These datas are free for academic use only, please contact me for any other use. Schistosoma mansoni see consensus multiple alignment with clustalw Direct access to contigs :
consensusID : consensus_10782#0 NCBI blastX ! send the sequence to the NCBI site ! NCBI blastN ! send the sequence to the NCBI site ! Sequences nbr = 22 consensus length = 689 fasta sequence [AAAACTAAACTATCAACTCAACATGTTTTATACCATACAAGTCAATTTTATTATTTTCTTGGTGCTAGGATACATTTACGAAAATCTAGCCTATAGATGGTATACACAAAACTCTGAATTATTAGCTTTACACAATGCATATAGAAGGAATATAAAATATGGTAATGTTCGTGATCAACCACAA-GCGATGAGTATGC-TTAAACTAACATGGAGTCATAAATTGGCTGAAATGGCTCAGGAATGGGCATTACAATGTGTGCCAAGACGAAGTAACATGACTATGAGGAAAGGTTCGAAATGGACATATGTTGGTCAG-AGTATCGCTTTCGTTCCTAAAGTTAGACAAGCAGCATCTGTATGGTTTGAACAACACAAGAATTACAATTTCGAAAACAATACTTGTGAGGCAAATAAAACTTGTGCAGATTACAAACAATTAGCTTTCGC-CGATACCACA-CATATTGGATGTGGTTATGCAATGTGTTTTAATC-TAACAGGA-CTAGATAAAGTTTTTGTTGTTTGCAACTATGGACCAGGGGGTAAATATGCCAATAGACAACCCTATGATCCTATATATCCTGAAGATCCATACTACCTCCCATGAATTTAACCTGTTAATATAACTGATGGTCATTTATACAAATCAGAATAATGTTTGAATGAAATTTCATATAAATATTTAATCTTTT] [+] EMBL CD183630 [AAAACTAAACTATCAACTCAACATGTTTTATACCATACAAGTCAATTTTATTATTTCCTTGGTGCTAGGATACATTTACGAAAATCTAGCCTATAGATGGTATACACAAAACTCTGAATTATTAGCTTTACACAATGCATATAGAAGGAATATAAAATATGGTAATGTTCGTGATCAACCACAA GCGATGAGTATGC TTAAACTAACATGGAGTCATAAATTGGCTGAAATGGCTCAGGAGTGGGCATTACAATGTGTGCCAAGACGAAGTAACATGACTATGAGGAAAGGTTCGAAATGGACATATGTTGGTCAG AGTATCGCTTTCGTTCCTAAAGTTAGACAAGCAGCATCTGTATGGNTTGAACAACACAAGAATTACAATTTCGAAAACAATACTTGTGAGGCAAATAAAACTTGTGCAGATTACAAACAATTAGCATTCGC CGATACCACA CATATTGGATGTGGTTATGCAATGTGTTTTAATC TAACAGGA CTAGAATAAGTTTTTGTTGTTTG ] [+] EMBL CD189351 [AAAACTAAACTATCAACTCAACATGTTTTATACCATACAAGTCAATTTTATTATTTTCTTGGTGCTAGGATACATTTACTATAATCTAGCCTATAGATGGTATACACAAAACTCTGAATTATTAGCTTTACACAATGCATATAGAAGGAATATAAAATATGGTAATGTTCGTGATCAACCACAA GCGATGAGTATGC TTAAACTAACATGGAGTCATAAATTGGCTGAAAT ] [+] EMBL CD183300 [ ACTATCAACTCAACATGTTTTATACCATACAAGTCAATTTTATTATTTTCTTGGTGCTAGGATACATTTACGAAAATCTAGCCTATAGATGGTATACACAAAACTCTGAATTATTAGCTTTACACAATGCATATAGAAGGAATATAAAATATGGTAATGTTCGTGATCAACCACAA GCGATGAGTATGC TTAAACTAACATGGAGTCATAAATTGGCTGAAATGGCTCAGGAATGGGCATTACAATGTGTGCCAAGACGAAGTAACATGACTATGAGGAAAGGTTCGAAATGGACATATGTTGGTCAG