Home
Who am I
Technology
EST Assembly
Contact

These datas are free for academic use only, please contact me for any other use.

Schistosoma mansoni
cluster # 10782 cluster # 10782       Sequences # 22       consensus # 1


see consensus multiple alignment with clustalw

Direct access to contigs :
consensus_10782#0 length = 689 sequences # 22  

consensusID : consensus_10782#0
NCBI blastX ! send the sequence to the NCBI site !
NCBI blastN ! send the sequence to the NCBI site !
Sequences nbr = 22
consensus length = 689
fasta sequence
                              [AAAACTAAACTATCAACTCAACATGTTTTATACCATACAAGTCAATTTTATTATTTTCTTGGTGCTAGGATACATTTACGAAAATCTAGCCTATAGATGGTATACACAAAACTCTGAATTATTAGCTTTACACAATGCATATAGAAGGAATATAAAATATGGTAATGTTCGTGATCAACCACAA-GCGATGAGTATGC-TTAAACTAACATGGAGTCATAAATTGGCTGAAATGGCTCAGGAATGGGCATTACAATGTGTGCCAAGACGAAGTAACATGACTATGAGGAAAGGTTCGAAATGGACATATGTTGGTCAG-AGTATCGCTTTCGTTCCTAAAGTTAGACAAGCAGCATCTGTATGGTTTGAACAACACAAGAATTACAATTTCGAAAACAATACTTGTGAGGCAAATAAAACTTGTGCAGATTACAAACAATTAGCTTTCGC-CGATACCACA-CATATTGGATGTGGTTATGCAATGTGTTTTAATC-TAACAGGA-CTAGATAAAGTTTTTGTTGTTTGCAACTATGGACCAGGGGGTAAATATGCCAATAGACAACCCTATGATCCTATATATCCTGAAGATCCATACTACCTCCCATGAATTTAACCTGTTAATATAACTGATGGTCATTTATACAAATCAGAATAATGTTTGAATGAAATTTCATATAAATATTTAATCTTTT]

[+] EMBL CD183630             [AAAACTAAACTATCAACTCAACATGTTTTATACCATACAAGTCAATTTTATTATTTCCTTGGTGCTAGGATACATTTACGAAAATCTAGCCTATAGATGGTATACACAAAACTCTGAATTATTAGCTTTACACAATGCATATAGAAGGAATATAAAATATGGTAATGTTCGTGATCAACCACAA GCGATGAGTATGC TTAAACTAACATGGAGTCATAAATTGGCTGAAATGGCTCAGGAGTGGGCATTACAATGTGTGCCAAGACGAAGTAACATGACTATGAGGAAAGGTTCGAAATGGACATATGTTGGTCAG AGTATCGCTTTCGTTCCTAAAGTTAGACAAGCAGCATCTGTATGGNTTGAACAACACAAGAATTACAATTTCGAAAACAATACTTGTGAGGCAAATAAAACTTGTGCAGATTACAAACAATTAGCATTCGC CGATACCACA CATATTGGATGTGGTTATGCAATGTGTTTTAATC TAACAGGA CTAGAATAAGTTTTTGTTGTTTG                                                                                                                                                                       ]
[+] EMBL CD189351             [AAAACTAAACTATCAACTCAACATGTTTTATACCATACAAGTCAATTTTATTATTTTCTTGGTGCTAGGATACATTTACTATAATCTAGCCTATAGATGGTATACACAAAACTCTGAATTATTAGCTTTACACAATGCATATAGAAGGAATATAAAATATGGTAATGTTCGTGATCAACCACAA GCGATGAGTATGC TTAAACTAACATGGAGTCATAAATTGGCTGAAAT                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                               ]
[+] EMBL CD183300             [        ACTATCAACTCAACATGTTTTATACCATACAAGTCAATTTTATTATTTTCTTGGTGCTAGGATACATTTACGAAAATCTAGCCTATAGATGGTATACACAAAACTCTGAATTATTAGCTTTACACAATGCATATAGAAGGAATATAAAATATGGTAATGTTCGTGATCAACCACAA GCGATGAGTATGC TTAAACTAACATGGAGTCATAAATTGGCTGAAATGGCTCAGGAATGGGCATTACAATGTGTGCCAAGACGAAGTAACATGACTATGAGGAAAGGTTCGAAATGGACATATGTTGGTCAG AGTATCGCTTTCGTTCCTAAAGTTAGACAAGCAGCATCTGTATGGTTTGAACAACACAAGAATTACAATTTCGAAAACAATACTTGTGAGGCAAATAAAACTTGTGCAGATTACAAACAATTAGCTTTCGC CGATACCACA CATATTGGATGTGGTTATGCAATGTGTTTTAATC TAACAGGA CTAGATAAAGTTTTTGTTGTTT                                                                                                                                                                        ]
