCT                                                                                                                                                                                                           ]
[-] EMBL CD165757             [                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                       AACTTTGTTGTGAATTAATCTTGAAGGATTTATATACATCTGATCCTACATGGAATATTATAAGTTTACGGTATTTTAATCCAGTCGGTGCACATGCCAGTGGATTAATTGGTGAAGATCCACAAGGAATTCCAAATAATCTAATGCCTTATGTAACTCAAGTAGCCAATGGTTTATTACCTTACGTAAATGTTTATGGAAATGATTATTCAACAGTCGATGGGACAGGTGTTCGAGATTATATTCACGTTGTTG                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                     ]
[-] EMBL CD073061             [                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                               CACAAGGAATTCCTAATAATCTAATGCCTTATGTAACTCAAGTAGCCAGTGGTTTATTACCTTACGT AATGTTTATGGAAATGATTATTCAACAGTCGATGGGACAGGTGTTCGAGATTATATTCACGTTGTTGATCTAGCTGAAGCCCATACTAAATCATTGGATAAAGTCAAACAGAATTGTGGTTTTAAGGTATATAATTTAGGTACAGGACAAGGATATTCTGTATTACAAATGATCCAAGCGATGGAAAAAGCAAGTGGTAAAACCATTCCTTATACAATATGTCCAAGACGACCTGGTGACTGTGCAACTGTTTATTCAGATGCATCATTAGCTCAACAAGAGTTAGGATGGAAGGCAAAATATGACATTGATAAAATGTGTGAAGATTTATGGAATTGGCAGGTGAAAAATCCACAAGGTTATCTTACTTCAATCCATTTTAATAATTGATGAATTGATTTTTTCAGGTTTTACTTAATTTGTACTTTTTTCTTTCATTTTCTACTTTATATAATATCTATGATTGCGAAATTATGTTTTATTTTATGGGCTTTCTCTTAAATTAATTTGTTTTTATCAGGTATTTTGTATAGCGATTTCGCTTAATTTAATATGTGAATAAAGTTTT]
[-] EMBL CD076738             [                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                        GCCTTATGTAACTCAAGTAGCCAGTGGTTTATTACCTTACGTAAATGTTTATGGAAATGATTATTCAACAGTCGATGGGACAGGTGTTCGAGATTATATTCACGTTGTTGATCTAGCTGAAGCCCATACTAAATCATTGGATAAAGTCAAACAGAATTGTGGTTTTAAGGTATATAATTTAGGTACAGGACAAGGATATTCTGTATTACAAATGATCCAAGCGATGGAAAAAGCAAGTGGTAAAACCATTCCTTATACAATATGTCCAAGACGACCTGGTGACTGTGCAACTGTTTATTCAGATGCATCATTAGCTCAACAAGAGTTAGGATGGAAGGCAAAATATGACATTGATAAAATGTGTGAAGATTTATGGAATTGGCAGGTGAAAAATCCACAAGGTTATCTTACTTCAATCCATTTTAATAATTGATGAATTGATTTTTTCAGGTTTTACTTAATTTGTACTTTTTTCTTTCATTTTCTACTTTATATAATATCTATGATTGCGAAATTATGTTTTATTTTATGGGCTTTCTCTTAAATTAATTTGTTTTTATCAGGTATTTTGTATAGCGATTTCGCTTAATTTAATATGTGAATAAAGTTTT]
[-] EMBL CD075364             [                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                           CTTACGTAAATGTTTATGGAAATGATTATTCAACAGTCGATGGGACAGGTGTTCGAGATTATATTCACGTTGTTGATCTAGCTGAAGCCCATACTAAATCATTGGATAAAGTCAAACAGAATTGTGGTTTTAAGGTATATAATTTAGGTACAGGACAAGGATATTCTGTATTACAAATGATCCAAGCGATGGAAAAAGCAAGTGGTAAAACCATTCCTTATACAATATGTCCAAGACGACCTGGTGACTGTGCAACTGTTTATTCAGATGCATCATTAGCTCAACAAGAGTTAGGATGGAAGGCAAAATATGACATTGATAAAATGTGTGAAGATTTATGGAATTGGCAGGTGAAAAATCCACAAGGTTATCTTACTTCAATCCATTTTAATAATTGATGAATTGATTTTTTCAGGTTTTACTTAATTTGTACTTTTTTCTTTCATTTTCTACTTTATATAATATCTATGATTGCGAAATTATGTTTTATTTTATGGGCTTTCTCTTAAATTAATTTGTTTTTATCAGGTATTTTGTATAGCGATTTCGCTTAATTTAATATGTGAATAAAGTTTT]


