Home
Who am I
Technology
EST Assembly
Contact

These datas are free for academic use only, please contact me for any other use.

Schistosoma mansoni
cluster # 11284 cluster # 11284       Sequences # 47       consensus # 4


see consensus multiple alignment with clustalw

Direct access to contigs :
consensus_11284#0 length = 1040 sequences # 43  
consensus_11284#1 length = 611 sequences # 2  
consensus_11284#2 length = 601 sequences # 1  
consensus_11284#3 length = 285 sequences # 1  

consensusID : consensus_11284#0
NCBI blastX ! send the sequence to the NCBI site !
NCBI blastN ! send the sequence to the NCBI site !
Sequences nbr = 43
consensus length = 1040
fasta sequence
                              [CGTAACTGTCGGGGCTACTTCCGTGAGGACGTTCTTCAATGAGTTTTCTTTTTGGAGC-CAGGAAAACACCTGAAGAGCAGCTAAGAGATAGCAAACGAACTATTGCAAGAACACTTAGAGAGATAGAAAGAGAAAAAGGTCAGTTGGAGAGGGAACGCACTCGAATAACAAATGAAATTCGTATGTTGGCAAAGCGTGGTCAGATTGATGCCGTCAGAGTAATGGCGAAGCAGTTAGTTCGAACAGACAGTTACATCAAAAAGTTCTCCTTGATGCACTCAAATATTACA-GCGTTGTCAATGAAAATTCAGACTTTAAAATCAACTGCCACGATGGCTTCAGCTATGAAACAGGTTGCGCTAACAATGAG-AAAAATGAATGCAACTATGCAGTTACCTCAGTTCCAAAAGGTCATGATGGAGTTTGAAAAACAAGCTGAAACGATGGAAATGAAACAGGATATGATGTCGG-ATGTGATA-GATGATGCTATTGGAGATCAGGATGACATTGAAGACTCTGAAGCTGTTGTAAACAAGG-TTTTAGAAGAGCTTGGCATCGATCTTAATGCACAGTTGAGTAATCTCCCAACAGCTAAGGATACGATTGGAAGTACAGTGCCAAGTGCAGTCCGACCTCATGCAGTCGCTACT-GATCCTACCCCAATAAC-GGGACCTGGGCCTAATTCTGATTCTATTGATCCTATTGATGAAAATAACTTGGAAGCTCGTTTAG-AACGTCTCAAAAGAAAATAAAATCTTAATTCACTTATGGGTGCACGTCAGCTTTCAGTTCTAACATCTATATCACCTCATGTTTATATAAACA-TA-TTTCACAATCCAGCATAATAATGCTTCAAACTTAA-TTATCATATAGATAATA-T--TTTGGACTTTTTGTTTCCTCATACTATCAAACTATTGCAAATAATTTTTAGAAAAATACTGTTTGGTGCTCTATGATGTAAATCTCTGCAGTTTACAATTTAAAAGTATTCTTAATAAAAGATTTTTGTTACTAAAAAAAAAAAAAAAAAAAAAAAAAAA]

