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Schistosoma mansoni
cluster # 10433 cluster # 10433       Sequences # 16       consensus # 1


see consensus multiple alignment with clustalw

Direct access to contigs :
consensus_10433#0 length = 1362 sequences # 16  

consensusID : consensus_10433#0
NCBI blastX ! send the sequence to the NCBI site !
NCBI blastN ! send the sequence to the NCBI site !
Sequences nbr = 16
consensus length = 1362
fasta sequence
                              [GCGGAAAAAAACTTGCTGATCGAAATTTGTTAAGAAGTGCTCTTCGTGGATTCTGCACGGCTTAAGTGTCATGAATCCCTCTCCTGCTTTTTCTGCAGCTAACGGCACTGGGTCTAACCTTCAGACTGGAAATACAGTCTCAGCTACTTGGATTAACAAATTGAAAATCGTTGGGCGAGGACAAAATTGGGCAGTTGCACCATGCGAACCATTTTACCTAATGGGTACGGAACCTCCTGCTCCAGATGCTGCTCTCACAGGTGCCAAGAACTTAATCGAACATTATGGTTTGGAGAATGCTTATCAAAAATTTTGTGGTAAACGCCTTAGAGAAGAGTTAAATGCTTTCTTACCTCATTTATCTGGAAACATTGACGTTCCAGCCTCAGTTGATGAAAGTGGGTTGATGAGTTTAATTGAAAGACCTCCAATTCGAGGTAAGGAGTTAAGACCATTTGCACCCAGTCAGTTGGACCATGCCTTTCGGTTACATCCTGGACCTTTACCTCAAGAGTATGCTTCCCTTTTTGCAGCAGCCCCATCCAAGCATATTCATCGTAGTGTACAAGACCAACAGCAACTTATGGGAAGTAATGGTACAGGTACTCGTGTACCGGCTACAGCTGTGCCTGGCCTGTCTAGTTCAGGATCTTTTCATCGTAGACGCCGTCGACACGAAGTCCATCGAGGAGCACTTGCATCTGGAAGTGACAGTAGTTCGTCTATAGGGGTACCAGGTGTTGGAGGAGTAGGAAGTGGAAATGTTAGTGCCAGTCCAGCATCATTTTTCACTGGAGCACCGACCGCCTATCCTCAATTAGGAGCAGTACATACAACGGCATCGTTATCCTCAAAATCTATGGTTTCACAGTCTCATACACTTTCTTCATCCTTAAGTATAACAACTTCTGCACCATGTACCAATGTAACCATGTCAAATCAATCATCTAATGCCTTAGATAACAATCCTGTTACCCAAGTGGTAAACCATAGTAAGTTAGTAGATCATCCACCTGGTCTTATTCCTGTATCAGCTCCTCATTCTCATCTATTAGGATCTTCTATTTCAACACCGTCATCATCTTCAGAGCCTCCACCTCCTCCATTATTAGCTCCCATACATCATCATTCAAATCAAAAATTACCACATTCAATTCAAAATACATCATCCACTTTAAATCCTTTATACAATAGTAATACAATTGATGTTAGTTTAACACCAAATAAATCTGTTCCACCTGCTCCACCGGTACTTCATTCTATTCATCCACCAAGTATAAATCCTATCAATTCATCTGTTCCTTCACAACCCCATTGTCATCAGTTTCACCACTATCGTCATCAGCAACAACAACAGTTATC]

[+] EMBL CD159077             [GCGGAAAAAAACTTGCTGATCGAAATTTGTTAAGAAGTGCTCTTCGTGGATTCTGCACGGCTTAAGTGTCATGAATCCCTCTCCTGCTTTTTCTGCAGCTAACGGCACTGGGTCTAACCTTCAGACTGGAAATACAGTCTCAGCTACTTGGATTAGCAAATTGAAAATCGTTGGGCGGGGACAAAATTGGGCAGTTGCACCATGCGAACCATTTTACCTAATGGGTACGGAACCTCCTGCTCCAGATGCTGCTCTCACAGGTGCCAAGAACTTAATCGAACATTATGGTTTGGAGAATGCTTATCAAAAATTTTGTGGTAAACGCCTTAGAGAAGAGTTAAATGCTTTCTTACCTCATTTATCTGGAAACATTGACGTTCCAGCCTCAGTTGATGAAAGTGGGTTGATGAGTTTAATTGAAAGACCTCCAATTCGAGGTAAGGAGTTAAGACCATTTGCACCCAGTCAGTTGGACCATGCCTTTCGGTTACATCCTGGACCTTTACCTCAAGAGTATGCTTCCCTTTTTGCAG                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                             ]
