Home
Who am I
Technology
EST Assembly
Contact

These datas are free for academic use only, please contact me for any other use.

Schistosoma mansoni
cluster # 10740 cluster # 10740       Sequences # 20       consensus # 1


see consensus multiple alignment with clustalw

Direct access to contigs :
consensus_10740#0 length = 1191 sequences # 20  

consensusID : consensus_10740#0
NCBI blastX ! send the sequence to the NCBI site !
NCBI blastN ! send the sequence to the NCBI site !
Sequences nbr = 20
consensus length = 1191
fasta sequence
                              [GCATGTGAAACAATGGGTAATGCAACAGCCATCTGTTCT-GTCAAAACAGGCACTTTAACAACAAATCGTATGACAGTTGTTCAATGTTATTTTGGTGAGAAATTAAC-CCAAAACACTGATCAATTACCAAAACTGAAAGATTTAAATCACAGAATTG-GACATAGATTTGTGCATGGTGTTTCAATTAATAGTAGTTATACATCACGTGTGACTATTCCAGACAAACCAAGTGAATTACCACAACAACTAGGGAAT-AAAACTGAATGTGCTTTGCTTGGATTTGTACGTCATTTAGGCGTAAATTATGAGGATATACGAGAACGTTGGCCACAAGAAAGTTTGGTGAAAGTATTCACATTTAATTCTTTACGAAAGTCAATGAGTACAGTGATTAAAAACTTGGAACCTGATAGGCCAGGTTATACTGTTTTCACTAAAGGTGCTTCCGAAATGGTTTTGAAAAAATGTAGTTTCATCCTCGATGCTAATGGTGATCCTAAGCCATTCACTAAAGCTGATCAAGATAATTTAGTTCGAGATGTAATTGAACAAATGGCTAGTGATGGATTACGTACCATAGGTATTGCATACAAAAGTTATATAGATCCTGCTGTTGGGTTATTTCCGAATGAGGTTCCTTTAAATCGTGGACAGACACCTGATTTTGATGATGAAGATATTATCGTCTCTGATTTAACATGTATTGGAATAGTAGGAATTGAAGATCCTGTAAGACCAGAGGTTCCTGCAGCTATACGAAAGTGTCAACGTGCCGGGATCACTGTACGTATGGTAACCGGTGATAATGTTAACACAGCAAGATCGATAGCTGCTAAATGTGGTATTCTTAAGCCAGGTGATAACTATATTGTGTTAGAAGGAAAAGAATTCAATGCTCGTGTACGTGATCCACGTACAAATCGTGTTAGACAAGATCTTATGGATCAAGTATGGCCACAGTTAAGAGTTCTTGCACGTTCCTCACCACAGGATAAATATACCTTAGTAAGTGGAATTATAGACAGTCATATTTCAACTCGTCGTGAAGTTGTTGCTGTAACTGGAGATGGTACAAATGATGGACCTGCATTGAAGAAGGCTGATGTTGGTTTCGCTATGGGTATAGCAGGAACAGATGTTGCAAAAGAAGCTTCAGATATTATATTAACGGACGANTACTNNTACAGTATC]

