|
These datas are free for academic use only, please contact me for any other use. Schistosoma mansoni see consensus multiple alignment with clustalw Direct access to contigs :
consensusID : consensus_10940#0 NCBI blastX ! send the sequence to the NCBI site ! NCBI blastN ! send the sequence to the NCBI site ! Sequences nbr = 26 consensus length = 1349 fasta sequence
[TACGATCCTTATCTTCCAGATGGGATCGAACGATCATTAGGTATCGAACGTGTTTACAGTCTTCAAGATCTACTATTTCAGAGTGATTGTGTCACTTTGCATTGCTCGCTTAATGAACAAAATCGCCATATGATCAATGAGCATACAATAAAGTTAATGAGACCGGGTGCATTTTTAATCAATACTGCTCGAGGTGGTTTAATTGATGAGGTAGCCCTTGCTGCTGCACTTAAAGAAGGTCGAATCCGTGCTGCGGCATTGGACGTAACAGAGACAGAACCATTTGTTTGGAGTAATAGTGCTTTAAAAGATGCTCCAAATCTTATTGTAACACCTCATATGGCATTTTACAGTGAATCAAGTATGCGTGAAATGCGTGAGGCAGCTGCAAATGAAATCCGAAGAGCTATTTTAAATCGTATTCCAGACTGTCTTCGAAACTGTGTCAATAAAGAATTTATGCCGAATGGTGGTTCGTCATTATTTTCTCACG-GTTGTTCCAACAATAGCCTATCAAATAATATCAATAATAATCCCCTGGTTAATAACAATCATCTATCCCTTGGAGCAGGTATACCTGGTGTTAATGCTCTCAATAGCAGTGTAGCTTCAGGATTAGAAAACGCCGCACGTGGTTTACATCCAGCAGCTGCAGCTGCCGCGTTTGGTCTTTCAGCAGGTCTTTTCTCTTCTGCTGCAGGTGGAGGTTGTGGTCTTGGGGTAGGTGCTAACAGTCTCCCCTTCCCTGCTAACCTAATTGGTGGATCAGGAATAGGTCTATCAAATGCCGGTGGTGGAGGTATTCTCACCAACAGCGGT-GGT-CCAACAACAATCC-CGGC-CCTTCCTCCCCCTCCTGCCGTTGCCGCAGCCGCCGCAGCTCATCTAGCTGGCCTTCCTCCTGTCTCAGCGTACGCCAACTTCTTTCCTCCTGGATTAGCCGCTGGTTTAGGCCTTCCTCTCCCCCCTCCACACGCCGCATCTCTAGCCGGAGTAACTGGATCCTTAGGAGGTACAACCACTGGGTCTTCAACGAGTGCAGCCTCAGGCAATTGTACTAATAATTCTACTTCTGGCTCAGGAGGCCAGACAGTCAGTTCCCCTTCACCTGCAACCAGTGGTTGTATCCCCGGTGTATCCAGCAGTACTTTTGATAGCGTACATGCTAGGCTCGCTGCTGCCGCTAGTCTTGTTGCTTCGGGTCTAAATCCGAGATCCTCATGATACTACGCCTATCAAAATTAATCAAAAGGTGTAAAGTGAACAAACTATATAAATGTTTTGCTAACTTTGAACTATAAGGGGATTTGTTTTTCCTATCCACCTACCATGCGTACGTGTATCGCATGTGT]
