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consensusID : consensus_11365#0 NCBI blastX ! send the sequence to the NCBI site ! NCBI blastN ! send the sequence to the NCBI site ! Sequences nbr = 55 consensus length = 979 fasta sequence
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[-] EMBL CD158234 [ ATTATTT GAATTCCTGCTCATGGTTGCACCGTTTTGTAAAACTCCTATTGAAGCAACACTAGTCGGGGTTTCGAATGTTCCTTATG ATCCGTCTGTAGACATGATCGTACATTCGTGGTTACCTATCTACCGCAGCTCTATTGGTTTAAGTGCTGGCGCCTCAAC AAAAATCGATATTC AG AAACGTGGTGTATATCCTGGTGGCGGGGGTGAAGTGTTGTTTTCTTCCAGGCCTTGTAGTGGAGTTGTTCCT ATTGAAAAGATTGTTGTTGGAAAAGTTTATAGAG TTCGTGGTATTTC ATGGAGCTGT CGTGTTAGCTC CTCGTACGGA CAATCC TTAGTGTCTGGTGC AAAATCGGTTCTC AATCAA TTTCT AAGTGATGTAT ]
[-] EMBL CD113376 [ TGGCTGCACCGTTTTGTAAAACTCCTATTGAAGCAACACTAGTCGGGGTTTCGAATGTTCCTTATG ATCCGTCTGTAGACATGATCGTACATTCGTGGTTACCTATCTACCGCAGCTCTATTGGTTTAAGTGCTGGCGCCTCAAC AAAAATCGATATTC AG AAACGTGGTGTATATCCTGGTGGCGGGGGTGAAGTGTTGTTTTCTTCCAGGCCTTGTAGTGGAGTTGTTCCT ATTGACAAGATTGATGTTGGAAAAGCTTATAGAG TTCGTGGTATTTC ATGGAGCTGT CGTGTTAGCTC CTCGTACGGC CAATCC TTAGTGTCTGGTGC AAAATCGGTTTTC AATCAA TTTNTGAAGTGATGTATACTTTACAATCGATCATCGCAAGGGTCAATAAGCAGCGCAAAAGCCCTGGATTTG ]
[-] EMBL CD177971 [ ACACTAGTCGGGGTTTCGAATGTTCCTTATG ATCCGTCTGTAGACATGATCGTACATTCGTGGTTACCTATCTACCGCAGCTCTATTGGTTTAAGTGCTGGCGCCTCAAC AAAAATCGATATTC AG AAACGTGGTGTATATCCTGGTGGCGGGGGTGAAGTGTTGTTTTCTTCCAGGCCTTGTAGTGGAGTTGTTCCT ATTGACAAGATTGATGTTGGAAAAGTTTATAGAG TTCGTGGTATTTC ATGGAGCTGT CGTGTTAGCTC CTCGTACGGA CAATCC TTAGTGTCTGGTGC AAAATCGGTTCTC AATCAA TTTCT AAGTGATGTATACTTTACAATCGATCATCGAAAGGGTCAATATGCAG GCAAAAGCCCTGGATTTGGTCTGACTCTGTGGGCGGAACGTAAAGACGGTGGTGTTTATTCTGCAGAAGCAATGTCGGAACCTGAAGGGAGTGATAATGTTTTTATGGATGCGGAAACCATAGGAAAATTAGCAGCACACCGACTATTAGAT]
[-] EMBL CD144451 [ CATGATCGTACATTCGTGGTTACCTATCTTCCGCAGCTCTATTGGTTTAAGTGCTGGCGCCTCAAC AAAAATCGATATTC AG AAACGTGGTGTAT ]
[-] EMBL CD136025 [ TGGTTACCTATCTACCGCAGCTCTATTGGTTTAAGTGCTGGCGCCTCAAC AAAAATCGATATTC AG AAACGTGGTGTATATCCTGGTGGCGGGGGTGAAGTGTTGTTTTCTTCCAGGCCTTGTAGTGGAGTTGTTCCT ATTGACAAGATTGATGTTGGAAAAGTTTATAGAG TTCGTGGTATTTC ATGGAGCTGT CGTATTAGCTC CTCGTACGGA CAATCC TTAGTGTCTGGTGC AAAATCGGTTCTC AATCAA TTTCT AAGTGATGTAT ]
[-] EMBL CD113385 [ TTGGTTTAAGTGGTGGCGCCTCAAC AAAAATCGATATTC AG AAACGTGGTGTATATCCTGGTGGCGGGGGTGAAGTGTTGTTTTCTTCCAGGCCTTGTAGTGGAGTTGTTCCT ATTGACAAGATTGATGTTGCAAAAGTTTATAGAG TTCGTGGTATTTC ATGGAGCTGT CGTGTTAGCTC CTCGTACGGA CAAT ]
[-] EMBL CD136091 [ AAATCGATATTC AG AAACGTGGTGTATATCCTGGTGGCGGGGGTGAAGTGTTGTTTTCTTCCAGGCCTTGTAGTGGAGTTGTTCCT ATTGACAAGATTGATGTTGGAAAAGTTTATAGAGCTTCGTGGTATCTCTATGGAGCTGTNCGTGTTAGCTCTCTCGTACGGACCAGTCCGTTAGTGTCTGGTGC AAAATCGGTTCTC AATCAA TTTCT AAGTGATGTAT ]
