These datas are free for academic use only, please contact me for any other use. Schistosoma mansoni see consensus multiple alignment with clustalw Direct access to contigs :
consensusID : consensus_10831#0 NCBI blastX ! send the sequence to the NCBI site ! NCBI blastN ! send the sequence to the NCBI site ! Sequences nbr = 2 consensus length = 793 fasta sequence [GATCACATCCTCTTTTCTTCTCTACAGGCGAGTTCAAAATGCAGAAACGAACTGAGTACCAGTGACGTACAGATTTTCTCAGTAAGTCATCAATTCTTGGGAGTAGTGTCTACAACTTTAATTGGCTAATTCAAGGGAACACTACGCTAACAGACCACTAGAGAGGATAAATATAGGCCGTCAGTCTTTTCTTCAATACGCAGTTCAAAGTTTGGAAGCATATTACCGACAAAACAAGTTTATATTGCTTTAAAGAAAATCAGTCTTAAGGCAATGACTTACAGTTAATAAATCTTAGGAATGGTCCAAACACTCTGCTTCCACTATAAACCATTAACGAGACTACAGATTATTGTATCTATTTGAGAACTTATGTATCCTTGACAAAACCCACTGATGTCCCTAAACGTGATTTACTTAATACAACGAAAACGAAAAATGGGTGACAATGTCAAGTCACAAACTCATCACAGATTAATAGAAAATACGTAAGAATGTCTACATACATAAGGAACGGAAGGTGGTAACCGAGTAAAAATAACCTACACACAAATATTTTGTTATCTTG-AAATTATATTGAAGAGTACAAAAGTTCTGTACATGACTCAAGGCAATATTTAGGGGTTTTTCTGTTGTTTTTTTTAATTAATCAAGCATTTCATTGTTTTCCACATTGGAAAGAAAATTGTTAGAATCATTTAATGTTTGCTGCTTTACTTGTATATACATAGATTTTATATATAAAACANATATTAAACCATTTTACGTTGTCTTGTTTTATGCTAATGATCGG] [+] EMBL CD131997 [GATCACATCCTCTTTTCTTCTCTACAGGCGAGTTCAAAATGCAGAAACGAACTGAGTACCAGTGACGTACAGATTTTCTCAGTAAGTCATCAATTCTTGGGAGTAGTGTCTACAACTTTAATTGGCTAATTCAAGGGAACACTACGCTAACAGACCACTAGAGAGGATAAATATAGGCCGTCAGTCTTTTCTTCAATACGCAGTTCAAAGTTTGGAAGCATATTACCGACAAAACAAGTTTATATTGCTTTAAAGAAAATCAGTCTTAAGGCAATGACTTACAGTTAATAAATCTTAGGAATGGTCCAAACACTCTGCTTCCACTATAAACCATTAACGAGACTACAGATTATTGTATCTATTTGAGAACTTATGTATCCTTGACAAAACCCACTGATGTCCCTAAACGTGATTTACTTAATACAACGAAAACGAAAAATGGGTGACAATGTCAAGTCACAAACTCATCACAGATTAATAGAAAATACGTAAGAATGTCTACATACATAAGGAACGGAAGGTGGTAACCGAGTAAAAATAACCTACACACAAATATTTTGTTATCTTG AAATTATATTGAAGAGTACAAAAGTTCTGTACATGA ] [+] EMBL CD131398 [ GTTCAAAGTTTGGAAGCATATTACCGACAAAACAAGTTTATATTGCTTTAAAGAAAATCAGTCTTAAGGCAATGACTTACAGTTAATAAATCTTAGGAATGGTCCAAACACTCTGCTTCCACTATAAACCATTAACGAGACTACAGATTATTGTATCTATTTGAGAACTTATGTATCCTTGACAAAACCCACTGATGTCCCTAAACGTGATTTACTTAATACAACGAAAACGAAAAATGGGTGACAATGTCAAGTCACAAACTCATCACAGATTAATAGAAAATACGTAAGAATGTCTACATACATAAGGAACGGAAGGTGGTAACCGAGTAAAAATAACCTACACACAAATATTTTGTTATCTTGAAAATTATATTGAAGAGTACAAAAGTTCTGTACATGACTCAAGGCAATATTTAGGGGTTTTTCTGTTGTTTTTTTTAATTAATCAAGCATTTCATTGTTTTCCACATTGGAAAGAAAATTGTTAGAATCATTTAATGTTTGCTGCTTTACTTGTATATACATAGATTTTATATATAAAACANATATTAAACCATTTTACGTTGTCTTGTTTTATGCTAATGATCGG] consensusID : consensus_10831#1 NCBI blastX ! send the sequence to the NCBI site ! NCBI blastN ! send the sequence to the NCBI site ! Sequences nbr = 20 consensus length = 519 fasta sequence [ANGCGGCCGCCNTTTTTTTCAATACGCAGTTCAAAGTTTGGAAGCATATTACCGACAAAACAAGTTTATATTGCTTTAAAGAAAATCAGTCTTAAGGCAATGACTTACAGTTAATAAATCTTAGGAATGGTCCAAACACTCTGCTTCCACTATAAACCATTAACGAGACTACAGATTATTGTATCTATTTGAGAACTTATGTATCCTTGACAAAACCCACTGATGTCCCTAAACGTGATTTACTTAATACAACGAAAACGAAAAATGGGTGACAATGTCAAGTCACAAACTCATCACAGATTAATAGAAAATACGTAAGAATGTCTACATACATAAGGAACGGAAGGTGGTAACCGAGTAAAAATAACCTACACACAAATATTTTGTTATCTTGAAAATTATATTGAAGAGTACAAAAGTTCTGTACATGACTCAAGGCAATATTTAGGGGTTTTTTGTCTTGTTATATTTCCGAGTGACTTATTCTCAGCGTTAAAATCAAAAACCCTAGAACTGTTC] [-] EMBL CD185348 [ANGCGGCCGCCTTTTTTTTCAATACGCAGTTCAAAGTTTGGAAGCATATTACCGACAAAACAAGTTTATATTGCTTTAAAGAAAATCAGTCTTAAGGCAATGACTTACAGTTAATAAATCTTAGGAATGGTCCAAACACTCTGCTTCCACTATAAACCATTAACGAGACTACAGATTATTGTATCTATTTGAGAACTTATGTATCCTTGACAAAACCCACTGATGTCCCTAAACGTGATTTACTTAATACAACGAAAACGAAAAATGGGTGACAATGTCAAGTCACAAACTCATCACAGATTAATAGAAAATACGTAAGAATGTCTACATACATAAGGAACGGAAGGTGGTAACCGAGTAAAAATAACCTACACACAAATATTTTGTTATCTTGAAAATTATATTGAAGAGTACAAAAGTTCTGTACATGACTCAAGGCAATATTTAGGGGTTTTTTGTCTTGTTATATTTCCGAGTGACTTATTCTCAGCGTTAAAATCAAAAACCCTAGAACTGTTC] [-] EMBL CD185568 [ NTTTTTTTCAATACGCAGTTCAAAGTTTGGAAGCATATTACCGACAAAACAAGTTTATATTGCTTTAAAGAAAATCAGTCTTAAGGCAATGACTTACAGTTAATAAATCTTAGGAATGGTCCAAACACTCTGCTTCCACTATAAACCATTAACGAGACTACAGATTATTGTATCTATTTGAGAACTTATGTATCCTTGACAAAACCCACTGATGTCCCTAAACGTGATTTACTTAATACAACGAAAACGAAAAATGGGTGACAATGTCAAGTCACAAACTCATCACAGATTAATAGAAAATACGTAAGAATGTCTACATACATAAGGAACGGAAGGTGGTAACCGAGTAAAAATAACCTACACACAAATATTTTGCTATCTTGAAAATTATATTGAAGAGTACAAAAGTTCTGTACATGACTCAAGGCAATATTTAGGGGTTTTTTGTCTTGTTATATTTCCGAGTGACTTATTCTCAGCGTTAAAATCAAAAACCCTAGAACTGTTC] [-] EMBL CD131570 [ NTTTTTTTCAATACGCAGTTCAAAGTTTGGAAGCATATTACCGACAAAACAAGTTTATATTGCTTTAAAGAAAATCAGTCTTAAGGCAATGACTTACAGTTAATAAATCTTAGGAATGGTCCAAACACTCTGCTTCCACTATAAACCATTAACGAGACTACAGATTATTGTATCTATTTGAGAACTTATGTATCCTTGACAAAACCCACTGATGTCCCTAAACGTGATTTACTTAATACAACGAAAACGAAAAATGGGTGACAATGTCAAGTCACAAACTCATCACAGATTAATAGAAAATACGTAAGAATGTCTACATACATAAGGAACGGAAGGTGGTAACCGAGTAAAAATAACCTACACACAAATATTTTGTTATCTTGAAAATTATATTGAAGAGTACAAAAGTTCTGTACATGACTCAAGGCAATATTTAGGGGTTTTTTGTCTTGTTATATTTCCGAGTGACTTATTCTCAGCGTTAAAATCAAAAACCCTAGAACTGTTC] [-] EMBL