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Schistosoma mansoni
cluster # 10989 cluster # 10989       Sequences # 27       consensus # 4


see consensus multiple alignment with clustalw

Direct access to contigs :
consensus_10989#0 length = 1011 sequences # 23  
consensus_10989#1 length = 338 sequences # 1  
consensus_10989#2 length = 256 sequences # 2  
consensus_10989#3 length = 156 sequences # 1  

consensusID : consensus_10989#0
NCBI blastX ! send the sequence to the NCBI site !
NCBI blastN ! send the sequence to the NCBI site !
Sequences nbr = 23
consensus length = 1011
fasta sequence
                              [TTTAAAGTAACCGCATTGTTACCATCATCATCACCATCATCATCATTATTTACTATAAACATAATAATGAATAAATTATTATTATTACTATTATATTTCATCTTATGTAATCTTTTGACAATGGTATACAGTGGACATAGAAATAAATATGATCAATATCAAATAAATTCTGCTTATCAACAACCTAATCAAAATAATAAATATAATGGTGATGATTATACTAATAAATATCCAAGTGGTAATTATTATTCGCCTACAGACAATCAGTACGGTAATAACTATGATAATAATAAAAATGATAATAATTATGGTAGTTCCAATTACCAACCAACGTCTTATGATTCATATACCAAT-TATAATGGGGATAAGTAC------AATAATAATAATAATAA------CAATAATAA-TAATAATGGTGATTATAACAATAACGATTATA-CATCAACAAATAATAATTATCAAGCAAATAATTATAAAGATTATGGAT-CCAGTGATATATCACC-TACTAGTGAATA--TGGTATTAGTTCAATTGGAA-CT-GGAGTTATATCTGGTTCTAAGTATAGTCATAGTCGATTAAATGTTCATGGTAAAATGACTGGTGTTGGACATCAAGATTATGGTGTACATTATTTATCATTGACTAAATTCCGTAAAGGTGGTGGCTATGATATCTATGGGAAAAAACGACAATTTTTAGACTATGATACACAAGGACATGTGAAAAAATATGGTAATCAACATATGAAAGCGAAATTTGAAGTTGTTGGTAATTTGCAAGGCTATTCAACATTCAAAGATAAATCAAGTTTTAAACCAAGCGGAAGTACTTATGGTAATTATGGTGGTAACGGAAACGGTGGTCAATCCTACTGAAGATTAAAACAACAAAGCACAATAGTGAACAAGGAACAAGATCATTATTATTATTATTATCAATAAAATAAATATATTTATGATCATTAAAAAAAAAAAAAAAAAAAAAAAAAAACATGCCATGCAGCTGCATTACCGTACTGCGTA]