[-] EMBL CD157067             [CGTAACTGTCGGGGCTACTTCCGTGAGGACGTTCTTCAATGAGTTTTCTTTTTGGAGC CAGGAAAACACCTGAAGAGCAGCTAAGAGATAGCAAACGAACTATTGCAAGAACACTCAGAGAGATAGAAAGAGAAAAAGGTCAGTTGGAGAGGGAACGCACTCGAATAACAAATGAAATTCGTATGTTGGCAAAGCGTGGTCAGATTGATGCCGTCAGAGTAATGGCGAAGCAGTTAGTTCGAACAGACAGTTACATCAAAAAGTTTTCCTTGATGCACTCAAATATTACA GCGTTGTCAATGAAAATTCAGACTTTAAAATCAACTGCCACGATGGCTTCAGCTATGAAACAGGTTGCGCTAACAATGAG AAAAATGAATGCAACTATGCAGTTACCTCAGTTCCAAAAGGTCATGATGGAGTTTGAAAAACAAGCTGAAACGATGGAAATGAA                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                      ]
[-] EMBL CD157226             [CGTGACTGTCGGGGCAACTTCCGTGAGGACGTTCTTCAATGAGTTTTCTTTTTGGATC CAGGAAAACACCTGAAGAGCAGCTAAGAGATAGCAAACGAACTATTGCAAGAACACTCAGAGAGATAGAAAGAGAAAAAGGTCAGTTGGAGAGGGAACGCACTCGAATAACAAATGAAATTCGTATGTTGGCAAAGCGTGGTCAGATTGATGCCGTCAGAGTAATGGCGAAGCAGTTAGTTCGAACAGACAGTTACATCAAAAAGTTTTCCTTGATGCACTCAAATATTACA GCGTTGTCAATGAAAATTCAGACTTTAAAATCAACTGCCACGATGGCTTCAGCTATGAAACAGGTTGCGCTAACAATGAG AAAAATGAATGCAACTATGCAGTTACCTCAGTTCCAAAAGGTCATGATGGAGTTTGAAAAACAAGCTGAAACGATGGAAATGAA                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                      ]
[-] EMBL CD094803             [ GTTACTGTCGGGGCTACTTCCGTGAGGACGTTCTTCAATGAGTTTTCTTTTTGGAGC CAGGAAAACACCTGAAGAGCAGCTAAGAGATAGCAAACGAACTATTGCAAGAACACTTAGAGAGATAGAAAGAGAAAAAGGTCAGTTGGAGAGGGAACGCACTCGAATAACAAATGAAATTCGTATGTTGGCAAAGCGTGGTCAGATTGATGCCGTCAGAGTAATGGCGAAGCAGTTAGTTCGAGCAGACAGTTACATCAAAAAGTTCTCCTTGATGCACTCAAATATTACA GCGTTGTCAATGAAAATTCAGACTTTAAAATCAACTGCCACGATGGCTTCAGCTATGAAACAGGTTGCGCTAACAATGAG AAAAATGAATGCAACTA                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                         ]
[+] EMBL CD180048             [             GCTACTTCCGTGAGGACGTTCTTCAATGAGTTTTCTTTTTGGAGC CAGGAAAACACCTGAAGAGCAGCTAAGAGATAGCAAACGAACTATTGCAAGAACACTTAGAGAGATAGAAAGAGAAAAAGGTCAGTTGGAGAGGGAACGCACTCGAATAACAAATGAAAT                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                            ]
[-] EMBL CD118998             [              CTACTTCCGTGAGGACGTTCTTCAATGAG TTTCCTTTTGGAGCNCAGGAAAACACCTGAAGAGCAGCTAAGAGATAGCAAACGAACTATTGCAAGAACACTCAGAGAGATAGAAAGAGAAAAAGGTCAGTTGGAGAGGGAACGCACTCGAATAACAAATGAAATTCGTATGTTGGCAAAGCGTGGTCAGATTGATGCCGTCAGAGTAATGGCGAAGCAGTTAGTTCGAACAGACAGTTACATCAAAAAGTTTTCCTTGATGCACTCAAATATTACA GCGTTGTCAATGAAAATTCAGACTTTAAAATCAACTGCCACGATGGCTTCAGCTATGAAACAGGTTGCGCTAACAATGAG AAAAATGAATGCAACTATGCAGTTACCTCAGTTCCAAAAGGTCATGATGGAGTTTGAAAAACAAGCTGAAACGATGGAAATGAA                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                      ]
[+] EMBL SMAA43885            [                                          GTTTTCTTTTTGGAGC CAGGAAAACACCTGAAGAGCAGCTAAGAGATAGCAAACGAACTATTGCAAGAACACTTAGAGAGATAGAAAGAGAAAAAGGTCAGTTGGAGAGGGAACGCACTCGAATAACAAATGAAATTCGTATGTTGGCAAAGCGTGGTCAGATTGATGCCGTCAGAGTAATGGCGAA NAGTTAGTTCGAACAGACAGTTACATCAAAAAGTTTTCCTTGATGCACTCAAATATTACA GCGTTGTCAATGAAAATTCAGACTTTAAAATCAACTGCCACGATGGCTTCAGCTATGAAACAGGTTGCGCTAACAATGAG AAAAATGAATGCAACTATGCAGTTACCTCAGTTCCAAAAGGTCATGATGGAGTTTGAAAAACAAGCTGAAACGATGGAAATGAAACAGGGTATGATGTCGG ATGTGATANGATGATGC                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                   ]
[+] EMBL AI976514             [                                                           CAGGAAAACACCTGAAGAGCAGCTAAGAGATAGCAAACGAACTATTGCAAGAACACTTAGAGAGATAGAAAGAGAAAAAGGTCAGTTGGAGAGGGAACGCACTCGAATAACAAATGAAATTCGTATGTTGGCAAAGCGTGGTCAGATTGATGCCGTCAGAGTAATGGCGAAGCAGTTAGTTCGAACAGACAGTTACATCAAAAAGTTCTCCTTGATGCACTCAAATATTACA GCGTTGTCAATGAAAATTCAGACTTTAAAATCAACTGCCACGATGGCTTCAGCTATGAAACAGGTTGCGCTAACAATGAG AAAAATGAATGCAACTATGCAGTTACCTCAGTTCCAAAAGGTCATGATGGAGTTTGAAAAACAAGCTGAAACGATGGAAATGAAACAGGATATGATGTCGG ATGTGATA GATGATGCTATTGGAGATCAGGATGACATTGAAGACTCTGAAGCTGTTGTAAACAAGG TTTTAGAAGAGCTTGGCATCGATCTTAATGCACAGTTGAGTAATCTCCCAACAG                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                          ]
[+] EMBL CD202957             [                                                                                         TAGCAAACGAACTATTGCAAGAACACTTAGAGAGATAGAAAGAGAAAAAGGTCAGTTGGAGAGGGAACGCACTCGAATAACAAATGAAATTCGTATGTTGGCAAAGCGTGGTCAGATTGATGCCGTCAGAGTAATGGCGAAGCAGTTAGTTCGAACAGACAGTTACATCAAAAAGTTCTCCTTGATGCACTCAAATATTACA GCGTTGTCAATGAAAATTCAGACTTTAAAATCAACTGCCACGATGGCTTCAGCTATGAAACAGGTTGCGCTAACAATGAG AAAAATGAATGCAACTATGCAGTTACCTCAGTTCCAAAAGGT                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                ]
[+] EMBL CD082292             [                                                                                                                            gccAAAGAG AAAAGGTCAGTTGGAGAGGGAACTCACTCGAATAACAAATGACATTCGTATGTTGGCAAAGCGTGGTCAGATTGATGCCGTCAGAGTAATGGCGAAGCAGTTAGTTCGAACAGACAGTTACATCAAAAAGTTTTCCTTGATGCACTCAAATATTACA GCGTTGTCAATGAAAATTCAGACTTTAAAATCAACTGCCACGATGGCTTCAGCTATGAAACAGGTTGCGCTAACAATGAG AAAAATGAATGCAACTATGCAGTTACCTCAGTTCCAAAAGGTCATGATGGAGTTTGAAAAACAAGCTGAAACGATGGAAATGAAACAGGATATGATGTCGG ATGTGATA GATGATGCTATTGGAGATCAGGATGACATTGAGGACTCTGAAGCTGTTGTAAACAAGG TTTTAGAAGAGCTTGGCATCGATCTTAATGCACAGTTGAGTAATCTCCCAACAGCTAAGGATACGATTGGAAGCACAGTGCCAAGTGCAGTCCGACCTCATGCAGTCGCTACT GATCCTACCCCAATAAC GGGACCTGNGCCTAATTCTGATTCTATTGATCCTATTGATGAAAATAACTTGGAAGCTCGTTTAG AACGTCTCAAAAGAAAAT                                                                                                                                                                                                                                                                                                        ]
[+] EMBL CD127385             [                                                                                                                                        atagtagGTTGGAGAGGGAACGTTCTCGAATAACAAATGAAATTCGTATGTTGGCAAAGCGTGGTCAGATTGATGCCGTCAGAGTAATGGCGAAGCAGTTAGTTCGAACAGACAGTTACATCAAAAAGTTTTCCTTGATGCACTCAAATATTACA GCGTTGTCAATGAAAATTCAGACTTTAAAATCAACTGCCACGATGGCTTCAGCTATGAAACAGGTTGCGCTAACAATGAG AAAAATGAATGCAACTATGCAGTTACCTCAGTTCCAAAAGGTCATGATGGAGTTTGAAAAACAAGCTGAAACGATGGAAATGAAACAGGATATGATGTCGG ATGTGATA GATGATGCTATTGGAGATCAGGATGACATTGAAGACTCTGAAGCTGTTGTAAACAAGG TTTTAGAAGAGCTTGGCATCGATCTTAATGCACAGTTG                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                          ]
[+] EMBL CD127502             [                                                                                                                                                        GGAACGC CTCGAATAACAAATGAAATTCGTATGTTGGCAAAGCGTGGTCAGATTGATGCCGTCAGAGTAATGGCGAAGCAGTTAGTTCGAACAGACAGTTACATCAAAAAGTTCTCCTTGATGCACTCTTATATTACA GCGTTGTCAATGAAAATTCAGACTTTAAAATCAACTGCCACGATGGCTTCAGCTATGAAACAGGTTGCGCTAACCCCGAC AAAAATGAATGCAACTATGCAGTTACCTCANTTCCAAAAGGTCATGATGGAGTTTGAAAAACAAGCTGAAACGATGGAAATGAAACAGGATATGATGTCGG ATGTGATA NATGATGCTATTGGAGATCAGGATGACATTGAAGACTCTGAAGCTGTTGTAAACAAGG TTTTAAAAAAGCTTGGCNTCGATCTTAATGCACAGTTGAGTAATCTCCCANCAGCTAAGGATACGATTGGAAGTACAGTGCCAAGTGCAGTCCGACCTCATGCAGTCGCTTCT GATCCTACCCCAATAAC GGGACCTGGGCCTAATTCTGATTCTATTGATCCTATTGATGAAAATAACT                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                          ]
[+] EMBL CD127484             [                                                                                                                                                          AACGCACTCGAATAACAAATGAAATTCGTATGTTGGCAAAGCGTGGTCAGATTGATGCCGTCAGAGTAATGGCGAAGCAGTTAGTTCGAACAGACAGTTACATCAAAAAGTTCTCCTTGATGCACTCAAATATTACA GCGTTGTCAATGAAAATTCAGACTTTAAAATCAACTGCCACGATGGCTTCAGCTATGAAACAGGTTGCGCTAACAATGAG AAAAATGAATGCAACTATGCAGTTACCTCAGTTCCAAAAGGTCATGATGGAGTTTGAAAAACAAGCTGAAACGATGGAAATGAAACAGGATATGATGTCGG ATGTGATA GATGATGCTATTGGAGATCAGGATGACATTGAAGACTCTGAAGCTGTTGTAAACAAGG TTTTAGAAGAGCTTGGCATCGATCTTAATGCACAGTTGAGTAATCTCCCAACAGCTAAGGATACGATTGGAAGTACAGTGCCAAGTGCAGTCCGACCTCATGCAGTCGCTACT GATCCTACCCCAATAAC GGGACCTGGGCCTAATTCTGATTCTATTGATCCTATTGATGAAAATAACTTGGAAGCTCGCTTAG AACGTCTCAAAAGAAAATAAAATCTTAATTCACTTATGGGTGCACGTCAGCTTTCAGTTCTAA                                                                                                                                                                                                                                                           ]
[+] EMBL CD127500             [                                                                                                                                                          AACGCACTCGAATAACAAATGAAATTCGTATGTTGGCAAAGCGTGGTCAGATTGATGCCGTCAGAGTAATGGCGAAGCAGTTAGTTCGAACAGACAGTTACATCAAAAAGTTCTCCTTGATGCACTCAAATATTACA GCGTTGTCTATGAAAATTCAGACTTTAAAATCAACTGCCACGATGGCTTCAGCTATGAAACAGGTTGCGCTAACAATGAG AAAAATGAATGCAACTATGCAGTTACCTCAGTTCCAAAAGGTCATGATGGAGTTTGAAAAACAAGCTGAAACGATGGAAATGAAACAGGATATGATGTCGG ATGTGATA GATGATGCTATTGGAGATCAGGATGACATTGAAGACTCTGAAGCTGTTGTAAACAAGG TTTTAGAAGGGCTTGGCATCGATCTTAATGCACAGTTGAGTAATCTCCCAACAGCTAAGGATACGATTGGAAGTACAGTGCCAAGCGCAGTCCGACCTCATGCAGTCGCTACT GATCCTACCCCAATAAC GGGACCTGGGCCTAATTCTGATTCTATTGATCCTATTGATGAAAATAACTTGGAAGCTCGTTTAG AACGTCTCAAAAGAAAATAAAATCTTAATTCACTTATGGGTGCACGTCAGCTTTCAGTTCTAA                                                                                                                                                                                                                                                           ]
[+] EMBL CD127311             [                                                                                                                                                          AACGCACTCGAATAACAAATGAAATTCGTATGTTGGCAAAGCGTGGTCAGATTGATGCCGTCAGAGTAATGGCGAAGCAGTTAGTTCGAACAGACAGTTACATCAAAAAGTTCTCCTTGATGCACTCAAATATTACA GCGTTGTCAATGAAAATTCAGACTTTAAAATCAACTGCCACGATGGCTTCAGCTATGAAACAGGTTGCGCTAACAATGAG AAAAATGAATGCAACTATGCAGTTACCTCAGTTCCAAAAGGTCATGATGGAGTTTGAAAAACAAGCTGAAACGATGGAAATGAAACAGGATATGATGTCGG ATGTGATA GATGATGCTATTGGAGATCAGGATGACATTGAAGACTCTGAAGCTGTTGTAAACAAGG TTTTAGAAGAGCTTGGCATCGATCTTAATGCACAGTTGAGTAATCTCCCAACAGCTAAGGATACGATTGGAAGTACAGTGCCAAGTGCAGTCCGACCTCATGCAGTCGCTACT GATCCTACCCCAATAAC GGGACCTGGGCCTAATTCTGATTCTATTGATCCTATTGATGAAAATAACTTGGAAGCTCGTTTAG AACGTCTCAAAAGAAAATAAAATCTTAATTCACTTATGGGTGCACGTCAGCTTTCAGTTCTta                                                                                                                                                                                                                                                           ]
[-] EMBL CD065261             [                                                                                                                                                           ACGCACTCGAATACCAAATGAAATTCGTATGTNGGCANAGCGTGGTCAGATTGATGCCGTCAGAGTAATGGCGAAGCAGTTAGTTCGAACAGACAGTTACATCANAAAGTTCTCCTTGATGCACTCAAATATTACA GCGTTGTCAATGAAAATTCAGACTTTAAAATCAACTGCCGCGATGGCTTCAGCTATGAAACAGGTTGCGCTAACAATGAG AAAAATGAATGCAACTATGCAGTTACCTCAGTTCCAAAAGGTCATGATGGAGTTTGAAAAACAAGCTGAAACGATGGAAATGAAACAGGATATGATGTCGG ATGTGATA GATGATGCTATTGGAGATCAGGATGACATTGAAGACTCTGAAGCTGTTGTAAACAAGG TTTTAGAAGAGCTTGGCATCGATCTTAATGCACAGTTGAGTAATCTCCCAACAGCTAAGGATACGATTGGAAGTACAGTGCCAAGTGCAGTCCGACCTCATGCAGTCGCTACT GATCCTACCCCAATAAC GGGACCTGGGCCTAATTCTGATTCTATTGATCCTATTGATGAAAATAACTTGGAAGCTCGTTTAG AACGTCTCAAAAGAAAATAAAATCTTAATTCACTTATGGGTGCACGTCAGCTTTCAGTTCTAAC                                                                                                                                                                                                                                                          ]
[-] EMBL CD127476             [                                                                                                                                                            CGCACTCGAATACCAAATGAAATTCGTATGTTGGCAAAGCGTGGTCAGATTGATGCCGTCAGAGTAATGGCGAAGCAGTTAGTTCGAACAGACAGTTACATCAAAAAGTTTTCCTTGATGCACTCAAATA TACAGGCGTTGTCAATGAAAATTCAGACTTTAAAATCAACTGCCACGATGGCTTCAGCTATGAAACAGGTTGCGCTAACAATGAGAAAAAATGAATGCAACTATGCAGTTACCTCAGTTCCAAAAGGTCATGATGGAGTTTGAAAAACAAGCTGAAACGATGGAAATGAAACAGGATATGATGTCGG ATGTGATA GATGATGCTATTGGAGATCAGGATGACATTGAGGACTCTGAAGCTGTTGTAAACAAGG TTTTAGAAGAGCTTGGCATCGATCTTAATGCACAGTTGAGTAATCTCCCAACAGCTAAGGATACGATTGGAAGCACAGTGCCAAGTGCAGTCCGACCTCATGCAGTCGCTACT GATCCTACCCCAATAAC GGGACCTGGGCCTAATTCTGATTCTATTGATCCTATTGATGAAAATAACTTGGAAGCTCGTTTAG AACGTCTCAAAAGAAAATAAAATCTTAATTCACTTATGGGTGCACGTCAGCTTTCAGTTCTAAC                                                                                                                                                                                                                                                          ]
[+] EMBL CD093916             [                                                                                                                                                                      TAACAAATGAAATTCGTATGTTGGCAAAGCGTGGTCAGATTGGTGCCGTCAGAGTAATGGCGAAGCAGTTAGTTCGAACAGACAGTTACATCAAAAAGCTCTCCTTGATGCACTCAAATATTACA GCGTTGTCAATGAGAATTCAGACTTTAAAATCAACTGCCACGATGGCTTCAGCTATGAAACAGGTTGCGCTAACAATGAG AAAAATGAATGCAACTATGCAGTTACCTCAGTTCCAAAAGGTCATGATGGAGTTTGAGAAACAAGCTGAAACGATGGAAATGAAACAGGATATGATGTCGG ATGTGATA GATGATGCTATTGGAGATCAGGATGACATTGAAGACTCTGAAGCTGTTGTAAACAAGG TTTTAGAAGAGCTTGGCATCGATCTTAATGCACAGTTGAGT                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                       ]
[+] EMBL CD084162             [                                                                                                                                                                                                                                                           gacccTCACGAAGTTCTCCTTGATGCACTCAAATATTACA GCGTTGTCAATGAAAATTCAGACTTTAAAATCAACTGCCACGATGGCTTCAGCTATGAAACAGGTTGCGCTAACAATGAG AAAAATGAATGCAACTATGCAGTTACCTCAGTTCCAAAAGGTCATGATGGAGTTTGAAAAACAAGCTGAAACGATGGAAATGAAACAGGATATGATGTCGG ATGTGATA GATGATGCTATTGGAGATCAGGATGACATTGAAGACTCTGAAGCTGTTGTCAACAAGG TTTTAGAAGAGCTTGGCATCGATCTTAATGCACAGTTGAGTAATCTCCCAACAGCTAAGGATACGATTG                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                           ]
[+] EMBL CD192688             [                                                                                                                                                                                                                                                                                             ATTACA GCGTTGTCAATGAAAATTCAGACTTTAAAATCAACTGCCACGATGGCTTCAGCTATGAAACAGGTTGCGCTAACAATGAG AAAAATGAATGCAACTATGCAGTTACCTCAGTTCCAAAAGGTCATGATGGAGTTTGAAAAACAAGCTGAAACGATGGAAATGA                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                       ]
[+] EMBL CD089018             [                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                         TATGAAACAGGTTGCGCTAACAATGAG AAAAATGAATGCAACTATGCAGTTACCTCAGTTCCAAAAGGTCATGATGGAGTTTGAAAAACAAGCTGAAACGATGGAAATGAAACAGGATATGATGTCGG ATGTGATA GATGATGCTATTGGAGATCAGGATGACATTGAAGACTCTGAAGCTGTTGTAAACAAGG TTTTAGAAGAGCTTGGCATCGATCTTAATGCACAGTTGAGTAATCTCCCAACAGCTAAGGATACGATTGGAAGTACAGTGCCAAGTGCAGTCCGACCTCATGCAGTCGCTACT GATCCTACCCCAATAAC GGGACCTGGGCCTAATTCTGATTCTATTGATCC                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                           ]
[+] EMBL CD126207             [                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                       atactcaAATGAG  AAAATGAATGCAACTAT C GTTACCTCAGTTCCAAAAGGTCATGATGGAGTTTGAAAAACAAGCTGAAACGATGGAAATGAAACAGGATATGATGTCGG ATGTGATA GATGATGCTATTGGAGATCAGGATGACATTGAAGACTCTGAAGCTGTTGTAAACAAGG TTTTAGAAGAGCTTGGCATCGATCTTAATGCACAGTTGAGTAATCTCCCAACAGCTAAGGATACGATTGGAAGTACAGTGCCAAGTGCAGTCCGACCTCATGCAGTCGCTACT GATCCTACCCCAATAAC GGGACCTGGGCCTAATTCTGATTCTATTGATCCTATTGATGAAAATAACTTGGAAGCTCGTTTAG AACGTCTCAAAAGAAAATAAAATCTTAATTCACTTATGGGTGCACGTCAGCTTTCAGTTCTAACA                                                                                                                                                                                                                                                         ]
[+] EMBL CD063143             [                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                              TGCAACTGTGCAGTTACCTCAGTTCCAAAAGGTCATGATGGAGTTTGAAAAACAAGCTGAAACGATGGAAATGAAACAGGATATGATGTCGG ATGTGATA GATGATGCTATTGGAGATCAGGATGACATTGAGGACTCTGAAGCTGTTGTAAACAAGG TTTTAAAAGAGCTTGGCATCGATCTTAATGCACAGTTGAGTAATCTCCCAACAGCTAAGGATACGATTGGAAGCACAGTGCCAAGTGCAGTCCGACCTCATGCAGTCGCTACT GATCCTACCCCAATAAC GG                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                          ]
[+] EMBL CD063109             [                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                              TGCAACTATGCAGTTACCTCAGTTCCAAAAGGTCATGATGGAGTTTGAAAAACAAGCTGAAACGATGGAAATGAAACAGGATATGATGTCGG ATGTGATA GATGATGCTATTGGAGATCAGGATGACATTGAAGACTCTGAAGCTGTTGTAAACAAGG TTTTAGAAGAGCTTGGCATCGATCTTAATGCACAGTTGAGTAATCT CCAACAGCTAAGGATACGATTGGAAGTACAGTGCCAAGTGCAGTCCGACCTCATGCAGTCGCTACT GATCCTACC                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                     ]
[+] EMBL CD063017             [                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                              TGCAACTATGCAGTTACCTCAGTTCCAAAAGGTCATGATGGAGTTTGAAAAACAAGCTGAAACGATGGAAATGAAACAGGATATGATGTCGG ATGTGATA GATGATGCTATTGGAGATCAGGATGACATTGAAGACTCTGAAGCTGTTGTAAACAAGG TTTTAGAAGAGCTTGGCATCGATCTTAATGCACAGTTGAGTAATCTCCCAACAGCTAAGGATACGATTGGAAGTACAGTGCCAAGCGCAGTCCGACCTCATGCAGTCGCTACT GATCCTACC                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                     ]
[+] EMBL CD063210             [                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                              TGCATTTATGCAGTTACCTCAGTTCCAAGAGGTCATGATGGAGTTTGAAAAACAAGCTGAAACGATGGAAATGAAACAGGATATGATGTCGG ATGTGATA GATGATGCTATTGGAGATCAGGATGACATTGAAGACTCTGAAGCTGTTGTAAACAAGG TTTTAAAAAAGCTTGGCATCGATCTTAATGGACAGTTGAGTAATCTCCCAACAGCTAAGGATACGATTGGAAGTACAGTGCTAAGTGCAGTCCGACCTCATGCAGTCGCTACT GATCCTACC                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                     ]
[-] EMBL CD126247             [                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                               GCAACTATGCAGTTACCTCAGTTCCAAAAGGTCATGATGGAGTTTGAAAAACAAGCTGAAACGATGGAAATGAAACAGGATATGATGTCGG ATGTGATA GATGATGCTATTGGAGATCAGGATGACATTGAAGACTCTGAAGCTGTTGTAAACAAGG TTTTAGAAGAGCTTGGCATCGATCTTAATGCACAGTTGAGTAATCTCCCAACAGCTAAGGATACGATTGGAAGTACAGTGCCAAGTGCAGTCCGACCTCATGCAGTCGCTACT GATCCTACCCC ATAAC GGa                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                         ]
[-] EMBL CD126225             [                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                               GCAACTATGCAGTTACCTCAGTTCCAAAAGGTCATGATGGAGTTTGAAAAACAAGCTGAAACGATGGAAATGAAACAGGATATGATGTCGG ATGTGATA GATGATGCTATTGGAGATCAGGATGACATTGAAGACTCTGAAGCTGTTGTAAACAAGG TTTTAGAAGAGCTTGGCATCGATCTTAATGCACAGTTGAGTAATCTCCCAACAGCTAAGGATACGATTGGAAGTACAGTGCCAAGTGCAGTCCGACCTCATGCAGTCGCTACT GATCCTACCCCAATAAC GGGACCTGGGCCTAATTCTGATTCTATTGATCCTATTGATGAAAATAACTTGGAAGCTCGTTTAG AACGTCTCAAAAGAAAATAAAATCTTAATTCACTTATGGGTGCACGTCAGCTTTCAGTTCTAACATCTATATCACCTCATGTCTATATAAACA TA TTTCACAATCCAGCATAATAATGCTTCAAACTTAAGTTATCATATAGATAATA T  TTTGGACT                                                                                                                                                        ]
[-] EMBL CD126246             [                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                               GCAACTATGCAGTTACCTCAGTTCCAAAAGGTCATGATGGAGTTTGAAAAACAAGCTGAAACGATGGAAATGAAACAGGATATGATGTCGG ATGTGATA GATGATGCTATTGGAGATCAGGATGACATTGAAGACTCTGAAGCTGTTGTAAACAAGG TTTTAGAAGAGCTTGGCATCGATCTTAATGCACAGTTGAGTAATCTCCCAACAGCTAAGGATACGATTGGAAGTACAGTGCCAAGTGCAGTCCGACCTCATGCAGTCGCTACT GATCCTACCCCAATAAC GGGACCTGGGCCTAATTCTGATTCTATTGATCCTAATGATGAAAATAACTTGGAAGCTCGTTTAG AACGTCTCAAAAGAAAATAAAATCTTAATTCACTTATGGGTGCACGTCAGCTTTCAGTTCTAACATCTATATCACCTCATGTTTATATAAACA TA TTTCACAATCCAGCATAATAATGCTTCAAACTTAA TTAT ATATAGATAATA T  TTTGGACTTTT                                                                                                                                                     ]
[-] EMBL CD126218             [                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                               GCAACTATGCAGTTACCTCAGTTCCAAAAGGTCATGATGGAGTTTGAAAAACAAGCTGAAACGATGGAAATGAAACAGGATATGATGTCGG ATGTGATA GATGATGCTATTGGAGATCAGGATGACATTGAAGACTCTGAAGCTGTTGTAAACAAGG TTTTAGAAGAGCTTGGCATCGATCTTAATGCACAGTTGAGTAATCTCCCAACAGCTAAGGATACGATTGGAAGTACAGTGCCAAGTGCAGTCCGACCTCATGCAGTCGCTACT GATCCTACCCCAATAAC GGGACCTGGGCCTAATCCTGATTCTATTGATCCTATTGATGAAAATAACTTGGAAGCTCGTTTAG AACGTCTCAAAAGAAAATAAAATCTTAATTCACTTATGGGTGCACGTCAGCTTTCAGTTCTAACATCTATATCACCTCATGTTTATATAAACA TA TTTCACAATCCAGCATAATAATGCTTCAAACTTAA TTATCATATAGATAATA T  TTTGGACTTTTT                                                                                                                                                    ]
[-] EMBL CD126220             [                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                               GCAACTATGCAGTTACCTCAGTT CAAAAGGTCATGATGGAGTTTGAAAAACAAGCTGAAACGATGGAAATGAAACAGGATATGATGTCGG ATGTGATA GATGATGCTATTGGAGATCAGGATGACATTGAGGACTCTGAAGCTGTTGTAAACAAGG TTTTAGAAGAGCTTGGCATCGATCTCAATGCACAGTTGAGTAATCTCCCAACAGCTAAGGATACGATTGGAAGCACAGTGCCAAGTGCAGTCCGACCTCATGCAGTCGCTACT GATCCTACCCCAATAAC GGGACCTGGGCCTAATTCTGATTCTATTGATCCTATTGATGAAAATAACTTGGAAGCTCGTTTAG AACGTCTCAAAAGAAAATAAAATCTTAATTCACTTATGGGTGCACGTCAGCTTTCAGTTCTAACATCTATATCACCTCATG TTATATAAACA TA TTTCACAATCCAGCATAATAATGCTTCAAACTTAA TTATCATATAGATAATA T  TTTGGACTTTTTGTTTCCTCAT                                                                                                                                          ]
[-] EMBL CD063084             [                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                               GCAACTATGCAGTTACCTCAGTTCCAAAAGGTCATGATGGAGTTTGAAAAACAAGCTGAATCGATGGAAATGAAACAGGATATGATGTCGGTATGTGATA GATGATGCTCTCGCAGATCAGGATGACATTGAGGACTTTGAAGCTGTTGTAAACAAGG TTTTAGAAGAGCTTGGCATCGATCTTAATGCGCAGTTGAGTAATCTCCCAACAGCTAAGGATACGATTGGAAGCTCAGTGCCAAGTGCAGTCCGACCTCATGCAGTCGCTGCT GATCCTACCCCAATAAA GGagct                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                      ]
[-] EMBL CD063064             [                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                               GCAACTATGCAGTTACCTCAGTTCCAAAAGGTCATGATGGAGTTTGAAAAACAAGCTGAAACGATGGAAATGAAACAGGATATGATGTCGG ATGTGATA GATGATGCTATTGGAGATCAGGATGACATTGAAGACTCTGAAGCTGTTGTAAACAAGG TTTTAGAAGAGCTTGGCATCGATCTTAATGCACAGTTGAGTAATCTCCCAACAGCTAAGGATACGATTGGAAGTACAGTGTCAAGTGCAGTCCGACCTCATGCAGTCGCTACT GATCCTACCCCAATAAC GGagc                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                       ]
[-] EMBL CD063083             [                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                               GCAACTATGCAGTTACCTCAGTTCCAAAAGGTCATGATGGAGTTTGAAAAACAAGCTGAAACGATGGAAATGAAACAGGATATGATGTCGG ATGTGATA GATGATGCTATTGGAGATCAGGATGACATTGAGGACTCTGAAGCTGTTGTAAACAAGG TTTTAGAAGAGCTTGGCATCGATCTTAATGCACAGTTGAGTAATCTCCCAACAGCTAAGGATACGATTGGAAGCACAGTGCCAAGTGCAGTCCGACCTCATGCAGTCGCTACT GATCCTACCCCAATAAC GGa                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                         ]
[-] EMBL CD063199             [                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                               GCAACTATGCAGTTACCTCAGTTCCAAAAGGTCATGATGGAGTTTGAAAAACAAGCTGAAACGATGGAAATGAAACAGGATATGATGTCGG ATGTGATA GATGATGCTATTGGAGATCAGGATGACATTGAAGACTCTGAAGCTGTTGTAAACAAGG TTTTAGAAGAGCTTGGCATCGATCTTAATGCACAGTTGAGTAATCTCCCAACAGCTAAGGATACGATTGGAAGTACAGTGCCAAGTGCAGTCCGACCTCATGCAGTCGCTGGT GATCCTACCCCAATAAC GGa                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                         ]
[-] EMBL CD075897             [                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                  ACTATGCAGTTACCTCAGTTCCAAAAGGTCATGATGGAGTTTGAAAAACAAGCTGAAACGATGGAAATGAAACAGGATATGATGTCGG ATGTGATA GATGATGCTATTGGAGATCAGGATGACATTGAGGACTCTGAAGCTGTTGTAAACAAGG TTTTAGAAGAGCTTGGCATCGATCTTAATGCACAGTTGAGTAATCTCCCAACAGCTAAGGATACGATTGGAAGCACAGTGCCAAGTGCAGTCCGACCTCATGCAGTCGCTACT GATCCTACCCCAATAAC GGGACCTGGGCCTAATTCTGATTCTATTGATCCTATTGATGAAAATAACTTGGAAGCTCGTTTAG AACGTCTCAAAAGAAAATAAAATCTTAATTCACTTATGGGTGCACGTCAGCTTTCAGTTCTAACATCTATATCACCTCATGTTTATATAAACA TA TTTCACAATCCAGCATAATAATGCTTTAAACTTAA TTATCATATAGATAATATT  TTTGGACTTTTTGTTTCCTCATACTATCAAACTATTGCAAATAATTTTTAGAAAAATACTGTTTGGTGCTCTATGATGTAAATCTCTGCAGTTTACGATTTAAAAGTATTCTTAATAAAAGATT                                    ]
[-] EMBL CD074880             [                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                       CAAAAGGTCATGATGGAGTTTGAAAAACAAGCTGAAACGATGGAAATGAAACAGGATATGATGTCGG ATGTGATA GATGATGCTATTGGAGATCAGGATGACATTGAAGACTCTGAAGCTGTTGTAAACAAGG TTTTAGAAGAGCTTGGCATCGATCTTAATGCACAGTTGAGTAATCTCCCAACAGCTAAGGATACGATTGGAAGTACAGTGCCAAGTGCAGTCCGACCTCATGCAGTCGCTACT GATCCTACCCCAATAAC GGGACCTGGGCCTAATTCTGATTCTATTGATCCTATTGATGAAAATAACTTGGAAGCTCGTTTAG AACGTCTCAAAAGAAAATAAAATCTTAATTCACTTATGGGTGCACGTCAGCTTTCAGTTCTAACATCTATATCACCTCATGTTTATATAAACA TA TTTCACAATCCAGCATAATAATGCTTCAAACTTAA TTATCATATAGATAATATT  TTTGGACTTTTTGTTTCCTCATACTATCAAACTATTGCAAATAATTTTTAGAAAAATACTGTTTGGTGCTCTATGATGTAAATCTCTGCAGTTTACAATTTAAAAGTATTCTTAATAAAAGATT                                    ]
[-] EMBL CD152246             [                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                     GGAGTTTGAAAAACAAGCTGAAACGATGGAAATGAAACAGGATATGATGTCGG ATGTGATA GATGATGCTATTGGAGATCAGGATGACATTGAAGACTCTGAAGCTGTTGTAAACAAGG TTTTAGAAGAGCTTGGCATCGATCTTAATGCACAGTTGAGTAATCTCCCAACAGCTAAGGATACGATTGGAAGTACAGTGCCAAGTGCAGTCCGACCTCATGCAGTCGCTACT GATCCTACCCCAATAAC GGGACCTGGGCCTAATTCTGATTCTATTGATCCTATTGATGAAAATAACTTGGAAGCTCGTTTAGCAACGTCTCAAAAGAAAATAAAATCTTAATTCACTTATGGGTGCACGTCAGCTTTCAGTTCTAACATCTATATCACCTCATGTTTATATGAACAGTAGTTTCACAATCCAGCATTATAATGCTTCAAACTTAA TTATCATATAGATAATA TTGTTTGGA                                                                                                                                                          ]
[+] EMBL CD182283             [                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                      GAAACAGGATATGATGTCGG ATGTGATA GATGATGCTATTGGAGATCAGGATGACATTGAAGACTCTGAAGCTGTTGTAAACAAGG TTTTAGAAGAGCTTGGCATCGATCTTAATGCACAGTTGAGTAATCTCCCAACAGCTAAGGATACGATTGGAAGTACAGTGCCAAGTGCAGTCCGACCTCATGCAGTCGCTACT GATCCTACCCCAATAAC GGGACCTGGGCCTAATTCTGATTCTATTGATCCTATTGATGAAAATAACTTGGAAGCTCGTTTAG AACGTCTCAA                                                                                                                                                                                                                                                                                                                ]
[-] EMBL AI395449             [                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                   AAGATTCTGAAGCTGTTGTAAACAAGGTTTTTAGAAGAGCTTGGCATCGATCTTAATGCACAGTTGAGTAATCTCCCAACAGCTAAGGATACGATTGGAAGTACAGTGCCAAGTGCAGTCCGACCTCATGCAGTCGCTACT GATCCTACCCCAATAAC GGGACCTGGGCCTAATTCTGATTCTATTGATCCTATTGATGAAAATAACTTGGAAGCTCGTTTAG AACGTCTCAAAAGAAAATAAAATCTTAATTCACTTATGGGTGCACGTCAGCTTTCAGTTCTAACATCTATATCACCTCATGTTTATATAAACA TA TTTCACAATCCAGCATAATAATGCTTCAAACTTAA TTATCATATAGATAATATT  TTTGGACTTTTTGTTTCCTCATACTATCAAACTATTGCAAATAATTTTTAGAAAAATACTGTTTGGTGCTCTATGATGTAAATCTCTGCAGTTTACAATTTAAAAGTATTCTTAATAAAAGATTTTTGTTACTAAAAAAAAAAAAAAAAAA         ]
[-] EMBL AI395052             [                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                      AGCACAGTGCCAAGTGCAGTCCGACCTCATGCAGTCGCTACTAGATCGTACCCCAATAACGGGGACCTGGGCCTAATTCTGATTCTATTGATCCTATTGATGAAAATAACTTGGAAGCTCGTTTAG AACGTCTCAAAAGAAAATAAAATCTTAATTCACTTATGGGTGCACGTCAGCTTTCAGTTCTAACATCTATATCACCTCATGTTTATATAAACA TA TTTCACAATCCAGCATAATAATGCTTTAAACTTAA TTATCATATAGATAATATT  TTTGGACTTTTTGTTTCCTCATACTATCAAACTATTGCAAATAATTTTTAGAAAAATACTGTTTGGTGCTCTATGATGTAAATCTCTGCAGTTTACAATTTAAAAGTATTCTTAATAAAAGATTTTTGTTACTAAAAAAAAAAAAAAAAA          ]
[-] EMBL AI395837             [                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                      CAGTCGGACCTCATGCAGTCACTACT GATCGTACCCCACTAAC GGGACCTGGGCCTATTTCTGATTCTATTCATCCTACTGATGAAAATAACTTGGAAGCTCGTTTAG AACGTCTCAAAGGAAAATCAAATCTTAATTCACTTATGGGTGCACGTCAGCTTTCAGTGCTCACATCTATATCACCTCATGTTTATATAAACA TA TTTCACAATCCAGCATAATAATGCTTTAAACTTAA TTGTCATCTAGATAATATT  TTTGGACTTTTTGTTTCCTCATCCTATCAAACTATTGCAATTAATTTTTAGAAAAATACTGTTTGGTGCTCTATGATGTAAATCTCTGCAGTTTACAATTTAAAAGTATTCTTAATAAAAGATTTTTGTTACTAAAAAAAAAAAAAAAAAAAAAAAAAAA]
[-] EMBL AI395620             [                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                         CGCTACT GATCCTA CCCAATAAC GGG CCTGG  CTAATTCTGATTCTATTGATCCTATTGATG AAATAACTTGGAAGCTCGTTTAG AACGTCTCAAAAGAAAATAAAATCTTAATTCACTTATGGGTGCACGTCAGCTTTCAGTTCTAACATCTATATCACCTCATGTTTATATAAACA TA TTTCACAATCCAGCATAATAATGCTTTAAACTTAA TTATCATATAGATAATATT  TTTGGACTTTTTGTTTCCTCATACTATCAAACTATTGCAAATAATTTTTAGAAAAATACTGTTTGGTGCTCTATGATGTAAATCTCTGCAGTTTACAATTTAAAAGTATTCTTAATAAAAGATTTTTGTTTCTTAAAAAAAAAAAAAAAAAAAAAAAAAA]
[-] EMBL CD167102             [                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                 C GGGACTTGGGCCTAATTCTGATTCTATTGATCCTATTGATGAAAATAACTTGGAAGCTCGTTTAG AACGTCCCCAAGGAAAATAAAATCTTAATTCACTTATGGGAGCACGTCAGCTTTCAGTTCTAAC                                                                                                                                                                                                                                                          ]


