These datas are free for academic use only, please contact me for any other use. Schistosoma mansoni see consensus multiple alignment with clustalw Direct access to contigs :
consensusID : consensus_10743#0 NCBI blastX ! send the sequence to the NCBI site ! NCBI blastN ! send the sequence to the NCBI site ! Sequences nbr = 21 consensus length = 1469 fasta sequence [AGCGAGCATGGGCCAATGCTGCTGTAAATAAAATTCAGGGAACCACAAGCAATGATAGTTATCCTCATGCCGAGAAGATTCTTTCTGACTGCTTTCTGGAGTACGGAAGACAATTGAGTCAGCAATCCGATTTGAGTCTGGCACTTACACAATGTGGAGAAGCATACAATAAAA-TTGTTGAATCAAAAAATCAATCAGTAGATGAAACAAAATCTGGCTATTTAAAACTGATTTCTGAGAAGTTACATCGAGATATCAGGAAAATATCGGCACTTCGAAAAAAGG-TTGAAAATAAACGATTAACGCTCGCTCATAGAAAAAATGTTCTAGAAAGAACCAAAGCTCAACCAGATCAAGCATTTGAGGAGTCTAGAATTCAGTATGAAGACGCA-TTGGCTGCTAGTACAACAGCTATGTCGAACTTTTTA-GATA-CTGAAGTTGAACAGATCAAGACTTTGTCTAATTTCGTTAATGCTCAATTAAGCTTCTATCAGGATGCTGCTCGAATTTTATCCGATCTACATGGAGGACTTGAAATGAGATTGTTGGATGCGCGTGATCATGCAAGACGACAAACTCCATATCCTA-TTAGTTCAAATAATGCTTTACCAGATATACCTTCATTATATCACGATTCTGCAAATTTCCAAATGAAGCCAAAATACGATGATCATTCAAACAGAACACCTCAATGTGTTGCCTTGTATGATTTCAACGCTGAAAGTCCTTTTGAACTATCTTTTTGTAAGGGCGATTCGATTAACTTAATTGAACAGATTGATGATAACTGG-TATTTGGGTGAGCTAAAT-GGACAAGAAGGTCATTTCCCAACAAATTTCGTCCATGTAACTTGTCCTTTACCATGAAATTCGTTCTTTTTTAATGCAGTCGATTTTTCAGTTCCTTCATGATGAAGTTTTATTTCCAGTTTAAGCCTCATCTAACCCTCCTCCATGCTATCACTGTTAGCATGCTGTTCTTTTTTTAATTTTCTCTCTCTTTGCTTATGATTCGTTAACGAGTACACACTTGAATATACACATACAAGTTACACTAAATGATA--GACTATTACAAATGATGTATTTATCTAGTTTCCATTAGAATTAAGACAATAATTTCAAAGTTTTTACCAACAGAGTAATTATTCTATCCCTTGCTCTATTCTTACGTCTTCCATCTAATTTAATTGTGCCTGAAACATTATCATTAATTAAGTGCCATTGTATTTTATAAATAACCGGTTACCTGTTTGTTTATTTCGGTATTTATTATGTGAAATTATTCTTTTTATCTAATTTTCTTTTTGTTTTTCGACATTTTATTACGGCAAGCCTTTATTTTGTTAATCATGTCCAACGACTATATTTTCTTTTTTTAGGATTGTTTACGTAATGCCAGAATTTTTTTATTTTTCTCACAGGTGCATATACTTTTTTAGCAAATCATTTTAGTTTATACTAATAATGCCC] [+] EMBL CD126159 [AGCGAGCATGGGCCAATGCTGCTGT AT AAATTCAGGCAACCACAAGCAATGATAGTTATCCTCATGCCGAGAAGATTCTTTCTGACTGCTTTCTGGAGTACGGAAGACAATTGAGTCAGCAATCCGATTTGAGTCTGGCACTTACACAATGTGGAGAAGCATACAATAAAA TTGTTGAATCAAAAAATCAATCAGTAGATGAAACAAAATCTGGCTATTTAAAACTGATTTCTGAGAAGTTACATCGAGATATCAGGAAAATATCGGCACTTCGAAAAAAGG TTGAAAA ] [+] EMBL CD125948 [ CTGCTGT AATAAAATTCAGGGAACCACAAGCAATGATAGTTATCCTCATGCCGAGAAGATTCTTTCTGACTGCTTTCTGGAGTACGGAAGACAATTGAGTCAGCGATCCGATTTGAGTCTGGCACTTACACAATGTGGAGAAGCATACAATAAAA TTGTTGAATCAAAAAATCAATCAGTAGATGAAAGAAAATCTGGCTATTTATAACTGATTTCTGAGAAGTTACATCGAGATATCAGGAAAATATCGGCACTTCGAAAAAAGG TTGAAAATAAACGATTAA ] [+] EMBL CD062951 [ CTGCTGTAAATAAAATTCAGGGAACCACAAGCAATGATAGTTATCCTCATGCCGAGAAGATTCTTTCTGACTGCTTTCTGGAGTACGGAAGACAATTGAGTCAGCAATCCGATTTGAGTCTGGCACTTACACAATGTGGAGAAGCATACAATAAAA TTGTTGAATCAAAAAATCAATCAGTAGATGAAACAAAATCTGGCTATTTAAAACTGATTTCTGAGAAGTTACATCGAGATATCAGGAAAATATCGGCACTTCGAAAAAAGG TTGAAAA ] [+] EMBL CD126018 [ CTGCTGTAAATAAAATTCA GGAACCACAAGCAATGATAGTTATCCTCATGCCGAGAAGATTCTTTCTGACTGCTTTCTGGAGTACGGAAGACAATTGAGTCAGCAATCCGATTTGAGTCTGGCACTTACACAATGTGGAGAAGCATACAATAAAA TTGTTGAATCATAAAATCAATCAGTAGATGAAACAAAATCTGGCTATTTAAAACTGATTTCTGAGAAGTTACATCGAGATATCAGGAAAATATCGGCACTTCGAAAAAAGG TTGAAAA ] [+] EMBL CD126007 [ CTGCTGTAAATAAAATTCAGGTAACCACAAGCAATGATAGTTATCCTCATGCCGAGAAGATTCTTTCTGACTGCTTTCTGGAGTACGGAAGACAATTGGGTCAGCAATCCGATTTGCGTCT ] [-] EMBL CD062869 [ TGCTGTAAATAAAATTCAGGGAACCACAAGCAATGATAGTTATCCTCATGCCGAGAAGATTCTTTCTGACTGCTTTCTGGAGTACGGAAGACAATTGAGTCAGCAATCCGATTTGAGTCTGGCACTTACACAATGTGGAGAAGCATACAATAAAA TTGTTGAATCAAAAAATCAATCAGTAGATGAAACAAAATCTGGCTATTTAAAACTGATTTCTGAGAAGTTACATCGAGATATCAGGAAAATATCGGCACTTCGAAAAAAGG TTGAAAATAAACGATTAACGCTCGCTCATAGAAAAAATGTTCTAGAAAGAACCAAAGCTCAACCAGATCAAGCATCTGAGGAGTCTAGAATTCAGTATGAAGACGCA TTGGCTGCTAGTACAACAGCTATGTCGAACTTTTTA GATA CTAAAGTTGAACAGATCAAGACTTTGTCTA ] [-] EMBL CD125934 [ TGCTGTAAATAAAATTCAGGGAACCACAAGCAATGATAGTTATCCTCATGCCGAGAAGATTCTTTCTGACTGCTTTCTGGAGTACGGAAGACAATTGAGTCAGCAATCCGATTTGAGTCTGGCACTTACACAATGTGGAGAAGCATACAATAAAA TTGTTGAATCAAGAAATCAATCAGTAGATGAAACAAAATCTGGCTATTTAAAACTGATTTCTGAGAAGTTACATCGAGATATCAGGAAAATATCGGCACTTCGAAAAAAGG TTGAAAATAAACGATTAACGCTCGCTCATAGAAAAAATGTTCTAG ] [-] EMBL CD126126 [ TGCTGTAAATAAAATTCAGGGAACCACAAGCAATGATAGTTATCCTCATGCCGAGAAGATTCTTTCTGACTGCTTTCTGGAGTACGGAAGACAATTGAGTCAGCAATCCGATTTGAGTCTGGCACTTACACAATGTGGAGAAGCATACAATAAAACTTGTTGAATCAAAAAATCAATCAGTAGATGAAACAAAATCTGGCTATTTAAAACTGGTTTCTGAGAAGTTACATCGAGATATCAGGAAAATATCGGCACTTCGAAAAAAGGATTGAAAATAAACGATTAACGCTCGCTCATAGAAAAAATGTTCTAGAAAGAACCAAAGCTCAACCAGATCAAGCATTTGAGGAGTCTAGAATTCAGTATGAAGACGCACTTGGCTGCTAGTACACCAGCTATGTCGAACTTATTACGATATCTGAAGTTGAACAGATC