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Schistosoma mansoni
cluster # 10405 cluster # 10405       Sequences # 16       consensus # 1


see consensus multiple alignment with clustalw

Direct access to contigs :
consensus_10405#0 length = 1137 sequences # 16  

consensusID : consensus_10405#0
NCBI blastX ! send the sequence to the NCBI site !
NCBI blastN ! send the sequence to the NCBI site !
Sequences nbr = 16
consensus length = 1137
fasta sequence
                              [TCCTTATTTCCAAACCCTGTCATCACAACCGACATACATGAGGCTGTGTCCTGACTGAGAATAGCTATGCCTTATGTGTTCGTTTCATTTTATCTAACAAAACTGTGTATGTATATACACAGTTGTACATACATATAGAGTAGATTTTGTATGTTGATGCTTTTTATATGAGTGTGTATTAGTATTGTTTGGGCTGTGTCGATTGGTTATGGCGAGTAGCCGTTCAGCTGCCCCGTGCATAGTTGATTCACGGTGGGTCGTTTCCTGCGGCTGAGATTGAATGGATGCACAGTTATACCTCTTGTCCATTACAGGGACTCGTTGGTTCCGACGTGCAGGCCACATGGGATGTTGATTTGCTAAGGTGCTTATGTCTTTCTTAGCAGTGTATTTGTATGTTTGTTTGTGATTGGCTTTGCTGTGTCTGTAGTCAGTCACATAGCTACTATACTGCATTGTTTACATTCGTGAATGATGTCGTTAGAGTAGCTGATATTTATGCAATGTATTTGATACGTGTGCGACAAAATGTTACCAGTGTGTTGTCT-GTTACATGAAACACCAGTGGTCAGTATGATT-TCAGG-TTTCATTGTGTACTT-TG-TTGG-NTATGTTAGTCATGTGAGTGTGCGAACTGAGCGAAGTAGAG-TTTTCTTTTATTATACTATGAAGACAGAATGAATTGTTTTACGTTGTGTGTATGTATGTGAATTT-CCTAGTAATTCAACTTTGTGCAGGAAGACATCAATTTGTTTGAAGCTTTATGTTTTTGTGAATATATATGCATATGAGAGTGAGTTGTTTTGAACGCTTGTTCACTTGTTGTGTAATTGTGTGTACGTAGATCTTTGAGTATAGTATATTGAATAGCCGTTCAGCTACTCCGTGTATATGTAATTCACGATGAGTCGTTTCCTGCGGCTGAGATTGAACGGATGCACTGCTATGCCTCTTGTCCATCACGTGGACTTGTTTGGTACGAATGCAGACGACATGTCACTTTAGTTATTTATCTTGTGCGTAACAGACATAAATTTTTTGGCTAGTCTTGTATGTGTTGAGCGTTGACGTTGATGGTGGATTTGAGATGGATTTTCGAGAAATAGATTTTGCGTTGGTCAATAAATCGTTGTGTTTAAA]

