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Schistosoma mansoni
cluster # 11280 cluster # 11280       Sequences # 46       consensus # 2


see consensus multiple alignment with clustalw

Direct access to contigs :
consensus_11280#0 length = 622 sequences # 7  
consensus_11280#1 length = 574 sequences # 39  

consensusID : consensus_11280#0
NCBI blastX ! send the sequence to the NCBI site !
NCBI blastN ! send the sequence to the NCBI site !
Sequences nbr = 7
consensus length = 622
fasta sequence
                              [CACCGGCATGTATTTTTTGTACAACTTATATAATACCGATTCTATTTGCAACATCTAAAGCGTCAAAATCA--GGAGGTAGCTTCACATATGC--TTTTTTAACATTGTTAGGGCAATTAAGCGTGTTGACTTT-CGCAACTTTGATATTAT-AAAG-TTCTTGGACAGCTGCCTTGATTGCTGGTTTGTTT-GCTCTTCGGTCAACAATGAA-CACTAATGTGTCGTTATCTTCAATTTTCTTCATTGCAGCTTCGGTGGTAACCGGATGTTGAATGATACGAAAGGCATCAAGTTTGTTCCTTTTGGGGATCAGGAATCTTCTGTCTTTTGGACAACGAGGAGGTTTGTACGTTTTAGGTCGCCTAAATCGCGTGGTATACATCACCCTCTTCTTGCCTTTTGTGTGAGCACCAAGTGTGACGGCCCGTTGTGCTTTCAATGCCTTCAGAGAAGCTGCAGACTTTTTGTTCCCTGCCTTCACTACTTTGCCACCTTTCACACCTTTCAGGGCTTTAAGTGACTTTGAAGGTTTTTGTGATTTTTTGGGTTCATTTTTGCTACTCTGAGTCTTCTTGACTTGATTCTCACTCTTCTACTGATTT-CC-CCCTTGNCCAGGGTGACCGAGGTC]

[+] EMBL CD131331             [CACCGGCATGTATTTTTTGTACAACTTATATAATACCGATTCTATTTGCAACATCTAAAGCGTCAAAATCA  GGAGGTAGCTTCACATATGC  TTTTTTAACATTGTTAGGGCAATTAAGCGTGTTGACTTT CGCAACTTTGATATTAT AAAG TTCTTGGACAGCTGCCTTGATTGCTGGTTTGTTT GCTCTTCGGTCAACAATGAA CACTAATGTGTCGTTATCTTCAATTTTCTTCATTGCAGCTTCGGTGGTAACCGGATGTTGAATGATACGAAAGGCATCAAGTTTGTTCCTTTTGGGGATCAGGAATCTTCTGTCTTTTGGACAACGAGGAGGTTTGTACGTTTTAGGTCGCCTAAATCGCGTGGTATACATCACCCTCTTCTTGCCTTTTGTGTGAGCACCAAGTGTGACGGCCCGTTGTGCTTTCAATGCCTTCA                                                                                                                                                                                       ]
[+] EMBL SMAA25723            [      CATGTATTTTTTGTACAACTTATATAATACCGATTCTATTTGCAACATCTAAAGCGTCAAAATCA  GGAGGTAGCTTCACATATGC  TTTTTTAACATTGTTAGGGCAATTAAGCGTGTTGACTTTCCGCAACTTTGATATTATAAAAGTTTCTTGGACAGCTGCCTTGATTGCTGGTTTGTTTGGCTCTTCGGTCAACAATGAACCACTtactg                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                          ]
[+] EMBL CD129387             [                                                   tgggcAAGGNGTGGAAATCANNGGAGGTAGCTTCACATATGCCTTTTTTTAACATTGTTAGGGCAATTAAGCGTGTTGACTTT CGCAACTTTGATATTAT AAAG TTCTTGGACAGCTGCCTTGATTGCTGGTTTGTTT GCTCTTCGGTCAACAATGAA CACTAATGTGTCGTTATCTCCAATTTTCTTCATTGCAGCTTCGGTGGTAACCGGATGTTGAATGATACGAGAGGCATCAAGTTTGTTCCTTTTGGGGATCAGGAATCTTCTGTCTTTTGGACAACGAGGAGGTTTGTACGTTTTAGGTCGCCTAAATCGCGTGGTATACATCACCCTCTTCTTGCCTTTTGTGTGAGCACCAAGTGTGACGGCCCGTTGTGCTTTCAATGCCTTCAGAGAAGCTGCAGACTTTTTGTTCCCTGCCTTCACTACTTTGCCACCTTTCACACCTTTCAGGGCTTTAAGTGACTTTGAAGGTTTTTGTGATTTTTTGGGTTCATTTTTGCTACTCTGAGTCTTCTTGACTTGATT                                               ]
[-] EMBL CD134937             [                                                                 AAATCA  GGAGGTAGCTTCACATATGC  TTTTTTAACATTGTTAGGGCAATTAAGCGTGTTGACTTT CGCAACTTTGATATTAT AAAG TTCTTGGACAGCTGCCTTGATTGCTGGTTTGTTT GCTCTTCGGTCAACAATGAA CACTAATGTGTCGTTATCTTCAATTTTCTTCATTGCAGCTTCGGTGGTAACCGGATGTTGAATGATACGAAAGGCATCAAGTTTGTTCCTTTTGGGGATCAGGAATCTTCTGTCTTTTGGACAACGAGGAGGTTTGTACGTTCTAGGTCGCCTAAATCGCGTGGTATACATCACCCTCTTCTTGCac                                                                                                                                                                                                                                        ]
[+] EMBL CD067325             [                                                               tgAAATCA  CGAGGTAGCTTCACATATGC  TTTTTTAACATTGTTAGGGCAATTAAGCGTGTTGACTTT CGCAACTTTGATATTAT AAAG TTCTTGGACAGCTGCCTTGATTGCTGGTTTGTTT GCTCTTCGGTCAACAATGAA CACTAATGTGTCGTTATCTTCAATTTTCTTCATTGCAGCTTCGGTGGTAACCGGATGTTGAATGATACGAAAGGCATCAAGTTTGTTCCTTTTGGGGATCAGGAATCTTCTGTCTTTTGGACAACGAGGAGGTTTGTACGTTTTAGGTCGCCTAAATCGCGTGGTATACATCACCCTCTTCTTGCCTTTTGTGTGAGCACCAAATGTGACGGCCCGTTGTGC                                                                                                                                                                                                     ]
[-] EMBL CD066284             [                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                        TTTTGGACAACGAGGAGGTTTGTACGTTTTAGGTTGCCTAAATCGCGTGGTATACATCAGCCTCTTCTTGCCTTTTGTGTGAGCACCAAGTGTGACGGCCCGTTGTGCTTTCAATGCCTTCAGAGAAGCTGCAGACTTTTTGTTCCCTGCCTTCATTACTTTGCCACCTTTCACACCTTTCAGGGCTTTAAGTGACTTTGAAGGTTTTTGTGATTTTTTGGGTTCATTTTTGCTACTCTGAGTCTTCTTGACTTGATCCTCACTCTTCTACTGATTT CC CCCTTG                  ]
[-] EMBL CD168195             [                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                             ACATCACCCTCTTCTTGCCTTTTGTGTGAGCACCAAGTGTGACGGCCCGTTGTGCTTTCAATGCCTTCAGAGAAGCTGCAGACTTTTTGTTCCCTGCCTTCACTACTTTGCCACCTTTCACACCTTTCAGGGCTTTAAGTGACTTTGAAGGTTTTTGTGATTTTTTGGGTTCATTTTTGCTACTCTGAGTCTTCTTGACTTGATTATCACTCTTCTCCTGATTTNCCACCCTTGNCCAGGGTGACCGAGGTC]