>consensus_10176#0 AGGCCTCGAGCCATATTCGGCACGAGGAATGCAGAAAGACAATAAAGGACTTGTACTGGT AACCGGTGGTTCCGGATTCATTGGAAGTCATACAATTGTGGAACTGGTCAATAATGGCTA CTCAGTTATCGCTTTGGATAACTTAAGTAATTCAAGTATTAATTGTATAGAACGTATTGA AAAAATAATTAATGAAAAATTACTCTTCTATGAAGTGAACTTACTAGATGAAAAAGCTGT AAATGATATCTTTGAAAAACATAAAATTGATTACGTCATACACTTTGCTGCTTTAAAATC CGTATCAGAATCAACTCAAAAGCCTATACAATATTACAACAATAATTTAGTGGGTATATT AAATTTATTGAAGGTGATGATTGAGCATAATGTTAAAAATTTCGTTCTATCCAGTTCTGC TACTGTCTATGGTGAACCGCAATTTTTACCACTTACGGAAAAACATCCAATTGGAAATTG TCAAAATTCATATGGTAATACAAAACTTTGTTGTGAATTAATCTTGAAGGATTTATATAC ATCTGATCCTACATGGAATATTATAAGTTTACGGTATTTTAATCCAGTCGGTGCACATGC CAGTGGATTAATTGGTGAAGATCCACAAGGAATTCCAAATAATCTAATGCCTTATGTAAC TCAAGTAGCCAGTGGTTTATTACCTTACGTAAATGTTTATGGAAATGATTATTCAACAGT CGATGGGACAGGTGTTCGAGATTATATTCACGTTGTTGATCTAGCTGAAGCCCATACTAA ATCATTGGATAAAGTCAAACAGAATTGTGGTTTTAAGGTATATAATTTAGGTACAGGACA AGGATATTCTGTATTACAAATGATCCAAGCGATGGAAAAAGCAAGTGGTAAAACCATTCC TTATACAATATGTCCAAGACGACCTGGTGACTGTGCAACTGTTTATTCAGATGCATCATT AGCTCAACAAGAGTTAGGATGGAAGGCAAAATATGACATTGATAAAATGTGTGAAGATTT ATGGAATTGGCAGGTGAAAAATCCACAAGGTTATCTTACTTCAATCCATTTTAATAATTG ATGAATTGATTTTTTCAGGTTTTACTTAATTTGTACTTTTTTCTTTCATTTTCTACTTTA TATAATATCTATGATTGCGAAATTATGTTTTATTTTATGGGCTTTCTCTTAAATTAATTT GTTTTTATCAGGTATTTTGTATAGCGATTTCGCTTAATTTAATATGTGAATAAAGTTTT



