cluster # 10289

These datas are free for academic use only, please contact me for any other use.

Schistosoma mansoni
cluster # 10289 cluster # 10289 Sequences # 15 consensus # 1
see consensus multiple alignment with clustalw

Direct access to contigs :
consensus_10289#0 length = 1129 sequences # 15
consensusID : consensus_10289#0
NCBI blastX ! send the sequence to the NCBI site !
NCBI blastN ! send the sequence to the NCBI site !
Sequences nbr = 15
consensus length = 1129
fasta sequence
                              [GCG-GTTTCTCAAAGTCAT-CGTGACCAACACAATGGTCAGTAGGCGAGAAGATGGGATTTGCTGCAGCTCTTGGAAGTCGAAGTGGGCAAGGAAGCATTTCAGGCATTACAGTTAAGTGTAAAACAAGACAAGCAAGTGATGGCCATTCTTTATCTAATCCTTTGAGTTTCACACCACCTCCAGATGTTTTCTGGATAAGAAAGTGTGTTATTCCACTTGTAGAAGATGGATAAACTGATGTCAACTGGGAGACTGTATCTTTTATTCGATTTCCTGGTATATGTGGTTGTCTAGAATGAAAACAGCCACCAGCTACTTGTCCATTACTAGAACGTACTGATAATGCAAAACTATTTGGGTGACTTCCGCTATCTCGGACAACAAAACTTCCAGGAGGTTGTTTGGCAAGCATTTCCAAAGCCTTTTCACGGGGTAAATCTGGAAGGTACCAAGGAGCATGAGACAACTCATTGATGTCGTCAAGAACATTTTGTGCAGGAACGTTTGGAGTGGAGCATGGAGATGTGGGAGGAACGGGAAGGTGCTGTTCAGTGGGTTTCAGTAACTGATTCGAATCTCCAGGATGCGGATTATTGTCAAATATAACGCACGTATGTTCACCACTGGTGCAACCTGGAGTGCACGTACAGCGTTTGCTAATTGGTAAACTATTATCGGAACTCGAGTCCGGATGACCAGAGCCAGATGTGGCAGTTGAGCACCCAGTGGTTGATGATGACGTTGTGGTTGCTGTAGACGTATTAGCTGGAGCATTATCATTGATAAACTGAGC-GTTACTTTCTTGAATATCTTTTTCTGGAATA-GGAGTTTCTTTGTCAAGAGCGATACCACCACAGCTGCGATGATCAGCCATATCATAGAAGTGTTGTGCCAGTGCAGATGTCGTAGATTTAGGTCCTAACGGTAAAACATCAGTAAGATCTTCCGTCATTTCATGGAGGGTTTTATTTACTTCCATTTCATGTAATTTTTCATGATGCTTCAAAACTGGACTTTGGTGATTTGCTGCTANGGTGGATGTGATACTCTTAGCTGGGAGCTGCGTAGATGAAGTTACTGATGAATGANAACGCGGTGGTGGGGGAGGTGGCTTTATCTGCTCACTCTT]

[+] EMBL CD113183             [GCG GTTTCTCAAAGTCAT CGTGACCAACACAATGGTCAGTAGGCGAGAAGATGGGATTTGCTGCAGCTCTTGGAAGTCGAAGTGGGCAAGGAAGCATTTCAGGCATTACAGTTAAGTGTAAAACAAGACAAGCAAGTGATGGCCATTCTTTATCTAATCCTTTGAGTTTCACACCACCTCCAGATGTTTTCTGGATAAGAAAGTGTGTTATTCCACTTGTAGAAGATGGATAAACTGATGTCAACTGGGAGACTGTATCTTTTATTCGATTTCCTGGTATATGTGGTTGTCTAGAATGAAAACAGCCACCAGCTACTTGTCCATTACTAGAACGTACTGATAATGCAAAACTATTTGGGTGACTTCCGCTATCTCGGACAACAAAACTTCCAGGAGGTTGTTTGGCAAGCA                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                ]
[+] EMBL CD113174             [GCG GTTTCTCAAAGTCAT CGTGACCAACACAATGGTCAGTAGGCGAGAAGATGGGATTTGCTGCAGCTCTTGGAAGTCGAAGTGGGCAAGGAAGCATTTCAGGCATTACAGTTAAGTGTAAAACAAGACAAGCAAGTGATGGCCACTCTTTATCTAATCCTTTGAGTTTCACACCACCTCCAGATGTTTTCTGGATAAGAAAGTGTGTTATTCCACTTGTAGAAGATGGATAAACTGATGTCAACTGGGAGACTGTATCTTTTATTCGATTTCCTGGTATATGTGGTTGTCTAGAATGAAAACAGCCACCAGCTACTTGTCCATTACTAGAACGTACTGATAATGCAAAACTATTTGGGTGACTTCCGCTATCTCGGACAACAAAACTCCCAGGAGGTTGTTTGGCAAGCA                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                ]