[+] EMBL BF936063             [TTTAAAGTAACCGCATTGTTACCATCATCATCACCATCATCATCATTATTTACTATAAACATAATAATGAATAAATTATTATTATTACTATTATATTTCATCTTATGTAATCTTTTGACAATGGTATACAGTGGACATAGAAATAAATATGATCAATATCAAATAAATTCTGCTTATCAACAACCTAATCAAAATAATAAATATAATGGTGATGATTATACTAATAAATATCCAAGTGGTAATTATTATTCGCCTACAGACAATCAGTACGGTAATAACTATGATAATAATAAAAATGATAATAATTATGGTAGTTCCAATTACCAACCAACGTCTTATGATTCATATACCAAT TATAATGGGGATAAGTACAATAATAATAATAATAATAATAA      CAATAATAA TAATAATGGTGATTATAACAATAACGATTATA CATCAACAAATAATAATTATCAAGCAAATAATTATAAAGATTATGGAT CCAGTGATATATCACC TACTAGTGAATA  TGGTATTAGTTCAATTGGAA CT GG                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                 ]
[+] EMBL AI068217             [ TTAAAGTAACCGCATTGTTACCATCATCATCACCATCATCATCATTATTTACTATAAACATAATAATGAATAAATTATTATTATTACTATTATATTTCATCTTATGTAATCTTTTGACAATGGTATACAGTGGACATAGAAATAAATATGATCAATATCAAATAAATTCTGCTTATCAACAACCTAATCAAAATAATAAATATAATGGTGATGATTATACTAATAAATATCCAAGTGGTAATTATTATTCGCCTACAGACAATCAGTACGGTAATAACTATGATAATAATAAAAATGATAATAATTATGGTAGTTCCAATTACCAACCAACGTCTTATGATTCATATACCAAT TATAATGGGGATAAGTAC      AATAATAATAATAATAA      CAATAATAA TAATAATGGTGATTATAACAATAACGATTATA CATCAACAAATAATAATTATCAAGCAAATAATTATAAAGATTATGGAT CCAGTGATATATCACC TACTAGTGAATA  TGGTATTAGTTCAATTGGAA CT GGAGTTATATCTGGTTCTAAGTATAGTCATAGTCGATTAAATGTTCATGGTAAAATGACTGGTGTTGGACATCAAGATTATGGTGTACATTATTTATCATTGACTAAATTCCGTAAAGGTGGTGGCTATGATATCTATGGGAAAAAACGACAATTTTTAGACT                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                ]
[+] EMBL AI067762             [       TAACCGCATTGTTACCATCATCATCACCATCATCATCATTATTTACTATAAACATAATAATGAATAAATTATTATTATTACTATTATATTTCATCTTATGTAATCTTTTGACAATGGTATACAGTGGACATAGAAATAAATATGATCAATATCAAATAAATTCTGCTTATCAACAACCTAATCAAAATAATAAATATAATGGTGATGATTATACTAATAAATATCCAAGTGGTAATTATTATTCGCCTACAGACAATCAGTACGGTAATAACTATGATAATAATAAAAATGATAATAATTATGGTAGTTCCAATTACCAACCAACGTCTTATGATTCATATACCAAT TATAATGGGGATAAGTACAATAATAATAATAATAATAATAA      CAATAATAA TAATAATGGTGATTATAACAATAA                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                    ]
[+] EMBL AI976602             [           CGCATTGATACCATCATCATCACCATCATCATCATTATTTACTATAAACATAATAATGAATAAATTATTATTATTACTATTATATCTCATCTTATGTAATCTTTTGACAATGGTATACAGTGGACATACAAATAAATATGATCAATATCAAATAAATTCTGCTTATCAACAACCTAATCAAAATAATAAATATAATGGTGATGATTATACTAATAAATATCCAAGTGGTAATTATTATTCGCCTACAGACAATCAGTACGG GATTACTATGATAATAATAAAAATGATAATAATTATGCGAGTTCCAATTACCAACCAACGTCTTATGATTCATATACCAAT TATAATGGGGATAAGTAC      AATAATAATAATAATAA      CAATAATAA TAATAATGGTGATTATAACAATAACGATTATA CATCAACAAATAATAATTATCAAGCAAATAATTATAAAGATTATGGAT CCAGTGATATATCACC TACTAGTGAATA  TGGTATTAGTTCAATTGGAA CT Gc                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                 ]
[+] EMBL BF936078             [            GCATGGCTACCATCATCATCACCATCATCATCATTACCTACTATCAACATAATAATGAATAAATTATTATTATTACTATTATATTTCATCTTATGTAATCTTTTGACAATGGTATACAGAGGACATAGAAATAAATATGATCAATATCAAATAAATTCTGCTTATCAACAACCTAATCAAAATAATAAATATAAAGGTGATGATTATACTAATAAATATCCAAGTGGCAATTATTATTCGCCTACAGACAATCAGTACGGTAATAACTATGATAATAATAAAAATGATAATAATTATGGTAGTTCCAATTACCAACCAACGTCTTATGATTCATATACCAAT TATAATGGGGATGAGTTC      AATACTAATAATCATAA      CAATTATAA TAATAATGGCGATTATAACAATAACGATTATA CATCAACACATAATAATTATCAAACAAATAATTATAAAGATTATGGAT CCAGTGATATATCACC TACTAct                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                  ]
[-] EMBL BF936927             [                                                                                                                                                                                                                                   ATATCCAAGTGGTAATTATTATTCGCCTACAGACAATCAGTACGGTAATAACTATGATAATAATAACAATGATAATAATTATGGTAGTTCCAATTACCAACCAACGTCTTATGATTCATATACCAAT TATAATGGGGATAAGTACAATAATAATAATAATAATAATAA      CAATAATAA TAATAATGGTGATTATAACAATAACGATTATA CATCAACAAATAATAATTATCAAGCAAATAATTATAAAGATTATGGAT CCAGTGATATATCACC TACTAGTGAATA  TGGTATTAGTTCAATTGGAA CT GGAGTTATATCTGGTTCTAAGTATAGTCATAGTCGATTAAATGTTCATGGTAAAATGACTGGTGTTGGACATCAAGATTATGGTGTACATTATTTATCATTGACTAAATTCCGTAAAGGTGGTGGCTATGATATCTATGGGAAAAAACGACAATTTTTAGACTATGATACACAAGGACATGTGAAAAAATATGGTAATCAACATATGAAAGCGAAATTTGAAGTTGTTGGTAATTTGCAAGGCTATTCAACATTCAAAGATAAATCAAGTTTTAAACCAAGCGGAAGTACTTATGGTAATTATGGTGGTAACGGAAACGGTGGTCAATCCTACTGAAGATTAAAACAACAAAGCACAATAGTGAACAAGGAACAAGATCATTATTATTATTATT                                                                                         ]
[+] EMBL AI976542             [                                                                                                                                                                                                                                                                                                           TAATAATTATGGTAGTTCCAATTACCAACCAACGTCTTATGATTCATATACCAAT TATAATGGGGATAAGTACAATAATAATAATAATAATAATAA      CAATAATAA TAATAATGGTGATTATAACAATAACGATTATA CATCAACAAATAATAATTATCAAGCAAATAATTATAAAGATTATGGAT CCAGTGATATATCACC TACTAGTGAATA  TGGTATTAGTTCAATTGGAA CT GGAGTTATATCTGGTTCTAAGTATAGTCATAGTCGATTAAATGTTCATGGTAAAATGACTGGTGTTGGACATCAAGATTATGGTGTACATTATTTATCATTGACTAAATTCCGTAAAGGTGGTGGCTATGATATCTATGGGAAAAAACGACAATTTTTAGACTATGATACACAAGGACATGTGAAAAAATATGGTAATCAACATATGAAAGCGAAATTTGAAGTTGTTGGTAATTTGCAAGGCTATTCAACATTCAAAGATAAATCAAGTTTTAAACCAAGCGGAAGTACTTATG                                                                                                                                                                                            ]
[+] EMBL BF936344             [                                                                                                                                                                                                                                                                                                           TAATAATTATGGTAGTTCCAATTACCAACCAACGTCTTATGATTCATATACCAAT TATAATGGGGATAAGTACAATAATAATAATAATAATAATAA      CAATAATAA TAATAATGGTGATTATAACAATAACGATTATA CATCAACAAATAATAATTATCAAGCAAATAATTATAAAGATTATGGAT CCAGTGATATATCACC TACTAGTGAATA  TGGTATTAGTTCAATTGGAA CT GGAGTTATATCTGGTTCTAAGTATAGTCATAGTCGATTAAATGTTCATGGTAAAATGACTGGTGTTGGACATCAAGATTATGGTGTACATTATTTATCATTGACTAAATTCCGTAAAGGGTGTGGCTATGATATCTATGGGAAAAAACGACAATTTTTAGACTATGATACACA                                                                                                                                                                                                                                                                                                                      ]
[+] EMBL BF936424             [                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                   GATTCATATACCAAT TATAATGGGGATAAGTAC      AATAATAATAATAATAA      CAATAATAATTAATAATGGTGATTATAACAATAACGATTATACCATCAACAAATAATAATTATCAAGCAAATAATTATAAAGATTATGGATCCCAGTGATATATCACCTTACTAGTGAATATTTGGTATTAGTTCAATTGGAACCTGGGAGTT                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                             ]
[+] EMBL SM535                [                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                             CCAAT TATAATGGGGATAAGTAC      AATAATAATAATAATAA      CAATAATAA TAATAATGGTGATTATAACAATAACGATTATA CATCAACAAATAATAATTATCAAGCAAATAATTATAAAGATTATGGAT CCAGTGATATATCACC TACTAGTGAATA  TGGTATTAGTTCAATTGGAA CT GGAGTTATATCTGGTTCTAAGTATAGTCATAGTCGATTAAATGT                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                       ]
