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Schistosoma mansoni
cluster # 10691 cluster # 10691       Sequences # 20       consensus # 3


see consensus multiple alignment with clustalw

Direct access to contigs :
consensus_10691#0 length = 870 sequences # 16  
consensus_10691#1 length = 493 sequences # 3  
consensus_10691#2 length = 434 sequences # 1  

consensusID : consensus_10691#0
NCBI blastX ! send the sequence to the NCBI site !
NCBI blastN ! send the sequence to the NCBI site !
Sequences nbr = 16
consensus length = 870
fasta sequence
                              [CCAGTTTATGTATATCTTTTGTTGATCATCTTTATAAATCATGTTTATTCAGCACGACCACTTACACCTTATCAAAGAAGTTTTACACCA-GCTAAAAATATTAGTTGTGCACAATGTGAAATGAAATTAGAAGTGGATAAATCGAAAAGTTTTGTAGAAACTGATATGTATCGTCGTAGATGTTTAGATGAACCAGAACTATTCTATAAACCATGTATTGTGAATGCTAAGAATACACCACGT-GG-ATGTGCTAAACTTACCACCTACTTAAAAGAACCCGTTGCTAAAGGTCGAGTTAAAGAAGTCACATTGATGAAACGTTTCTG-TGCTACTG-AAGGTGCTG-AGCCAGAAGAGATTAGATGTGTCAATCGTGCTTCAGAAGG-TGGCTATTCAGAATTATGCATTTGT-GGTACAGATAATTGTAATTCTGCTCCACAATTATTGAAATCATCATTATCATCGTCACCTATTTTTTCTCTAACAATAACAACCATTTACATGATATTTATGAAAATCAACTAATGGATTATCATTATTAGCCGAATTTGTAAGCAGTATACATATACATATTGTAGAGAAACAGAGATATGTTTAGTCCAATGTGTTAACCAATGGGGGTGAAAAGTAACTAAATCTAGTTTAACCATGTAAATGTGTGAAAGCACATAAGCACTTTTACACAAACACACTCACAG-AATTGTGCATTTTCCTGATTGGTAG-CCGTAAATCGTTTGTTATTGTATTCCCCTTTTTTAAATTTACATACAATTAGGCTGATTATTGTC-AATAATATTGTCTGTTGTGATGAATACTTTTTGTTGTGTTGTCTATTAGTAGTATCCTATACATATATGTATAAGTATAATTTAG]

