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These datas are free for academic use only, please contact me for any other use. Schistosoma mansoni see consensus multiple alignment with clustalw Direct access to contigs :
consensusID : consensus_10360#0 NCBI blastX ! send the sequence to the NCBI site ! NCBI blastN ! send the sequence to the NCBI site ! Sequences nbr = 15 consensus length = 460 fasta sequence
[TTACAA-TTCTTTTAAAAG-AAAAACAGTT-TCTTCTAAATGTTCATATTTATCATTACTTCAATACATGCACACACACACGTAAGTCATGATTGTCAACAGTCTGTTCATGTTCTGATCATCAATACAGTGTGTTTCGTTGACCTAATTACTATTTATAAATGAATTTTGATGAACAAGTTTTGATAAATATAATTT-CTTCAATTATAAATAATGACGATCAGAGAATT-AAAAAAAAAATGGATACAGACACCAATATCTAAATAACAT-GCTGATTCAT-GAATTTTATTAAT-TGT-CTTCATG-TACTCAACCTATTT-CATTAATCCGTTTGTTTCACTCTTAAACACACTTTGTTTGGATTTAAAAGTTAGATTGGGTTTAATGACGTGATCATTCACTCCACAAATTCCATTTGGCACAAATTCTTTATAAAAAAATCGAAATCATAACGATGCATTGATTA]
[+] EMBL CD126234 [TTACAA TTCTTTT AAAG AAAAACAGTT TCTTCTAAATGTTCATATTTATCATTACTTCAATACATGCACACACACACGTAAGTCATGATTGTCAACAGTCTGTTCATGTTCTGATCATCAATACAGTGTGTTTCGTTGACCTAATTACTATTTATAAATGAATTTTGATGAACAAGTTTTGATAAATATAATTT CTTCAATTATAAATAATGACGATCAGAGAATT AAAAAAAAAATGGATACAGTCACCAATATCTAAATAACAT GCTGATTCAT GAATTTTATTAAT TGT CTTCATG TACTCAACCTATT ]
[+] EMBL CD126240 [TTACAANTTCTTTTAAAAG AAAAACAGTT TCTTCTAAATGTTCATATTTATCATTACTTCAATACATGCACACACACACGTAAGTCATGATTGTCAACAGTCTGTTCATGTTCTGATCATCAATACAGTGTGTTTCGTTGACCTAATTACTATTTATAAATGAATTTTGATGAACAAGTTTTGATAAATATAATTT CTTCAATTATAAATAATGACGATCAGAGAATT AAAAAAAAAATGGATACAGACACCAATATCTAAATAACAT GCTGATTCAT GAATTTTATTAAT TGT CTTCATG TACTCAACCTATT ]
[+] EMBL CD063217 [ CAA TTTTTTTAAAAA AAAAACAGTT TCCTCTAAATGTTCATATTTATCATTACTTCAATACATGCACACACACACGTAAGTCATGATTGTCAACAGTCTGTTCATGTTCTGATCATCAATACAGTGTGTTTCGTTGACCTAATTACTATTTATAAATGAATTTTGATGAACAAGTTTTGATAAATATAATTT CTTCAATTATAAATAATGACGATCAGAGAATT AAAAAAAAATGGATACAGACACCAATATCTAAATAACAT GCTGATTCAT GAATTTTATTAAT TGT CTTCATG TACTCAACCTATT ]
[+] EMBL CD063102 [ CAA TTTTTTTAAAAA AAAAACAGTT TCTTCTAAATGTTCATATTTATCATTACTTCAATACATGCACACACACACGTAAGTCATGATTGTCAACAGTCTGTTCATGTTCTGATCATCAATACAGTGTGTTTCGTTGACCTAATTACTATTTATAAATGAATTTTGATGAACAAGTTTTGATAAATATAATTT CTTCAATTATAAATAATGACGATCAGAGAATT AAAAAAAAAATGGATACGGACACCAATATCTAAATAACAT GCTGATTCAT GAATTTTATTAAT TGT CTTCATG TACTCAACCTATT ]
[+] EMBL CD126216 [ AA TTCTTTTAAAAG AAAAACAGTT TCTTCTAAATGTTCATATTTATCATTACTTCAATACATGCACACACACACGTAAGTCATGATTGTCAACAGTCTGTTCATGTTCTGATCATCAATACAGTGTGTNTCGTTGACCTAATTACTATTTATAA ]
[+] EMBL CD063125 [ AA TTCTTTTAAAAG AAAAACAGTT TCTTCTAAATGTTCATATTTATCATTACTTCAATACATGCACACACACACGTAAGTCATGATTGTCAACAGTCTGTTCATGTTCTGATCATCAATACAGTGTGTTTCGTTGACCTAATTACTATTTATAAATGAATTTTGATGAACAAGTTTTGATAAATATAATTT CTTCAATTATAAATAATGACGATCAGAGAATTAAAAAAAAAAATGGATACAGACACCAATATCTAAATAACAT GCTGATTCAT GAATTTTATTAAT TGT CTTCATG TACTCAACCTATT ]
[-] EMBL CD126188 [ A TTCTTTTAAAAG AAAAACAGTT TCTTCTAAATGTTCATATTTATCATTACTTCAATACATGCACACACACACGTAAGTCATGATTGTCAACAGTCTGTTCATGTTCTGATCATCAATACAGTGTGTTTCGTTGACCTAATTACTATTTATAAATGAATTTTGATGAACAAGTTTTGATAAATATAATTT CTTCAATTATAAATAATGACGATCAGAGAATT AAAAAAAAAATGGATACAGACACCAATATCTAAATAACAT GCTGATTCAT GAATTTTATTAAT TGT CTTCATG TACTC ACCTATTTACAT ]