[-] EMBL BF936833             [                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                              CAATATA AATGGGGATAAGTGC      AATAATAATAATAATAATAATACCAATAATAA TAATAATGGTGATTATAACAATAACGATTATA CATCAACAAATAATAATTATCAAGCAAATAATTATAAAGATTATGGAT CCAGTGATATATCACC TACTAGTGAATA  TGGTATTAGTTCAATTGGAA CT GGAGTTATATCTGGTTCTAAGTATAGTCATAGTCGATTAAATGTTCATGGTAAAATGACTGGTGTTGGACATCAAGATTATGGTGTACATTATTTATCATTGACTAAATTCCGTAAAGGTGGTGGCTATGATATCTATGGGAAAAAACGACAATTTTTAGACTATGATACACAAGGACATGTGAAAAAATATGGTAATCAACATATGAAAGCGAAATTTGAAGTTGTTGGTAATTTGCAAGGCTATTCAACATTCAAAGATAAATCAAGTTTTAAACCAAGCGGAAGTACTTATGGTAATTATGGTGGTAACGGAAACGGTGATCAATCCTACTGAAGATTAAAACAACAAAGCACAATAGTGAACAA                                                                                                                   ]
[-] EMBL BF936786             [                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                AGTGC      AATAATAATAATAATCC      CAATAATAA TAATAATGGTGATTATACCAATAACGATTATA CATCAACAAATAATAATTATCAAGCAAATAATTATAAAGATTATGGAT CCAGTGATATATCACC TACTAGTGAATA  TGGTATTAGTTCAATTGGAA CT GGAGTTATATCTGGTTCTAAGTATAGTCATAGTCGATTAAATGTTCATGGTAAAATGACTGGTGTTGGACATCAAGATTATGGTGTACATTATTTATCATTGACTAAATTCCGTAAAGGTGGTGGCTATGATATCTATGGGAAAAAACGACAATTTTTAGACTATGATACACAAGGACATGTGAAAAAATATGGTAATCAACATATGAAAGCGAAATTTGAAGTTGTTGGTAATTTGCAAGGCTATTCAACATTCAAAGATAAATCAAGTTTTAAACCAAGCGGAAGTACTTATGGTAATTATGGTGGTAACGGAAACGGTGGTCAATCCTACTGAAGATTAAAACAACAAAGCACAATAGTGAACAAGGAACAAGATCATTATTATTATTATTATCAATAA                                                                                 ]
[-] EMBL BF937006             [                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                AATGGTGATTATAACAATANCGATTATA CATCAACAAATAATAATTATCAAGCAAATAATTATAAAGATTATGGAT CCAGTGATATATCACC TACTAGTGAATA  TGGTATTAGTTCAATTGGAA CT GGAGTTATATCTGGTTCTAAGTATAGTCATAGTCGATTAAATGTTCATGGTAAAATGACTGGTGTTGGACATCAAGATTATGGTGTACATTATTTATCATTGACTAAATTCCGTAAAGGTGGTGGCTATGATATCTATGGGAAAAAACGACAATTTTTAGACTATGATACACAAGGACATGTGAAAAAATATGGTAATCAACATATGAAAGCGAAATTTGAAGTTGTTGGTAATTTGCAAGGCTATTCAACATTCAAAGATAAATCAAGTTTTAAACCAAGCGGAAGTACTTATGGTAATTATGGTGGTAACGGAAACGGTGGTCAATCCTACTGAAGATTAAAACAACAAAGCACAATAGTGAACAAGGAACAAGATCATTATTATTATTATTATCAATAAAATAAATATATTT                                                                    ]
[-] EMBL BF936612             [                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                   CAAATAATAATTATCAAGCAAATAATTATAAAGATTATGGAT CCAGTGATATATCACC TACTAGTGAATA  TGGTATTAGTTCAATTGGAA CT GGAGTTATATCTGGTTCTAAGTATAGTCATAGTCGATTAAATGTTCATGGTAAAATGACTGGTGTTGGACATCAAGATTATGGTGTACATTATTTATCATTGACTAAATTCCGTAAAGGTGGTGGCTATGATATCTATGGGAAAAAACGACAATTTTTAGACTATGATACACAAGGACATGTGAAAAAATATGGTAATCAACATATGAAAGCGAAATTTGAAGTTGTTGGTAATTTGCAAGGCTATTCAACATTTAAAGATAAATCAAGTTTTAAACCAAGCGGAAGTACTTATGGTAATTATGGTGGTAACGGAAACGGTGGTCAATCCTACTGAAGATTAAAACAACAAAGCTCAATAGTGAACAAGGAACAAGATCATTATTATTATTATTATCAATAAAATAAATATATTT                                                                    ]
[-] EMBL AI976305             [                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                  AGATTATGGAT CCAGTGATATATCACC TACTAGTGAATA  TGGTATTAGTTCAATTGGAA CT GGAGTTATATCTGGTTCTAAGTATAGTCATAGTCGATTAAATGTTCATGGTAAAATGACTGGTGTTGGACATCAAGATTATGGTGTACATTATTTATCATTGACTAAATTCCGTAAAGGTGGTGGCTATGATATCTATGGGAAAAAACGACAATTTTTAGACTATGATACACAAGGACATGTGAAAAAATATGGTAATCAACATATGAAAGCGAAATTTGAAGTTGTTGGTAATTTGCAAGGCTATTCAACATTCAAAGATAAATCAAGTTTTAAACCAAGCGGAAGTACTTATGGTAATTATGGTGGTAACGGAAACGGTGGTCAATCCTACTGAAGATTAAAACAACAAAGCACAATAGTGAACAAGGAACAAGATCATTATTATTATTATTATCAATAAAATAAATATATTT                                                                    ]
[-] EMBL CD072658             [                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                     TATATCACC TACTAGTGAATA  TGGTATTAGTTCAATTGGAA CT GGAGTTATATCTGGTTCTAAGTATAGTCATAGTCGATTAAATGTTCATGGTAAAATGACTGGTGTTGGACATCAAGATTATGGTGTACATTATTTATCATTGACTAAATTCCGTAAAGGTGGTGGCTATGATATCTATGGGAAAAAACGACAATTTTTAG                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                   ]
[-] EMBL AI975627             [                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                        ATCACC  ACTAGTGAATA  TGGTATTAGTTCAATTGGAA CT GGAGTTATATCTGGTTCTAAGTATAGTCATAGTCGATTAAATGTTCATGGTAAAATGACTGGTGTTGGACATCAAGATTATGGTGTACATTATTTATCATTGACTAAATTCCGTAAAGGTGGTGGCTATGATATCTATGGGAAAAAACGACAATTTTTAGACTATGATACACAAGGACATGTGAAAAAATATGGTAATCAACATATGAAAGCGAAATTTGAAGTTGTTGGTAATTTGCAAGGCTATTCAACATTCAAAGATAAATCAAGTTTTAAACCAAGCGGAAGTACTTATGGTAATTATGGTGGTAACGGAAACGGTGGTCAATCCTACTGAAGATTAAAACAACAAAGCACAATAGTGAACAAGGAACAAGATCATTATTATTATTATTATCAATAAAATAAATATATTT                                                                    ]
[-] EMBL AI976387             [                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                        ATCACC TACTAGTGAATA  TGGTATTAGTTCAATTGGAA CT GGAGTTATATCTGGTTCTAAGTATAGTCATAGTCGATTAAATGTTCATGGTAAAATGACTGGTGTTGGACATCAAGATTATGGTGTACATTATTTATCATTGACTAAATTCCGTAAAGGTGGTGGCTATGATATCTATGGGAAAAAACGACAATTTTTAGACTATGATACACAAGGACATGTGAAAAAATATGGTAATCAACATATGAAAGCGAAATTTGAAGTTGTTGGTAATTTGCAAGGCTATTCAACATTCAAAGATAAATCAAGTTTTAAACCAAGCGGAAGTACTTATGGTAATTATGGTGGTAACGGAAACGGTGGTCAATCCTACTGAAGATTAAAACAACAAAGCACAATAGTGAACAAGGAACAAGATCATTATTATTATTATTATCAATAAAATAAATATATTTATGATCATTAAAAAAAAAAAAAAAAAAAAAAAAAAACATGCCATGCAGCTGCATTACCGTACTGCGTA]
[-] EMBL AI976610             [                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                              GGTATTAGTTCAATTGGAA CT GGAGTTATATCTGGTTCTAAGTATAGTCATAGTCGATTAAATGTTCATGGTAAAATGACTGGTGTTGGACATCAAGATTATGGTGTACATTATTTATCATTGACTAAATTCCGTAAAGGTGGTGGCTATGATATCTATGGGAAAAAACGACAATTTTTAGACTATGATACACAAGGACATGTGAAAAAATATGGTAATCAACATATGAAAGCGAAATTTGAAGTTGTTGGTAATTTGCAAGGCTATTCAACATTCAAAGATAAATCAAGTTTTAAACCAAGCGGAAGTACTTATGGTAATTATGGTGGTAACGGAAACGGTGGTCAATCCTACTGAAGATTAAAACAACAAAGCACAATAGTGAACAAGGAACAAGATCATTATTATTATTATTATCAATAAAATAAATATATTT                                                                    ]
[-] EMBL SM584                [                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                          GACTAAATTCCGTAAAGGTGGTGGCTATGATATCTATGGGAAAAAACGACAATTTTTAGACTATGATACACAAGGACATGTGAAAAAATATGGTAATCAACATATGAAAGCGAAATTTGAAGTTGTTGGTAATTTGCAAGGCTATTCAACATTCAAAGATAAATCAAGTTTTAAACCAAGCGGAAGTACTTATGGTAATTATGGTGGTAACGGAAACGGTGGTCAATCCTACTGAAGATTAAAACAACAAAGCACAATAGTG                                                                                                                        ]
[-] EMBL SM626                [                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                          GACCAAATTCCGTAAAGGTGGTGGCTATGATATCTATGGGAAAAAACGACNA CTTTAGACTATGATACACAAGGACATGTGANNAAATATGGTAATCAACATATGAAAGCGAAATTTGAAGTTGTTGGTAATTTGCAAGGCTATTCAACATTCAAAGATAAATCAAGTTTTAAACCAAGCGGAAGTACTTATGGTAATTATGGTGGTAACGGAAACGGTGGTCAATCCTACTGAAGATTAAAACAACAAAGCACAATAGTG                                                                                                                        ]
[+] EMBL SM6581               [                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                 GAAAAAACGACAATTTTTAGACTATGATACACAAGGACATGTGAAAAAATATGGTAA CAACATATGAAAGCGAAATTTGAAGTTGTTGGTAATTTGCAAGGCTA TCAACATTCAAAGATAAATTAAGTTTTAAACCAAGCGGAAGTACTTATGGTAATTAT GTGGTAACGGAAAC GT GTCAATCCTACT                                                                                                                                                     ]
[+] EMBL SM280                [                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                          TGAAAAAATNTGGTAATCAACATNTGAAAGCGAAATTGGANGTTGTTGGTAATTGGNAAGGNTATTCACCATTCAAAGATAANTCAAGTTTTAAACCAAGCGGAAGTACTTATGGTAATTATGGTGGTAACGGAAACGGTGGTCAATCCTACTGAAGATTAAAACAACANAGCACAATAGTGAACAAGGAACAAGATCATTATTATTATTATTATCAATAAAATAANTNTNTT                                                                     ]


