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Schistosoma mansoni
cluster # 10216 cluster # 10216       Sequences # 14       consensus # 3


see consensus multiple alignment with clustalw

Direct access to contigs :
consensus_10216#0 length = 1681 sequences # 9  
consensus_10216#1 length = 1183 sequences # 4  
consensus_10216#2 length = 575 sequences # 1  

consensusID : consensus_10216#0
NCBI blastX ! send the sequence to the NCBI site !
NCBI blastN ! send the sequence to the NCBI site !
Sequences nbr = 9
consensus length = 1681
fasta sequence
                              [ACTACGTTACATTTTGTAACGAGGCAGTTTGCGCAGTGTTCATTTTAATGAATATAGGTTCATTCAACTGAGCGTTTTAGGTGAAACTTGAAGTTTATGGAAGTTTTTGGGTCGCATCACCGTAGACGAAATGTATTCAGTCGCAGACATTGACTTAATTGAAGATCGTTATTATAGAGATTTACCAAGTTCTAAGCACAATCTGTCTTTTGCTGGCTGTGGCTTTCTCGGATTGTATCATATTGGTGTTTGTTGCTGTATTAAGCGTTTCGCACCCCATCTATATCAAAATAAACCAGTATCTGGAACTAGCGCTGGTGCATTAGCCGCAGCTTGTTTAGTGTGTGATTTGGATATGGATGTATGTGTTCGGCATATTTGTAAACTCGTTGAAAACACGAGACGCTTTATGCTTGGTCCATTTGATCCCCGATATAAAATAAGCGAATATTTAAAAGATGGCTTATCTCAGTTATTACCACCAGATGCTCATGTTTTGTGCTCTGATCGCCTTTCGATATCGTTAACGTGCTTCACTACGCGAAAGAACATCGTCGTCCGAAAGTATAAAAATAGGGATGAGGTAATCCAAGCTCTGCTGTGTTCTGCGTATATTCCTATTTTTAGTGGGTTTGTTCCCTTAACTTTTAGAGGTCAGCCTGTGGTCGATGACGGTTTATCAAACAATTTACTTAGCATAAACCAACAGACTATTAAAGTTAGTCCATTTGCTGGTGATTCAGATATATGTCCACTGGAATCAAAATGGGGCCCACAGTATCATAGAGCTCAGCCACAAAAGTACGAAGATGTGTTAGGTTCAATCTCATTACTGAATCTTTCAATGAGCTTCAACTTAACAAATATTAAACGTTTAGTGGGAATGGTGTGGCCAATGGCTCCTGATCAGTTGGTCAACTTAGCCAACCAAGGTTATGATGATGCATTACGGTTTTTAATTACACGTGGTTTTATTGCTTGTCGTATACATCAAACTCCAAGAGAATTTTCAAATATTTCTCGAATGAAATCACGAAACTCTCCACGGATTCGTCGATTACATAGTTGTGATTCACTTGTATCCAGTAAAATACATAATGATTCAGATAGTAATCAAAATCGCTACCCTGAAACAAGTTCAGTTGTTCGAACGGTCAAATCCTCTAAATTTATCGGTTCCGCACCTAAAAAATTAATTAGTGGCTCTGGGATCGGCCTAAATGTAGCTCACTGTTGTGCATGTCGAAATGAATTGTATAGGGCGATTAACTCTTCGTTACCTTCTTCATTGAGTTCACTTATTAGAGATAGTACAAAAATTCCACAATCATATTTAAACTGTATTCAAAGTCATCTTTGGATGTATGGATCATCTTTGTGCTCAATGAGTTTTAAACTGGTTGGTTTTCCTCTGAGGTTACAAATTAAATTTCTAATATATGTTATCTCCAGATATGTAGGGGCTTTAGAACAATCCCATATTGGTACTTATCACTTACTCAGTTTGTTGGATCTTTTAAAAGAGTCTCAGTGGTATCTTGAAACAGTGAACGAAACAGAACAAACTTCGACTAGTACACTAAATAAAGCAATCGATAAAACGATACCAATGTCCTTAGATTCAGATACCAAAAAGAGTTGTCATCGATTNTCTACAAACAGTCATCCAGTTATTTCAATG]