[+] EMBL CD113221             [GCGNGTTTCTCAAAGTCAT CGTGACCAACACAATGGTCAGTAGGCGAGAAGATGGGATTTGCTGCAGCTCTTGGAAGTCGAAGTGGGCGAGGAAGCATTTCAGGCATTACAGTTTAGTGTAAAACAAGACAAGCAAGTGATGGCCATTCTTTATCTAATCCTTTGAGTTTCACACCACCTCCAGATGTTTTCTGGATAAAAAAGTGTGTTATTCCACTTGTAGAAAATGGATAAACTGATGTCAACTGGGAGACTGTATCTTTTATTCGATTTCCTGGTATATGTGGTTGTCTAGAATGAAAACAGCCACCAGCTACTTGTCCATTACTAGAACGTACTGATAATGCAAAACTATTTGGGTGACTTCCGCTATCTCGGACAACAAAACTTCCAGGAGGTTGTTTGGCAAGCA                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                ]
[+] EMBL CD113212             [GCG GTTTCTCAAAGTCATGCG GACCAACACAATGGTCAGTAGGCGAGAAGATGGGATTTGCTGCAGCTCTTGGAAGTCGAAGTGGGCAAGGAAGCATTTCAGGCATTACAGTTAAGTGTAAAACAAGACAAGCAAGTGATGGCCATTCTTTATCTAATCCTTTGGGTTTCACACCACCTCCAGATGTTTTCTGGATAAGAAAGTGTGTTATTCCACTTGTAGAAGATGGATAAACTGATGTCAACTGGGAGACTGTATCTTTTATTCGATTTCCTGGTATATGTGGTTGTCTAGAATGAAAACAGCCACCAGCTACTTGTCCATTACTAGAACGTACTGATAATGCAAAACTATTTGGGTGACTTCCGCTATCTCGGACAACAAAACTTCCAGGAGGTTGTTTGGCAAGCA                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                ]
[+] EMBL CD183416             [                                                                                                                                                                                                                                                                                                TTGTCTAGAATGAAAACAGCCACCAGCTACTTGTCCATTACTAGAACGTACTGATAATGCAAAACTATTTGGGTGACTTCCGCTATCTCGGACAACAAAACTTCCAGGAGGTTGTTTGGCAAGCATTTCCAAAGCCTTTTCACGGGGTAAATCTGGAAGGTACCAAGGAGCATGAGACAACTCATTGATGTCGTCAAGAACATTTTGTGCAGGAACGTTTGGAGTGGAGCATGGAGATGTGGGAGGAACGGGAAGGTGCTGTTCAGTGGGTTTCAGTAACCGATTCGAATCTCCAGGATGCGGATTATTGTCAAATATAACGCACGTATGTTCACCACTGGTGCAACCTGGAGTGCACGTACAGCGTTTGCTAATTGGTAAACTATTATCGGAACTCGAGTCCGGATGACCAGAGCCAGATGTGGCAGTTGAGCACCCAGTGGTTGATGATGACGTTGTGGTTGCTGTAGACGTATTAGCTGGAGCATTATCATTGATAAACTGAGCNNGTACCTTTTNGAATATCTNNTTCTGGAATA GGAGTTNCTNTGTCAAGAGCGATACCACCACAGCTGCGATGATCAGCCATATCATAGA                                                                                                                                                                                                                                                       ]
[+] EMBL CD183519             [                                                                                                                                                                                                                                                                                                TTGTCTAGAATGAAAACAGCCACCAGCTACTTGTCCATTACTAGAACGTACTGATAATGCAAAACTATTTGGGTGACTTCCGCTATCTCGGACAACAAAACTTCCAGGAGGTTGTTTGGCAAGCATTTCCAAAGCCTTTTCACGGGGTAAATCTGGAAGGTACCAAGGAGCATGAGACAACTCATTGATGTCGTCAAGAACATTTTGTGCAGGAACGTTTGGAGTGGAGCATGGAGATGTGGGAGGAACGGGAAGGTGCTGTTCAGTGGGTTTCAGTAACTGATTCGAATCTCCAGGATGCGGATTATTGTCAAATATAACGCACGTATGTTCACCACTGGTGCAACCTGGAGTGCACGTACAGCGTTTGCTAATTGGTAAACTATAATCGGAACTCGAGTCCGGATGACCAGAGCCAGATGTGGCAGTTGAGCACCCAGTAGTTGATGATGACGTTGTGGTTGCTGTAGACGTATTAGCTGGAGCATTATCATTGATAAACTGAGC GTTACTTTCTTGAATATCTTTTTCTGGAATAGGGAG TTCTTTGTCAAGAGCGATACCACCACAGCTGCGATGATCAGCCATATCATAGA                                                                                                                                                                                                                                                       ]
