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Schistosoma mansoni
cluster # 10674 cluster # 10674       Sequences # 19       consensus # 1


see consensus multiple alignment with clustalw

Direct access to contigs :
consensus_10674#0 length = 641 sequences # 19  

consensusID : consensus_10674#0
NCBI blastX ! send the sequence to the NCBI site !
NCBI blastN ! send the sequence to the NCBI site !
Sequences nbr = 19
consensus length = 641
fasta sequence
                              [ATTGCGGAACCTCTTGAAGAGTCATTATGTTTGTTCATCATTCAGAATTTGTGCCTGCACCAAATACCATTGGAAATATGGCACTACTACCCTTACGCACAAAATTTCGAGGACCTGCACCTATGAATATGGATTTGGAAAAAGATATTATTGACGAAGCTCTCTATCTTTTTAAATCACTCATATTTCTTCGACAGTACGAACTAAAAAGTGAAGCTGATCGTGTACTTGTTTATCTCGTTTTATATATTTTGGAATGCTTAAGAAAATTACAAAGGTGTCCAAATAGAACTTCTGGAGCTAAAGAATTAGCTGCAATGGCCATAAGTCGTTTCGATATACCAGGTGATCCAGATTTTCCTCGAGAATTAAACAATATGTATGCTAAACCGAAAAATGCCACAGAAATGGAAACAATGCG-TGGTTATTTAACTCAGTTAAGACAAGAGTTAGGTGTACGATTATTAGATAAAGTCTACCGTAATGATAATAGCCCACCGAGTAAGTGGTGGTTGTGCTTTGGCAAGCGTCGTTTCATGGATCAATCTTTAACGCCATT-GGGAGTATTCTAAGAAAAGCTCTTTTTTACACATACTATTGGTATTTTATCGTTGTTTGTTTCTCTTCTATGACAGTAACTT]

[-] EMBL CD188655             [ATTGCGGAACCTCTTGAAGAGTCATTATGTTTGTTCATCATTCAGAATTTGTGCCTGCACCAAATACCATTGGAAATATGGCACTACTACCCTTACGCACAAAATTTCGAGGACCTGCACCTATGAATATGGATTTGGAAAAAGATATTATTGACGAAGCTCTCTATCTTTTTAAATCACTCATATTTCTTCGACAGTACGAACTAAAAAGTGAAGCTGATCGTGTACTTGTTTATCTCGTTTTATATATTTTGGAATGCTTAAGAAAATTACAAAGGTGTCCAAATAGAACTTCTGGAGCTAAAGAATTAGCTGCAATGGCCATAAGTCGT                                                                                                                                                                                                                                                                                                                       ]
[+] EMBL AI067978             [ TTGCGGAACCTCTTGAAGAGTCATTATGTTTGTTCATCATTCAGAATTTGTGCCTGCACCAAATACCATTGGAAATATGGCACTACTACCCTTACGCACAAAATTTCGAGGACCTGCACCTATGAATATGGATTTGGAAAAAGATATTATTGACGAAGCTCTCTATCTTTTTAAATCACTCAGATTTCTTCGACAGTACGAACTAAAAAGTGAAGCTGATCGTGTACTTGTTTATCTCGTTTTATATATTTTGGAATGCTTAAGAAAATTACAAAGGTGTCCAAATAGAACTTCTGGAGCTAAAGAATTAGCTGCAATGGCCATAAGTCGTTTCGATATACCAGGTGATCCAGATTTTCCTCGAGAATTAAACAATATGTATGCTAAACCGAAAAATGCCACAGAAATGGAAACAATGCG TGGTTATTTAACTCAGTTAAGACAAGAGTTAGGTGTACGATTATTAGATAAAGTCTACCGTAATGATAATAGCCCACCGAGTAAGTGGTGGTTGTGCTTTGGCAAGCGTCGTTTCATGGATCAATCTTTAACGCCATT GGGAGTATTCTAAGAAAAGCTCTTTTTTACACATACTATTGGTATTTTATCGTTGTTTG                       ]
