These datas are free for academic use only, please contact me for any other use. Schistosoma mansoni see consensus multiple alignment with clustalw Direct access to contigs :
consensusID : consensus_10423#0 NCBI blastX ! send the sequence to the NCBI site ! NCBI blastN ! send the sequence to the NCBI site ! Sequences nbr = 11 consensus length = 976 fasta sequence [GAGCCAGATTCGGCACGAGGGAAATACACAATTCTGGATTGATATCTTTAAATGTTCTATGTTGTGTAGCATGAATACCGCTGGGTCGTTGAATCCCACAATTCCAAATCAAAATGATATTCATACGAACTTAATGTATAGAAGAGATTTACTTGACTATATATTAAATTATATGAATAGTAACCGGATGGATGTTATATGCTCAAACTCATTTATAATGGATTCTTTGTTAAATTTCAATTCACAATTAAGTCATAACACTGTATTACATAATAATCAGTTCTACTCAACATTGATCCCTTATTTATTTCCTATGGATTTAAATCTTAATTCATTGCAACAACAACATCAAAATCATCAGATACAAAATTGTACTAATGACTGGTTGGTGGGTAATGATCATATCAATAATAACGGTAATAATACTTCGGATCCAACATTAATGTACCTTGCAGTAGCTACCCAATGTATTCTACGCTATTTCTTAACAACACATAATTATCAACAAATTTTATATCTCAATTCATTTCTTCATTCCAATTATTCATCAACATCAGCTACATATAATAATACAAGTAGTCAGAATGACGATATGTTCTTTGAATCACCTAAGAATACATTAGAATCTAATTCCAGATTATTAATTCATCAATACTTAGAAATAGATCATTGTAATTCAATGAAAATAAATGAAAATTCATCAATTACACCACGTATAAAACGTTATAAATGTACATATCCTAATTGTAC-A-AAGCATA-TTATAAACGTTCTCATTTAAATG-ACATTAT-CA-TTACATACTGGTGCTAANCCACA-TTATGT-ATCAACCTGG-NTGT-ATGCACGTTTAACGTGCTGATCATATCCGGNATGACGTGC-CTACTGGGGACGTATTTCATGAATGGTGGTTAACGTTTAAACGAAGGACCTTTAAGTCATTAATAAAATGTGGCAAATTATTTTTAAC-GTTTTCTATTTCCAA] [+] EMBL CD080043 [GAGCCAGATTCGGCACGAGGGAAATACACAATTCTGGATTGATATCTTTAAATGTTCTATGTTGTGTAGCATGAATACCGCTGGGTCGTTGAATCCCACAATTCCAAATCAAAATGATATTCATACGAACTTAATGTATAGAAGAGATTTACTTGACTATATATTAAATTATATGAATAGTAACCGGATGGATGTTATATGCTCAAACTCATTTATAATGGATTCTTTGTTAAATTTCAATTCACAATTAAGTCATAACACTGTATTACATAATAATCAGTTCTACTCAACATTGATCCCTTATTTATTTCCTATGGATTTAAATCTTAATTCATTGCAACAACAACATCAAAATCATCAGATACAAAATTGTACTAATGACTGGTTGGTGGGTAATGATCATATCAATAATAACGGTAATAATACTTCGGATCCAACATTAATGTACCTTGCAGTAGCTACCCAATGTATTCTACGCTATTTCTTAACAACACATAATTATCAACAAACTTTATATCTCAATTCATTTCTTCATTCCAATTATTCATCAACATCAGCTACATATAATAATACAAGTAGTCAGAATGACGATATGTTCTTTGAATCACCTAAGAATACATTAGAATCTAATTCCAGATTATTAATTCATCAATACTTAGAAATAGATCATTGTAATTCAATGAAAATAAATGANAATTCATCAATTACACCACGTATAANACGTTATAAATGTACATATCCTAATTGTAC A AAGCATATTTAT AACGTTCTCATTTAAATG ACATTATNCA TTACATACTGGTGCTAANCCACA TTATGT ATCAAACTGGNNTGT