AGTATCGCTTTCGTTCCTAAAGTTAGACAAGCAGCATCTGTATGGTTTGAACAACACAAGAATTACAATTTCGAAAACAATACTTGTGAGGCAAATAAAACTTGTGCAGATTACAAACAATTAGCTTTCGC CGATACCACA CATATTGGATGTGGTTATGCAATGTGTTTTAATC TAACAGGA CTAGATAAAGTTTTTGTTGTTT ] [+] EMBL CD186202 [ CTATCAACTCAACATGTTTTATACCATACAAGTCAATTTTATTATTTTCTTGGTGCTAGGATACATTTACGAAAATCTAGCCTATAGATGGTATACACAAAACTCTGAATTATTAGCTTTACACAATGCATATAGAAGGAATATAAAATATGGTAATGTTCGTGATCAACCACAA GCGATGAGTATGC TTAAACTAACATGGAGTCATAAATTGGCTGAAATGGCTCAGGAGTGGGCATTACAATGTGTGCCAAGACGAAGTAACATGACTATGAGGAAAGGTTCGAAATGGACATATGTTGGTCAG AGTATCGCTTTCGTTCCTAAAGTTAGACAAGCAGCATCTGTATGGTTTGAACAACACAAGAATTACAATTTTGAAAACAATACTTGTGAGGCAAATAAAACTTGTGCAGATTACAAACAATTAGCATTCGC CGATACCACA CATATTGGATGTGGTTATGCAATGTGTTTTAATC TAACAGGA CTAGATAAAGTTTTTGTTGTTTGC ACTATGGACCAGGGGGTAAATATGCCAATAGACAACCCTATGATCCTATATATCCTGAAGATCC ] [-] EMBL CD189013 [ ATCAACTCAACATGTTTTATACCATACAAGTCAATTTTATTATTTTCTTGGTGCTAGGATACATTTACGAAAATCTAGCCTATAGATGGTATACACAAAACTCTGAATTATTAGCTTTACACAATGCATATAGAAGGAATATAAAATATGGTAATGTTCGTGATCAACCACAA GCGATGAGTATGC TTAAACTAACATGGAGTCATAAATTGGCTGAAATGGCTCAGGAGTGGGCATTA ] [+] EMBL CD178353 [ tggaaggCAACTCAACATGTTTTATACCATACAAGTCAATTTTATTATTTTCTTGGTGCTAGGATACATTTACGAAAATCTAGCCTATAGATGGTATACACAAAACTCTGAATTATTAGCTTTACACAATGCATATAGAAGGAATATAAAATATGGTAATGTTCGTGATCAACCACAA GCGATGAGTATGC TTAAACTAACATGGAGCCATAAATTGGCTGAAATGGCTCAGGAATGGGCATTACAATGTGTGCCAAGACGAAGTAACATGACTATGAGGAAAGGTTCGAAATGGACATATGTTGGTCAG AGTATCGCTTTCGTTCCTAAAGTTAGACAAGCAGCATCTGTATGGTTTGAACAACACAAGAATTACAATTTCGAAAACAATACTTGTGAGGCAAATAAAACTTGTGCAGATTACAAACAATTAGCTTTCGC CGATACCACA CATATTGGATGTGGTTATGCAATGTGTTTTAATC TAACAGGA CTAGATAAAGTTTTTGTTGTTTGCAACTATGGACCAGGGGGTAAATATGCCAATAGACAACCCTATGATCCTATATATCCTGAAG ] [+] EMBL CD080376 [ gCTCAACATGTTTTATACCATACAAGTCAATTTTATTATTTTCTTGGTGCTAGGATACATTTACGAAAATCTAGCCTATAGATGGTATACACAAAACTCTGAATTATTAGCTTTACACAATGCATATAGAAGGAATATAAAATATGGTAATGTTCGTGATCAACCACAA GCGATGAGTATGC TTAAACTAACATGGAGTCATAAATTGGCTGAAATGGCTCAGGAATGGGCATTACAATGTGTGCCAAGACGAAGTAACATGACTATGAGGAAAGGTTCGAAATGGACATATGTTGGTCAG AGTATCGCTTTCGTTCCTAAAGTTAGACAAGCAGCATCTGTATGGTTTGAACAACACAAGAATTACAATTTCGAAAACAATACTTGTGAGGCAAATAAAACTTGTGCAGATTACAAACAATTAGCTTTCGC