cluster # 1047

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Schistosoma mansoni
cluster # 1047 cluster # 1047 Sequences # 2 consensus # 1

see consensus multiple alignment with clustalw

Direct access to contigs :

consensus_1047#0 length = 795 sequences # 2

consensusID : consensus_1047#0
NCBI blastX ! send the sequence to the NCBI site !
NCBI blastN ! send the sequence to the NCBI site !
Sequences nbr = 2
consensus length = 795
fasta sequence

                              [GGACAGGCTTATCGAACTCAAAACCATTATGAATATTAAAACAGATTTAATCAACCGAGCTGTCAGCTTATTTGATCAACATATTAAAGCTAAGACACCAGTTGAAGCTGAGAAATTAATTCTACAATTTGGACCGAAAATTATGTCAAAAGTTGGTCAATGTTATCGTTTATATGCTGCTGCTGAAGATTTAAATGGTGCTATATGTAATGGTATTGTAAGTGTATTAAATGGTTTCTGGTTTTTATTTGGTTGGGTTACATTTATTGGTACATTAATTATGTTATTTAGTTTATTACTATTAATGCATAAAACACCAATAGATCAATCATCAACTGTTGAAAAATCTTATCATAGAAATATAAAACATAAAGATATACCTTCTATGGGAACAGAAACATCGACAAATCCTAGTGAATTAGAAGCACTTAATAATCGATAAAAGAACAAAAAAAGAAGGATACACAATCCATCCCCCTCCTCCTTTTCCTTTGTATAACAATAATAATAATAATAATCATAATGTGCATACAAATTTATACTATTCATTTATGTATAATAATACTTCCTTGTCTGTATGAGTATGCGTGCGCGTGCGTGCGTGCGTGTGTGTGAATGATGATCATCAATTNTTTTTTTAATTNTTACCATATAATCTATAAACCATTCTGGCATGATTCCCTCCCCCCTATTACTCTAATTGAATCAAAGCTTATTTGTTTATATTATTATTATTATCATGTTAACAAGTCATGTATGTCTCTCTAGGAATTTTTTTTCTATACAGAAAAATAT]

[+] EMBL CD082174             [GGACAGGCTTATCGAACTCAAAACCATTATGAATATTAAAACAGATTTAATCAACCGAGCTGTCAGCTTATTTGATCAACATATTAAAGCTAAGACACCAGTTGAAGCTGAGAAATTAATTCTACAATTTGGACCGAAAATTATGTCAAAAGTTGGTCAATGTTATCGTTTATATGCTGCTGCTGAAGATTTAAATGGTGCTATATGTAATGGTATTGTAAGTGTATTAAATGGTTTCTGGTTTTTATTTGGTTGGGTTACATTTATTGGTACATTAATTATGTTATTTAGTTTATTACTATTAATGCATAAAACACCAATAGATCAATCATCAACTGTTGAAAAATCTTATCATAGAAATATAAAACATAAAGATATACCTTCTATGGGAACAGAAACATCGACAAATCCTAGTGAATTAGAAGCACTTAATAATCGATAAAAGAACAAAAAAAGAAGGATACACAATCCATCCCCCTCCTCCTTTTCCTTTGTATAACAATAATAATAATAATAATCATAATGTGCATACAAATTTATACTATTCATTTATGTATAATAATACTTCCTTGTCTGTATGAGTATGCGTGCGCGTGCGTGCGTGCGTGTGTGTGAATGATGATCATCAATTNTTTTTTTAATTNTTA                                                                                                                                                    ]
[-] EMBL CD075790             [                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                       TCCTTTGTATACCAATAATAATAATAATAATCATAATGTGCATACAAATTTATACTATTCATTTATGTATAATAATACTTCCTTGTCTGTATGAGTATGCGTGCGCGTGCGTGCGTGCGTGTGTGTGAATNATGATCATCAATTTTTTTTTTAATTTTTACCATATAATCTATAAACCATTCTGGCATGATTCCCTCCCCCCTATTACTCTAATTGAATCAAAGCTTATTTGTTTATATTATTATTATTATCATGTTAACAAGTCATGTATGTCTCTCTAGGAATTTTTTTTCTATACAGAAAAATAT]




>consensus_1047#0
GGACAGGCTTATCGAACTCAAAACCATTATGAATATTAAAACAGATTTAATCAACCGAGC
TGTCAGCTTATTTGATCAACATATTAAAGCTAAGACACCAGTTGAAGCTGAGAAATTAAT
TCTACAATTTGGACCGAAAATTATGTCAAAAGTTGGTCAATGTTATCGTTTATATGCTGC
TGCTGAAGATTTAAATGGTGCTATATGTAATGGTATTGTAAGTGTATTAAATGGTTTCTG
GTTTTTATTTGGTTGGGTTACATTTATTGGTACATTAATTATGTTATTTAGTTTATTACT
ATTAATGCATAAAACACCAATAGATCAATCATCAACTGTTGAAAAATCTTATCATAGAAA
TATAAAACATAAAGATATACCTTCTATGGGAACAGAAACATCGACAAATCCTAGTGAATT
AGAAGCACTTAATAATCGATAAAAGAACAAAAAAAGAAGGATACACAATCCATCCCCCTC
CTCCTTTTCCTTTGTATAACAATAATAATAATAATAATCATAATGTGCATACAAATTTAT
ACTATTCATTTATGTATAATAATACTTCCTTGTCTGTATGAGTATGCGTGCGCGTGCGTG
CGTGCGTGTGTGTGAATGATGATCATCAATTNTTTTTTTAATTNTTACCATATAATCTAT
AAACCATTCTGGCATGATTCCCTCCCCCCTATTACTCTAATTGAATCAAAGCTTATTTGT
TTATATTATTATTATTATCATGTTAACAAGTCATGTATGTCTCTCTAGGAATTTTTTTTC
TATACAGAAAAATAT

clustalw multiple alignements is not computed in this case