These datas are free for academic use only, please contact me for any other use. Schistosoma mansoni see consensus multiple alignment with clustalw Direct access to contigs :
consensusID : consensus_10889#0 NCBI blastX ! send the sequence to the NCBI site ! NCBI blastN ! send the sequence to the NCBI site ! Sequences nbr = 22 consensus length = 900 fasta sequence [CTCGAGGGCCAGAATTCGGCACGAGGTCGCACATATCTTCCAGTATTTTAAAGTGATCGGAGAATGAAAAGTGGCTGGGAGTATATTGGAATCTTTTTGTACATTATGGTGAATATTCTGGATAAACAACGATGTCATTCAGTGCGTTGCTACGTCTGTGATTATTGTCCGATAGTAACAAGCGTATCAATATCAGAAGAGAACAACTGTACATCTTGCTCAACGGCTGGTTATAATTATTCGATTCACAGAATATGCGTGTTT-AAGAATGGCATACCCATTAACTTCCCAAACGAAAATCGAACGCAGTGTAACACTGATTTGTGTAACGGGTTAACAGTTGATAACACTGGAAAAATTCCATCAGTTCCTATAGCAAATCCATTTC-GTTGCTATACGTGTTTGAATTGTACAAAAAGTAA-CCAAAAGGTACTTAGCGGTTGTGGTGC-ATGTGTGACAACTCGTGGTTCTGGAATTATCAGTAAATTTTGTGGAACTACATGTGAAAGATTGTATATTGACGATCAAATTAGTTGTTGCTCAACAGATCTATGTAACGGAATGACAAAATTATCTATTCATCGTCATGTTATTATTGTTCTGTTTGTTTGCATAGGAATCAGTAAATACATTCTATGAATGACTAAGCCCATAATCTTCTGTGATTTATATACTTGCTTTGAATTTATATACATTTTGGTCATTTTAATTGAAATCTATTCATTATTAAACACTCTACCTT-CTTCCATACACATTCACATATTA-AATTTGTTGTTTCTTGAAATAGTTCACTATGTACTACATATATCGTTCTATTTGTAATAAATTTATAGTTTGAACGTAAAAAAAAGTAAAAAAAAAAAAAAAAAAAAAAAAAAAAAAAAAAGAAGAAAAGAAAAA] [+] EMBL CD079388 [CTCGAGGGCCAGAATTCGGCACGAGGTCGCACATATCTTCCAGTACTTTAAAGTGATCGGAGAATGAAAAGTGGCTGGGAGTATATTGGAATCTTTTTGTACATTATGGTGAATATTCTGGATAAACAACGATGTCATTCAGTGCGTTGCTACGTCTGTGATTATTGTCCGATAGTAACAAGCGTATCAATATCAGAAGAGAACAACTGTACATCTTGCTCAACGGCTGGTTATAATTATTCGATTCACAGAATATGCGTGTTT AAGGATGGCATACCCATTAACTTCCCAAACGAAAATCGAACGCAGTGTAACACTGATTTGTGTAACGGGTTAACAGTTGATAACACTGGAAAAATTCCATCAGTTCCTATAGCAAATCCATTTC GTTGCTATACGTGTTTGAATTGTACAAAAAGTAA CCAAAAGGTACTTAGCGGTTGTGGTGC ATGTGTGACAACTCGTGGTTCTGGAATTATCAGTAAATTTTGTGGAACTACATGTAAAAGATTGTATATTGACGATCAAATTAGTTGTTGCTCAACAGATCTATGTAACGGAATGACAAAATTATCTATTCATCGTCATGTTATTATTGTTCTGTTTGTTTGCATAGGAATCAGTAAATACATTCTATGAATGACTAAGCCCATAATCTTCTGTGATTTATATACTTGCTTTGAATTTATATACATTNTGGTCATTNTAATTGAAATCTATTCATTATTAAACACTCTACCTT CTTCCATACACATTCACATATTANATTTTGTTGGTTCTTTGAATAGTTCACTATGTACTACATATATCGNTCTATTTGT ATAAATTTATAG ] [+] EMBL CD191935 [ tGAAGTCGCACATATCTTCCAGTATTTTAAAGTGATCGGAGAATGAAAAGTGGCTGGGAGTATATTGGAATCTTTTTGTACATTATGGTGAATATTCTGGATAAACAACGATGTCATTCAGTGCGTTGCTACGTCTGTGATTATTGTCCGATAGTAACAAGCGTATCAATATCAGAAGAGAACAACTGTACATCTTGCTCAACGGCTGGTTATAATTATTCGATTCACAGAATATGCGTGTTT GAGAATGGCATACCCATTAACTTCCCAAACGAAAATCGAACGCAGTGTAACAC ] [+] EMBL CD079962 [ CGCACATATCTTCCAGTACTTTAAAGTGATCGGAGAATGAAAAGTGGCTGGGAGTATATTGGAATCTTTTTGTACATTATGGTGAATATTCTGGATAAACAACGATGTCATTCAGTGCGTTGCTACGTCTGTGATTATTGTCCGATAGTAACAAGCGTATCAATATCAGAAGAGAACAACTGTACATCTTGCTCAACGGCTGGTTATAATTATTCGATTCACAGAATATGCGTGTTT AAGGATGGCATACCCATTAACTTCCCAAACGAAAATCGAACGCAGTGTAACACTGATTTGTGTAACGGGTTAACAGTTGATAACACTGGAAAAATTCCATCAGTTCCTATAGCAAATCCATTTC GTTGCTATACGTGTTTGAATTGTACAAAAAGTAA CCAAAAGGTACTTAGCGGTTGTGGTGC ATGTGTGACAACTCGTGGTTCTGGAATTATCAGTAAATTTTGTGGAACTACATGTGAAAGATTGTATATTGACGATCAAATTAGTTGTTGCTCAACAGATCTATGTAACGGAATGACAAAATTATCTATTCATCGTCATGTTATTATTGTTCTGTTTGTTTGCATAGGAATCAGTAAATACATTCTATGAATGACTAAGCCCATAATCTTCTGTGATTTATATACTTGCTTTGAATTTATATACATTNTGGTCATTNTAATTGAAATCTATTCATTATTAAACACTCTACCTTNCTT CATACACATTCACATATTT AAATTGNTGNNTC TGAANTAGNTCACTATGTACTACATATATCGNTCTATTTGT ATAAATTat ] [+] EMBL CD082976 [ cgACATATCTTCCAGTA TTTAAAGTGATCGGAGAATGAAAAGTGGCTGGGAGTATATTGGAATCTTTTTGTACATTATGGTGAATATTCTGGATAAACAACGATGTCATTCAGTGCGTTGCTACGTCTGTGATTATTGTCCGATAGTAACAAGCGTATCAATATCAGAAGAGAACAACTGTACATCTTGCTCAACGGCTGGTTATAATTATTCGATTCACAGAATATGCGTGTTT GAGAATGGCATACCCATTAACTTCCCAAACGAAAATCGAACGCAGTGTAACACTGATTTGTGTAACGGGTTAACAGTTGATAACACTGGAAAAATTCCATCAGTTCCTATAGCAAATCCATTTC GTTGCTATACGTGTTTGAATTGTACAAAAAGTAA CCAAAAGGTACTTAGCGGTTGTGGTGT ATGTGTGACAACTCGTGGTTCTGGAATTATCAGTAAATTTTGTGGAACTACATGTGAAAGATTGTATATTGACGATCAAATTAGTTGTTGCTCAACAGATCTATGTAACGGAATGACANAATTATCTATTCATCGNCATGGTAT ] [+] EMBL SMAA8338 [ CTTCCAGTATTTTAAAGTGATCGGAGAATGAAAAGTGGCTGGGAGTATATTGGAATCTTTTTGTACATTATGGTGAATATTCTGGATAAACAACGATGTCATTCAGTGCGTTGCTACGTCTGTGATTATTGTCCGATAGTAACAAGCGTATCAATATCAGAAGAGAACAACTGTACATCTTGCTCAACGGCTGGTTATAATTATTCGATTCACAGAATATGCGTGTTT GAGAATGGCATACCCATTAACTTCCCAAACGAAAATCGAACGCAGTGAAACACTGATTTGTGTAACGGGTTAACAGTTGATAACACTGGAAAAATTCCATCAGTTCCTATAGCAAATCCATTTCGGTTGCTATACGTGTTTGAATTGTACAAAAAGTAA CCAAAAGGNACTTAGCGGTTGTGGTGC ATGTGTGACA ] [+] EMBL SMAA8274 [ TATTTTAAAGTGATCGGAGAATGAAAAGTGGCTGGGAGTATATTGGAATCTTTTTGTACATTATGGTGAATATTCTGGATAAACAACGATGTCATTCAGTGCGTTGCTACGTCTGTGATTATTGTCCGATAGTAACAAGCGTATCAATATCAGAAGAGAACAACTGTACATCTTGCTCAACGGCTGGTTATAATTATTCGATTCACAG