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These datas are free for academic use only, please contact me for any other use. Schistosoma mansoni see consensus multiple alignment with clustalw Direct access to contigs :
consensusID : consensus_10200#0 NCBI blastX ! send the sequence to the NCBI site ! NCBI blastN ! send the sequence to the NCBI site ! Sequences nbr = 14 consensus length = 982 fasta sequence
[TTTGAGTATTGTAGAATTATATTTAATTAAAGATTAAATCTATGATTAGAATTTGATATATTCTATGTATTTGCGAATATTGATATGTCAGTCATATATAAGTAACCTTAAGCTAAACTGTCCTCATCGATCCATGTGGTTTGTGGTATCATATTCATCATTTCACTATACTGTTTTAAGCATAATTTATCATGTAGATAACCGCTGATGTGAAATGGCTTGGAAACGGGGGGGATTGTAATACTGTTCAATACATCATATCTTTTGAAATTTGTTGGTAAAAGTAGAAAATTTACTTGCTGTGCTTCAAGAAATGGTCCATTTATAGACGGTGTGTAATGTACATCAACACAAGCGATAGCTGGTATAAAACCATCAGCTGAGGCGGTAACTATGTATTTGCCT-TTTGTAAGAAGTCGATAATAATCACCAAATTGATCTGTATTTATATTGTGAAGTATAGGAGTGAGAGTAGTTGGATCAGTTATATTAGCTACTTTGATGATTGCGTTTTCTACTGGAATGTAAGTATTTTCCGCATATCCATATACAGTGCCTTTAATACCTCTATGGACTTGCAAAATATAGTTGAGCAGAGACATTTTATTTTCATTCCAATATCTTGGTAATTCAGAAGCGTTGGGAAACTTTTCACAACCCAATTCCAAAGTTATTTCGAAACTATTCGTGTGCAGATAATTGTAATCTTGCATTCCTCCATTCAACGAATACCATCTTGCACCATTTGTAATGCCATCATTGAAGTGGTTATCGGAGTCATAGCACTTTTTAATCCCTTTTTTCATTCGTGGATGTTTATCAGCATAGGATTCTGCTAGCTCAACAAAAGTAGGGTTGTCTGGTGTAATAGATTCGGCAGAATTCCCAGTTATTGACTTATCAAACGGATAATTTGCAACCAAATCACCACCATGCATATTAGCACCCAGCACAAAATTGATTTTGTCTAACCATTCCATTA]
[+] EMBL CD073896 [TTTGAGTATTGTAGAATTATATTTAATTAAAGATTAAATCTATGATTAGAATTTGATATATTCTATGTATTTGCGAATATTGATATGTCAGTCATATATAAGTAACCTTAAGCTAAACTGTCCTCATCGATCCATGTGGTTTGTGGTATCATATTCATCATTTCACTATACTGTTTTAAGCATAATTTATCATGTAAATAACCGCTGATGTGAAATGGCTTGGAAACGGGGGGGATTGTAATACTGTTCAATACATCATATCTTTTGAAATTTGTTGGTAAAAGTAGAAAATTTACTTGCTGTGCTTCAAGAAATGGTCCATTTATAGACGGTGTGTAATGTACATCAACACAAGCGATAGCTGGTATAAAACCATCAGCTGAGGCGGTAACTATGTATTTGCCT TTTGTAAGAAGTCGATAATAATCACCAAATTGATCTGTATTTATATTGCGAAGTATAGGAGTGAGAGTAGTTGGATCAGTTATATTAGCTACTTTGATGATTGCGTTTTCTACTGGAATGT ]