[+] EMBL CD170467 [TACGATCCTTATCTTCCAGATGGGATCGAACGATCATTAGGTATCGAACGTGTTTACAGTCTTCAAGATCTACTATTTCAGAGTGATTGTGTCACTTTGCATTGCTCGCTTAATGAACAAAATCGCCATATGATCAATGAGCATACAATAAAGTTAATGAGACCGGGTGCATTTTTAATCAATACTGCTCGAGGTGGTTTAATTGATGAGGTAGCCCTTGCTGCTGCACTTAAAGAAGGTCGAATCCGTGCTGCGGCATTGGACGTAACAGAGACAGAACCATTTGTTTGGAGTAATAGTGCTTTAAAAGATGCTCCAAATCTTATTGTAACACCTCATATGGCATTTTACAGTGAATCAAGTATGCGTGAAATGCGTGAG ]
[+] EMBL CD097705 [ GCACTTAAAGAAGGTCGAATCCGTGCTGCGGCATTGGACGTAACAGAGACAGAACCATTTGTTTGGAGTAATAGTGCTTTAAAAGATGCTCCNAATCTTATTGNTACACCTCATATGGCAT ]
[+] EMBL CD185038 [ AAGAAGGTCGAATCCGTGCTGCGGCATTGGACGTAACAGAGACAGAACCATTTGTTTGGAGTAATAGTGCTTTAAAAGATGCTCCAAATCTTATTGTAACACCTCATATGGCATTTTACAGTGAATCAAGTATGCGTGAAATGCGTGAGGCAGCTGCAAATGAAATCCGAAGAGCTATTTTAAATCGTATTCCAGACTGTCTTCGAAACTGTGTCAATCAAGAATTTATGCCGAATGGTGGTTCGTCATTATTTTCTCACG GTTGTTCCAACAATAGCCTATCGAATAATATCAATAATAATCCCCTGGTTAATAACAATCAT ]
[+] EMBL CD185047 [ AAGAAGGTCGAATCCGTGCTGCGGCATTGGACGTAACAGAGACAGAACCATTTGTTTGGAGTAATAGTGCTTTAAAAGATGCTCCAAATCTTATTGTAACACCTCATATGGCATTTTACAGTGAATCAAGTATGCGTGAAATGCGTGAGGCAGCTGCAAATGAAATCCGAAGAGCTATTTTAAATCGTATTCCAGACTGTCTTCGAAACTGTGTCACTAAAGAATTTATGCCGAATGGTGGTTCGTCATTATTTTCTCACG GTTGTTCCAACAATAGCCTATCAAATAATATCAATAATAATCCCCTGGTTAATAACAATCATCTATCCCTTGGAGCAGGTATACCTGGTGTTAATGCTCTCAATAGCAGTGTAGCTTCAGGATTAGAAAACGCCGCACGTGGTTTACATCCAGCAGCTGCAG ]
[-] EMBL CD185081 [ AGAAGTTCGAATCCGTGCTGCGGCATTGGACGTAACAGAGACAGAACCATTTGTTTGGAGTAATAGTGCTTTAAAAGATGCTCCAAATCTTATTGTAACACCTCATATGGCATTTTACAGTGAATCAAGTATGCGTGAAATGCGTGAGGCAGCTGCAAATGAAATCCGAAGAGCTATTTTAAATCGTATTCCAGACTGTCTTCGAAACTGTGTCAATAAAGAATTTATGCCGAATGGTGGTTCGTCATTATTTTCTCACG GTTGTTCCAACAATAGCCTATCAAATAATATCAATAATAATCCCCTGGTTAATAACAATCATCTATCCCTTGGAGCAGGTATACCTGGTGTTAATGCTCTCAATAGCAGTGTAGCTTCAGGATTAGAAAACGCCGCACGTGGTTTACATCCAGCAGCTGCAGCTGCCGCGT ]
