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consensusID : consensus_11193#0 NCBI blastX ! send the sequence to the NCBI site ! NCBI blastN ! send the sequence to the NCBI site ! Sequences nbr = 28 consensus length = 1029 fasta sequence
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*** *
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consensus_11193#1 TTTTAAGTAAAGTTCTGGAGCAACACGCATATACAAATT-CATATTTAGATCATTATGA- 122
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consensus_11193#0 CAGGAGACTTATTATCTTGTAACTTTTCAGACATTGGGTTCAGGGGTGCAGCACTGTTGG 240
consensus_11193#1 TAAGTGATAAATGGTTTTGCTGCTGCTCCACCAGCAATT----GTATTCATCATAGGTG- 177
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consensus_11193#0 CTTCAGGCTTCATAGCAGGGAACAAGATAACTTCCTTGATGTTATTTGTATTTGTCAGGA 300
consensus_11193#1 TTTCAACCTCCA------GAAATCCAAGATCATCTAAGAACCTACGGACGTAATTGATTA 231
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consensus_11193#0 ACATAGTTAATCTGTCAATACCGAGACCCCAACCTGCAGTTGGCGGAAGACCGTAACCTA 360
consensus_11193#1 TGCGAGCCCGTGTTATGAATCGTTGGCGTACATCCTCATTCATGAGGAGATCCAAA--TA 289
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consensus_11193#0 AAGCCGTGAGAAAC-TGCTCATCCGTCACCATGGCTTCAGCGT-CGCCTGCTGCTTTGTC 418
consensus_11193#1 ACGTTGACGGAAACGTGTTTCCTTGTCCTTAACGCCATAATGCATGTGCGGAAGTTGGTA 349
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consensus_11193#0 TTTAGCCTGTTCCAAGAATCGTTCACGTTGTACAACTGGATCATTTAGCTCTGTATATGC 478
consensus_11193#1 CAAACACGGAGATAGAAGT--TTGATTTCGTGAG---GAATGAT---GCTCAATTCACCA 401
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consensus_11193#0 ATTACACAGTTCTTTATGTAGCATAAACAATTCAAAGCGTTCCGTTAGACCTGGACGAGA 538
consensus_11193#1 AGTTTGGATTTGCCTGGGGAACCAGAACAACCAATGATATC-------ACCTAGATGGAT 454
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consensus_11193#0 TCTATGTTCTTTAGCCAAAGGACTCATTATACATGGACGACATGTAAGAAAAGTTGGGTT 598
consensus_11193#1 TATTTCATTTATA-TCATGGAACTCAGTTT-CA-----GATTTGTAGGAACGAATG---- 503
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consensus_11193#0 AACGCACAATGGTTCCAAGAATTCGCCAGCCAGCTTATCTAATAAT-CGGGCTGTAGTTT 657
consensus_11193#1 --TTTGCCATGACTT---GTAACCGACAGTCTTCAGATCGAATGTCATAGAATATTAATT 558
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consensus_11193#0 TTGGTTCTGGACAATCAATACCATGTTGAGCTGCAATTTTTAAAAAGAACTGACGAGTTT 717
consensus_11193#1 TTGATCCAG----CTGACCGCTTTGCATGAACACGACCTGCAATACTGACTGAGACATCA 614
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consensus_11193#0 CTTCTGTTTCAAATGTTT-CTGGAAGAGGTAGTTTAGTGTTTAGTTTAGCTGCTAAATCA 776
consensus_11193#1 -------TCCAAATGCTCGCCAGAGCTCAAAGATGAATATTTC------TTGATAAACTC 661
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consensus_11193#0 TCATAGAAATTGATACGTTTAAAAGGTGGAGTACAATCGACAATTATCTCGTCTGATTCT 836
consensus_11193#1 CGCTAGAGAAATAGTTGGATGAAATTTG---TGTGGATATGGGTTTTTCTGTGTGTTTTT 718
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consensus_11193#0 GCACCGTCCGGATGATATTTAATAATGTAGGAACCGAAAAGATGTTTTACTAAACCAGAA 896
consensus_11193#1 G-AGTTCCGAAATAGCATTT--TTCCGCATTTCATGGTAACTTGTGGCGTCAACC---AG 772
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consensus_11193#0 ATCAAATCTTCAGTAATAGTCATGAGATCTTCATAATCTGCATACGCCATGTAGAATTCA 956
consensus_11193#1 GTCC--TCTTTTGTTATATTATCTTTTTTGTGATGAATTTCATTC-CGTTGAGACATT-- 827
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consensus_11193#0 CATGAAGTAAACTCTGGATTATGAGTTAAGTCAATACCTTCGTTCCTGAACACACGGCCA 1016
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consensus_11193#0 AGTTCGTAGACAC 1029
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| Copyright Thu Nov 6 12:32:27 CET 2003 Hubert Wassner (hubert.wassner@noos.fr) | ||||