[-] EMBL CD137682             [CCAGTTTATGTATATCTTTTGTTGATCATCTTTATAAATCATGTTTATTCAGCACGACCACTTACACCTTATCAAAGAAGTTTTACACCA GCTAAAAATATTAGTTGTGCACAATGTGAAATGAAATTAGAAGTGGATAAATCGAAAAGTTTTGTAGAAACTGATATGTATCGTCGTAGATGTTTAGATGAACCAGAACTATTCTATAAACCATGTATTGTGAATGCTAAGAATACACCACGT GG ATGTGCTAAACTTACCACCTACTTAAAAGAACCCGTTGCTAAAGGTCGAGTTAAAGAAGTCACATTGATGAAACGTTTCTG TGCTACTG AAGGTGCTG AGCCAGAAGAGATTAGATGTGTCAATCGTGCTTCAGAAGG TGGCTATTCAGAATTATGCATTTGT GGTACAGATAATTGTAATTCTGCTCCACAATTATTGAAATCATCATTATCATCGTCACCTATTTTTTCTCTAACAATAACAACCATTTAC                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                       ]
[+] EMBL CD082063             [                                        gaacTTATTCAGCACGACCACTTACACCTTATCAATGAAGTTTTACACCA GCTACAAATATTAGTTGTGCACAATGTGAAATGAAATTAGAAGTGGATAAATCGAAAAGTTTTGTAGAAACTGATATGTATCGTCGAAGATGTTTAGATGAACCAGAACTATTCTATAAACCATGTATTGTGAATGCTAAGAATACACCACGT GG ATGTGCTAAACTTACCACCTACTTGAAAGAACCCGTTGCTAAAGGTCGAGTTAAAGAAGTCACATTGATGAAACGTTTCTG TGCTACTG AAGGTGCTG AGCCAGAGGAGATTAGATGTGTCAATCGTCCTTCAGAAGG TGGTTATTCAGAATTATGCATTTGT GGTACAGATAATTGTAATTCTGCTCCACAGTTATTGAAATCATCATTA      TCACCTATTTTCTCTTTAACAATATCAACCATTTACGTGATATTTATGAAAATCAACTAATGAATTATCATTATTAGCCGAATTTGTAAGCAGTATACATATACATATTGTAGAGAAACAGAGATATGTTTAGTCCAATGTGTTAACCAATGGGGGTGAAAAGTAACTAAATCTAGTTTAACCATGTAAATGTGTGAAAGCACATAAGCACTTTTACACAAACACACTCACAG AATTGTGCATTTTCCTGATTGGTAGNCCGT AATCGTTTGTTATTGTATTCCCCTTTTTTAAA TTACATACAATTAGGCTGNATATTGGCNNAT ATATgnc                                                                          ]
[+] EMBL CD191090             [                                                                                  TTACACCACGCTAAAAATATTAGTTGTGCACAATGTGAAATGAAATTAGAAGTGGATAAATCGAAAAGTTTTGTAGAAACTGATATGTATCGTCGAAGATGTTTAGATGAACCAGAACTATTCTATAAACCATGTATTGTGAATGCTAAGAATACACCACGT GG ATGTGCTAAACTTACCACCTACTTGAAAGAACCCGTTGCTAAAGGTCGAGTTAAAGAAGTCACATTGATGAAACGTTTCTG TGCTACTG AAGGTGCTG AGCCAGAGGAGATTAGATGTGTCAATCG                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                        ]
[+] EMBL CD134017             [                                                                                                      TAGTTGTGCACAATGTGAAATGAAATTAGAAGTGGATAAATCGAAAAGTTTTGTAGAAACTGATATGTATCGTCGTAGATGTTTAGATGAACCAGAACTATTCTATAAACCATGTATTGTGAATGCTAAGAATACACCACGT GG ATGTGCTAAACTTACCACCTACTTAAAAGAACCCGTTGCTAAAGGTCGAGTTAAAGAAGTCACATTGATGAAACGTTTCTG TGCTACTG AAGGTGCTG AGCCAGAAGAGATTAGATGTGTCAATCGTGCTTCAGAAGG TGGCTATTCAGAATTATGCATTTGT GGTACAGATAATTGTAATTCTGCTCCACAATTATTGAAATCATTATTATCATCGTCACCTACTTTTTCTCTAACAATAACAACCATTTACATGATATTTATGAAAATCAACTAATGGATTATCATTATTAG                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                              ]
[+] EMBL AI110934             [                                                                                                                                                                                        TTAGATGAACCAGAACTATTCTATAAACCATGTATTGTGAATGCTAAGAATACACCACGT GG ATGTGCTAAACTTACCACCTACTTAAAAGAACCCGTTGCTAAAGGTCGAGTTAAAGAAGTCACATTGATGAAACGTTTCTGTTGCTACTGAAAGGTGCTGAAGCCAGAANANATTAGATGTGTCAATCGTGCTTCAGAAGG TGGCTATTCAGAATTATGCATTTGT GGTACAGATAATTGTAATTCTGCTCCACAATTATTGAAATCATCATTATCATCGTCACCTATTTTTTCTCTAACAATAACAACCATTTACATGATNTTTATGAAAATCA                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                    ]
[+] EMBL AI111160             [                                                                                                                                                                                        TTAGATGAACCAGAACTATTCTATAAACCATGTATTGTGAATGCTAAGAATACNCCACGTGGG ATGTGCTAAACTTACCACCTACTTAAAANAACCCGTTGCTAAAGGTCGAGTTAAAGAAGTCACATTGATGAAACGTTTCTG TGCTACTG AAGGTGCTG AGCCAGAANAGATTAGATGTGTCAATCGTGCTTCAGAAGG TGGCTATTCAGAATTATGCATTTGT GGTACAGATAATTGTAATTCTGCTCCACAATT                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                 ]
[+] EMBL AI110968             [                                                                                                                                                                                        TTAGATGAACCAGAACTATTCTATAAACCATGTATTGTGAATGCTAAGAATACACCACGT GG ATGTGCTAAACTTACCACCTACTTAAAAGAACCCGTTGCTAAAGGTCGAGTTAAAGAAGTCACATTGATGAAACGTTTCTG TGCTACTG AAGGTGCTG AGCCAGAAGAGATTAGATGTGTCAATCGTGCTTCAGAAGG TGGCTATTCAGAATTATGCATTTGT GGTACAGATAATTGTAATTCTGCTCCACAATTATTG                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                             ]
[+] EMBL AI110912             [                                                                                                                                                                                        TTAGATGAACCAGAACTATTCTATAAACCATGTATTGTGAATGCTAAGAATACACCACGT GG ATGTGCTAAACTTACCACCTACTTAAAANAACCCGTTGCTAAAGGTCGAGTTAAAGAAGTCACATTGATGAAACGTTTCTG TGCTACTG AAGGTGCTG AGCCAGAANANATTAGATGTGTCTATCGTGCTTCAGAAGG TGGCTATTCANAATTATGCATTTGT GGTACAGATAATTGTAATTCTGCTCCACAATTATTGAAATCATCATTATCATCGTCACCTATTTTTTCTCTAACAATAACAACCATTTACATGATATTTATGAAAATCAACTAATGGATTATCATTATTAGCCGAATTTGTAAGCAGTATATATATNCNTAATGTAGAGAAACAAAGATATTTTTAGTCCAATGTGTTAACCAATGGGGGTGAAAAGTAATTAAACCTAGTTTAACCATGTTAATGTGTGAAAGCACATAAGCACTTTTACACAAATACGC CACAG AAat                                                                                                                                                                             ]
[+] EMBL AI111155             [                                                                                                                                                                                            ATGAACCAGAACTATTCTATAAACCATGTNTTGTGAATGCTAAGAATACNCCACGTGGG ATGTGCTAAACTTACCACCTACTTAAAANAACCCGTTGCTAAAGGTCGAGTTAAAGAAGTCACATTGATGAAACGTTTCTG TGCTACTG AAGGTGCTG AGCCAGAANANATTAGATNTNTCANNC NGNNTCCNAAGGNTGGCTATTCAGAATTATGCATTTGT GGTACAGATAATTGTAATTCTGCTCCACAATTATTGAAATCATCATTATCATCGTCACCTATTTTTTCTCTAACAATAAC                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                 ]
[+] EMBL AI111153             [                                                                                                                                                                                            ATGAACCAGAACTATTCTATAAACCATGTNTTGTGAATGCTAAGAATACNCCACGT GGNATGTGCTAAACTTACCACCTACTTAAAAAAACCCGTTGCTAAAGGTCGAGTTAAAGAAGTCNCATTGATGAAACGTTTCTG TGCTACTG AAGGTGCTG AGCCAGAAAANATTAGATGTGTCAATCGTGCTTCAGAAGG TGGCTATTCANAATTNTNC TTTGTGGGTCCAGATAATTGTAATTCTGCNCCACAATTATTGAAATCATCATTATCATCGTCACCTATTTTTTCTCTAACAATAACAACCATTTACNTGATATTTATGAAAATCANCTAATGGATTATCATTATTAGCCGAATTTGTNAGCAGTATATATATACA                                                                                                                                                                                                                                                                                                                  ]
[+] EMBL AI110902             [                                                                                                                                                                                                ACCAGAACTATTCTATAAACCATGTNTTGTGAATGCTAAGAATACNCCACGT GG ATGTGCTAAACTTACCACCTACTTAAAANAACCCGTTGCTAAAGGTCGAGTTAAAGAANTCACATTGATGAAACGTTTCTG TGCTACTG AAGGTGCTG AGCCANAANANATTAGATGTGTCAATCGTGCTTCAGAAGG TGGCTATTCANAATTATGCATTTGT GGTACANATAATTGTAATTCTGCTCCNCAATTATTGAAATCATCATTATCATCGTCACCTATTTTTTCTCTAACAATAACAACCATTTACATGATATTTATGAAAATCNACTAATGGATTATCATTATTAGCCGAATTTGTAAGCAGTATATATATACNTAATGTAGAGAAACAAAGATATTTTTAGTCCAATGTGTTAACCANTGGGGGTGAAAAGTAATTAAACCTAGTTTAACCATGTTAATGTGTGAAAGCACATAAGCACTTTTACACAAATACGCTCACAGAAATTGTGCA TTTCCTAATTGGTAG CCGTAAATCat                                                                                                                                            ]
[+] EMBL CD082287             [                                                                                                                                                                                                                                                                      aaACCTACTTGAAAGAACCCGTTGCTAAAGGTCG CTTAAAGAAGTCACATTGACGAAACGTTTCTG TGCTACTG AAGGTGCTG AGCCAGAGGAGATTAGATGTGTCAATCGTCCTTCAGAAGG TGGTTATTCAGAATTATGCATTTGT GGTACAGATAATTGTAATTCTGCTCCACAGTTATTGAAATCATCATTA      TCACCTATTTTCTCTTTAACAATATCAACCATTTACGTGATATTTATGAAAATCAACTAATGAATTATCATTATTAGCCGAATTTGTAAGCAGTATACATATACATATTGTAGAGAAACAGAGATATGTTTAGTCCAATGTGTTAACCAATGGGGGTGAAAAGTAACTAAATCTAGTTTAACCATGTAAATGTGTGAAAGCACATAAGCACTTTTACACAAACACACTCACAG AATTGTGCATTTTCCTGATTGGTAG CCGTAAATCGTTTGTTATTGTATTCCCCTTTTTTAAATTTACATACAATTAGGCTGATTATTGTC AATAATATTGTCTGTTGTGATGAATACTTTTTGTTGTGTTGTCTATTAGTAGTATCCTATACATAT                   ]
[-] EMBL CD075127             [                                                                                                                                                                                                                                                                                        CCGTTGCTAAAGGTCGAGTTAAAGAAGTCACATTGATGAAACGTTTCTG TGCTACTG AAGGTGCTG AGCCAGAGGAGATTAGATGTGTCAATCGTCCTTCAGAAGG TGGTTATTCAGAATTATGCATTTGT GGTACAGATAATTGTAATTCTGCTCCACAGTTATTGAAATCATCATTA      TCACCTATTTTCTCTTTAACAATATCAACCATTTACGTGATATTTATGAAAATCAACTAATGAATTATCATTATTAGCCGAATTTGTAAGCAGTATACATATACATATTGTAGAGAAACAGAGATATGTTTAGTCCAATGTGTTAACCAATGGGGGTGAAAAGTAACTAAATCTAGTTTAACCATGTAAATGTGTGAAAGCACATAAGCACTTTTACACAAACACACTCACAG AATTGTGCATTTTCCTGATTGGTAG CCGTAAATCGTTTGTTATTGTATTCCCCTTTTTTAAATTTACATACAATTAGGCTGATTATTGTC AATAATATTGTCTGTTGTGATGAATACTTTTTGTTGTGTTGTCTATTAGTAGTATCCTATACATATA                  ]
[-] EMBL CD075893             [                                                                                                                                                                                                                                                                                            TGCTAAAGGTCGAGTTAAAGAAGTCACATTGATGAAACGTTTCTG TGCTACTG AAGGTGCTG AGCCAGAGGAGATTAGATGTGTCAATCGTCCTTCAGAAGG TGGTTATTCAGAATTATGCATTTGT GGTACAGATAATTGTAATTCTGCTCCACAGTTATTGAAATCATCATTA      TCACCTATTTTCTCTTTAACAATATCAACCATTTACGTGATATTTATGAAAATCAACTAATGAATTATCATTATTAGCCGAATTTGTAAGCAGTATACATATACATATTGTAGAGAAACAGAGATATGTTTAGTCCAATGTGTTAACCAATGGGGGTGAAAAGTAACTAAATCTAGTTTAACCATGTAAATGTGTGAAAGCACATAAGCACTTTTACACAAACACACTCACAG AATTGTGCATTTTCCTGATTGGTAG CCGTAAATCGTTTGTTATTGTATTCCCCTTTTTTAAATTTACATACAATTAGGCTGATTATTGTC AATAATATTGTCTGTTGTGATGAATACTTTTTGTTGTGTTGTCTATTAGTAGTATCCTATACATATA                  ]
[-] EMBL CD077062             [                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                   CAATCGTGCTTCAGAAGG TGGCTATTCAGAATTATGCATTTGT GGTACAGATAATTGTAATTCTGCTCCACAATTATTGAAATCATCATTATCATCGTCACCTATTTTTTCTCTAACAATAACAACCATTTACATGATATTTATGAAAATCAACTAATGGATTATCATTATTAGCCGAATTTGTAAGCAGTATATATATACATAATGTAGAGAAACAAAGATATTTTTAGTCCAATGTGTTAACCAATGGGGGTGAAAAGTAATTAAACCTAGTTTAACCATGTAAATGTGTGAAAGCACATAAGCACTTTTACACAAATACGCTCACAG AATTGTGCATTTTCCTAATTGGTAG CCGTAAATCATTTGTCATTATA TCCACCTTTTTAAACTTATATACAATTAGGATGATTATTGTC AATAATATTGTCTGTTGTGATGATTGTTTTTTGTTGTGCTGTCTATTAGTAGTATCCTATACATATATGTATAAGTATAATTTAG]
[-] EMBL CD136347             [                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                     ATGCATTTGT GGTACAGATAATTGTAATTCTGCTCCACAATTATTGAAATCATCATTATCATCGTCACCTATTTTTTCTCTAACAATAACAACCATTTACATGATATTTATGAAAATCAACTAATGGATTATCATT                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                   ]