>consensus_11284#0 CGTAACTGTCGGGGCTACTTCCGTGAGGACGTTCTTCAATGAGTTTTCTTTTTGGAGCCA GGAAAACACCTGAAGAGCAGCTAAGAGATAGCAAACGAACTATTGCAAGAACACTTAGAG AGATAGAAAGAGAAAAAGGTCAGTTGGAGAGGGAACGCACTCGAATAACAAATGAAATTC GTATGTTGGCAAAGCGTGGTCAGATTGATGCCGTCAGAGTAATGGCGAAGCAGTTAGTTC GAACAGACAGTTACATCAAAAAGTTCTCCTTGATGCACTCAAATATTACAGCGTTGTCAA TGAAAATTCAGACTTTAAAATCAACTGCCACGATGGCTTCAGCTATGAAACAGGTTGCGC TAACAATGAGAAAAATGAATGCAACTATGCAGTTACCTCAGTTCCAAAAGGTCATGATGG AGTTTGAAAAACAAGCTGAAACGATGGAAATGAAACAGGATATGATGTCGGATGTGATAG ATGATGCTATTGGAGATCAGGATGACATTGAAGACTCTGAAGCTGTTGTAAACAAGGTTT TAGAAGAGCTTGGCATCGATCTTAATGCACAGTTGAGTAATCTCCCAACAGCTAAGGATA CGATTGGAAGTACAGTGCCAAGTGCAGTCCGACCTCATGCAGTCGCTACTGATCCTACCC CAATAACGGGACCTGGGCCTAATTCTGATTCTATTGATCCTATTGATGAAAATAACTTGG AAGCTCGTTTAGAACGTCTCAAAAGAAAATAAAATCTTAATTCACTTATGGGTGCACGTC AGCTTTCAGTTCTAACATCTATATCACCTCATGTTTATATAAACATATTTCACAATCCAG CATAATAATGCTTCAAACTTAATTATCATATAGATAATATTTTGGACTTTTTGTTTCCTC ATACTATCAAACTATTGCAAATAATTTTTAGAAAAATACTGTTTGGTGCTCTATGATGTA AATCTCTGCAGTTTACAATTTAAAAGTATTCTTAATAAAAGATTTTTGTTACTAAAAAAA AAAAAAAAAAAAAAAAAAAA