[+] EMBL CD193475 [ ACGTGGTGTATATCCTGGTGGCGGGGGTGAAGTGTTGTTTTCTTCCAGGCCTTGTAGTGGAGTTGTTCCT ATTGACAAGATTGATGTTGGAAAAGTTTATAGAG TTCGTGGTATTTC ATGGAGCTGT CGTGTTAGCTC CTCGTACGGA CAATCC TTAGTGTCTGGTGC AAAATCGGTTCTC AATCAA TTTCT AAGTGATGTA ]
[-] EMBL CD193433 [ CGTGGTGTATATCCTGGTGGCGGGGGTGAAGTGTTGTTTTCTTCCAGGCCTTGTAGTGGAGTTGTTCCT ATTGACAAGATTGATGTTGGAAAAGTTTATAGAG TTCGTGGTATTTC ATGGAGCTGT CGTGTTAGCTC CTCGTACGGA CAATCC TTAGTGTCTGGTGC AAAATCGGTTCTC AATCAA TTTCT AAGTGATGTAT ]
[-] EMBL CD136127 [ GGCCTTGTAGTGGAGTTGTTCCT ATTGACAAGATTGATGTTGGAAAAGTTAATAGAG TTCGTGGTATTTC ATGGAGCTGT CGTGTTAGCTC CTCGTACGGA CAATCC TTAGTGTCTGGTGC AAAATCGGTTCTC AATCAACTTTCT AAGTGATGTATAat ]
consensusID : consensus_11365#1 NCBI blastX ! send the sequence to the NCBI site ! NCBI blastN ! send the sequence to the NCBI site ! Sequences nbr = 2 consensus length = 620 fasta sequence
[GGCCTCGAGGCTACGAATTCGGCACGAGGCGAATGTTCCTTATGATCCGTCTGTAGACATGATCGTACATTCGTGGTTACCTATCTACCGCAGCTCTATTGGTTTAAGTGCTGGCGCCTCAACAAAAATCGATATTCAGAAACGTGGTGTATATCCTGGTGGCGGGGGTGAAGTGTTGTTTTCTTCCAGGCCTTGTAGTGGAGTTGTTCCTATTGACAAGATTGATGTTGGAAAAGTTTATAGAGTTCGTGGTATTTCATGGAGCTGTCGTGTTAGCTCCTCGTACGGACAATCCTTAGTGTCTGGTGCAAAATCGGTTCTCAATCAATTTCTAAGTGATGTATACTTTACAATCGATCATCGAAAGGGTCAATATGCAGGCAAAAGCCCTGGATTTGGTCTGACTCTGTGGGCGGAACGTAAAGACGGTGGTGTTTATTCTGCAGAAGCAATGTCGGAACCTGAAGGGAGTGATAATGTTCTTATGGATGCGGAAACCATAGGAAAATTAGCAGCACACCGACTATTAGATCAGATTTACAGAGGGGGCTTCATTGATTCGGGAACCCAATCGTTGGCTTTCGTCCTGATGGCTTGTGAAAGTGGACGTAATGCTAGCC]
[+] EMBL CD084159 [GGCCTCGAGGCTACGAATTCGGCACGAGGCGAATGTTCCTTATGATCCGTCTGTAGACATGATCGTACATTCGTGGTTACCTATCTACCGCAGCTCTATTGGTTTAAGTGCTGGCGCCTCAACAAAAATCGATATTCAGAAACGTGGTGTATATCCTGGTGGCGGGGGTGAAGTGTTGTTTTCTTCCAGGCCTTGTAGTGGAGTTGTTCCTATTGACAAGATTGATGTTGGAAAAGTTTATAGAGTTCGTGGTATTTCATGGAGCTGTCGTGTTAGCTCCTCGTACGGACAATCCTTAGTGTCTGGTGCAAAATCGGTTCTCAATCAATTTCTAAGTGATGTATACTTTACAATCGATCATCGAAAGGGTCAATATGCAGGCAAAAGCCCTGGATTTGGTCTGACTCTGTGGGCGGAACGTAAAGACGGTGGTGTTTATTCTGCAGAAGCAATGTCGGAACCTGAAGGGAGTGATAATGTTCTTATGGATGCGGAAACCATAGGAAAATTAGCAGCACACCGACTATTAGATCAGATTTACAGAGGGGGCTTCA ]
[-] EMBL CD195934 [ tgGGAGCTGTCGTGTTAGCTCCTCGTACGGACAATCCTTAGTGTCTGGTGCAAAATCGGTTCTCAATCAATTTCTAAGTGATGTATACTTTACAATCGATCATCGAAAGGGTCAATATGCAGGCAAAAGCCCTGGATTTGGTCTGACTCTGTGGGCGGAACGTAAAGACGGTGGTGTTTATTCTGCAGAAGCAATGTCGGAACCTGAAGGGAGTGATAATGTTCTTATGGATGCGGAAACCATAGGAAAATTAGCAGCACACCGACTATTAGATCAGATTTACAGAGGGGGCTTCATTGATTCGGGAACCCAATCGTTGGCTTTCGTCCTGATGGCTTGTGAAAGTGGACGTAATGCTAGCC]