CD131708 [ TTTTTTTCAATACGCAGTTCAAAGTTTGGAAGCATATTACCGACAAAACAAGTTTATATTGCTTTAAAGAAAATCAGTCTTAAGGCAATGACTTACAGTTAATAAATCTTAGGAATGGTCCAAACACTCTGCTTCCACTATAAACCATTAACGAGACTACAGATTATTGTATCTATTTGAGAACTTATGTATCCTTGACAAAACCCACTGATGTCCCTAAACGTGATTTACTTAATACAACGAAAACGAAAAATGGGTGACAATGTCAAGTCACAAACTCATCACAGATTAATAGAAAATACGTAAGAATGTCTACATACATAAGGAACGGAAGGTGGTAACCGAGTAAAAATAACCTACACACAAATATTTTGTTATCTTGAAAATTATATTGAAGAGTACAAAAGTTCTGTACATGACTCAAGGCAATATTTAGGGGTTTTTTGTCTTGTTATATTTCCGAGTGACTTATTCTCAGCGTTAAAATCAAAAACCCTAGAACTGTTC] [-] EMBL CD131645 [ TTTTTTTCAATACGCAGTTCAAAGTTTGGAAGCATATTACCGACAAAACAAGTTTATATTGCTTTAAAGAAAATCAGTCTTAAGGCAATGACTTACAGTTAATAAATCTTAGGAATGGTCCAAACACTCTGCTTCCACTATAAACCATTAACGAGACTACAGATTATTGTATCTATTTGAGAACTTATGTATCCTTGACAAAACCCACTGATGTCCCTAAACGTGATTTACTTAATACAACGAAAACGAAAAATGGGTGACAATGTCAAGTCACAAACTCATCACAGATTAATAGAAAATACGTAAGAATGTCTACATACATAAGGAACGGAAGGTGGTAACCGAGTAAAAATAACCTACACACAAATATTTTGTTATCTTGAAAATTATATTGAAGAGTACAAAAGTTCTGTACATGACTCAAGGCAATATTTAGGGGTTTTTTGTCTTGTTATATTTCCGAGTGACTTATTCTCAGCGTTAAAATCAAAAACCCTAGAACTGTTC] [+] EMBL CD185317 [ GCAGTTCAAAGTTTGGAAGCATATTACCGACAAAACAAGTTTATATTGCTTTAAAGAAAATCAGTCTTAAGGCAATGACTCACAGTTAATAAATCTTAGGAATGGTCCAAACACTCTGCTTCCACTATAAACCATTAACGAGACTACAGATTATTGTATCTATTTGAGAACTTATGTATCCTTGACAAAACCCACTGATGTCCCTAAACGTGATTTACTTAATACAACGAAAACGAAAAATGGGTGACAATGTCAAGTCACAAACTCATCACAGATTAATAGAAAATACGTAAGAATGTCTACATACATAAGGAACGGAAGGTGGTAACCGAGTAAAAATAACCTACACACAAATATTTTGTTATCTTGAAAATTATATTGAAGAGTACAAAAGTTCTGTACATGACTCAAGGCAATATTTAGGAGTTTTTTGTCTTGTTATATTTCCGAGTGACTTATTCTCAGCGTTAAAATCAAAAACCCTAGAACTGTT ] [+] EMBL CD185265 [ GTTCAAAGTTTGGAAGCATATTACCGACAAAACAAGTTTATATTGCTTTAAAGAAAATCAGTCTTAAGGCAATGACTTACAGTTAATAAATCTTAGGAATGGTCCAAACACTCTGCTTCCACTATAAACCATTAACGAGACTACAGATTATTGTATCTATTTGAGAACTTATGTATCCTTGACAAAACCCACTGATGTCCCTAAACGTGATTTACTTAATACAACGAAAACGAAAAATGGGTGACAATGTCAAGTCACAAACTCATCACAGATTAATAGAAAATACGTAAGAATGTCTACATACATAAGGAACGGAAGGTGGTAACCGAGTAAAAATAACCTACACACAAATATTTTGTTATCTTGAAAATTATATTGAAGAGTACAAAAGTTCTGTACATGACTCAAGGCAATATTTAGGGGTTTTTTGTCTTGTTATATTTCCGAGTGACTTATTCTCAGCGTTAAAATCAAAAACCCTAAAACTGTT ] [+] EMBL CD131364 [ GTTCAAAGTTTGGAAGCATATTACCGACAAAACAAGTTTATATTGCTTTAAAGAAAATCAGTCTTAAGGCAATGACTTACAGTTAATAAATCTTAGGAATGGTCCAAACACTCTGCTTCCACTATAAACCATTAACGAGACTACAGATTATTGTATCTATTTGAGAACTTATGTATCCTTGACAAAACCCACTGATGTCCCTAAACGTGATTTACTTAATACAACGAAAACGAAAAATGGGTGACAATGTCAAGTCACAAACTCATCACAGATTAATAGAAAATACGTAAGAATGTCTACATACATAAGGAACGGAAGGTGGTAACCGAGTAAAAATAACCTACACACAAATATTTTGTTATCTTGAAAATTATATTGAAGAGTACAAAAGTTCTGTACATGACTCAAGGCAATATTTAGGGGTTTTTTGTCTTGTTATATTTCCGAGTGACTTATTCTCAGCGTTAAAATCAAAAACCCTAGAACTGTT ] [+] EMBL CD131413 [ GTTCAAAGTTTGGAAGCATATTACCGACAAAACAAGTTTATATTGCTTTAAAGAAAATCAGTCTTAAGGCAATGACTTACAGTTAATAAATCTTAGGAATGGTCCAAACACTCTGCTTCCACTATAAACCATTAACGAGACTACAGATTATTGTATCTATTTGAGAACTTATGTATCCTTGACAAAACCCACTGATGTCCCTAAACGTGATTTACTTAATACAACGAAAACGAAAAATGGGTGACAATGTCAAGTCACAAACTCATCACAGATTAATAGAAAATACGTAAGAATGTCTACATACATAAGGAACGGAAGGTGGTAACCGAGTAAAAATAACCTACACACAAATATTTTGTTATCTTGAAAATTATATTGAAGAGTACAAAAGTTCTGTACATGACTCAAGGCAATATTTAGGGGTTTTTTGTCTTGTTATATTTCCGAGTGACTTATTCTCAGCGTTAAAATCAAAAACCCTAGAACTGTT ] [+] EMBL CD133851 [ GTTCAAAGTTTGGAAGCATATTACCGACAAAACAAGTTTATATTGCTTTAAAGAAAATCAGTCTTAAGGCAATGACTTACAGTTAATAAATCTTAGGAATGGTCCAAACACTCTGCTTCCACTATAAACCATTAACGAGACTACAGATTATTGTATCTATTTGAGAACTTATGTATCCTTGACAAAACCCACTGATGTCCCTAAACGTGTTTTACTTAATACAACGAAAACGAAAAATGGGTGACAATGTCAAGTCACAAACTCATCACAGATTAATAGAAAATACGTAAGAATGTCTACATACATAAGGAACGGAAGGTGGTAACCGAGTAAAAATAACCTACACACAAATATTTTGTTATCTCGAAAATTATATTGAAGAGTACAAAAGTTCTGTACATGACTCAAGGCACTATTTAGGGGTTTTTTGTCTTGTTATATTTCCGAGTGACTTATTCTCAGCGTTAAAATCAAAAACCCTAAAACTGTT ] [-] EMBL CD131699 [ TTCAAAGTTTGGAAGCATATTACCGACAAAACAAGTTTATATTGCTTTAAAGAAAATCAGTCTTAAGGCAATGACTTACAGTTAATAAATCTTAGGAATGGTCCAAACACTCTGCTTCCACTATAAACCATTAACGAGACTACAGATTATTGTATCTATTTGAGAACTTATGTATCCTTGACAAAACCCACTGATGTCCCTAAACGTGATTTACTTAATACAACGAAAACGAAAAATGGGTGACAATGTCAAGTCACAAACTCATCACAGATTAATAGAAAATACGTAAGAATGTCTACATACATAAGGAACGGAAGGTGGTAACCGAGTAAAAATAACCTACACACAAATATTTTGTTATCTTGAAAATTATATTGAAGAGTACAAAAGTTCTGTACATGACTCAAGGCAATATTTAGGGGTTTTTTGTCTTGTTATATTTCCGAGTGACTTATTCTCAGCGTTAAAATCAAAGACCCTAGAACTGTTC] [-] EMBL CD133732 [ TTCAAAGTTTGGAAGCATATTACCGACAAAACAAGTTTATATTGCTNTAAAGAAAATCAGTCTTAAGGCAATGACTTACAGTTAATAAATCTTAGGAATGGTCCAAACACTCTGCTTCCACTATAAACCATTAACGAGACTACAGATTATTGTATCTATTTGAGAACTTATGTATCCTTGACAAAACCCACTGATGTCCCTAAACGTGATTTACTTAATACAACGAAAACGAAAAATGGGTGACAATGTCAAGTCACAAACTCATCACAGATTAATAGAAAATACGTAAGAATGTCTACATACATAAGGAACGGAAGGTGGTAACCGAGTAAAAATAACCTACACACAAATATTTTGTTATCTTGAAAATTATATTGAAGAGTACAAAAGTTCTGTACATGACTCAAGGCAATATTTAGGGGTTTTTTGTCTTGTTATATTCCCGAGTGACTTATTCTCAGCGTTAAAATCAAAAACCCTAGAACTGTTC] [-] EMBL