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Schistosoma mansoni
cluster # 10560 cluster # 10560       Sequences # 18       consensus # 1


see consensus multiple alignment with clustalw

Direct access to contigs :
consensus_10560#0 length = 1600 sequences # 18  

consensusID : consensus_10560#0
NCBI blastX ! send the sequence to the NCBI site !
NCBI blastN ! send the sequence to the NCBI site !
Sequences nbr = 18
consensus length = 1600
fasta sequence
                              [TACAAGACATCCAAATGTATAGATTGTGGATTTCAGGCTCATAAACGATGTGCTGATCTTGTACCGTGTGACTGTGTACCAGATATTAAACAAATGAAACGAGTGTTCGGTGTGGACTTGACTAATTTGGCGAG-AGCTGAAAACAAGACTGTGCCAACTCTGCTAATTAAATGCATTCAAGAGGTAGAACGTCGAGATGGTTTGTGTTGTGAAGGCCTGTATCGTATTCCTGGAAATTATGATCTTGTGGAAGAACTACGTACTGAATTCGATAAAGATCCGGAATTGGCAAATGTATCTGAGTCACGTGTTCGAGATATCAATGTTTTGACAAGTTTGATTAAATCATTTCTGCGTCAATTGCCTGTCCCATTAATCACTTATGAGGCATATCCAGATTTACTGGATGTTGTTAGAGATGATCGACTTAATGAACAAGAGAAATTAGATATGTTAAGGAAAATATTTGCTCGCTTACCCGGTGCCCATTATGAAAGTTTACGTTATTTTATAAACCATATACACAGAGTGGCTGAAAAGCAAGATGTGAATATGATGACTACAGCTAATTTAGCTATTGTTCT-ATCACCTACTTTACTGAGTTCATCTTATACTGATCCTATAAGTTGTTTAGCTGGAACACTTTTTGAACATACCTTAATAGAATTACTTATAAAACATTGTACTTACTTGCTTCCATCAAACGGACGATGGTTAGCTAGTAGACCTACTGAATTAGCCGACAATGCAATCCATTCACCATCCCATCGTCATAGTCAAATCATTACCAATAATAATTTTACTCCACCAGCCACTACGGTATCACCACCCAGTATACCATCTTATAAGAAATGGAATTTTTTAAGAAGTCGATCATCCACAGATACCCGTACAGTGCCAACTTTATCACCTATCCCGTGAAATTGGATGGAAGTTTCATCGATCTCTTTCTTCGTCTGTCTGCAGATAATTATTGTGTCAGTATGAATAAATTATTGTGTAATGTTATATTTTTTACTACCTATCTTACCACTATATCGTTCTCAAATTGTTCTGTATCGACAAATATTTGTTAACACATTCCACCATTTTTTCCATATAACTTTTTGATTATGTTCATTTTTTGCATTTCACAAAACGTCTGGTTCTTAACAAACTTGTACACATATATTTGTTCTTTTCTCGAATTCCATAATATTTGTGTGTGCTTGGTTTAAAGAAATCATTCATAAGTGATACTTTTATTGTCTTCCAGTTATTCTTTCTTTTATCTACTTCTTTAAACCATCTAAATGCGGACAATATATTTTCGAGTTTATATGGCCACTTAAACGCATATTTATATAGATATAGCGTGTTTCTAACAGCTGATTGTGTATTTCTATCCTATCCTATTGTTCAACTCACTATCTTTGAATATATGCTTGTTGTTCAACTCTTATTATATGGGGATTATGCTGAGACATCTTTAAAAATTATTTAATGATAAACTTATATGATGGTACCATTTTTATTTGATTTTTATAAATAGGACTGATAATGCAAGACAAGAAAAAGAAATAACACTTTGTACATATACATATACCTGTATTAATAAACT]

[+] EMBL CD059238             [TACAAGACATCCAAATGTATAGATTGTGGATTTCAGGCTCATAAACGGTGTGCTGATCTTGTACCGTGTGACTGTGTACCAGATATTAAACAAATGAAACGAGTGTTCGGTGTGGACTTGACTAATTTGGCGAGTAGCTGTAAACAAGACTGTGCCAACTCTGCTAATGAAATGCATTCAAGAGGTAAAACGTCGAGATGGTTTGTGTTGTGAAGGCCTGTATCGTATTCCTGG                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                        ]
