These datas are free for academic use only, please contact me for any other use. Schistosoma mansoni see consensus multiple alignment with clustalw Direct access to contigs :
consensusID : consensus_10184#0 NCBI blastX ! send the sequence to the NCBI site ! NCBI blastN ! send the sequence to the NCBI site ! Sequences nbr = 14 consensus length = 611 fasta sequence [GGTTTTTCCCAAACCTGACACAAGATGAATTCTGGAGTAAAATGTCACTCATCTTGCCCTATTGCTTTCCATGATTTGAAAATGAACAAAAAACATCGTTATGTTTTGTTTCACATCAACGATGGAGGAGAAGTCAGCATT-CTAAAAAAAGCCGAGAGAGAGGCAACGT-ACCAAAA-TTTC-AGAGAAGATATGATTGAAGCAATGGAATTGAAAGACGGTCGGTACGTTGTATATGACTATGAATACCCCAATAAATGTACAGACTTGTTTTTTATAATGTGGACCCCGAAAAACTTAAGCACTAAAAAGAATATGGTGTATGCAGCCT-CAAAGTGTGCCGTAAAGTCTCAGTTCCAAGGAATCAAACATTTCTTGGAGGCACATGACCTAGAAGATATCAGTGAAGAGCGTTTTAATGAAGTGGGGAAGCAGAATAGATTGAGCTGAGTTATTGGAACTTTAATGT-GG-ATCATTTGTACGGATTACACTTTCTAACTGGATTTTACTTGTTTTTTTTCTAATTAATGCAACTCATCCCATGTATTTGATTTTCAGCTTCAGTTCAAACTTTGTATTTCCATAGTCTCTGACCAGACTGTTCTGTAGACGGT] [+] EMBL AI764903 [GGTTTTTCCCAAACCTGACACAAGATGAATTCTGGAGTAAAATGTCACTCATCTTGCCCTATTGCTTTCCATGATTTGAAAATGAACAAAAAACATCGTTATGTTTTGTTTCACATCAACGATGGAGGAGAAGTCAGCATT ATAAAAAAAGCCGAGAGAGAGGCAACGT ACCAAAA TTTC AGAGAAGATATGATTGAAGCAATGGAATTGAAAGACGGTCGGTACGTTGTATATGACTATGAATACCCCAATAAATGTACAGACTTGTTTTTTATAATGTGGACCCCGAAAAACTTAAGCACTAAAAAGAATATGGTGTATGCAGCNTYCAAAGTGTGCCGTAAAGTCTCAGTTCCAAGGAATCAAACATTTCTTGGAGGCACATGACCTAGAAGATATCAGTGAAGAGCGTTTTAATGAAGTGGGGAAGCAGAATAGATTGAGCTGAGTTATTGGAACTTTAATGT GG ATCATTTGTACGGATTACACTTT ] [+] EMBL AI764909 [GGTTTTTCCCAAACCTGACACAAGATGAATTCTGGAGTAAAATGTCACTCATCTTGCCCTATTGCTTTCCATGATTTGAAAATGAACAAAAAACATCGTTATGTTTTGTTTCACATCAACGATGGAGGAGAAGTCAGCATT NTAAAAAAAGCC ] [+] EMBL AI764910 [GGTTTTTCCCAAACCTGACACAAGATGAATTCTGGAGTAAAATGTCACTCATCTTGCCCTATTGCTTTCCATGATTTGAAAATGAACAAAAAACATCGTTATGTTTTGTTTCACATCAACGATGGAGGAGAAGTCAGCATTNCNAAAAAAAGCCGAGAGAGAGGCAACGTCACCAAAATTTTCGAGAGAA ] [+] EMBL CD119658 [ atcttcAATGAACAAAAAACATCGTTATGTTTTGTTTCACATCAACGATGGAGGAGAAGTCAGCATT CTAAAAAAAGCCGAGAGAGAGGCAACGT ACCAAAA TTTC AGAGAAGATATGATTGAAGCAATGGAATTGAAAGACGGTCGGTACGTTGTATATGACTATGAATACCCCAATAAATGTACAGACTTGTTTTTTATAATGTGGACCCCGAAAAACTTAAGCACTAAAAAGAATATGGTGTATGCAGCCT CAAAGTGTGCCGTAAAGTCTCAGTTCCAAGGAATCAAACATTTCTTGGAGGCACATGACCTACAACATATCAGTGAAGAGCGTTTTAATGAAGTGGGGA ] [+] EMBL CD119732 [ gccttcAATGAACAAAAAACATCGTTATGTTTTGTTTCACATCAACGATGGAGGAGAAGTCAGCATT CTAAAAAAAGCCGAGAGAGAGGCAACGT ACCAAAA TTTC AGAGAAGATATGATTGAAGCAATGGAATTGAAAGACGGTCGGTACGTTGTATATGACTATGAATACCCCAATAAATGTACAGACTTGTTTTTTATAATGTGGACCCCGAAAAACTTAAGCACTAAAAAGAATATGGCGTATGCAGCCT