consensusID : consensus_10176#1
NCBI blastX ! send the sequence to the NCBI site !
NCBI blastN ! send the sequence to the NCBI site !
Sequences nbr = 3
consensus length = 1227
fasta sequence
                              [GGCACGAGGACTATTATCGTATTCAGAATTCGTGTGAATGCAGTAAAGACAATAAAGGACTTGTACTGGTAACCGGTGGTTCCGGATTCATTGGAAGTCATACAATTGTGGAACTGGTCAATAATGGCTACTCAGTTATCGCTTTGGATAACTTAAGTAATTCAAGTATTAATTGTATAGAACGTATTGAAAAAATAATTAATGAAAAATTACTCTTCTATGAAGTGAACTTACTAGATGAAAAAGCTGTAAATGATATCTTTGAAAAACATAAAATTGATTACGTCATACACTTTGCTGCTTTAAAATCCGTATCAGAATCAACTCAAAAGCCTATACAATATTACAACAATAATTTAGTGGGTATATTAAATTTATTGAAGGTGATGATTGAGCATAATGTTAAAAATTTCGTTCTATCCAGTTCTGCTACTGTCTATGGTGAACCGCAATTTTTACCACTTACGGAAAAACATCCAATTGGAAATTGTCAAAATTCATATGGTAATACAAAACTTTGTTGTGAATTAATCTTGAAGGATTTATATACATCTGATCCTACATGGAATATTATAAGTTTACGGTATTTTAATCCAGTCGGTGCACATGCCAGTGGATTAATTGGTGAAGATCCACANNGAATNNTCC-AAT-ATCTAATGCCTTATGTAACTCAAGTAGCCAGTGGTTTATTACCTTACGTAAATGTTTATGGAAATGATTATTCAACAGTCGATGGGACAGGTGTTCGAGATTATATTCACGTTGTTGATCTAGCTGAAGCCCATACTAAATCATTGGATAAAGTCAAACAGAATTGTGGTTTTAAGGTATATAATTTAGGTACAGGACAAGGATATTCTGTATTACAAATGATCCAAGCGATGGAAAAAGCAAGTGGTAAAACCATTCCTTATACAATATGTCCAAGACGACCTGGTGACTGTGCAACTGTTTATTCAGATGCATCATTAGCTCAACAAGAGTTAGGATGGAAGGCAAAATATGACATTGATAAAATGTGTGAAGATTTATGGAATTGGCAGGTGAAAAATCCACAAGGTTATCTTACTTCAATCCATTTTAATAATTGATGAATTGATTTTTTCAGGTTTTACTTAATTTGTACTTTTTTCTTTCATTTTCTACTTTATATAATATCTATGATTGCGAAATTATGTTTTATTTTATGGGCTTTCTCTTAAATTAAAAAACAGTTGGCCGCGGCCG]

[+] EMBL CD083165             [GGCACGAGGACTATTATCGTATTCAGAATTCGTGTGAATGCAGTAAAGACAATAAAGGACTTGTACTGGTAACCGGTGGTTCCGGATTCATTGGAAGTCATACAATTGTGGAACTGGTCAATAATGGCTACTCAGTTATCGCTTTGGATAACTTAAGTAATTCAAGTATTAATTGTATAGAACGTATTGAAAAAATAATTAATGAAAAATTACTCTTCTATGAAGTGAACTTACTAGATGAAAAAGCTGTAAATGATATCTTTGAAAAACATAAAATTGATTACGTCATACACTTTGCTGCTTTAAAATCCGTATCAGAATCAACTCAAAAGCCTATACAATATTACAACAATAATTTAGTGGGTATATTAAATTTATTGAAGGTGATGATTGAGCATAATGTTAAAAATTTCGTTCTATCCAGTTCTGCTACTGTCTATGGTGAACCGCAATTTTTACCACTTACGGAAAAACATCCAATTGGAAATTGTCAAAATTCATATGGTAATACAAAACTTTGTTGTGAATTAATCTTGAAGGATTTATATACATCTGATCCTACATGGAATATTATAAGTTTACGGTATTTTAATCCAGTCGGTGCACATGCCAGTGGATTAATTGGTGAAGATCCACANNGAATNNTCC AAT ATCTAATGCCTTATGTAAC                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                             ]
[+] EMBL SMAA8301             [                                                                                                                                                                                                                                        atTAGATGAAAAAGCTGTAAATGATATCTTTGAAAAACATAAAATTGATTACGTCATACACTTTGCTGCTTTAAAATCCGTATCAGAATCAACTCAAAAGCCTATACAATATTACAACAATAATTTCGTGGGT                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                ]
[-] EMBL CD075442             [                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                          GTGAA TAATCTTGAAGGATTTATATACATCTGATCNTACATGGAATATTATAAGTTTACGGTATTTTAATCCAGTCGGTGCACATGCCAGTGGATTAATTGGTGAAGATCCACAAGGAAT  TCCAAATAATCTAATGCCTTATGTAACTCAAGTAGCCAGTGGTTTATTACCTTACGTAAATGTTTATGGAAATGATTATTCAACAGTCGATGGGACAGGTGTTCGAGATTATATTCACGTTGTTGATCTAGCTGAAGCCCATACTAAATCATTGGATAAAGTCAAACAGAATTGTGGTTTTAAGGTATATAATTTAGGTACAGGACAAGGATATTCTGTATTACAAATGATCCAAGCGATGGAAAAAGCAAGTGGTAAAACCATTCCTTATACAATATGTCCAAGACGACCTGGTGACTGTGCAACTGTTTATTCAGATGCATCATTAGCTCAACAAGAGTTAGGATGGAAGGCAAAATATGACATTGATAAAATGTGTGAAGATTTATGGAATTGGCAGGTGAAAAATCCACAAGGTTATCTTACTTCAATCCATTTTAATAATTGATGAATTGATTTTTTCAGGTTTTACTTAATTTGTACTTTTTTCTTTCATTTTCTACTTTATATAATATCTATGATTGCGAAATTATGTTTTATTTTATGGGCTTTCTCTTAAATTAAAAAACAGTTGGCCGCGGCCG]