[+] EMBL CD186202             [         CTATCAACTCAACATGTTTTATACCATACAAGTCAATTTTATTATTTTCTTGGTGCTAGGATACATTTACGAAAATCTAGCCTATAGATGGTATACACAAAACTCTGAATTATTAGCTTTACACAATGCATATAGAAGGAATATAAAATATGGTAATGTTCGTGATCAACCACAA GCGATGAGTATGC TTAAACTAACATGGAGTCATAAATTGGCTGAAATGGCTCAGGAGTGGGCATTACAATGTGTGCCAAGACGAAGTAACATGACTATGAGGAAAGGTTCGAAATGGACATATGTTGGTCAG AGTATCGCTTTCGTTCCTAAAGTTAGACAAGCAGCATCTGTATGGTTTGAACAACACAAGAATTACAATTTTGAAAACAATACTTGTGAGGCAAATAAAACTTGTGCAGATTACAAACAATTAGCATTCGC CGATACCACA CATATTGGATGTGGTTATGCAATGTGTTTTAATC TAACAGGA CTAGATAAAGTTTTTGTTGTTTGC ACTATGGACCAGGGGGTAAATATGCCAATAGACAACCCTATGATCCTATATATCCTGAAGATCC                                                                                                     ]
[-] EMBL CD189013             [           ATCAACTCAACATGTTTTATACCATACAAGTCAATTTTATTATTTTCTTGGTGCTAGGATACATTTACGAAAATCTAGCCTATAGATGGTATACACAAAACTCTGAATTATTAGCTTTACACAATGCATATAGAAGGAATATAAAATATGGTAATGTTCGTGATCAACCACAA GCGATGAGTATGC TTAAACTAACATGGAGTCATAAATTGGCTGAAATGGCTCAGGAGTGGGCATTA                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                            ]
[+] EMBL CD178353             [      tggaaggCAACTCAACATGTTTTATACCATACAAGTCAATTTTATTATTTTCTTGGTGCTAGGATACATTTACGAAAATCTAGCCTATAGATGGTATACACAAAACTCTGAATTATTAGCTTTACACAATGCATATAGAAGGAATATAAAATATGGTAATGTTCGTGATCAACCACAA GCGATGAGTATGC TTAAACTAACATGGAGCCATAAATTGGCTGAAATGGCTCAGGAATGGGCATTACAATGTGTGCCAAGACGAAGTAACATGACTATGAGGAAAGGTTCGAAATGGACATATGTTGGTCAG AGTATCGCTTTCGTTCCTAAAGTTAGACAAGCAGCATCTGTATGGTTTGAACAACACAAGAATTACAATTTCGAAAACAATACTTGTGAGGCAAATAAAACTTGTGCAGATTACAAACAATTAGCTTTCGC CGATACCACA CATATTGGATGTGGTTATGCAATGTGTTTTAATC TAACAGGA CTAGATAAAGTTTTTGTTGTTTGCAACTATGGACCAGGGGGTAAATATGCCAATAGACAACCCTATGATCCTATATATCCTGAAG                                                                                                         ]
[+] EMBL CD080376             [               gCTCAACATGTTTTATACCATACAAGTCAATTTTATTATTTTCTTGGTGCTAGGATACATTTACGAAAATCTAGCCTATAGATGGTATACACAAAACTCTGAATTATTAGCTTTACACAATGCATATAGAAGGAATATAAAATATGGTAATGTTCGTGATCAACCACAA GCGATGAGTATGC TTAAACTAACATGGAGTCATAAATTGGCTGAAATGGCTCAGGAATGGGCATTACAATGTGTGCCAAGACGAAGTAACATGACTATGAGGAAAGGTTCGAAATGGACATATGTTGGTCAG AGTATCGCTTTCGTTCCTAAAGTTAGACAAGCAGCATCTGTATGGTTTGAACAACACAAGAATTACAATTTCGAAAACAATACTTGTGAGGCAAATAAAACTTGTGCAGATTACAAACAATTAGCTTTCGC CGATACCACA CATATTGGATGTGGTTATGCAATGTGTTTTAATC TAACAGGA CTAGATAAAGTTTTTGTTGTTTGCAACTATGGACCAGGGGGTAAATATGCCAATAGACAACCCTATGATCCTATATATCCTGAAGATCCATACTACCTCCCATGAATTTAACCTGTTAATATAACTGATGGTCATTTATACAAATCAGAATAATGTTTGAATGAAATTTCATATAAATATTTAATCTTT ]
