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Schistosoma mansoni
cluster # 10743 cluster # 10743       Sequences # 21       consensus # 1


see consensus multiple alignment with clustalw

Direct access to contigs :
consensus_10743#0 length = 1469 sequences # 21  

consensusID : consensus_10743#0
NCBI blastX ! send the sequence to the NCBI site !
NCBI blastN ! send the sequence to the NCBI site !
Sequences nbr = 21
consensus length = 1469
fasta sequence
                              [AGCGAGCATGGGCCAATGCTGCTGTAAATAAAATTCAGGGAACCACAAGCAATGATAGTTATCCTCATGCCGAGAAGATTCTTTCTGACTGCTTTCTGGAGTACGGAAGACAATTGAGTCAGCAATCCGATTTGAGTCTGGCACTTACACAATGTGGAGAAGCATACAATAAAA-TTGTTGAATCAAAAAATCAATCAGTAGATGAAACAAAATCTGGCTATTTAAAACTGATTTCTGAGAAGTTACATCGAGATATCAGGAAAATATCGGCACTTCGAAAAAAGG-TTGAAAATAAACGATTAACGCTCGCTCATAGAAAAAATGTTCTAGAAAGAACCAAAGCTCAACCAGATCAAGCATTTGAGGAGTCTAGAATTCAGTATGAAGACGCA-TTGGCTGCTAGTACAACAGCTATGTCGAACTTTTTA-GATA-CTGAAGTTGAACAGATCAAGACTTTGTCTAATTTCGTTAATGCTCAATTAAGCTTCTATCAGGATGCTGCTCGAATTTTATCCGATCTACATGGAGGACTTGAAATGAGATTGTTGGATGCGCGTGATCATGCAAGACGACAAACTCCATATCCTA-TTAGTTCAAATAATGCTTTACCAGATATACCTTCATTATATCACGATTCTGCAAATTTCCAAATGAAGCCAAAATACGATGATCATTCAAACAGAACACCTCAATGTGTTGCCTTGTATGATTTCAACGCTGAAAGTCCTTTTGAACTATCTTTTTGTAAGGGCGATTCGATTAACTTAATTGAACAGATTGATGATAACTGG-TATTTGGGTGAGCTAAAT-GGACAAGAAGGTCATTTCCCAACAAATTTCGTCCATGTAACTTGTCCTTTACCATGAAATTCGTTCTTTTTTAATGCAGTCGATTTTTCAGTTCCTTCATGATGAAGTTTTATTTCCAGTTTAAGCCTCATCTAACCCTCCTCCATGCTATCACTGTTAGCATGCTGTTCTTTTTTTAATTTTCTCTCTCTTTGCTTATGATTCGTTAACGAGTACACACTTGAATATACACATACAAGTTACACTAAATGATA--GACTATTACAAATGATGTATTTATCTAGTTTCCATTAGAATTAAGACAATAATTTCAAAGTTTTTACCAACAGAGTAATTATTCTATCCCTTGCTCTATTCTTACGTCTTCCATCTAATTTAATTGTGCCTGAAACATTATCATTAATTAAGTGCCATTGTATTTTATAAATAACCGGTTACCTGTTTGTTTATTTCGGTATTTATTATGTGAAATTATTCTTTTTATCTAATTTTCTTTTTGTTTTTCGACATTTTATTACGGCAAGCCTTTATTTTGTTAATCATGTCCAACGACTATATTTTCTTTTTTTAGGATTGTTTACGTAATGCCAGAATTTTTTTATTTTTCTCACAGGTGCATATACTTTTTTAGCAAATCATTTTAGTTTATACTAATAATGCCC]

[+] EMBL CD126159             [AGCGAGCATGGGCCAATGCTGCTGT  AT AAATTCAGGCAACCACAAGCAATGATAGTTATCCTCATGCCGAGAAGATTCTTTCTGACTGCTTTCTGGAGTACGGAAGACAATTGAGTCAGCAATCCGATTTGAGTCTGGCACTTACACAATGTGGAGAAGCATACAATAAAA TTGTTGAATCAAAAAATCAATCAGTAGATGAAACAAAATCTGGCTATTTAAAACTGATTTCTGAGAAGTTACATCGAGATATCAGGAAAATATCGGCACTTCGAAAAAAGG TTGAAAA                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                 ]
[+] EMBL CD125948             [                  CTGCTGT AATAAAATTCAGGGAACCACAAGCAATGATAGTTATCCTCATGCCGAGAAGATTCTTTCTGACTGCTTTCTGGAGTACGGAAGACAATTGAGTCAGCGATCCGATTTGAGTCTGGCACTTACACAATGTGGAGAAGCATACAATAAAA TTGTTGAATCAAAAAATCAATCAGTAGATGAAAGAAAATCTGGCTATTTATAACTGATTTCTGAGAAGTTACATCGAGATATCAGGAAAATATCGGCACTTCGAAAAAAGG TTGAAAATAAACGATTAA                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                      ]