consensusID : consensus_11284#1
NCBI blastX ! send the sequence to the NCBI site !
NCBI blastN ! send the sequence to the NCBI site !
Sequences nbr = 2
consensus length = 611
fasta sequence
                              [GGAACGCACTCGAATAACAAATGAAATTCGTATGTTGGCAAAGCGTGGTCAGATTGATGCCGTCAGAGTAATGGCGAAGCAGTTAGTTCGAACAGACAGTTACATCAAAAAGTTTTCCTTGATGCACTCAAATATTACAGTTTGTCACGTTTTATCAGTCGTGTATTTTCTAATAATAGGCGTTGTCAATGAAAATTCAGACTTTAAAATCAACTGCCACGATGGCTTCAGCTATGAAACAGGTTGCGCTAACAATGAGAAAAATGAATACAACTATGCAGTTACCTCAGTTCCAAAAGGTCATGATGGAGTTTGAAAAACAAGCTGAAACGATGGAAATGAAACAGGATATGATGTCGGATGTGATAGATGATGCTATTGGAGATCAGGATGACATTGAAGACTCTGAAGCTGTTGTAAACAAGGTTAGTGCCGGTTTTTATTCGTAGTCTAATCATGCACTCCAAGCCGAGTCGACATATCCTAGAGATCGAACTCCAGCAAGTTCTAATCAGTTCGTAAGTAATTTGACCAAGATAACAAAATATTATACTGTGCAACGTCTGACCTCAAGTATTGTTCGTTTGACAACACCTTGTCATTCCCCGACT]