[+] EMBL AI067878             [ TTGCGGAACCTCTTGAAGAGTCATTATGTTTGTTCATCATTCAGAATTTGTGCCTGCACCAAATACCATTGGAAATATGGCACTACTACCCTTACGCACAAAATTTCGAGGACCTGCACCTATGAATATGGATTTGGAAAAAGATATTATTGACGAAGCTCTCTATCTTTTTAAATCACTCATATTTCTTCGACAGTACGAACTAAAAAGTGAAGCTGATCGTGTACTTGTTTATCTCGTTTTATATATTTTGGAATGCTTAAGAAAATTACAAAGGTGTCCAAATAGAACTTCTGGAGCTAAAGAATTAGCTGCAATGGCCATAAGTCGTTTCGATATACCAGGTGATCCAGATTTTCCTCGAGAATTAAACAATATGTATGCTAAACCGAAAAATGCCACAGAAATGGAAACAATGCG TGGTTATTTAACTCAGTTAAGACAAGAGTTAGGTGTACGATTATTAGATAAAGTCTACCGTAATGATAATAGCCCACCGAGTAAGTGGTGGTTGTGCTTTGGCAAGCGTCGTTTCATGGATCAATCTTTAACGCCATT GGGAGTATTCTAAGAAAAGCTCTTTTTTACACATACTATTGGTATTTTATCGTTGTTTG                       ]
[+] EMBL AI068031             [ TTGCGGAACCTCTTGAAGAGTCATTATGTTTGTTCATCATTCAGAATTTGTGCCTGCACCAAATACCATTGGAAATATGGCACTACTACCCTTACGCACAAAATTTCGAGGACCTGCACCTATGAATATGGATTTGGAAAAAGATATTATTGACGAAGCTCTCTATCTTTTTAAATCACTCATATTTCTTCGACAGTACGAACTAAAAAGTGAAGCTGATCGTGTACTTGTTTATCTCGTTTTATATATTTTGGAATGCTTAAGAAAATTACAAAGGTGTCCAAATAGAACTTCTGGAGCTAAAGAATTAGCTGCAATGGCCATAAGTCGTTTCGATATACCAGGTGATCCAGATTTTCCTCGAGAATTAAACAATATGTATGCTAAACCGAAAAATGCCACAGAAATGGAAACAATGCG TGGTTATTTAACTCAGTTAAGACAAGAGTTAGGTGTACGATTAT                                                                                                                                                                                 ]
[+] EMBL AI067907             [ TTGCGGAACCTCTTGAAGAGTCATTATGTTTGTTCATCATTCAGAATTTGTGCCTGCACCAAATACCATTGGCAATATGGCACTACTACCCTTACGCACAAAATTTCGAGGACCTGCACCTATGAATATGGATTTGGAAAAAGATATTATTGACGAAGCTCTCTATCTTTTTAAATCACTCATATTTCTTCGACAGTACGAACTAAAAAGTGAAGCTGATCGTGTACTTGTTTATCTCGTTTTATATATTTTGGAATGCTTAAGAAAATTACAAAGGTGTCCAAATAGAACTTCTGGAGCTAAAGAATTAGCTGCAATGGCCATAAGTCGTTTCGATATACCAGGTGATCCAGATTTTCCTCGAGAATTAAACAATATGTATGCTAAACCGAAAAATGCCACAGAAATGGAAACAATGCG TGGTTATTTAACTCAGTTAAGACAAGAGTTAGGTGTACGATTATTAGATAAAGTCTACCGTAATGATAATAGCCCACCGAGTAAGTGGTGGTTGTGCTTTGGCAAGCGTCGTTTCATGGATCAATCTTTAACGCCATT GGGAGTATTCTAAGAAAAGCTCTTTTTT                                                      ]
[+] EMBL AI068040             [ TTGCGGAACCTCTTGAAGAGTCATTATGTTTGTTCATCATTCAGAATTTGTGCCTGCACCAAATACCATTGGAAATATGGCACTACTACCCTTACGCACAAAATTTCGAGGACCTGCACCTATGAATATGGATTTGGAAAAAGATATTATTGACGAAGCTCTCTATCTTTTTAAATCACTCATATTTCTTCGACAGTACGAACTAAAAAGTGAAGCTGATCGTGTACTTGTTTATCTCGTTTTATATATTTTGGAATGCTTAAGAAAATTACAAAGGTGTCCAAATAGAACTTCTGGAGCTAAAGAATTAGCTGCAATGGCCATAAGTCGTTTCGATATACCAGGTGATCCAGATTTTCCTCGAGAATTAAACAATATGTATGCTAAACCGAAAAATGCCACAGAAATGGAAACAATGCG TGGTTATTTAACTCAGT                                                                                                                                                                                                            ]