[+] EMBL CD062951             [                  CTGCTGTAAATAAAATTCAGGGAACCACAAGCAATGATAGTTATCCTCATGCCGAGAAGATTCTTTCTGACTGCTTTCTGGAGTACGGAAGACAATTGAGTCAGCAATCCGATTTGAGTCTGGCACTTACACAATGTGGAGAAGCATACAATAAAA TTGTTGAATCAAAAAATCAATCAGTAGATGAAACAAAATCTGGCTATTTAAAACTGATTTCTGAGAAGTTACATCGAGATATCAGGAAAATATCGGCACTTCGAAAAAAGG TTGAAAA                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                 ]
[+] EMBL CD126018             [                  CTGCTGTAAATAAAATTCA GGAACCACAAGCAATGATAGTTATCCTCATGCCGAGAAGATTCTTTCTGACTGCTTTCTGGAGTACGGAAGACAATTGAGTCAGCAATCCGATTTGAGTCTGGCACTTACACAATGTGGAGAAGCATACAATAAAA TTGTTGAATCATAAAATCAATCAGTAGATGAAACAAAATCTGGCTATTTAAAACTGATTTCTGAGAAGTTACATCGAGATATCAGGAAAATATCGGCACTTCGAAAAAAGG TTGAAAA                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                 ]
[+] EMBL CD126007             [                  CTGCTGTAAATAAAATTCAGGTAACCACAAGCAATGATAGTTATCCTCATGCCGAGAAGATTCTTTCTGACTGCTTTCTGGAGTACGGAAGACAATTGGGTCAGCAATCCGATTTGCGTCT                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                            ]
[-] EMBL CD062869             [                   TGCTGTAAATAAAATTCAGGGAACCACAAGCAATGATAGTTATCCTCATGCCGAGAAGATTCTTTCTGACTGCTTTCTGGAGTACGGAAGACAATTGAGTCAGCAATCCGATTTGAGTCTGGCACTTACACAATGTGGAGAAGCATACAATAAAA TTGTTGAATCAAAAAATCAATCAGTAGATGAAACAAAATCTGGCTATTTAAAACTGATTTCTGAGAAGTTACATCGAGATATCAGGAAAATATCGGCACTTCGAAAAAAGG TTGAAAATAAACGATTAACGCTCGCTCATAGAAAAAATGTTCTAGAAAGAACCAAAGCTCAACCAGATCAAGCATCTGAGGAGTCTAGAATTCAGTATGAAGACGCA TTGGCTGCTAGTACAACAGCTATGTCGAACTTTTTA GATA CTAAAGTTGAACAGATCAAGACTTTGTCTA                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                    ]
[-] EMBL CD125934             [                   TGCTGTAAATAAAATTCAGGGAACCACAAGCAATGATAGTTATCCTCATGCCGAGAAGATTCTTTCTGACTGCTTTCTGGAGTACGGAAGACAATTGAGTCAGCAATCCGATTTGAGTCTGGCACTTACACAATGTGGAGAAGCATACAATAAAA TTGTTGAATCAAGAAATCAATCAGTAGATGAAACAAAATCTGGCTATTTAAAACTGATTTCTGAGAAGTTACATCGAGATATCAGGAAAATATCGGCACTTCGAAAAAAGG TTGAAAATAAACGATTAACGCTCGCTCATAGAAAAAATGTTCTAG                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                           ]
[-] EMBL CD126126             [                   TGCTGTAAATAAAATTCAGGGAACCACAAGCAATGATAGTTATCCTCATGCCGAGAAGATTCTTTCTGACTGCTTTCTGGAGTACGGAAGACAATTGAGTCAGCAATCCGATTTGAGTCTGGCACTTACACAATGTGGAGAAGCATACAATAAAACTTGTTGAATCAAAAAATCAATCAGTAGATGAAACAAAATCTGGCTATTTAAAACTGGTTTCTGAGAAGTTACATCGAGATATCAGGAAAATATCGGCACTTCGAAAAAAGGATTGAAAATAAACGATTAACGCTCGCTCATAGAAAAAATGTTCTAGAAAGAACCAAAGCTCAACCAGATCAAGCATTTGAGGAGTCTAGAATTCAGTATGAAGACGCACTTGGCTGCTAGTACACCAGCTATGTCGAACTTATTACGATATCTGAAGTTGAACAGATC AGACTTAGTCTAATTTCGTTAATG TCA  TAAGC                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                             ]