[+] EMBL CD059277             [              ATGTATAGATTGTGGATTTCAGGCTCATAAACGATGTGCTGATCTTGTACCGTGTGACTGTGTACCAGATATTAAACAAATGAAACGAGTGTTCGGTGTGGACTTGACTAATTTGGCGAG AGCTGAAAACAAGACTGTGCCAACTCTGCTAATTAAATGCATTCAAGAGGTACAACGTCGAGATGGTTTGTGTTGTGAAGGCCTGTATCGTATTCCTGG                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                        ]
[-] EMBL CD059284             [               TGTATAGATTGTGGATTTCAGGCTCATAAACGATGTGCTGATCTTGTACCGTGTGACTGTGTACCAGATATTAAACAAATGAAACGAGTGTTCGGTGTGGACTTGACTAATTTGGCGAG AGCTGAAAACAAGACTGTGCCAACTCTGCTAATTAAATGCATTCAAGAGGTAGAACGTCGAGATGGTTTGTGTTGTGAAGGCCTGTATCGTATTCCTGGA                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                       ]
[+] EMBL CD059176             [                GTATAGATTGTGGATTTCAGGCTCATAAACGATGTGCTGATCTTGTACCGTGTGACTGTGTACCAGATATTAAACAAATGAAACGAGTGTTCGGTGTGGACTTGACTAATTTGGCGAG AGCTGAAAACAAGACTGTGCCAACTCTGCTAATTAAATGCATTCAAGAGGTAGAACGTCGAGATGGTTTGTGTTGTGAAGGCCTGTATCGTATTCCTGG                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                        ]
[+] EMBL CD059202             [                GTATAGATTGTGGATCTCAGGCTCATAAACGACGTGCTGATCTTGTACCGTGTGACTGTGTACCAGATATTAAACAAATGAAACGAGTGTTCGGTGTGGACTTGACTAATTTGGCGAG AGCTGAAAACAAGACTGTGCCAACTCTGCTAATTAAATGCATTCAAGAGGTAGAACGTCGAGATGGTTTGTGTTGTGAAGGCCTGTATCGTATTCCTGG                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                        ]
[-] EMBL CD059278             [                 TATAGATTGTGGATTTCAGGCTCATAAACGGTGTGCTGATCTTGTACCGTGTGACTGTGTACCAGATATTAAACAAATGAAACGAGTGTTCGGTGTGGACTTGACTAATTTGGCGAG AGCTGAAAACAAGACTGTGCCAACTCTGCTAATTAAATGCATTCAAGAGGTAGAACGTCGAGATGGTTTGTGTTGTGAAGGCCTGTATCGTATTCCTGGA                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                       ]
[-] EMBL CD198593             [                              TTTCAGGCTCATAGACGATGTGCTGATCTTGTACCGTGTGACTGTGTACCAGATATTAAACAAATGAAACGAGTGTTCGGTGTGGACTTGACTAATTTGGCGAG AGCTGAAAACAAGACTGTGCCAACTCTGCTAATTAAATGCATTCAAGAGGTAGAACGTCGAGATGGTTTGTGTTGTGAAGGCCTGTATCGTATTCCTGGAAATTATGATCTTGTGGAAGAACTACGTACTGAATTCGATAAAGATCCGGAATTGGCAAATGTATCTGAGTCACGTGTTCGAGATATCAATGTTTTGACAAGTTTGATTAAATCATTTCTGCGTCAATTGCCTGTCCCATTAATCACTTATGAGGCATATCCAGATTTACTGGATGTTGTTAGAGATGATCGACTTAATGAACAAGAGAAATTAGATATGTTAAGGAAAAT                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                 ]