CD131360 [ TTCAAAGTTTGGAAGCATATTACCGACAAAACAAGTTTATATTGCTTTAAAGAAAATCAGTCTTAAGGCAATGACTTACAGTTAATAAATCTTAGGAATGGTCCAAACACTCTGCTTCCACTATAAACCATTAACGAGACTACAGATTATTGTATCTATTTGAGAACTTATGTATCCTTGACAAAACCCACTGATGTCCCTAAACGTGATTTACTTAATACAACGAAAACGAAAAATGGGTGACAATGTCAAGTCACAAACTCATCACAGATTAATAGAAAATACGTAAGAATGTCTACATACATAAGGAACGGAAGGTAGTAACCGAGTAAAAATAACCTACACACAAATATTTTGTTATCTTGAAAATTATATTGAAGAGTACAAAAGTTCTGTACATGACTCAAGGCAATATTTAGGGGTTTTTTGTCTTGTTATATTTCCGAGTGACTTATTCTCAGCGTTAAAATCAAAAACCCTAGAACTGTTC] [-] EMBL CD131696 [ TTCAAAGTTTGGAAGCATATTACCGACAAAACAAGTTTATATTGCTTTAAAGAAAATCAGTCTTAAGGCAATGACTTACAGTTAATAAATCTTAGGAATGGTCCAAACACTCTGCTTCCACTATAAACCATTAACGAGACTACAGATTATTGTATCTATTTGAGAACTTATGTATCCTTGACAAAACCCACTGATGTCCCTAAACGTGATTTACTTAATACAACGAAAACGAAAAATGGGTGACAATGTCAAGTCACAAACTCATCACAGATTAATAGAAAATACGTAAGAATGTCTACATACATAAGGAACGGAAGGTGGTAACCGAGTAAAAATAACCTACACACAAATATTTTGTTATCTTGAAAATTATATTGAAGAGTACAAAAGTTCTGTACATGACTCAAGGCAATATTTAGGGGTTTTTTGTCTTGTTATATTTCCGAGTGACTTATTCTCAGCGTTAAAATCAAAAACCCTAGAACTGTTC] [-] EMBL CD185114 [ TTCAAAGTTTGGAAGCATATTACCGACAAAACAAGTTTATATTGCTTTAAAGAAAATCAGTCTTAAGGCAATGACTTACAGTTAATTAATCTTAGGAATGGTCCAAACACTCTGCTTCCACTATAAACCATTAACGAGACTACAGATTATTGTATCTATTTGAGAACTTATGTATCCTTGACAAAACCCACTGATGTCCCTAAACGTGATTTACTTAATACAACGAAAACGAAAAATGGGTGACAATGTCAAGTCACAAACTCATCACAGATTAATAGAAAATACGTAAGAATGTCTACATACATAAGGAACGGAAGGTGGTAACCGAGTAAAAATAACCTACACACAAATATTTTGTTATCTTGAAAATTATATTGAAGAGTACAAAAGTTCTGTACATGACTCAAGGCAATATTTAGGGGTTTTTTGTCTTGTTATATTTCCGAGTGACTTATTCTCAGCGTTAAAATCAAAAACCCTAGAACTGTTC] [-] EMBL CD131606 [ TTCAAAGTTTGGAAGCATATTACCGACAAAACAAGTTTATATTGCTTTAAAGAAAATCAGTCTTAAGGCAATGACTTACAGTTAATAAATCTTAGGAATGGTCCAAACACTCTGCTTCCACTATAAACCATTAACGAGACTACAGATTATTGTATCTATTTGAGAACTTATGTATCCTTGACAAAACCCACTGATGTCCCTAAACGTGATTTACTTAATACAACGAAAACGAAAAATGGGTGACAATGTCAAGTCACAAACTCATCACAGATTAATAGAAAATACGTAAGAATGTCTACATACATAAGGAACGGAAGGTGGTAACCGAGTAAAAATAACCTACACACAAATATTTTGTTATCTTGAAAATTATATTGAAGAGTACAAAAGTTCTGTACATGACTCAAGGCAATATTTAGGGGTTTTTTGTCTTGTTATATTTCCGAGTGACTTGTTCTCAGCGTTAAAATCAAGAACCCTAGAACTGTTC] [-] EMBL CD133768 [ TTCAAAG