>consensus_11280#0 CACCGGCATGTATTTTTTGTACAACTTATATAATACCGATTCTATTTGCAACATCTAAAG CGTCAAAATCAGGAGGTAGCTTCACATATGCTTTTTTAACATTGTTAGGGCAATTAAGCG TGTTGACTTTCGCAACTTTGATATTATAAAGTTCTTGGACAGCTGCCTTGATTGCTGGTT TGTTTGCTCTTCGGTCAACAATGAACACTAATGTGTCGTTATCTTCAATTTTCTTCATTG CAGCTTCGGTGGTAACCGGATGTTGAATGATACGAAAGGCATCAAGTTTGTTCCTTTTGG GGATCAGGAATCTTCTGTCTTTTGGACAACGAGGAGGTTTGTACGTTTTAGGTCGCCTAA ATCGCGTGGTATACATCACCCTCTTCTTGCCTTTTGTGTGAGCACCAAGTGTGACGGCCC GTTGTGCTTTCAATGCCTTCAGAGAAGCTGCAGACTTTTTGTTCCCTGCCTTCACTACTT TGCCACCTTTCACACCTTTCAGGGCTTTAAGTGACTTTGAAGGTTTTTGTGATTTTTTGG GTTCATTTTTGCTACTCTGAGTCTTCTTGACTTGATTCTCACTCTTCTACTGATTTCCCC CTTGNCCAGGGTGACCGAGGTC



consensusID : consensus_11280#1
NCBI blastX ! send the sequence to the NCBI site !
NCBI blastN ! send the sequence to the NCBI site !
Sequences nbr = 39
consensus length = 574
fasta sequence
                              [AGNAGGTAGCTTCACATATGCTTTTTTAACATTGTTAGGGCAATTAAGCGTGTTGACTTTCGCAACTTTGATATTATAAAGTTCTTGGACAGCTGCCTTGATTGCTGGTTTGTTTGCTCTTCGGTCAACAATGAACACTAATGTGTCGTTATCTTCAATTTTCTTCATTGCAGCTTCGGTGGTAACCGGATGTTGAATGATACGAAAGGCATCAAGTTTGTTCCTTTTGGGGATCAGGAATCTTCTGTCTTTTGGACAACGAGGAGGTTTGTACGTTTTAGGTCGCCTAAA-TCGCGTGGTATACATCACCCTCTTCTTGCCTTTTGTGTGAGCACCA-AGTGTGACGGCCC-GTTGTGCTTTCAATGCCTTCAGAGAAGCTGCAGACTTTTTGTTCCCTGCCTTCACTACTTTGCCACCTTTCACACCTTTCAGGGCTTTAAGTGACTTTGAAGGTTTTTGTGA-TTTTTTGGGTTCATTTTTGCTACTCTGAGTCTTCTTGACTTGATTATCACTCTTCTCCTGTTTTTTCGCTGGAGCCTTGGGAGCCATGCCTCAATCGTTCGTACCGCCAAAC]

