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Schistosoma mansoni
cluster # 11 cluster # 11       Sequences # 2       consensus # 1


see consensus multiple alignment with clustalw

Direct access to contigs :
consensus_11#0 length = 500 sequences # 2  

consensusID : consensus_11#0
NCBI blastX ! send the sequence to the NCBI site !
NCBI blastN ! send the sequence to the NCBI site !
Sequences nbr = 2
consensus length = 500
fasta sequence
                              [AAAACGGGTGGAGAGTTTAATTATTTTTCCTTCTCTTTTATCATACACTGACAGGTTTTGAAAATTAAACTGTTCATATTGGTGTCATAAATTTTATACGCAATTGTATTTGTTTCTTGTCAAGTTCGTATATTTAAATTATATTTTATTTCCTATTCTGCAATAAGATAAATGTACACGTTATGACCATAAATTCAAGATTTAGACTTTAGTCTTGTAACTGAACTA-TCTGTTTAATATATTACATCACAGTTCTTGTAATTTGGTGGGGTAATTAATTTCTTTCCCAAGGCCACTTTT-GTTGGGTTCATTTGTCCTATGTTGATTGGTCCTGATAATCTGTGGGATTATCGACCATCGTTTACCTGAATTCCAGCGAACATATACG-TTTTTCGATCGAGTCGTAACTAAATTCTCTTATTACGAAGTGTTTTACTTAAATTATACATATTCTTACACAGTGATGCTGTAATATAAGTTGAATACAAACAGGGTTTTTA]

[+] EMBL CD154951             [AAAACGGGTGGAGAGTTTAATTATTTTTCCTTCTCTTTTATCATACACTGACAGGTTTTGAAAATTAAACTGTTCATATTGGTGTCATAAATTTTATACGCAATTGTATTTGTTTCTTGTCAAGTTCGTATATTTAAATTATATTTTATTTCCTATTCTGCAATAAGATAAATGTACACGTTATGACCATAAATTCAAGATTTAGACTTTAGTCTTGTAACTGAACTA TCTGTTTAATATATTACATCACAGTTCTTGTAATTTGGTGGGGTAATTAATTTCTTTCCCAAGGCCACTTTT GTTGGGTTCATTTGTCCTATGTTGATTGGTCCTGATAATCTGTGGGATTATCGACCATCGTTTACCTGAATTCCAGCGAACATATACG TTTTTCGATCGAGTCGTAACTAAATTCTCTTATTACGAAGTGTTTTACTTAAATTATACATATTCTTACACAGTGATGCTGTAATATAAGTTGAATACAAACAGGGTTTTTA]
[+] EMBL CD155086             [AAAACGGGTGGAGAGTTTAATTATTTTTCCTTCTCTTTTATCATACACTGACAGGTTGAAAAAATTAAACTGTTCATATTGGTGTCATAAATTTTATACGCAATTGTATTTGTTTCTTGTCAAGTTCGTATATTTAAATTATATTTTATTTCCTATTCTGCAATAAGATAAATGTACACGTTATGACCATAAATTCAAGATTTAGACTTTAGTCTTGAAACTG ACTATTGTGTTTAATATATTACATCACAGTTCTTGTAATTTGGTGGGGTAATTAATTTCTTTCCCACGGCCACTTTTGGTTGGGTTCATTTGTCCTATGTTGATTGGTCCTGANTATCTGNNGGATTATCGACCATCGTTTACCTGAATTCCAGCGAACATATACGTTTTTTCGATCGAGTCGTAACTAAATTCTCTTATTACGAAGTGTTNTACGTCAAATATACATATTCCTACACAGGGATGCTGTAATATAAG TGAATAC AACCGGGTTTTT ]


>consensus_11#0 AAAACGGGTGGAGAGTTTAATTATTTTTCCTTCTCTTTTATCATACACTGACAGGTTTTG AAAATTAAACTGTTCATATTGGTGTCATAAATTTTATACGCAATTGTATTTGTTTCTTGT CAAGTTCGTATATTTAAATTATATTTTATTTCCTATTCTGCAATAAGATAAATGTACACG TTATGACCATAAATTCAAGATTTAGACTTTAGTCTTGTAACTGAACTATCTGTTTAATAT ATTACATCACAGTTCTTGTAATTTGGTGGGGTAATTAATTTCTTTCCCAAGGCCACTTTT GTTGGGTTCATTTGTCCTATGTTGATTGGTCCTGATAATCTGTGGGATTATCGACCATCG TTTACCTGAATTCCAGCGAACATATACGTTTTTCGATCGAGTCGTAACTAAATTCTCTTA TTACGAAGTGTTTTACTTAAATTATACATATTCTTACACAGTGATGCTGTAATATAAGTT GAATACAAACAGGGTTTTTA



clustalw multiple alignements is not computed in this case


Copyright Thu Nov 6 12:32:27 CET 2003 Hubert Wassner    (hubert.wassner@noos.fr)