ATATGCGTGTTT GAGAATGGCATACCCATTAACTTCCCAAACGAAAATCGAACGCAGTGAAACACTGATTTGTGTAACGGGTTAACAGTTGATAACACTGG AAAATTCCATCAGTTCCTA ] [+] EMBL SMAA8269 [ TATTTTAAAGTGATCGGAGAATGAAAAGTGGCTGGGAGTATATTGGAATCTTTTTGTACATTATGGTGAATATTCTGGATAAACAACGATGTCATTCAGTGCGTTGCTACGTCTGTGATTATTGTCCGATAGTAACAAGCGTATCAATATCAGAAGAGAACAACTGTACATCTTGCTCAACGGCTGGTTATAATTATTCGATTCACAGAATATGCGTGTTTGAAGAATGGCATA ] [+] EMBL SMAA85822 [ TATTTTAAAGTGATCGGAGAATGAAAAGTGGCTGGGAGTATATTGGAATCTTTTTGTACATTATGGTGAATATTCTGGATAAACAACGATGTCATTCAGTGCGTTGCTACGTCTGTGATTATTGTCCGATAGTAACAAGCGTATCAATATCAGAAGAGAACAACTGTACATCTTGCTCAACGGCTGGTTATAATTATTCGATTCACAGAATATGCGTGTTT GAGAATGGCATACCCATTAACTTCCCAAACGAAAATCGAACGCAGTGAAACACTGATTTGTGTAACGGGTTAACAGTTGATAACACTGGAAAAATTCCATCAGTTCCTATAGCAAATCCATTTC GTTGCTATACGTGTTTGAATTGTACAAAAAGTAA CCAAAAGGTACTTAGCGGTTGTGGTGC ATGTGTGAC ACTCGTGGTTCTGGAATTAT ] [+] EMBL AF029222 [ GGCTGGGAGTATATTGGAATCTTTTTGTACATTATGGTGAATATTCTGGATAAACAACGATGTCATTCAGTGCGTTGCTACGTCTGTGATTATTGTCCGATAGTAACAAGCGTATCAATATCAGAAGAGAACAACTGTACATCTTGCTCAACGGCTGGTTATAATTATTCGATTCACAGAATATGCGTGTTT AAGGATGGCATACCCATTAACTTCCCAAACGAAAATCGAACGCAGTGTAACACTGATTTGTGTAACGGGTTAACAGTTGATAACACTGGAAAAATTCCATCAGTTCCTATAGCAAATCCATTTC GTTGCTATACGTGTTTGAATTGTACAAAAAGTAA CCAAAAGGTACTTAGCGGTTGTGGTGC ATGTGTGACAACTCGTGGTTCTGGAATTATCAGTAAATTTTGTGGAACTACATGTGAAAGATTGTATATTGACGATCAAATTAGTTGTTGCTCAACAGATCTATGTAACGGAATGACAAAATTATCTATTCATCGTCATGTTATTATTGTTCTGTTTGTTTGCATAGGAATCAGTAAATA ] [-] EMBL CD073663 [ CGTCTGTGA TATTGTCCGATAGTAACAAGCGTATCAATATCAGAAGAGAACAACTGTACATCTTGCTCAACGGCTGGTTATAATTATTCGATTCACAGAATATGCGTGTTT AAGGATGGCATACCCATTAACTTCCCAAACGAAAATCGAACGCAGTGTAACACTGATTTGTGTAACGGGTTAACAGTTGATAACACTGGAAAAATTCCATCAGTTCCTATAGCAAATCCATTTC GTTGCTATACGTGTTTGAATTGTACAAAAAGTAA CCAAAAGGTACTTAGCGGTTGTGGTGC ATGTGTGACAACTCGTGGTTCTGGAATTATCAGTAAATTTTGTGGAACTACATGTAAAAGATTGTATATTGACGATCAAATTAGTTGTTGCTCAACAGATCTATGTAACGGAATGACAAAATTATCTATTCATCGTCATGTTATTATTGTTCTGTTTGTTTGCATAGGAATCAGTAAATACATTCTATGAATGACTAAGCCCATAATATTCTGTGATTTATATACTTGCTTTGAATTTATATACATTTTGGTCATTTTAATTGAAATCTATTCATTATTAAACACTCTACCTT CTTCCATACACATTCACATATTA AATTTGTTGTTTCTTGAAATAGTTCACTATGTAGTACATATATCGTTCTATATGTAATAAATTTATAGTTTGAACGTAAAAAAAAGT ] [-] EMBL