CGATACCACA CATATTGGATGTGGTTATGCAATGTGTTTTAATC TAACAGGA CTAGATAAAGTTTTTGTTGTTTGCAACTATGGACCAGGGGGTAAATATGCCAATAGACAACCCTATGATCCTATATATCCTGAAGATCCATACTACCTCCCATGAATTTAACCTGTTAATATAACTGATGGTCATTTATACAAATCAGAATAATGTTTGAATGAAATTTCATATAAATATTTAATCTTT ] [+] EMBL AA559805 [ TTTTCTTGGTGCTAGGATACATTTACGAAAATCTAGCCTATGGATGGTATACACAAAACTCTGAATTATTAGCTTTACACAATGCATATAGAAGAGATATAAAATATGGTAATGTTCGTGATCAACCACAA GCGATGAGTATGC TTAAACTAACATGGAGTCATAAATTGGCTGAAATGGCTCAGGAGTGGGCATTACAATGTGTGCCAAGACNAAGTAACATGACTATGAGGAAAGGTTCGAAATGGACATATGTTGGTCAGAAGTATCGCTTTCGTTCCTAA ] [+] EMBL CD077679 [ gaggTTTCTTGGTGCTAGGATACATTTACGAAAATCTAGCCTATAGATGGTATACACAAAACTCTGAATTATTAGCTTTACACAATGCATATAGAAGGAATATAAAATATGGTAATGTTCGTGATCAACCACAA GCGATGAGTATGC TTAAACTAACATGGAGTCATAAATTGGCTGAAATGGCTCAGGAATGGGCATTACAATGTGTGCCAAGACGAAGTAACATGACTATGAGGAAAGGTTCGAAATGGACATATGTTGGTCAG AGTATCGCTTTCGTTCCTAAAAGTAGAC AGCAGCATCTGTATGGTTTGA AACAC ] [-] EMBL CD078509 [ TTGGTGCTAGGATACATTTACGAAAATCTAGCCTATAGATGGTATACACAAAACTCTGAATTATTAGCTTTACACAATGCATATAGAAGGAATATAAAATATGGTAATGTTCGTGATCAACCACAA GCGATGAGTATGC TTAAACTAACATGGAGTCATAAATTGGCTGAAATGGCTCAGGAATGGGCATTACAATGTGTGCCAAGACGAAGTAACATGACTATGAGGAAAGGTTCGAAATGGACATATGTTGGTCAG AGTATCGCTTTCGTTCCTAAAGTTAGACAAGCAGCATCTGTATGGTTTGAACAACACAAGAATTACAATTTCGAAAACAATACTTGTGAGGCAAATAAAACTTGTGCAGATTACAAACAATTAGCTTTCGC CGATACCACA CATATTGGATGTGGTTATGCAATGTGTTTTAATC TAACAGGA CTAGATAAAGTTTTTGTTGTTTGCAACTATGGACCAGGGGGTAAATATGCCAATAGACAACCCTATGATCCTATATATCCTGAAGATCCATACTACCTCCCATGAATTTAACCTGTTAATATAACTGATGGTCATTTATACAAATCAGAATAATGTTTGAATGAAATTTCATATAAATATTTAATCTTTT] [-] EMBL CD169860 [ ACAANACTCTGAATTATTAGCTTTACNCAATGCATATAGAAGGAATATAAAATATGGTAATGTTCGTGATCAACCACAA GCGATGAGTATGC TTAAACTAACATGGAGTCATAAATTGGCTGAAATGGCTCAGGAATGGGCATTACAATGTGTGCCAAGACGAAGTAACATGACTATGAGGAAAGGTTCGAAATGGACATATGTTGGTCAG AGTATCGCTTTCGTTCCTAAAGTTAGACAAGCAGCATCTGTATGGTTTGAACAACACAAGAATTACAATTTCGAAAACAATACTTGTGAGGCAAATAAAACTTGTGCAGATTACAAACAATTAGCTTTCGC CGATACCACA CATATTGGATGTGGTTATGCAATGTGTTTTAATC TAACAGGA CTAGATAAAGTTTTTGTT ] [-] EMBL CD169955 [ ACAAAACTCTGAATTATTAGCTTTACACAATGCATATAGAAGNAATATAAAATATGGTAATGTTCGTGATCAACCACAA