>consensus_10691#0 CCAGTTTATGTATATCTTTTGTTGATCATCTTTATAAATCATGTTTATTCAGCACGACCA CTTACACCTTATCAAAGAAGTTTTACACCAGCTAAAAATATTAGTTGTGCACAATGTGAA ATGAAATTAGAAGTGGATAAATCGAAAAGTTTTGTAGAAACTGATATGTATCGTCGTAGA TGTTTAGATGAACCAGAACTATTCTATAAACCATGTATTGTGAATGCTAAGAATACACCA CGTGGATGTGCTAAACTTACCACCTACTTAAAAGAACCCGTTGCTAAAGGTCGAGTTAAA GAAGTCACATTGATGAAACGTTTCTGTGCTACTGAAGGTGCTGAGCCAGAAGAGATTAGA TGTGTCAATCGTGCTTCAGAAGGTGGCTATTCAGAATTATGCATTTGTGGTACAGATAAT TGTAATTCTGCTCCACAATTATTGAAATCATCATTATCATCGTCACCTATTTTTTCTCTA ACAATAACAACCATTTACATGATATTTATGAAAATCAACTAATGGATTATCATTATTAGC CGAATTTGTAAGCAGTATACATATACATATTGTAGAGAAACAGAGATATGTTTAGTCCAA TGTGTTAACCAATGGGGGTGAAAAGTAACTAAATCTAGTTTAACCATGTAAATGTGTGAA AGCACATAAGCACTTTTACACAAACACACTCACAGAATTGTGCATTTTCCTGATTGGTAG CCGTAAATCGTTTGTTATTGTATTCCCCTTTTTTAAATTTACATACAATTAGGCTGATTA TTGTCAATAATATTGTCTGTTGTGATGAATACTTTTTGTTGTGTTGTCTATTAGTAGTAT CCTATACATATATGTATAAGTATAATTTAG