>consensus_10989#0 TTTAAAGTAACCGCATTGTTACCATCATCATCACCATCATCATCATTATTTACTATAAAC ATAATAATGAATAAATTATTATTATTACTATTATATTTCATCTTATGTAATCTTTTGACA ATGGTATACAGTGGACATAGAAATAAATATGATCAATATCAAATAAATTCTGCTTATCAA CAACCTAATCAAAATAATAAATATAATGGTGATGATTATACTAATAAATATCCAAGTGGT AATTATTATTCGCCTACAGACAATCAGTACGGTAATAACTATGATAATAATAAAAATGAT AATAATTATGGTAGTTCCAATTACCAACCAACGTCTTATGATTCATATACCAATTATAAT GGGGATAAGTACAATAATAATAATAATAACAATAATAATAATAATGGTGATTATAACAAT AACGATTATACATCAACAAATAATAATTATCAAGCAAATAATTATAAAGATTATGGATCC AGTGATATATCACCTACTAGTGAATATGGTATTAGTTCAATTGGAACTGGAGTTATATCT GGTTCTAAGTATAGTCATAGTCGATTAAATGTTCATGGTAAAATGACTGGTGTTGGACAT CAAGATTATGGTGTACATTATTTATCATTGACTAAATTCCGTAAAGGTGGTGGCTATGAT ATCTATGGGAAAAAACGACAATTTTTAGACTATGATACACAAGGACATGTGAAAAAATAT GGTAATCAACATATGAAAGCGAAATTTGAAGTTGTTGGTAATTTGCAAGGCTATTCAACA TTCAAAGATAAATCAAGTTTTAAACCAAGCGGAAGTACTTATGGTAATTATGGTGGTAAC GGAAACGGTGGTCAATCCTACTGAAGATTAAAACAACAAAGCACAATAGTGAACAAGGAA CAAGATCATTATTATTATTATTATCAATAAAATAAATATATTTATGATCATTAAAAAAAA AAAAAAAAAAAAAAAAAAACATGCCATGCAGCTGCATTACCGTACTGCGTA



