cluster # 1103

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Schistosoma mansoni
cluster # 1103 cluster # 1103 Sequences # 2 consensus # 1

see consensus multiple alignment with clustalw

Direct access to contigs :

consensus_1103#0 length = 910 sequences # 2

consensusID : consensus_1103#0
NCBI blastX ! send the sequence to the NCBI site !
NCBI blastN ! send the sequence to the NCBI site !
Sequences nbr = 2
consensus length = 910
fasta sequence

                              [CAAATAAAGCACGTGTTATTGACTTATTTCATCGTAAAGATCGTGATCGAGATGGTCGACTTACAAGAGCTGAATTTATTGATGGTATTATAGAAATGAAATTCCAAACAAGTCGTGTTGAAATGGAAACAGTTGCAGATATATTCGATGCTAATGGAGATGGATATATTGATTATCGTGAATGTTTAAATGCACTAAGAGCTAATTATACTAATTTAGATAGAACATCATCATCGAATACTAATGGTGGTAGTTCATTAAGCTTAAATCGTTTCGGTCCATCAGATGAAGAAACCATTAATGATGAATTAAAACGTCAAGTTGGATTGTGTACATGTCATAACACATATAAAATTAAGAAAATGGCAACAAATAAATATCGGTTCGGTGACTCACAAAAATTATGTCTAGTTCGCATCCTTCGTAGTGCTGTAATGGCTCGTGTAGGTGGTGGCTGGATTACACTGGACGAATTTTTAGTGAAAAATGATCCATGTCGAGATGCCTGTGAACGCTTAACTAGTATAGCAGATTTAGCTAAAGCAGCCGGTGTTGGTCACAACTCATACTGGTCTCCTTCATCTGTTACTTTTCAACATTCATCTTCAACAGTAAAATCGAATCGAAATAATAGTGCTAATAATTATAAATATAATCATCCGGTGATTAGTTCAACAAGTAGTTGTAGTGAAAGTGGTCATAGTAGTAGTTGTCATGATAGTAAACAGATTACTGACTATTTTATATCGAATACAATGACTAAAAATCCTGTAGTTAAATCTTCTGAATCATCTTTATCCAGTTCATCACGTTTAAAAACTGTTCATAAACGTTCACGTTATGATACTCATAATTTATATCAATTAATGATGAATGGTCCTGGACAAGACCATGCATTTTATTTAGTTAT]

[+] EMBL CD120852             [CAAATAAAGCACGTGTTATTGACTTATTTCATCGTAAAGATCGTGATCGAGATGGTCGACTTACAAGAGCTGAATTTATTGATGGTATTATAGAAATGAAATTCCAAACAAGTCGTGTTGAAATGGAAACAGTTGCAGATATATTCGATGCTAATGGAGATGGATATATTGATTATCGTGAATGTTTAAATGCACTAAGAGCTAATTATACTAATTTAGATAGAACATCATCATCGAATACTAATGGTGGTAGTTCATTAAGCTTAAATCGTTTCGGTCCATCAGATGAAGAAACCATTAATGATGAATTAAAACGTCAAGTTGGATTGTGTACATGTCATAACACATATAAAATTAAGAAAATGGCAACAAATAAATATCGGTTC                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                            ]
[+] EMBL CD165742             [                                                                                                                                                                                                                                                                                               GAAGAAACCATTAATGATGAATTAAAACGTCAAGTTGGATTGTGTACATGTCATAACACATATAAAATTAAGAAAATGGCAACAAATAAATATCGGTTCGGTGACTCACAAAAATTATGTCTAGTTCGCATCCTTCGTAGTGCTGTAATGGCTCGTGTAGGTGGTGGCTGGATTACACTGGACGAATTTTTAGTGAAAAATGATCCATGTCGAGATGCCTGTGAACGCTTAACTAGTATAGCAGATTTAGCTAAAGCAGCCGGTGTTGGTCACAACTCATACTGGTCTCCTTCATCTGTTACTTTTCAACATTCATCTTCAACAGTAAAATCGAATCGAAATAATAGTGCTAATAATTATAAATATAATCATCCGGTGATTAGTTCAACAAGTAGTTGTAGTGAAAGTGGTCATAGTAGTAGTTGTCATGATAGTAAACAGATTACTGACTATTTTATATCGAATACAATGACTAAAAATCCTGTAGTTAAATCTTCTGAATCATCTTTATCCAGTTCATCACGTTTAAAAACTGTTCATAAACGTTCACGTTATGATACTCATAATTTATATCAATTAATGATGAATGGTCCTGGACAAGACCATGCATTTTATTTAGTTAT]




>consensus_1103#0
CAAATAAAGCACGTGTTATTGACTTATTTCATCGTAAAGATCGTGATCGAGATGGTCGAC
TTACAAGAGCTGAATTTATTGATGGTATTATAGAAATGAAATTCCAAACAAGTCGTGTTG
AAATGGAAACAGTTGCAGATATATTCGATGCTAATGGAGATGGATATATTGATTATCGTG
AATGTTTAAATGCACTAAGAGCTAATTATACTAATTTAGATAGAACATCATCATCGAATA
CTAATGGTGGTAGTTCATTAAGCTTAAATCGTTTCGGTCCATCAGATGAAGAAACCATTA
ATGATGAATTAAAACGTCAAGTTGGATTGTGTACATGTCATAACACATATAAAATTAAGA
AAATGGCAACAAATAAATATCGGTTCGGTGACTCACAAAAATTATGTCTAGTTCGCATCC
TTCGTAGTGCTGTAATGGCTCGTGTAGGTGGTGGCTGGATTACACTGGACGAATTTTTAG
TGAAAAATGATCCATGTCGAGATGCCTGTGAACGCTTAACTAGTATAGCAGATTTAGCTA
AAGCAGCCGGTGTTGGTCACAACTCATACTGGTCTCCTTCATCTGTTACTTTTCAACATT
CATCTTCAACAGTAAAATCGAATCGAAATAATAGTGCTAATAATTATAAATATAATCATC
CGGTGATTAGTTCAACAAGTAGTTGTAGTGAAAGTGGTCATAGTAGTAGTTGTCATGATA
GTAAACAGATTACTGACTATTTTATATCGAATACAATGACTAAAAATCCTGTAGTTAAAT
CTTCTGAATCATCTTTATCCAGTTCATCACGTTTAAAAACTGTTCATAAACGTTCACGTT
ATGATACTCATAATTTATATCAATTAATGATGAATGGTCCTGGACAAGACCATGCATTTT
ATTTAGTTAT

clustalw multiple alignements is not computed in this case