ATGCACGTTTAACGTGCTGATCATATCCGGNATGACGTGC CTACTGGGGACGTATTTCATGAATGGTGGTTAACGTTTAAACGAAGGACCTTTAAGTCATTAATAAAATGTGGCAAATTATTTTTAAC GTTTTCTATTTCCAA] [+] EMBL CD080055 [ GAAATACACAATTCTGGATTGATATCTTTAAATGTTCTATGTTGTGTAGCATGAATACCGCTGGGTCGTTGAATCCCACAATTCCAAATCAAAATGATATTCATACGAACTTAATGTATAGAAGAGATTTACTTGACTATATATTAAATTATATGAATAGTAACCGGATGGATGTTATATGCTCAAACTCATTTATAATGGATTCTTTGTTAAATTTCAATTCACAATTAAGTCATAACACTGTATTACATAATAATCAGTTCTACTCAACATTGATCCCTTATTTATTTCCTATGGATTTAAATCTTAATTCATTGCAACAACAACATCAAAATCATCAGATACAAAATTGTACTAATGACTGGTTGGTGGGTAATGATCATATCAATAATAACGGTAATAATACTTCGGATCCAACATTAATGTACCTTGCAGTAGCTACCCAATGTATTCTACGCTATTTCTTAACAACACATAATTATCAACAAACTTTATATCTCAATTCATTTCTTCATTCCAATTATTCATCAACATCAGCTACATATAATAATACAAGTAGTCAGAATGACGATATGTTCTTTGAATCACCTAAGAATACATTAGAATCTAATTCCAGATTATTAATTCATCAATACTTAGAAATAGATCATTGTAATTCAATGAAAATAAATGAAAATTCATCAATTACACCACGTATAAAACGTTATAAATGTACATATCCTAATTGTAC A AAGCATA TTATAAACGTTCTCATTT AATG AACTTAT CA TTACATACT GTGCTAA CCACA TTATGT ATCAACCTGG TGT ATGCACGTTTACCGTGCTGACAATATCAGGTATGAC TGCACTACTGTGGACGTATTTCATGTATGTTGGTT ACGTTTAACCG TGGACCTTTAAATCATTACTGAAA GTTGTAAATTA TTTAAACGGTTTTTTATTTaaa ] [+] EMBL AI068238 [ CAAACTCATTTATAATGGATTCTTTGTTAAATTTCAATTCACAATTAAGTCATAACACTGTATTACATAATAATCAGTTCTACTCAACATTGATCCCTTATTTATTTCCTATGGATTTAAATCTTAATTCATTGCAACAACAACATCAAAATCATCAGATACAAAATTGTACTAATGACTGGTTGGTGGGTAATGATCATATCAATAATAACGGTAATAATACTTCGGATCCAACATTAATGTACCTTGCAGTAGCTACCCAATGTATTCTACGCTATTTCTTAACAACACATAATTATCAACAAATTTTATATCTCAATTCATTTCTTCATTCCAATTATTCATCAACATCAGCTACATATAATAATACAAGTAGTCAGAATGACGATATGTTCATTGAATCACCTAAGAATA ] [+] EMBL AI067175 [ CAAACTCATTTATAATGGATTCTTTGTTAAATTTCAATTCACAATTAAGTCATAACACTGTATTACATAATAATCAGTTCTACTCAACATTGATCCCTTATTTATTTCCTATGGATTTAAATCTTAATTCATTGCAACAACAACATCAAAATCATCAGATACAAAATTGTACTAATGACTGGTTGGTGGGTAATGATCATATCAATAATAACGGTAATAATACTTCGGATCCAACATTAATGTACCTTGCAGTAGCTACCCAATGTATTCTACGCTATTTCTTAACAACACATAATTATCAACAAATTTTATATCTCAATTCATTTCTTCATTCCAATTATTCATCAACATCAGCTACATATAATAATACAAGTAGTCAGAATGACGATATGTTCTTTGAATCACCTAAGAATACATTAGAATCTAATTCCAGATTATTAATTCATCAATACTTAGAAATAGATCATTGTAATTCAATGAAAATAAATGAAAATTCATCAATTACACCACGTATAAAACGTTATAAATGTACATATCCTAATTGTAC ACAAGCATA TTATAAACGTTCTCATTTAAATGAACATTAT CATTTACATACTGGTG ] [+] EMBL AI067231 [ CATTTATAATGGATTCTTTGTTAAATTTCAATTCACAATTAAGTCATAACACTGTATTACATAATAATCAGTTCTACTCAACATTGATCCCTTATTTATTTCCTATGGATTTAAATCTTAATTCATTGCAACAACAACATCAAAATCATCAGATACAAAATTGTACTAATGACTGGTTGGTGGGTAATGATCATATCAATAATAACGGTAATAATACTTCGGATCCAACATTAATGTACCTTGCAGTAGCTACCCAATGTATTCTACGCTATTTCTTAACAACACATAATTATCAACAAATTTTATATCTCAATTCATTTCTTCATTCCAATTATTCATCAACATCAGCTACATATAATAATACAAGTAGTCAGAATGACGATATGTTCTTTGAATCACCTAAGAATACATTAGAATCTAATTCCAGATTATTAATTCATCAATACTTAGAAATAGATCATTGTAATTCAATGAAAATAAATGAAAATTCATCAATTACACCACGTATAAAACGTTATAAATGTACATATCCTAATTGTACAA AAGCATA TTATAAACGTTCTCATTTAAATGAACATTAT CATTTACATACTGGTGCTAAACCACATTTATGTAATCAACCTGG TTGTAATGCACGTTTt ] [+] EMBL AI068052 [ CATTTATAATGGATTCTTTGTTAAATTTCAATTCACAATTAAGTCATAACACTGTATTACATAATAATCAGTTCTACTCAACATTGATCCCTTATTTATTTCCTATGGATTTAAATCTTAATTCATTGCAACAACAACATCAAAATCATCAGATACAAAATTGTACTAATGACTGGTTGGTGGGTAATGATCATATCAATAATAACGGTAATAATACTTCGGATCCAACATTAATGTACCTTGCAGTAGCTACCCAATGTATTCTACGCTATTTCTTAACAACACATAATTATCAACAAATTTTATATCTCAATTCATTTCTTCATTCCAATTATTCATCAACATCAGCTACATATAATAATACAAGTAGTCAGAATGACGATATGTTCTTTGAATCACCTAAGAATACATTAGAATCTAA ] [+] EMBL AI068306 [ CATTTATAATGGATTCTTTGTTAAATTTCAATTCACAATTAAGTCATAACACTGTATTACATAATAATCAGTTCTACTCAACATTGATCCCTTATTTATTTCCTATGGATTTAAATCTTAATTCATTGCAACAACAACATCAAAATCATCAGATACAAAATTGTACTAATGACTGGTTGGTGGGTAATGATCATATCAATAATAACGGTAATAATACTTCGGATCCAACATTAATGTACCTTGCAGTAGCTACCCAATGTATTCTACGCTATTTCTTAACAACACATAATTATCAACAAATTTTATATCTCAATTCATTTCTTCATTCCAATTATTCATCAACATCAGCTACATATAATAATACAAGTAGTCAGAATGACGATATGTTCTTTGAATCACCTAAGAATACATTAGAATCTAATTCCAGATTATTAA ] [+] EMBL AI068303 [ CATTTATAATGGATTCTTTGTTAAATTTCAATTCACAATTAAGTCATAACACTGTATTACATAATAATCAGTTCTACTCAACATTGATCCCTTATTTATTTCCTATGGATTTAAATCTTAATTCATTGCAACAACAACATCAAAATCATCAGATACAAAATTGTACTAATGACTGGTTGGTGGGTAATGATCATATCAATAATAACGGTAATAATACTTCGGATCCAACATTAATGTACCTTGCAGTAGCTACCCAATGTATTCTACGCTATTTCTTAACAACACATAATTATCAACAAATTTTATATCTCAATTCATTTCTTCATTCCAATTATTCATCAACATCAGCTACATATAATAATACAAGTAGTCAGAATGACGATATGTTCTTTGAATCACCTAAGAATA ] [+] EMBL AI068361 [ CATTTATAATGGATTCTTTGTTAAATTTCAATTCACAATTAAGTCATAACACTGTATTACATAATAATCAGTTCTACTCAACATTGATCCCTTATTTATTTCCTATGGATTTAAATCTTAATTCATTGCAACAACAACATCAAAATCATCAGATACAAAATTGTACTAATGACTGGTTGGTGGGTAATGATCATATCAATAATAACGGTAATAATACTTCGGATCCAACATTAATGTACCTTGCAGTAGCTACCCAATGTATTCTACGCTATTTCTTAACAACACATAATTATCAACAAATTTTATATCTCAATTCATTTCTTCATTCCAATTATTCATCAACATCAGCTACATATAATAATACAAGTAGTCAGAATGACGATATGTTCTTTGAATCACCTAAGAATA ] [+] EMBL AI067118 [ CATTTATAATGGATTCTTTGTTAAATTTCAATTCACAATTAAGTCATAACACTGTATTACATAATAATCAGTTCTACTCAACATTGATCCCTTATTTATTTCCTATGGATTTAAATCTTAATTCATTGCAACAACAACATCAAAATCATCAGATACAAAATTGTACTAATGACTGGTTGGTGGGTAATGATCATATCAATAATAACGGTAATAATACTTCGGATCCAACATTAATGTACCTTGCAGTAGCTACCCAATGTATTCTACGCTATTTCTTAACAACACATAATTATCAACAAATTTTATATCTCAATTCATTTCTTCATTCCAATTATTCATCAACATCAGCTACATATAATAATACAAGTAGTCAGAATGACGATATGTTCTTTGAATCACCTAAGAATA ] [+] EMBL AI067141 [ CATTTATAATGGATTCTTTGTTAAATTTCAATTCACAATTAAGTCATAACACTGTATTACATAATAATCAGTTCTACTCAACATTGATCCCTTATTTATTTCCTATGGATTTAAATCTTAATTCATTGCAACAACAACATCAAAATCATCAGATACAAAATTGTACTAATGACTGGTTGGTGGGTAATGATCATATCAATAATAACGGTAATAATACTTCGGATCCAACATTAATGTACCTTGCAGTAGCTACCCAATGTATTCTACGCTATTTCTTAACAACACATAATTATCAACAAATTTTATATCTCAATTCATTTCTTCATTCCAGTTATTCATCAACATCAGCTACATATAATA ] consensusID : consensus_10423#1 NCBI blastX ! send the sequence to the NCBI site ! NCBI blastN ! send the sequence to the NCBI site ! Sequences nbr = 3 consensus length = 953 fasta sequence [TCGCGGCCAAAAATTCGGCACGAGGGAATACCGCTGGGTCGTTGAATCCCACAATTCCAAATCAAAATGATATTCATATGAACTTAATGTATAGAAGAGATTTACTTGACTATATATTAAATTATATGAATAGTAACCGGATGGATGTTATATGCTCAAACTCATTTATAATGGATTCTTTGTTAAATTTCAATTCACAATTAAGTCATAACACTGTATTACATAATAATCAGTTCTACTCAACATTGATCCCTTATTTATTTCCTATGGATTTAAATCTTAATTCATTGCAACAACAACATCAAAATCATCAGATACAAAATTGTACTAATGACTGGTTGGTGGGTAATGATCATATCAATAATAACGGTAATAATACTTCGGATCCAACATTAATGTACCTTGCAGTAGCTACCCAAT-GTATTCTACGCT-ATTTCTTAACAACTCATAATTATCAACAAATTTTATATCTCAATTCATTTCTTCATTCCAATTATTCATCAACATCAGCTACATATAATAATACAAGTAGTCAGAATGACGATATGTTCTTTGAATCACCTAAGAATACTTTAGAATCTAATTCCAGATTATTAATTCATCAATACTTAGAAATAGATCATTGTAATTCAATGAANATAAATGAGNATTCATCAATTACACCACGTATAAAACGTTATAAATGTACATATCCTAATTGTACAAAAGCATATTATAAACGTTCTCATTTAAATGAACATTATCNATTACATACTGGNTGCTAACCACATTTATGNTATCAACCTGGNTGTAATGCACGTTTACACGTGCTGATCAATATCACGTCATAGACGTGCCATACTGGNGAACGTATTTTCATTGAATGGGTTGTTAAACGTTTAAACGTATGATCATTAAAGTCATTAACTAAAATGTTGTACAAATTTTTATTACTGTTTTTTTCATATTCGAAA] [+] EMBL CD079860 [TCGCGGCCAAAAATTCGGCACGAGGGAATACCGCTGGGTCGTTGAATCCCACAATTCCAAATCAAAATGATATTCATATGAACTTAATGTATAGAAGAGATTTACTTGACTATATATTAAATTATATGAATAGTAACCGGATGGATGTTATATGCTCAAACTCATTTATAATGGATTCTTTGTTAAATTTCAATTCACAATTAAGTCATAACACTGTATTACATAATAATCAGTTCTACTCAACATTGATCCCTTATTTATTTCCTATGGATTTAAATCTTAATTCATTGCAACAACAACATCAAAATCATCAGATACAAAATTGTACTAATGACTGGTTGGTGGGTAATGATCATATCAATAATAACGGTAATAATACTTCGGATCCAACATTAATGTACCTTGCAGTAGCTACCCAAT GTATTCTACGCT ATTTCTTAACAACTCATAATTATCAACAAATTTTATATCTCAATTCATTTCTTCATTCCAATTATTCATCAACATCAGCTACATATAATAATACAAGTAGTCAGAATGACGATATGTTCTTTGAATCACCTAAGAATACTTTAGAATCTAATTCCAGATTATTAATTCATCAATACTTAGAAATAGATCATTGTAATTCAATGAANATAAATGAGNATTCATCAATTACACCACGTATAAAACGTTATAAATGTACATATCCTAATTGTACAAAAGCATATTATAAACGTTCTCATTTAAATGAACATTATCNATTACATACTGGNTGCTAACCACATTTATGNTATCAACCTGGNTGTAATGCACGTTTACACGTGCTGATCAATATCACGTCATAGACGTGCCATACTGGNGAACGTATTTTCATTGAATGGGTTGTTAAACGTTTAAACGTATGATCATTAAAGTCATTAACTAAAATGTTGTACAAATTTTTATTACTGTTTTTTTCATATTCGAAA] [+] EMBL AI067034 [ CATTTATAATGGATTCTTTGTTAAATTTCAATTCACAATTAAGTCATAACACTGTATTACATAATAATCAGTTCTACTCAACATTGATCCCTTATTTATTTCCTATGGATTTAAATCTTAATTCATTGCAACAACAACATCAAAATCATCAGATACAAAATTGTACTAATGACTGGTTGGTGGGTAATGATCATATCAATAATAACGGTAATAATACTTCGGATCCAACATTAATGTACCTTGCAGTAGCTACCCAATGGTA TCTACGCTNATTcnn ] [+] EMBL AI067066 [ CATTTATAATGGATTCTTTGTTAAATTTCAATTCACAATTAAGTCATAACACTGTATTACATAATAATCAGTTCTACTCAACATTGATCCCTTATTTATTTCCTATGGATTTAAATCTTAATTCATTGCAACAACAACATCAAAATCATCAGATACAAAATTGTACTAATGACTGGTTGGTGGGTAATGATCATATCAATAATAACGGTAATAATACTTCGGATCCAACATTAATGTACCTTGCAGTAGCTACCCAAT GTATTCT ] consensusID : consensus_10423#2 NCBI blastX ! send the sequence to the NCBI site ! NCBI blastN ! send the sequence to the NCBI site ! Sequences nbr = 2 consensus length = 696 fasta sequence [CAACAACATCAAAATCATCAGATTCTAAATTGTACTAATGACCGGTTGGAGGGTAATGATCATATCAATAATAACGGTAATAATACTTCGGATCCAACATTAATGTACCTTGCAGTAGCTACCCAATGTATTCTACGCTATTTCTTAACAACACATAATTATCAACAAATTTTATATCTCAATTCATTTCTTCATTCCAATTATTCATCAACATCAGCTACATATAATAATACAAGTAGTCAGAATGACGATATGTTCTTTGAATCACCTAAGAATACATTAGAATCTAATTCCAGATTATTAATTCATCAATACTTAGAAATAGATCATTGTAATTCAATGAAAATAAATGAAAATTCATCAATTACACCACGTATAAAACGTTATAAATGTACATATCCTAATTGTACAAAAGCATATTATAAACGTTCTCATTTAAATGAACATTATCATTTACATACTGGTGGCTAAACCACATTTATGTAATCAACCTGGTTGTAATGGCACGTTTTACACGTGCTGATCAATTATCACGTCATAGACGTGCACATACTAGGTGAACGTAATTNTCATTGGTATGGTTTGTTTAAAACGTTTTAAACGTAGTGATCATTTAAAAGTACATTTAACTAGAAATGTATGTACAAAA-TTAATTTATAAACTGGTTTTTTTTTC-TATATATTTCG-AAAAAAAGAA] [+] EMBL