TTGGAAGCATATTACCGACAAAACAAGTTTATATTGCTTTAAAGAAAATCAGTCTTAAGGCAATGACTTACAGTTAATAAATCTTAGGAATGGTCCAAACACTCTGCTTCCACTATAAACCATTAACGAGACTACAGATTATTGTATCTATTTGAGAACTTATGTATCCTTGACAAAACCCACTGATGTCCCTAAACGTGATTTACTTAATACAACGAAAACGAAAAATGGGTGACAATGTCAAGTCACAAACTCATCACAGATTAATAGAAAATACGTAAGAATGTCTACATACATAAGGAACGGAAGGTGGTAACCGAGTAAAAATAACCTACACACAAATATTTTGTTATCTTGAAAATTATATTGAAGAGTACAAAAGTTCTGTACATGACTCAAGGCAATATTTAGGGGTTTTTTGTCTTGTTATATTCCCGAGTGACTTATTCTCAGCGTTAAAATCAAAAACCCTAGAACTGTTC] [-] EMBL CD131290 [ TTCAAAGTTTGGAAGCATATTACCGACAAAACAAGTTTATATTGCTTTAAAGAAAATCAGTCTTAAGGCAATGACTTACAGTTAATAAATCTTAGGAATGGTCCAAACACTCTGCTTCCACTATAAACCATTAACGAGACTACAGATTATTGTATCTATTTGAGAACTTATGTATCCTTGACAAAACCCACTGATGTCCCTAAACGTGATTTACTTAATACAACGAAAACGAAAAATGGGTGACAATGTCAAGTCACAAACTCATCACAGATTAATAGAAAATACGTAAGAATGTCTACATACATAAGGAACGGAAGGTGGTAACCGAGTAAAAATAACCTACACACAAATATTTTGTTATCTTGAAAATTATATTGAAGAGTACAAAAGTTCTGTACATGACTCAAGGCAATATTTAGGGGTTTTTTGTCTTGTTATATTTCCGAGTGACTTATTCTCAGCGTTAAAATCAAAAACCCTAGAACCGTT ] [+] EMBL CD131430 [ TTCAAAGTTTGGAAGCATATTACCGACAAAACAAGTTTATATTGCTTTAAAGAGAATCAGTCTTAAGGCAATGACTTACAGTTAATAAATCTTAGGAATGGTCCAAACACTCTGCTTCCACTATAAACCATTAACGAGACTACAGATTATTGTATCTATTTGAGAACTTATGTATCCTTGACAAAACCCACTGATGTCCCTAAACGTGATTTACTTAATACAACGAAAACGAAAAATGGGTGACAATGTCAAGTCACAAACTCATCACAGATTAATAGAAAATACGTAAGAATGTCTACATACATAAGGAACGGAAGGTGGTAACCGAGTAAAAATAACCTACACACAAATATTTTGTTATCTTGAAAATTATATTGAAGAGTACAAAAGTTCTGTACGTGACTCAAGGCAATATTTAGGGG TTTTTGTCTTGTTATATTTCCGAGTGACTTATTCTCAGCGTTAAAATCAAAAACCCTAGAACTGTT ] [-] EMBL CD133731 [ ACCGACAAAACAAGTTTATATTGCCTTAAAGAAAATCAGTCTTAAGGCAATGACTTACAGTTAATAAATCTTAGGAATGGTCCAAACACTCTGCTTCCACTATAAACCATTAACGAGACTACAGATTATTGTATCTATTTGAGAACTTATGTATCCTTGACAAAACCCACTGATGTCCCTAAACATGATTTACTTAATACAACGAAAACGAAAAATGGGTGACAATGTCAAGTCACAAACTCATCACAGATTAATAGAAAATACGTAAGAATGTCTACATACATAAGGAACGGAAGGTGGTAACCGAGTAAAAATAACCTACACACAAATATTTTGTTATCTTGAAAATTATATTGAAGAGTACAAAAGTTCTGTACATGACTCAAGGCAATATTTAGGGGTTTTTTGTCTTGTTATATTTCCGAGTGACTTATTCTCAGCGTTAAAATCAAAAACCCTAGAACTGTTC] consensusID : consensus_10831#2 NCBI blastX ! send the sequence to the NCBI site ! NCBI blastN ! send the sequence to the NCBI site ! Sequences nbr = 1 consensus length = 498 fasta sequence [ATACGCAGTTCAAAGTTTGGAAGCATATGACCGACAAAACAAGTTTATATTGCTTTAAAGAAAATCAGTCTTAAGGCAATGACTTACAGTTAATAAATCTTAGGAATGGTCCAAACACTCTGCTTCCACTATAAACCATTAACGAGACTACAGATTATTGTATCTATTTGAGAACTTATGTATCCTTGACCGCCCCTTTTTTGTGACTCATTTCTTGGTCCTCTACTCAACATCTTTTTTGTGAGGCATTTACACATTTATTCACTTCTATCATCGCAAATATGTGTACTTCTCCGGTACAACAGAACCAGCATACACGTGGAATAATATCAAGTAATTCAAACTCTCAAGATGTTCAGGAAACAGAAGTGTTACGAAGTAATGTATTGCGAACAAAGTTAGCGAATAAACTGGGAAAGTTCAAAAGTAGAAAATTAGTAAGACGTGGGACATTCGGAAGTGATAAAAAAAGTTTGATTTTTATCCATCATAATGATT] [-] EMBL