consensusID : consensus_10989#1
NCBI blastX ! send the sequence to the NCBI site !
NCBI blastN ! send the sequence to the NCBI site !
Sequences nbr = 1
consensus length = 338
fasta sequence
                              [TAGACTATCACACACAAGGACATGTGAAAAAATATGGTAATCACCATATATAAGCGAAATTTGAAGTTGTTGGTAATTTGAAAGAGCTATTCAACATTCAAAAATAAATAAAGTTTTAAACCAAGCGGAAGTACTTTTGGTAATTATGGTGGTAACGGAAACGGTGGTCAATCTTGCTAAAAATTAAACCAACAAAGCCCAATAGTGAACAAGGAACAAAATCATAATAATTATAATTATCAATAAAATAAATATATTTATGATCATTAAAAAAAAAAAAAAAAAATAAAAAAAAAAAAAAAAAAAAAACATGCCATGCAGCTGCATTACCGTAATGC]

[-] EMBL AI975194             [TAGACTATCACACACAAGGACATGTGAAAAAATATGGTAATCACCATATATAAGCGAAATTTGAAGTTGTTGGTAATTTGAAAGAGCTATTCAACATTCAAAAATAAATAAAGTTTTAAACCAAGCGGAAGTACTTTTGGTAATTATGGTGGTAACGGAAACGGTGGTCAATCTTGCTAAAAATTAAACCAACAAAGCCCAATAGTGAACAAGGAACAAAATCATAATAATTATAATTATCAATAAAATAAATATATTTATGATCATTAAAAAAAAAAAAAAAAAATAAAAAAAAAAAAAAAAAAAAAACATGCCATGCAGCTGCATTACCGTAATGC]