[+] EMBL AI068095             [ TTGCGGAACCTCTTGAAGAGTCATTATGTTTGTTCATCATTCAGAATTTGTGCCTGCACCAAATACCATTGGAAATATGGCACTACTACCCTTACGCACAAAATTTCGAGGACCTGCACCTATGAATATGGATTTGGAAAAAGATATTATTGACGAAGCTCTCTATCTTTTTAAATCACTCATATTTCTTCGACAGTACGAACTAAAAAGTGAAGCTGATCGTGTACTTGTTTATCTCGTTTTATATATTTTGGAATGCTTAAGAAAATTACAAAGGTGTCCAAATAGAACTTCTGGAGCTAAAGAATTAGCTGCAATGGCCATAAGTCGTTTCGATATACCAGGTGATCCAGATTTTCCTCGAGAATTAAACAATATGTATGCTAAACCGAAAAATGCCACAGAAATGGAAACAATGCG T                                                                                                                                                                                                                            ]
[+] EMBL AI067506             [ TTGCGGAACCTCTTGAAGAGTCATTATGTTTGTTCATCATTCAGAATTTGTGCCTGCACCAAATACCATTGGAAATATGGCACTACTACCCTTACGCACAAAATTTCGAGGACCTGCACCTATGAATATGGATTTGGAAAAAGATATTATTGACGAAGCTCTCTATCTTTTTAAATCACTCATATTTCTTCGACAGTACGAACTAAAAAGTGAAGCTGATCGTGTACTTGTTTATCTCGTTTTATATATTTTGGAATGCTTAAGAAAATTACAAAGGTGTCCAAATAGAACTTCTGGAGCTAAAGAATTAGCTGCAATGGCCATAAGTCGTTTCGATATACCAGGTGATCCAGATTTTCCTCGAGAATTAAACAATATGTATGCTAAACCGAAAAATGC                                                                                                                                                                                                                                                   ]
[+] EMBL AI068109             [ TTGCGGAACCTCTTGAAGAGTCATTATGTTTGTTCATCATTCAGAATTTGTGCCTGCACCAAATACCATTGGAAATATGGCACTACTACCCTTACGCACAAAATTTCGAGGACCTGCACCTATGAATATGGATTTGGAAAAAGATATTATTGACGAAGCTCTCTATCTTTTTAAATCACTCATATTTCTTCGACAGTACGAACTAAAAAGTGAAGCTGATCGTGTACTTGTTTATCTCGTTTTATATATTTTGGAATGCTTAAGAAAATTACAAAGGTGTCCAAATAGAACTTCTGGAGCTAAAGAATTAGCTGCAATGGCCATAAGTCGTTTCGATATACCAGGTGATCCAGATTTTCCTCGAGAATTAAACAATATGTATGCTAAACCGAAAAATGCCACAGAAATGGAAACAATGCG TGGTTATT                                                                                                                                                                                                                     ]