CD131505 [ATACGCAGTTCAAAGTTTGGAAGCATATGACCGACAAAACAAGTTTATATTGCTTTAAAGAAAATCAGTCTTAAGGCAATGACTTACAGTTAATAAATCTTAGGAATGGTCCAAACACTCTGCTTCCACTATAAACCATTAACGAGACTACAGATTATTGTATCTATTTGAGAACTTATGTATCCTTGACCGCCCCTTTTTTGTGACTCATTTCTTGGTCCTCTACTCAACATCTTTTTTGTGAGGCATTTACACATTTATTCACTTCTATCATCGCAAATATGTGTACTTCTCCGGTACAACAGAACCAGCATACACGTGGAATAATATCAAGTAATTCAAACTCTCAAGATGTTCAGGAAACAGAAGTGTTACGAAGTAATGTATTGCGAACAAAGTTAGCGAATAAACTGGGAAAGTTCAAAAGTAGAAAATTAGTAAGACGTGGGACATTCGGAAGTGATAAAAAAAGTTTGATTTTTATCCATCATAATGATT] consensus multiple alignement with clustalw CLUSTAL W (1.82) multiple sequence alignment consensus_10831#0 GATCACATCCTCTTTTCTTCTCTACAGGCGAGTTCAAAATGCAGAAACGAACTGAGTACC 60 consensus_10831#1 ------------------------------------------------------------ consensus_10831#2 ------------------------------------------------------------ consensus_10831#0 AGTGACGTACAGATTTTCTCAGTAAGTCATCAATTCTTGGGAGTAGTGTCTACAACTTTA 120 consensus_10831#1 ------------------------------------------------------------ consensus_10831#2 ------------------------------------------------------------ consensus_10831#0 ATTGGCTAATTCAAGGGAACACTACGCTAACAGACCACTAGAGAGGATAAATATAGGCCG 180 consensus_10831#1 ------------------------------------------------------ANGCGG 6 consensus_10831#2 ------------------------------------------------------------ consensus_10831#0 TCAGTCTTTTCTTCAATACGCAGTTCAAAGTTTGGAAGCATATTACCGACAAAACAAGTT 240 consensus_10831#1 CCGCCNTTTTTTTCAATACGCAGTTCAAAGTTTGGAAGCATATTACCGACAAAACAAGTT 66 consensus_10831#2 ---------------ATACGCAGTTCAAAGTTTGGAAGCATATGACCGACAAAACAAGTT 45 **************************** **************** consensus_10831#0 TATATTGCTTTAAAGAAAATCAGTCTTAAGGCAATGACTTACAGTTAATAAATCTTAGGA 300 consensus_10831#1 TATATTGCTTTAAAGAAAATCAGTCTTAAGGCAATGACTTACAGTTAATAAATCTTAGGA 126 consensus_10831#2 TATATTGCTTTAAAGAAAATCAGTCTTAAGGCAATGACTTACAGTTAATAAATCTTAGGA 105 ************************************************************ consensus_10831#0 ATGGTCCAAACACTCTGCTTCCACTATAAACCATTAACGAGACTACAGATTATTGTATCT 360 consensus_10831#1 ATGGTCCAAACACTCTGCTTCCACTATAAACCATTAACGAGACTACAGATTATTGTATCT 