[+] EMBL CD073887 [ AGAATTATATTTAATAAAAGATTAAATCTATGATTAGAATTTGATATATTCTATGTATTTGCGAATATTGATATGTCAGTCATATATAAGTAACCTTAAGCTAAACTGTCCTCATCGATCCATGTGGTTTGTGGTATCATATTCATCATTTCACTATACTGTTTTAAGCATAATTTATCATGTAGATAACCGCTGATGTGAAATGGCTTGGAAACGGGGGGGATTGTAATACTGTTCAATACATCATATCTTTTGAAATTTGTTGGTAAAAGTAGAAAATTTACTTGCTGTGCTTCAAGAAATGGTCCATTTATAGACGGTGTGTAATGTACATCAACACAAGCGATAGCTGGTATAAAACCATCAGCTGAGGCGGTAACTATGTATTTGCCT TTTGTAAGAAGTCGATAATAATCACCAAATTGATCTGTATTTATATTGTGAAGTATAGGAGTGAGAGTAGTTGGATCAGTTATATTAGCTACTTTGATGATTGCGTTTTCTACTGGAATGTAAGTATTTTCCGCATATCCATATACAGTGCCTTTAATACCTCTATGGACTTGCAAAATATAGTTGAGCAGAGACATTTTATTTTCATTCCAATATCTTGGTAATTCAGAAGCGTTGGGAAACTTTTCACAACCCAATTCCAAAGTTATTTCGAAA ]
[+] EMBL CD076615 [ ATTTGATATATTCTATGTATTTGCGAATATTGATATGTCAGTCATATATAAGTAACCTTAAGCTAAACTGTCCTCATCGATCCATGTGGTTTGTGGTATCATATTCATCATTTCACTATACTGTTTTAAGCATAATTTATCATGTAGATAACCGCTGATGTGAAATGGCTTGGAAACGGGGGGGATTGTAATACTGTTCAATACATCATATCTTTTGAAATTTGTTGGTAAAAGTAGAAAATTTACTTGCTGTGCTTCAAGAAATGGTCCATTTATAGACGGTGTGTAATGTACAT AACACAAGCGATAGCTGGTATAAAACCATCAGCTGAGGCGGTAACTATGTATTTGCCT TTTGTAAGAAGTCGATAATAATCACCAAATTGATCTGTATTTATATTGTGAAGTATAGGAGTGAGAGTAGTTGGATCAGTTATATTAGCTACTTTGATGATTGCGTTTTCTACTGGAATGTAAGTATTTTCCGCATATCCATATACAGTGCCTTTAATACCTCTATGGACTTGC AAATATAG ]
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[+] EMBL CD149198 [ TCAGTTATATTAGCTACTTTGATGATTGCGTTTTCTACTGGAATGTAAGTATTTTCCGCATATCCATATACAGTGCCTTTAATACCTCTATGGACTTGCAAAATATAGTTGAGCAGAGACATTTTATTTTCATTCCAATATCTTGGTAATTCAGAAGCGT ]
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[-] EMBL CD195225 [ GTTATATTAGCTACTTTGATGATTGCGTTTTCTACTGGAATGTAAGTATTTTCCGCATATCCATATACAGTGCCTTTAATACCTCTATGGACTTGCAAAATATAGTTGAGCAGAGACATTATATTTTCATTCCAATATCTTGGTAATTCAGAAGCGTTGGGAAACTTTTCACAACCCAATTCCAAAGTTATTTCGAAACTATTCGTGTGCAGATAATTGTAATCTTGCATTCCTCCATTCAACGGATACCATCTTGCACCATTTGTAATGCCATCATTGAAGTGGTTATCGGAGTCATAGCACTTTTTAATCCCTTTTTTCATTCGTGGATGTTTATCAGCATAGGATTCTGCTAGCTCAACAAAAGTAGGGTTGTCTGGTGTAATAGATTCGGCAGAATTCCCAGTTATTGACTTATCAAACGGATAATTTGCAAC ]
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[-] EMBL CD111795 [ AAACTATTCGTGTGCAGATAATTGTAATCTTGCATTCCTCCATTCAACGAATACCATCTTGCACCATTTGTAATGCCATCATTGAAGTGGTTATCGGAGTCATAGCACTTTNTAATCCCTTTTTTCATTCGTGGATGTTTATCAGCATAGGATTCTGCTAGCTCAACAAAAGTAGGGTTGTCTGGTGTAATAGATTCGGCAGAATTCCCAGTTATTGACTTATCAAACGGATAATTTGCAACCAAATCACCACCATGCATATTAGCACCCAGCACAAAATTGATTTTGTCTAACCATTCCATTA]
clustalw multiple alignements is not computed in this case |
| Copyright Thu Nov 6 12:32:27 CET 2003 Hubert Wassner (hubert.wassner@noos.fr) | ||||