>consensus_10989#1 TAGACTATCACACACAAGGACATGTGAAAAAATATGGTAATCACCATATATAAGCGAAAT TTGAAGTTGTTGGTAATTTGAAAGAGCTATTCAACATTCAAAAATAAATAAAGTTTTAAA CCAAGCGGAAGTACTTTTGGTAATTATGGTGGTAACGGAAACGGTGGTCAATCTTGCTAA AAATTAAACCAACAAAGCCCAATAGTGAACAAGGAACAAAATCATAATAATTATAATTAT CAATAAAATAAATATATTTATGATCATTAAAAAAAAAAAAAAAAAATAAAAAAAAAAAAA AAAAAAAAACATGCCATGCAGCTGCATTACCGTAATGC



consensusID : consensus_10989#2
NCBI blastX ! send the sequence to the NCBI site !
NCBI blastN ! send the sequence to the NCBI site !
Sequences nbr = 2
consensus length = 256
fasta sequence
                              [AATTTGCAAGGTTATTCAACATTCAAAAATAAATCAAGTTTTAAACCAAGCGAAAGGAATTATGGTAATTATGGTGGTAAGGAAAACGGTGGTCAATCCTATTGAAAATTAAAACAACAAAGCCCAATAGTGAACAAGGACCAAGATCATTATTATTATTATTATCAATAAAATAAATATATTTATGTTCTTTTAAAAAAAAAAAAAAAAAAAAAAAAAAAAAATAAAAAAAAATACATGCCATGCAGCTGCATTA]