consensusID : consensus_10691#1
NCBI blastX ! send the sequence to the NCBI site !
NCBI blastN ! send the sequence to the NCBI site !
Sequences nbr = 3
consensus length = 493
fasta sequence
                              [AGGANNCGGCACGAGGCACAATGTGAAATGAAATTAGAAGTGGATAAATCGAAAAGTTTTGTAGAAACTGATATGTATCGTCGTAGATGTTTAGATGAACCAGAACTATTCTATAAACCATGTATTGTGAATGCTAAGAATACACCACGTGGATGTGCTAAACTTACCACCTACTTAAAAGAACCCGTTGCTAAAGGTCGAGTTAAAGAAGTCACATTGATGAAACGTTTCTGTGCTACTGAAGGTGCTGAGCCAGAAGAGATTAGATGTGTCAATCGTGCTTCAGAAGGTGGCTATTCAGAATTNTGCATTTGTGGTACAGATAATTGTAATTCTGCTCCACACNTNGTTGNCATCATCNNTTATCAATCGNCANCCTCTTNNNTCCTCTACCCGNTTNGGTANGCCNTTNANCCGGCGATTTTTGGAAAANNCCCCCGNNCCGGGANTACCNCTTANTNNGCCGGANNTTGGCNAAGCCGCTTTTTTGNCT]