[-] EMBL CD185092 [ AGAAGGTCGAATCCGTGCTGCGGCATTGGACGTAACAGAGACAGAACCATTTGTTTGGAGTAATAGTGCTTTAAAAGATGCTCCAAATCTTATTGTAACACCTCATATGGCATTTTACAGTGAATCAAGTATGCGTGAAATGCGTGAGGCAGCTGCAAATGAAATCCGAAGAGCTATTTTAAATCGTATTCCAGACTGTCTTCGAAACTGTGTCAATAAAGAATTTATGCCGAATGGTGGTTCGTCATTATTTTCTCACG GTTGTTCCAACAATAGCCTATCAAATAATATCAATAATAATCCCCTGGTTAATAACAATCATCTATCCCTTGGAGCAGGTATACCTGGTGTTAATGCTCTCAATAGCAGTGTAGCTTCAGGATTAGAAAACGCCGCACGTGGTTTACATCCAGCAGCTGCAGCTGCCGCGT ]
[+] EMBL CD164874 [ AGGTCGAATCCGTGCTGCGGCATTGGACGTAACAGAGACAGAACCATTTGTTTGGAGTAATGGTGCTTTAAAAGATGCTCCAAATCTTATTGTAACACCTCATATGGCATTTTACAGTGAATCAAGTATGCGTGA ]
[+] EMBL CD164863 [ AGGTCGAATCCGTGCTGCGGCATTGGACGTAACAGAGACAGAACCATTTGTTTGGAGTAATAGTGCTTTAAAAGATGCTCCAAATCTTATTGTAACACCTCATATGGCATTTTACAGTGAATCAAGTACGCGTGAAATGCGTGAGGCAGCTGCAAATGAAATCCGAAGAGCTATTTTAAATCGTATTCCAGACTGTCTTCGAAACTGTGTCAATAAAGAATTTATGCCGAATGGTGGTTCGTCATTATTTTCTCACG GTTGTTCCAACAATAGCCTATCAAATAATATCAATAAT ATCCCCTGGTTAATAACAATCATCTATCCCTTGGAGCAGGTATACCTGGTGTTAATGCTCTCAATAGCAGTGTAGCTTCAGGATTAGAAAACGCCGCACGTGGTTTACATCCAGCAGCTGCAGCTGCCGCGTTTGGTCTTTCAGCAGGTCT ]
[+] EMBL CD139028 [ AGGTCGAATCCGTGCTGCGGCATTGGACGTAACAGATACAGAACCATTTGTTTGGAGTAATAGTGCTTTAAAAGATGCTCCAAATCTTATTGTAACACCTCATATGGCATTTTACAGTGAATCAAGTATGCGTGAAATGCGTGAGGCAGCTGCAAATGAAATCCGAAGAGCTATTTTAAATCGTATTCCAGACTGTCTTCGAAACTGTGTCAATAAAGAATTTATGCCGAATGGTGGTTCGTCATTATTTTCTCACG GTTGTTCCAACAATAGCCTATCAAATAATATCAATAATAATCCCCTGGTTAATAACAATCATCTATCCCTTGGAGCAGGTATACCTGGTGTTAATGCTCTCAATAGCAGTGTACCTTCAGGATTAGAAAACGCCCCCCGTGGTTAACAT ]
[+] EMBL CD164791 [ AGGTCGAATCCGTGCTGCGGCATTGGACGTAACAGAGACAGAACCATTTGTTTGGAGTAATAGTGCTTTAAAAGATGCTCCAAATCTTATTGTAACACCTCATATGGCATTTTACAGTGAATCAAGTATGCGTGAAATGCGTGAGGCAGCTGCAAATGAAATCCGAAGAGCTATTTTAAATCGTATTCCAGACTGTCTTCGAAACTGTGTCAATAAAGAATTTATGCCGAATGGTGGTTCGTCATTATTTTCTCACG GTTGTTCCAACAATAGCCTATCAAATAATATCAATAATAATCCCCTGGTTAATAACAATCATCTATCCCTTGGAGCAGGTATACCTGGTGTTAATGCTCTCAATAGCAGTGTAGCTTCAGGATTAGAAAACGCCGCACGTGG ]