[-] EMBL CD180894             [ACTACGTTACATTTTGTAACGAGGCAGTTTGCGCAGTGTTCATTTTAATGAATATAGGTTCATTCAACTGAGCGTTTTAGGTGAAACTTGAAGTTTATGGAAGTTTTTGGGTCGCATCACCGTAGACGAAATGTATTCAGTCGCAGACATTGACTTAATTGAAGATCGTTATTATAGAGATTTACCAAGTTCTAAGCACAATCTGTCTTTTGCTGGCTGTGGCTTTCTCGGATTGTATCATATTGGTGTTTGTTGCTGTATTAAGCGTTTCGCACCCCATCTATATCAAAATAAACCAGTATCTG                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                ]
[+] EMBL CD162847             [         CATTTTGTAACGAGGCAGTTTGCGCAGTGTTCTTTTTAATGAATATAGGTTCATTCAACTGAGCGTTTTAGGTGAAACTTGAAGTTTATGGAAGTTTTTGGGTCGCATCACCGTAGACGAAATGTATTCAGTCGCAGACATTGACTTAATTGAAGATCGTTATTATAGAGATTTACCAAGTTCTAAGCACAATCTGTCTTTTGCTGGCTGTGGCTTTCTCGGATTGTATCATATTGGTGTTTGTTGCTGTATTAAGCGTTTCGCACCCCATCTATATCAAAATAAACCAGTATCTGGAACTAGCGCTGGTGCATTAGCCGCAGCTTGTTTAGTGTGTGATTTGGATATGGATGTATGTGTTCGGCATATTTGTAAACTCGTTGAAAACACGAGACGCTTTATGCTTGGTCCATTTGATCCCCGATATAAAATAAGCGAATATTTAAAAGATGGCTTATCTCAGTTATTACCACCAGATGCTCATGTTTTGTGCTCTGATCGCCTTTCGATATCGTTAACGTGCTTCACTACGCGAAAGAACATCGTCGTCCGAAAGTATAAAAATAGGGATGAGGTAATCCAAGCTCTGCTGTGTTCTGCGTAT                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                            ]
[-] EMBL CD160954             [                                                                                                                                                                                                                                                                                                                      AGCGCTGGTGCATTAGCCGCAGCTTGTNTAGTGTGTGATTTGGATATGGATGTATGTGTTCGGCATATTTGTAAACTCGTTGAAAACACGAGACGCTTTATGCTTGGTCCATTTGATCCCCGATATAAAATAAGCGAATATTTAAAAGATGGCTTATCTCAGTTATTACCACCAGATGCTCATGTTTTGTGCTCTGATCGCCTTTCGATATCGTTAACGTGCTTCACTACGCGAAAGAACATCGTCGTCCGAAAGTATAAAAATAGGGATGAGGTAATCCAAGCTCTGCTGTGTTCTGCGTATATTCCTATTTTTAGTGGGTTTGTTCCCTTAACTTTTAGAGGTCAGCCTGTGGTCGATGACGGTTTATCAAACAATTTACTTAGCATAAACCAACAGACTATTAAAGTTAGTCCATTTGCTGGTGATTCAGATATATGTCCACTGGAATCAAAATGGGGCCCACAGTATCATAGAGCTCAGCCACAAAAGTACGAAGATGTGTTAGGTTCAATCTCATTACTGAACCTTTCAATGAGCTTCAACTTAACAAATATTAAACGTTTAGTGGGAATGGTGTGACCAATGGCTCCTGATCAGTTGGT                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                              ]
[+] EMBL CD182190             [                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                     GAATCAAAATGGGGCCCACAGTATCATAGAGCTCAGCCACAAAAGTACGAAGATGTGTTAGGTTCAATCTCATTACTGAATCTTTCAATGAGCTTCAACTTAACAAATATTAAACGTTTAGTGGGAATGGTGTGGCCAATGGCTCCTGATCAGTTGGTCAACTTAGCCGACCAAGGTTATGATGATGCATTACGGTTTTTAATTACACGTGGTTTTATTGCTTGTCGTATACATCAAACTCCAAGAGAATTTTCAGATATTTCTCGAATGAAATCACGAAACTCTCCACGGATTCGTCGATTACATAGTTGTG                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                   ]
[+] EMBL CD061900             [                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                   CCCACAGTATCATAGAGCTCAGCCACAAAAGTACGAAGATGTGTTAGGTTCAATCTCATTACTGAATCTTTCAATGAGCTTCAACTTAACAAATATTAAACGTTTAGTGGGAATGGTGTGGCCAATGGCTCCTGATCAGTTGGTCAACTTAGCCAACCAAGGTTATGATGATGCATTACGGTTTTTAATTACACGTGGTTTTATTGCTTGTCGTATACATCAAACTCCAAGAGAATTTTCAAATATTTCTCGAATGAAATCACGAAACTCTCCACGGATTCGTCGATTACATAGTTGTGATTCACTTGTATCCAGTAAAA                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                              ]
[+] EMBL CD153440             [                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                  TCAACTTAGCCAACCAAGGTTATGATGATGCATTACGGTTTTTAATTACACGTGGTTTTATTGCTTGTCGTATACATCAAACTCCAAGAGAATTTTCAAATATTTCTCGAATGAAATCACGAAACTCTCCACGGATTCGTCGATTACATAGTTGTGATTCACTTGTATCCAGTAAAATACATAATGATTCAGATAGTAATCAAAATCGCTACCCTGAAACAAGTTCAGTTGTTCGAACGGTCAAATCCTCTAAATTTATCGGTTCCGCACCTAAAAAATTAATTAGTGGCTCTGGGATCGGCCTAAATGTAGCTCACTGTTGTGCATGTCGAAATGAATTGTATAGGGCGATTAACTCTTCGTTACCTTCTTCATTGAGTTCACTTATTAGAGATAGTACAAAAATTCCACAATCATATTTAAACTGTATTCAAAGTCATCTTTGGATGTATGGATCATCTTTGTGCTCAATGAGTTTTAAACTGGTTGGGTTTCCTCT                                                                                                                                                                                                                                                                            ]
[+] EMBL CD152987             [                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                  TCAACTTAGCCAACCAAGGTTATGATGATGCATTACGGTTTTTAATTACACGTGGTTTTATTGCTTGTCGTATACATCAAACTCCAAGAGAATTTTCAAATATTTCTCGAATGAAATCACGAAACTCTCCACGGATTCGTCGATTACATAGTTGTGATTCACTTGCATCCAGTAAAATACATAATGATTCAGATAGTAATCAAAATCGCTACCCTGAAACAAGTTCAGTTGTTCGAACGGTCAAATCCTCTAAATTTATCGGTTCCGCACCTAAAAAATTAATTAGTGGCTCTGGGATCGGCCTAAATGTAGCTCACTGTTGTGCATGTCGAAATGAATTGTATAGGGCGATTAACTCTTCGTTACCTTCTTCATTGAGTTCACTTATTAGAGATAGTACAAAAATTCCACAATCATATTTAAACTGTATTCAAAGTCATCTTTGGATGTATGGATCATCTTTGTGCTCAATGAGTTTTAAACTGGTTGGTTTTCCTCTGAGGTTACAAATTANATTTCTAATATATGNTATCTCCAGATATGTAGGG                                                                                                                                                                                                                           ]
[+] EMBL AI977454             [                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                      TTGTTCGAACGGTCAAATCCTCTAAATTTATCGGTTCCGCACCTAAAAAATTAATTAGTGGCTCTGGGATCGGCCTAAATGTAGCTCACTGTTGTGCATGTCGAAATGAATTGTATAGGGCGATTAACTCTTCGTTACCTTCTTCATTGAGTTCACTTATTAGAGATAGTACAAAAATTCCACAATCATATTTAAACTGTATTCAAAGTCATCTTTGGATGTATGGATCATCTTTGTGCTCAATGAGTTTTAAACTGGTTGGTTTTCCTCTGAGGTTACAAATTAAATTTCTAATATATGTTATCTCCAGATATGTAGGGGCTTTAGAACAATCCCATATTGGTACTTATCACTTACTCAGTTTGTTGGATCTTTTAAAAGAGTCTCAGTGGTATCTTGAAACAGTGAACGAAACAGAACAAACTTCGACTAGTACACTAAATAAAGCAATCGATAAAACGATACCAATGTCCTTAGATTCAGATACCAAAAAGAGTTGTCATCGATTNTCTACAAACAGTCATCCAGTTATTTCAATG]
[+] EMBL AI977599             [                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                      TTGTTCGAACGGTCAAATCCTCTAAATTTATCGGTTCCGCACCTAAAAAATTAATTAGTGGCTCTGGGATCGGCCTAAATGTAGCTCACTGTTGTGCATGTCGAAATGAATTGTATAGGGCGATTAACTCTTCGTTACCTTCTTCATTGAGTTCACTTATTAGAGATAGTACAAAAATTCCACAATCATATTTAAACTGTATTCAAAGTCATCTTTGGATGTATGGATCATCTTTGTGCTCAATGAGTTTTAAACTGGTTGGTTTTCCTCTGAGGTTACAAATTAAATTTCTAATATATGTTATCTCCAGATATGTAGGGGCTTTAGAACAATCCCATATTGGTACTTATCACTTACTCAGTTTGTTGGATCTTTTAAAAGAGTCTCAGTGGTATCTTGAAACAGTGAACGAAACAGAACAAACTTCGACTAGTACACTAAATAAAGCAATCGATAAAACGATACCAATGTCCTTAGATTCAGATACCANAAAGAGTTGTCATCGATTTTCTACAAACAGTCATCCAGTTATTTCAATG]