[+] EMBL SM067                [AGGANNCGGCACGAGGCACAATGTGAAATGAAATTAGAAGTGGATAAATCGAAAAGTTTTGTAGAAACTGATATGTATCGTCGTAGATGTTTAGATGAACCAGAACTATTCTATAAACCATGTATTGTGAATGCTAAGAATACACCACGTGGATGTGCTAAACTTACCACCTACTTAAAAGAACCCGTTGCTAAAGGTCGAGTTAAAGAAGTCACATTGATGAAACGTTTCTGTGCTACTGAAGGTGCTGAGCCAGAAGAGATTAGATGTGTCAATCGTGCTTCAGAAGGTGGCTATTCAGAATTNTGCATTTGTGGTACAGATAATTGTAATTCTGCTCCACACNTNGTTGNCATCATCNNTTATCAATCGNCANCCTCTTNNNTCCTCTACCCGNTTNGGTANGCCNTTNANCCGGCGATTTTTGGAAAANNCCCCCGNNCCGGGANTACCNCTTANTNNGCCGGANNTTGGCNAAGCCGCTTTTTTGNCT]
[+] EMBL SM7231               [               GCACAATGTGAAATGAAATTAGAAGTGGATAAATCGAAAAGTTTTGTAGAAACTGATATGTATCGTCGTAGATGTTTAGATGAACCAGAACTATTCTATAAACCATGTATTGTGAATGCTAAGAATACACCACGTGGATGTGCTAAACTTACCACCTACTTAAAAGAACCCGTTGCTAAAGGTCGAGTTAAAGAAGTCACATTGATGAAACGTTTCTGTGCTACTGAAGGTGCTGAGCCAGAAGAGATTAGATGTGTCAATCGTGCTTCAGAAGGTGGCTATTCAGAATTNTGCATTTGTGGTACAGATAATTGTA                                                                                                                                                                  ]
[+] EMBL AI111083             [                                                                                          TTAGATGAACCAGAACTATTCTATAAACCATGTTTCGTGAATGCTAAGAATACACCACGTGGATGTGCTAAACTTNCCNCCTACTTAAAAGAACCCGTTGCTANAGGTCG                                                                                                                                                                                                                                                                                                     ]