CD082375 [CAACAACATCAAAATCATCAGATTCTAAATTGTACTAATGACCGGTTGGAGGGTAATGATCATATCAATAATAACGGTAATAATACTTCGGATCCAACATTAATGTACCTTGCAGTAGCTACCCAATGTATTCTACGCTATTTCTTAACAACACATAATTATCAACAAATTTTATATCTCAATTCATTTCTTCATTCCAATTATTCATCAACATCAGCTACATATAATAATACAAGTAGTCAGAATGACGATATGTTCTTTGAATCACCTAAGAATACATTAGAATCTAATTCCAGATTATTAATTCATCAATACTTAGAAATAGATCATTGTAATTCAATGAAAATAAATGAAAATTCATCAATTACACCACGTATAAAACGTTATAAATGTACATATCCTAATTGTACAAAAGCATATTATAAACGTTCTCATTTAAATGAACATTATCATTTACATACTGGTGGCTAAACCACATTTATGTAATCAACCTGGTTGTAATGGCACGTTTTACACGTGCTGATCAATTATCACGTCATAGACGTGCACATACTAGGTGAACGTAATTNTCATTGGTATGGTTTGTTTAAAACGTTTTAAACGTAGTGATCATTTAAAAGTACATTTAACTAGAAATGTATGTACAAAA TTAATTTATAAACTGGTTTTTTTTTC TATATATTTCG AAAAAAAGAA] [-] EMBL CD075976 [ CAAATTTTATATCTCAATTCATTTCTTCATTCCAATTATTCATCAACATCAGCTACATATAATAATACAAGTAGTCAGAATGNCGATATGTTCTTTGAATCCCCTAAGAATACATTAGAATCTAATTCCAGATTATTAATTCATCAATACTTAGAAATAGATCATTGTAATTCAATGAAAATAAATGAAAATTCATCAATTACCCCACGTATAAAACGTTATAAATGTACATATCCTAATTGTACAAAAGCATATTATAAACGTTCTCATTTAAATGAACATTATCATTTACATACTGGT GCTAAACCCCATTTATGTAATCAACCTGGTTGTAAT GCACGTTTTACACGTGCTGATCAATTATCACGTCATAGACGTGCACATACT GGTGAACGTAATTTTCATT GTAATGTTTGTTTAAAACGTTTTAAACGTAGTGATCATTTAAAAGTACATTTAACTAGAAATGTATGTACAAAATTTAATTTATAAACT GTTTTTTTTTCATATATATTTCGAAAAAAAAGAA] consensus multiple alignement with clustalw CLUSTAL W (1.82) multiple sequence alignment consensus_10423#0 GAGCCAGATTCGGCACGAGGGAAATACACAATTCTGGATTGATATCTTTAAATGTTCTAT 60 consensus_10423#1 ------------------------------------------------TCGCGGCCAAAA 12 consensus_10423#2 ------------------------------------------------------------ consensus_10423#0 GTTGTGTA-GCATGAATACCGCTGGGTCGTTGAATCCCACAATTCCAAATCAAAATGATA 119 consensus_10423#1 ATTCGGCACGAGGGAATACCGCTGGGTCGTTGAATCCCACAATTCCAAATCAAAATGATA 72 consensus_10423#2 ------------------------------------------------------------ consensus_10423#0 TTCATACGAACTTAATGTATAGAAGAGATTTACTTGACTATATATTAAATTATATGAATA 179 consensus_10423#1 TTCATATGAACTTAATGTATAGAAGAGATTTACTTGACTATATATTAAATTATATGAATA 