>consensus_10216#0 ACTACGTTACATTTTGTAACGAGGCAGTTTGCGCAGTGTTCATTTTAATGAATATAGGTT CATTCAACTGAGCGTTTTAGGTGAAACTTGAAGTTTATGGAAGTTTTTGGGTCGCATCAC CGTAGACGAAATGTATTCAGTCGCAGACATTGACTTAATTGAAGATCGTTATTATAGAGA TTTACCAAGTTCTAAGCACAATCTGTCTTTTGCTGGCTGTGGCTTTCTCGGATTGTATCA TATTGGTGTTTGTTGCTGTATTAAGCGTTTCGCACCCCATCTATATCAAAATAAACCAGT ATCTGGAACTAGCGCTGGTGCATTAGCCGCAGCTTGTTTAGTGTGTGATTTGGATATGGA TGTATGTGTTCGGCATATTTGTAAACTCGTTGAAAACACGAGACGCTTTATGCTTGGTCC ATTTGATCCCCGATATAAAATAAGCGAATATTTAAAAGATGGCTTATCTCAGTTATTACC ACCAGATGCTCATGTTTTGTGCTCTGATCGCCTTTCGATATCGTTAACGTGCTTCACTAC GCGAAAGAACATCGTCGTCCGAAAGTATAAAAATAGGGATGAGGTAATCCAAGCTCTGCT GTGTTCTGCGTATATTCCTATTTTTAGTGGGTTTGTTCCCTTAACTTTTAGAGGTCAGCC TGTGGTCGATGACGGTTTATCAAACAATTTACTTAGCATAAACCAACAGACTATTAAAGT TAGTCCATTTGCTGGTGATTCAGATATATGTCCACTGGAATCAAAATGGGGCCCACAGTA TCATAGAGCTCAGCCACAAAAGTACGAAGATGTGTTAGGTTCAATCTCATTACTGAATCT TTCAATGAGCTTCAACTTAACAAATATTAAACGTTTAGTGGGAATGGTGTGGCCAATGGC TCCTGATCAGTTGGTCAACTTAGCCAACCAAGGTTATGATGATGCATTACGGTTTTTAAT TACACGTGGTTTTATTGCTTGTCGTATACATCAAACTCCAAGAGAATTTTCAAATATTTC TCGAATGAAATCACGAAACTCTCCACGGATTCGTCGATTACATAGTTGTGATTCACTTGT ATCCAGTAAAATACATAATGATTCAGATAGTAATCAAAATCGCTACCCTGAAACAAGTTC AGTTGTTCGAACGGTCAAATCCTCTAAATTTATCGGTTCCGCACCTAAAAAATTAATTAG TGGCTCTGGGATCGGCCTAAATGTAGCTCACTGTTGTGCATGTCGAAATGAATTGTATAG GGCGATTAACTCTTCGTTACCTTCTTCATTGAGTTCACTTATTAGAGATAGTACAAAAAT TCCACAATCATATTTAAACTGTATTCAAAGTCATCTTTGGATGTATGGATCATCTTTGTG CTCAATGAGTTTTAAACTGGTTGGTTTTCCTCTGAGGTTACAAATTAAATTTCTAATATA TGTTATCTCCAGATATGTAGGGGCTTTAGAACAATCCCATATTGGTACTTATCACTTACT CAGTTTGTTGGATCTTTTAAAAGAGTCTCAGTGGTATCTTGAAACAGTGAACGAAACAGA ACAAACTTCGACTAGTACACTAAATAAAGCAATCGATAAAACGATACCAATGTCCTTAGA TTCAGATACCAAAAAGAGTTGTCATCGATTNTCTACAAACAGTCATCCAGTTATTTCAAT G