[+] EMBL CD147219             [TCCTTATTTCCAAACCCTGTCATCACAACCGACATACATGAAGCTGTGTCCTGACTGAGAATAGCTATGCCTTATGTGTTCGTTTCATTTTATCTAACAAAACTGTGTATGTATATACACAGTTGTACATACATATAGAGTAGATTTTGTATGTTGATGCTTTTTATATGAGTGTGTATTAGTATTGTTTGGGCTGTGTCGATTGGTTATAGCGAGTAGCCGTTCAGCTGCCCCGTGCATAGTTGATTCACGGTGGGTCGTTTC                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                 ]
[-] EMBL CD086397             [ ctTTATTTCCAAACCCTGTCATCACAACCGACATACATGAGGCTGTGTCCTGACTGAGAATAGCTATGCCTTATGTGTTCGTTTCATTTTATCTAACAAAACTGTGTATGTATATACACAGTTGTACATACATATAGAGTAGATTTTGTATGTTGATGCTTTTTATATGAGTGTGTATTAGTATTGTTTGGGCTGTGTCGATTGGTTATGGCGAGTAGCCGTTCAGCTGCCCCGTGCATAGTTGATTCACGGTGG                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                         ]
[-] EMBL CD192689             [                      TCACAACCGACATACATGAGGCTGTGTCCTGACTGAGAATAGCTATGCCTTATGTGTTCGTTTCATTTTATCTAACAAAACTGTGTATGTATATACACAGTTGTACATACATATAGAGTAGATTTTGTATGTTGATGCTTTTTATATGAGTGTGTATTAGTATTGTTTGGGCTGTGTCGATTGGTTATGGCGAGTAGCCGTTCAGCTGCCCCGTGCATAGTTGATTCACGGTGGGTCGTTTCCTGCGGCTGAGATTGAATGGATGCACAGTTATACCTCTTGTCCATTACAGGGACTCGTTGGTTCCGACGTGCAG                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                       ]
[-] EMBL CD199424             [                                                                                                                                                                    TATATGAGTGTGTATTAGTATTGTTNGGGCTGTGTCGATTGGTTATTGCGAGTAGGCGTTCAGCTGCCCCGTGCATAGTTGATTCACGGTGGGTCGTTTCCTGCGGCTGAGATTGAATGGATGCACAGTTATACCTCTTGTCCATTACAGGGACTCGTTGGTTCCGACGTGCAGGCCACATGGGATGTTGATTTGCTAAGGTGCTTATGTCTTTCTTAGCAGTGTATTTGTATGTTTGTTTGTGATTCTCTATGCTGTGTCTGTAGTCAGTCACATAGCTACTATACTGC                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                   ]
[+] EMBL CD148986             [                                                                                                                                                                                                                                                  TTGATTCACGGTGGGTCGTTTCCTGCGGCTGAGATTGAATGGATGCACAGTTATACCTCTTGTCCATTACAGGGACTCGTTGGTTCCGACGTGCAGGCCACATGGGATGTTGATTTGCTAAGGTGCTTATGTCTTTCTTAGCAGTGTATTTGTATGCTTGTTTGTGATTGGCTTTGCTGTGTCTGTAGTCAGTCACATAGCTACTATACTGCATTGTTTACATTCGTGAATGATGTCGTTAGAGTAGCTGATATTTATGCAATGTATTTGATACGTGTGCGACAAAATGTTACCAGTGTGTTGTCT GTTACATGAAACACCAGTGGTCAGTATGATT TCAGG TTTCATTGTGTACTC TG TTGG TTATGTTAGTCATGTGAGTGTGCGAACTGAGCGAAGTAGAG TTTTCTTTTATTATACTATGAAGACAGAATGAATTGTTTTACGTTGTGTGTATGTATGTGAATTT CCTAGTAGTTCAACTTTGTGCAGGAAGACATCAATTTGTTTGAAGCTTTATGTTTTTGTGAATATATATGCATATGAGAGTGAGTTGTTTTGAACGCTTGTTCACTTGTTGTGTAATTGTGTGTACGTAGATCTTTGAGTATAGTATATTGAATAGCCGTTCAGCTA                                                                                                                                                                                                                                                                   ]
[+] EMBL CD110802             [                                                                                                                                                                                                                                                  TTGATTCACGGTGGGTCGTTTCCTGCGGCTGAGATTGAATGGATGCACAGTTATACCTCTTGTCCATTACAGGGACTCGTTGGTTCCGACGTGCAGGCCACATGGGATGTTGATTTGCTAAGGTGCTTATGTCTTTCTTAGAAGTGTATTTGTATGTTTGTTTGTGATTGGCTTTGCTGTGTCTGTAGTCAGTCACATAGCTACTATACCGCATTGTTTACATTCGTGAATGATGTCGTTAGAGTAGCTGATATTTATGCAATGTATTTGATACGTGTGCGACAAAATGTTACCAGTGTGTTGTCT GTTACATGAAACACCAGTGGTCAGCATGATT TCAGG TTTCATTGCGTACTT TG ATGGNNTATGTag                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                              ]
[+] EMBL CD111897             [                                                                                                                                                                                                                                                  TTGATTCACGGTGGGTCGTTTCCTGCGGCTGAGATTGAATGGATGCACAGTTATACCTCTTGTCCATTACAGGGACTCGTTGGTTCCGACGTGCAGGCCACATGGGATGTTGATTTGCTAAGGTGCTTATGTCTTTCTTAGAAGTGTATTTGTATGTTTGTTTGTGATTGGCTTTGCTGTGTCTGTAGTCAGTCACATAGCTACTATACTGCATTGTTTACATTCGTGAATGATGTCGTTAGAGTAGCTGATATTTATGCAATGTATCTGATACGTGTGCGACAAAATGTTACCAGTGTNGTGTCTNNGTACATG AACACCAGTGGTCAGTATGATT TCAGGNNTTCA TGNGNACTTNNG TGGN NTATGTag                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                              ]
