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Schistosoma mansoni
cluster # 1087 cluster # 1087       Sequences # 2       consensus # 1


see consensus multiple alignment with clustalw

Direct access to contigs :
consensus_1087#0 length = 664 sequences # 2  

consensusID : consensus_1087#0
NCBI blastX ! send the sequence to the NCBI site !
NCBI blastN ! send the sequence to the NCBI site !
Sequences nbr = 2
consensus length = 664
fasta sequence
                              [CTTTTATTTCAAATAATAATTCTTTTTGTATGGATAAAATGAAATGGATGAAAATAATGAAACAATCAGTTATAAATAACAAAGGAAACAACAGCATCACCATAATGTTTATTAAATTATTAATAAAGTAATCTTCATTATAAACAATAAAAGACAGAACAACAAAAGAGTGACCTTTTTTCGGGGGGGGGGTATTCATTGAACAATGAACTTTTATACAAATTAAAACAAAGGAACCCCAATATTATAATGATTTATATATGCGCTTAAAAATATTTTAATTATTGGGAAAATGTATATAGATAAAGGTGCGGCATTATTATTGTTACTATATGAATACAAAGAGTTAATATGTATGGGTGTTGTTAGTGAATAATTTCCATTGGACAACTCGAAAACGAGGAAAAAAAACAGGTTTATTTACCATGGATATTAATAATATACGATAATAATAATAATGATTAAATTGATATGTAGGGAAATTCTTAATTCTGGTTATTTGTTCACTTTTATCTGTTTGTTGTTAAGTATCTTATCTTATGAACAAAACCTATTTGATAGTTNTATTATTGTCATTAAAATTATTGAATATGAAACAATCTTTTATTAAAAATAAACAAATTTGAACTCTTGTTACCTACCTACCTACTCACCCACCCACCTA]

[+] EMBL CD075906             [CTTTTATTTCAAATAATAATTCTTTTTGTATGGATAAAATGAAATGGATGAAAATAATGAAACAATCAGTTATAAATAACAAAGGAAACAACAGCATCACCATAATGTTTATTAAATTATTAATAAAGTAATCTTCATTATAAACAATAAAAGACAGAACAACAAAAGAGTGACCTTTTTTCGGGGGGGGGGTATTCATTGAACAATGAACTTTTATACAAATTAAAACAAAGGAACCCCAATATTATAATGATTTATATATGCGCTTAAAAATATTTTAATTATTGGGAAAATGTATATAGATAAAGGTGCGGCATTATTATTGTTACTATATGAATACAAAGAGTTAATATGTATGGGTGTTGTTAGTGAATAATTTCCATTGGACAACTCGAAAACGAGGAAAAAAAACAGGTTTATTTACCATGGATATTAATAATATACGATAATAATAATAATGATTAAATTGATATGTAGGGAAATTCTTAATTCTGGTTATTTGTTCACTTTTATCTGTTTGTTGTTAAGTATCTTATCTTATGAACAAAACCTATTTGATAGTTNTATTATTGTCATTAAAATTATTGAATATGAAACAATCTTTTATTAAAAATAAACAAATTTGAACTCTTGTTACCTACCTACCTACTCACCCACCCACCTA]
[+] EMBL CD075889             [CTTTTATTTCAAATAATAATTCTTTTTGTATGGATAAAATGAAATGGATGAAAATAATGAAACAATCAGTTATAAATAACAAAGGAAACAACAGCATCACCATAATGTTTATTAAATTATTAATAAAGTAATCTTCATTATAAACAATAAAAGACAGAACAACAAAAGAGTGACCTTTTTTCGGGGGGGGGGTATTCATTGAACAATGAACTTTTATACAAATTAAAACAAAGGAACCCCAATATTATAATGATTTATATATGCGCTTAAAAATATTTTAATTATTGGGAAAATGTATATAGATAAAGGTGCGGCATTATTATTGTTACTATATGAATACAAAGAGTTAATATGTAT GGTGTTGTTAGTGAATAATTTCCATTGGACAACTCGAAAACGAGGAAAAAAAACAGGTTTATTTACCATGGATATTAATAATATACGATAATAATAATAATGATTAAATTGATATGTAGGGAAATTCTTAATTCTGGTTATTTGTTCACTTTTATCTGTTTGTTGTTAAGTATCTTATCTTATGAACAAAACCTATTTGATAGT                                                                                                      ]


>consensus_1087#0 CTTTTATTTCAAATAATAATTCTTTTTGTATGGATAAAATGAAATGGATGAAAATAATGA AACAATCAGTTATAAATAACAAAGGAAACAACAGCATCACCATAATGTTTATTAAATTAT TAATAAAGTAATCTTCATTATAAACAATAAAAGACAGAACAACAAAAGAGTGACCTTTTT TCGGGGGGGGGGTATTCATTGAACAATGAACTTTTATACAAATTAAAACAAAGGAACCCC AATATTATAATGATTTATATATGCGCTTAAAAATATTTTAATTATTGGGAAAATGTATAT AGATAAAGGTGCGGCATTATTATTGTTACTATATGAATACAAAGAGTTAATATGTATGGG TGTTGTTAGTGAATAATTTCCATTGGACAACTCGAAAACGAGGAAAAAAAACAGGTTTAT TTACCATGGATATTAATAATATACGATAATAATAATAATGATTAAATTGATATGTAGGGA AATTCTTAATTCTGGTTATTTGTTCACTTTTATCTGTTTGTTGTTAAGTATCTTATCTTA TGAACAAAACCTATTTGATAGTTNTATTATTGTCATTAAAATTATTGAATATGAAACAAT CTTTTATTAAAAATAAACAAATTTGAACTCTTGTTACCTACCTACCTACTCACCCACCCA CCTA



clustalw multiple alignements is not computed in this case


Copyright Thu Nov 6 12:32:27 CET 2003 Hubert Wassner    (hubert.wassner@noos.fr)