[+] EMBL CD164833 [ AGGTCGAATCCGTGCTGCGGCATTGGACGTAACAGAGACAGAACCATTTGTTTGGAGTAATAGTGCTTTAAAAGATGCTCCAAATCTTATTGTAACACCTCATATGGCATTTTACAGTGAATCAAGTATGCGTGAAATGCGTGAGGCAGCTGCAAATGAAATCCGAAGAGCTATTTTAAATCGTATTCCAGACTGTCTTCGAAACTGTGTCAATAAAGAATTTATGCCGAATGGTGGTTCGTCATTATTTTCTCACG GTTGTTCCAACAATAGCCTATCAAATAATATCAATAATAATCCCCCGGTTAATAAAAATCATCTATCCCTTGGAGCAGGTATACCTGGTGTTAATGCTCTCAATAGCAGTGTAGCTTCAGGATTAGAAAACGCCGCACGTGG ]
[+] EMBL CD125560 [ AGGTCGAATCCGTGCTGCGGCATTGGACGTAACAGAGACAGAACCATTTGTTTGGAGTAATAGTGCTTTAAAAGATGCTCCAAATCTTATTGTAACACCTCATATGGCATTTTACAGTGAATCAGGTATGCGTGAAATGCGTGAGGCAGCTGCAAATGAAATCCGAAGAGCTATTTTAAATCGTATTCCAGACTGTCTTCGAAACTGTGTCAATAAAGAATTTATGCCGAATGGTGGTTCGTCATTATTTTCTCACG GTTGTTCCAACAATAGCCTATCAAATAATATCAATAATAATCCCCTGGTTAATAACAATCA ]
[-] EMBL CD125558 [ GGTCGAATCCGTGCTGCGGCATTGGACGTAACAGAGACAGAACCATTTGTTTGGAGTAATAGTGCTTTAAAAGATGCTCCAAATCTTATTGTAACACCTCATATGGCATTTTACAGTGAATCAAGTATGCGTGAAATGCGTGAGGCAGCTGCAAATGAAATCCGAAGAGCTATTTTAAATCGTATTCCAGACTGTCTTCGAAACTGTGTCAATAAAGAATTTATGCCGAATGGTGGTTGGTCCTTATTTTCTCTCGCGGTGTTTCAACAATAGCCTATCAAATAATATCAATAATAATCCCCTGGTTAATAACAATCATCTATCCCTTGGAGCAGGTATATCCGGTGTTAATGCTCTCAATAGCAGTGTAGCTTCAGGA ]
[+] EMBL CD138094 [ TGTTTGGAGTAATAGTGCTTTAAAAGATGCTCCAAATCTTATTGTAACACCTCATATGGCATTTTACAGTGAATCAAGTATGCGTGAAATGCGTGAGGCAGCTGCAAATGAAATCCGAAGAGCTATTTTAAATCGTATTCCAGACTGTCTTCGAAACTGTGTCAATAAAGAATTTATGCCGAATGGTGGTTCGTCATTATTTTCTCACG GTTGTTCCTACAATAGCCTATCAAATAATATCAATAATAATCCCCTGGTTAATAACAATCATCTATCCCTTGGAGCAGGTATACCTGGTGTTAATGCTCTCAATAGCAGTGTAGCTTCAGGATTAGAAAACGCCGCACGTGGTTTACATCCAGCAGCTGCAGCTGCCGCGTTTGGTCTTTCAGCAGGTCTTTTCTCTTCTGCTGCAGGTGGAGGTTGTGGTCTTGGGGT ]
[+] EMBL CD125466 [ CCGAAGAGCTATTTTAAATCGTATTCCAGACTGTCTTCGAAACTGTGTCAATAAAGAATTTATGCCGAATGGTGGTTCGTCATTATTTTCTCACG GTTGTTCCAACAATAGCCTATCAAATAATATCAATAATAATCCCCTGGTTAATAACAATCATCTATCCCTTGGAGCAGGTATACCCGGTGTTAATGCTCTCAGTAGCAGTGTAGCTTCAGGATTAGAAAACGCCGCACGTGGTTTACATCCAGCAGCTGCAGCTGCCGCGTTTGGTCTTTCAGCAGGTCTTTTCTCTTCTGCTGCAGGTGGAGGTTGTGGTCTTGGGGTAGGTGCTAACAGTCTCCCCTTCCCTGCTAACCTAATTGGTGGATCAGGAATAGGTCTATCAAATGCCGGTGGTGGAGGTATTCTCACCAACAGCGGT GGT CCAACAACAATCC CGGC CCTTCCTCCCCCTCCTGCCGT ]
