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These datas are free for academic use only, please contact me for any other use. Schistosoma mansoni see consensus multiple alignment with clustalw Direct access to contigs :
consensusID : consensus_10340#0 NCBI blastX ! send the sequence to the NCBI site ! NCBI blastN ! send the sequence to the NCBI site ! Sequences nbr = 15 consensus length = 783 fasta sequence
[GGCCANAATTTGGCACGAGGCCGGGCGTAAATAGTGTA-GCTGCTA-ACG-TATTCAACCAAATTGACAGG-AACAGAAGTGGATCCATATGTGCAAGC-GAATTACAACAGGCACTATCCAACGGATTGGGTACATCATTCAATATTAAAACGATTGAACTGATGATATGTATGTTTGACAAAGATATGAATGGCACTATAAATATCTGTGAATTCTCTC-AACTATTTGAGTACGTACAACAGTGGCAACAATGTTTTCGATCATATGACAGAGATAGGTCTGGTACAATTGACTGTCGAGAGTTTCATACTGCTTTAACAAGCTTTGGTTATCGATTGTCTCCAGATTTTTCACAATTTTTAGTTAGAAAATTCGACAAACAACGTCGCGGATCAGTAGGATTTGATAATTTCATCTTGGCATGCGTCTGTTTAAAGAATTTAACTGATGTATTCAGACCATATGATTATCAAAGAAATGGAATGGCACAACTTAGTTATGAACAATTTTTAACTGCTGCTTTCAGTGTAGTTAGTTAATTAGTTAATTCAATATATTACAATGTTGACTATTATCCATATCTCTTCTTATTTAAGATTATAAGATATTAATTATTAACTTAATCTGTACCTGATAAGCATTAACTTCTATATGACCCATATTATCAAC-AACAACANCNNAC-AC-AAGTCTTTTCTTGTCTAGAGAAAACA-AAAA--CCG-AA-GTAT-G--AACATTATGT-ATACCT-AATAT-AATGATTGTGAATTG-TTTTGTATGAATACA--TNTTCTGTAAT]
[+] EMBL CD079632 [GGCCANAATTTGGCACGAGGCCGGGCGTGAATAGTGTA GCTGCTA ACG TATTCAACCAAATTGACAGG AACAGAAGTGGATCCATATGTGCAAGC GAATTACAACAGGCACTATCCAACGGATTGGGTACATCATTCAATATTAAAACGATTGAACTGATGATATGTATGTTTGACAAAGATATGAATGGCACTATAAATATCTGTGAATTCTCTC AACTATTTGAGTACGTACAACAGTGGCAACAATGTTTTCGATCATATGACAGAGATAGGTCTGGTACAATTGACTGTCGAGAGTTTCATACTGCTTTAACAAGCTTTGGTTATCGATTGTCTCCAGATTTTTCACAATTTTTAGTTAGAAAATTCGACAAACAACGTCGCGGATCAGTAGGATTTGATAATTTCATCTTGGCATGCGTCTGTTTAAAGAATTTAACTGATGTATTCAGACCATATGATTATCAAAGAAATGGAATGGCACAACTTAGTTATGAACAATTTTTAACTGCTGCTTTCAGTGTAGTTAGTTAATTAGTTAATTCAATATATTACAATGTTGACTATTATCCATATCTCTTCTTATTTAAGATTATAAGATATTAATTATTAACTTAATCTGTACCTGATAAGCATTAACTTCTATATGACCCATATTATCAAC AACAACANCNNAC AC AAGTCTTTTCTTGTCTAGAGAAAACA ANNA CCG AA GTAT G AACATTATGT ATACCT ATAT AATGANTGTGAAATG TTTGTATG ATACA TNTTCTGT ]
