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consensusID : consensus_11068#0 NCBI blastX ! send the sequence to the NCBI site ! NCBI blastN ! send the sequence to the NCBI site ! Sequences nbr = 24 consensus length = 1392 fasta sequence
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consensus multiple alignement with clustalw CLUSTAL W (1.82) multiple sequence alignment
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************************************************************
consensus_11068#0 ATTTCGGAGCAAGACTTAGATGAACTTAATATAGAGATAATACGTAACACTTTGTACAGG 600
consensus_11068#1 ATTTCGGAGCAAGACTTAGATGAACTTAATATAGAGATAATACGTAACACTTTGTACAGG 175
************************************************************
consensus_11068#0 GCATATATTGAAGATTTTTATGCCTTCTGTAAATCACTGGGTGGAATCACCGCCGAGGTG 660
consensus_11068#1 GCATATATTGAAGATTTTTATGCCTTCTGTAAATCACTGGGTGGAATCACTGCCGAGGTG 235
************************************************** *********
consensus_11068#0 ATGTGTGAGTTGTTGGCTTTTGAAGCTGATAGGAGGGCGTTTATCATAACAATCAATTCA 720
consensus_11068#1 ATGTGTGAGTTGTTGGCTTTTGAAGCTGATAGGAGGGCGTTTATCATAACAATCAATTCA 295
************************************************************
consensus_11068#0 TTCGGGACAGAACTTTCGAACGAAGATCGGTCCAAACTTTATCCTCGCTGTGGAAAACTT 780
consensus_11068#1 TTCGGGACAGAACTTTCGAACGAAGATCGGTCCAAACTTTATCCTCGCTGTGGAAAACTT 355
************************************************************
consensus_11068#0 AACCCAGAGGGGCTTGTTCAACTTGCTAAGGCTAACGATTACGAACAAGTAAAATCCGTT 840
consensus_11068#1 AACCCAGAGGGGCTTGTTCAACTTGCTAAGGCTAACGATTACGAACAAGTAAAATCCGTT 415
************************************************************
consensus_11068#0 GCCAGGTACTATTCGAATTATTCCTCTTTGTTTGAAGAAACTGGTGAGGGCTTTGGGGAT 900
consensus_11068#1 GCCAGGTACTATTCGAATTATTCCTCTTTGTTTGAAGAAACTGGTGAGGGCTTTGGGGAT 475
************************************************************
consensus_11068#0 AAGACATTAGAAGATAAATTCTTTGAATATGAAGTTCAATTGAATGTAGACGCCTTCTTA 960
consensus_11068#1 AAGACATTAGAAGATAAATTCTTTGAATATGAAGTTCAATTGAATGTAGACGCCTTCTTA 535
************************************************************
consensus_11068#0 CAGCAGTTCCATTATGGTATATTCTACGCCCTTCTTAAATTAAAGGAACAAGAAATGAGA 1020
consensus_11068#1 CAGCAGTTCCATTATGGTATATTCTACGCCCTTCTTAAATTAAAGGAACAAGAAATGAGA 595
************************************************************
consensus_11068#0 AATATCGTTTGGATTGCGGAGTGCGTTTCCCAACGTCATCGTACCAAAATTGACTCTTAT 1080
consensus_11068#1 AATATCGTTTGGATTGCGGAGTGCGTTTCCCAACGTCATCGTACCAAAATTGACTCTTAT 655
************************************************************
consensus_11068#0 ATCAATATTTTATGACCTGAATATGA--CGTTTTGTTGAAAAATTATTCCACGCTTAAAA 1138
consensus_11068#1 ATCAATATTTTATGACCTGAATATNNGACGTTNTGTTGAANAATTATTCCACGCTTAAAA 715
************************ **** ******* *******************
consensus_11068#0 TGCGTTCTAAGCATAATGTTTTTGACTGTTATAGCTTACTTTGGATTTATTTATTTATTT 1198
consensus_11068#1 TGCNGTCTAAGCATAATGTTTTTGACTGTTATAGCTTACTTTGGATNTATTTATTTATTT 775
*** ***************************************** *************
consensus_11068#0 AAACTCGTGAAAAATTTATATAATTTATTTTTTCTGTATGATTAATTTCAAGTGATTATT 1258
consensus_11068#1 AA-CTCGTGAAAA--TTATATAATT--ATTTTTCTG-ATGAT-AATTTCA-GTGGATATT 827
** ********** ********** ******** ***** ******* *** ****
consensus_11068#0 AAAACGGTTTTAGTCGTCCGAATCACTAATATCAATTTTGAGATTTCCTTTCGTAAATAT 1318
consensus_11068#1 AAA-CGGTTT-AGTCGTCGATACTA----TATCAATTT-GAGATTC---TTCGAATATA- 876
*** ****** ******* * * ********* ****** **** * ***
consensus_11068#0 CATTTTAGATGCTTCCATTCTTTCTCCTAACACCTGATTTTTTGTTAATGTTGTGTTGGA 1378
consensus_11068#1 ---TTTAGA--GCTNCATTCTCTCT----ACACCGA---TTTTGGTAG-GNTG-GGTGGA 922
****** * ****** *** ***** ***** ** * ** * ****
consensus_11068#0 ATATCAATAAACTA 1392
consensus_11068#1 ATACAT-------- 928
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| Copyright Thu Nov 6 12:32:27 CET 2003 Hubert Wassner (hubert.wassner@noos.fr) | ||||