[+] EMBL CD111820             [                                                                                                                                                                                                                                                  TTGATTCACGGTGGGTCGTTTCCTGCGGCTGAGATTGAATGGATGCACAGTTATACCTCTCGTCCATTACAGGGACTCGTTGGTTCCGACGTGCAGGCCACATGGGATGTTGATTTGCTAAGGTGCTTATGTCTTTCTTAGAAGTGTATTTGTATGTTTGTTTGTGATTGGCTTTGCTGTGTCTGTAGTCAGTCACATAGCTACTATACTGCATTGTTTACATTCGTGAATGATGTCGTTAGAGTAGCTGATATTTATGCAATGTATTTGATACGTGTGCGACAANATGTTACCAGTGTGTAGTCT GTTACATGAAACACCAGTGGTCAGTATGATTNNCAGG  TTCAATGNGTACTT TGNTGGG NTATGTag                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                              ]
[+] EMBL CD148932             [                                                                                                                                                                                                                                                  TTGATTCACGGTGGGTCGTTTCCTGCGGCTGAGATTGAATGGATGCACAGTTATACCTCTTGTCCATTACAGGGACTCGCTGGTTCCGACGTGCAGGCCACATGGGATGTTGATTTGCTAAGGTGCTTATGTCTTTCTTAGCAGTGTATTTGTATGTTTGTTTGTGATTGGCTTTGCTGTGTCTGTAGTCAGTCACATAGCTACTATACTGCATTGTTTACATTCCTGAATGATGTCGTTAGAGTAGCTGATATTT                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                       ]
[+] EMBL CD112007             [                                                                                                                                                                                                                                                  TTGATTCACGGTGGGTCGTTTCCTGCGGCTGAGATTGAATGGATGCACAGTTATACCTCTTGTCCATTACAGGGACTCGTTGGTTCCGACGTGCAGGCCACATGGGATGTTGATTTGCTAAGGTGCTTATGTCTTTCTTAGCAGTGTATTTGTATGTTTGTTTGTGATTGGCTTTGCTGTGTCTGTAGTCAGTCACATAGCTACTATACTGCATTGTTTACATTCGTGAATGATGT                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                           ]
[-] EMBL CD148858             [                                                                                                                                                                                                                                                   TGATTCAGGGTGGGTCGTTTCTTGCGGCTGAGATTGAATGGATGCACAGTTATACCTCTTGTCCATTACAGGGACTGGTTGGTTCCGACGTGCAGGCCACATGGGATGTTGATTTGCTAAGGTGCTTATGTCTTTCTTAGCAGTGTATTTGTATGTTTGTTTGTGATTGGCTTTGCTGTGTCTGTAGTCAGTCACATAGCTATTATACTGCATTGTTTACATTCGTGAATGATGTCGTTAGAGTAGCTGATATTTATGCAATGTATTTGATACGTGTGCGACAAAATGTTACCAGTGTGTTGTCT GTTACATGAAACACCAGTGGTCAGTATGATT TCAGG TTTCATTGTGTACTT TG TTGG TTATGTTAGT                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                            ]
[-] EMBL CD118283             [                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                        GG TTTCATTGTGGACTT GG TGGT ATATGTTAGTCATGTGAGTGTGCGAACTGAGCGAAG AAAGTTTTTCTTTTATTATCATATGAAGACAGAATGAATTGTTTACCGTGGTGTGTATGTATGTGAATTTCCCTAGTAATTCAACTTTGAGCAGGAAGACATCAATTTGTTGAAAGCTTTATGTTTTTGTGAATATATATGCATATGAGAGTGAGTTGTTTTGAACGCTTGTTCACTTGTTGTGTAATTGTGTGTACGTAGATCTTTGAGTATAGTATATTGAATAGCCGTTCAGCTACTCCGTGTATATGTAATTCACGATGAGTCGTTTCCTGCGGCTGAGATTGAACGGATGCACTGCTATGCCTCTTGTCCATCACGTGGACTTGTTTGGTACGAATGCAGACGACATGTCACTTTAGTTATTTATCTTGTGCGTAACAGACATAAATTTTTTGGCTAGTCTTGTATGTGTTGAGCGTTG                                                                         ]
[-] EMBL CD148787             [                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                               TATGTATGTGAATTT CCTAGTAATTCAACTTTGTGCAGGAAGACATCAATTTGTTTGAAGCTTTATGTTTTTGTGAATATATATGCATATGAGAGTGAGTTGTTTTGAACGCTTGTTCACTTGTTGTGTAATTGTGTGTACGTAGATCTTTGAGTATAGTATATTGAATAGCCGTTCAGCTACTCCGTGTATATGTAATTCACGATGAGTCGTTTCCTGCGGCTGAGATTGAACGGATGCACTGCTATGCCTCTTGTCCATCACGTGGACTTGTTTGGTACGAATGCAGACGACATGTCACTTTAGTTATTTATCTTGTGCGTAACAGACATAAATTTTTTGGCTAGTCTT                                                                                          ]
[-] EMBL CD148789             [                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                              TGTAATTGTGTGTACGTAGATCTTTGAGTATAGTATATTGAATAGCCGTTCAGCTACTCCGTGTATATGTAATTCACGATGAGTCGTTTCCTGCGGCTGAGATTGAACGGATGCACTGCTATGCCTCTTGTCCATCACGTGGACTTGTTTGGTACGAATGCAGACGACATGTCACTTTAGTTATTTATCTTGTGCGTAACAGACATAAATTTTTTGGCTAGTCTT                                                                                          ]
[+] EMBL CD148886             [                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                  GTAATTCACGATGAGTCGTTTCCTGCGGCTGAGATTGACCGGATGCACTGCTATGCCTCTTGTCCATCACGTGGACTTGTTTGGTACAAATGCA                                                                                                                                                         ]
[+] EMBL CD062970             [                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                        caAATGCAGACGACATGTCACTTTAGTTATTTATCTTGTGCGTAACAGACAT AATTTTTTGGCTAGTCTTGTATGTGTTGAGCGTTGACGTTGATGGTGGATTTGAGATGGATTTTCGAGAAATAGATTTTGCGTTGGTCAATAAATCGTTGTGTTTAAA]


