Home
Who am I
Technology
EST Assembly
Contact

These datas are free for academic use only, please contact me for any other use.

Schistosoma mansoni
cluster # 1080 cluster # 1080       Sequences # 2       consensus # 1


see consensus multiple alignment with clustalw

Direct access to contigs :
consensus_1080#0 length = 479 sequences # 2  

consensusID : consensus_1080#0
NCBI blastX ! send the sequence to the NCBI site !
NCBI blastN ! send the sequence to the NCBI site !
Sequences nbr = 2
consensus length = 479
fasta sequence
                              [GTAATGGAATAAATTAATTTCCATTAATTAATTGAGGATAAGGTAATGTTTTGATTCAATGAATTCGTTTACTATCATTGTTTCAATCTACTCAGTTATATTTATATTGAATCATTAAAAATGACTAAGTGAGACGTTCGATTGAAATCTGTATGTTAATCAATGATAAATCACTCGATGTTCAATTCAGATAAAATTACTTAATCATTAAAATATATTAAATAATGATAACTTTGTGATGACATAATGTTGACGTCATTCAATTTATTATTTGACGTCATTTCTTATCAACTATTATTATTATTAGTTGTAAATGATAGAAATTCTTTCTATTTATTCACCTACAATAACATAATGGATTCGAAATTAGATTCTACTTATAAAAAAAACAACGTTAACATTTCAACAAATGAATAAGAGTTTATAATCAAATAGATTATCATTATTGTTAATGTCTTTTAATTATCTACATTCAGGAC]

[+] EMBL CD187747             [GTAATGGAATAAATTAATTTCCATTAATTAATTGAGGATAAGGTAATGTTTTGATTCAATGAATTCGTTTACTATCATTGTTTCAATCTACTCAGTTATATTTATATTGAATCATTAAAAATGACTAAGTGAGACGTTCGATTGAAATCTGTATGTTAATCAATGATAAATCACTCGATGTTCAATTCAGATAAAATTACTTAATCATTAAAATATATTAAATAATGATAACTTTGTGATGACATAATGTTGACGTCATTCAATTTATTATTTGACGTCATTTCTTATCAACTATTATTATTATTAGTTGTAAATGATAGAAATTCTTTCTATTTATTCACCTACAATAACATAATGGATTCGAAATTAGATTCTACTTATAAAAAAAACAACGTTAACATTTCAACAAATGAATAAGAGTTTATAATCAAATAGATTATCATTATTGTTAATGTCTTTTAATTATCTACATTCAGGAC]
[+] EMBL CD189696             [GTAATGGAATAAATTAATTTTCATTAATTAATTGAGGATAAGGTAATGTTTTGATTCAATGAATTCGTTTACTATCATTGTTTCAATCTATTCAGTTATATTTATATTGAATCATTAAAAATGACTAAGTGAGACGTTCGATTGAAATCTGTATGTTAATCAATGATAAATCACTCGATGTTCAATTCAGATAAAATTACTTAATCATTAAAATATATTAAATAATGATAACTTTGTGATGACATAATGTTGACGTCATTCAATTTATTATTTGACGTCATTTCTTATCAACTATTATTATTATTAGTTGTAAATGATAGAAATTCTTTCTATTTATTCACCTACAATAACATAATGGATTCGAAATTAGATTCTACTTATAAAAAAAACAACGTTAACATTTCAACAAATGAATAAGAGTTTAT                                                      ]


>consensus_1080#0 GTAATGGAATAAATTAATTTCCATTAATTAATTGAGGATAAGGTAATGTTTTGATTCAAT GAATTCGTTTACTATCATTGTTTCAATCTACTCAGTTATATTTATATTGAATCATTAAAA ATGACTAAGTGAGACGTTCGATTGAAATCTGTATGTTAATCAATGATAAATCACTCGATG TTCAATTCAGATAAAATTACTTAATCATTAAAATATATTAAATAATGATAACTTTGTGAT GACATAATGTTGACGTCATTCAATTTATTATTTGACGTCATTTCTTATCAACTATTATTA TTATTAGTTGTAAATGATAGAAATTCTTTCTATTTATTCACCTACAATAACATAATGGAT TCGAAATTAGATTCTACTTATAAAAAAAACAACGTTAACATTTCAACAAATGAATAAGAG TTTATAATCAAATAGATTATCATTATTGTTAATGTCTTTTAATTATCTACATTCAGGAC



clustalw multiple alignements is not computed in this case


Copyright Thu Nov 6 12:32:27 CET 2003 Hubert Wassner    (hubert.wassner@noos.fr)