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Schistosoma mansoni
cluster # 10735 cluster # 10735       Sequences # 20       consensus # 1


see consensus multiple alignment with clustalw

Direct access to contigs :
consensus_10735#0 length = 570 sequences # 20  

consensusID : consensus_10735#0
NCBI blastX ! send the sequence to the NCBI site !
NCBI blastN ! send the sequence to the NCBI site !
Sequences nbr = 20
consensus length = 570
fasta sequence
                              [ATTTAATTTGGGATTTATAATAGCACAACATAATCAAGATTTATTCATCATTGATCAACATGCTAGT-GATGAAAAATATCGATTTGAACAATTATCAGAAAATTATCGATTTAAAAGTCAACCATTAGTTGTGCCTCAAAAGTTGAATTTAACAAT-AACAAATGAACAAGTGTTAATCAATAATTT-GGATGTNTTCGCTAGGAACGGATTCGCTTTTCGTATTCACAGTGACNAACCTGCTGGTCAACAAATATCTCTTGTTGCTGCACCAATGCTAGAAAACAAGTTATTCAGTTACAGAGATATTGAAGAAATGTTGTTTGTATTATCTGAAACATGTAATAAG-AAATGTCGACCATCCCGTTT-GAGAGATATACTTGCTTCACGATCATGTCGTAGTGCTGTTATGATTGGAACAGCATTAGATCNTAAAAAGATGAAACGAATCTTAACAAATATGGGCTCCATGGGATCATCCATGGGAATTGTCCACATGGGACNTCCAACGATGCGACATTTATATCATTTAAACCC-TTTAAATGAATAACAATCAATAATCATATTGTACCT]