>consensus_10176#1 GGCACGAGGACTATTATCGTATTCAGAATTCGTGTGAATGCAGTAAAGACAATAAAGGAC TTGTACTGGTAACCGGTGGTTCCGGATTCATTGGAAGTCATACAATTGTGGAACTGGTCA ATAATGGCTACTCAGTTATCGCTTTGGATAACTTAAGTAATTCAAGTATTAATTGTATAG AACGTATTGAAAAAATAATTAATGAAAAATTACTCTTCTATGAAGTGAACTTACTAGATG AAAAAGCTGTAAATGATATCTTTGAAAAACATAAAATTGATTACGTCATACACTTTGCTG CTTTAAAATCCGTATCAGAATCAACTCAAAAGCCTATACAATATTACAACAATAATTTAG TGGGTATATTAAATTTATTGAAGGTGATGATTGAGCATAATGTTAAAAATTTCGTTCTAT CCAGTTCTGCTACTGTCTATGGTGAACCGCAATTTTTACCACTTACGGAAAAACATCCAA TTGGAAATTGTCAAAATTCATATGGTAATACAAAACTTTGTTGTGAATTAATCTTGAAGG ATTTATATACATCTGATCCTACATGGAATATTATAAGTTTACGGTATTTTAATCCAGTCG GTGCACATGCCAGTGGATTAATTGGTGAAGATCCACANNGAATNNTCCAATATCTAATGC CTTATGTAACTCAAGTAGCCAGTGGTTTATTACCTTACGTAAATGTTTATGGAAATGATT ATTCAACAGTCGATGGGACAGGTGTTCGAGATTATATTCACGTTGTTGATCTAGCTGAAG CCCATACTAAATCATTGGATAAAGTCAAACAGAATTGTGGTTTTAAGGTATATAATTTAG GTACAGGACAAGGATATTCTGTATTACAAATGATCCAAGCGATGGAAAAAGCAAGTGGTA AAACCATTCCTTATACAATATGTCCAAGACGACCTGGTGACTGTGCAACTGTTTATTCAG ATGCATCATTAGCTCAACAAGAGTTAGGATGGAAGGCAAAATATGACATTGATAAAATGT GTGAAGATTTATGGAATTGGCAGGTGAAAAATCCACAAGGTTATCTTACTTCAATCCATT TTAATAATTGATGAATTGATTTTTTCAGGTTTTACTTAATTTGTACTTTTTTCTTTCATT TTCTACTTTATATAATATCTATGATTGCGAAATTATGTTTTATTTTATGGGCTTTCTCTT AAATTAAAAAACAGTTGGCCGCGGCCG