CD074156 [ CTGTACATCTTGCTCAACGGCTGGTTATAATTATTCGATTCACAGAATATGCGTGTTT AAGGATGGCATACCCATTAACTTCCCAAACGAAAATCGAACGCAGTGTAACACTGATTTGTGTAACGGGTTAACAGTTGATAACACTGGAAAAATTCCATCAGTTCCTATAGCAAATCCATTTC GTTGCTATACGTGTTTGAATTGTACAAAAAGTAA CCAAAAGGTACTTAGCGGTTGTGGTGC ATGTGTGACAACTCGTGGTTCTGGAATTATCAGTAAATTTTGTGGAACTACATGTGAAAGATTGTATATTGACGATCAAATTAGTTGTTGCTCAACAGATCTATGTAACGGAATGACAAAATTATCTATTCATCGTCATGTTATTATTGTTCTGTTTGTTTGCATAGGAATCAGTAAATACATTCTATGAATGACTAAGCCCATAATCTTCTGTGATTTATATACTTGCTTTGAATTTATATACATTTTGGTCATTTTAATTGAAATCTATTCATTATTAAACACTCTACCTT CTTCCATACACATTCACATATTA AATTTGTTGTTTCTTGAAATAGTTCACTATGTACTACATATATCGTTCTATTTGTAATAAATTTATAG ] [+] EMBL CD127174 [ TCGATTCACAGAATATGCGTGTTT GAGAATGGCATACCCATTAACTTCCCAAACGAAAATCGAACGCAGTGTAACACTGATTTGTGTAACGGGTTAACAGTTGATAACACTGGAAAAATTCCATCAGTTCCTATAGCAAATCCATTTC GTTGCTATACGTGTTTGAATTGTACAAAAAGTAA CCAAAAGGTACTTAGCGGTTGTGGTGC ATGTGTGACAACTCGTGGTTCTGGAATTATCAGTAAATTTTGTGGAACTACATGTGAAAGATTGTATATTGACGATCAAATTAGTTGTTGCTCAACAGATCTATGTAACGGAATGACAAAATTATCTATTCATCGNCATGTTATTATTGTTCTGTTTGTTTGCATAGGAATCAGTAAATACATTCTATGAATGACTAAGCCCATAATCTTCTGTGATTTATATACTTGCTTTGAATTTATATACATTTTGGTCATTNTAATTGAAATCTATTCATTAT ] [-] EMBL SMAA85759 [ ACTTCCCAAACG AAATCGAACGCAGTGTAACACTGATTTGTGTAACGGGTTAACAGTTGATAACACTGGGAAAATTCCATCAG TCCTATAGCAAATCCATTTC GTTGCTATACGTGTTTGAATTGTACAAAAAGTAA CCAAAAGGTACTTAGCGGTTGTGGTGC ATGTGTGACAACTCGTGGTTCTGGAATTATCAGTAAATTTTGTGGAACTACATGTGAAAGATTGTATATTGACGATCAAATTAGTTGTTGCTCAACAGATCTATGTAACGGAATGACAAAATTATCTATTCATCGTCATGTTATTATTGTTCTGTTTGTTTGCATAGGAATCAGTAAATACATTCTATGAATGACTAAGCCCATAATCTTCTGTGATTTATATACTTGCTTTGAATTTATATACATTTTGGTCATTTTAATTGAAATCTATTCATTATTAAACACTCTACCTT CTGCCATACACATTCACATATTA AATTTGTTGTTTCTTGAAATAGTTCACTATGTACTACATATATCGTTCTATTTGTAATAAATTTATAG ] [-] EMBL CD076559 [ TGATTTGTGTAACGGGTTAACAGTTGATAACACTGGAAAAATTCCATCAGTTCCTATAGCAAATCCATTTC GTTGCTATACGTGTTTGAATTGTACAAAAAGTAA CCAAAAGGTACTTAGCGGTTGTGGTGT ATGTGTGACAACTCGTGGTTTTGGAATTATCAGTAAATTTTGTGGAACTACATGTGAAAGATTGTATATTGACGATCAAATTAGTTGTTGCTCAACAGATTTATGTAACGGAATGACAAAATTATCTATTCATCGTCATGTTATTATTGTTCTGTTTGTTTGCATAGGAATCAGTAAATACATTTTATGAATGACTAAGCCCATAATCTTCTGTGATTTATATACTTGCTTTGAATTTATATACATTTTGGTCATTTTAATTGAAATCTATTCATTATTAAACACTTTACCTT TTTCCATACACATTCACATATTA