[+] EMBL CD153474             [  GGAAAAAAACTTGCTGATCGAAATTTGTTAAGAAGTGCTCTTCGTGGATTCTGCACGGCTTAAGTGTCATGAATCCCTCTCCTGCTTTTTCTGCAGCTAACGGCACTGGGTCTAACCTTCAGACTGGAAATACAGTCTCAGCTACTTGGATTAACAAATTGAAAATCGTTGGGCGAGGACAAAATTGGGCAGTTGCACCATGCGAACCATTTTACCTAATGGGTACGGAACCTCCTGCTCCAGATGCTGCTCTCACAGGTGCCAAGAACTTAATCGAACATTATGGTTTGGAGAATGCTTATCAAAAATTTTGTGGTAAACGCCTTAGAGAAGAGTTAAATGCTTTCTTACCTCATTTATCTGGAAACATTGACGTTCCAGCCTCAGTCGATGAAAGTGGGTTGATGAGTTTAATTGAAAGACCTCCAATTCGAGGTAAGGAGTTAAGACCATTTGCACCCAGTCAGTTGGACCATGCCTTTCGGTTACATCC                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                   ]
[-] EMBL CD153246             [   GAAAAAAACTTGCTGATCGAAATNTGNTAAGAAGTGCTCTTCGTGGATTCTGCACGGCTTAAGTGTCATGAATCCCTCTCCTGCTCTGTCTGCAGCTAACGGCACTGGGTCTAACCTTCAGACTGGAAATACAGTCTCAGCTACTTGGATTAACAAATTGAAAATCGTTGGGCGAGGACAAAATTGGGCAGTTGCACCATGCGAACCATTTTACCTAATGGGTACGGAACCTCCTGCTCCAGATGCTGCTCTCACAGGTGCCAAGAACTTAATCGAACATTATGGTTTGGAGAATGCTTATCAAAAATTTTGTGGTAAACGCCTTAGAGAAGAGTTAAATGCTTTCTTACCTCATTTATCTGGAAACATTGACGTTCCAGCCTCAGTTGATGAAAGTGGGTTGATGAGTTTAATTGAAAGACCTCCAATTCGAGGTAAGGAGTTAAGACCATTTGCACCCAGTCAGTTGGACCATGCCTTTCGGTTACATCCTGGACCTTTACCTCAAGAGTATGCTTCCCTTTTTGCAGCAGCCCCATCCAAGCATATTCATCGTAGT                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                ]
[-] EMBL CD153247             [   GAAAAAAACTTGCTGATCGAAATNTGTTAAGAAGTGCTCTTCGTGGATTCTGCACGGCTTAAGTGTCATGAATCCCTCTCCTGCTCTTTCTGCAGCTAACGGCACTGGGTCTAACCTTCAGACTGGAAATACAGTCTCAGCTACTTGGATTAACAAATTGAAAATCGTTGGGCGAGGACAAAATTGGGCAGTTGCACCATGCGAACCATTTTACCTAATGGGTACGGAACCTCCTGCTCCAGATGCTGCTCTCACAGGTGCCAAGAACTTAATCGAACATTATGGTTTGGAGAATGCTTATCAAAAATTTTGTGGTAAACGCCTTAGAGAAGAGTTAAATGCTTTCTTACCTCATTTATCTGGAAACATTGACGTTCCAGCCTCAGTTGATGAAAGTGGGTTGATGAGTTTAATTGAAAGACCTCCAATTCGAGGTAAGGAGTTAAGACCATTTGCACCCAGTCAGTTGGACCATGCCTTTCGGTTACATCCTGGACCTTTACCTCAAGAGTATGCTTCCCTTTTTGCAGCAGCCCCATCCAAGCATATTCATCGTAGT                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                ]