[+] EMBL CD188462             [                                                                                                                                                                                                                                                                                                TTGTCTAGAATGAAAACAGCCACCAGCTACTTGTCCATTACTAGAACGTACTGATAATGCAAAACTATTTGGGTGACTTCCGCTATCTCGGACAACAAAACTTCCAGGAGGTTGTTTGGCAAGCATTTCCAAAGCCTTTTCACGGGGTAAATCTGGAAGGTACCAAGGAGCATGAGACAACTCATTGATGTCGTCAAGAACATTTTGTGCAGGAACGTTTGGAGTGGAGCATGGAGATGTGGGAGGAACGGGAAGGTGCTGTTCAGTGGGTTTCAGTAACTG                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                   ]
[-] EMBL CD189112             [                                                                                                                                                                                                                                                                                                 TGTCTAGAATGAAAACAGCCACCAGCTACTTGTCCATTACTAGAACGTACTGATAATGCAAAACTATTTGGGTGACTTCCGCTATCTCGGACAACAAAACTTCCAGGAGGTTGTTTGGCAAGCATTTCCAAAGCCTTTTCACGGGGTAAATCTGGAAGGTACCAAGGAGCATGAGACAACTCATTGATGTCGTCAAGAACATTTTGTGCAGGAACGTTTGGAGTGGAGCATGGAGATGTGGGAGGAACGGGAAGGTGCTGTTCAGTGGGTTTCAGTAACTGATTCGAATCTCCAGGAcag                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                ]
[-] EMBL CD091660             [                                                                                                                                                                                                                                                                                                   TCTAGAATGANAACAGCCACCAGCTACTTGTCCATTACTAGAACGTACTGATAATGCAAAACTATTTGGGTGACTTCCGCTATCTCGGACAACAAAACTTCCAGGGGGTTGTTTGGCAAGCATTTCCAAAGCCTTTTCACGGGGTAAATCTGGAAGGTACCAAGGAGCATGAGACAACTCATTGATGTCGTCAAGAACATTTTGTGCAGGAACGTTTGGAGTGGAGCATGGAGATGTGGGAGGAACGGGAAGGTGCTGTTCAGTGGGTTTCAGTAACTGATTCGAATCTCCAGGATGCGGATTATTGTCAAATATAACGCACGTATGTTCACCACTGGTGCAACCTGGAGTGCACGTACAGCGTTTGCTAATTGGTAAACTATTATCGGAACTCGAGTCCGGATGACCAGAGCCAGATGTGGCAGTTGAGCACCCAGTGGTTGATGATGACGTTGTGGTTGCTGTAGACGTATTAGCTGGAGCATTATCATTGATAAACTGAGC GTTACTTTCTTGAATATCTTTTTCTGGAATA GGAGTTTCTTTGTCAAGAGCGATA                                                                                                                                                                                                                                                                                         ]