[+] EMBL CD125541 [ CCGAAGAGCTATTTTAAATCGTATTCCAGACTGTCTTCGAAACTGTGTCAATAAAGAATTTATGCCGAATGGTGGTTCGTCATTATTTTCTCACG GTTGTTCCAACAATAGCCTATCAAATAATATCAATAATAATCCCCTGGTTAATAACAATCATCTATCCCTTGGAGCAGGTATACCTGGTGTTAATGCTCTCAATAGCAGTGTAGCTTCAGGATTAGAAAACGCCGCACGTGGTTTACATCCAGCAGCTGCAGCTGCCGCGTTTGGTCTTTCAGCAGGTCTTTTCTCTTCTGCTGCAGGTGGAGGTTGTGGTCTTGGGGTAGGTGCTAACAGTCTCCCCTTCCCTGCTAACCTAATTGGTGGATCAGGAATAGGTCTATCAAATGCCGGTGGTGGAGGTATTCTCACCAACAGCGGT GGT CCAACAACAATCC CGGC CCTTCCTCCCCCTCCTGCCGT ]
[+] EMBL CD149337 [ AAGAGCTATTTTAAATCGTATTCCAGACTGTCTTCGAAACTGTGTCAATAAAGAATTTATGCCGAATGGTGGTTCGTCATTATTTTCTCACG GTTGTTCCAACAATAGCCTATCAAATAATATCAATAATAATCCCCTGGTTAATAACAATCATCTATCCCTTGGAGCAGGTATACCTGGTGTTAATGCTCTCAATAGCAGTGTAGCTTCAGGATTAGAAAACGCCGCACGTGGTTTACATCCAGCAGCTGCAGCTGCCGCGTTTGGTCTTTCAGCAGGTCTTTTCTCTTCTGCTGCAGGTGGAGGTTGTGGTCTTGGGGTAGGTGCTAACAGTCTCCCCTTCCCTGCTAACCTAATTGGTGGATCAGGAATAGGTCTATCAAATGCCGGTGGTGGAGGTATTCTCACCAACAGCGGTGGGT CC ACAACAATCC CGGCNCCTT CTCCCCCTCCTGCCGTTGCCGCAGCCGCCGCAGCTCATCTAGCTGGg ]
[+] EMBL CD149131 [ AAAAGCTATTTTAAATCGTATTCCACACTGTCTTCGAAACTGTGTCAATAAAGAATTTATGCCGAATGGTGGTTCGTCATTATTTTCTCACG GTTGTTCCAACAATAGCCTATCAAATAATATCAATAATAATCCCCTGGTTAATAACAATCATCTATCCCTTGGAGCAGGTATACCTGGTGTTAATGCTCTCAATAACAGTGT ]
[+] EMBL CD183086 [ AATAACAATCATCTATCCCTTGGAGCAGGTATACCTGGTGTTAATGCTCTCAATAGCAGTGTAGCTTCAGGATTAGAAAACGCCGCACGTGGTTTACATCCAGCAGCTGCAGCTGCCGCGTTTGGTCTTTCAGCAGGTCTTTTCTCCTCTGCTGCAGGTGGAGGTTGTGGTCTTGGGGTAGGTGCTAACAGTCTCCCCTTCCCTGCTAACCTAATTGGTGGATCAGGAATAGGTCTATCAAATGCCGGTGGTGGAGGTATTCTCACCAACAGCGGT GGTCCCAAC ACAATCCNGGGC CTTTTCT CCCCT CTGCNGNTGCCGCAGCCGCCGCAGCTCATCTAGCTGGCCTTNCT CTGTC ]