[+] EMBL CD184164             [ gnGAAAAAAACTTGCTGATCGAAATTTGTTAAGAAGTGCTCTTCGTGGATTCTGCACGGCTTAAGTGTCATGAATCCCTCTCCTGCTTTTTCTGCAGCTAACGGCACTGGGTCTAACCTTCAGACTGGAAATACAGTCTCAGCTACTTGGATTAACAAATTGAAAATCGTTGGGCGAGGACAAAATTGGGCAGTTGCACCATGCGAACCATTTTACCTAATGGGTACGGAACCTCCTGCTCCAGATGCTGCTCTCACAGGTGCCAAGAACTTAATCGAACATTATGGTTTGGAGAATGCTTATCAAAAATTTTGTGGTAAACGCCTTAGAGAAGAGTTAAATGCTTTCTTACCTCATTTATCTGGAAACATTGACGTTCCAGCCTCAGTTGATGAAAGTGGGTTGATGAGTTTAATTGAAAGACCTCCAATTCGAGGTAAGGAGTTAAGACCATTTGCACCCAGTCAGTTGGACCATGCCTTTCGGTTACATCCTGGACCTTTACCTCAAGAGTATGCTTCC                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                       ]
[-] EMBL CD097513             [   GAAAAAAACTTGCTGATCGAAATTTGTTAAGAAGTGCTCTTCGTGGATTCTGCACGGCTTAAGTGTCATGAATCCCTCTCCTGCTTTTTCTGCAGCTAACGGCACTGGGTCTAACCTTCAGACTGGAAATACAGTCTCAGCTACTTGGATTAACAAATTGAAAATCGTTGGGCGAGGACAAAATTGGGCAGTTGCACCATGCGAACCATTTTACCTAATGGGTACGGAACCTCCTGCTCCAGATGCTGCTC                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                    ]
[+] EMBL CD149751             [        AAACTTGCTGATCGAGATTTGTTAAGAAGTGCTCTTCGTGGATTCTGCACGGCTTAAGTGTCATGAATCCCTCTCCTGCTTTTTCTGCAGCTAACGGCACTGGGTCTAACCTTCACACTGGAAATACAGTCTCATCTACTTGGATTAACAAATTGAAAATCGTTGGGCGAGGACAAAATTGGGCAGTTGCACCATGCGAACCATTTTACCTAATGGGTACGGAACCTCCTGCTCCAGATGCTGCTCTCACAGGTGCCAAGAACTTAATCGAACATTATGGTTTGG                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                             ]
[-] EMBL CD097511             [                                                       CACGGCTTAAGTGTCATGAATCCCTCTCCTGCTTTTTCTGCAGCTAACGGCACTGGGTCTAACCTTCAGACTGGAAATACAGTCTCAGCTACTTGGATTAACAAATTGAAAATCGTTGGGCGAGGACAAAATTGGGCAGTTGCACCATGCGAACCATTTTACCTAATGGGTACGGAACCTCCTGCTCCAGATGCTGCTCTCACAGGTGCCAAGAACTTAATCGAACATTATGGTTTGGAGAATGCTTATCAAAAATTTTGTGGTAAACGCCTTAGAGAAGAGTTAAATGCTTTCTTACCTCATTTATCTGGAAACATTGACGTTCCAGCCTCAGTTGATGAAAGTGGGTTGATGAGTTTAATTGAAAGACCTCCAATTCGAGGTAAGGAGTTAAGACCATTTGCACCCAGTCAGTTGGACTATGCCTTTCGGTTACATCCTGGACCTTTACCTCAAGAGTATGCTTCCCTTTTTGCAG                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                             ]