[+] EMBL CD091609             [                                                                                                                                                                                                                                                                                                      AGAATGAAAACAGCCACCAGCTACTTGTCCATTACTAGAACGTACTGATAATGCAAAACTATTTGGGTGACTTCCGCTATCTCGGACAACAAAACTTCCAGGAGGTTGTTTGGCAAGCATTTCCAAAGCCTTTTCACGGGGTAAATCTGGAAGGTACCAAGGAGCATGAGACAACTCATTGATGTCGTCAAGAACATTTTGTGCAGGAACGTTTGGAGTGGAGCATGGAGATGTGGGAGGAACGGGAAGGTGCTGTTCAGTGGGTTTCAGTAACTGATTCGAATCTCCAGGATGCGGATTATTGTCAAATATAACGCACGTATGTTCACCACTGGTGCAACCTGGAGTGCACGTACAGCGTTTGCTAATTGGTAAACTATTATCGGAACTCGAGTCCGGATGACCAGAGCCAGATGTGGCAGTTGAGCACCCAGTGGTTGATGATGACGTTGTGGTTGCTGTAGACGTATTAGCTGGAGCATTATCATTGATAAACTGAGC GTTACTTTCTTG ATATCTTTTTCTGGAATA NGAAGTTCTTTGTCAAGAGCGAT                                                                                                                                                                                                                                                                                          ]
[+] EMBL CD168137             [                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                 GGAGGAACGGGAAGGTGCTGTTCAGTGGGTTTCAGTAACTGATTCGAATCTCCAGGATGCGGATTATTGTCAAATATAACGCACGTATGTTCA CACTGGTGCAACCTGGAGTGCACGTACAGCGTTTGCTAATTGGTAAACTATTATCGGAACTCGAGTCCGGATGACCAGAGCCAGATGTGGCAGTTGAGCACCCAGTGGTTGATGATGACGTTGTGGTTGCTGTAGACGTATTAGCTGGAGCATTATCATTGATAAACTGAGC GTTACTTTCTTGAATATCTTTTTCTGGAATA GGAGTTTCTTTGTCAAGAGCGATACCACCACAGCTGCGATGATCAGCCATATCATAGAAGTGTTGTGCCAGTGCAGATGTCGTAGATTTAGGTCCTAACGGTAAAACATCAGTAAGATCTTCCGTCATTTCATGGAGGGTTTTATTTACTTCCATTTCATGTAATTTTTCATGATGCTTCAAAACTGGACTTTGGTGATTTGCTGCT                                                                                                  ]
[+] EMBL CD111809             [                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                      AACGGGAAGGTGCTGTTCAGTGGGTTTCAGTAACTGATTCGAATCTCCAGGATGCGGATTATTGTCAAATATAACGCACGTATGTTCACCACTGGTGCAACCTGGAGTGCACGTACAGCGTTTGCTAATTGGTAAACTATTATCGGAACTCGAGTCCGGATGACCAGAGCCAGATGTGGCAGTTGAGCACCCAGTGGTTGATGATGACGTTGTGGTTGCTGTAGACGTATTAGCTGGAGCATTATCATTGATAAACTGAGC GTTACTTTCTTGAATATCTTTTTCTGGAATA GGAGTTTCTTTGTCAAGAGCGATACCACCACAGCTGCGATGATCAGCCATATC                                                                                                                                                                                                                                                            ]