[+] EMBL AI067767             [  TGCGGAACCTCTTGAAGAGTCATTATGTTTGTTCATCATTCAGAATTTGTGCCTGCACCAAATACCATTGGAAATATGGCACTACTACCCTTACGCACAAAATTTCGAGGACCTGCACCTATGAATATGGATTTGGAAAAAGATATTATTGACGAAGCTCTCTATCTTTTTAAATCACTCATATTTCTTCGACAGTACGAACTAAAAAGTGAAGCTGATCGTGTACTTGTTTATCTCGTTTTATATATTTTGGAATGCTTAAGAAAATTACAAAGGTGTCCAAATAGAACTTCTGGAGCTAAAGAATTAGCTGCAATGGCCATAAGTCGTTTCGATATACCAGGTGATCCAGATTTTCCTCGAGAATTAAACAATATGTATGCTAAACCGAAAAATGCCACAGAAATGGAAACAATGCG TGGTTATTTAACTCAGTTAAGACAAGAGTTAG                                                                                                                                                                                             ]
[+] EMBL AI067626             [  TGCGGAACCTCTTGAAGAGTCATTATGTTTGTTCATCATTCAGAATTTGTGCCTGCACCAAATACCATTGGAAATATGGCACTACTACCCTTACGCACAAAATTTCGAGGACCTGCACCTATGAATATGGATTTGGAAAAAGATATTATTGACGAAGCTCTCTATCTTTTTAAATCACTCATATTTCTTCGACAGTACGAACTAAAAAGTGAAGCTGATCGTGTACTTGTTTATCTCGTTTTATATATTTTGGAATGCTTAAGAAAATTACAAAGGTGTCCAAATAGAACTTCTGGAGCTAAAGAATTAGCTGCAATGGCCATAAGTCGTTTCGATATACCAGGTGATCCAGATTTTCCTCGAGAATTAAACAATATGTATGCTAAACCGAAAAATGCCACAGAAATGGAAACAATGCG TGGTTATTTAACTCAGTTAAGACAAGAGTTAGGTGTACG                                                                                                                                                                                      ]
[+] EMBL AI067891             [  TGCGGAACCTCTTGAAGAGTCATTATGTTTGTTCATCATTCAGAATTTGTGCCTGCACCAAATACCATTGGAAATATGGCACTACTACCCTTACGCACAAAATTTCGAGGACCTGCACCTATGAATATGGATTTGGAAAAAGATATTATTGACGAAGCTCTCTATCTTTTTAAATCACTCATATTTCTTCGACAGTACGAACTAAAAAGTGAAGCTGATCGTGTACTTGTTTATCTCGTTTTATATATTTTGGAATGCTTAAGAAAATTACAAAGGTGTCCAAATAGAACTTCTGGAGCTAAAGAATTACCTGCAATGGCCATAAGTCGTTTCGATATACCAGGTGATCCAGATTTTCCTCGAGAATTAAACAATATGTATGCTAAACCGAAAAATGCCACAGAAATGGAAACAATGCG TGGTTATTTAACTCAGTTAAGACAAGAGTTAGGTGTACGATTATTAGATAAAGTCTACCGTAATGATAATAGCCCACCGAGTAAGTGGTGGTTGTGCTTTGGCAAGCGTCGTTTCATGGATCAATCTTTAACGCCATT GGGAGTATTCTAAGAAAAGCTCTTTTTTACACATACTACTGGTATTTTATCGTTGTTTGTTTCTCTTCTATGACAGTAACTT]
[+] EMBL AI067918             [  TGCGGAACCTCTTGAAGAGTCATTATGTTTGTTCATCATTCAGAATTTGTGCCTGCACCAAATACCATTGGAAATATGGCACTACTACCCTTACGCACAAAATTTCGAGGACCTGCACCTATGAATATGGATTTGGAAAAAGATATTATTGACGAAGCTCTCTATCTTTTTAAATCACTCATATTTCTTCGACAGTACGAACTAAAAAGTGAAGCTGATCGTGTACTTGTTTATCTCGTTTTATATATTTTGGAATGCTTAAGAAAATTACAAAGGTGTCCAAATAGAACTTCTGGAGCTAAAGAATTAGCTGCAATGGCCATAAGTCGTTTCGATATACCAGGTGATCCAGATTTTCCTCGAGAATTAAACAATATGTATGCTAAACCGAAAAATGCCACAGAAATGGAAACAATGCG TGGTTATTTAACTCAGTTAAGACAAGAGTTAGGTGTACGATTATTAGATAAAGTCTACCGTAATGATAATAGCCCACCGAGTAAGTGGTGGTTGTGCTTTGGCAAGCGTCGTTTCATGGATCAATCTTTAACGCCATTGGGGAGTATTCTAAGAAAAGCTCTTTTTTACACATACca                                            ]