[+] EMBL CD116999             [                                                                                                                                                                                                         ATGCGAACCATTTTACCTAATGGGTACGGAACCTCCTGCTCCAGATGCTGCTCTCACAGGTGCCAAGAACTTAATCGAACATTATGGTTTGGAGAATGCTTATCAAAAATTTTGTGGTAAACGCCTTAGAGAAGAGTTAAATGCTTTCTTACCTCATTTATCTGGAAACATTGACGTTCCAGCCTCAGTTGATGAAAGTGGGTTGATGAGTTTAATTGAAAGACCTCCAATTCGAGGTAAGGAGTTAAGACCATTTGCACCCAGTCAGTTGGACCATGCCTTTCGGTTACATCCTGGACCTTTACCTCAAGAGTATGCTTCCCTTTTTGCAGCAGCCCCATCCAAGCATATTCATCGTAGTGTACAAGACCAACAGCAACTTATGGGAAGTAATGGTACAGGTACTCGTGTACCGGCTACAGCTGTGCCTGGCCTGTCTAGTTCAGGATCTTTTCATCGTAGACGCCGTCGACACGAAGTCCATCGAGGAGCACTTGCATCTGGAAGTGACAGTAGTTCGTCTATAGGGGTACCAGGTGTTGGAGGAGTAGGAAGTGGAAATGTTAGTGCCAGTCCAGCATCATTTTTCACTGGAGCACCG                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                ]
[-] EMBL CD124462             [                                                                                                                                                                                                                                                                        CAAGAACTTAATCGAACATTATGGTTTGGAGAATGCTTATCAAAAATTTTGTGGTAAACGCCTTAGAGAAGAGTTAAATGCTTTCTTACCTCATTTATCTGGAAACATTGACGTTCCAGCCTCAGTTGATGAAAGTGGGTTGATGAGTTTAATTGAAAGACCTCCAATTCGAGGTAAGGAGTTAAGACCATTTGCACCCAGTCAGTTGGACCATGCCTTTCGGTTACATCCTGGACCTTTACCTCAAGAGTATGCTTCCCTTTTTGCAGCAGCCCCATCCAAGCATATTCATCGTAGTGTACAAGACCAACAGCAACTTATGGGAAGTAATGGTACAGGTACTCGTGTACCGGCTACAGCTGTGCCTGGCCTGTCTAGTTCAGGATCTTTTCATCGTAGACGCCGTCGACACGAAGTCCATCGAGGAGCACTTGCATCTGGAAGTGACAGTAGTTCGTCTATAGGGGTAC                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                    ]
[-] EMBL CD117371             [                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                       TATCTGGAAACATGNACGTTCCAGCCTCAGTTGATGAAAGTGGGTTGATGAGTTTAATTGAAAGACCTCCAATTCGAGGTAAGGAGTTAAGACCATTTGCACCCAGTCAGTTGGACCATGCCTTTCGGTTACATCCTGGACCTTTACCTCAAGAGTATGCTTCCCTTTTTGCAGCAGCCCCATCCAAGCATATTCATCGTAGTGTACAAGACCAACAGCAACTTTTGGGAAGTAATGGTACAGGTACTCGTGTACCGGCTACAGCTGTGCCTGGCCTGTCTAGTTCAGGATCTTTTCATCGTAGACGCCGTCGACACGAAGTCCATCGAGGAGCACTTGCATCTGGAAGTGACAGTAGTTCGTCTATAGGGGTACCAGGTGTTGGAGGAGTAGGAAGTGGAAATGTTAGTGCCAGTCCAGCATCATTTTTCACTGGAGCACCGACCGCCTATCCTCAATTAGGAGCAGTACATACAACGGCATCGTTATCCTCAAAATCTATGGTTTCACAGTCTCATACACTTTCTTCATCCTTAAGTATAACAACTTCT                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                    ]