GCGATGAGTATGCTTTAAACTAACATGGAGTCATAAATTGGCTGAAATGGCTCAGGAGTGGGCATTACAATGTGTGCCAAGACGAAGTAACATGACTATGAGGAAAGGTTCGAAATGGACATATGTTGGTCAG AGTATCGCTTTCGTTCCTAAAGTTAGACAAGCAGCATCTGTATGGTTTGAACAACACAAGAATTACAATTTCGAAAACAATACTTGTGAGGCAAATAAAACTTGTGCAGATTACAAACAATTAGCATTCGC CGATACCACA CATATTGGATGTGGTTATGCAATGTGTTTTAATC TAACAGGA CTAGATAAAGTTTTTGTT ] [-] EMBL CD074292 [ CTGAATTATTAGCTTTACACAATGCATATAGAAGGAATATAAAATATGGTAATGTTCGTGATCAACCACAA GCGATGAGTATGC TTAAACTAACATGGAGTCATAAATTGGCTGAAATGGCTCAGGAATGGGCATTACAATGTGTGCCAAGACGAAGTAACATGACTATGAGGAAAGGTTCGAAATGGACATATGTTGGTCAG AGTATCGCTTTCGTTCCTAAAGTTAGACAAGCAGCATCTGTATGGTTTGAACAACACAAGAATTACAATTTCGAAAACAATACTTGTGAGGCAAATAAAACTTGTGCAGATTACAAACAATTAGCTTTCGC CGATACCACA CATATTGGATGTGGTTATGCAATGTGTTTTAATC TAACAGGA CTAGATAAAGTTTTTGTTGTTTGCAACTATGGACCAGGGGGTAAATATGCCAATAGACAACCCTATGATCCTATATATCCTGAAGATCCATACTACCTCCCATGAATTTAACCTGTTAATATAACTGATGGTCATTTATACAAATCAGAATAATGTTTGAATGAAATTTCATATAAATATTTAATTTTTT] [-] EMBL CD202543 [ agAATATGGTAATGTTCGTGATCAACCACAA TCGATGAGTATGA TTAAACTAACATGTAGTCATAAATTGTCTGAAATGGCTCAGGAGTGGGCATTACAATGTGTGCCAAGACGAAGTAACATGACTATGAGGAAAGGTTCGAAATGGACATATGTTGGTCAG AGTATCGTTTTCGTTCGTAAAGTTAGACAAGCAGCATCTGTATGGTTTGAACAGCACAAGAATTACAATTTCGAAAACAATACTTGTGAGGCAAATAAAACTTGTGCAGATTACAAACAATTAGCATTCACATGATACCACAGCATATTGGATGTGGTTATGCAATGTGTTTTAATCATAACAGGATCTAGATAAAGTTTT ] [+] EMBL CD197629 [ TAATGTTCGTGATCAACCACAACGCGATGAGTATGC TTAAACTAACATGGAGTCATAAATTGGCTGAAATGGCTCAGGAGTGGGCATTACAATGTGTGCCAAGACGAAGTAACATGACTATGAGGAAAGGTTCGAAATGGACATATGTTGGTCAG AGTATCGCTTGCGTTCCTAAAGTTAGACAAGCAGCATCTGTATGGTTTGAACAACACAAGAATTACAATCTCGAAAACTATACTTGTGAGGCAAATAAAACTTGTGCAGATTACAAACAATTAGCATTCGC CGATACCACA CATATTGGATGTGGTTATGCAATGTGTGTTAATC TAACAGGA CTAGATAAAGTATAAGTAGTAAGCGACTATGGACCACGGGGTAAATATGCCAAT ] [+] EMBL CD197675 [ TAATGTTCGTGATCAACCACAA GCGATGAGTATGC TTAAACTAACATGGAGTCATAAATTGGCTGAAATGGCTCAGGAATGGGCATTACAATGTGTGCCAAGACGAAGTAACATGACTATGAGGAAAGGTTCGAAATGGACATATGTTGGTCAG AGTATCGCTTTCGTTCCTAAAGTTAGACAAGCAGCATCTGTATGGTTTGAACAACACAAGAATTACAATTTCGAAAACAATACTTGTGAGGCAAATAAAACTTGTGCAGATTACAAACAATTAGCTTTCGC CGATACCACA CATATTGGATGTGGTTATGCAATGTGTTTTAATC TAACAGGA CTAGATAAAGTTTTTGTTGTTTGCAACTAAGGACCAGGGGGTAAATATGCCAAT ] [-] EMBL CD197709 [ AATGTTCGTGATCAACCACAA GCGATGAGTATGC TTAAACTAACAGGGAGTCATAAATTGGCTGAAATGGCTCAGGAATGGGCATTACAATGTGTGCCAAGACGAAGTAACATGACTATGAGGAAAGGTTCGAAATGGACATATGTTGGTCAG AGTATCGCTTTCGTTCCTAAAGTTAGACAAGCAGCATCTGTATGGTTTGAACAACACAAGAATTACAATTTCGAAAACAATACTTGTGAGGCAAATAAAACTTGTGCAGATTACAAACAATTAGCTTTCGC CGATACCACA CATATTGGATGTGGTTATGCAATGTGTTTTAATC TAACAGGA CTAGATAAAGTTTTTGTTGTTTGCAACTATGGACCAGGGGGTAAATATGCCAATA ] [-] EMBL CD197820 [ AATGTTCGTGATCAACCACAA GCGATGAGTATGC TTAAACTAACATGGAGTCATAAATTGGCTGAAATGGCTCAGGAGTGGGCATTACAATGTGTGCCAAGACGAAGTAACATGACTATGAGGAAAGGTTCGAAATGGACATATGTTGGTCAG AGTATCGCTTTCGTTCCTAAAGTTAGACAAGCAGCATCTGTATGGTTTGAACAACACAAGAATTACAATTTCGAAAACAATACTTGTGAGGCAAATAAAACTTGTGCAGATTACAAACAATTAGCATTCGC CGATACCACA CATATTGGATGTGGTTATGCAATGTGTTTTAATC TAACAGGA CTAGATAAAGTTTTTGTTGTTTGCAACTATGGACCAGGGGGTAAATATGCCAATA ] [-] EMBL CD197817 [ AATGTTCGTGATCAACCACAA GCGATGAGTATGC TTAAACTAACATGGAGTCATAAATTGGCTGAAATGGCTCAGGAATGGGCATTACAATGTGTGCCAAGACGAAGTAACATGACTATGAGGAAAGGTTCGAAATGGACATATGTTGGTCAG AGTATCGCTTTCGTTCCTAAAGTTAGACAAGCAGCATCTGTATGGTTTGAACAACACAGGAATTACAATTTCGAAAACAATACTTGTGAGGCAAATAAAACTTGTGCAGATTACAAACAATTAGCTTTCGC CGATACCACA CATATTGGATGTGGTTATGCAATGTGTTTTAATC TAACAGGA CTAGATAAAGTTTTTGTTGTTTGCAACTATGGACCAGGGGGTAAATATGCCAATAGACAACCCTATGATCCTA ] [-] EMBL CD179113 [ GTGATCAACCACAA GCGGTGAGTATGC TTAAACTAACATGGAGTCATAAATTGGCTGAAATGGCTCAGGAATGGGCATTACAATGTGTGCCAAGACGAAGTAACATGACTATGAGGAAAGGTTCGAAATGGACATATGTTGGTCAG ] [-] EMBL CD197512 [ ACAA GCGATGAGTATGC TTAAACTAACATGGAGTCATAAATTGGCTGAAATGGCTCAGGAATGGGCATTACAATGTGTGCCAAGACGAAGTAACATGACTATGAGGAAAGGTTCGAAATGGACATATGTTGGTCAG AGTATCGCTTTCGTTCCTAAAGTTAGACAAGCAGCATCTGTATGGTTTGAACAACACAAGAATTACAATTTCGAAAACAATACTTGTGAGGCAAATAAAACTTGTGCAGATTACAAACAATTAGCTTTCGC CGATACCACA CATATTGGATGTGGTTATGCAATGTGTTTTAATC TAACAGGA CTAGATAAAGTTTTTGTTGTTTGCAACTATGGACCAGGGGGTAAATATGCCAATA ] [-] EMBL CD169997 [ CTGTATGGTTTGAACAACACAAGAATTACAATTTCGAAAACAATACTTGTGAGGCAAATAAAACTTGTGCGGATTACAAACAATTAGCTTTCGC CGATACCACA CATATTGGATGTGGTTATGCAATGTGTTTTAATC TAACAGGA CTAGATAAAGTTTTTGTT ] clustalw multiple alignements is not computed in this case |
Copyright Thu Nov 6 12:32:27 CET 2003 Hubert Wassner (hubert.wassner@noos.fr) | ||||