These datas are free for academic use only, please contact me for any other use. Schistosoma mansoni see consensus multiple alignment with clustalw Direct access to contigs :
consensusID : consensus_11280#0 NCBI blastX ! send the sequence to the NCBI site ! NCBI blastN ! send the sequence to the NCBI site ! Sequences nbr = 7 consensus length = 622 fasta sequence [CACCGGCATGTATTTTTTGTACAACTTATATAATACCGATTCTATTTGCAACATCTAAAGCGTCAAAATCA--GGAGGTAGCTTCACATATGC--TTTTTTAACATTGTTAGGGCAATTAAGCGTGTTGACTTT-CGCAACTTTGATATTAT-AAAG-TTCTTGGACAGCTGCCTTGATTGCTGGTTTGTTT-GCTCTTCGGTCAACAATGAA-CACTAATGTGTCGTTATCTTCAATTTTCTTCATTGCAGCTTCGGTGGTAACCGGATGTTGAATGATACGAAAGGCATCAAGTTTGTTCCTTTTGGGGATCAGGAATCTTCTGTCTTTTGGACAACGAGGAGGTTTGTACGTTTTAGGTCGCCTAAATCGCGTGGTATACATCACCCTCTTCTTGCCTTTTGTGTGAGCACCAAGTGTGACGGCCCGTTGTGCTTTCAATGCCTTCAGAGAAGCTGCAGACTTTTTGTTCCCTGCCTTCACTACTTTGCCACCTTTCACACCTTTCAGGGCTTTAAGTGACTTTGAAGGTTTTTGTGATTTTTTGGGTTCATTTTTGCTACTCTGAGTCTTCTTGACTTGATTCTCACTCTTCTACTGATTT-CC-CCCTTGNCCAGGGTGACCGAGGTC] [+] EMBL CD131331 [CACCGGCATGTATTTTTTGTACAACTTATATAATACCGATTCTATTTGCAACATCTAAAGCGTCAAAATCA GGAGGTAGCTTCACATATGC TTTTTTAACATTGTTAGGGCAATTAAGCGTGTTGACTTT CGCAACTTTGATATTAT AAAG TTCTTGGACAGCTGCCTTGATTGCTGGTTTGTTT GCTCTTCGGTCAACAATGAA CACTAATGTGTCGTTATCTTCAATTTTCTTCATTGCAGCTTCGGTGGTAACCGGATGTTGAATGATACGAAAGGCATCAAGTTTGTTCCTTTTGGGGATCAGGAATCTTCTGTCTTTTGGACAACGAGGAGGTTTGTACGTTTTAGGTCGCCTAAATCGCGTGGTATACATCACCCTCTTCTTGCCTTTTGTGTGAGCACCAAGTGTGACGGCCCGTTGTGCTTTCAATGCCTTCA ] [+] EMBL SMAA25723 [ CATGTATTTTTTGTACAACTTATATAATACCGATTCTATTTGCAACATCTAAAGCGTCAAAATCA GGAGGTAGCTTCACATATGC TTTTTTAACATTGTTAGGGCAATTAAGCGTGTTGACTTTCCGCAACTTTGATATTATAAAAGTTTCTTGGACAGCTGCCTTGATTGCTGGTTTGTTTGGCTCTTCGGTCAACAATGAACCACTtactg ] [+] EMBL CD129387 [ tgggcAAGGNGTGGAAATCANNGGAGGTAGCTTCACATATGCCTTTTTTTAACATTGTTAGGGCAATTAAGCGTGTTGACTTT CGCAACTTTGATATTAT AAAG TTCTTGGACAGCTGCCTTGATTGCTGGTTTGTTT GCTCTTCGGTCAACAATGAA CACTAATGTGTCGTTATCTCCAATTTTCTTCATTGCAGCTTCGGTGGTAACCGGATGTTGAATGATACGAGAGGCATCAAGTTTGTTCCTTTTGGGGATCAGGAATCTTCTGTCTTTTGGACAACGAGGAGGTTTGTACGTTTTAGGTCGCCTAAATCGCGTGGTATACATCACCCTCTTCTTGCCTTTTGTGTGAGCACCAAGTGTGACGGCCCGTTGTGCTTTCAATGCCTTCAGAGAAGCTGCAGACTTTTTGTTCCCTGCCTTCACTACTTTGCCACCTTTCACACCTTTCAGGGCTTTAAGTGACTTTGAAGGTTTTTGTGATTTTTTGGGTTCATTTTTGCTACTCTGAGTCTTCTTGACTTGATT ] [-] EMBL CD134937 [ AAATCA GGAGGTAGCTTCACATATGC TTTTTTAACATTGTTAGGGCAATTAAGCGTGTTGACTTT CGCAACTTTGATATTAT AAAG TTCTTGGACAGCTGCCTTGATTGCTGGTTTGTTT GCTCTTCGGTCAACAATGAA CACTAATGTGTCGTTATCTTCAATTTTCTTCATTGCAGCTTCGGTGGTAACCGGATGTTGAATGATACGAAAGGCATCAAGTTTGTTCCTTTTGGGGATCAGGAATCTTCTGTCTTTTGGACAACGAGGAGGTTTGTACGTTCTAGGTCGCCTAAATCGCGTGGTATACATCACCCTCTTCTTGCac ] [+] EMBL CD067325 [ tgAAATCA CGAGGTAGCTTCACATATGC TTTTTTAACATTGTTAGGGCAATTAAGCGTGTTGACTTT CGCAACTTTGATATTAT AAAG TTCTTGGACAGCTGCCTTGATTGCTGGTTTGTTT GCTCTTCGGTCAACAATGAA CACTAATGTGTCGTTATCTTCAATTTTCTTCATTGCAGCTTCGGTGGTAACCGGATGTTGAATGATACGAAAGGCATCAAGTTTGTTCCTTTTGGGGATCAGGAATCTTCTGTCTTTTGGACAACGAGGAGGTTTGTACGTTTTAGGTCGCCTAAATCGCGTGGTATACATCACCCTCTTCTTGCCTTTTGTGTGAGCACCAAATGTGACGGCCCGTTGTGC ] [-] EMBL CD066284 [ TTTTGGACAACGAGGAGGTTTGTACGTTTTAGGTTGCCTAAATCGCGTGGTATACATCAGCCTCTTCTTGCCTTTTGTGTGAGCACCAAGTGTGACGGCCCGTTGTGCTTTCAATGCCTTCAGAGAAGCTGCAGACTTTTTGTTCCCTGCCTTCATTACTTTGCCACCTTTCACACCTTTCAGGGCTTTAAGTGACTTTGAAGGTTTTTGTGATTTTTTGGGTTCATTTTTGCTACTCTGAGTCTTCTTGACTTGATCCTCACTCTTCTACTGATTT CC CCCTTG ] [-] EMBL CD168195 [ ACATCACCCTCTTCTTGCCTTTTGTGTGAGCACCAAGTGTGACGGCCCGTTGTGCTTTCAATGCCTTCAGAGAAGCTGCAGACTTTTTGTTCCCTGCCTTCACTACTTTGCCACCTTTCACACCTTTCAGGGCTTTAAGTGACTTTGAAGGTTTTTGTGATTTTTTGGGTTCATTTTTGCTACTCTGAGTCTTCTTGACTTGATTATCACTCTTCTCCTGATTTNCCACCCTTGNCCAGGGTGACCGAGGTC] consensusID : consensus_11280#1 NCBI blastX ! send the sequence to the NCBI site ! 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Copyright Thu Nov 6 12:32:27 CET 2003 Hubert Wassner (hubert.wassner@noos.fr) | ||||