[+] EMBL CD082377 [ GCGTGAATATTGTANGCTGCTA ACGATTTTCAACCAAATTGACAGGCAACAGAAGTGGATCCATATGTGCAAGC GAATTACAACAGGCACTATCCAACGGATTGGGTACATCATTCAATATTAAAACGATTGAACTGATGATATGTATGTTTGACAAAGATATGAATGGCACTATAAATATCTGTGAATTCTCTC AACTATTTGAGTACGTACAACAGTGGCAACAATGTTTTCGATCATATGACAGAGATAGGTCTGGTACAATTGACTGTCGAGAGTTTCATACTGCTTTAACAAGCTTTGGTTATCGATTGTCTCCAGATTTTTCACAATTTTTAGTTAGAAAATTCGACAAACAACGTCGCGGATCAGTAGGATTTGATAATTTCATCTTGGCATGCGTCTGTTTAAAGAATTTAACTGATGTATTCAGACCATATGATTATCAAAGAAATGGAATGGCACAACTTAGTTATGAACAATTTTTAACTGCTGCTTTCAGTGTAGTTAGTTAATTAGTTAATTCAATATATTACAATGTTGACTATTATCCATATCTCTTCTTATTTAAGATTATAAGATATTAATTATTAACTTAATCTGTACCTGATAAGCATTAACTTCTATATGACCCATATTATCAACNNAC ACANCNNAC AC AAGTCTTTTTCTGTCTAGAG AAACANAAAC CCG AANGTAT GGAAACA TATGT ATACCTAAATAT AATGA TGNGAATNG TTTTGTATGAATACA ]
[+] EMBL CD161683 [ AAATAGTGTA GCTGCTA ACG TATTCAACCAAATTGACAGG AACAGAAGTGGATCCATATGTGCAAGC GAATTACAACAGGCACTATCCAACGGATTGGGTACATCATTCAATATTAAAACGATTGAACTGATGATATGTATGTTTGACAAAGATATGAATGGCACTATAAATATCTGTGAATTCTCTC GACTATTTGAGTACGTACAACAGTGGCAACAATGTT ]
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[-] EMBL CD073895 [ TCTGTGAATTCTCTC AACTATTTGAGTACGTACAACAGTGGCAACAATGTTTTCGATCATATGACAGAGATAGGTCTGGTACAATTGACTGTCGAGAGTTTCATACTGCTTTAACAAGCTTTGGTTATCGATTGTCTCCAGATTTTTCACAATTTTTAGTTAGAAAATTCGACAAACAACGTCGCGGATCAGTAGGATTTGATAATTTCATCTTGGCATGCGTCTGTTTAAAGAATTTAACTGATGTATTCAGACCATATGATTATCAAAGAAATGGAATGGCACAACTTAGTTATGAACAATTTTTAACTGCTGCTTTCAGTGTAGTTAGTTAATTAGTTAATTCAATATATTACAATGTTGACTATTATCCATATCTCTTCTTATTTAAGATTATAAGATATTAATTATTAACTTAATCTGTACCTGATAAGCATTAACTTCTATATGACCCATATTATCAAC AACAACAAC AACAACAAAGTCTTTTCTTGTCTAGAGAAAACA AAAAACCCGAAA GTATGG AACATTATGTAATACCT AATATAAATGATTGTGAATTGTTTTTGTATGAATACAATTTTTCTGTAAT]
[-] EMBL CD075978 [ TTTCGATCATATGACAGAGATAGGTCTGGTACAATTGACTGTCGAGAGTTTCATACTGCTTTAACAAGCTTTGGTTATCGATTGTCTCCAGATTTTTCACAATTTTTAGTTAGAAAATTCGACAAACAACGTCGCGGATCAGTAGGATTTGATAATTTCATCTTGGCATGCGTCTGTTTAAAGAATTTAACTGATGTATTCAGACCATATGATTATCAAAGAAATGGAATGGCACAACTTAGTTATGAACAATTTTTAACTGCTGCTTTCAGTGTAGTTAGTTAATTAGTTAATTCAATATATTACAATGTTGACTATTATCCATATCTCTTCTTATTTAAGATTATAAGATATTAATTATTAACTTAATCTGTACCTGATAAGCATTAACTTCTATATGACCCATATTATCAAC AACAACAAC AACAACAAAGTCTTTTCTTGTCTAGAGAAAACA AAAAACCCGAAA GTATGG AACATTATGTAATACCT AATATAAATGATTGTGAATTGTTTTTGTATGAATACAa ]
clustalw multiple alignements is not computed in this case |
| Copyright Thu Nov 6 12:32:27 CET 2003 Hubert Wassner (hubert.wassner@noos.fr) | ||||