[-] EMBL CD127244             [                                                  TGCTGATCTTGTACCGTGTGACTGTGTACCAGATATTAAACAAATGAAACGAGTGTTCGGTGTGGACTTGACTAATTTGGCGAG AGCTGAAAACAAGACTGTGCCAACTCTGCTAATTAAATGCATTCAAGAGGTAGAACGTCGAGATGGTTTGTGTTGTGAAGGCCTGTATCGTATTCCTGGAAATTATGATCTTGTGGAAGAACTACGTACTGAATTCGATAAAGATCCGGAATTGGCAAATGTATCTGAGTCACGTGTTCGAGATATCAATGTTTTGACAAGTTTGATTAAATCATTTCTGCGTCAATTGCCTGTCCCATTAATCACTTATGAGGCATATCCAGATTTACTGGATGTTGTTAGAGATAATCGACTTAATGAACAAGAGAAATTAGATATGTTAAGGAAAATATTTGCTCGCTTACCCGGTGCCCATTATGAAAGTTTACGTTATTTTATAAACCATATACACAGAGTGGCTGAAAAGCAAGATGTGAATATGATGACTACAGCTAATTTAGATATTGTTCT ATCACCTACTatgtctcat                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                     ]
[+] EMBL CD165098             [                                                                                                                                       AGCTGAAAACAAGACTGTGCCAACTCTGCTAATTAAATGCATTCAAGAGGTAGAACGTCGAGATGGTTTGTGTTGTGAAGGCCTGTATCGTATTCCTGGAATTTATGATCTTGTGGAAGAACTACGTACTGAATTCGATAAAGATCCGGAATTGG                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                ]
[+] EMBL CD081231             [                                                                                                                                                                                                                                                                                                                            GATATCAATGTTTTGACAAGTTTGATTAAATCATTTCTGCGTCAATTGCCTGTCCCATTAATCACTTATGAGGCATATCCAGATTTACTGGATGTTGTTAGAGATGATCGACTTAATGAACAAGAGAAATTAGATATGTTAAGGAAAATATTTGCTCGCTTACCCGGTGCCCATTATGAAAGTTTACGTTATTTTATAAACCATATACACAGAGTGGCTGAAAAGCAAGATGTGAATATGATGACTACAGCTAATTTAGCTATTGTTCT ATCACCTACTTTACTGAGTTCATCTTATACTGATCCTATAAGTTGTTTAGCTGGAACACTTTTTGAACATACCTTAATAGAATTACTTATAAAACATTGTACTTACTTGCTTCCATCAAACGGACGATGGTTAGCTAGTAGACCTACTGAATTAGCCGACAATGCAATCCATTCACCATCCCATCGTCATAGTCAAATCATTACCAATAATAATTTTACTCCACCAGCCACTACGGTATCACCACCCAGTATACCATCTTATAAGAAATGGAATTTTTTAAGAAGTCGATCATCCACAGATACCCGTACAGTGCCAACTTTATCACCTATCCCGTGAAATTGGATGGAAGTTTCATCGATCTCTTTCTTCGTCTGTCTGCAGATAATTATTGTGTCAGTATGAATAAATTATTGTGTAATGTTATATTTTTTACTACCTATCTTACCACTATATCG                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                ]
[+] EMBL CD065225             [                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                    caggatccCCTGTCCCATTAATCACTTANGTGGCATATCCAGATTTACTGGATGTTGTTAGAGATGATCGACTTAATGAACAAGAGAAATTAGATATGTTAAGGAAAATATTTGCTCGCTTACCCGGTGCCCATTATGAAAGTTTACGTTATTTTATAAACCATATACACAGAGTGGCTGAAAAGCAAGATGTGAATATGATGACTACAGCTAATTTAGCTATTGTTCT ATCACCTACTTTACTGAGTTCATCTTATACTGATCCTATAAGTTGTTTAGCTGGAACACTTTTTGAACATACCTTAATAGAATTACTTATAAAACATTGTACTTACTTGCTTCCATCAAACGGACGATGGT                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                     ]