[+] EMBL CD150440             [GCATGTGAAACAATGGGTAATGCAACAGCCATCTGTTCT GACAAAACAGGCACTTTAACAACAAATCGTATGACAGTTGTTCAATGTTATTTTGGTGAGAAATTAAC CCAAAACACTGATCAATTACCAAAACTGAGAGATTTAAATCACAGAATTG GACATAGATTTGTGCATGGTGTTTCAATTAATAGTAGTTATACATCACGTGTGACTATTCCAAACAAACCAAGTGAATTACCACAACAACTAGGGAAT AAAACTGAATGTGCTTTGCTTGGATTTGTACGTCATTTAGGCGTAAATTATGAGGATATACGAGAACGTTGGCCACAAGAAAGTTTGGTGAAAGTATTCACATTTAATTCTTTACGAAAGTCAATGAGTACAGTGATTAAAAACTTGGAACCTGATAGGCCAGGTTATACTGT                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                           ]
[+] EMBL CD161680             [                           GCC TCTGTTCT ATCAAAACAGGCACTTTAACAACAAATCGTATGACAGTTGTTCAATGTTATTTTGGTGAGAAATTATCTCCAAAACACTGATCAATTACCAAAACTGAAAGATTTAAATCACAGATTTGTTACATAGATTTGTGCATGGTGTTTCAATTAATAGTAGTTATACATCACGTGTGACTATTCCAGACAAACCAAGTGAATTACCACAACAACTAGGGAAT AAAACTGAATGTGCTTTGCTTGGATTTGTACGTCATTTATGCGTAA                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                          ]
[+] EMBL CD161741             [                               ctTGTCCTAGTCAAAACAGGCACTTTAACAACAAATCGTATGACAGTTGTTCAATGTTATTTTGGTGAGAAATTAAC CCCAAACACTGATCAGTTACCAAAACTGAAAGATTTAAATCACAGAATTG TACATAGATTTGTGCATGGTGTTTCAATTAATAGTAGTTATACATCACGTGTGACTATTCCAGACTAACCAAGTGAATTACCACAACCCCTCGGGAAT AAAACTGAATGTGCTTTGCTTGGATCTGTACGTCATTTAGGCGTAA                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                          ]
[+] EMBL CD161759             [                                                     CTTTAACAACAAATCGTATGACAGTTGTTCAATGTTATTTTGGTGAGAAATTAAC CCAAAACACTGATCAATTACCAAAACTGAAAGATTTAAATCACAGAATTG GACATAGATTTGTGCATGGTGTTTCAATTAATAGTAGTTATACATCACGTGTGACTATTCCAGACAAACCAAGTGAATTACCACAACGACTAGGGAAT AAAACTGAATGTGCTTTGCTTGGATTTGTACGTCATTTAGGCGTAA                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                          ]
[+] EMBL CD161692             [                                                     CTTTAACAACAAATCGTATGACAGTTGTTCAATGTTATTTTGATGAGAAATTAAC CCAAAACACTGATCAATTACCAAAACTGAAAGATTTAAATCACAGAATTG GACATAGATTTGTGCATGGTGTTTCAATTAATAGTAGTTATACATCACGTGTGACTATTCCAGACAAACCAAGTGAATTACCACAACAACTAGGGAAT AAAACTGAATGTGCTTTGCTTGGATTTGTACGTCATTTAGGCGTAA                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                          ]
[+] EMBL CD161679             [                                                     CTTTAACAACAAATCGCATGACAGTTGTTCAATGTTATTTTGGTGAGAAATTAAC CCTTAA ACTGATCAATTACCAAAACTGAAAGATTTAAATCACAGAATTG GACATAGATTTGTGCATGGTGTTTCAATTAATAGTAGTTATACATCACGTGTGACTATTCCAGACAAACCAAGTGAATTACCACAACAACTAGGGAAT AAAACTGAATGTGCTTTGCTTGGATTTGTACGTCATTTACGCGTAA                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                          ]
[+] EMBL CD161733             [                                                     CTTTAACAACAAATCGTATGACAGTTGTTCAATGTTATTTTGGTGAGAAATTAAC CCAAAACACTGATCAATTACCAAAACTGAAAGATTTAAATCACAGAATTG GACATAGATNTGTGCATGGTGTTTCAA TAATAGTAG TATACATCACGTGTGACTA TCCAGAC AACCCAGTGAATTACCAC AC ACTA GGAATAAAAACTG ATGTGCTTTGCTTGGATTTG ACGTCATTTAGGCGTA                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                           ]