AGACTTAGTCTAATTTCGTTAATG TCA TAAGC ] [+] EMBL CD119329 [ accgtctAGGGAACCACATGCAAGGATAGTTATCCTCATGCCGAGAAGATTCTTTCTGACTGCTTTCTGGAGTACGGAAGACAATTGAGTCAGCAATCCGATTTGAGTCTGGCACTTACACAATGGGGAGAAGCATACAATAAAA TTGTTGAATCAAAA ] [-] EMBL CD119323 [ AGCAATGATAGTTATCCTCATGCCGAGAAGATTCTTTCTGACTGCTTTCTGGAGTACGGAAGACAATTGAGTCAGCAATCCGATTTGAGTCTGGCACTTACACAATGTGGAGAAGCATACAATAAAA TTGTTGAATCAAAAA ] [+] EMBL CD126015 [ GCATACAATACAA TTGTTGAATCAAAAAATCAATCAGTAGATGAAACAAAATCTGGCTATTTAAAACTGATTTCTGAGAAGTTACATCGAGATATCAGGAAAATATCGGCACTTCGAAAAAAGG TTGAAAATAAACGATTAACGCTCGCTCATAGAAAAAATGTTCTAGAA ] [+] EMBL CD080151 [ ACAATAAAA TTGTTGAATCAAAAAATCAATCAGTAGATGAAACAAAATCTGGCTATTTAAAACTGATTTCTGAGAAGTTACATCGAGATATCAGGAAAATATCGGCACTTCGAAAAAAGG TTGAAAATAAACGATTAACGCTCGCTCATAGAAAAAATGTTCTAGAAAGAACCAAAGCTCAACCAGATCAAGCATTTGAGGAGTCTAGAATTCAGTATGAAGACGCA TTGGCTGCTAGTACAACAGCTATGTCGAACTTTTTA GATA CTGAAGTTGAACAGATCAAGACTTTGTCTAATTTCGTTAATGCTCAATTAAGCTTCTATCAGGATGCTGCTCGAATTTTATCCGATCTACATGGAGGACTTGAAATGAGATTGTTGGATGCGCGTGATCATGCAAGACGACAAACTCCATATCCTA TTAGTTCAAATAATGCTTTACCAGATATACCTTCATTATATCACGATTCTGCAAATTTCCAAATGAAGCCAAAATACGATGATCATTCAAACAGAACACCTCAATGTGTTGCCTTGTATGATTTCAACGCTGAAAGTCCTTTTGAACTATCTTTTTGTAAGGGCGATTCGATTAACTTAATTGAACAGATTGATGATAACTGGNTATTTGGGTGAGCTAAATGGGAC AGAAGGTCATTTCCC ACANATTTCGTCCATGTA ] [-] EMBL CD129608 [ ATCAAGACTTTGTCTAATTTCGTTAATGCTCAATTAAGCTTCTATCAGGATGCTGCTCGAATTTTATCCGATCTACATGGAGGACTTGAAATGAGATTGTTGGATGCGTGTGATCATGCAAGCTGACAAACCCCATATCCTA TTAGTTCAAATAATGCTTTATCAGATATA ] [+] EMBL CD067194 [ caagagaGAAGCTGCTCTAATTTTATCCCATCTACATGGAGGACTTGAAATGATATTGTTGGATGCGCCTGATCATGCTAGACGACCAACTCCATATCCTA TTACATCAAATAATGCTTTACCAGATATACCTTCAT ] [-] EMBL CD182510 [ TAT CTATTTAGTTCAAATAATGCTTTACCAGATATACCTTCATTATATCACGATTCTGCAAATTTCCAAATGAAGCCAAAATACGATGATCATTCAAACAGAACACCTCAATGTGTTGCCTTGTATGATTTCAACGCTGAAAGTCCTTTTGAACTATCTTTTTGTAAGGGCGATTCGATTAACTTAATTGAACAGATTGATGATAACTGG TATTTTGGTGAGCTAAAT GGACAAGAAGGTCATTTCCCAACAAATTTCGTCCATGTAACTTGTCCTTTACCATGAAATTCGTTCTTTTTTAATGCAGTCGATTTTTCAGTTCCTTCATGATGAAGTTTTATTTCCAGTTTAAGCCT ] [+] EMBL CD199676 [ AAATGAAGCCAAAATACGATGATCATTCAAACAGAACACCTCAATGTGTTGCCTTGTATGATTTCGACGCTGAAAGTCCTTTTGAACTATCTTTTTGTAAGGGCGATTCGATTAACTTAATTGAACAGATTGATGATAACTGG TATTTGGGTGAGCTAAAT GGACAAGAAGGTCATTTCCCAACAAATTTCGTCCATGTAACTTGTCCTTTACCATGAAATTCGTTCTTTTTTAATGCAGTCGATTTTTCAGTTCCTTCATGCTGAA ] [-] EMBL CD199765 [ AATGAAGCCATAATACGATGATCATTCAAACAGAACACCTCAATGTGTTGCCTTGTATGATTTCAACGCTGAAAGTCCTTTTGAACTATCTTTTTGTAAGGGCGATTCGATTAACTTAATTGAACAGATTGATGATAACTGG TATTTGGGTGAGCTAAAT GGACAAGAAGGTCATTTCCCAACAAATTTCGTCCATGTAACTTGTCCTTTACCATGAAATTCGTTCTTTTTTAATGCAGTCGATTTTTCAGTTCCTTCATGATGAAG ] [-] EMBL CD199735 [ AATGAAGCCAAAATACGATGATCATTCAAACAGAACACCTCAATGTGTTGCCTTGTATGATTTCAACGCTGAAAGTCCTTTTGAACTATCTTTTTGTAAGGGCGATTCGATTAACTTAATTGAACAGATTGATGATAACTGG TATTTGGGTGAGCTAAAT GGACAAGAAGGTCATTTCCCAACAAATTTCGTCCATGTAACTTGTCCTTTACCATGAAATTCGTTCTTTTTTAATGCAGTCGATTTTTCAGTTCCTTCATGATGAAG ] [-] EMBL CD161260 [ CTGG TATTTGGGTGAGCTAAAT GGACAAGAAGGTCATTTCCCAACAAATCTCGTCCATGTAACTTGTCCTTTACCATGAAATTCGTTCTTTTTTAATGCAGTCGATTTTTCAGTTCCTTCATGATGAAGTTTTATTTCCAGTTTAAGCCTCATCTAACCCTCCTCCATGCTATCACTGTTAGCATGCTGTTCTTTTTTTAATTTTCTCTCTCTTTGCTTATGATTCGTTAACGAGTACACACTTGAATATACACATACAAGTTACACTAAATGATA GACTATTACAAATGATGTATTTATCTAGTTTCCATTAGAATTAAGACAATAATTTCAA ] [-] EMBL CD161110 [ CTGG TATTTGGGTGAGCTAAAT GGACAAGAAGGTCATTTCCCAACAAATCTCGTCCATGTAACTTGTCCTTTACCATGAAATTCGTTCTTTTTTAATGCAGTCGATTTTTCAGTTCCTTCATGATGAAGTTTTATTTCCAGTTTAAGCCTCATCTAACCCTCCTCCATGCTATCACTGTTAGCATGCTGTTCTTTTTTTAATTTTCTCTCTCTTTGCTTATGATTCGTTAACGAGTACACACTTGAATATACACATACAAGTTACACTAAATGATA GACTATTACAAATGATGTATTTATCTAGTTTCCATTAGAATTAAGACAATAATTTCAA ] [+] EMBL AW061423 [ TCTCTTTGCTTATGATTCGTTAACGAGTACACACTTGAATATACACATACAAGTTACACTAAATGATABMGACTATTACAAATGATGTATTTATCTAGTTTCCATTAGAATTAAGACAATAATTTCAAAGTTTTTACCAACAGAGTAATTATTCTATCCCTTGCTCTATTCTTACGTCTTCCATCTAATTTAATTGTGCCTGAAACATTATCATTAATTAAGTGCCATTGTATTTTATAAATAACCGGTTACCTGTTTGTTTATTTCGGTATTTATTATGTGAAATTATTCTTTTTATCTAATTTTCTTTTTGTTTTTCGACATTTTATTACGGCAAGCCTTTATTTTGTTAATCATGTCCAACGACTATATTTTCTTTTTTTAGGATTGTTTACGTAATGCCAGAATTTTTTTATTTTTCTCACAGGTGCATATACTTTTTTAGCAAATCATTTTAGTTTATACTAATAATGCCC] clustalw multiple alignements is not computed in this case |
Copyright Thu Nov 6 12:32:27 CET 2003 Hubert Wassner (hubert.wassner@noos.fr) | ||||