132 consensus_10423#2 ------------------------------------------------------------ consensus_10423#0 GTAACCGGATGGATGTTATATGCTCAAACTCATTTATAATGGATTCTTTGTTAAATTTCA 239 consensus_10423#1 GTAACCGGATGGATGTTATATGCTCAAACTCATTTATAATGGATTCTTTGTTAAATTTCA 192 consensus_10423#2 ------------------------------------------------------------ consensus_10423#0 ATTCACAATTAAGTCATAACACTGTATTACATAATAATCAGTTCTACTCAACATTGATCC 299 consensus_10423#1 ATTCACAATTAAGTCATAACACTGTATTACATAATAATCAGTTCTACTCAACATTGATCC 252 consensus_10423#2 ------------------------------------------------------------ consensus_10423#0 CTTATTTATTTCCTATGGATTTAAATCTTAATTCATTGCAACAACAACATCAAAATCATC 359 consensus_10423#1 CTTATTTATTTCCTATGGATTTAAATCTTAATTCATTGCAACAACAACATCAAAATCATC 312 consensus_10423#2 -----------------------------------------CAACAACATCAAAATCATC 19 ******************* consensus_10423#0 AGATACAAAATTGTACTAATGACTGGTTGGTGGGTAATGATCATATCAATAATAACGGTA 419 consensus_10423#1 AGATACAAAATTGTACTAATGACTGGTTGGTGGGTAATGATCATATCAATAATAACGGTA 372 consensus_10423#2 AGATTCTAAATTGTACTAATGACCGGTTGGAGGGTAATGATCATATCAATAATAACGGTA 79 **** * **************** ****** ***************************** consensus_10423#0 ATAATACTTCGGATCCAACATTAATGTACCTTGCAGTAGCTACCCAATGTATTCTACGCT 479 consensus_10423#1 ATAATACTTCGGATCCAACATTAATGTACCTTGCAGTAGCTACCCAATGTATTCTACGCT 432 consensus_10423#2 ATAATACTTCGGATCCAACATTAATGTACCTTGCAGTAGCTACCCAATGTATTCTACGCT 139 ************************************************************ consensus_10423#0 ATTTCTTAACAACACATAATTATCAACAAATTTTATATCTCAATTCATTTCTTCATTCCA 539 consensus_10423#1 ATTTCTTAACAACTCATAATTATCAACAAATTTTATATCTCAATTCATTTCTTCATTCCA 492 consensus_10423#2 ATTTCTTAACAACACATAATTATCAACAAATTTTATATCTCAATTCATTTCTTCATTCCA 199 ************* ********************************************** consensus_10423#0 ATTATTCATCAACATCAGCTACATATAATAATACAAGTAGTCAGAATGACGATATGTTCT 599 consensus_10423#1 ATTATTCATCAACATCAGCTACATATAATAATACAAGTAGTCAGAATGACGATATGTTCT 552 consensus_10423#2 ATTATTCATCAACATCAGCTACATATAATAATACAAGTAGTCAGAATGACGATATGTTCT 259 ************************************************************ consensus_10423#0 TTGAATCACCTAAGAATACATTAGAATCTAATTCCAGATTATTAATTCATCAATACTTAG 659 consensus_10423#1 