[+] EMBL CD161760             [                                                     CTTTAACAACAAATCGTATGACAGTTGTTCAATGTTATTTTGATGAGAAATTAAC CCAAAACACTGATCAATTACCAAAACTGAAAGATTTAAATCACAGAATTG GACATAGATTTGTGCATGGTGTTTCAATTAATAGTAGTTATACATCACGTGTGACTATTCCAGACAAACCAAGTGAATTACCACAACAACTAGGGAAT AAAACTGAATGTGCTTTGCTTGGATTTGTACGTCATTTAGGCGTAA                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                          ]
[+] EMBL CD161670             [                                                     CTTTAACAACAAATCGTATGACAGTTGTTCAATGTTATTTTGGTGAGAAATTAAC CCAAAACACTGATCAATTACCAAAACTGAAAGATTTAAATCACAGAATTG GACATAGATTTGTGCATGGTGTTTCAATTAATAGTAGTTATACATCACGTGTGACTATTCCAGACAAACCAAGTGAATTACCACAACAACTAGGGAAT AAAACTGAATGTGCTTTGCTTGGATTTGTACGTCATTTAGGCGTAA                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                          ]
[+] EMBL CD161735             [                                                     CTTTAACAACAAATCGTATGACAGTTGTTCAATGTTATTTTGGTGAGAAATTAAC CCAAAACACTGATCAATTACCAAAACTGAAAGATTTAAATCACAGAATTG GACATAGATTTGTGCATGGTGTTTCAATTAATAGTAGTTATACATCACGTGTGACTATTCCAGACAAACCAAGTGAATTACCACAACAACTAGGGAAT AAAACTGAATGTGCTTTGCTTGGATTTGTACGTCATTTAGGCGTAA                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                          ]
[+] EMBL CD161749             [                                                     CTTTAACAACAAATCGTATGACAGTTGTTCAATGTTATTTTGGTGAGAAATTAAC CCAAAACACTGATCAATTACCAAAACTGAAAGATTTAAATCACAGAATTG GACATAGATTTGTGCATGGTGTTTCAATTAATAGTAGTTATACATCACGTGTGACTATTCCAGACAAACCAAGTGAATTACCACAACAACTAGGGAAT AAAACTGAATGTGCTTTGCTTGGATTTGTACGTCATTTAGGCGTAA                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                          ]
[+] EMBL CD161753             [                                                     CTTTAACAACAAATCGTATGACAGTTGTTCAATGTTATTTTGGTGAGAAATTAAC CCAAAACACTGATCAATTACCAAAACTGAAAGATTTAAATCACAGAATTG GACATAGATTTGTGCATGGTGTTTCAATTAATAGTAGTTATACATCACGTGTGACTATTCCAGACAAACCAAGTGAATTACCACAACAACTAGGGAAT AAAACTGAATGTGCTTTGCTTGGATTTGTACGTCATTTAGGCGTAA                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                          ]
[+] EMBL CD161766             [                                                     CTTTAACAACAAATCGTATGACAGTTGTTCAATGTTATTTTGGTGAGAAATTAAC CCAAAACACTGATCAATTACCAAAACTGAAAGATTTAAATCACAGAATTG GACATAGATTTGTGCATGGTGTTTCAATTAATAGTAGTTATACATCACGTGTGACTATTCCAGACAAACCAAGTGAATTACCACAACAACTAGGGAAT AAAACTGAATGTGCTTTGCTTGGATTTGTACGTCATTTAGGCGTAA                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                          ]
[+] EMBL CD161678             [                                                     CTTTAACAGCAAATCGTATGACGGTTGTTCAATGTTATTTTGGTGAGAAATTAAC CCAAAACACTGATCAATTACCAAAACTGAAAGATTTAAATCACAGAATTG GACATAGATTTGTGCATGGTGTTTCAATTAATAGTAGTTATACATCACGTGTGACTATTCCAGACAAACCAAGTGAATTACCACAACAACTAGGGAAT AAAACTGAATGTGCTTTGCTTGGATTTGTACGTCATTTAGGCGTAA                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                          ]
[+] EMBL CD161722             [                                                     CTTTAACAACAAATCGTATGACAGTTGTTCAATGTTATTTTGGTGAGAAATTAAC CCAAAACACTGATCAATTACCAAAACTGAAAGATTTAAATCACAGAATTG GACATAGATTTGTGCATGGTGTTTCAATTAATAGTAGTTATACATCACGTGTGACTATTCCAGACAAACCAAGTGAATTACCACAACAACTAGGGAGT AAAACTGAATGTGCTTTGCTTGGATTTGTACGTCATTTAGGCGTAA                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                          ]