[-] EMBL AI976343             [AGNAGGTAGCTTCACATATGCTTTTTTAACATTGTTAGGGCAATTAAGCGTGTTGACTTTCGCAACTTTGATATTATAAAGTTCTTGGACAGCTGCCTTGATTGCTGGTTTGTTTGCTCTTCGGTCAACAATGAACACTAATGTGTCGTTATCTTCAATTTTCTTCATTGCAGCTTCGGTGGTAACCGGATGTTGAATGATACGAAAGGCATCAAGTTTGTTCCTTTTGGGGATCAGGAATCTTCTGTCTTTTGGACAACGAGGAGGTTTGTACGTTTTAGGTCGCCTAAA TCGCGTGGTATACATCACCCTCTTCTTGCCTTTTGTGTGAGCACCA AGTGTGACGGCCC GTTGTGCTTTCAATGCCTTCAGAGAAGCTGCAGACTTTTTGTTCCCTGCCTTCACTACTTTGCCACCTTTCACACCTTTCAGGGCTTTAAGTGACTTTGAAGGTTTTTGTGA TTTTTTGGGTTCATTTTTGCTACTCTGAGTCTTCTTGACTTGATTATCACTCTTCTCCTGTTTTTTCGCTGGAGCCTTGGGAGCCATGCCTCAATC                ]
[+] EMBL CD067324             [             ACATATGCTTTTTTAACATTGTTAGGGCAATTAAGCGTGTTGACTTTCGCAACTTTGATATTATAAAGTTCTTGGACAGCTGCCTTGATTGCTGGTTTGTTTGCTCTTCGGTCAACAATGAACACTAATGTGTCGTTATCTTCAATTTTCTTCATTGCAGCTTCGGTGGTAACCGGATGTTGAATGATACGAAAGGCATCAAGTTTGTTCCTTTTGGGGATCAGGAATCTTCTGTCTTTTGGACAACGAGGAGGTTTGTACGTTTTAGGTCGCCTAAA TCGCGTGGTATACATCACCCTCTTCTTGCCTTTTGTGTGAGCACCA AGTGTGACGGCCC GTTGTGCTTTCA                                                                                                                                                                                                                     ]
[-] EMBL CD129539             [              CATATGCTTTTTTAACATTGTTAGGGCAATTAAGCGTGTTGACTTTCGCAACTTTGATATTATAAAGTTCTTGGACAGCTGCCTTGATTGCTGGTTTGTTTGCTCTTCGGTCAACAATGAACACTAATGTGTCGTTAACTTCAATTTTCTTCATTGCAGCTTCGGTGGTAACCGGATGTTGAATGATACGAAAGGCATCAAGTTTGTTCCTTTTGGGGATCAGGAATCTTCTGTCTTTTGGACAACGAGGAGGTTTGTACGTTTTAGGTCGCCTAAA TCGCGTGGTATACATCACCCTCTTCTTGCCTTTTGTGTGAGCACCA AGTGTGACGGCCC GTTGTGCTTTCAATGCCTTCAGAGAAGCTGCAGACTTTTTGTTCCCTGCCTTCACTACTTTGCCACCTTTCACACCTTTCAGGGCTTTAAGTGACTTTGAAGGTTTTTGTGA TTTTTTGGGTTCATTTTTGCTACCCTGAGTCTTCTTGACTTGATTA                                                                  ]
[+] EMBL CD137202             [                         TTAACATTGTTAGGGCAATTAAGCGTGTTGACTTTCGCAACTTTGATATTATAAAGTTCTTGGACAGCTGCCTTGATTGCTGGTTTGTTTGCTCTTCGGTCAACAATGAACACTAATGTGTCGGTATCTTCAATTTTCTTCATTGCAGCTTCGGTGG                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                            ]
[+] EMBL CD136679             [                         TTAACATTGTTAGGGCAATTAAGCGTGTTGACTTTCGCAACTTTGATATTATAAAGTTCTTGGACAGCCGCCTTGATTGCTGGTTTGTTTGCTCTT GGTCAACAATGAACACTAATGTGTCGTTATCTTCAATTTTCTTCATTGCAGCTTCGGTGGTAACCGGATGTTGAATGATACGAAAGGCATCAAGTTTGTTCCTTTTGGGGATCAGGAATCTTCTGTCTTTTGGACAACGAGGAGGTTTGTACGTTTTAGGTCGCCTAAA TCGCGTGGTATACATCACCCTCTTCTTGCCTTTTGTGTGAGCACCA AGTGTGACGGCCC GTTGTGCTTTCAATGCCTTCAGAGAAGCTGCAGACTTTTTGTTCCCTGCCTTCACTACTTTGCCACCTTTCACACCTTTCAGGGCTTTAAGTGACTTTGAAGGTTTTTGTGA TTTTTTGGGT                                                                                                      ]
[+] EMBL CD136972             [                         TTAACATTGTTAGGGCAATTAAGCGTGTTGACTTTCGCAACTTTGATATTATAAAGTTCTTGGACAGCTGCCTTGATTGCTGGTTTGTTTGCTCTTCGGTCAACAATGAACACTAATGTGTCGTTATCTTCAATTTTCTTCATTGCAGCTTCGGTGGTAACCGGATGTTGAATGATACGAAAGGCATCAAGTTTGTTCCTTTTGGGGATCAGGAATCTTCTGTCTTTTGGACAACGAGGAGGTTTGTACGTTTTAGGTCGCCTAAA TCGCGTGGTATACATCACCCTCTTCTTGCCTTTTGTGTGAGCACCA AGTGTGACGGCCC GTTGTGCTTTCAATGCCTTCAGAGAAGCTGCAGACTTTTTGTTCC                                                                                                                                                                                    ]
[+] EMBL CD136975             [                         TTAACATTGTTAGGGCAATTAAGCGTGTTGACTTTCGCAACTTTGATATTATAAAGTTCTTGGACAGCTGCCTTGATTGCTGGTTTGTTTGCTCTTCGGTCAACAATGAACACTAATGTGTCGTTATCTTCAATTTTCTTCATTGCAGCTTCGGTGGTAACCGGATGTTGAATGATACGAAAGGCATCAAGTTTGTTCCTTTTGGGGATCAGGAATCTTCTGTCTTTTGGACAACGAGGAGGTTTGTACGTTTTAGGTCGCCTAAA TCGCGTGGTATACATCACCCTCTTCTTGCCTTTTGTGTGAGCACCA AGTGTGACGGCCC GTTGTGCTTTCAATGCCTTCAGAGAAGCTGCAGACTTTTT                                                                                                                                                                                         ]
[-] EMBL AI976382             [                                     GGGCAATTAAGCGTGTTGACTTTCGCAACTTTGATATTATATAGTTCTTGGACAGCTGCCTTGATTGCTGGTTTGTTTGCTCTTCGGTCAACAATGAACACTAATGTGTCGTTATCTTCAATTTTCTTCATTGCAGCTTCGGTGGTAACCGGATGTTGAATGATACGAAAGGCATCAAGTTTGTTCCTTTTGGGGATCAGGAATCTTCTGTCTTTTGGACAACGAGGAGGTTTGTACGTTTTAGGTCGCCTAAA TCGCGTGGTATACATCACCCTCTTCTTGCCTTTTGTGTGAGCACCA AGTGTGACGGCCC GTTGTGCTTTCAATGCCTTCAGAGAAGCTGCAGACTTTTTGTTCCCTGCCTTCACTACTTTGCCACCTTTCACACCTTTCAGGGCTTTAAGTGACTTTGAAGGTTTTTGTGA TTTTTTGGGTTCATTTTTGCTACTCTGAGTCTTCTTGACTTGATTATCACTCTTCTCCTGTTTTTTCGCTGGAGCCTTGGGAGCCATGCCTCAATC                ]
[+] EMBL CD125708             [                                                                                                                                    GAACACTAATGTGTCGTTATCTTCAATTTTCTTCATTGCAGCTTCGGTGGTAACCGGATGTTGAATGATACGAAAGGCATCAAGTTTGTTCCTTTTGGGGATCAGGAATCTTCTGTCTTTTGGACAACGAGGAGGTTTGTACGTTTTAGGTCGCCTAAA TCGCGTGGTATACATCACCCTCTTCTTGCCTTT                                                                                                                                                                                                                                                             ]
[-] EMBL CD067427             [                                                                                                                                                                                          CGGATGTTGAATGATACGAAAGGCATCAAGTTTGTTCCTTTTGGGGATCAGGAATCTTCTGTCTTTTGGACAACGAGGAGGTTTGTACGTTTTAGGTCGCCTAAA TCGCGTGGTATACATCA CCTCTTCTTGCCTTTTGTGTGAGCACCA AGTGTGACGGCCC GTTGTGCTTTCAATGCCTTCAGAGAAGCTGCAGACTTTTTGTTCCCTGCCTTCACTACTTTGCCACCTTTCACACCTTTCAGGGCTTTAAGTGACTTTGAAGGTTTTTGTGA TTTTTTGGGTTCATTTTTGCTA TNTGAGT TTCTTGACcgc                                                                      ]