>consensus_10405#0 TCCTTATTTCCAAACCCTGTCATCACAACCGACATACATGAGGCTGTGTCCTGACTGAGA ATAGCTATGCCTTATGTGTTCGTTTCATTTTATCTAACAAAACTGTGTATGTATATACAC AGTTGTACATACATATAGAGTAGATTTTGTATGTTGATGCTTTTTATATGAGTGTGTATT AGTATTGTTTGGGCTGTGTCGATTGGTTATGGCGAGTAGCCGTTCAGCTGCCCCGTGCAT AGTTGATTCACGGTGGGTCGTTTCCTGCGGCTGAGATTGAATGGATGCACAGTTATACCT CTTGTCCATTACAGGGACTCGTTGGTTCCGACGTGCAGGCCACATGGGATGTTGATTTGC TAAGGTGCTTATGTCTTTCTTAGCAGTGTATTTGTATGTTTGTTTGTGATTGGCTTTGCT GTGTCTGTAGTCAGTCACATAGCTACTATACTGCATTGTTTACATTCGTGAATGATGTCG TTAGAGTAGCTGATATTTATGCAATGTATTTGATACGTGTGCGACAAAATGTTACCAGTG TGTTGTCTGTTACATGAAACACCAGTGGTCAGTATGATTTCAGGTTTCATTGTGTACTTT GTTGGNTATGTTAGTCATGTGAGTGTGCGAACTGAGCGAAGTAGAGTTTTCTTTTATTAT ACTATGAAGACAGAATGAATTGTTTTACGTTGTGTGTATGTATGTGAATTTCCTAGTAAT TCAACTTTGTGCAGGAAGACATCAATTTGTTTGAAGCTTTATGTTTTTGTGAATATATAT GCATATGAGAGTGAGTTGTTTTGAACGCTTGTTCACTTGTTGTGTAATTGTGTGTACGTA GATCTTTGAGTATAGTATATTGAATAGCCGTTCAGCTACTCCGTGTATATGTAATTCACG ATGAGTCGTTTCCTGCGGCTGAGATTGAACGGATGCACTGCTATGCCTCTTGTCCATCAC GTGGACTTGTTTGGTACGAATGCAGACGACATGTCACTTTAGTTATTTATCTTGTGCGTA ACAGACATAAATTTTTTGGCTAGTCTTGTATGTGTTGAGCGTTGACGTTGATGGTGGATT TGAGATGGATTTTCGAGAAATAGATTTTGCGTTGGTCAATAAATCGTTGTGTTTAAA



clustalw multiple alignements is not computed in this case


Copyright Thu Nov 6 12:32:27 CET 2003 Hubert Wassner    (hubert.wassner@noos.fr)