AATTTGTTGTTTCTTGAAATAGTTCACTATGTACTACATATATCGTTCTATTTGTAATAAATTTATAG ] [-] EMBL SMAA85818 [ CAAACCCATTTC G TGCTATACGTGTTTGAATTGTACAAAAAGTAACCCAAAAGGTACTTAGCGGTTGTGGTGC ATGTGTGACAACTCGTGGTTCTGGAATTATCAGTAAATTTTGTGGAACTACATGTGAAAGATTGTATATTGACGATCAAATTAGTTGTTGCTCAACAGATCTATGTAACGGAATGCCAAAATTATCTATTCATCGTCATGTTATTATTGTTCTGTTTGTTTGCATAGGAATCAGTAAATACATTCTATGAATGACTAAGCCCATAATCTTCTGTGATTTATATACTTGCTTTGAATTTATATACATTTTGGTCATTTTAATTGAAATCTATTCATTATTAAACACTCTACCTT CTTCCATACACATTCACATATTA AATTTGTTGTTTCTTGAAATAGTTCACTATGTACTACATATATCGTTCTATTTGTAATAAATTTATAG ] [-] EMBL SMAA8340 [ AAGGTACTTAGCGGTTGTGGTGCAATGTGTGACAACTCGTGGTTCTGGAATTATCAGTAAATTTTGTGGAACTACATGTGAAAGATTGTATATTGACGATCAAATTAGTTGTTGCTCAACAGATCTATGTAACGGAATGACAAAATTATCTATTCATCGTCATGTTATTATTGTTCTGTTTGTTTGCATAGGAATCAGTAAATACATTCTATGAATGACTAAGCCCATAATCTTCTGTGATTTATATACTTGCTTTGAATTTATATACATTTTGGTCATTTTAATTGAAATCTATTCATTATTAAACACTCTACCTT CTTCCATACACATTCACATATTA AATTTGTTGTTTCTTGAAATAGTTCACTATGTACTACATATATCGTTCTATTTGTAATAAATTTATAG ] [-] EMBL SMAA85832 [ AACTCGTGGTTCTGGAATTATCAGTAAATTTTGTGGAACTACATGTGAAGGATTGTATATTGACGATCAAATTAGTTGTTGCTCAACAGATCTATGTAACGGAATGACAAAATTATCTATTCATCGTCATGTTATTATTGTTCTGTTTGTTTGCATAGGAATCAGTAAATACATTCTATGAATGACTAAGCCCATAATCTTCTGTGATTTATATACTTGCTTTGAATTTATATACATTTTGGTCATTTTAATTGAAATCTATTCATTATTAAACACTCTACCTT CTTCCATACACATTCACATATTA AATTTGTTGTTTCTTGAAATAGTTCACTATGTACTACATATATCGTTCTATTTGTAATAAATTTATAG ] [+] EMBL AI764864 [ AAATACATTCTATGAATGACTAAGCCCATAATCTTCTGTGATTTATATACTTGCTTTGAATTTATATACATTTTGGTCATTTTAATTGAAATCTATTCATTATTAAACACTCTACCTT CTTCCATACACATTCACATATTA AATTTGTTGTTTCTTGAAATAGTTCACTATGTACTACATATATCGTTCTATTTGTAAAAAATT ] [-] EMBL SMAA85802 [ TAAGCCCATAATCTTCTGTGATTTATATACTTGCTTTGAATTTATATACATTTTGGTCATTTTAATTGAAATCTATTCATTATTAAACACTCTACCTT CTTCCATACACATTCACATATTA AATTTGTTGTTTCTTGAAATAGTTCACTATGTACTACATATATCGTTCTATTTGTAATAAATTTATAG ] [-] EMBL SMAA85788 [ atcCTTCTGTGATTTATATACTTGCTTTGAATTTATATACATTTTGGTCATTTTAATTGAAATCTATTCATTATTAAACACTCTACCTT CTTCCATACACATTCACATATTA AATTTGTTGTTTCTTGAAATAGTTCACTATGTACTACATATATCGTTCTATTTGTAATAAATTTATAG ] [-] EMBL SMAA8292 [ CTTCTGTGATGTATATACTTGCTTTGAATTTATATACATTTTGGTCATTTTAATTGAAATCTATTCATTATTAAACACTCTACCTT CTTCCATACACATTCACATATTA AATTTGTTGTTTCTTGAAATAGTTCACTATGTACTACATATATCGTTCTATTTGTAATAAATTTATAG ] [+] EMBL CD134511 [ ccT