[+] EMBL AA559805             [                                                     TTTTCTTGGTGCTAGGATACATTTACGAAAATCTAGCCTATGGATGGTATACACAAAACTCTGAATTATTAGCTTTACACAATGCATATAGAAGAGATATAAAATATGGTAATGTTCGTGATCAACCACAA GCGATGAGTATGC TTAAACTAACATGGAGTCATAAATTGGCTGAAATGGCTCAGGAGTGGGCATTACAATGTGTGCCAAGACNAAGTAACATGACTATGAGGAAAGGTTCGAAATGGACATATGTTGGTCAGAAGTATCGCTTTCGTTCCTAA                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                     ]
[+] EMBL CD077679             [                                                  gaggTTTCTTGGTGCTAGGATACATTTACGAAAATCTAGCCTATAGATGGTATACACAAAACTCTGAATTATTAGCTTTACACAATGCATATAGAAGGAATATAAAATATGGTAATGTTCGTGATCAACCACAA GCGATGAGTATGC TTAAACTAACATGGAGTCATAAATTGGCTGAAATGGCTCAGGAATGGGCATTACAATGTGTGCCAAGACGAAGTAACATGACTATGAGGAAAGGTTCGAAATGGACATATGTTGGTCAG AGTATCGCTTTCGTTCCTAAAAGTAGAC AGCAGCATCTGTATGGTTTGA  AACAC                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                ]
[-] EMBL CD078509             [                                                          TTGGTGCTAGGATACATTTACGAAAATCTAGCCTATAGATGGTATACACAAAACTCTGAATTATTAGCTTTACACAATGCATATAGAAGGAATATAAAATATGGTAATGTTCGTGATCAACCACAA GCGATGAGTATGC TTAAACTAACATGGAGTCATAAATTGGCTGAAATGGCTCAGGAATGGGCATTACAATGTGTGCCAAGACGAAGTAACATGACTATGAGGAAAGGTTCGAAATGGACATATGTTGGTCAG AGTATCGCTTTCGTTCCTAAAGTTAGACAAGCAGCATCTGTATGGTTTGAACAACACAAGAATTACAATTTCGAAAACAATACTTGTGAGGCAAATAAAACTTGTGCAGATTACAAACAATTAGCTTTCGC CGATACCACA CATATTGGATGTGGTTATGCAATGTGTTTTAATC TAACAGGA CTAGATAAAGTTTTTGTTGTTTGCAACTATGGACCAGGGGGTAAATATGCCAATAGACAACCCTATGATCCTATATATCCTGAAGATCCATACTACCTCCCATGAATTTAACCTGTTAATATAACTGATGGTCATTTATACAAATCAGAATAATGTTTGAATGAAATTTCATATAAATATTTAATCTTTT]
[-] EMBL CD169860             [                                                                                                         ACAANACTCTGAATTATTAGCTTTACNCAATGCATATAGAAGGAATATAAAATATGGTAATGTTCGTGATCAACCACAA GCGATGAGTATGC TTAAACTAACATGGAGTCATAAATTGGCTGAAATGGCTCAGGAATGGGCATTACAATGTGTGCCAAGACGAAGTAACATGACTATGAGGAAAGGTTCGAAATGGACATATGTTGGTCAG AGTATCGCTTTCGTTCCTAAAGTTAGACAAGCAGCATCTGTATGGTTTGAACAACACAAGAATTACAATTTCGAAAACAATACTTGTGAGGCAAATAAAACTTGTGCAGATTACAAACAATTAGCTTTCGC CGATACCACA CATATTGGATGTGGTTATGCAATGTGTTTTAATC TAACAGGA CTAGATAAAGTTTTTGTT                                                                                                                                                                            ]