consensusID : consensus_10176#2
NCBI blastX ! send the sequence to the NCBI site !
NCBI blastN ! send the sequence to the NCBI site !
Sequences nbr = 4
consensus length = 648
fasta sequence
                              [AGNAATTCGGCACGAGGGGGAATTCCAAATGATCTAATGCCTTATGTAACTCAAGTAGCCAGTGGTTTATTACCTTACGTAAATGTTTATGGAAATGATTATTCAACAGTCGATGGGACAGGTGTTCGAGATTATATTCACGTTGTTGATCTAGCTGAAGCCCATACTAAATCATTGGATAAAGTCAAACAGAATTGTGGTTTTAAGGTATATAATTTAGGTACAGGACAAGGATATTCTGTATTAC-AAATGATCCAAGCGATGGAAAAAGCAAGTGGTAAAACCATTCCTTATACAATATGTCCAAGACGACCTGGTGACTGTGCAACTGTTTATTCAGATGCATCATTAGCTCAACAAGAGTTAG-GATGGAAGGCAAAATATGACATTGATAAAATGTGTGAAGATTTATGGAATTGGCAGGTGAAAAATCCACAAGGTTATCTTACTTCAATCCATTTTAATAATTGATGAATTGATTTTTTCAGGTTTTACTTAATTTGTACTTTTTTCTTTCATTTTCTACTTTATATAATATCTATGATTGCGAAATTATGTTTTATTTTATGGGCTTTCTCTTAAATTAATTTGTTTTTATCAGGTATTTTGTATAGCGATTTCGCTTAATTTAATATGTGAATAAAGTTT]

[+] EMBL CD081540             [AGNAATTCGGCACGAGGGGGAATTCCAAATGATCTAATGCCTTATGTAACTCAAGTAGCCAGTGGTTTATTACCTTACGTAAATGTTTATGGAAATGATTATTCAACAGTCGATGGGACAGGTGTTCGAGATTATATTCACGTTGTTGATCTAGCTGAAGCCCATACTAAATCATTGGATAAAGTCAAACAGAATTGTGGTTTTAAGGTATATAATTTAGGTACAGGACAAGGATATTCTGTATTAC AAATGATCCAAGCGATGGAAAAAGCAAGTGGTAAAACCATTCCTTATACAATATGTCCAAGACGACCTGGTGACTGTGCAACTGTTTATTCAGATGCATCATTAGCTCAACAAGAGTTAG GATGGAAGGCAAAATATGACATTGATAAAATGTGTGAAGATTTATGGAATTGGCAGGTGAAAAATCCACAAGGTTATCTTACTTCAATCCATTTTAATAATTGATGAATTGATTTTTTCAGGTTTTACTTAATTTGTACTTTTTTCTTTCATTTTCTACTTTATATAATATCTATGATTGCGAAATTATGTTTTATTTTATGGGCTTTCTCTTAAATTAATTTGTTTTTATCAGGTATTTTGTATAGCGATTTCGCTTAATTTAATATGTGAATAAAGTTT]
[-] EMBL CD145335             [                                                                                     TTTATGGAAATGATTATTCAACAGTCGATGGGACAGGTGTTCGAGATTATATTCACGTTGTTGATCTAGCTGAAGCCCATACTAAATCATTGGATAAAGTCAAATAGAATTGTGGTTTTAAGGTATATAATTCAGGTACAGGACAAGGATATTCTGTATTAC AAATGATCCAAGCGATGGAAAAAGCAAGTGGTAAAACCATTCCTTATACAATATGTCCAAGACGACCTGGTGACTGTGCAACTGTTTATTCAGATGCATCATTAGCTCAACAAGAGTTAGCGA CGAAGGCCAAATATGACATTGATAAAATGTGTGAAGATTTATGGAATTGGCAGGTGAAAAATCCGCAAGGTTATCTTACTTCAATCCATTTTAATAATTGATGAATTGATTTTTTCAGGTTTTACTTAATTTGTACTTTTTTCTTTCATTTTCTACTTTATATAATATCTATGATTGCGAAATTATGTTT                                                                                        ]
[+] EMBL SMAA69082            [                                                                                                                                                                                                                                          TATTCTGTATTAC AAATGATCCAAGCGATGGAAAAAGCAAGTGGTAAAACCATTCCTTATACAATATGTCCAAGACGACCTGGTGACTGTNCAACTGTTTATTCAGATGCATCATTAGCTCAACAAGAGTTAG GATGGAAGGCAAAATATGACATTGATAAAATGTGTGAAGATTTATGGAATTGGC GGTGAAAAAT                                                                                                                                                                                                                        ]
[-] EMBL CD181761             [                                                                                                                                                                                                                                            aTCTGTA TACNNAATGATNCCAGCGATGGAAAAAGCAAGTGGTAAAACCATTCCTTATACAATATGTCCAAGACGACCTGGTGACTGTGCAACTGTTTATTCAGATGCATCATTAGCTCAACAAGAGTTAG GATGGAAGGCAAAATATGACATTGATAAAATGTGTGAAGATTTATGGAATTGGCAGGTGAAAAATCCACAAGGTTATCTTACTTCAATCCATTTTAATAATTGATGAATTGATTTTTTCAGGTTTTACTTAATTTGTACTTTTTTCTTTCATTTTCTACTTTATATAATATCTATGATTGCGAAATTATGTTTTATTTTATGGGCTTTCTCTTAAATTAAT                                                            ]