CTTCCATACACATTCACATATTA AATTTGTTGTTTCTTGAAATAGTTCACTATGTACTACATATATCGTTCTATTTGTAATAAATTTATAGTTTGAAAAAAAAAAAAAAAAAAAAAAAAAAAAAAAAAAAAAAAAAAAAAAAAAGAAGAAAAGAAAAA] consensusID : consensus_10889#1 NCBI blastX ! send the sequence to the NCBI site ! NCBI blastN ! send the sequence to the NCBI site ! Sequences nbr = 1 consensus length = 747 fasta sequence [TATTTCCACGCTTGTGAGACTAGTTTATTTCTCGGAATTGAAGTCGCACATATCTCCCAGTACTTTAAAGTGATCGGAGAATGAAAAGTGGCTGGANGTATATTGGAATCTTTTTGGTACATTATGGTGAATATTCTGGATAAACAACGATGTCATTCAGTGCGTTGCTACGTCTGTGATTATTGTCCGATAGTAACNAGCGTATCAATATCAGAAGAGAACAACTGTACATCTTGCTCAACGGCTGGTTATAATTATTCGATTCACAGAATATGCGTGTTTAAGGATGGCATACCCATTAACTTCCCAAACGAAAATCGAACGCAGTGTAACACTGATTTGTGTAACGGGTTAACAGTTGATAACACTGGAAAAATTCCATCAGTTCCTATAGCAAATCCATTTCGTTGCTATACGTGTTTGAATTGTACAAAAAGTAACCAAAAGGTACTTAGCGGTTGTGGTGCATGTGTGACAACTCGTGGTTCTGGAATTATCAGTAAATTTTGTGGAACTACATGTGAAAGATTGTATATTGACGATCAAATTAGTTGTTGCTCAACAGATCTATGTAACGGAATGACAAAATTATCTATTCATCGTCATGTTATTATTGTTCTGTTTGTTTGCATAGGAATCAGTAAATACATTCTATGAATGACTAAGCCCATAATCTTCTGTGATTTATATACTTGCTTTGAATTTATATACATTTTGGTCATTTTAATTGAAATCTATTCATTATTA] [-] EMBL CD178093 [TATTTCCACGCTTGTGAGACTAGTTTATTTCTCGGAATTGAAGTCGCACATATCTCCCAGTACTTTAAAGTGATCGGAGAATGAAAAGTGGCTGGANGTATATTGGAATCTTTTTGGTACATTATGGTGAATATTCTGGATAAACAACGATGTCATTCAGTGCGTTGCTACGTCTGTGATTATTGTCCGATAGTAACNAGCGTATCAATATCAGAAGAGAACAACTGTACATCTTGCTCAACGGCTGGTTATAATTATTCGATTCACAGAATATGCGTGTTTAAGGATGGCATACCCATTAACTTCCCAAACGAAAATCGAACGCAGTGTAACACTGATTTGTGTAACGGGTTAACAGTTGATAACACTGGAAAAATTCCATCAGTTCCTATAGCAAATCCATTTCGTTGCTATACGTGTTTGAATTGTACAAAAAGTAACCAAAAGGTACTTAGCGGTTGTGGTGCATGTGTGACAACTCGTGGTTCTGGAATTATCAGTAAATTTTGTGGAACTACATGTGAAAGATTGTATATTGACGATCAAATTAGTTGTTGCTCAACAGATCTATGTAACGGAATGACAAAATTATCTATTCATCGTCATGTTATTATTGTTCTGTTTGTTTGCATAGGAATCAGTAAATACATTCTATGAATGACTAAGCCCATAATCTTCTGTGATTTATATACTTGCTTTGAATTTATATACATTTTGGTCATTTTAATTGAAATCTATTCATTATTA] consensusID : consensus_10889#2 NCBI blastX ! send the sequence to the NCBI site ! NCBI blastN ! send the sequence to the NCBI site ! Sequences nbr = 1 consensus length = 251 fasta sequence [ACTACATCGTCATGTTATTATTGTTCTGCNTGTTTGCATAGGAAGGCAGTAAATACANTNCTATGANTGGCTAAGCCCATNATCTTCTGTGNTNTANAAANATGCTTTGAANTTANAAANAANNTGGTNNGTTTAATTGAANTCTANTCATTATTAAACACTCTACCTTCTTCCATACACANTCACATAATAAATTTGTTGTTTCTTGAAATAGTTACACTANGTTCTACATATATCGTTNCTATTNGTAA] [-] EMBL