[+] EMBL CD170923             [GGAACGCACTCGAATAACAAATGAAATTCGTATGTTGGCAAAGCGTGGTCAGATTGATGCCGTCAGAGTAATGGCGAAGCAGTTAGTTCGAACAGACAGTTACATCAAAAAGTTTTCCTTGATGCACTCAAATATTACAGTTTGTCACGTTTTATCAGTCGTGTATTTTCTAATAATAGGCGTTGTCAATGAAAATTCAGACTTTAAAATCAACTGCCACGATGGCTTCAGCTATGAAACAGGTTGCGCTAACAATGAGAAAAATGAATACAACTATGCAGTTACCTCAGTTCCAAAAGGTCATGATGGAGTTTGAAAAACAAGCTGAAACGATGGAAATGAAACAGGATATGATGTCGG                                                                                                                                                                                                                                                           ]
[+] EMBL CD139846             [                                                                                                                                                                                                                                                                                                                 ATGGAGTTTGAAAAACAAGCTGAAACGATGGAAATGAAACAGGATATGATGTCGGATGTGATAGATGATGCTATTGGAGATCAGGATGACATTGAAGACTCTGAAGCTGTTGTAAACAAGGTTAGTGCCGGTTTTTATTCGTAGTCTAATCATGCACTCCAAGCCGAGTCGACATATCCTAGAGATCGAACTCCAGCAAGTTCTAATCAGTTCGTAAGTAATTTGACCAAGATAACAAAATATTATACTGTGCAACGTCTGACCTCAAGTATTGTTCGTTTGACAACACCTTGTCATTCCCCGACT]