[+] EMBL CD114616             [                                                                                                                                                                                                 TGAATGATACGAAAGGCATCAAGTTTGTTCCTTTTGGGGATCAGGAATCTTCTGTCTTTTGGACAACGAGGAGGTTTGTACGTTTTAGGTCGCCTAAA TCGCGTGGTATACATCACCCTCTTCTTGCCTTTTGTGTGAGCACCA AGTGTGACGGCCC GTTGTGCTTTCAATGCCTTCAGAGAAGCTGCAGACTTTTTGTTCCCTGCCTTCACTACTTTGCCACCTTTCACACCTTTCAGGGCTTTAAGTGACTTTGAAGGTTTTTGTGA TTTTTTGGGTTCATTTTTGCTACTCTGAGTCTTC                                                                              ]
[+] EMBL CD114392             [                                                                                                                                                                                                 TGAATGATACGAAAGGCATCAAGTTTGTTCCTTTTGGGGATCAGGAATCTTCTGTCTTTTGGACAACGAGGAGGTTTGTACGTTTTAGGTCGCCTAAA TCGCGTGGTATACATCACCCTCTTCTTGCCTTGTGTGTGAGCACCA AGNGAGACGGCCC GNCGNGCTTNCAATGCCTCCAGAGAAGCTGCAGACTCTTTGTTCCCTGCCTTCACTACTTTGCCACCTTTCACACCTTTCAGGGC                                                                                                                                            ]
[+] EMBL CD114430             [                                                                                                                                                                                                 TGAATGATACGAAAGGCATCAAGTTTGTTCCTTTTGGGGATCAGGAATCTTCTGTCTTTTGGACAACGAGGAGGTTTGTACGTTTTAAGTCGCCTAAA TCGCGTGGTATACATCACCCTCTTCTTGCCTTTTGTGTGAGCACCA AGTGCGACGGCCC GNTGTGCTTTCAATGCCTTCAGAGAAGCTGCAGACTTTTTGTTCCCTGCCTTCACTACTTTGCCACCTTTCACACCCTTCAGGGCTTTAAGTGAATTTGAAGGTTTTTGTGA TTTTTTGGGTTCATTTTTGCTACTCTGAGTCTTC                                                                              ]
[-] EMBL CD152057             [                                                                                                                                                                                                  GAATGATGCGAAAGGCATCAAGTTTGTTCCTTTTGCCGATCAGGAGTCTTCAGTCTTTTGGACACCGAGGAGGTTTGTACGTATTAGGTCGCATAAT TCTCGTGGTATACATCACCCTCTTCTTGCCTTTTGTGTGAGCACCA AGTGTGACGGCCC GTTGTGCTTTCAATGCCTTCAGAGAAGCTGCAGACTTTTTGTTCCCTGCCTTCACTACTTTGCCACCTTTCACACCTTTCAGGGCTTTAAGTGACTTTGAAGGTTTT                                                                                                                      ]
[-] EMBL CD114612             [                                                                                                                                                                                                  GAATGATACGAAAGGCATCAAGTTTGTTCCTTTTGGGGATCAGGAATCTTCTGTCTTTTGGACAACGAGGAGGTTTGTACGTTTTAGGTCGCCTAAA TCGCGTGGTATACATCACCCTCTTCTTGCCTTTTGTGTGAGCACCA AGTGTGACGGCCC GTTGTGCTTTCAATGCCTTCAGAGAAGCTGCAGACTTTTTGTTCCCTGCCTTCACTACTTTGCCACCTTTCACACCTTTCAGGGCTTTAAGTGACTTTGAAGGTTTTTGTGA TTTTTTGGGTTCATTTTTGCTACTCTGAGTCTTCT                                                                             ]
[-] EMBL CD114606             [                                                                                                                                                                                                  GAATGATACGAAAGGCATCAAGTTTGTTCCTTTTGGGGATCAGGAATCTTCTGTCTTTTGGACAACGAGGAGGTTTGTACGTTTTAGGTCGCCTAAA TCGCGTGGTATACATCACCCTCTTCTTGCCTTTTGTGTGAGCACCA AGTGTGACGGCCC GTTGTGCTTTCAATGCCTTCAGAGAAGCTGCAGACTTTTTGTTCCCTGCCTTCACTACTTTGCCACCTTTCACACCTTTCAGGGCTTTAAGTGACTTTGAAGGTTTTTGTGA TTTTTTGGGTTCATTTCTGCTACTCTGAGTCTTCT                                                                             ]
[-] EMBL CD114597             [                                                                                                                                                                                                  GAATGATACGAAAGGCATCAAGTTTGTTCCTTTTGGGGATCAGGAATCTTCTGTCTTTTGGACAACGAGGAGGTTTGTACGTTTTAGGTCGCCTAAA TCGCGTGGTATACATCACCCTCTTCTTGCCTTTTGTGTGAGCACCA AGTGTGACGGCCC GTTGTGCTTTCAATGCCTTCAGAGAAGCTGCAGACTTTTTGTTCCCTGCCTTCACTACTTTGCCACCTTTCACACCTTTCAGGGCTTTAAGTGACTTTGAAGGTTTTTGTGA TTTTTTGGGTTCATTTCTGCTACTCTGAGTCTTCT                                                                             ]
[-] EMBL CD114567             [                                                                                                                                                                                                  GAATGATACGAAAGGCATCAAGTTTGTTCCTTTTGGGGATCAGGAATCTTCTGTCTTTTGGACAACGAGGAGGTTTGTACGTTTTAGGTCGCCTAAA TCGCGTGGTATACATCACCCTCTTCTTGCCTTTTGTGTGAGCACCA AGTGTGACGGCCC GTTGTGCTTTCAATGCCTTCAGAGAAGCTGCAGACTTTTTGTTCCCTGCCTTCACTACTTTGCCACCTTTCACACCTTTCAGGGCTTTAAGTGACTTTGAAGGTTTTTGTGA TTTTTTGGGTTCATTTTTGCTACTCTGAGTCTTCT                                                                             ]
[-] EMBL CD114496             [                                                                                                                                                                                                  GAATGATACGAAAGGCATCAAGTTTGTTCCTTTTGGGGATCAGGAATCTTCTGTCTTTTGGACAACGAGGAGGTTTGTACGTTTTAGGTCGCCTAAA TCGCGTGGTATACATCACCCTCTTCTTGCCTTTTGTGTGAGCACCA AGTGTGACGGCCC GTTGTGCTTTCAATGCCTTCAGAGAAGCTGCAGACTTTTTGTTCCCTGCCTTCACTACTTTGCCACCTTTCACACCTTTCAGGGCTTTAAGTGACTTTGAAGGTTTTTGTGA TTTTTTGGGTTCATTTTTGCTACTCTGAGTCTTCT                                                                             ]