consensusID : consensus_10216#1
NCBI blastX ! send the sequence to the NCBI site !
NCBI blastN ! send the sequence to the NCBI site !
Sequences nbr = 4
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fasta sequence
                              [TCGAGGCCAGAATTGGGCACGAGGGAATTCCACAATCATATTTAAACTGTATTCAAAGTCATCTTTGGATGTATGGATCATCTTTGTGCTCAATGAGTTTTAAACTGGTTGGTTTTCCTCTGAGGTTACAAATTAAATTTCTAATATATGTTATCTCCAGATATGTAGGGGCTTTAGAACAATCCCATATTGGTACTTATCACTTACTCAGTTTGTTGGATCTTTTAAAAGAGTCTCAGTGGTATCTTGAAACAGTGAACGAAACAGAACAAACTTCGACTAGTACACTAAATAAAGCAATCGATAAAACGATACCAATGTCCTTAGATTCAGATACCAAAAAGAGTTGTCATCGATTTTCTACAAACAGTCATCCAGTTATTTCAATGATAAATTCAATTTTTTGGAAGGGAGCTGATCGCTTGAGTGGTTTGATTTTACGATTAAATTCGTTTGAGTTACCAACAGCCATGGACTGTGGATTAGAATTACTTTCTTACTCATCACAAAAGAGTGTCGCTAATCCGTGTTTGTTACATATGAATGATCTGGAGTCAGATATCAGTCAGGCGGATTGTAGATGTAAGGTAGAAAATAACGACAGTGGAATTTGTTGCACACCAAGCAATTCAGTTTTAGAAAACAAGTTTTTATTAACCGATAATGTAAATATCGACTCCAGCACACCTTACTCAGAATTTTAAATGTAAGGAAGGTGTTATCGATCATTTCATTTTAACTAGTCATAATTTGTTTTTCTTGCAAATCCTAACTGATTCGTTATCCATATTTTTTTAAGTGATTTTGATTTTTTTATTTGTTTCTTTATTTTTTTTGTCTATAAATGATTTAAACTAAACATAAATTTTTGATTTTGTTAGCTAATAACAAGATTATATTCTTTTTGAACATCTAGCACTTTGAAATTATTCCACAAAATATATTCTGTTTCCGTAGCAAATTTTTGTTATATAACATATGTCGGACATTTTACAAAACCTTTTGTTGCTCATTAATTGATACCTACTCAACATATGGGGGATTTCGTAAACATTTATTAGTCGTTTTGCATAGAGTATTTTAAATAACTTTGTAATCTTAACTTTCTAGTTTGTTTAGAATGTTATGTTTGCTAAAAGTCTTAATCTGTTAACTGCTATAGTTTTGTACTACAATACAAAGT]

