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Schistosoma mansoni
cluster # 112 cluster # 112       Sequences # 2       consensus # 1


see consensus multiple alignment with clustalw

Direct access to contigs :
consensus_112#0 length = 1046 sequences # 2  

consensusID : consensus_112#0
NCBI blastX ! send the sequence to the NCBI site !
NCBI blastN ! send the sequence to the NCBI site !
Sequences nbr = 2
consensus length = 1046
fasta sequence
                              [AGGTCAAAGCTTGGTAACTGCGTTCAAAATGGTTAGGATTGTGGTCAAGAAAGGTGACNCAGGCTTTTTTTATGATTGACCGCTCATCAAGCACTCCTATTGAAGAATTATTAAGCGAAATCTGTGAAATATACAATGGCATCCTTAAAATTCATCGGATATGTGGAGAAATGGAAGAGTTAGCAAAACATGGTGTTACTCTACCACCAAATATGCAAGGTCTTACGGACGAACAAATTTGTGACCTAAAACTTGAAGACGAGTGGGGAAAGAAGTGTATTCCTAGTGGTGGCTATGTTGAGTGCAAGGACGAAATAGGTAGGAGAAATGGTGTTGCACCGACCGAAAAAATGGTGGAAGTGCTAAAAAGAACAATGGATGAATCCAAGCAGTTGATTTCTCGAGATCTCGTTAAGAAAGATATCAGTATCGAGAAGAGTGTTATCCGAGAAGCTTTGATGATGCTTACTGGTGCAGTAACCATCGTTTATCCTATGGGTCTACCTCCATATGATCCTATTAAATTGGAGTTTGACAATGAAGAGGATTTAAGTGGAACGCATGCATCTCAAGAAGTAATCACAGCAGATAATGCTAGTTTATGGTTNTCANGAAAAGAAATGCATCGTGGAAAACTTCTCTCAGATTATATTGGACATAATGATAAAACTAAGATTATTGCTAAATTAACAAAACGTGGTACTGGTGCACCAGCACGTGAACCTATTATAAATGAAGAACAACAACGTGCTATGATGGCATATTATTATAAAAGACAAGAAGAATGGAAAAAACTTGAAGCTGATGATGATGATTGTTATTTAAATTCAGCTTGGGCTGAACCTAATCAATTAAAACGACAGTTTCATGGATTAACTAATATCAAATGGGGTCCAAAATGATGTTGTATAGAAAAAATGAAGAAAACATATAGGACATCAATATCTCTACCCATTGTTTTTATAGTTTTCCACTGAATAACCATTTTTTTTTAAATGTAAATAACTTCATTTATGGATTTATTTCCCACTTAAAAGTTCAGAATT]