[-] EMBL CD114463             [                                                                                                                                                                                                  GAATGATACGAAAGGCATCAAGTTTGTTCCTTTTGGGGATCAGGAATCTTCTGTCTTTTGGACAACGAGGAGGTTTGTACGTTTTAGGTCGCCTAAA TCGCGTGGTATACATCACCCTCTTCTTGCCTTTTGTGTGAGCACCA AGTGTGACGGCCC GTTGTGCTTTCAATGCCTTCAGAGAAGCTGCAGACTTTTTGTTCCCTGCCTTCACTACTTTGCCACCTTTCACACCTTTCAGGGCTTTAAGTGACTTTGAAGGTTTTTGTGA TTTTTTGGGTTCATTTTTGCTACTCTGAGTCTTCT                                                                             ]
[+] EMBL CD168272             [                                                                                                                                                                                                       ATACGAAAGGCATCAAGTTTGTTCCTTTTGGGGATCAGGAATCTTCTGTCTTTTGGACAACGAGGAGGTTTGTACGTTTTAGGTCGCCTAAA TCGCGTGGTATACATCACCCTCTTCTTGCCTTTTGTGTGAGCACCA AGTGTGACGGCCC GTTGTGCTTTCAATGCCTTCAGAGAAGCTGCAGACTTTTTGTTCCCTGCCTTCACTACTTTGCCACCTTTCACACCTTTCAGGGCTTTAAGTGACTTTGAAGGTTTTTGTGA TTTTTTGGGTTCATTTTTGCTACTCTGAGTCTTCTTGACTTGATT                                                                   ]
[+] EMBL CD066349             [                                                                                                                                                                                                                                                     TGTCTTTTGGACAACGAGGAGGTTTGTACGTTGTAGGTCGCCTAAA TCGCGTGGTATACATCACCCTCTTCTTGCCTTTTGTGTGAGCACCA AGTGTGACTGCCC GTTGTGCTTTCA                                                                                                                                                                                                                     ]
[+] EMBL CD066420             [                                                                                                                                                                                                                                                        CTTTTGGACAACGACGAGGTTTGTACGCTTTACGTCGCCTAAA TCGCGTGGTATACATCACCCTCTTCTTGCCTTTTGTGCCAGCACCA AGTGTGACCGCC                                                                                                                                                                                                                                   ]
[+] EMBL CD168055             [                                                                                                                                                                                                                                                        CTTTTGGACATCGAGGAGGTTTGTACGTTTTAGGTCGCCTAAA TCGCGTGGTATACATCACCCTCTTCTTGCCTTTTGTGTGAGCACCA AGTGTGACGGCCC GTTGTGCTTTCAATGCCTTCAGAGAAGCTGCAGACTTTTTGTTCCCTGCCTTCACTACTTTGCCACCTTTCACACCTTTCAGGGCTTTAAGTGACTTTGAAGGTTTTTGTGATTTTTTTGGGTTCATTTTTGCTACTCTGAGTCTTCTTGACTTGATT                                                                   ]
[+] EMBL CD066538             [                                                                                                                                                                                                                                                        CTTTTGGACAACGAGGAGGTTTGTACGTTTTAGGTCGCCTAAA TCGCGTGGTATACATCACCCTCTTCTTGCCTTTTGTGTGAGCACCA AGTGTGACGGCCC GTTGTGCTTTCAATGCCTTCAGAGAAGCTGCAGACTTTTTGTTCCCTGCCTTCACTACTTTGCCACCTTTCACACCTTTCAGGGCTT                                                                                                                                          ]
[+] EMBL CD067121             [                                                                                                                                                                                                                                                        CTTTTGGACAACGAGGAGGTTTGTACGTTTTAAGTCGCCTAAA TCGCGTGGTATACATCACCCTCTTCTTGCCTTTTGTGTGAGCACCA AGTGTGACGGCCC GTTGTGCTTTCAATGCCTTCAGAGAAGCTGCAGACTTTTTGTTCCCTGCCTTCACTACTTTGCCACCTTTCACACCTTTCAGGGCTTTAAGTGACTTTGAAGGTTTTTGTGA TTTTTTGGGTTCATTTTTGCTACTCTGAGTCTTCTTGACTTGATTATCACTCTTCTCCTGTTTTTTCGCTGGAGCCTTGGGAGCCATGCCTCAATCGct             ]
[+] EMBL CD066587             [                                                                                                                                                                                                                                                        CTTTTGGACAACGAGGAGGTTTGTACGTTTTAGGTCGCCTAAA TCGCGTGGTATACATCACCCTCTTCTTGCCTTTTGTGTGAGCACCA AGTGTGACTGCCC GCTGTGCTTTCAATGCCTTCAGAGAAGCTGCATACTTTTTGTTCCCTGCCTTCACTACTTTGCCACCTTTCACACCTTTCAAGGCTTTAAGTGACTTTGAAGGTTTTTGCGA TTTTTTGGGTTCATTTTTGCTACTCTGAGTCTTCTTGACTTGATTATCACTCTTCTCCTG ATTTTCGCTGGAGCCTTGGGAGCCATGCCTCAATCGTTCGTACCGCCAA  ]
[-] EMBL CD067250             [                                                                                                                                                                                                                                                         TTTTGGACAACGAGGAGGTTTGTACGTTTTAGGTCGCCTAAA TCGCGTGGTATACATCACCCTCTTCTTGCCTTTTGTGTGAGCACCA AGTGTGACGGCCC GTTGTGCTTTCAATGCCTTCAGAGAAGCTGCAGACTTTTTGTTCCCTGCCTTCACTACTTTGCCACCTTTCACACCTTTCAGGGCTTTAAGTGACTTTGAAGGTTTTTGTGA TTTTTTGGGTTCATTTTTGCTACTCTGAGTCTTCTTGACTTCATTA                                                                  ]