[+] EMBL CD081359             [TCGAGGCCAGAATTGGGCACGAGGGAATTCCACAATCATATTTAAACTGTATTCAAAGTCATCTTTGGATGTATGGATCATCTTTGTGCTCAATGAGTTTTAAACTGGTTGGTTTTCCTCTGAGGTTACAAATTAAATTTCTAATATATGTTATCTCCAGATATGTAGGGGCTTTAGAACAATCCCATATTGGTACTTATCACTTACTCAGTTTGTTGGATCTTTTAAAAGAGTCTCAGTGGTATCTTGAAACAGTGAACGAAACAGAACAAACTTCGACTAGTACACTAAATAAAGCAATCGATAAAACGATACCAATGTCCTTAGATTCAGATACCAAAAAGAGTTGTCATCGATTTTCTACAAACAGTCATCCAGTTATTTCAATGATAAATTCAATTTTTTGGAAGGGAGCTGATCGCTTGAGTGGTTTGATTTTACGATTAAATTCGTTTGAGTTACCAACAGCCATGGACTGTGGATTAGAATTACTTTCTTACTCATCACAAAAGAGTGTCGCTAATCCGTGTTTGTTACATATGAATGATCTGGAGTCAGATATCAGTCAGGCGGATTGTAGATGTAAGGTAGAAAATAACGACAGTGGAATTTGTTGCACACCAAGCAATTCAGTTTTAGAAAACAAGTTTTTATTAACCGATAATGTAAATATCGACTTCAGCACACCT                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                              ]
[+] EMBL CD062079             [                                                                                                                                                       TATCTCCAGATATGTAGGGGCTTTAGAACAATCCCATATTGGTACTTATCACTTACTCAGTTTGTTGGATCTTTTAAAAGAGTCTCAGTGGTATCTTGAAACAGTGAACGAAACAGAACAAACTTCGACTAGTACACTAAATAAAGCAATCGATAAAACGATACCAATGTCCTTAGATTCAGATACCAAAAAGAGTTGTCATCGATTTTCTACAAACAGTCATCCAGTTATTTCAATGATAAATTCAATTTTTTGGAAGGGAGCTGATCGCTTGAGTGGTTTGATTTTACGATTAAATTCGTTTGAGTTACCAACAGCCATGGACTGTGGATTAGAATTACTTTCTTACTCATCACAAAAGAGTGTCGCTAATCCGTGTTTGTTACATATGAATGATCTGGAGTCAGATATCAGTCAGGCGGATTGTAGATGTA                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                      ]
[-] EMBL CD075193             [                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                          TATGAATGATCTGGAGTCAGATATCAGTCAGGCGGATTGTAGATGTAAGGTAGAAAATAACGACAGTGGAATTTGTTGCACACCAAGCAATTCAGTTTTAGAAAACAAGTTTTTATTAACCGATAATGTAAATATCGACTCCAGCACACCTTACTCAGAATTTTAAATGTAAGGAAGGTGTTATCGATCATTTCATTTTAACTAGTCATAATTTGTTTTTCTTGCAAATCCTAACTGATTCGTTATCCATATTTTTTTAAGTGATTTTGATTTTTTTATTTGTTTCTTTATTTTTTTTGTCTATAAATGATTTAAACTAAACATAAATTTTTGATTTTGTTAGCTAATAACAAGATTATATTCTTTTTGAACATCTAGCACTTTGAAATTATTCCACAAAATATATTCTGTTTCCGTAGCAAATTTTTGTTATATAACATATGTCGGACATTTTACAAAACCTTTTGTTGCTCATTAATTGATACCTACTCAACATATGGGGGATTTCGTAAACATTTATTAGTCGTTTTGCATAGAGTATTTTAAATAACTTTGTAATCTTAACTTTCTAGTTTGTTTAGAATGTTATGTTTGCTAAAAGTCTTAATCTGTTAACTGCTATAGTTTTGTACTACAATACAAAGT]
[-] EMBL CD073357             [                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                      CAGTTTTAGAAAACAAGTTTTTATTAACCGATAATGTAAATATCGACTCCAGCACACCTTACTCAGAATTTTAAATGTAAGGAAGGTGTTATCGATCATTTCATTTTAACTAGTCATAATTTGTTTTTCTTGCAAATCCTAACTGATTCGTTATCCATATTTTTTTAAGTGATTTTGATTTTTTTATTTGTTTCTTTATTTTTTTTGTCTATAAATGATTTAAACTACACATAAATTTTTGATTTTGTTAGCTAATAACAAGATTATATTCTTTTTGAACATCTAGCACTTTGAAATTATTCCCCAAAATATATTCTGTTTCCGTAGCAAATTTTTGTTATATAACATATGTCGGACATTTTACAAACCCTTTTGTTGCTCATTAATTGATACCTATTCAACATATGGGGGATTTCGTAAACATTTATTAGTCGTTTTGCATAGAGTATTTTAAATACCTTTGTAATCTTAACTTTCTAGTTTGTTTAGAATGTTATGTTTGCTAAAAGTCTTAATCTGTTAACTGCTATAGTTTTGTACTCCAATACAAAGT]


>consensus_10216#1 TCGAGGCCAGAATTGGGCACGAGGGAATTCCACAATCATATTTAAACTGTATTCAAAGTC ATCTTTGGATGTATGGATCATCTTTGTGCTCAATGAGTTTTAAACTGGTTGGTTTTCCTC TGAGGTTACAAATTAAATTTCTAATATATGTTATCTCCAGATATGTAGGGGCTTTAGAAC AATCCCATATTGGTACTTATCACTTACTCAGTTTGTTGGATCTTTTAAAAGAGTCTCAGT GGTATCTTGAAACAGTGAACGAAACAGAACAAACTTCGACTAGTACACTAAATAAAGCAA TCGATAAAACGATACCAATGTCCTTAGATTCAGATACCAAAAAGAGTTGTCATCGATTTT CTACAAACAGTCATCCAGTTATTTCAATGATAAATTCAATTTTTTGGAAGGGAGCTGATC GCTTGAGTGGTTTGATTTTACGATTAAATTCGTTTGAGTTACCAACAGCCATGGACTGTG GATTAGAATTACTTTCTTACTCATCACAAAAGAGTGTCGCTAATCCGTGTTTGTTACATA TGAATGATCTGGAGTCAGATATCAGTCAGGCGGATTGTAGATGTAAGGTAGAAAATAACG ACAGTGGAATTTGTTGCACACCAAGCAATTCAGTTTTAGAAAACAAGTTTTTATTAACCG ATAATGTAAATATCGACTCCAGCACACCTTACTCAGAATTTTAAATGTAAGGAAGGTGTT ATCGATCATTTCATTTTAACTAGTCATAATTTGTTTTTCTTGCAAATCCTAACTGATTCG TTATCCATATTTTTTTAAGTGATTTTGATTTTTTTATTTGTTTCTTTATTTTTTTTGTCT ATAAATGATTTAAACTAAACATAAATTTTTGATTTTGTTAGCTAATAACAAGATTATATT CTTTTTGAACATCTAGCACTTTGAAATTATTCCACAAAATATATTCTGTTTCCGTAGCAA ATTTTTGTTATATAACATATGTCGGACATTTTACAAAACCTTTTGTTGCTCATTAATTGA TACCTACTCAACATATGGGGGATTTCGTAAACATTTATTAGTCGTTTTGCATAGAGTATT TTAAATAACTTTGTAATCTTAACTTTCTAGTTTGTTTAGAATGTTATGTTTGCTAAAAGT CTTAATCTGTTAACTGCTATAGTTTTGTACTACAATACAAAGT