[+] EMBL CD124081             [                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                             CCAGTCAGTTGGACCATGCCTTTCGGTTACATCCTGGACCTTTACCTCAAGAGTATGCTTCCCTTTTTGCAGCGGCCCCATCCAAGCATATTCATCGTAGTGTACAAGACCAACAGCAACTTATGGGAAGTAATGGTACAGGTACTCGTGTACCGGCTACAGCTGTGCCTGGCCTGTCTAGTTCAGGATCTTTTCATCGTAGACGCCGTCGACACGAAGTCCATCGAGGAGCACTTGCATCTGGAAGTGACAGTAGTTCGTCTATAGGGGTACCAGGTGTTGGAGGAGTAGGAAGTGGAAATGTTAGTGCCAGTCCAGCATCATTTTTCACTGGAGCACCGACCGCCTATCCTCAATTAGGAGCAGTACATACAACGGCATCGTTATCCTCAAAATCTA                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                      ]
[-] EMBL CD117732             [                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                     GGTTACATCCTGGACCTTTACCTCAAGAGTATGCTTCCCTTTTTGCAGCAGCCCCATCCAAGCATATTCATCGTAGTGTACAAGACCAACAGCAACTTTTGGGAAGTAATGGTACAGGTACTCGTGTACCGGCTACAGCTGTGCCTGGCCTGTCTAGTTCAGGATCTTTTCATCGTAGACGCCGTCGACACGAAGTCCATCGAGGAGCACTTGCATCTGGAAGTGACAGTAGTTCGTCTATAGGGGTACCAGGTGTTGGAGGAGTAGGAAGTGGAAATGTTAGTGCCAGTCCAGCATCATTTTTCACTGGAGCACCGACCGCCTATCCTCAATTAGGAGCAGTACATACAACGGCATCGTTATCCTCAAAATCTATGGTTTCACAGTCTCATACACTTTCTTCATCCTTAAGTATAACAACTTCT                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                    ]
[-] EMBL CD115599             [                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                             TTTTGCAGCAGCCCCATCCAAGCATATTCATGGTAGTGTACAAGACCAACAGCAACTTATGGGAAGTAATGGTACAGGTACTCGTGTACCGGCTACAGCTGTACCTGGCCTGTCTAGTTCAGGATCTTTTCATCGTAGGCGCCGTCGACTCGAAGTCCATCGAGGAGCACTTGCATCTGGAAGTGACAGTAGCTCCTCCACAGGGGTACCAGGTGTTGGAGGAGTAAGAAGTGGAAATGTTAGTGCCAGTCCAGCATCATTTTTCACTGGAGCACCGACCGCCTATCCTCAATTAGGAGC                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                         ]
[-] EMBL CD155687             [                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                  AACGGCATCGTTATCCTCAAAATCTATGGTTTCACAGTCTCATACACTTTCTTCATCCTTAAGTATAACAACTTCTGCACCATGTACCAATGTAACCATGTCAAATCAATCATCTAATGCCTTAGATAACAATCCTGTTACCCAAGTGGTAAACCATAGTAAGTTAGTAGATCATCCACCTGGTCTTATTCCTGTATCAGCTCCTCATTCTCATCTATTAGGATCTTCTATTTCAACACCGTCATCATCTTCAGAGC                                                                                                                                                                                                                                                                               ]