[-] EMBL CD067011             [                                                                                                                                                                                                                                                         TTTTGGACAACGAGGAGGTTTGTACGTTTTAGGTCGCCTAAA TCGCGTGGTATACATCACCCTCTTCTTGCCTTTTGTGTGAGCACCA AGTGTGACGGCCC GTTGTGCTTTCAATGCCTTCAGAGAAGCTGCAGACTTTCTGTTCCCTGCCTTCACTACTTTGCCACCTTTCACACCTTTCAGGGCTTTAAGTGACTTTGAAGGTTTTTGTGA TTTTTTGGGTTCATTTTTGCTACTCTGAGTCTTCTTGACTTGATTA                                                                  ]
[-] EMBL CD067225             [                                                                                                                                                                                                                                                         TTTTGGACAACGAGGAGGTTTGTACGTTTTAGGTCGCCTAAA TCGCGTGGTATACATCACCCTCTTCTTGCCTTCTGTGTGAGCACCA AGTGTGACGGCCC GTTGTGCTTTCAATGCCTTCAGAGAAGCTGCAGACTTTTTGTTCCCTGCCTTCACTACTTTGCCACCTTTCACACCTTTCAGGGCTTTAAGTGACTTTGAAGGTTTTTGTGA TTTTTTGGGTTCATTTTTGCTACTCTGAGTCTTCTTGACTTGATTA                                                                  ]
[-] EMBL CD067012             [                                                                                                                                                                                                                                                          TTTGGACACCAAGGAGGTTTGTACGTTNTAGGTCGCCTAAA TCGCGTGGTATACATCACCCTCTTCTTGCCTTNTGTGTGAGCACCA AGTGTGACGGCCC GTTGTGCTTTCAATGCCTTCAGAGAAGCTGCAGACTTTCTGTTCCCTGCCTTCACTACTTTGCCACCTTTCACACCTTTCAGGGCTTTAAGTGACTTTGAAGGTTTTTGTGA TTTTTTGGGTTCATTTTTGCTACTCTGAGTCTTCTTGACTTGATTATCACTCTTCTCCTGTTTTTTCGCTGGAGCCTTGGGAGCCATGCCTCAATCGTTCGTACCGCCAAAC]
[-] EMBL CD185069             [                                                                                                                                                                                                                                                           tgGGACAACGAGGAGGTTTGTACGTTTTAGGTCGCCTAAA TCGCGTGGTATACATCACCCTCTTCTTGCCTTTTGTGTGAGCACCA AGTGTGACGGCCC GTTGTGCTTTCAATGCCTTCAGAGAAGCTGCAGACTTTTTGTTCCCTGCCTTCACTACTTTGCCACCTTTCACACCTTTCAGGGCTTTAAGTGACTTTGAAGGTTTTTGTGA TTTTTTGGGTTCATTTTTGCT                                                                                           ]
[-] EMBL CD067428             [                                                                                                                                                                                                                                                                    GAGGAGGTTTGTACGTTTTAGGTCG CTAAATTCGCGTGGTATACATCACCCTCTTCTTGCCTTTTGTGTGAGCACCA AGTGTGACGGCCC GTTGTGCTTTCAATGCCTTCAGAGAAGCTGCAGACTTTTTGTTCCCTGCCTTCACTACTTTGCCACCTTTCACACCTTTCAGGGCTTTAAGTGACTTTGAAGGTTTTTGTGA TTTTTTGGGTTAATTTTTGCTACTTTGAGTCTTTTTGACTTGATTATCA                                                               ]
[-] EMBL CD170664             [                                                                                                                                                                                                                                                                        AGGTTTGTACGTTTTAGGTCGCCTAAG TCGCGTGGTATACATCACCCTCTTCTTGCCTTTTGTGTGAGCACCA AGTGTGACGGCCC GTTGTGCTTTCAATGCCTTCAGAGAAGCTGCAGACTTATTGTTCCCTGCCTTCACTACTTTGC                                                                                                                                                                  ]
[-] EMBL CD114575             [                                                                                                                                                                                                                                                                                                                        TCTTCTTGCCTTTTGTGTGAGCACCA AGTGTGACGGCCC GTTGTGCTTTCAATGCCTTCAGAGAAGCTGCAGACTTTTTGTTCCCTGCCTTCACTACTTTGCCACCTTTCACACCTTTCAGGGCTTTAAGTGACTTTGAAGGTTTTTGTGA TTTTTTGGGTTCATTTTTGCTACTCTGAGTCTTCT                                                                             ]
[+] EMBL CD065476             [                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                        GTGAGCACCACAGTGTGACGGCCCTGTTGCGCTTTCAATGCCTTCAGAGAAGCTGCAGACTTTTTGTTCCCTGCCTTCACTACTTTGCCACCTTTCACACCTTTCAGGGCTTTAAGTGACTT                                                                                                                                ]
[-] EMBL CD182322             [                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                           GGCCC GTTGTGCTTTCAATGCCTTCAGAGAAGCTGCAGACTTTTTGTTCCCTGCCTTCACTACTTTGCCACCTTTCACACCTTTCAGGGCTTTAAGTGACTTTGAAGGTTTTTGTGA TTTTTTGGGTTCGTTTTTGCTACTCTGAGTCTTCTTGACTTGATTATCACTCTTCTCCTGTTTTTTCGCTGGAGCCTTGGGAGCCATGCCTC                    ]
[-] EMBL CD067226             [                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                        TGTTCCCTGCCTTCACTACTTTGCCACCTTTCACACCTTTCAGGGCTTTAAGTGACTTTGAAGGTTTTTGTGA TTTTTTGGGTTCATTTTTGCTACTCTGAGTCTTCTTGACTTGATTATCACTCTTCTCCTGTTTTTTCGCTGGAGCCTTGGGAGCCATGCCTCAATCGTTCGTACCGCCAAAC]
[-] EMBL CD067251             [                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                          ACCTTTCAGGGCTTTAAGTGACTCTGAAGGTTTTTGTGA TTCTTTGGGTTCATTTTTGCTACTCTGAGTCTTCTTGACTTGATTATCACTCTTCTCCTGTTTGTTCGCTGGAGCCTTGGGAGCCATGCCTCAATCGTTCGTACCGCCAAAC]