[-] EMBL AW016991             [AATTTGCAAGGTTATTCAACATTCAAAAATAAATCAAGTTTTAAACCAAGCGAAAGGAATTATGGTAATTATGGTGGTAAGGAAAACGGTGGTCAATCCTATTGAAAATTAAAACAACAAAGCCCAATAGTGAACAAGGACCAAGATCATTATTATTATTATTATCAATAAAATAAATATATTTATGTTCTTTTAAAAAAAAAAAAAAAAAAAAAAAAAAAAAATAAAAAAAAATACATGCCATGCAGCTGCATTA]
[-] EMBL BF936303             [                                                                                              AATCCTGCTGAAGATTAAACCAACAAAGCCCAATAGTGAACAAGGAACAAGATCATTATTATTATTATTATCAATAAAATAAATATATTTATGTTCTTTTAAAAAAAAAAAAAAAAAAAAAAAAAAAAAA AAAAAAACNAACATGCCATGCAGCTGCATTA]


>consensus_10989#2 AATTTGCAAGGTTATTCAACATTCAAAAATAAATCAAGTTTTAAACCAAGCGAAAGGAAT TATGGTAATTATGGTGGTAAGGAAAACGGTGGTCAATCCTATTGAAAATTAAAACAACAA AGCCCAATAGTGAACAAGGACCAAGATCATTATTATTATTATTATCAATAAAATAAATAT ATTTATGTTCTTTTAAAAAAAAAAAAAAAAAAAAAAAAAAAAAATAAAAAAAAATACATG CCATGCAGCTGCATTA



consensusID : consensus_10989#3
NCBI blastX ! send the sequence to the NCBI site !
NCBI blastN ! send the sequence to the NCBI site !
Sequences nbr = 1
consensus length = 156
fasta sequence
                              [ATGGTGGTAACGGAAACGGTGGTCAATCATTCTGAAGATTAGAACAACAAAGCGCAATAGTGAACAAGGAACAAGATCATTTTTTTTTTTATTATCAATAAAATAAATATATTTATGATCATTCCATGCAGATGCATTACCGTAATGCGTCCCTCC]

[-] EMBL AI975525             [ATGGTGGTAACGGAAACGGTGGTCAATCATTCTGAAGATTAGAACAACAAAGCGCAATAGTGAACAAGGAACAAGATCATTTTTTTTTTTATTATCAATAAAATAAATATATTTATGATCATTCCATGCAGATGCATTACCGTAATGCGTCCCTCC]


>consensus_10989#3 ATGGTGGTAACGGAAACGGTGGTCAATCATTCTGAAGATTAGAACAACAAAGCGCAATAG TGAACAAGGAACAAGATCATTTTTTTTTTTATTATCAATAAAATAAATATATTTATGATC ATTCCATGCAGATGCATTACCGTAATGCGTCCCTCC



consensus multiple alignement with clustalw

CLUSTAL W (1.82) multiple sequence alignment


consensus_10989#1      ------------------------------------------------------------
consensus_10989#2      ------------------------------------------------------------
consensus_10989#0      TTTAAAGTAACCGCATTGTTACCATCATCATCACCATCATCATCATTATTTACTATAAAC 60
consensus_10989#3      ------------------------------------------------------------
                                                                                   

consensus_10989#1      ------------------------------------------------------------
consensus_10989#2      ------------------------------------------------------------
consensus_10989#0      ATAATAATGAATAAATTATTATTATTACTATTATATTTCATCTTATGTAATCTTTTGACA 120
consensus_10989#3      ------------------------------------------------------------
                                                                                   

consensus_10989#1      ------------------------------------------------------------
consensus_10989#2      ------------------------------------------------------------
consensus_10989#0      ATGGTATACAGTGGACATAGAAATAAATATGATCAATATCAAATAAATTCTGCTTATCAA 180
consensus_10989#3      ------------------------------------------------------------
                                                                                   

consensus_10989#1      ------------------------------------------------------------
consensus_10989#2      ------------------------------------------------------------
consensus_10989#0      CAACCTAATCAAAATAATAAATATAATGGTGATGATTATACTAATAAATATCCAAGTGGT 240
consensus_10989#3      ------------------------------------------------------------
                                                                                   

consensus_10989#1      ------------------------------------------------------------
consensus_10989#2      ------------------------------------------------------------
consensus_10989#0      AATTATTATTCGCCTACAGACAATCAGTACGGTAATAACTATGATAATAATAAAAATGAT 300
consensus_10989#3      ------------------------------------------------------------
                                                                                   

consensus_10989#1      ------------------------------------------------------------
consensus_10989#2      ------------------------------------------------------------
consensus_10989#0      AATAATTATGGTAGTTCCAATTACCAACCAACGTCTTATGATTCATATACCAATTATAAT 360
consensus_10989#3      ------------------------------------------------------------
                                                                                   

consensus_10989#1      ------------------------------------------------------------
consensus_10989#2      ------------------------------------------------------------
consensus_10989#0      GGGGATAAGTACAATAATAATAATAATAACAATAATAATAATAATGGTGATTATAACAAT 420
consensus_10989#3      ------------------------------------------------------------
                                                                                   