TTGAATCACCTAAGAATACTTTAGAATCTAATTCCAGATTATTAATTCATCAATACTTAG 612 consensus_10423#2 TTGAATCACCTAAGAATACATTAGAATCTAATTCCAGATTATTAATTCATCAATACTTAG 319 ******************* **************************************** consensus_10423#0 AAATAGATCATTGTAATTCAATGAAAATAAATGAAAATTCATCAATTACACCACGTATAA 719 consensus_10423#1 AAATAGATCATTGTAATTCAATGAANATAAATGAGNATTCATCAATTACACCACGTATAA 672 consensus_10423#2 AAATAGATCATTGTAATTCAATGAAAATAAATGAAAATTCATCAATTACACCACGTATAA 379 ************************* ******** ************************ consensus_10423#0 AACGTTATAAATGTACATATCCTAATTGTACAAA-GCATATTATAAACGTTCTCATTTAA 778 consensus_10423#1 AACGTTATAAATGTACATATCCTAATTGTACAAAAGCATATTATAAACGTTCTCATTTAA 732 consensus_10423#2 AACGTTATAAATGTACATATCCTAATTGTACAAAAGCATATTATAAACGTTCTCATTTAA 439 ********************************** ************************* consensus_10423#0 ATGA-CATTATCA-TTACATACTGGTG-CTAANCCACATT-ATGT-ATCAACCTGGNTGT 833 consensus_10423#1 ATGAACATTATCNATTACATACTGGNT-GCTAACCACATTTATGNTATCAACCTGGNTGT 791 consensus_10423#2 ATGAACATTATCATTTACATACTGGTGGCTAAACCACATTTATGTAATCAACCTGGTTGT 499 **** ******* *********** * ******* *** ********** *** consensus_10423#0 A-TG-CACGTTT-A-ACGTGCTGATCA--TATC-CGGNAT-GACGTGC-C-TACTGGG-G 882 consensus_10423#1 AATG-CACGTTT-ACACGTGCTGATCAA-TATCACGTCATAGACGTGC-CATACTGGN-G 846 consensus_10423#2 AATGGCACGTTTTACACGTGCTGATCAATTATCACGTCATAGACGTGCACATACTAGGTG 559 * ** ******* * ************ **** ** ** ******* * **** * * consensus_10423#0 A-CGTA--TTTCA--TGAATGG--TGGTTAACG---TTTAAACGAAG-GACCTTT--AA- 928 consensus_10423#1 AACGTA--TTTTCATTGAATGGGTTGTTAAACG---TTTAAACGTAT-GATCATT--AAA 898 consensus_10423#2 AACGTAATTNTCATTGGTATGGTTTGTTTAAAACGTTTTAAACGTAGTGATCATTTAAAA 619 * **** * * * **** ** * ** ******** * ** * ** ** consensus_10423#0 GT-CATT-AA-TAAAA---TGTGG--CAAATTATTTTTAACGTTTTCT--ATTTCCAA-- 976 consensus_10423#1 GT-CATT-AACTAAAA---TGTTGTACAAATTTTTATTACTGTTTTTTTCATATTCGAAA 953 consensus_10423#2 GTACATTTAACTAGAAATGTATGTACAAAATTAATTTATAAACTGGTTTTTTTTTCTATA 679 ** **** ** ** ** * * ***** * * * * * * * * consensus_10423#0 ----------------- consensus_10423#1 ----------------- consensus_10423#2 TATTTCGAAAAAAAGAA 696 |
Copyright Thu Nov 6 12:32:27 CET 2003 Hubert Wassner (hubert.wassner@noos.fr) | ||||