>consensus_11280#1 AGNAGGTAGCTTCACATATGCTTTTTTAACATTGTTAGGGCAATTAAGCGTGTTGACTTT CGCAACTTTGATATTATAAAGTTCTTGGACAGCTGCCTTGATTGCTGGTTTGTTTGCTCT TCGGTCAACAATGAACACTAATGTGTCGTTATCTTCAATTTTCTTCATTGCAGCTTCGGT GGTAACCGGATGTTGAATGATACGAAAGGCATCAAGTTTGTTCCTTTTGGGGATCAGGAA TCTTCTGTCTTTTGGACAACGAGGAGGTTTGTACGTTTTAGGTCGCCTAAATCGCGTGGT ATACATCACCCTCTTCTTGCCTTTTGTGTGAGCACCAAGTGTGACGGCCCGTTGTGCTTT CAATGCCTTCAGAGAAGCTGCAGACTTTTTGTTCCCTGCCTTCACTACTTTGCCACCTTT CACACCTTTCAGGGCTTTAAGTGACTTTGAAGGTTTTTGTGATTTTTTGGGTTCATTTTT GCTACTCTGAGTCTTCTTGACTTGATTATCACTCTTCTCCTGTTTTTTCGCTGGAGCCTT GGGAGCCATGCCTCAATCGTTCGTACCGCCAAAC