[-] EMBL CD126212 [ A TTCTTTTAAAAG AAAAACAGTT TCTTCTAAATGTTCATATTTATCATTACTTCAATACATGCACACACACACGTAAGTCATGATTGTCAACAGTCTGTTCATGTTCTGATCATCAATACAGTGTGTTTCGTTGACCTAATTACTATTTATAAATGAATTTTGATGAACAAG TTTGATAAATATAATTT CTTCAATTATAAATAATGACGATCAGAGAATT AAAAAAAAAATGGATACAGACACCAATATCTAAATAACAT GCTGATTCAT GAATTTTATTAATNTGT CTTCATG TACTC ACCTATTTaca ]
[-] EMBL CD126223 [ A TTCTTTTAAAAG AAAAACAGTT TCTTCTAAATGTTCATATTTATCATTACTTCAATACATGCACACACACACGTAAGTCATGATTGTCAACAGTCTGTTCATGTTCTGATCATCAATACAGTGTGTTTCGTTGACCTAATTACTATTTATAAATGAATTTTGATGAACAAGTTTTGATAAATATAATTT CTTCAATTATAAATAATGACGATCAGAGAATT AAAAAAAAAATGGATACAGACACCAATATCTAAATAACAT GCTGATTCAT GAATTTTATTAAT TGT CTTCATG ACTC ACCTATTTACAT ]
[-] EMBL CD063112 [ A TTCTTTTAAAAG AAAAACAGTT TCTTCTAAATGTTCATATTTATCATTACTTCAATACATGCACACACACACGTAAGTCATGATTGTCAACAGTCTGTTCATGTTCTGATCATCAATACAGTGTGTTTCGTTGACCTAATTACTATTTATAAATGAATTTTGATGAACAAGTTTTGATAAATATAATTT CTTCAATTATAAATAATGACGATCAGAGAATT AAAAAAAAAATGGATACAGACACCAATATCTAAATAACAT GCTGATTCAT GAATTTTATTAAT TGT CTTCATG TACTCAACCTATTT ]
[-] EMBL CD063236 [ A TTCTTTTAAAAG AAAAACAGTT TCTTCTAAATGTTCATATTTATCATTACTTCAATACATGCACACACACACGTAAGTCATGATTGTCAACAGTCTGTTCATGTTCTGATCATCAATACAGTGTGTTTCGTTGACCTAATTACTATTTATAAATGAATTTTGATGAACAAGTTTTGATAAATATAATTT CTTCAATTATAAATAATGACGATCAGAGAATT AAAAAAAAAATGGATACAGACACCAATATCTAAATAACAT GCTGATTCAT GAATTTTATTAAT TGT CTTCATG TACTCAACCTATTT ]
[-] EMBL CD063124 [ A TTCTTTTAAAAG AAAAACAGTT TCTTCTAAATGTTCATATTTATCATTACTTCAATACATGCACACACACACGTAAGTCATGATTGTCAACAGTCTGTTCATGTTTTGATCATCAATACAGTGTGTTTCGTTGACCTAATTACTATTTATAAATGAATTTTGATGAACAAGTTTTGATAAATATAATTT CTTCAATTATAAATAATGACGATCAGAGAATT AAAAAAAAAATGGATACAGACACCAATATTTAAATAACAT GCTGATTCAT GAATTTTATTAAT TGG CTTCATG TACTCAACAAATTT ]
[-] EMBL CD063186 [ A TTCTTTTTAAAG AAAAACAGTT TCTTTTAAATGCTCATATTTATCATTACTTCAATACATGCACACACACACGTAAGTCATGATTGTCAACAGTCTGTTCATGTTCTGATCATCAATACAGTGTGTTTCGTTGACCTAATTACTATTTATAAATGAATTTTGATGAACAAGTTTTGATAAATATAATTT CTTCAATTATAAATAATGACGATCAGAGAATT AAAAAAAAAATGGATACAGACACCAATATCTAAATAACAT GCTGATTCAT GAATTTTATTAAT TGT CTTCATG TACTCAACAAATTT ]
[+] EMBL CD063282 [ TCTTTTAAAAGAAAAAACAGTTATCTTCTAAATGTTCATATTTATCATTACTTCAATACATGCACACACACACGTAAGTCATGATTGTCAACAGACTGGTCATGTTCTGATCATCAATACAGTGGGTGGAGTTGACCTAATTACTATTTATAAATGAATTTTGATGAACAAGTTTTGATAAATATAATTT CTTCAATTATAAATAATGACGATCAGAGAATT AAAAAAAAGATGGATACAGACACCAATATCTAAATAACAT GCTGATTCATGGAATTTTATTAATCTGTCCTTCATGATACTC ]
[+] EMBL AW497736 [ TGTTCTGATCATCAATACAGTGTGTTTCGTTGACCTAATTACTATTTATAAATGAATTTTGATGAACAAGTTTTGATAAATATAATTTCCTCCAATTATAAATAATGACGATCAGAG ATT TAAAAAAAAATGGATACAGACACCAATATCTAAATAACATGGCGGATTC T GAATTTTATAAAT GGT C TCA G GACTC ACCTATTA CATTAATCCGTTTGTTTCACTCTTAAACACACTTTGTTTGGATTTAAAAGTTAGATTGGGTTTAATGACGTGATCATTCACTCCACAAATTCCATTTGGCACAAATTCTTTATAAAAAAATCGAAATCATAACGATGCATTGATTA]
clustalw multiple alignements is not computed in this case |
| Copyright Thu Nov 6 12:32:27 CET 2003 Hubert Wassner (hubert.wassner@noos.fr) | ||||