186 consensus_10831#2 ATGGTCCAAACACTCTGCTTCCACTATAAACCATTAACGAGACTACAGATTATTGTATCT 165 ************************************************************ consensus_10831#0 ATTTGAGAACTTATGTATCCTTGACAAAACCCACTGATGTCCCTAAACGTGATTTACTTA 420 consensus_10831#1 ATTTGAGAACTTATGTATCCTTGACAAAACCCACTGATGTCCCTAAACGTGATTTACTTA 246 consensus_10831#2 ATTTGAGAACTTATGTATCCTTGACCGC-CCCTTTTTTGTGACTCATTTCTTGGTCCTCT 224 ************************* *** * *** ** * * ** consensus_10831#0 ATACAACGAAAACGAAAAATGGGTGACAATGTCAAGTCACAAACTCATCACAGATTAATA 480 consensus_10831#1 ATACAACGAAAACGAAAAATGGGTGACAATGTCAAGTCACAAACTCATCACAGATTAATA 306 consensus_10831#2 ACTCAAC----ATCTTTTTTGTGAGGCATTTACA---CATTTATTCACTTCTA--TCATC 275 * **** * ** * * ** * ** ** * *** * * ** consensus_10831#0 GAAAATACGTAAGAATGTCTACATACATAAGGAACGGAAGGTGGTAACCGAGTAAAAATA 540 consensus_10831#1 GAAAATACGTAAGAATGTCTACATACATAAGGAACGGAAGGTGGTAACCGAGTAAAAATA 366 consensus_10831#2 GCAAATATGTGTACTTCTCCG-GTACAACAGAACCAGCATACAC--GTGGAATAATATCA 332 * ***** ** * ** **** ** * * * * ** *** * * consensus_10831#0 ACCTACACACAAATATTTTGTTATCTTGAAA-TTATATTGAAGAGTACAAAAGTTCTGTA 599 consensus_10831#1 ACCTACACACAAATATTTTGTTATCTTGAAAATTATATTGAAGAGTACAAAAGTTCTGTA 426 consensus_10831#2 AGTAATTCA-AACTCTCAAGATGTTCAGGAAACAGAAGTGTTACGAAGTAATGTATTGCG 391 * * ** ** * * * * * * ** * ** * * ** ** ** consensus_10831#0 CATGACTCAAGGCAATATTTAGGGGTTTTTCTGTTGTTTTTTTTAATTAATCAAGCATTT 659 consensus_10831#1 CATGACTCAAGGCAATATTTAGGGGTTTTT----TGTCTTGTTATATTT-CCGAGTGACT 481 consensus_10831#2 AACAAAGTTAGCGAATAAACTGGGAAAGTTC---AAAAGTAGAAAATTAGTAAGACGTGG 448 * * ** **** *** ** * *** consensus_10831#0 CATTGTTTTCCACATTGGAAAGAAAATTGTTAGAATCATTTAATGTTTGCTGCTTTACTT 719 consensus_10831#1 TA---TTCTCAGCGTTAAAATCAAAAACCCTAGAACTGTTC------------------- 519 consensus_10831#2 GA---CATTCGGAAGTGATAAAAAAAGTTTGATTTTTATCCATCATAATGATT------- 498 * ** * * **** * * consensus_10831#0 GTATATACATAGATTTTATATATAAAACANATATTAAACCATTTTACGTTGTCTTGTTTT 779 consensus_10831#1 ------------------------------------------------------------ consensus_10831#2 ------------------------------------------------------------ consensus_10831#0 ATGCTAATGATCGG 793 consensus_10831#1 -------------- consensus_10831#2 -------------- |
Copyright Thu Nov 6 12:32:27 CET 2003 Hubert Wassner (hubert.wassner@noos.fr) | ||||