>consensus_10691#1 AGGANNCGGCACGAGGCACAATGTGAAATGAAATTAGAAGTGGATAAATCGAAAAGTTTT GTAGAAACTGATATGTATCGTCGTAGATGTTTAGATGAACCAGAACTATTCTATAAACCA TGTATTGTGAATGCTAAGAATACACCACGTGGATGTGCTAAACTTACCACCTACTTAAAA GAACCCGTTGCTAAAGGTCGAGTTAAAGAAGTCACATTGATGAAACGTTTCTGTGCTACT GAAGGTGCTGAGCCAGAAGAGATTAGATGTGTCAATCGTGCTTCAGAAGGTGGCTATTCA GAATTNTGCATTTGTGGTACAGATAATTGTAATTCTGCTCCACACNTNGTTGNCATCATC NNTTATCAATCGNCANCCTCTTNNNTCCTCTACCCGNTTNGGTANGCCNTTNANCCGGCG ATTTTTGGAAAANNCCCCCGNNCCGGGANTACCNCTTANTNNGCCGGANNTTGGCNAAGC CGCTTTTTTGNCT



consensusID : consensus_10691#2
NCBI blastX ! send the sequence to the NCBI site !
NCBI blastN ! send the sequence to the NCBI site !
Sequences nbr = 1
consensus length = 434
fasta sequence
                              [AATGTGTCAATCGTCCTTCAAAAGGTGGTTATTCAGAATTATGCATTTGTGGTACAGATAATTGTAATTTTGCTCCCCAGTTATTGAAATCATCATTATCCCCTATTTTTTTTTTAACAAAATCAACCATTTACGTGATATTTATGAAAATCAACTAATGAATTATCATTATTAACCGAATTTGTAAGCAGTATACATATACATATTGTAAAGAAACAAAGATATGTTTAGTCCAATGTGTTAACCAATGGGGGTGAAAAGTAACTAAATTTAGTTTAACCATGTAAATGTGTGAAAGCACATAAGCACTTTTACACAAACACACTCACAAAATTGGGCATTTTCCTGATTGGTAACCGTAAATCGTTTGTTATTGGATTCCCCCTTTTTAAATTTACAAACAAATAGGGTGATTATTGTCAAAAAAAATGTCT]