[+] EMBL CD119329             [                             accgtctAGGGAACCACATGCAAGGATAGTTATCCTCATGCCGAGAAGATTCTTTCTGACTGCTTTCTGGAGTACGGAAGACAATTGAGTCAGCAATCCGATTTGAGTCTGGCACTTACACAATGGGGAGAAGCATACAATAAAA TTGTTGAATCAAAA                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                          ]
[-] EMBL CD119323             [                                               AGCAATGATAGTTATCCTCATGCCGAGAAGATTCTTTCTGACTGCTTTCTGGAGTACGGAAGACAATTGAGTCAGCAATCCGATTTGAGTCTGGCACTTACACAATGTGGAGAAGCATACAATAAAA TTGTTGAATCAAAAA                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                         ]
[+] EMBL CD126015             [                                                                                                                                                                 GCATACAATACAA TTGTTGAATCAAAAAATCAATCAGTAGATGAAACAAAATCTGGCTATTTAAAACTGATTTCTGAGAAGTTACATCGAGATATCAGGAAAATATCGGCACTTCGAAAAAAGG TTGAAAATAAACGATTAACGCTCGCTCATAGAAAAAATGTTCTAGAA                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                         ]
[+] EMBL CD080151             [                                                                                                                                                                     ACAATAAAA TTGTTGAATCAAAAAATCAATCAGTAGATGAAACAAAATCTGGCTATTTAAAACTGATTTCTGAGAAGTTACATCGAGATATCAGGAAAATATCGGCACTTCGAAAAAAGG TTGAAAATAAACGATTAACGCTCGCTCATAGAAAAAATGTTCTAGAAAGAACCAAAGCTCAACCAGATCAAGCATTTGAGGAGTCTAGAATTCAGTATGAAGACGCA TTGGCTGCTAGTACAACAGCTATGTCGAACTTTTTA GATA CTGAAGTTGAACAGATCAAGACTTTGTCTAATTTCGTTAATGCTCAATTAAGCTTCTATCAGGATGCTGCTCGAATTTTATCCGATCTACATGGAGGACTTGAAATGAGATTGTTGGATGCGCGTGATCATGCAAGACGACAAACTCCATATCCTA TTAGTTCAAATAATGCTTTACCAGATATACCTTCATTATATCACGATTCTGCAAATTTCCAAATGAAGCCAAAATACGATGATCATTCAAACAGAACACCTCAATGTGTTGCCTTGTATGATTTCAACGCTGAAAGTCCTTTTGAACTATCTTTTTGTAAGGGCGATTCGATTAACTTAATTGAACAGATTGATGATAACTGGNTATTTGGGTGAGCTAAATGGGAC AGAAGGTCATTTCCC ACANATTTCGTCCATGTA                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                               ]
[-] EMBL CD129608             [                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                   ATCAAGACTTTGTCTAATTTCGTTAATGCTCAATTAAGCTTCTATCAGGATGCTGCTCGAATTTTATCCGATCTACATGGAGGACTTGAAATGAGATTGTTGGATGCGTGTGATCATGCAAGCTGACAAACCCCATATCCTA TTAGTTCAAATAATGCTTTATCAGATATA                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                        ]
[+] EMBL CD067194             [                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                            caagagaGAAGCTGCTCTAATTTTATCCCATCTACATGGAGGACTTGAAATGATATTGTTGGATGCGCCTGATCATGCTAGACGACCAACTCCATATCCTA TTACATCAAATAATGCTTTACCAGATATACCTTCAT                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                 ]