[-] EMBL CD169955             [                                                                                                         ACAAAACTCTGAATTATTAGCTTTACACAATGCATATAGAAGNAATATAAAATATGGTAATGTTCGTGATCAACCACAA GCGATGAGTATGCTTTAAACTAACATGGAGTCATAAATTGGCTGAAATGGCTCAGGAGTGGGCATTACAATGTGTGCCAAGACGAAGTAACATGACTATGAGGAAAGGTTCGAAATGGACATATGTTGGTCAG AGTATCGCTTTCGTTCCTAAAGTTAGACAAGCAGCATCTGTATGGTTTGAACAACACAAGAATTACAATTTCGAAAACAATACTTGTGAGGCAAATAAAACTTGTGCAGATTACAAACAATTAGCATTCGC CGATACCACA CATATTGGATGTGGTTATGCAATGTGTTTTAATC TAACAGGA CTAGATAAAGTTTTTGTT                                                                                                                                                                            ]
[-] EMBL CD074292             [                                                                                                                 CTGAATTATTAGCTTTACACAATGCATATAGAAGGAATATAAAATATGGTAATGTTCGTGATCAACCACAA GCGATGAGTATGC TTAAACTAACATGGAGTCATAAATTGGCTGAAATGGCTCAGGAATGGGCATTACAATGTGTGCCAAGACGAAGTAACATGACTATGAGGAAAGGTTCGAAATGGACATATGTTGGTCAG AGTATCGCTTTCGTTCCTAAAGTTAGACAAGCAGCATCTGTATGGTTTGAACAACACAAGAATTACAATTTCGAAAACAATACTTGTGAGGCAAATAAAACTTGTGCAGATTACAAACAATTAGCTTTCGC CGATACCACA CATATTGGATGTGGTTATGCAATGTGTTTTAATC TAACAGGA CTAGATAAAGTTTTTGTTGTTTGCAACTATGGACCAGGGGGTAAATATGCCAATAGACAACCCTATGATCCTATATATCCTGAAGATCCATACTACCTCCCATGAATTTAACCTGTTAATATAACTGATGGTCATTTATACAAATCAGAATAATGTTTGAATGAAATTTCATATAAATATTTAATTTTTT]
[-] EMBL CD202543             [                                                                                                                                                         agAATATGGTAATGTTCGTGATCAACCACAA TCGATGAGTATGA TTAAACTAACATGTAGTCATAAATTGTCTGAAATGGCTCAGGAGTGGGCATTACAATGTGTGCCAAGACGAAGTAACATGACTATGAGGAAAGGTTCGAAATGGACATATGTTGGTCAG AGTATCGTTTTCGTTCGTAAAGTTAGACAAGCAGCATCTGTATGGTTTGAACAGCACAAGAATTACAATTTCGAAAACAATACTTGTGAGGCAAATAAAACTTGTGCAGATTACAAACAATTAGCATTCACATGATACCACAGCATATTGGATGTGGTTATGCAATGTGTTTTAATCATAACAGGATCTAGATAAAGTTTT                                                                                                                                                                                ]
[+] EMBL CD197629             [                                                                                                                                                                  TAATGTTCGTGATCAACCACAACGCGATGAGTATGC TTAAACTAACATGGAGTCATAAATTGGCTGAAATGGCTCAGGAGTGGGCATTACAATGTGTGCCAAGACGAAGTAACATGACTATGAGGAAAGGTTCGAAATGGACATATGTTGGTCAG AGTATCGCTTGCGTTCCTAAAGTTAGACAAGCAGCATCTGTATGGTTTGAACAACACAAGAATTACAATCTCGAAAACTATACTTGTGAGGCAAATAAAACTTGTGCAGATTACAAACAATTAGCATTCGC CGATACCACA CATATTGGATGTGGTTATGCAATGTGTGTTAATC TAACAGGA CTAGATAAAGTATAAGTAGTAAGCGACTATGGACCACGGGGTAAATATGCCAAT                                                                                                                                        ]