>consensus_10176#2 AGNAATTCGGCACGAGGGGGAATTCCAAATGATCTAATGCCTTATGTAACTCAAGTAGCC AGTGGTTTATTACCTTACGTAAATGTTTATGGAAATGATTATTCAACAGTCGATGGGACA GGTGTTCGAGATTATATTCACGTTGTTGATCTAGCTGAAGCCCATACTAAATCATTGGAT AAAGTCAAACAGAATTGTGGTTTTAAGGTATATAATTTAGGTACAGGACAAGGATATTCT GTATTACAAATGATCCAAGCGATGGAAAAAGCAAGTGGTAAAACCATTCCTTATACAATA TGTCCAAGACGACCTGGTGACTGTGCAACTGTTTATTCAGATGCATCATTAGCTCAACAA GAGTTAGGATGGAAGGCAAAATATGACATTGATAAAATGTGTGAAGATTTATGGAATTGG CAGGTGAAAAATCCACAAGGTTATCTTACTTCAATCCATTTTAATAATTGATGAATTGAT TTTTTCAGGTTTTACTTAATTTGTACTTTTTTCTTTCATTTTCTACTTTATATAATATCT ATGATTGCGAAATTATGTTTTATTTTATGGGCTTTCTCTTAAATTAATTTGTTTTTATCA GGTATTTTGTATAGCGATTTCGCTTAATTTAATATGTGAATAAAGTTT



consensus multiple alignement with clustalw

CLUSTAL W (1.82) multiple sequence alignment


consensus_10176#0      ----------AGGCCTCGAGCCATATTCGGCACGAGGAATGCAGAAAGACAATAAAGGAC 50
consensus_10176#2      ------------------------------------------------------------
consensus_10176#1      GGCACGAGGACTATTATCGTATTCAGAATTCGTGTGAATGCAGTAAAGACAATAAAGGAC 60
                                                                                   

consensus_10176#0      TTGTACTGGTAACCGGTGGTTCCGGATTCATTGGAAGTCATACAATTGTGGAACTGGTCA 110
consensus_10176#2      ------------------------------------------------------------
consensus_10176#1      TTGTACTGGTAACCGGTGGTTCCGGATTCATTGGAAGTCATACAATTGTGGAACTGGTCA 120
                                                                                   

consensus_10176#0      ATAATGGCTACTCAGTTATCGCTTTGGATAACTTAAGTAATTCAAGTATTAATTGTATAG 170
consensus_10176#2      ------------------------------------------------------------
consensus_10176#1      ATAATGGCTACTCAGTTATCGCTTTGGATAACTTAAGTAATTCAAGTATTAATTGTATAG 180
                                                                                   

consensus_10176#0      AACGTATTGAAAAAATAATTAATGAAAAATTACTCTTCTATGAAGTGAACTTACTAGATG 230
consensus_10176#2      ------------------------------------------------------------
consensus_10176#1      AACGTATTGAAAAAATAATTAATGAAAAATTACTCTTCTATGAAGTGAACTTACTAGATG 240
                                                                                   