[+] EMBL CD080337             [AGGTCAAAGCTTGGTAACTGCGTTCAAAATGGTTAGGATTGTGGTCAAGAAAGGTGACNCAGGCTTTTTTTATGATTGACCGCTCATCAAGCACTCCTATTGAAGAATTATTAAGCGAAATCTGTGAAATATACAATGGCATCCTTAAAATTCATCGGATATGTGGAGAAATGGAAGAGTTAGCAAAACATGGTGTTACTCTACCACCAAATATGCAAGGTCTTACGGACGAACAAATTTGTGACCTAAAACTTGAAGACGAGTGGGGAAAGAAGTGTATTCCTAGTGGTGGCTATGTTGAGTGCAAGGACGAAATAGGTAGGAGAAATGGTGTTGCACCGACCGAAAAAATGGTGGAAGTGCTAAAAAGAACAATGGATGAATCCAAGCAGTTGATTTCTCGAGATCTCGTTAAGAAAGATATCAGTATCGAGAAGAGTGTTATCCGAGAAGCTTTGATGATGCTTACTGGTGCAGTAACCATCGTTTATCCTATGGGTCTACCTCCATATGATCCTATTAAATTGGAGTTTGACAATGAAGAGGATTTAAGTGGAACGCATGCATCTCAAGAAGTAATCACAGCAGATAATGCTAGTTTATGGTTNTCANGAAAAGA                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                           ]
[-] EMBL CD074257             [                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                        GTTATCCGAGAAGCTTTGATGATGCTTACTGGTGCAGTAACCATCGTTTATCCTATGGGTCTACCTCCATATGATCCTATTAAATTGGAGTTTGACAATGAAGAGGATTTAAGTGGAACGCATGCATCTCAAGAAGTAATCACAGCAGATAATGCTAGTTTATGGTTTTCAGGAAAAGAAATGCATCGTGGAAAACTTCTCTCAGATTATATTGGACATAATGATAAAACTAAGATTATTGCTAAATTAACAAAACGTGGTACTGGTGCACCAGCACGTGAACCTATTATAAATGAAGAACAACAACGTGCTATGATGGCATATTATTATAAAAGACAAGAAGAATGGAAAAAACTTGAAGCTGATGATGATGATTGTTATTTAAATTCAGCTTGGGCTGAACCTAATCAATTAAAACGACAGTTTCATGGATTAACTAATATCAAATGGGGTCCAAAATGATGTTGTATAGAAAAAATGAAGAAAACATATAGGACATCAATATCTCTACCCATTGTTTTTATAGTTTTCCACTGAATAACCATTTTTTTTTAAATGTAAATAACTTCATTTATGGATTTATTTCCCACTTAAAAGTTCAGAATT]


>consensus_112#0 AGGTCAAAGCTTGGTAACTGCGTTCAAAATGGTTAGGATTGTGGTCAAGAAAGGTGACNC AGGCTTTTTTTATGATTGACCGCTCATCAAGCACTCCTATTGAAGAATTATTAAGCGAAA TCTGTGAAATATACAATGGCATCCTTAAAATTCATCGGATATGTGGAGAAATGGAAGAGT TAGCAAAACATGGTGTTACTCTACCACCAAATATGCAAGGTCTTACGGACGAACAAATTT GTGACCTAAAACTTGAAGACGAGTGGGGAAAGAAGTGTATTCCTAGTGGTGGCTATGTTG AGTGCAAGGACGAAATAGGTAGGAGAAATGGTGTTGCACCGACCGAAAAAATGGTGGAAG TGCTAAAAAGAACAATGGATGAATCCAAGCAGTTGATTTCTCGAGATCTCGTTAAGAAAG ATATCAGTATCGAGAAGAGTGTTATCCGAGAAGCTTTGATGATGCTTACTGGTGCAGTAA CCATCGTTTATCCTATGGGTCTACCTCCATATGATCCTATTAAATTGGAGTTTGACAATG AAGAGGATTTAAGTGGAACGCATGCATCTCAAGAAGTAATCACAGCAGATAATGCTAGTT TATGGTTNTCANGAAAAGAAATGCATCGTGGAAAACTTCTCTCAGATTATATTGGACATA ATGATAAAACTAAGATTATTGCTAAATTAACAAAACGTGGTACTGGTGCACCAGCACGTG AACCTATTATAAATGAAGAACAACAACGTGCTATGATGGCATATTATTATAAAAGACAAG AAGAATGGAAAAAACTTGAAGCTGATGATGATGATTGTTATTTAAATTCAGCTTGGGCTG AACCTAATCAATTAAAACGACAGTTTCATGGATTAACTAATATCAAATGGGGTCCAAAAT GATGTTGTATAGAAAAAATGAAGAAAACATATAGGACATCAATATCTCTACCCATTGTTT TTATAGTTTTCCACTGAATAACCATTTTTTTTTAAATGTAAATAACTTCATTTATGGATT TATTTCCCACTTAAAAGTTCAGAATT



clustalw multiple alignements is not computed in this case


Copyright Thu Nov 6 12:32:27 CET 2003 Hubert Wassner    (hubert.wassner@noos.fr)