[+] EMBL CD170203             [                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                GATGTGAATATGATGACTACAGCTAATTTAGCTATTGTTCT ATCACCTACTTTACTGAGTTCATCTTATACTGATCCTATAAGTTGTTTAGCTGGAACACTTTTTGAACATACCTTAATAGAATTACTTATAAAACATTGTACTTACTTGCTTCCATCAAACGGACGATGGTTAGCTAGTAGAC                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                         ]
[+] EMBL CD136381             [                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                GATGTGAATATGATGACTACAGCTAATTTAGCTATTGTTCT ATCACCTACTTTACTGAGTTCATCTTATACTGATCCTATAAGTTGTTTAGCTGGAACACTTCTTGAACATACCTTAATAGAATTACTTATAAAACATTGTACTTACTTGCTTCCATCAAACGGACGATGGTTAGCTAGTAGAC                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                         ]
[-] EMBL CD193645             [                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                GATGTGAATATGATGACTACAGCTAATTTAGCTATTGTTCTCATCACCTACTTTACTGAGTTCATCTTATACTGATCCTATAAGTTGTTTAGCTGGAACACTTTTTGAACATACCTTAACAGAATTACTTATAAAACATTGTACTTACTTGCTTCCATCAAACGGACGATGGTTAGCTAGTAGGCCTACTGA                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                  ]
[-] EMBL CD193743             [                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                 ATGTGAATATGATGACTACAGCTAATTTAGCTATTGTTCT ATCACCTACTTTACTGAGTTCATCTTATACTGATCCTATAAGTTGTTTAGCGGGAACACTTTTTGAACATACCTTAATAGAATTACTTATAAAACATTGTACTTACTTGCTTCCATCAAACGGACGATGGTTAGCTAGTAGACCTACTGAATT                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                               ]
[+] EMBL CD097054             [                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                  GTATACCATCTTATAAGAAATGGAATTTTTTAAGAAGTCGATCATCCACAGATACCCGTACAGTGCCAACTTTATCACCTATCCCGTGAAATTGGATGGAAGTTTCATCGATCTCTTTCTTCGTCTGTCTGCAGATAATTATTGTGTCAGTATGAATAAATTATTGTGTAATGTTATATTTTTTACTACCTA                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                ]
[+] EMBL CD131033             [                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                  GTATACCATCTTATAAGAAATGGAATTTTTTAAGAAGTCGATCATCCACAGATACCCGTACAGTGCCAACTTTATCACCTATCCCGTGAAATTGGATGGAAGTTTCATCGATCTCTTTCTTCGTCTGTCTGCAGATAATTATTGTGTCAGTATGAATAAATTATTGTGTAATGTTATATTTTTTACTACCTATCTTACCACTATATCGTTCTCAAATTGTTCTGTATCGACAAATATTTGTTAACACATTCCACCATTTTTTCCATATAACTTTTTGATTATGTTCATTTTTTGCATTTCACAAAACGTCTGGTTCTTAACAAACTTGTACACATATATTTGTTCTTTTCTCGAATTCCATAATATTTGTGTGTGCTTGGTTTAAAGAAATCATTCATAAGTGATACTTTTATTGTCTTCCAGTTATTCTTTCTTTTATCTACTTCTTTAAA                                                                                                                                                                                                                                                                                                                            ]
