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These datas are free for academic use only, please contact me for any other use. Schistosoma mansoni see consensus multiple alignment with clustalw Direct access to contigs :
consensusID : consensus_10882#0 NCBI blastX ! send the sequence to the NCBI site ! NCBI blastN ! send the sequence to the NCBI site ! Sequences nbr = 24 consensus length = 499 fasta sequence
[TTTCCTTTTTCTTCTTCGAATTGTTTATCATAATTAAACGAAGATTTATTAGTTCCTGATACTGAATATGAGTAGTGTGTTGGTAATAATGGAACAGGGTTATGAAAATATTGAAGTTTACCAACCAGCTTCGTGGACATTTGACTTTC-AATCTGGAATTCATCGGAGGCATGACTTATGCTAACAGCACCAATACGAGCCCAGTCGGCAACAAAAGAACGACCGTAGCCATACATTTCCT-GGTTAACAGGTGGTCTGTTGATATGATTGCAGCGGTGTGTATGTATATTCCACCATTC-TGCATAGTATGTTA-GGGGTACAGTGAAGTCCA-TTATGTAAACAACTTATATATTTTGCAAAAGATCCCAAAACCGTTATTNTTAGGTGGCTTGAAAAAACACCTTTAAAACTCTTGTATTGGCAAACCGTCAAATTGATCATTCACTATTGTTATCGGGACATAACACAGACACATATGCGCCACATAAATCATTAGATT]
[+] EMBL CD070209 [TTTCCTTTTTCTTCTTCGAATTGTTTATCATAATTAAACGAAGATTTATTAGTTCCTGATACTGAATATGAGTAGTGTGTTGGTAATAATGGAACAGGGTTATGAAAATATTGAAGTTTACCAACCAGCTTCGTGGACATTTGACTTTC AATCTGGAATTCATCGGAGGCATGACTTATGCTAACAGCACCAATACGAGCCCAGTCGGCAACAAAAGAACGACCGTAGCCATACATTTCCT GGTTAACAGGTGGTCTGTTGATATGATTGCAGCGGTGTGTATGTATATTCCACCATTC TGCATAGTATGTTA GGGGTACAGTGAAGTCCA TTATGTNAACAACTTATATATTTTGCAAAAGATCC ]
[+] EMBL CD070233 [TTTCCTTTTTCTTCTTCGAATTGTTTATCATAATTAAACGAAGATTTATTAGTTCCTGATACTGAATATGAGTAGTGTGTTGGTAATAATGGAACAGGGTTATGAAAATATTGAAGTTTACCAACCAGCTTCGTGGACATTTGACTTTC AATCTGGAATTCATCGGAGGCATGACTTATGCTAACAGCACCAATACGAGCCCAGTCGGCAACAAAAGAACGACCGTAGCCATACATTTCCT GGTTAACAGGTGGTCTGTTGATATGATTGCAGCGGTGTGTATGTATATTCCACCATTC TGCGTAGTATGTTA GGNGTACAGTGAAGTCCA TTATGTAAACAACTTATATA ]
[+] EMBL CD070308 [TTTCCTTTTTCTTCTTCGAATTGTTTATCATAATTAAACGAAGATTTATTAGTTCCTGATACTGAATATGAGTAGTGTGTTGGTAATAATGGAACAGGGTTATGAAAATATTGAAGTTTACCAACCAGCTTCGTGGACATTTGACTTTC AATCTGGAATTCATCGGAGGCATGACTTATGCTAACAGCACCAATACGAGCCCAGTCGGCAACAAAAGAACGACCGTAGCCATACATTTCCT GGTTAACAGGTGGTCTGTTGATATGATTGCAGCGGTGTGTATGTATATTCCACCATTC TGCATAGTATGTTA GGGGTACAGTGAAGTCCATTTATGT AACNACTTATA ]
[+] EMBL CD070296 [TTTCCTTTTTCTTCTTCGAATTGTTTATCATAATTAAACGAAGATTTATTAGTTCCTGATACTGAATATGAGTAGTGTGTTGGTAATAATGGAACAGGGTTATGAAAATATTGAAGTTTACCAACCAGCTTCGTGGACATTTGACTTTC AATCTGGAATTCATCGGAGGCATGACTTATGCTAACAGCACCAATACGAGCCCAGTCGGCAACAAAAGAACGACCGTAGCCATACATTTCCT GGTTAACAGGTGGTCTGTTGATATGATTGCAGCGGTGTGTATGTATATTCCACCATTC TGCATAGTATGTTAGGGGGTACAGTGAAGTCCA TTATGTAAACA ]