SM840 [ACTACATCGTCATGTTATTATTGTTCTGCNTGTTTGCATAGGAAGGCAGTAAATACANTNCTATGANTGGCTAAGCCCATNATCTTCTGTGNTNTANAAANATGCTTTGAANTTANAAANAANNTGGTNNGTTTAATTGAANTCTANTCATTATTAAACACTCTACCTTCTTCCATACACANTCACATAATAAATTTGTTGTTTCTTGAAATAGTTACACTANGTTCTACATATATCGTTNCTATTNGTAA] consensus multiple alignement with clustalw CLUSTAL W (1.82) multiple sequence alignment consensus_10889#0 ----------CTCGAGGGCCAGAATT------CGGCAC-GAGGTCGCACATATCTTCCAG 43 consensus_10889#1 TATTTCCACGCTTGTGAGACTAGTTTATTTCTCGGAATTGAAGTCGCACATATCTCCCAG 60 consensus_10889#2 ------------------------------------------------------------ consensus_10889#0 TATTTTAAAGTGATCGGAGAATGAAAAGTGGCTGGGAGTATATTGGAATCTTTTTG-TAC 102 consensus_10889#1 TACTTTAAAGTGATCGGAGAATGAAAAGTGGCTGGANGTATATTGGAATCTTTTTGGTAC 120 consensus_10889#2 ------------------------------------------------------------ consensus_10889#0 ATTATGGTGAATATTCTGGATAAACAACGATGTCATTCAGTGCGTTGCTACGTCTGTGAT 162 consensus_10889#1 ATTATGGTGAATATTCTGGATAAACAACGATGTCATTCAGTGCGTTGCTACGTCTGTGAT 180 consensus_10889#2 -----------------------ACTACATCGTCATGTTAT-TATTGTTCTGCNTGTTTG 36 ** ** ***** * *** * * *** consensus_10889#0 TATTGTCCGATAGTAACAAGCGTATCAATATCAGAAGAGAACAACTGTACATCTTGCTCA 222 consensus_10889#1 TATTGTCCGATAGTAACNAGCGTATCAATATCAGAAGAGAACAACTGTACATCTTGCTCA 240 consensus_10889#2 CATAGGAAGGCAGTAAATACANTNCTATGANTGGCTAAGCCCAT-----NATCTTCTGTG 91 ** * * ***** * * * * * ** ** ***** consensus_10889#0 ACGGCTGGTTATAATTATTCGATTCACAGAATATG-CGTGTTTAAGAATGGCATACCCAT 281 consensus_10889#1 ACGGCTGGTTATAATTATTCGATTCACAGAATATG-CGTGTTTAAGGATGGCATACCCAT 299 consensus_10889#2 NTNTANAAANATGCTTTGAANTTANAAANAANNTGGTNNGTTTAATTGAANTCTANTCAT 151 ** ** * * * ** ** ****** ** *** consensus_10889#0 TAACTTCCCAAACGAAAATCGAACGCAGTGTAACACTGATTTGTGTAACGGGTTAACAGT 341 consensus_10889#1 TAACTTCCCAAACGAAAATCGAACGCAGTGTAACACTGATTTGTGTAACGGGTTAACAGT 359 consensus_10889#2 TA-----TTAAAC----ACTCTACCTTCTTCCATACACANTCACATAATAAATTTGTTGT 202 ** **** * ** * * ** * * *** ** ** consensus_10889#0 TGATAACACTGGAAAAATTCCATCAGTTCCTATAGCAAATCCATTTCGTTGCTATACGTG 401 consensus_10889#1 TGATAACACTGGAAAAATTCCATCAGTTCCTATAGCAAATCCATTTCGTTGCTATACGTG 419 consensus_10889#2 