>consensus_11284#1 GGAACGCACTCGAATAACAAATGAAATTCGTATGTTGGCAAAGCGTGGTCAGATTGATGC CGTCAGAGTAATGGCGAAGCAGTTAGTTCGAACAGACAGTTACATCAAAAAGTTTTCCTT GATGCACTCAAATATTACAGTTTGTCACGTTTTATCAGTCGTGTATTTTCTAATAATAGG CGTTGTCAATGAAAATTCAGACTTTAAAATCAACTGCCACGATGGCTTCAGCTATGAAAC AGGTTGCGCTAACAATGAGAAAAATGAATACAACTATGCAGTTACCTCAGTTCCAAAAGG TCATGATGGAGTTTGAAAAACAAGCTGAAACGATGGAAATGAAACAGGATATGATGTCGG ATGTGATAGATGATGCTATTGGAGATCAGGATGACATTGAAGACTCTGAAGCTGTTGTAA ACAAGGTTAGTGCCGGTTTTTATTCGTAGTCTAATCATGCACTCCAAGCCGAGTCGACAT ATCCTAGAGATCGAACTCCAGCAAGTTCTAATCAGTTCGTAAGTAATTTGACCAAGATAA CAAAATATTATACTGTGCAACGTCTGACCTCAAGTATTGTTCGTTTGACAACACCTTGTC ATTCCCCGACT