consensus_10989#1      ------------------------------------------------------------
consensus_10989#2      ------------------------------------------------------------
consensus_10989#0      AACGATTATACATCAACAAATAATAATTATCAAGCAAATAATTATAAAGATTATGGATCC 480
consensus_10989#3      ------------------------------------------------------------
                                                                                   

consensus_10989#1      ------------------------------------------------------------
consensus_10989#2      ------------------------------------------------------------
consensus_10989#0      AGTGATATATCACCTACTAGTGAATATGGTATTAGTTCAATTGGAACTGGAGTTATATCT 540
consensus_10989#3      ------------------------------------------------------------
                                                                                   

consensus_10989#1      ------------------------------------------------------------
consensus_10989#2      ------------------------------------------------------------
consensus_10989#0      GGTTCTAAGTATAGTCATAGTCGATTAAATGTTCATGGTAAAATGACTGGTGTTGGACAT 600
consensus_10989#3      ------------------------------------------------------------
                                                                                   

consensus_10989#1      ------------------------------------------------------------
consensus_10989#2      ------------------------------------------------------------
consensus_10989#0      CAAGATTATGGTGTACATTATTTATCATTGACTAAATTCCGTAAAGGTGGTGGCTATGAT 660
consensus_10989#3      ------------------------------------------------------------
                                                                                   

consensus_10989#1      -------------------------TAGACTATCACACACAAGGACATGTGAAAAAATAT 35
consensus_10989#2      ------------------------------------------------------------
consensus_10989#0      ATCTATGGGAAAAAACGACAATTTTTAGACTATGATACACAAGGACATGTGAAAAAATAT 720
consensus_10989#3      ------------------------------------------------------------
                                                                                   

consensus_10989#1      GGTAATCACCATATATAAGCGAAATTTGAAGTTGTTGGTAATTTGAAAGAGCTATTCAAC 95
consensus_10989#2      ---------------------------------------AATTTGCAAG-GTTATTCAAC 20
consensus_10989#0      GGTAATCAACATATGAAAGCGAAATTTGAAGTTGTTGGTAATTTGCAAG-GCTATTCAAC 779
consensus_10989#3      ------------------------------------------------------------
                                                                                   

consensus_10989#1      ATTCAAAAATAAATAAAGTTTTAAACCAAGCGGAAGTACTTTTGGTAATTATGGTGGTAA 155
consensus_10989#2      ATTCAAAAATAAATCAAGTTTTAAACCAAGCGAAAGGAATTATGGTAATTATGGTGGTAA 80
consensus_10989#0      ATTCAAAGATAAATCAAGTTTTAAACCAAGCGGAAGTACTTATGGTAATTATGGTGGTAA 839
consensus_10989#3      --------------------------------------------------ATGGTGGTAA 10
                                                                         **********

consensus_10989#1      CGGAAACGGTGGTCAATCTTGCTAAAAATTAAACCAACAAAGCCCAATAGTGAACAAGGA 215
consensus_10989#2      GGAAAACGGTGGTCAATCCTATTGAAAATTAAAACAACAAAGCCCAATAGTGAACAAGGA 140
consensus_10989#0      CGGAAACGGTGGTCAATCCTACTGAAGATTAAAACAACAAAGCACAATAGTGAACAAGGA 899
consensus_10989#3      CGGAAACGGTGGTCAATCATTCTGAAGATTAGAACAACAAAGCGCAATAGTGAACAAGGA 70
                        * *************** *  * ** **** * ********* ****************

consensus_10989#1      ACAAAATCATAATAATTATAATTATCAATAAAATAAATATATTTATGATCATTAAAAAAA 275
consensus_10989#2      CCAAGATCATTATTATTATTATTATCAATAAAATAAATATATTTATGTTCTTTTAAAAAA 200
consensus_10989#0      ACAAGATCATTATTATTATTATTATCAATAAAATAAATATATTTATGATCATTAAAAAAA 959
consensus_10989#3      ACAAGATCATTTTTTTTTTTATTATCAATAAAATAAATATATTTATGATCATTCCATGCA 130
                        *** *****  *  ** * *************************** ** **  *   *

consensus_10989#1      AAAAAAAAAAATAAAAAAAAAAAAAAAAAAAAAA--CATGCCATGCAGCTGCATTACCGT 333
consensus_10989#2      AAAAAAAAAAAAAAAAAAAAAAAATAAAAAAAAATACATGCCATGCAGCTGCATTA---- 256
consensus_10989#0      AAAAAAAAAAAAAAAAAAAA----------------CATGCCATGCAGCTGCATTACCGT 1003
consensus_10989#3      GATGCATTACCGTAATGCGTCCCTCC---------------------------------- 156
                        *   *  *    **                                             

consensus_10989#1      AATGC--- 338
consensus_10989#2      --------
consensus_10989#0      ACTGCGTA 1011
consensus_10989#3      --------
                               




Copyright Thu Nov 6 12:32:27 CET 2003 Hubert Wassner    (hubert.wassner@noos.fr)