[-] EMBL CD182510             [                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                          TAT CTATTTAGTTCAAATAATGCTTTACCAGATATACCTTCATTATATCACGATTCTGCAAATTTCCAAATGAAGCCAAAATACGATGATCATTCAAACAGAACACCTCAATGTGTTGCCTTGTATGATTTCAACGCTGAAAGTCCTTTTGAACTATCTTTTTGTAAGGGCGATTCGATTAACTTAATTGAACAGATTGATGATAACTGG TATTTTGGTGAGCTAAAT GGACAAGAAGGTCATTTCCCAACAAATTTCGTCCATGTAACTTGTCCTTTACCATGAAATTCGTTCTTTTTTAATGCAGTCGATTTTTCAGTTCCTTCATGATGAAGTTTTATTTCCAGTTTAAGCCT                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                      ]
[+] EMBL CD199676             [                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                              AAATGAAGCCAAAATACGATGATCATTCAAACAGAACACCTCAATGTGTTGCCTTGTATGATTTCGACGCTGAAAGTCCTTTTGAACTATCTTTTTGTAAGGGCGATTCGATTAACTTAATTGAACAGATTGATGATAACTGG TATTTGGGTGAGCTAAAT GGACAAGAAGGTCATTTCCCAACAAATTTCGTCCATGTAACTTGTCCTTTACCATGAAATTCGTTCTTTTTTAATGCAGTCGATTTTTCAGTTCCTTCATGCTGAA                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                            ]
[-] EMBL CD199765             [                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                               AATGAAGCCATAATACGATGATCATTCAAACAGAACACCTCAATGTGTTGCCTTGTATGATTTCAACGCTGAAAGTCCTTTTGAACTATCTTTTTGTAAGGGCGATTCGATTAACTTAATTGAACAGATTGATGATAACTGG TATTTGGGTGAGCTAAAT GGACAAGAAGGTCATTTCCCAACAAATTTCGTCCATGTAACTTGTCCTTTACCATGAAATTCGTTCTTTTTTAATGCAGTCGATTTTTCAGTTCCTTCATGATGAAG                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                           ]
[-] EMBL CD199735             [                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                               AATGAAGCCAAAATACGATGATCATTCAAACAGAACACCTCAATGTGTTGCCTTGTATGATTTCAACGCTGAAAGTCCTTTTGAACTATCTTTTTGTAAGGGCGATTCGATTAACTTAATTGAACAGATTGATGATAACTGG TATTTGGGTGAGCTAAAT GGACAAGAAGGTCATTTCCCAACAAATTTCGTCCATGTAACTTGTCCTTTACCATGAAATTCGTTCTTTTTTAATGCAGTCGATTTTTCAGTTCCTTCATGATGAAG                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                           ]
[-] EMBL CD161260             [                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                         CTGG TATTTGGGTGAGCTAAAT GGACAAGAAGGTCATTTCCCAACAAATCTCGTCCATGTAACTTGTCCTTTACCATGAAATTCGTTCTTTTTTAATGCAGTCGATTTTTCAGTTCCTTCATGATGAAGTTTTATTTCCAGTTTAAGCCTCATCTAACCCTCCTCCATGCTATCACTGTTAGCATGCTGTTCTTTTTTTAATTTTCTCTCTCTTTGCTTATGATTCGTTAACGAGTACACACTTGAATATACACATACAAGTTACACTAAATGATA  GACTATTACAAATGATGTATTTATCTAGTTTCCATTAGAATTAAGACAATAATTTCAA                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                            ]