consensusID : consensus_11284#2
NCBI blastX ! send the sequence to the NCBI site !
NCBI blastN ! send the sequence to the NCBI site !
Sequences nbr = 1
consensus length = 601
fasta sequence
                              [CACGAGGCGAACTATTGCAAGAACACTTAGAGAGATAGAAAGAGAAAAAGGTCAGTTGGAGAGGGAACGCACTCGAATAACAAATGAAATTCGTATGTTGGCAAAGCGTGGTCAGNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNAAGCAGTTAGTTCGAACAGACAGTTACATCAAAAAGTTCTCCTTGATGCACTCAAATATTACAGCGTTGTCAATGAAAATTCAGACTTTAAAATCAACTGCCACGATGGCTTCAGCTATGAAACGAATGCAACTATGCAGTTACCTCAGTTCCAAAAGGTCATGATGGAGTTTGAAAAACAAGCTGAAACGATGGAAATGAAACAGGATATGATGTCGGATGTGATAGATGATGCTATTGGAGATCAGGATNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNTGTAAACAAGGTTTTAGAAGAGCTTGGCATCGATCTTAATGCACAGTTGAGTAATCTCCCAACAGCTAAGGATACGATTGGAAGTACAGTGCCAAGTGCAGTCCGACCTCATGCAGTCGCTACTGATCCTACCCCAATTTGATCCTATTGATGANAATAACTTGGAAGCTCGTTTAGAACGTCTCANA]

[+] EMBL CD081056             [CACGAGGCGAACTATTGCAAGAACACTTAGAGAGATAGAAAGAGAAAAAGGTCAGTTGGAGAGGGAACGCACTCGAATAACAAATGAAATTCGTATGTTGGCAAAGCGTGGTCAGNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNAAGCAGTTAGTTCGAACAGACAGTTACATCAAAAAGTTCTCCTTGATGCACTCAAATATTACAGCGTTGTCAATGAAAATTCAGACTTTAAAATCAACTGCCACGATGGCTTCAGCTATGAAACGAATGCAACTATGCAGTTACCTCAGTTCCAAAAGGTCATGATGGAGTTTGAAAAACAAGCTGAAACGATGGAAATGAAACAGGATATGATGTCGGATGTGATAGATGATGCTATTGGAGATCAGGATNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNTGTAAACAAGGTTTTAGAAGAGCTTGGCATCGATCTTAATGCACAGTTGAGTAATCTCCCAACAGCTAAGGATACGATTGGAAGTACAGTGCCAAGTGCAGTCCGACCTCATGCAGTCGCTACTGATCCTACCCCAATTTGATCCTATTGATGANAATAACTTGGAAGCTCGTTTAGAACGTCTCANA]


>consensus_11284#2 CACGAGGCGAACTATTGCAAGAACACTTAGAGAGATAGAAAGAGAAAAAGGTCAGTTGGA GAGGGAACGCACTCGAATAACAAATGAAATTCGTATGTTGGCAAAGCGTGGTCAGNNNNN NNNNNNNNNNNNNNNNNNNAAGCAGTTAGTTCGAACAGACAGTTACATCAAAAAGTTCTC CTTGATGCACTCAAATATTACAGCGTTGTCAATGAAAATTCAGACTTTAAAATCAACTGC CACGATGGCTTCAGCTATGAAACGAATGCAACTATGCAGTTACCTCAGTTCCAAAAGGTC ATGATGGAGTTTGAAAAACAAGCTGAAACGATGGAAATGAAACAGGATATGATGTCGGAT GTGATAGATGATGCTATTGGAGATCAGGATNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNTGTAAAC AAGGTTTTAGAAGAGCTTGGCATCGATCTTAATGCACAGTTGAGTAATCTCCCAACAGCT AAGGATACGATTGGAAGTACAGTGCCAAGTGCAGTCCGACCTCATGCAGTCGCTACTGAT CCTACCCCAATTTGATCCTATTGATGANAATAACTTGGAAGCTCGTTTAGAACGTCTCAN A



consensusID : consensus_11284#3
NCBI blastX ! send the sequence to the NCBI site !
NCBI blastN ! send the sequence to the NCBI site !
Sequences nbr = 1
consensus length = 285
fasta sequence
                              [ATGTGTGAGAACACGTATGGGTTCATGGCAGTGTTCAGTACTGACAAGCTATAACTCGTCATGTTTATATAAACTGATGTCCCAATCCAGCATAGTAATGCTGTAAACTGTAATTATCATATAGATAATAGTTGTGGACGGATTGTTCCCTCATACTATCAAGCTATTGCAAATAATTTTTAGAAAAATACTGTTTGGTGCTCTATGATGTAAATCTCTGCAGTACACAATTTAAAAGTATTCTTAGTAAAAGATTTGTGTTTCTAAAAAAAAATAAAATAAATA]

[-] EMBL AI395392             [ATGTGTGAGAACACGTATGGGTTCATGGCAGTGTTCAGTACTGACAAGCTATAACTCGTCATGTTTATATAAACTGATGTCCCAATCCAGCATAGTAATGCTGTAAACTGTAATTATCATATAGATAATAGTTGTGGACGGATTGTTCCCTCATACTATCAAGCTATTGCAAATAATTTTTAGAAAAATACTGTTTGGTGCTCTATGATGTAAATCTCTGCAGTACACAATTTAAAAGTATTCTTAGTAAAAGATTTGTGTTTCTAAAAAAAAATAAAATAAATA]


>consensus_11284#3 ATGTGTGAGAACACGTATGGGTTCATGGCAGTGTTCAGTACTGACAAGCTATAACTCGTC ATGTTTATATAAACTGATGTCCCAATCCAGCATAGTAATGCTGTAAACTGTAATTATCAT ATAGATAATAGTTGTGGACGGATTGTTCCCTCATACTATCAAGCTATTGCAAATAATTTT TAGAAAAATACTGTTTGGTGCTCTATGATGTAAATCTCTGCAGTACACAATTTAAAAGTA TTCTTAGTAAAAGATTTGTGTTTCTAAAAAAAAATAAAATAAATA



consensus multiple alignement with clustalw

CLUSTAL W (1.82) multiple sequence alignment


consensus_11284#0      CGTAACTGTCGGGGCTACTTCCGTGAGGACGTTCTTCAATGAGTTTTCTTTTTGGAGCCA 60
consensus_11284#3      ------------------------------------------------------------
consensus_11284#1      ------------------------------------------------------------
consensus_11284#2      ------------------------------------------------------------
                                                                                   

consensus_11284#0      GGAAAACACCTGAAGAGCAGCTAAGAGATAGCAAACGAACTATTGCAAGAACACTTAGAG 120
consensus_11284#3      ------------------------------------------------------------
consensus_11284#1      ------------------------------------------------------------
consensus_11284#2      ------------------------------------------------------------
                                                                                   

consensus_11284#0      AGATAGAAAGAGAAAAAGGTCAGTTGGAGAGGGAACGCACTCGAATAACAAATGAAATTC 180
consensus_11284#3      ------------------------------------------------------------
consensus_11284#1      ------------------------------------------------------------
consensus_11284#2      ------------------------------------------------------------
                                                                                   

consensus_11284#0      GTATGTTGGCAAAGCGTGGTCAGATTGATGCCGTCAGAGTAATGGCGAAGCAGTTAGTTC 240
consensus_11284#3      ------------------------------------------------------------
consensus_11284#1      ------------------------------------------------------------
consensus_11284#2      ------------------------------------------------------------
                                                                                   

consensus_11284#0      GAACAGACAGTTACATCAAAAAGTTCTCCTTGATGCACTCAAATATTACAGCGTTGTCAA 300
consensus_11284#3      ------------------------------------------------------------
consensus_11284#1      ------------------------------------------------------------
consensus_11284#2      ------------------------------------------------------------
                                                                                   