[-] EMBL CD096664             [                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                CCTCAAAATCTATGGTGTCACAGTCTCAAACACTTTCTTCATCCTTAAGTATAACAACTTCTGCACCATGTACCAATGTAACCATGTCAAATCAATCATCTAATGCCTTAGATAACAATCCTGTTACCCAAGTGGTAAACCATAGTAAGTTAGTAGATCATCCACCTGGTCTTATTCCTGTATCAGCTCCTCATTCTCATCTATTAGGATCTTCTATTTCAACATCGTCATCATCTTCAGAGCCTCCACCTCCTCCATTATTAGCTCCCATACATCATCATTCAAATCAAAAATTACCACATTCAATTCAAAATACATCATCCACTTTAAATCCTTTATACAATAGTAATACAATTGATGTTAGTTTAACACCAAATAAATCTGTTCCACCTGCTCCACCGGTACTTCATTCTATTCATCCACCAAGTATAAATCCTATCAATTCATCTGTTCCTTCACAACCCCATTGTCATCAGTTTCACCACTATCGTCATCAGCAACAACAACAGTTATC]


>consensus_10433#0 GCGGAAAAAAACTTGCTGATCGAAATTTGTTAAGAAGTGCTCTTCGTGGATTCTGCACGG CTTAAGTGTCATGAATCCCTCTCCTGCTTTTTCTGCAGCTAACGGCACTGGGTCTAACCT TCAGACTGGAAATACAGTCTCAGCTACTTGGATTAACAAATTGAAAATCGTTGGGCGAGG ACAAAATTGGGCAGTTGCACCATGCGAACCATTTTACCTAATGGGTACGGAACCTCCTGC TCCAGATGCTGCTCTCACAGGTGCCAAGAACTTAATCGAACATTATGGTTTGGAGAATGC TTATCAAAAATTTTGTGGTAAACGCCTTAGAGAAGAGTTAAATGCTTTCTTACCTCATTT ATCTGGAAACATTGACGTTCCAGCCTCAGTTGATGAAAGTGGGTTGATGAGTTTAATTGA AAGACCTCCAATTCGAGGTAAGGAGTTAAGACCATTTGCACCCAGTCAGTTGGACCATGC CTTTCGGTTACATCCTGGACCTTTACCTCAAGAGTATGCTTCCCTTTTTGCAGCAGCCCC ATCCAAGCATATTCATCGTAGTGTACAAGACCAACAGCAACTTATGGGAAGTAATGGTAC AGGTACTCGTGTACCGGCTACAGCTGTGCCTGGCCTGTCTAGTTCAGGATCTTTTCATCG TAGACGCCGTCGACACGAAGTCCATCGAGGAGCACTTGCATCTGGAAGTGACAGTAGTTC GTCTATAGGGGTACCAGGTGTTGGAGGAGTAGGAAGTGGAAATGTTAGTGCCAGTCCAGC ATCATTTTTCACTGGAGCACCGACCGCCTATCCTCAATTAGGAGCAGTACATACAACGGC ATCGTTATCCTCAAAATCTATGGTTTCACAGTCTCATACACTTTCTTCATCCTTAAGTAT AACAACTTCTGCACCATGTACCAATGTAACCATGTCAAATCAATCATCTAATGCCTTAGA TAACAATCCTGTTACCCAAGTGGTAAACCATAGTAAGTTAGTAGATCATCCACCTGGTCT TATTCCTGTATCAGCTCCTCATTCTCATCTATTAGGATCTTCTATTTCAACACCGTCATC ATCTTCAGAGCCTCCACCTCCTCCATTATTAGCTCCCATACATCATCATTCAAATCAAAA ATTACCACATTCAATTCAAAATACATCATCCACTTTAAATCCTTTATACAATAGTAATAC AATTGATGTTAGTTTAACACCAAATAAATCTGTTCCACCTGCTCCACCGGTACTTCATTC TATTCATCCACCAAGTATAAATCCTATCAATTCATCTGTTCCTTCACAACCCCATTGTCA TCAGTTTCACCACTATCGTCATCAGCAACAACAACAGTTATC



clustalw multiple alignements is not computed in this case


Copyright Thu Nov 6 12:32:27 CET 2003 Hubert Wassner    (hubert.wassner@noos.fr)