[+] EMBL CD161748             [                                                     CTTTAACAACAAATCGTATGACAGTTGTTCAATGTTATTTTGGTGAGAAATTAAC CCAAAACACTGATCAATTACCAAAACTGAAAGATTTAAATCACAGAATTG GACATAGATTTGTGCATGGTGTTTCAATTAATAGTAGTTATACATCACGTGTGACTATTCCAGACAAACCAAGTGAATTACCACAACAACTAGGGAAT AAAACTGAATGTGCTCTGCTTGGATTTGTACGTCATTTAGGCGTAA                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                          ]
[+] EMBL CD201332             [                                                                                                                                                                                                  TAGTTATACATCACGTGTGACTATTCCAGACAAACCAAGTGAATTATCACAACAACTAGGGAAT AAAACTGAATGTGCTTTGCTTGGATTTGTACGTCATTTAGGCGTAAATTATGAGGATATACGAGAACGTTGGCCACAAGAAAGTTTGGTGAAAGTATTCACATTTAATTCTTTACGAAAGTCAATGAGTACAGTGATTAAAAACTTGGAACCTGATAGGCCAGGTTATACTGTTTTCACTAAAGGTGCTTCCGAAATGGTTTTGAAAAAATGTAGTTTCATCCTCGATGCTAATGGTGATCCTAAGCCATTCACTAAAGCTGATCAAGATAATTTAGTTCGAGATGTAATTGAACAAATGGCTAGTGATGGATTACGTACCATAGGTATTGCATACAAAAGTTATATAGATCCTGCTGTTGGGTTATTTCCGAATGAGGTTCCTTTAAATCGTGGACAGACACCTGATTTTGATGATGAAGATATTATCGTCTCTGATTTAACATGTATTGGAATAGTANGAATTGAAGATCCTGnt                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                           ]
[-] EMBL CD128912             [                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                        TATACTGTTTTCACTAAAGGTGCTTCCGAAATGGTTTTGAAAAAATGTAGTTTCATCCTCGATGCTAATGGTGATCTTAAGCCATTCACTAAAGCTGATCAAGATAATTTAGTTCGAGATGTAATTGAACAAATGGCTAGTGTTGGATTACGTACCATAGGTATTGCATACAAAAGTTATATAGATCCTGCTGTTGGGTTATTTCCGAATGAGGTTCCTTTAAATCGTGGACAGACACCTGATTTTGATGATGAAGATATTATCGTCTCTGATTTAACATGTATTGGAATAGTAGGAATTGAAGATCCTGTAAGACCAGAGGTTCCTGCAGCTATACGAAAGTGTCAACGTGCCGGGATCACTGTACGTATGGTAACCGGTGATAATGTTAACACAGCAAGATCGATAGCTGCTAAATGGAGT TTTTTAAGCCAGGTGAgt                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                         ]
[-] EMBL CD147892             [                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                            TGCATACAAAAGTTATATAGATCCTGCTGTTGGGTTATTTCCGAATGAGGTTCCTTTAAATCGTGGACAGACACCTGATTTTGATGATGAAGATATTATCGTCTCTGATTTAACATGTATTGGAATAGTAGGAATTGAAGATCCTGTAAGACCAGAGGTTCCTGCAGCTATACGAAAGTGTCAACGTGCCGGGATCACTGTACGTATGGTAACCGGTGATAATGTTAACACAGCAAGATCGATAGCTGCTAAATGTGGTATTCTTAAGCCAGGTGATAACTATATTGTGTTAGAAGGAAAAGAATTCAATGCTCGTGTACGTGATCCACGTACAAATCGTGTTAGACAAGATCTTATG                                                                                                                                                                                                                                                         ]
[+] EMBL CD201609             [                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                         TATATAGATCCTGCTGTTGGGTTATTTCCGAATGAGGTTCCTTTAAATCGTGGACAGACACCTGATTTTGATGATGAAGATATTATCGTCTCTGATTTAACATGTATTGGAATAGTAGGAATTGAAGATCCTGTAAGACCAGAGGTTCCTGCAGCTATACGAAAGTGTCAACATGCCGGGATCACTGTACGTATGGTAACCGGTGATAATGTTAACACAGCAAGATCGATAGCTGCTAAATGTGGTATTCTTAAGCCAGGTGATAACTATATTGTGTTAGAAGGAAAAGAATTCAATGCTCGTGTACGTGATCCACGTACAAATCGTGTTAGACAAGATCTTATGGATCAAGTATGGCCACAGTTAAGAGTTCTTGCACGTTCCTCACCACAGGATAAATATACCTTAGTAAGTGGAATTATAGACAGTCATATTTCAACTCGTCGTGAAGTTGTTGCTGTAACTGGAGATGGTACAAATGATGGACCTGCATTGAAGAAGGCTGATGTTGGTTTCGCTATGGGTATAGCAGGAACAGATGTTGCAAAAGAAGCTTCAGATATTATATTAACGGACGANTACTNNTACAGTATC]