[+] EMBL CD197675             [                                                                                                                                                                  TAATGTTCGTGATCAACCACAA GCGATGAGTATGC TTAAACTAACATGGAGTCATAAATTGGCTGAAATGGCTCAGGAATGGGCATTACAATGTGTGCCAAGACGAAGTAACATGACTATGAGGAAAGGTTCGAAATGGACATATGTTGGTCAG AGTATCGCTTTCGTTCCTAAAGTTAGACAAGCAGCATCTGTATGGTTTGAACAACACAAGAATTACAATTTCGAAAACAATACTTGTGAGGCAAATAAAACTTGTGCAGATTACAAACAATTAGCTTTCGC CGATACCACA CATATTGGATGTGGTTATGCAATGTGTTTTAATC TAACAGGA CTAGATAAAGTTTTTGTTGTTTGCAACTAAGGACCAGGGGGTAAATATGCCAAT                                                                                                                                        ]
[-] EMBL CD197709             [                                                                                                                                                                   AATGTTCGTGATCAACCACAA GCGATGAGTATGC TTAAACTAACAGGGAGTCATAAATTGGCTGAAATGGCTCAGGAATGGGCATTACAATGTGTGCCAAGACGAAGTAACATGACTATGAGGAAAGGTTCGAAATGGACATATGTTGGTCAG AGTATCGCTTTCGTTCCTAAAGTTAGACAAGCAGCATCTGTATGGTTTGAACAACACAAGAATTACAATTTCGAAAACAATACTTGTGAGGCAAATAAAACTTGTGCAGATTACAAACAATTAGCTTTCGC CGATACCACA CATATTGGATGTGGTTATGCAATGTGTTTTAATC TAACAGGA CTAGATAAAGTTTTTGTTGTTTGCAACTATGGACCAGGGGGTAAATATGCCAATA                                                                                                                                       ]
[-] EMBL CD197820             [                                                                                                                                                                   AATGTTCGTGATCAACCACAA GCGATGAGTATGC TTAAACTAACATGGAGTCATAAATTGGCTGAAATGGCTCAGGAGTGGGCATTACAATGTGTGCCAAGACGAAGTAACATGACTATGAGGAAAGGTTCGAAATGGACATATGTTGGTCAG AGTATCGCTTTCGTTCCTAAAGTTAGACAAGCAGCATCTGTATGGTTTGAACAACACAAGAATTACAATTTCGAAAACAATACTTGTGAGGCAAATAAAACTTGTGCAGATTACAAACAATTAGCATTCGC CGATACCACA CATATTGGATGTGGTTATGCAATGTGTTTTAATC TAACAGGA CTAGATAAAGTTTTTGTTGTTTGCAACTATGGACCAGGGGGTAAATATGCCAATA                                                                                                                                       ]
[-] EMBL CD197817             [                                                                                                                                                                   AATGTTCGTGATCAACCACAA GCGATGAGTATGC TTAAACTAACATGGAGTCATAAATTGGCTGAAATGGCTCAGGAATGGGCATTACAATGTGTGCCAAGACGAAGTAACATGACTATGAGGAAAGGTTCGAAATGGACATATGTTGGTCAG AGTATCGCTTTCGTTCCTAAAGTTAGACAAGCAGCATCTGTATGGTTTGAACAACACAGGAATTACAATTTCGAAAACAATACTTGTGAGGCAAATAAAACTTGTGCAGATTACAAACAATTAGCTTTCGC CGATACCACA CATATTGGATGTGGTTATGCAATGTGTTTTAATC TAACAGGA CTAGATAAAGTTTTTGTTGTTTGCAACTATGGACCAGGGGGTAAATATGCCAATAGACAACCCTATGATCCTA                                                                                                                     ]