[+] EMBL AI068097             [  TGCGGAACCTCTTGAAGAGTCATTATGTTTGTTCATCATTCAGAATTTGTGCCTGCACCAAATACCATTGGAAATATGGCACTACTACCCTTACGCACAAAATTTCGAGGACCTGCACCTATGAATATGGATTTGGAAAAAGATATTATTGACGAAGCTCTCTATCTTTTTAAATCACTCATATTTCTTCGACAGTACGAACTAAAAAGTGAAGCTGATCGTGTACTTGTTTATCTCGTTTTATATATTTTGGAATGCTTAAGAAAATTACAAAGGTGTCCAAATAGAACTTCTGGAGCTAAAGAATTAGCTGCAATGGCCATAAGTCGTTTCGATATACCAGGTGATCCAGATTTTCCTCGAGAATTAAACAATATGTATGCTAAACCG                                                                                                                                                                                                                                                           ]
[+] EMBL AI067269             [  TGCGGAACCTCTTGAAGAGTCATTATGTTTGTTCATCATTCAGAATTTGTGCCTGCACCAAATACCATTGGAAATATGGCACTACTACCCTTACGCACAAAATTTCGAGGACCTGCACCTATGAATATGGATTTGGAAAAAGATATTATTGACGAAGCTCTCTATCTTTTTAAATCACTCATATTTCTTCGACAGTACGAACTAAAAAGTGAAGCTGATCGTGTACTTGTTTATCTCGTTTTATATATTTTGGAATGCTTAAGAAAATTACAAAGGTGTCCAAATAGAACTTCTGGAGCTAAAGAATTAGCTGCAATGGCCATAAGTCGTTTCGATATACCAGGTGATCCAGATTTTCCTCGAGAATTAAACAATATGTATGCTAAACCGAAAAATGCCACAGAAATGGAAACAATGCG TGGTTATTTAACTCAGTTAAGACAAGAGTTAGGTGTACGATTATTAGATAAAGTCTACCGTAATGA                                                                                                                                                           ]
[+] EMBL AI977267             [     GGAACCTCTTGAAGAGTCATTATGTTTGTTCATCATTCAGAATTTGTGCCTGCACCAAATACCATTGGAAATATGGCACTACTACCCTTACGCACAAAATTTCGAGGACCTGCACCTATGAATATGGATTTGGAAAAAGATATTATTGACGAAGCTCTCTATCTTTTTAAATCACTCATATTTCTTCGACAGTACGAACTAAAAAGTGAAGCTGATCGTGTACTTGTTTATCTCGTTTTATATATTTTGGAATGCTTAAGAAAATTACAAAGGTGTCCAAATAGAACTTCTGGAGCTAAAGAATTAGCTGCAATGGCCATAAGTCGTTTCGATATACCAGGTGATCCAGATTTTCCTCGAGAATTAAACAATATGTATGCTAAACCGAAAAATGCCACAGAAATGGAAACAATGCG TGGTTATTTAACTCAGTTAAGACAAGAGTTAGGTGTACGATTATTAGATAAAGTCTACCGTAATG                                                                                                                                                            ]
[+] EMBL AI068278             [            CTTGAAGAGTCATTATGTTTGTTCATCATTCAGAATTTGTGCCTGCACCAAATACCATTGGAAATATGGCACTACTACCCTTACGCACAAAATTTCGAGGACCTGCACCTATGAATATGGATTTGGAAAAAGATATTATTGACGAAGCTCTCTATCTTTTTAAATCACTCATATTTCTTCGACAGTACGAACTAAAAAGTGAAGCTGATCGTGTACTTGTTTATCTCGTTTTATATATTTTGGAATGCTTAAGAAAATTACAAAGGTGTCCAAATAGAACTTCTGGAGCTAAAGAATTAGCTGCAATGGCCATAAGTCGTTTCGATATACCAGGTGATTCAGATTTTCCTCGAGAATTAAACAATATGTATGCTAAACCGAAAAATGCCACAGAAATGGCAACAATGCGTTGGTTA TTAACTCAG                                                                                                                                                                                                             ]