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[+] EMBL CD070207 [ TAGTTCCTGATACTGAATATGAGTAGTGTGTTGGTAATAATGGAACAGGGTTATGAAAATATTGAAGTTTACCAACCAGCTTCGTGGACATTTGACTTTC AATCTGGAATTCATCGGAGGCATGACTTATGCTAACAGCACCAATACGAGCCCAGTCGGCAACAAAAGAACGACCGTAGCCATACATTTCCT GGTTAACAGGTGGTCTGTTGATATGATTGCAGCGGTGTGTATGTATATTCCACCATTC TGCATAGTATGTTA GGNGTACAGTGAAGTCCA TTATGTAAACAACTTATATATTTTGCAAAnn ]
[+] EMBL CD070227 [ AGTTCCTGATACTGAATATGAGTAGTGTGTTGGTAATAATGGAACAGGGTTATGAAAATATTGAAGTTTACCAACCAGCTTCGTGGACATTTGACTTTC AATCTGGAATTCATCGGAGGCATGACTTATGCTAACAGCACCAATACGAGCCCAGTCGGCAACAAAAGAACGACCGTAGCCATACATTTCCT GGTTAACAGGTGGTCTGTTGATATGATTGCAGCGGTGTGTATGTATATTCCACCATTC TGCATAGTATGTTA GGGGTACAGTGAAGTCCA TTATGTAAACAACTTATATA ]
[+] EMBL CD070240 [ TCCTGATACTGAATATGAGTAGTGTGTTGGTAATAATGGAACAGGGTTATGAAAATATTGAAGTTTACCAACCAGCTTCGTGGACATTTGACTTTC AATCTGGAATTCATCGGAGGCATGACTTATGCTAACAGCACCAATACGAGCCCAGTCGGCAACAAAAGAACGACCGTAGCCATACATTTCCT GGTTAACAGGTGGTCTGTTGATATGATTGCAGCGGTGTGTATGTATATTCCACCATTC TGCATAGTATGTTA GGGGTACAGTGAAGTCCA TTATGTAAACAACTTATATATTTT ]
[+] EMBL CD070247 [ TCCTGATACTGAATATGAGTAGTGTGTTGGTAATAATGGAACAGGGTTATGAAAATATTGAAGTTTACCAACCAGCTTCGTGGACATTTGACTTTC AATCTGGAATTCATCGGAGGCATGACTTATGCTAACAGCACCAATACGAGCCCAGTCGGCAACAAGAGAACGACCGTAGCCATACATTTCCT GGTTAACAGGTGGTCTGTTGATATGATTGCAGCGGTGTGTATGTATAT ]
[+] EMBL CD070248 [ TCCTGATACTGAATATGAGTAGTGTGTTGGTAATAATGGAACAGGGTTATGAAAATATTGAAGTTTACCAACCAGCTTCGTGGACATTTGACTTTC AATCTGGAATTCATCGGAGGCATGACTTATGCTAACAGCACCAATACGAGCCCAGTCGGCAACAAAAGAACGACCGTAGCCATACATTTCCT GGTTAACAGGT ]
[+] EMBL CD070195 [ TTGAAGTTTACCAGCCAGCTTCGTGGACATTTGACTTTC AATCTGAGATTCATCGGAGGCATGACTTATGCTAACAGCACCAATACGAGCCCAGTCGGCAACAAAAGAACGACCGTAGCCATACATTTCCT GGTTAACAGGTGGTCTGTTGATATGATTGCAGCGGTGTGTATGTATATTCCACCATTC TGCATAGTATGTTA GGGGTACAGTGAAGTCCA TTATGTAAAC ACTTATATATTTTGCAAAg ]
[-] EMBL CD070416 [ AGCCATACA TTCCTNGGTTANCAGGTGGTCTGTTGATATGATTGCAGCGGTGTGTATGTATA TCCACCATTCNTGCATAGTATGTTA GGGGTACAGTGAAGTCCG TTATGTAAACAACTTATATATTTTGC AAAGATCCCAAAACCGTTATTNTTAGGTGGCTTGAAAAAACACCTTTAAAACTCTTGTATTGGCAAACCGTCAAATTGATCATTCACTATTGTTATCGGGACATAACACAGACACATATGCGCCACATAAATCATTAGATT]
clustalw multiple alignements is not computed in this case |
| Copyright Thu Nov 6 12:32:27 CET 2003 Hubert Wassner (hubert.wassner@noos.fr) | ||||