consensus_11284#0      TGAAAATTCAGACTTTAAAATCAACTGCCACGATGGCTTCAGCTATGAAACAGGTTGCGC 360
consensus_11284#3      ------------------------------------------------------------
consensus_11284#1      ------------------------------------------------------------
consensus_11284#2      ------------------------------------------------------------
                                                                                   

consensus_11284#0      TAACAATGAGAAAAATGAATGCAACTATGCAGTTACCTCAGTTCCAAAAGGTCATGATGG 420
consensus_11284#3      ------------------------------------------------------------
consensus_11284#1      ------------------------------------------------------------
consensus_11284#2      ------------------------------------------------------------
                                                                                   

consensus_11284#0      AGTTTGAAAAACAAGCTGAAACGATGGAAATGAAACAGGATATGATGTCGGATGTGATAG 480
consensus_11284#3      ------------------------------------------------------------
consensus_11284#1      ------------------------------------------------------------
consensus_11284#2      ------------------------------------------------------------
                                                                                   

consensus_11284#0      ATGATGCTATTGGAGATCAGGATGACATTGAAGACTCTGAAGCTGTTGTAAACAAGGTTT 540
consensus_11284#3      ------------------------------------------------------------
consensus_11284#1      ------------------------------------------------------------
consensus_11284#2      ------------------------------------------------------------
                                                                                   

consensus_11284#0      TAGAAGAGCTTGGCATCGATCTTAATGCACAGTTGAGTAATCTCCCAACAGCTAAGGATA 600
consensus_11284#3      ------------------------------------------------------------
consensus_11284#1      ------------------------------------------------------------
consensus_11284#2      ------------------------------------------------------------
                                                                                   

consensus_11284#0      CGATTGGAAGTACAGTGCCAAGTGCAGTCCGACCTCATGCAGTCGCTACTGATCCTACCC 660
consensus_11284#3      ------------------------------------------------------------
consensus_11284#1      ------------------------------------------------------------
consensus_11284#2      ------------------------------------------------------------
                                                                                   

consensus_11284#0      CAATAACGGGACCTGGGCCTAATTCTGATTCTATTGATCCTATTGATGAAAATAACTTGG 720
consensus_11284#3      ------------------------------------------------------------
consensus_11284#1      ------------------------------------------------------------
consensus_11284#2      ------------CACGAGGCGAACTATTGCAAGAACACTTAGAGAGATAGAAAGAGAAAA 48
                                                                                   

consensus_11284#0      AAGCTCGTTTAGAACGTCTCAAAAGAAAATAAAATCTTAATT-CACTTATGGGTGCACGT 779
consensus_11284#3      -------------------------------ATGTGTGAGAA-CACGTATGGGTTCATGG 28
consensus_11284#1      ---------------GGAACGCACTCGAATAACAAATGAAATTCGTATGTTGGCAAAGCG 45
consensus_11284#2      AGGTCAGTTGGAGAGGGAACGCACTCGAATAACAAATGAAATTCGTATGTTGGCAAAGCG 108
                                                      *    * *    *   * * **   *   

consensus_11284#0      CAGC--TTTCAGTTCTAACAT-CTATATCACCTCATGTTTATATAAACATATTTCACAAT 836
consensus_11284#3      CAGT--GTTCAGTACTGACAAGCTATAACTCGTCATGTTTATATAAACTGATGTCCCAAT 86
consensus_11284#1      TGGTCAGATTGATGCCGTCAGAGTAATGGCGAAGCAGTTAGTTCGAACAGACAGTTACAT 105
consensus_11284#2      TGGTCAGNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNAAGCAGTTAGTTCGAACAGACAGTTACAT 168
                         *                                 ***  *   ***  *       **

consensus_11284#0      CCAGCATAATAATGCTTCAAACT-TAATTATCATA--TAGATAATATTT-TGGACTTTTT 892
consensus_11284#3      CCAGCATAGTAATGCTGTAAACTGTAATTATCATA--TAGATAATAGTTGTGGACGGATT 144
consensus_11284#1      CAAAAAGTTTTCCTTGATGCACT-CAAATATTACAGTTTGTCACGTTTTATCAGTCGTGT 164
consensus_11284#2      CAAAAAGTTCTCCTTGATGCACT-CAAATATTACAG------------------------ 203
                       * *  *              ***  ** *** * *                         

consensus_11284#0      GTTTCCTCATACTA--TCAAACTATTGCAAAT--AATTTTTAGAAAAATACTGTT-TGGT 947
consensus_11284#3      GTTCCCTCATACTA--TCAAGCTATTGCAAAT--AATTTTTAGAAAAATACTGTT-TGGT 199
consensus_11284#1      ATTTTCTAATAATAGGCGTTGTCAATGAAAATTCAGACTTTAAAATCA-ACTGCCACGAT 223
consensus_11284#2      ----------------CGTTGTCAATGAAAATTCAGACTTTAAAATCA-ACTGCCACGAT 246
                                              * ** ****  *   **** **  * ****    * *

consensus_11284#0      GCTCTATGATGTAAATCT--CTGCA-----------------GTTTACAATTTAAAAGTA 988
consensus_11284#3      GCTCTATGATGTAAATCT--CTGCA-----------------GTACACAATTTAAAAGTA 240
consensus_11284#1      GGCTTCAGCTATGAAACAGGTTGCGCTAACAATGAGAAAAATGAATACAACTATGCAGTT 283
consensus_11284#2      GGCTTCAGCTATGAAAC-------------------------GAATGCAACTATGCAGTT 281
                       *   *  * * * ** *                         *    *** *    *** 

consensus_11284#0      TTCTTAAT---AAAAGAT-----TTTTGTTACTAAAAAAAAAAAAAAAAAAAAAAAAAAA 1040
consensus_11284#3      TTCTTAGT---AAAAGAT-----TTGTGTTTCTAAAAAAAAATAAAATAAATA------- 285
consensus_11284#1      ACCTCAGTTCCAAAAGGTCATGATGGAGTTTGAAAAACAAGCTGAAACGATGGAAATGAA 343
consensus_11284#2      ACCTCAGTTCCAAAAGGTCATGATGGAGTTTGAAAAACAAGCTGAAACGATGGAAATGAA 341
                         ** * *   ***** *     *   ***   **** **    ***  *          

consensus_11284#0      ------------------------------------------------------------
consensus_11284#3      ------------------------------------------------------------
consensus_11284#1      ACAGGATATGATGTCGGATGTGATAGATGATGCTATTGGAGATCAGGATGACATTGAAGA 403
consensus_11284#2      ACAGGATATGATGTCGGATGTGATAGATGATGCTATTGGAGATCAGGATNNNNNNNNNNN 401
                                                                                   

consensus_11284#0      ------------------------------------------------------------
consensus_11284#3      ------------------------------------------------------------
consensus_11284#1      CTCTGAAGCTGTTGTAAACAAGGTT------------AGTGCCGGTTTTTATTCGTAGTC 451
consensus_11284#2      NNNNNNNNNNNNTGTAAACAAGGTTTTAGAAGAGCTTGGCATCGATCTTAATGCACAGTT 461
                                                                                   

consensus_11284#0      ------------------------------------------------------------
consensus_11284#3      ------------------------------------------------------------
consensus_11284#1      TAATCATGCACTCCAAGCCGAGT---CGACATATCCTAGAGATCGAACTCCAGCAAGTTC 508
consensus_11284#2      GAGTAATCTCCCAACAGCTAAGGATACGATTGGAAGTACAGTGCCAAGTGCAGTCCGACC 521
                                                                                   

consensus_11284#0      ------------------------------------------------------------
consensus_11284#3      ------------------------------------------------------------
consensus_11284#1      TAATCAGTTCGTAAGTAATTTGACCAAGATAACAAAATATTATACTGTGCAACGTCTGAC 568
consensus_11284#2      TCATGCAGTCGCTACTGATCCTACCCCAATTTGATCCTATTGATGANAATAACTTGGAAG 581
                                                                                   

consensus_11284#0      -------------------------------------------
consensus_11284#3      -------------------------------------------
consensus_11284#1      CTCAAGTATTGTTCGTTTGACAACACCTTGTCATTCCCCGACT 611
consensus_11284#2      CTC--GTTTAGAACGTCTCANA--------------------- 601
                                                                  




Copyright Thu Nov 6 12:32:27 CET 2003 Hubert Wassner    (hubert.wassner@noos.fr)