[-] EMBL CD179113             [                                                                                                                                                                          GTGATCAACCACAA GCGGTGAGTATGC TTAAACTAACATGGAGTCATAAATTGGCTGAAATGGCTCAGGAATGGGCATTACAATGTGTGCCAAGACGAAGTAACATGACTATGAGGAAAGGTTCGAAATGGACATATGTTGGTCAG                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                          ]
[-] EMBL CD197512             [                                                                                                                                                                                    ACAA GCGATGAGTATGC TTAAACTAACATGGAGTCATAAATTGGCTGAAATGGCTCAGGAATGGGCATTACAATGTGTGCCAAGACGAAGTAACATGACTATGAGGAAAGGTTCGAAATGGACATATGTTGGTCAG AGTATCGCTTTCGTTCCTAAAGTTAGACAAGCAGCATCTGTATGGTTTGAACAACACAAGAATTACAATTTCGAAAACAATACTTGTGAGGCAAATAAAACTTGTGCAGATTACAAACAATTAGCTTTCGC CGATACCACA CATATTGGATGTGGTTATGCAATGTGTTTTAATC TAACAGGA CTAGATAAAGTTTTTGTTGTTTGCAACTATGGACCAGGGGGTAAATATGCCAATA                                                                                                                                       ]
[-] EMBL CD169997             [                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                    CTGTATGGTTTGAACAACACAAGAATTACAATTTCGAAAACAATACTTGTGAGGCAAATAAAACTTGTGCGGATTACAAACAATTAGCTTTCGC CGATACCACA CATATTGGATGTGGTTATGCAATGTGTTTTAATC TAACAGGA CTAGATAAAGTTTTTGTT                                                                                                                                                                            ]


>consensus_10782#0 AAAACTAAACTATCAACTCAACATGTTTTATACCATACAAGTCAATTTTATTATTTTCTT GGTGCTAGGATACATTTACGAAAATCTAGCCTATAGATGGTATACACAAAACTCTGAATT ATTAGCTTTACACAATGCATATAGAAGGAATATAAAATATGGTAATGTTCGTGATCAACC ACAAGCGATGAGTATGCTTAAACTAACATGGAGTCATAAATTGGCTGAAATGGCTCAGGA ATGGGCATTACAATGTGTGCCAAGACGAAGTAACATGACTATGAGGAAAGGTTCGAAATG GACATATGTTGGTCAGAGTATCGCTTTCGTTCCTAAAGTTAGACAAGCAGCATCTGTATG GTTTGAACAACACAAGAATTACAATTTCGAAAACAATACTTGTGAGGCAAATAAAACTTG TGCAGATTACAAACAATTAGCTTTCGCCGATACCACACATATTGGATGTGGTTATGCAAT GTGTTTTAATCTAACAGGACTAGATAAAGTTTTTGTTGTTTGCAACTATGGACCAGGGGG TAAATATGCCAATAGACAACCCTATGATCCTATATATCCTGAAGATCCATACTACCTCCC ATGAATTTAACCTGTTAATATAACTGATGGTCATTTATACAAATCAGAATAATGTTTGAA TGAAATTTCATATAAATATTTAATCTTTT



clustalw multiple alignements is not computed in this case


Copyright Thu Nov 6 12:32:27 CET 2003 Hubert Wassner    (hubert.wassner@noos.fr)