[-] EMBL CD161110             [                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                         CTGG TATTTGGGTGAGCTAAAT GGACAAGAAGGTCATTTCCCAACAAATCTCGTCCATGTAACTTGTCCTTTACCATGAAATTCGTTCTTTTTTAATGCAGTCGATTTTTCAGTTCCTTCATGATGAAGTTTTATTTCCAGTTTAAGCCTCATCTAACCCTCCTCCATGCTATCACTGTTAGCATGCTGTTCTTTTTTTAATTTTCTCTCTCTTTGCTTATGATTCGTTAACGAGTACACACTTGAATATACACATACAAGTTACACTAAATGATA  GACTATTACAAATGATGTATTTATCTAGTTTCCATTAGAATTAAGACAATAATTTCAA                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                            ]
[+] EMBL AW061423             [                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                           TCTCTTTGCTTATGATTCGTTAACGAGTACACACTTGAATATACACATACAAGTTACACTAAATGATABMGACTATTACAAATGATGTATTTATCTAGTTTCCATTAGAATTAAGACAATAATTTCAAAGTTTTTACCAACAGAGTAATTATTCTATCCCTTGCTCTATTCTTACGTCTTCCATCTAATTTAATTGTGCCTGAAACATTATCATTAATTAAGTGCCATTGTATTTTATAAATAACCGGTTACCTGTTTGTTTATTTCGGTATTTATTATGTGAAATTATTCTTTTTATCTAATTTTCTTTTTGTTTTTCGACATTTTATTACGGCAAGCCTTTATTTTGTTAATCATGTCCAACGACTATATTTTCTTTTTTTAGGATTGTTTACGTAATGCCAGAATTTTTTTATTTTTCTCACAGGTGCATATACTTTTTTAGCAAATCATTTTAGTTTATACTAATAATGCCC]


>consensus_10743#0 AGCGAGCATGGGCCAATGCTGCTGTAAATAAAATTCAGGGAACCACAAGCAATGATAGTT ATCCTCATGCCGAGAAGATTCTTTCTGACTGCTTTCTGGAGTACGGAAGACAATTGAGTC AGCAATCCGATTTGAGTCTGGCACTTACACAATGTGGAGAAGCATACAATAAAATTGTTG AATCAAAAAATCAATCAGTAGATGAAACAAAATCTGGCTATTTAAAACTGATTTCTGAGA AGTTACATCGAGATATCAGGAAAATATCGGCACTTCGAAAAAAGGTTGAAAATAAACGAT TAACGCTCGCTCATAGAAAAAATGTTCTAGAAAGAACCAAAGCTCAACCAGATCAAGCAT TTGAGGAGTCTAGAATTCAGTATGAAGACGCATTGGCTGCTAGTACAACAGCTATGTCGA ACTTTTTAGATACTGAAGTTGAACAGATCAAGACTTTGTCTAATTTCGTTAATGCTCAAT TAAGCTTCTATCAGGATGCTGCTCGAATTTTATCCGATCTACATGGAGGACTTGAAATGA GATTGTTGGATGCGCGTGATCATGCAAGACGACAAACTCCATATCCTATTAGTTCAAATA ATGCTTTACCAGATATACCTTCATTATATCACGATTCTGCAAATTTCCAAATGAAGCCAA AATACGATGATCATTCAAACAGAACACCTCAATGTGTTGCCTTGTATGATTTCAACGCTG AAAGTCCTTTTGAACTATCTTTTTGTAAGGGCGATTCGATTAACTTAATTGAACAGATTG ATGATAACTGGTATTTGGGTGAGCTAAATGGACAAGAAGGTCATTTCCCAACAAATTTCG TCCATGTAACTTGTCCTTTACCATGAAATTCGTTCTTTTTTAATGCAGTCGATTTTTCAG TTCCTTCATGATGAAGTTTTATTTCCAGTTTAAGCCTCATCTAACCCTCCTCCATGCTAT CACTGTTAGCATGCTGTTCTTTTTTTAATTTTCTCTCTCTTTGCTTATGATTCGTTAACG AGTACACACTTGAATATACACATACAAGTTACACTAAATGATAGACTATTACAAATGATG TATTTATCTAGTTTCCATTAGAATTAAGACAATAATTTCAAAGTTTTTACCAACAGAGTA ATTATTCTATCCCTTGCTCTATTCTTACGTCTTCCATCTAATTTAATTGTGCCTGAAACA TTATCATTAATTAAGTGCCATTGTATTTTATAAATAACCGGTTACCTGTTTGTTTATTTC GGTATTTATTATGTGAAATTATTCTTTTTATCTAATTTTCTTTTTGTTTTTCGACATTTT ATTACGGCAAGCCTTTATTTTGTTAATCATGTCCAACGACTATATTTTCTTTTTTTAGGA TTGTTTACGTAATGCCAGAATTTTTTTATTTTTCTCACAGGTGCATATACTTTTTTAGCA AATCATTTTAGTTTATACTAATAATGCCC



clustalw multiple alignements is not computed in this case


Copyright Thu Nov 6 12:32:27 CET 2003 Hubert Wassner    (hubert.wassner@noos.fr)