[+] EMBL CD111777             [                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                      AACGGGAAGGTGCTGTTCAGTGGGTTTCAGTAACTGATTCGAATCTCCAGGATGCGGATTATTGTCAAATATAACGCACGTATGTTCACCACTGGTGCAACCTGGAGTGCACGTACAGCGTTTGCTAATTGGTGAACTATTATCGGAACTCGAGTCCGGATGACCAGAGCCAGATGTGGC                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                   ]
[+] EMBL CD178802             [                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                         GTGGGTTTCAGTAACTGATTCGAATCTCCAGGATGCGGATTATTGTCAAATATAACGCACGTATGTTCACCACTGGTGCAACCTGGAGTGCACGTACAGCGTTTGCTAATTGGTAAACTATTATCGGAACTCGAGTCCGGATGACCAGAGCCAGATGTGGCAGTTGAGCACCCAGTGGTTGATGATGACGTTGTGGTTGCTGTAGACGTATTAGCTGGAGCATTATCATTGATAAACTGAGC GTTACTTTCTTGAATATCTTTTTCTGGAATA GGAGTTTCTTTGTCAAGAGCGATACCACCACAGCTGCGATGATCAGCCATATCATAGAAGTGTTGTGCCAGTGCAGATGTCGTAGATTTAGGTCCTAACGGTAAACCATCAGTAAGATCTTCCGTCATTTCATGGAGGGTTTTATTTACTTCCATTTCATGTAATTTTTCATGATGCTTCAAAACTGGACTTTGGTGATTTGCTGCTANGGTGGATGTGATACTCTTAGCTGGGAGCTGCGTAGATGAAGTTACTGATGAATGANAACGCGGTGGTGGGGGAGGTGGCTTTATCTGCTCACTCTT]
[+] EMBL CD188701             [                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                  GCACGTACAGCGTTTGCTAATTGGTAAACTATTATCGGAACTCGAGTCCGGATGACCAGAGCCAGATGTGGCAGTTGAGCACCCAGTGGTTGATGATGACGTTGTGGTTGCTGTAGACGTATTAGCTGGAGCATTATCATTGATAAACTGAGC GTTACTTTCTTGAATATCTTTTTCTGGAATA GGAGTTTCTTTGTCAAGAGCGATACCACCACAGCTGCGATGATCAGCCATATCATAG                                                                                                                                                                                                                                                        ]




>consensus_10289#0
GCGGTTTCTCAAAGTCATCGTGACCAACACAATGGTCAGTAGGCGAGAAGATGGGATTTG
CTGCAGCTCTTGGAAGTCGAAGTGGGCAAGGAAGCATTTCAGGCATTACAGTTAAGTGTA
AAACAAGACAAGCAAGTGATGGCCATTCTTTATCTAATCCTTTGAGTTTCACACCACCTC
CAGATGTTTTCTGGATAAGAAAGTGTGTTATTCCACTTGTAGAAGATGGATAAACTGATG
TCAACTGGGAGACTGTATCTTTTATTCGATTTCCTGGTATATGTGGTTGTCTAGAATGAA
AACAGCCACCAGCTACTTGTCCATTACTAGAACGTACTGATAATGCAAAACTATTTGGGT
GACTTCCGCTATCTCGGACAACAAAACTTCCAGGAGGTTGTTTGGCAAGCATTTCCAAAG
CCTTTTCACGGGGTAAATCTGGAAGGTACCAAGGAGCATGAGACAACTCATTGATGTCGT
CAAGAACATTTTGTGCAGGAACGTTTGGAGTGGAGCATGGAGATGTGGGAGGAACGGGAA
GGTGCTGTTCAGTGGGTTTCAGTAACTGATTCGAATCTCCAGGATGCGGATTATTGTCAA
ATATAACGCACGTATGTTCACCACTGGTGCAACCTGGAGTGCACGTACAGCGTTTGCTAA
TTGGTAAACTATTATCGGAACTCGAGTCCGGATGACCAGAGCCAGATGTGGCAGTTGAGC
ACCCAGTGGTTGATGATGACGTTGTGGTTGCTGTAGACGTATTAGCTGGAGCATTATCAT
TGATAAACTGAGCGTTACTTTCTTGAATATCTTTTTCTGGAATAGGAGTTTCTTTGTCAA
GAGCGATACCACCACAGCTGCGATGATCAGCCATATCATAGAAGTGTTGTGCCAGTGCAG
ATGTCGTAGATTTAGGTCCTAACGGTAAAACATCAGTAAGATCTTCCGTCATTTCATGGA
GGGTTTTATTTACTTCCATTTCATGTAATTTTTCATGATGCTTCAAAACTGGACTTTGGT
GATTTGCTGCTANGGTGGATGTGATACTCTTAGCTGGGAGCTGCGTAGATGAAGTTACTG
ATGAATGANAACGCGGTGGTGGGGGAGGTGGCTTTATCTGCTCACTCTT
clustalw multiple alignements is not computed in this case