consensus multiple alignement with clustalw

CLUSTAL W (1.82) multiple sequence alignment


consensus_11280#0      CACCGGCATGTATTTTTTGTACAACTTATATAATACCGATTCTATTTGCAACATCTAAAG 60
consensus_11280#1      ------------------------------------------------------------
                                                                                   

consensus_11280#0      CGTCAAAATCAGGAGGTAGCTTCACATATGCTTTTTTAACATTGTTAGGGCAATTAAGCG 120
consensus_11280#1      ----------AGNAGGTAGCTTCACATATGCTTTTTTAACATTGTTAGGGCAATTAAGCG 50
                                 ** ***********************************************

consensus_11280#0      TGTTGACTTTCGCAACTTTGATATTATAAAGTTCTTGGACAGCTGCCTTGATTGCTGGTT 180
consensus_11280#1      TGTTGACTTTCGCAACTTTGATATTATAAAGTTCTTGGACAGCTGCCTTGATTGCTGGTT 110
                       ************************************************************

consensus_11280#0      TGTTTGCTCTTCGGTCAACAATGAACACTAATGTGTCGTTATCTTCAATTTTCTTCATTG 240
consensus_11280#1      TGTTTGCTCTTCGGTCAACAATGAACACTAATGTGTCGTTATCTTCAATTTTCTTCATTG 170
                       ************************************************************

consensus_11280#0      CAGCTTCGGTGGTAACCGGATGTTGAATGATACGAAAGGCATCAAGTTTGTTCCTTTTGG 300
consensus_11280#1      CAGCTTCGGTGGTAACCGGATGTTGAATGATACGAAAGGCATCAAGTTTGTTCCTTTTGG 230
                       ************************************************************

consensus_11280#0      GGATCAGGAATCTTCTGTCTTTTGGACAACGAGGAGGTTTGTACGTTTTAGGTCGCCTAA 360
consensus_11280#1      GGATCAGGAATCTTCTGTCTTTTGGACAACGAGGAGGTTTGTACGTTTTAGGTCGCCTAA 290
                       ************************************************************

consensus_11280#0      ATCGCGTGGTATACATCACCCTCTTCTTGCCTTTTGTGTGAGCACCAAGTGTGACGGCCC 420
consensus_11280#1      ATCGCGTGGTATACATCACCCTCTTCTTGCCTTTTGTGTGAGCACCAAGTGTGACGGCCC 350
                       ************************************************************

consensus_11280#0      GTTGTGCTTTCAATGCCTTCAGAGAAGCTGCAGACTTTTTGTTCCCTGCCTTCACTACTT 480
consensus_11280#1      GTTGTGCTTTCAATGCCTTCAGAGAAGCTGCAGACTTTTTGTTCCCTGCCTTCACTACTT 410
                       ************************************************************

consensus_11280#0      TGCCACCTTTCACACCTTTCAGGGCTTTAAGTGACTTTGAAGGTTTTTGTGATTTTTTGG 540
consensus_11280#1      TGCCACCTTTCACACCTTTCAGGGCTTTAAGTGACTTTGAAGGTTTTTGTGATTTTTTGG 470
                       ************************************************************

consensus_11280#0      GTTCATTTTTGCTACTCTGAGTCTTCTTGACTTGATTCTCACTCTTCTACTGATTTCCCC 600
consensus_11280#1      GTTCATTTTTGCTACTCTGAGTCTTCTTGACTTGATTATCACTCTTCTCCTGTTTTTTCG 530
                       ************************************* ********** *** ***  * 

consensus_11280#0      CTTGNCCAGGGTGACCGAGGTC---------------------- 622
consensus_11280#1      CTGGAGCCTTGGGAGCCATGCCTCAATCGTTCGTACCGCCAAAC 574
                       ** *  *   * ** * * * *                      




Copyright Thu Nov 6 12:32:27 CET 2003 Hubert Wassner    (hubert.wassner@noos.fr)