>consensus_10740#0 GCATGTGAAACAATGGGTAATGCAACAGCCATCTGTTCTGTCAAAACAGGCACTTTAACA ACAAATCGTATGACAGTTGTTCAATGTTATTTTGGTGAGAAATTAACCCAAAACACTGAT CAATTACCAAAACTGAAAGATTTAAATCACAGAATTGGACATAGATTTGTGCATGGTGTT TCAATTAATAGTAGTTATACATCACGTGTGACTATTCCAGACAAACCAAGTGAATTACCA CAACAACTAGGGAATAAAACTGAATGTGCTTTGCTTGGATTTGTACGTCATTTAGGCGTA AATTATGAGGATATACGAGAACGTTGGCCACAAGAAAGTTTGGTGAAAGTATTCACATTT AATTCTTTACGAAAGTCAATGAGTACAGTGATTAAAAACTTGGAACCTGATAGGCCAGGT TATACTGTTTTCACTAAAGGTGCTTCCGAAATGGTTTTGAAAAAATGTAGTTTCATCCTC GATGCTAATGGTGATCCTAAGCCATTCACTAAAGCTGATCAAGATAATTTAGTTCGAGAT GTAATTGAACAAATGGCTAGTGATGGATTACGTACCATAGGTATTGCATACAAAAGTTAT ATAGATCCTGCTGTTGGGTTATTTCCGAATGAGGTTCCTTTAAATCGTGGACAGACACCT GATTTTGATGATGAAGATATTATCGTCTCTGATTTAACATGTATTGGAATAGTAGGAATT GAAGATCCTGTAAGACCAGAGGTTCCTGCAGCTATACGAAAGTGTCAACGTGCCGGGATC ACTGTACGTATGGTAACCGGTGATAATGTTAACACAGCAAGATCGATAGCTGCTAAATGT GGTATTCTTAAGCCAGGTGATAACTATATTGTGTTAGAAGGAAAAGAATTCAATGCTCGT GTACGTGATCCACGTACAAATCGTGTTAGACAAGATCTTATGGATCAAGTATGGCCACAG TTAAGAGTTCTTGCACGTTCCTCACCACAGGATAAATATACCTTAGTAAGTGGAATTATA GACAGTCATATTTCAACTCGTCGTGAAGTTGTTGCTGTAACTGGAGATGGTACAAATGAT GGACCTGCATTGAAGAAGGCTGATGTTGGTTTCGCTATGGGTATAGCAGGAACAGATGTT GCAAAAGAAGCTTCAGATATTATATTAACGGACGANTACTNNTACAGTATC



clustalw multiple alignements is not computed in this case


Copyright Thu Nov 6 12:32:27 CET 2003 Hubert Wassner    (hubert.wassner@noos.fr)