T-----TCTTGAAATAGTTACACTANGTTCTACA-------TATATCGTTNCTATTNGTA 250 * ** ** * ** ** * * *** * ** ***** **** ** consensus_10889#0 TTTGAATTGTACAAAAAGTAACCAAAAGGTACTTAGCGGTTGTGGTGCATGTGTGACAAC 461 consensus_10889#1 TTTGAATTGTACAAAAAGTAACCAAAAGGTACTTAGCGGTTGTGGTGCATGTGTGACAAC 479 consensus_10889#2 A----------------------------------------------------------- 251 consensus_10889#0 TCGTGGTTCTGGAATTATCAGTAAATTTTGTGGAACTACATGTGAAAGATTGTATATTGA 521 consensus_10889#1 TCGTGGTTCTGGAATTATCAGTAAATTTTGTGGAACTACATGTGAAAGATTGTATATTGA 539 consensus_10889#2 ------------------------------------------------------------ consensus_10889#0 CGATCAAATTAGTTGTTGCTCAACAGATCTATGTAACGGAATGACAAAATTATCTATTCA 581 consensus_10889#1 CGATCAAATTAGTTGTTGCTCAACAGATCTATGTAACGGAATGACAAAATTATCTATTCA 599 consensus_10889#2 ------------------------------------------------------------ consensus_10889#0 TCGTCATGTTATTATTGTTCTGTTTGTTTGCATAGGAATCAGTAAATACATTCTATGAAT 641 consensus_10889#1 TCGTCATGTTATTATTGTTCTGTTTGTTTGCATAGGAATCAGTAAATACATTCTATGAAT 659 consensus_10889#2 ------------------------------------------------------------ consensus_10889#0 GACTAAGCCCATAATCTTCTGTGATTTATATACTTGCTTTGAATTTATATACATTTTGGT 701 consensus_10889#1 GACTAAGCCCATAATCTTCTGTGATTTATATACTTGCTTTGAATTTATATACATTTTGGT 719 consensus_10889#2 ------------------------------------------------------------ consensus_10889#0 CATTTTAATTGAAATCTATTCATTATTAAACACTCTACCTTCTTCCATACACATTCACAT 761 consensus_10889#1 CATTTTAATTGAAATCTATTCATTATTA-------------------------------- 747 consensus_10889#2 ------------------------------------------------------------ consensus_10889#0 ATTAAATTTGTTGTTTCTTGAAATAGTTCACTATGTACTACATATATCGTTCTATTTGTA 821 consensus_10889#1 ------------------------------------------------------------ consensus_10889#2 ------------------------------------------------------------ consensus_10889#0 ATAAATTTATAGTTTGAACGTAAAAAAAAGTAAAAAAAAAAAAAAAAAAAAAAAAAAAAA 881 consensus_10889#1 ------------------------------------------------------------ consensus_10889#2 ------------------------------------------------------------ consensus_10889#0 AAAAAGAAGAAAAGAAAAA 900 consensus_10889#1 ------------------- consensus_10889#2 ------------------- |
Copyright Thu Nov 6 12:32:27 CET 2003 Hubert Wassner (hubert.wassner@noos.fr) | ||||