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[+] EMBL AI110894             [ TTTAATTTGGGATTTATAATAGCACAACATAATCAAGATTTATTCATCATTGATCAACATGCTAGT GATGAAAAATATCGATTTGAACAATTATCAGAAAATTATCGATTTAAAAGTCNACCATTAGTTGTGCCTCNAAAGTTGAATTTAACNATNACCAAATGAACNAGTGTTAATCAATAATTTGGGATGTNTTCGCTAGGAACGGATTCNCTTTTCGTATTCACAGTGACNAACCTGCTGGTCAACAAATATCTCTTGTTGCTGCACCAATGCTAGAAAACAAGTTNTTCNGTTACAGAGATATTGAAGAAATGTTGTTTGTATTATCTGAAACATGTNATAAG AAATGTCGACCATCCCGTTT GAGAGATATACTTGCTTCACGATCATGTCGTAGTGCTGTTATGATTGGAACNGCATTAGATCTTNAAAAGATGAAACGAATCTTAACAAATATGGGCTCCATGGGATCATCCATGGGAATTGTCCACATGGGAC TCCAACGATGCGACATTTATATCATTTAAACCC T                                   ]
[+] EMBL AI111167             [ TTTAATTTGGGATTTATAATAGCACAACATAATCAAGATTTATTCATCATTGATCAACATGCTAGT GATGAAAAATATCGATTTGAACAATTATCAGAAAATTATCGATTTAAAAGTCAACCATTAGTTGTGCCTCAAAAGTTGAATTTAACAAT AACAAATGAACAAGTGTTAATCAATAATTT GGATGTNTTCGCTAGGAACGGATTCGCTTTTCGTATTCACAGTGACNAACCTGCTGGTCAACAAATATCTCTTGTTGCTGCACCAATGCTAGAAAACAAGTTNTTCAGTTACAGAGATATTGAANAAATGTTGTTTGTATTATCTGAAACATGTAATAAG AAATGTCGACCATCCCGTTTGGAGAGATATACTTGCTTCACGATCATGTCGTANTGCTGTTATGAT                                                                                                                                                                ]
[+] EMBL AI110931             [ TTTAATTTGGGATTTATAATAGCACAACATAATCAAGATTTATTCATCATTGATCAACATGCTAGT GATGAAAAATATCGATTTGAACAATTATCANAAAATTATCGATTTAAAAGTCAACCATTAGTTGTGCCTCAAAAGTTGAATTTNACNAT AACAAATGAACNAGTGTTAATCAATAATTT GGATGTNTTCGCTAGGAACGGATTCGCTTTTCGTNTTCACAGTGACNAACCTGCTGGTCAACAAATNTCTCTTGTTGCTGCACCAATGCTAGAAAACNAGTTATTCAGTTACAGAGATATTGAAGAAATGTTGTTTGTATTATCTGAAACATGTNATAAG AAATGTCGACCATCCCGTTT GAGAGATATNCTTGCTTCACGATCATGTCGTAGTGCTGTTATGATT                                                                                                                                                               ]
[+] EMBL AI111113             [ TTTAATTTGGGATTTATAATAGCACAACATAATCAAGATTTATTCATCATTGATCAACATGCTAGT GATGAAAAATATCGATTTGAACAATTATCAGAAAATTATCGATTTAAAAGTCAACCATTAGTTGTGCCTCAAAAGTTGAATTTAACAAT AACAAATGAACAAGTGTTAATCAATAATTT GGATGTATTCGCTAGGAACGGATTCGCTTTTCGTATTCACAGTGACNAACCTGCTGGTCAACAAATATCTCTTGTTGCTGCACCAATGCTAGAAAACAAGTTATTCAGTTACAGAGATATTGAAGAAATGTTGTTTGTATTATCTGAAACATGTAATAAG AAATGTCGACCATCCCGTTT GAGAGATATACTTGCTTCACGATCATGTCGTAGTGCTGTTATGA                                                                                                                                                                 ]
[+] EMBL AI111049             [ TTTAATTTGGGATTTATAATAGCACAACATAATCAAGATTTATTCATCATTGATCAACATGCTAGT GATGAAAAATATCGATTTGAACAATTATCAGAAAATTATCGATTTAAAAGTCAACCATTAGTTGTGCCTCAAAAGTTGAATTTAACAAT AACAAATGAACAAGTGTTAATCAATAATTT GGATGTNTTCGCTAGGAACGGATTCGCTTTTCGTATTCACAGTGACNAACCTGCTGGTCAACAAATATCTCTTGTTGCTGCACCAATGCTAGAAAACAAGTTNTTCAGTTACAGAGATATTGAAGAAATGTTGTTTGTATTATCTGAAACATGTAATAAGAAAATGTCGACCANCCCGTTT GAGAGATATACTTGCTTCACGATCATGTCGTAGTGCTGTTA                                                                                                                                                                    ]
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[+] EMBL AI110951             [ TTTAATTTGGGATTTATAATAGCACAACATAATCAAGATTTATTCATCATTGATCAACATGCTAGT GATGAAAAATATCGATTTGAACAATTATCANAAAATTATCGATTTAAAAGTCAACCATTAGTTGTGCCTCAAAAGTTGAATTTAACAAT AACAAATGAACAAGTGTTAATCAATAATTT GGATGTATTCGCTAGGAACGGATTCGCTTTTCGTATTCACAGTGACNAACCTGCTGGTCAACAAATATCTCTTGT                                                                                                                                                                                                                                                                                                                        ]
[+] EMBL AI111018             [ TTTAATTTGGGATTTATAATAGCACAACATAATCAAGATTTATTCATCATTGATCAACATGCTAGT GATGAAAAATATCGATTTGAACAATTATCANAAAATTATCGATTTAAAAGTCAACCATTAGTTGTGCCTCAAAAGTTGAATTTAACAAT AACAAATGAACAANTGTTAATCAATAATTT GGATGTATNCGCTAGGAACGGATTCGCTTTNCGTATTCNCAGTGACAAACCTGCTGGTCAACAAATATCTC                                                                                                                                                                                                                                                                                                                            ]
[+] EMBL AI110898             [         GGGATTTATNATAGCACNACATAATCNAGATTTATTCNTCATTGATCANCNTGCTAGT GATGAAAAATATCGATTTGANCAATTATCNGAAAATTNTCGATTTAAAAGTCAACCATTAGTTGTGCCTCAAAAGTTGAATTTAACAAT AACGAATGAACAAGTGTTAATCAATAATTT GGATGTTTTCGCTAGGAACGGATTCGCTTTTCGTATTCACNGTGACGAACCTGCTGGTCAACAAATNTCTCTTGTTGCTGCACCAATGCTAGAAAACAAGTTNTTCCGTTACCGAGATATTGAANAAATGTTGTTTGTATTATCTGAAACATGTAATAAG AAATGTCCACCATCCCGTTT GAGAGATATACTTGCTTCACGATCATGTCGTATTGCTGTTNTGATTGGA  ATCA  ATATCNTAtgttccca                                                                                                                                    ]


>consensus_10735#0 ATTTAATTTGGGATTTATAATAGCACAACATAATCAAGATTTATTCATCATTGATCAACA TGCTAGTGATGAAAAATATCGATTTGAACAATTATCAGAAAATTATCGATTTAAAAGTCA ACCATTAGTTGTGCCTCAAAAGTTGAATTTAACAATAACAAATGAACAAGTGTTAATCAA TAATTTGGATGTNTTCGCTAGGAACGGATTCGCTTTTCGTATTCACAGTGACNAACCTGC TGGTCAACAAATATCTCTTGTTGCTGCACCAATGCTAGAAAACAAGTTATTCAGTTACAG AGATATTGAAGAAATGTTGTTTGTATTATCTGAAACATGTAATAAGAAATGTCGACCATC CCGTTTGAGAGATATACTTGCTTCACGATCATGTCGTAGTGCTGTTATGATTGGAACAGC ATTAGATCNTAAAAAGATGAAACGAATCTTAACAAATATGGGCTCCATGGGATCATCCAT GGGAATTGTCCACATGGGACNTCCAACGATGCGACATTTATATCATTTAAACCCTTTAAA TGAATAACAATCAATAATCATATTGTACCT



clustalw multiple alignements is not computed in this case


Copyright Thu Nov 6 12:32:27 CET 2003 Hubert Wassner    (hubert.wassner@noos.fr)