[+] EMBL CD189558             [                                                   TGCCTGCACCAAATACCATTGGAAATATGGCACTACTACCCTTACGCACAGAATTTCGAGGACCTGCACCTATGAATATGGATTTGGAAAAAGATATTATTGACGAAGCTCTCTATCTTTTTAAATCACTCATATTTCTTCGACAGTACGAACTAAAAAGTGAAGCTGATCGTGAACTTGTTTATCTCGTTTTATATATTTGGGAATGCTTAAGAAAATTACAAAGGTGGCCAAATAAAACTTCTGGAGCTAAAGAATTAGCTGCAATGGCCATAAGTCG                                                                                                                                                                                                                                                                                                                        ]
[-] EMBL CD063545             [                                                                                                                                                                                                            TAAAAAGTGAAGCTGATCGTGTACTTGTTTATCTCGTTTTATATATTTTGGAATGCTTAAGAAAATTACAAAGGTGTCCAAATAGAACTTCTGGAGCTAAAGAATTAGCTGCAATGGCCATAAGTCGTTTCGATATACCAGGTGATCCAGATTTTCCTCGAGAATTAAACAATATG                                                                                                                                                                                                                                                                       ]


>consensus_10674#0 ATTGCGGAACCTCTTGAAGAGTCATTATGTTTGTTCATCATTCAGAATTTGTGCCTGCAC CAAATACCATTGGAAATATGGCACTACTACCCTTACGCACAAAATTTCGAGGACCTGCAC CTATGAATATGGATTTGGAAAAAGATATTATTGACGAAGCTCTCTATCTTTTTAAATCAC TCATATTTCTTCGACAGTACGAACTAAAAAGTGAAGCTGATCGTGTACTTGTTTATCTCG TTTTATATATTTTGGAATGCTTAAGAAAATTACAAAGGTGTCCAAATAGAACTTCTGGAG CTAAAGAATTAGCTGCAATGGCCATAAGTCGTTTCGATATACCAGGTGATCCAGATTTTC CTCGAGAATTAAACAATATGTATGCTAAACCGAAAAATGCCACAGAAATGGAAACAATGC GTGGTTATTTAACTCAGTTAAGACAAGAGTTAGGTGTACGATTATTAGATAAAGTCTACC GTAATGATAATAGCCCACCGAGTAAGTGGTGGTTGTGCTTTGGCAAGCGTCGTTTCATGG ATCAATCTTTAACGCCATTGGGAGTATTCTAAGAAAAGCTCTTTTTTACACATACTATTG GTATTTTATCGTTGTTTGTTTCTCTTCTATGACAGTAACTT



clustalw multiple alignements is not computed in this case


Copyright Thu Nov 6 12:32:27 CET 2003 Hubert Wassner    (hubert.wassner@noos.fr)