consensusID : consensus_10216#2
NCBI blastX ! send the sequence to the NCBI site !
NCBI blastN ! send the sequence to the NCBI site !
Sequences nbr = 1
consensus length = 575
fasta sequence
                              [ATAATTGTGAGTTTTGAATATGATTTAATTTGTAGTCTTTCGTAGACTCCGTCAGTCTGAACTGTTTCCTTATACGAGTTGGTTTTCATTGATGATACTTTCGTTTATTTCGGTGCTTTTTCAGATATGTAGGGGCTTTAGAACAATCCCATATTGGTACTTATCACTTACTCAGTTTGTTGGATCTTTTAAAAGAGTCTCAGTGGTATCTTGAAACAGTGAACGAAACAGAACAAACTTCGACTAGTACACTAAATAAAGCAATCGATAAAACGATACCAATGTCCTTAGATTCAGATACCAAAAAGAGTTGTCATCGATTTTCTACAAACAGTCATCCAGTTATTTCAATGATAAATTCAATTTTTTGGAAGGGAGCTGATCGCTTGAGTGGTTTGATTTTACGATTAAATTCGTTTGAGTTACCAACAGCCATGGACTGTGGATTAGAATTACTTTCTTACTCATCACAAAAGAGTGTCGCTAATCCGTGTTTGTTACATATGAATGATCTGGAGTCAGATATCAGTCAGGCGGATTGTAGATGTAAGGTAGAAAATAACGACAGTGGAATT]

[+] EMBL CD078898             [ATAATTGTGAGTTTTGAATATGATTTAATTTGTAGTCTTTCGTAGACTCCGTCAGTCTGAACTGTTTCCTTATACGAGTTGGTTTTCATTGATGATACTTTCGTTTATTTCGGTGCTTTTTCAGATATGTAGGGGCTTTAGAACAATCCCATATTGGTACTTATCACTTACTCAGTTTGTTGGATCTTTTAAAAGAGTCTCAGTGGTATCTTGAAACAGTGAACGAAACAGAACAAACTTCGACTAGTACACTAAATAAAGCAATCGATAAAACGATACCAATGTCCTTAGATTCAGATACCAAAAAGAGTTGTCATCGATTTTCTACAAACAGTCATCCAGTTATTTCAATGATAAATTCAATTTTTTGGAAGGGAGCTGATCGCTTGAGTGGTTTGATTTTACGATTAAATTCGTTTGAGTTACCAACAGCCATGGACTGTGGATTAGAATTACTTTCTTACTCATCACAAAAGAGTGTCGCTAATCCGTGTTTGTTACATATGAATGATCTGGAGTCAGATATCAGTCAGGCGGATTGTAGATGTAAGGTAGAAAATAACGACAGTGGAATT]


>consensus_10216#2 ATAATTGTGAGTTTTGAATATGATTTAATTTGTAGTCTTTCGTAGACTCCGTCAGTCTGA ACTGTTTCCTTATACGAGTTGGTTTTCATTGATGATACTTTCGTTTATTTCGGTGCTTTT TCAGATATGTAGGGGCTTTAGAACAATCCCATATTGGTACTTATCACTTACTCAGTTTGT TGGATCTTTTAAAAGAGTCTCAGTGGTATCTTGAAACAGTGAACGAAACAGAACAAACTT CGACTAGTACACTAAATAAAGCAATCGATAAAACGATACCAATGTCCTTAGATTCAGATA CCAAAAAGAGTTGTCATCGATTTTCTACAAACAGTCATCCAGTTATTTCAATGATAAATT CAATTTTTTGGAAGGGAGCTGATCGCTTGAGTGGTTTGATTTTACGATTAAATTCGTTTG AGTTACCAACAGCCATGGACTGTGGATTAGAATTACTTTCTTACTCATCACAAAAGAGTG TCGCTAATCCGTGTTTGTTACATATGAATGATCTGGAGTCAGATATCAGTCAGGCGGATT GTAGATGTAAGGTAGAAAATAACGACAGTGGAATT



consensus multiple alignement with clustalw

CLUSTAL W (1.82) multiple sequence alignment


consensus_10216#1      ------------------------------------------------------------
consensus_10216#2      ------------------------------------------------------------
consensus_10216#0      ACTACGTTACATTTTGTAACGAGGCAGTTTGCGCAGTGTTCATTTTAATGAATATAGGTT 60
                                                                                   

consensus_10216#1      ------------------------------------------------------------
consensus_10216#2      ------------------------------------------------------------
consensus_10216#0      CATTCAACTGAGCGTTTTAGGTGAAACTTGAAGTTTATGGAAGTTTTTGGGTCGCATCAC 120
                                                                                   

consensus_10216#1      ------------------------------------------------------------
consensus_10216#2      ------------------------------------------------------------
consensus_10216#0      CGTAGACGAAATGTATTCAGTCGCAGACATTGACTTAATTGAAGATCGTTATTATAGAGA 180
                                                                                   