[-] EMBL CD075678             [AATGTGTCAATCGTCCTTCAAAAGGTGGTTATTCAGAATTATGCATTTGTGGTACAGATAATTGTAATTTTGCTCCCCAGTTATTGAAATCATCATTATCCCCTATTTTTTTTTTAACAAAATCAACCATTTACGTGATATTTATGAAAATCAACTAATGAATTATCATTATTAACCGAATTTGTAAGCAGTATACATATACATATTGTAAAGAAACAAAGATATGTTTAGTCCAATGTGTTAACCAATGGGGGTGAAAAGTAACTAAATTTAGTTTAACCATGTAAATGTGTGAAAGCACATAAGCACTTTTACACAAACACACTCACAAAATTGGGCATTTTCCTGATTGGTAACCGTAAATCGTTTGTTATTGGATTCCCCCTTTTTAAATTTACAAACAAATAGGGTGATTATTGTCAAAAAAAATGTCT]


>consensus_10691#2 AATGTGTCAATCGTCCTTCAAAAGGTGGTTATTCAGAATTATGCATTTGTGGTACAGATA ATTGTAATTTTGCTCCCCAGTTATTGAAATCATCATTATCCCCTATTTTTTTTTTAACAA AATCAACCATTTACGTGATATTTATGAAAATCAACTAATGAATTATCATTATTAACCGAA TTTGTAAGCAGTATACATATACATATTGTAAAGAAACAAAGATATGTTTAGTCCAATGTG TTAACCAATGGGGGTGAAAAGTAACTAAATTTAGTTTAACCATGTAAATGTGTGAAAGCA CATAAGCACTTTTACACAAACACACTCACAAAATTGGGCATTTTCCTGATTGGTAACCGT AAATCGTTTGTTATTGGATTCCCCCTTTTTAAATTTACAAACAAATAGGGTGATTATTGT CAAAAAAAATGTCT



consensus multiple alignement with clustalw

CLUSTAL W (1.82) multiple sequence alignment


consensus_10691#0      CCAGTTTATGTATATCTTTTGTTGATCATCTTTATAAATCATGTTTATTCAGCACGACCA 60
consensus_10691#2      ------------------------------------------------------------
consensus_10691#1      ------------------------------------------------------------
                                                                                   

consensus_10691#0      CTTACACCTTATCAAAGAAGTTTTACACCAGCTAAAAATATTAGTTGTGCACAATGTGAA 120
consensus_10691#2      ------------------------------------------------------------
consensus_10691#1      ------------------------------------------------------------
                                                                                   

consensus_10691#0      ATGAAATTAGAAGTGGATAAATCGAAAAGTTTTGTAGAAACTGATATGTATCGTCGTAGA 180
consensus_10691#2      ------------------------------------------------------------
consensus_10691#1      ------------------------------------------------------------
                                                                                   

consensus_10691#0      TGTTTAGATGAACCAGAACTATTCTATAAACCATGTATTGTGAATGCTAAGAATACACCA 240
consensus_10691#2      ------------------------------------------------------------
consensus_10691#1      ------------------------------------------------------------
                                                                                   

consensus_10691#0      CGTGGATGTGCTAAACTTACCACCTACTTAAAAGAACCCGTTGCTAAAGGTCGAGTTAAA 300
consensus_10691#2      ------------------------------------------------------------
consensus_10691#1      ------------------------------------------------------------
                                                                                   

consensus_10691#0      GAAGTCACATTGATGAAACGTTTCTGTGCTACTGAAGGTGCTGAGCCAGAAGAGATTAGA 360
consensus_10691#2      ----------------------------------------------------------AA 2
consensus_10691#1      ----------------AGGANNCGGCACGAGGCACAATGTGAAATGAAATTAGAAGTGGA 44
                                                                                  *

consensus_10691#0      TGTGTCAATCGTGCTTCAGAAGGTGGCTATTCAGAATTATGCATTTGTGGTACAGATAAT 420
consensus_10691#2      TGTGTCAATCGTCCTTCAAAAGGTGGTTATTCAGAATTATGCATTTGTGGTACAGATAAT 62
consensus_10691#1      TAAATCGAAAAGTTTTGTAGAAACTGATATGTATCGTCGTAGATGTTTAG-ATGAACCAG 103
                       *   ** *      **    *    * ***  *   *  *  ** * * * *   *  * 