[-] EMBL CD075062             [                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                               CANAACGTCTGGTTCTTAACAAACTTGTACACATATATTTGTTCTTTTCTCGAATTCCATAATATTTGTGTGTGCTTGGTTTAAAGAAATCATTCATAAGTGATACTTTTATTGTCTTCCAGTTATTCTTTCTTTTATCTACTTCTTTAAACCATCTAAATGCGGACAATATATTTTCGAGTTTATATGGCCACTTAAACGCATATTTATATAGATATAGCGTGTTTCTAACAGCTGATTGTGTATTTCTATCCTATCCTATTGTTCAACTCACTATCTTTGAATATATGCTTGTTGTTCAACTCTTATTATATGGGGATTATGCTGAGACATCTTTAAAAATTATTTAATGATAAACTTATATGATGGTACCATTTTTATTTGATTTTTATAAATAGGACTGATAATGCAAGACAAGAAAAAGAAATAACACTTTGTACATATACATATACCTGTATTAATAAACT]


>consensus_10560#0 TACAAGACATCCAAATGTATAGATTGTGGATTTCAGGCTCATAAACGATGTGCTGATCTT GTACCGTGTGACTGTGTACCAGATATTAAACAAATGAAACGAGTGTTCGGTGTGGACTTG ACTAATTTGGCGAGAGCTGAAAACAAGACTGTGCCAACTCTGCTAATTAAATGCATTCAA GAGGTAGAACGTCGAGATGGTTTGTGTTGTGAAGGCCTGTATCGTATTCCTGGAAATTAT GATCTTGTGGAAGAACTACGTACTGAATTCGATAAAGATCCGGAATTGGCAAATGTATCT GAGTCACGTGTTCGAGATATCAATGTTTTGACAAGTTTGATTAAATCATTTCTGCGTCAA TTGCCTGTCCCATTAATCACTTATGAGGCATATCCAGATTTACTGGATGTTGTTAGAGAT GATCGACTTAATGAACAAGAGAAATTAGATATGTTAAGGAAAATATTTGCTCGCTTACCC GGTGCCCATTATGAAAGTTTACGTTATTTTATAAACCATATACACAGAGTGGCTGAAAAG CAAGATGTGAATATGATGACTACAGCTAATTTAGCTATTGTTCTATCACCTACTTTACTG AGTTCATCTTATACTGATCCTATAAGTTGTTTAGCTGGAACACTTTTTGAACATACCTTA ATAGAATTACTTATAAAACATTGTACTTACTTGCTTCCATCAAACGGACGATGGTTAGCT AGTAGACCTACTGAATTAGCCGACAATGCAATCCATTCACCATCCCATCGTCATAGTCAA ATCATTACCAATAATAATTTTACTCCACCAGCCACTACGGTATCACCACCCAGTATACCA TCTTATAAGAAATGGAATTTTTTAAGAAGTCGATCATCCACAGATACCCGTACAGTGCCA ACTTTATCACCTATCCCGTGAAATTGGATGGAAGTTTCATCGATCTCTTTCTTCGTCTGT CTGCAGATAATTATTGTGTCAGTATGAATAAATTATTGTGTAATGTTATATTTTTTACTA CCTATCTTACCACTATATCGTTCTCAAATTGTTCTGTATCGACAAATATTTGTTAACACA TTCCACCATTTTTTCCATATAACTTTTTGATTATGTTCATTTTTTGCATTTCACAAAACG TCTGGTTCTTAACAAACTTGTACACATATATTTGTTCTTTTCTCGAATTCCATAATATTT GTGTGTGCTTGGTTTAAAGAAATCATTCATAAGTGATACTTTTATTGTCTTCCAGTTATT CTTTCTTTTATCTACTTCTTTAAACCATCTAAATGCGGACAATATATTTTCGAGTTTATA TGGCCACTTAAACGCATATTTATATAGATATAGCGTGTTTCTAACAGCTGATTGTGTATT TCTATCCTATCCTATTGTTCAACTCACTATCTTTGAATATATGCTTGTTGTTCAACTCTT ATTATATGGGGATTATGCTGAGACATCTTTAAAAATTATTTAATGATAAACTTATATGAT GGTACCATTTTTATTTGATTTTTATAAATAGGACTGATAATGCAAGACAAGAAAAAGAAA TAACACTTTGTACATATACATATACCTGTATTAATAAACT



clustalw multiple alignements is not computed in this case


Copyright Thu Nov 6 12:32:27 CET 2003 Hubert Wassner    (hubert.wassner@noos.fr)