consensus_10216#1      ------------------------------------------------------------
consensus_10216#2      ------------------------------------------------------------
consensus_10216#0      TTTACCAAGTTCTAAGCACAATCTGTCTTTTGCTGGCTGTGGCTTTCTCGGATTGTATCA 240
                                                                                   

consensus_10216#1      ---------------------------------------TCGAGGCCAGAATTGGGCACG 21
consensus_10216#2      ------------------------------------------------------------
consensus_10216#0      TATTGGTGTTTGTTGCTGTATTAAGCGTTTCGCACCCCATCTATATCAAAATAAACCAGT 300
                                                                                   

consensus_10216#1      AGGGAATTCCACAATCAT--ATTTAAACTGTATTCAAAGTCATCTTTGGATGTATGGATC 79
consensus_10216#2      ----------ATAATTGTGAGTTTTGAATATGATTTAATTTGTAGTCTTTCGTAGACTCC 50
consensus_10216#0      ATCTGGAACTAGCGCTGGT-GCATTAGCCGCAGCTTGTTTAGTGTGTGATTTGGATATGG 359
                                 *            *               *  *                 

consensus_10216#1      ATCTTTGTGCTCAATGAGTTT-TAAACTGGTTGGTTTTCCTCTGAGGTTACAAATTAAAT 138
consensus_10216#2      GTCAGTCTGAACTGTTT-CCT-TATACGAGTTGGTTTTCAT-TGATGATAC---TTTCGT 104
consensus_10216#0      ATGTATGTGTTCGGCATATTTGTAAACTCGTTGAAAA-CACGAGACGCTTTATGCTTGGT 418
                        *   * **  *        * ** **  ****     *    ** * *      *   *

consensus_10216#1      TTCTAATATATGTTATCTCCAGATATGTAGGGGCTTTAGAACAATCCCATATTGGTACTT 198
consensus_10216#2      TTATTTCG-GTGCT-TTTTCAGATATGTAGGGGCTTTAGAACAATCCCATATTGGTACTT 162
consensus_10216#0      CCATTTGATCCCCGATATA-AAATAAGCGAATATTTAAAAGATGGCTTATCTCAGTTATT 477
                          *           * *  * *** *       ** * *     *  ** *  **  **

consensus_10216#1      ATCACTTACTCAGTTTGTTGGATCTTTTAAAAGAGTCTCAGT---GGTATCTTGAAACAG 255
consensus_10216#2      ATCACTTACTCAGTTTGTTGGATCTTTTAAAAGAGTCTCAGT---GGTATCTTGAAACAG 219
consensus_10216#0      ACCACCAGATGCTCATGTTTTGTGCTCTGATCGCCTTTCGATATCGTTAACGTGCTTCAC 537
                       * ***    *     ****   *  * * *  *  * **  *   * ** * **   ** 

consensus_10216#1      TGAACGAAACAGAACAAACTTCGACTAGTACACTAA-----ATAAAGCAATCGATAAAAC 310
consensus_10216#2      TGAACGAAACAGAACAAACTTCGACTAGTACACTAA-----ATAAAGCAATCGATAAAAC 274
consensus_10216#0      TACGCGAAAGAACATCGTCGTCCGAAAGTATAAAAATAGGGATGAGGTAATCCA-AGCTC 596
                       *   ***** *  *    * **    **** *  **     ** * * **** * *   *

consensus_10216#1      GATACCAATGTCCTTAGATTCAGATACCAAAAAGAGTTGTCATCG-ATTTTCTACAAACA 369
consensus_10216#2      GATACCAATGTCCTTAGATTCAGATACCAAAAAGAGTTGTCATCG-ATTTTCTACAAACA 333
consensus_10216#0      TGCTGTGTTCTGCGTATATTCCTATTTTTAGTGGGTTTGTTCCCTTAACTTTTAGAGGTC 656
                               * * * ** ****  **    *   *  ****   *  *  ** ** *    

consensus_10216#1      GTCATCCAGTTATT-----TCAATGATAAATTCAATTTTTTGGAAGGGAGCTGATCGCTT 424
consensus_10216#2      GTCATCCAGTTATT-----TCAATGATAAATTCAATTTTTTGGAAGGGAGCTGATCGCTT 388
consensus_10216#0      AGCCTGTGGTCGATGACGGTTTATCAAACAATTTACTTAGCATAAACCAACAGACTATTA 716
                         * *   **   *     *  ** * * * *  * **     **   * * **    * 

consensus_10216#1      GAGTGGTTTGATTTTACGATTAAATTCGTTTGAGTTACCAACAGCCATGGACTGTGGATT 484
consensus_10216#2      GAGTGGTTTGATTTTACGATTAAATTCGTTTGAGTTACCAACAGCCATGGACTGTGGATT 448
consensus_10216#0      AAGTTAGTCCATTTGCTGGT--GATTCAGATATATGTCCACTGGAATCAAAATGGGGCCC 774
                        ***   *  ****   * *   ****   *   *  ***   *      * ** **   

consensus_10216#1      AGAATTACTTTCTTACTCA-TCACAAAAG------AGTGTCGCTAATCCGTGTTTGTTAC 537
consensus_10216#2      AGAATTACTTTCTTACTCA-TCACAAAAG------AGTGTCGCTAATCCGTGTTTGTTAC 501
consensus_10216#0      ACAGT-ATCATAGAGCTCAGCCACAAAAGTACGAAGATGTGTTAGGTTCAATCTCATTAC 833
                       * * * *   *    ****  ********        ***      * *    *  ****