consensus_10691#0      TGTAATTCTGCTCCACAATTATTGAAATCATCATTATCATCGTCACCTATTTTTTCTCTA 480
consensus_10691#2      TGTAATTTTGCTCCCCAGTTATTGAAATCATCATTA------TCCCCTATTTTTTTTTTA 116
consensus_10691#1      AACTATTCTATAAACCATGTATTGTGAATGCTAAGAATA---CACCACGTGGATGTGCTA 160
                           *** *      **  *****  *     *  *         *   *   *    **

consensus_10691#0      ACAATAACAACCATTTACATGA---TATTTATGAAAATCAA-CTAATGGATTATCATTAT 536
consensus_10691#2      ACAAAATCAACCATTTACGTGA---TATTTATGAAAATCAA-CTAATGAATTATCATTAT 172
consensus_10691#1      AACTTACCACCTACTTAAAAGAACCCGTTGCTAAAGGTCGAGTTAAAGAAGTCACATTGA 220
                       *    * ** * * ***   **     **  * **  ** *  *** * * *  ****  

consensus_10691#0      TAGCCGAATTTGTAAGCAGTATACATATACATATTGTAGAGAAACAGAGATATGTTTAGT 596
consensus_10691#2      TAACCGAATTTGTAAGCAGTATACATATACATATTGTAAAGAAACAAAGATATGTTTAGT 232
consensus_10691#1      TGAA-ACGTTTCTGTGCTAC-TGAAGGTGCTGAGCCAGAAGAGATT-AGATGTGTC-AAT 276
                       *       *** *  **    *  *  * *  *      *** *   **** ***  * *

consensus_10691#0      CCAATGTGTTAACCAATGGGGGTGAAAAGTAACTAAATC-TAGTTTAACCA--TGTAAAT 653
consensus_10691#2      CCAATGTGTTAACCAATGGGGGTGAAAAGTAACTAAATT-TAGTTTAACCA--TGTAAAT 289
consensus_10691#1      C--GTGCTTCAGAAGGTGGCTATTCAGAATTNTGCATTTGTGGTACAGATAATTGTAATT 334
                       *   **  * *     ***   *  * * *     * *  * **  *   *  ***** *

consensus_10691#0      GTGTGAAAGCACATAAGCACTTTTACACAAACACACTCACAGAA----TTGTGCATTTTC 709
consensus_10691#2      GTGTGAAAGCACATAAGCACTTTTACACAAACACACTCACAAAA----TTGGGCATTTTC 345
consensus_10691#1      CTGCTCCA-CACNTNGTTGNCATCATCNNTTATCAATCGNCANCCTCTTNNNTCCTCTAC 393
                        **    * *** *        * *        ** **          *    * * * *

consensus_10691#0      CTGATTGG---TAGCCGTAAATCGTTTGTTATTGTA---TTCCCCTTTTTTAAATTTACA 763
consensus_10691#2      CTGATTGG---TAACCGTAAATCGTTTGTTATTGGA---TTCCCCCTTTTTAAATTTACA 399
consensus_10691#1      CCGNTTNGGTANGCCNTTNANCCGGCGATTTTTGGAAAANNCCCCCGNNCCGGGANTACC 453
                       * * ** *      *  * *  **    ** *** *     ****           *** 

consensus_10691#0      TACAATTAGGCTGATTATTGTCAATAATATTGTCTGTTGTGATGAATACTTTTTGTTGTG 823
consensus_10691#2      AACAAATAGGGTGATTATTGTCAAAAAAAATGTCT------------------------- 434
consensus_10691#1      NCTTANTNNGCCGGANNTTGGCNAAGCCGCTTTTTTGNCT-------------------- 493
                           * *  *  *    *** * *      * * *                         

consensus_10691#0      TTGTCTATTAGTAGTATCCTATACATATATGTATAAGTATAATTTAG 870
consensus_10691#2      -----------------------------------------------
consensus_10691#1      -----------------------------------------------
                                                                      




Copyright Thu Nov 6 12:32:27 CET 2003 Hubert Wassner    (hubert.wassner@noos.fr)