consensus_10176#0      AAAAAGCTGTAAATGATATCTTTGAAAAACATAAAATTGATTACGTCATACACTTTGCTG 290
consensus_10176#2      ------------------------------------------------------------
consensus_10176#1      AAAAAGCTGTAAATGATATCTTTGAAAAACATAAAATTGATTACGTCATACACTTTGCTG 300
                                                                                   

consensus_10176#0      CTTTAAAATCCGTATCAGAATCAACTCAAAAGCCTATACAATATTACAACAATAATTTAG 350
consensus_10176#2      ------------------------------------------------------------
consensus_10176#1      CTTTAAAATCCGTATCAGAATCAACTCAAAAGCCTATACAATATTACAACAATAATTTAG 360
                                                                                   

consensus_10176#0      TGGGTATATTAAATTTATTGAAGGTGATGATTGAGCATAATGTTAAAAATTTCGTTCTAT 410
consensus_10176#2      ------------------------------------------------------------
consensus_10176#1      TGGGTATATTAAATTTATTGAAGGTGATGATTGAGCATAATGTTAAAAATTTCGTTCTAT 420
                                                                                   

consensus_10176#0      CCAGTTCTGCTACTGTCTATGGTGAACCGCAATTTTTACCACTTACGGAAAAACATCCAA 470
consensus_10176#2      ------------------------------------------------------------
consensus_10176#1      CCAGTTCTGCTACTGTCTATGGTGAACCGCAATTTTTACCACTTACGGAAAAACATCCAA 480
                                                                                   

consensus_10176#0      TTGGAAATTGTCAAAATTCATATGGTAATACAAAACTTTGTTGTGAATTAATCTTGAAGG 530
consensus_10176#2      ------------------------------------------------------------
consensus_10176#1      TTGGAAATTGTCAAAATTCATATGGTAATACAAAACTTTGTTGTGAATTAATCTTGAAGG 540
                                                                                   

consensus_10176#0      ATTTATATACATCTGATCCTACATGGAATATTATAAGTTTACGGTATTTTAATCCAGTCG 590
consensus_10176#2      ------------------------------------------------------------
consensus_10176#1      ATTTATATACATCTGATCCTACATGGAATATTATAAGTTTACGGTATTTTAATCCAGTCG 600
                                                                                   

consensus_10176#0      GTGCACATGCCAGTGGATTAATTGGTGAAGATCCACAAGGAATTCCAAATAATCTAATGC 650
consensus_10176#2      --------------------AGNAATTCGGCACGAGGGGGAATTCCAAATGATCTAATGC 40
consensus_10176#1      GTGCACATGCCAGTGGATTAATTGGTGAAGATCCACANNGAATNNTCCAATATCTAATGC 660
                                           *    *   *  * *    ****     *  *********

consensus_10176#0      CTTATGTAACTCAAGTAGCCAGTGGTTTATTACCTTACGTAAATGTTTATGGAAATGATT 710
consensus_10176#2      CTTATGTAACTCAAGTAGCCAGTGGTTTATTACCTTACGTAAATGTTTATGGAAATGATT 100
consensus_10176#1      CTTATGTAACTCAAGTAGCCAGTGGTTTATTACCTTACGTAAATGTTTATGGAAATGATT 720
                       ************************************************************

consensus_10176#0      ATTCAACAGTCGATGGGACAGGTGTTCGAGATTATATTCACGTTGTTGATCTAGCTGAAG 770
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                       ************************************************************

consensus_10176#0      CCCATACTAAATCATTGGATAAAGTCAAACAGAATTGTGGTTTTAAGGTATATAATTTAG 830
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consensus_10176#0      GTACAGGACAAGGATATTCTGTATTACAAATGATCCAAGCGATGGAAAAAGCAAGTGGTA 890
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                       *******       **  * *                                       

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Copyright Thu Nov 6 12:32:27 CET 2003 Hubert Wassner    (hubert.wassner@noos.fr)