consensus_10216#1      ATA-----TGAATGATCTGGAGTCAGATATCAGTCAGGCGGATTGTAGATGTAAGGTAGA 592
consensus_10216#2      ATA-----TGAATGATCTGGAGTCAGATATCAGTCAGGCGGATTGTAGATGTAAGGTAGA 556
consensus_10216#0      TGAATCTTTCAATGAGCTTCAACTTAACAAATATTAAACGTTTAGTGGGAATGGTGTGGC 893
                         *     * ***** **  *     * *    * *  **  * ** *   *   ** * 

consensus_10216#1      AAATAACGACAGTGGAATTTGTT------GCACACCAAG------------CAATTCAGT 634
consensus_10216#2      AAATAACGACAGTGGAATT----------------------------------------- 575
consensus_10216#0      CAATGGCTCCTGATCAGTTGGTCAACTTAGCCAACCAAGGTTATGATGATGCATTACGGT 953
                        ***  *  * *   * **                                         

consensus_10216#1      TTTAGAAAACAAGTTTTTATTAACCGATAATGTAAATATCGA-CTCCAGCACACCTTACT 693
consensus_10216#2      ------------------------------------------------------------
consensus_10216#0      TTTTAATTACACGTGGTT-TTATTGCTTGTCGTATACATCAAACTCCAAGAGAATTTTCA 1012
                                                                                   

consensus_10216#1      CAGAATTTT-AAATGTAAGGAAGGTGTTATCGATCATTTCATT--TTAACTAGTCATAAT 750
consensus_10216#2      ------------------------------------------------------------
consensus_10216#0      AATATTTCTCGAATGAAATCACGAAACTCTCCACGGATTCGTCGATTACATAGTTGTGAT 1072
                                                                                   

consensus_10216#1      TTGTTTTTCTTGC---AAATCCTAACTGATTCGT----TATCCATATTTTTTTAAGTGAT 803
consensus_10216#2      ------------------------------------------------------------
consensus_10216#0      TCACTTGTATCCAGTAAAATACATAATGATTCAGATAGTAATCAAAATCGCTACCCTGAA 1132
                                                                                   

consensus_10216#1      TTTGATTTTTTTATTTGTTTCTTTATTTTTTTTGTCTATAAATGATTTAAACT--AAACA 861
consensus_10216#2      ------------------------------------------------------------
consensus_10216#0      ACAAGTTCAGTTGTTCGAACGGTCAAATCCTCTAAATTTATCGGTTCCGCACCTAAAAAA 1192
                                                                                   

consensus_10216#1      TAAATTTTTGATTTTGTTAGCTAATAACAAGATTATATTCTTTTTGAACATCTAGCACTT 921
consensus_10216#2      ------------------------------------------------------------
consensus_10216#0      TTAATTAGTGGCTCTGGGATCGGCCTAAATGTAGCTCACTGTTGTGCATGTCGAAATGAA 1252
                                                                                   

consensus_10216#1      TGAAATTATTCCACAAAATATATTCTGTTTCCGTAGCAAATTTTTGTTATATAACATATG 981
consensus_10216#2      ------------------------------------------------------------
consensus_10216#0      TTGTATAGGGCGATTAACTCTTCGTTACCTTCTTCATTGAGTTCACTTATTAGAGATAGT 1312
                                                                                   

consensus_10216#1      TCGGACATTTTACAAAACCTTTTGTTGCTCATTAATTGATACCTACTCAACATATGGGGG 1041
consensus_10216#2      ------------------------------------------------------------
consensus_10216#0      ACAAAAATTCCACAATCATATTTAAACTGTATTCAAAGTCATCT-TTGGATGTATGGATC 1371
                                                                                   

consensus_10216#1      AT-TTCGTAAACATTTATT---------AGTCGTTTTGCATAGAGTATTTTAAATAACTT 1091
consensus_10216#2      ------------------------------------------------------------
consensus_10216#0      ATCTTTGTGCTCAATGAGTTTTAAACTGGTTGGTTTTCCTCTGAGGTTACAAATTAAATT 1431
                                                                                   

consensus_10216#1      TGTAATCTTAACTTTCT--AGTTTGTTTAGAATGTTATGTTTGCTAAAAGTCTTAATCTG 1149
consensus_10216#2      ------------------------------------------------------------
consensus_10216#0      TCTAATATATGTTATCTCCAGATATGTAGGGGCTTTAGAACAATCCCATATTGGTACTTA 1491
                                                                                   

consensus_10216#1      TTAACTGCTATAGTT-TTGTACTACAATACAAAGT------------------------- 1183
consensus_10216#2      ------------------------------------------------------------
consensus_10216#0      TCACTTACTCAGTTTGTTGGATCTTTTAAAAGAGTCTCAGTGGTATCTTGAAACAGTGAA 1551
                                                                                   

consensus_10216#1      ------------------------------------------------------------
consensus_10216#2      ------------------------------------------------------------
consensus_10216#0      CGAAACAGAACAAACTTCGACTAGTACACTAAATAAAGCAATCGATAAAACGATACCAAT 1611
                                                                                   

consensus_10216#1      ------------------------------------------------------------
consensus_10216#2      ------------------------------------------------------------
consensus_10216#0      GTCCTTAGATTCAGATACCAAAAAGAGTTGTCATCGATTNTCTACAAACAGTCATCCAGT 1671
                                                                                   

consensus_10216#1      ----------
consensus_10216#2      ----------
consensus_10216#0      TATTTCAATG 1681
                                 




Copyright Thu Nov 6 12:32:27 CET 2003 Hubert Wassner    (hubert.wassner@noos.fr)