CAAAGTGTGCCGTAAAGTCTCAGTTCCAAGGAATCAAACATTTCTTGGAGGCACATGACCTAGAAGATATCAGTGAAGAGCGTTTTAATGAAGTGGGGA ] [+] EMBL CD146449 [ CGTTATGTTTTGTTTCACATCAACGATGGAGGAGAAGTCAGCATT CTAAAAAAAGCCGAGAGAGAGGCAACGT ACCAAAA TTTC AGAGAAGATATGATTGAAGCAATGGAATTGAAAGACGGTCGGTACGTTGTATATGACTATGAATACCCCAATAAATGTACAGACTTGTTTTTTATAATGTGGACCCCGAAAAACTTAAGCACTAAAAAGAATATGGTGTATGCAGCCT CAAAGTGTGCCGTAAAGTCTCAGTTCCAAGGAATCAAACATTTCTTGGAGGCACATGACCTAGAAGATATCAGTGAAG ] [-] EMBL CD126173 [ GCCGAGAGAGAGGCAACGT ACCAAAA TTTC AGAGAAGATATGATTGAAGCAATGGAATTGAAAGACGGTCGGTACGTTGTATATGACTATGAATACCCCAACAAATGTACAGACTTGTTTTTTATAATGTGGACCCCGAAAAACTTAAGCACTAAAAAGAATATGGTGTATGCAGCCT CAAAGTGTGCCGTAAAGTCTCAGTTCCTAGGAATCAAACATTTCTTGGAGGCACATGACCTAGAAGATATCAGTGAAGAGCGTTTTAATGAAGTGGGGAAGCAGAATAGATTGAGCTGAGTTATTGGAACTTTAATGT GG ATCATTTGTACGGATTACACTTTCTAACTGGATTTTACTTGTTTTTTTTCTAATTAATGCAACTCATCCCATGTATTTGATTTTCAGCTTCAGTTC AACTTTGTATTTCCATAGTCTC ] [+] EMBL CD199475 [ GGACCCCGAAAAACTTAAGCACTAAAAAGAATATGGTGTATGCAGCCT CAAAGTGTGCCGTAAAGTCTCAGTTCCAAGGAATCAAACATTTCTTGGAGGCACATGACCTAGAAGATATCAGTGAAGAGCGTTTTAATGAAGTGGGGAAGCAGAATAGATTGAGCTGAGTTATTGGAACTTTAATGT GG ATCATTTGTACGGATTA ] [+] EMBL CD119911 [ GTTTTAATGAAGTGGGGAAGCAGAATAGATTGAGCTGAGTTATTGGAACTTTAATGT GG ATCATTTGTACGGATTACACTTTCAAACTGGATTTAACTTGTTTTTTTTCAAATTAAGGCAACTCATCCCATGAATTTGATTTTCAGCTTCAGTTCAAACTTTGTATTTCCATAGTCTCTGACCA ] [+] EMBL CD119541 [ GTTTTAATGAAGTGGGGAAGCAGAATAGATTGAGCTGAGTTATTGGAACTTTAATGT GG ATCATTTGTACGGATTACACTTTCTAACTGGATTTTACTTGTTTTTTTTCTAATTAATGCAACTCATCCCATGTATTTGATTTTCAGCTTCAGTTCAAACTTTGTATTTCCATAGTCTCTGACCA ] [+] EMBL CD119561 [ GTTTTAATGAAGTGGGGAAGCAGAATAGATTGAGCTGAGTTATTGGAACTTTAATGT GG ATCATTTGTACGGATTACACTTTCTAACTGGATTTTACTTG TTTTTTTCTAATTAATGCAACTCATCCCATGTATTTGATTTTCAGCTTCAGTTCAAACTTTGTATTTCCATAGTCTCTGACCA ] [-] EMBL CD119449 [ TTTTAATGAAGTGGGGAAGCAGAATAGATTGAGCTGAGTTATTGGAACTTTAATATAAG ATCATTTGTACGGATTACACTTTCTAACTGGATTTTACTTGTTTTTTTTCTAATTAATGCAACTCATCCCATGTATTTGATTTTCAGCTTCAGTTCAAACTTTGTATTTCCATAGTCTCAGACCAGACTGTTCTGTAGACGGT] [-] EMBL CD119310 [ TTTTAATGAAGTGGGGAAGCAGAATAGATTTAGCTGAGTTATTGGAACTTTAATGT GG ATCATTTGTACGGATTACACCTTCTAACTGGATTTTACTTG GTTTTTTCTAATTAATGCAACTCATCCCATGTATTTTATTTTCAGCTTCAGTTCAAACTTTGTATTTCCATAGTCTCTGACCAG ] [-] EMBL CD119366 [ TTTTAATGAAGTGGGGAAGCAGAATAGATTGAGCTGAGTTATTGGAACTTTAATAT GGAATCATTTGTACGGATTACACTTTCTAACTGGATTTTACTTGTTTTTTTTCTAATTAATGCAACTCATCCCATGTATTTGATTTTCAGCTTCAGTTCAAACTTTGTATTTCCATAGTCTCAGACCAGACTGTTCTGTAGACGGT] clustalw multiple alignements is not computed in this case |
Copyright Thu Nov 6 12:32:27 CET 2003 Hubert Wassner (hubert.wassner@noos.fr) | ||||