[-] EMBL CD167994 [ CCGCACGTGGTTTACATCCAGCAGCTGCAGCTGCCGCGTTTGGTCTTTCAGCAGGTCTTTTCTCTTCTGCTGCAGGTGGAGGTTGTGGTCTTGGGGTAGGTGCTAACAGTCTCCCCTTCCCTGCTAACCTAATTAGTGGATCAGGAATAGGTCTATCAAATGCCGGTGGTGGAGGTATTCTCACCAggg ]
[-] EMBL CD143141 [ GGTGGAGGTTGTGGTCTTGGGGTAGGTGCTAACAGTCTCCCCTTCCCTGCTANCCTAATTGGTGGATCAGGAATAGGTCTATCAAATGCCGGTGGTGGAGGTATTCTCACCAACAGCGGT GGT CCAACAACAATCC CGGC CCTTCCTCCCCCTCCTGCCGTTGCCGCAGCCGCCGCAGCTCATCTAGCTGGCCTTCCTCCTGTCTCAGCGTACGCCAACTTCTTTCCTCCTGGATTAGCCGCTGGTTTAGGCCTTCCTCTCCCCCCTCCACACGCCGCATCTCTAGCCGGAGTAACTGGATCCTTAGGAGGTACAACCACTGGGTCTTCAACGAGTGCAGCCTCAGGCAATTGTACTAATA ]
[-] EMBL CD168063 [ ncnnnnnnTGNTANCCTAATTGGTGGATCAGGAATAGGTCTATCAAATGCCGGTGGAGGAGGTATTCTCACCAACAGCGGT GGT CCAACAACAATCC CGGC CCTTCCTCCCCCTCCTGCCGTTGCCGCAGCCGCCGCAGCTCATCTAGCTGG ]
[-] EMBL CD168090 [ CAAATGCCGGTGGTGGAGGTATTCTCACCAACAGCGGT GGT CCAACAACAATCC CGGC CCTTCCTCCCCCTCCTGCCGTTGCCGCAGCCGCCGCAGCTCATCTAGCTGGCCTTCCTCCTGTCTCAGCGTACGCCAA ]
[-] EMBL CD168083 [ CAAATGCCGGTGGTGGAGGTATTCTCACCAACAGCGGT GGT CCAACAACAATCC CGGC CCTTCCTCCCCCTCCTGCCGTTGCCGCAGCCGCCGCAGCTCATCTAGCTGGCCTTCCTCCTGTCTCAGCGTACGCCAA ]
[+] EMBL CD138884 [ CCTTAGGAGGTACAACCACTGGGTCTTCAACGAGTGCAGCCTCAGGCAATTGTACTAATAATTCTACTTCTGGCTCAGGAGGCCAGACAGTCAGTTCCCCTTCACCTGCAACCAGTGGTTGTATCCCCGGTGTATCCAGCAGTACTTTTGATAGCGTACATGCTAGGCTCGCTGCTGCCGCTAGTCTTGTTGCTTCGGGTCTAAATCCGAGATCCTCATGATACTACGCCTATCAAAATTAATCAAAAGGTGTAAAGTGAACAAACTATATAAATGTTTTGCTAACTTTGAACTATAAGGGGATTTGTTTTTCCTATCCACCTACCATGCGTACGTGTAT ]
[+] EMBL CD138546 [ GACAGTCAGTTCCCCTTCACCTGCAACCAGTGGTTGTATCCCCGGTGTATCCAGCAGTACTTTTGATAGCGTACATGCTAGGCTCGCTGCTGCCGCTAGTCTTGTTGCTTCGGGTCTAAATCCGAGATCCTCATGATACTACGCTTATCAAAATTAATCAAAAGGTGTAAAGTGAACAAACTATATAAATGTTTTGCTAACTTTGAACTATAAGGGGATTTGTTTTTCCTATCCACCTACCATGCGTACGTGTATCGCATGTGT]
clustalw multiple alignements is not computed in this case |
| Copyright Thu Nov 6 12:32:27 CET 2003 Hubert Wassner (hubert.wassner@noos.fr) | ||||