consensusID : consensus_11365#2 NCBI blastX ! send the sequence to the NCBI site ! NCBI blastN ! send the sequence to the NCBI site ! Sequences nbr = 1 consensus length = 368 fasta sequence
[TCCTTTGCACAGGACTCAAGGTCGTGGAGGCAGATTTGGTCTCATGGTTTCCACCATACTCCTGGAAGGGCATGGTAATTTTAGGGTGAAGATAGCGCTCAGTCTAATCAGCTGTAAAAAACTTGTTTTTTTTGTATTCGTCACAAAAACGATAGTCCAGGAGTCGATAATGCTGAGGTCTGCTTATTGAAGCTTGCCGACAAAATATCGAATGGGACAGCAATCAAAATTAACGATACAGGTACTATTGTGTCTGTTTCCCCGGGGACTCTGATTGGAGGCAGTTTCAGCCTCGAATGTTCAAATGATCGAGGTATCGGGTATTATTTGGAATTCCTGCTCATGGTTGCACCGTTTTGTAAAACTCC]
[+] EMBL CD113961 [TCCTTTGCACAGGACTCAAGGTCGTGGAGGCAGATTTGGTCTCATGGTTTCCACCATACTCCTGGAAGGGCATGGTAATTTTAGGGTGAAGATAGCGCTCAGTCTAATCAGCTGTAAAAAACTTGTTTTTTTTGTATTCGTCACAAAAACGATAGTCCAGGAGTCGATAATGCTGAGGTCTGCTTATTGAAGCTTGCCGACAAAATATCGAATGGGACAGCAATCAAAATTAACGATACAGGTACTATTGTGTCTGTTTCCCCGGGGACTCTGATTGGAGGCAGTTTCAGCCTCGAATGTTCAAATGATCGAGGTATCGGGTATTATTTGGAATTCCTGCTCATGGTTGCACCGTTTTGTAAAACTCC]
consensusID : consensus_11365#3 NCBI blastX ! send the sequence to the NCBI site ! NCBI blastN ! send the sequence to the NCBI site ! Sequences nbr = 1 consensus length = 323 fasta sequence
[AATGTCTTGTGAAACAGGATACATTGTAAAACTAGTTTGAAACATCCATGTCTGAATGTAAATTTAGCAAGCTCACTGTCTACTGGTTTGAATTAGATCAATCTCCCACGATGAATTAAATTTTTCAAATGCTTCTTAATTCACTCACTCAGAACGAATAATTTTTCAGAGTTCGTGGTATTTCATGGAGCTGTCGTGTTAGCTCCTCGTACGGACAATCCTTAGTGTCTGGTGCAAAATCGGTTCTCAATCAATTTCTAAGTGATGTATACTTTACAATCGATCATCGAAAGGGTCAATATGCAGGCAAAAGCCCTGGATTT]
[-] EMBL CD181075 [AATGTCTTGTGAAACAGGATACATTGTAAAACTAGTTTGAAACATCCATGTCTGAATGTAAATTTAGCAAGCTCACTGTCTACTGGTTTGAATTAGATCAATCTCCCACGATGAATTAAATTTTTCAAATGCTTCTTAATTCACTCACTCAGAACGAATAATTTTTCAGAGTTCGTGGTATTTCATGGAGCTGTCGTGTTAGCTCCTCGTACGGACAATCCTTAGTGTCTGGTGCAAAATCGGTTCTCAATCAATTTCTAAGTGATGTATACTTTACAATCGATCATCGAAAGGGTCAATATGCAGGCAAAAGCCCTGGATTT]
consensus multiple alignement with clustalw CLUSTAL W (1.82) multiple sequence alignment
consensus_11365#1 ----------------------------------------------------GGCCTCGA 8
consensus_11365#3 ------------------------------------------------------------
consensus_11365#0 ATTGTCCGTACGCGGAGCTAACACGACAGCTCCATGAAATACCACGAACTCTATAAACTT 60
consensus_11365#2 ------------------------------------------------------------
consensus_11365#1 GGCTACGAATTCGGCACGAGGCGAATGTTCCTTATGATCCGTCTGTAGACATGATCGTAC 68
consensus_11365#3 -----------------------------------------------------AATGT-- 5
consensus_11365#0 TTCCAACATCAATCTTGTCAATAGGAACAAATCCACTCAAGGTCGTGGAGGCAGATTTGG 120
consensus_11365#2 ------------TCCTTTGCACAGGA---------CTCAAGGTCGTGGAGGCAGATTTGG 39
*
consensus_11365#1 ATTCGTGGTTACCTATCTACC----GCAGCTC-TATTGGTTTAAGTGCTGGCGC----CT 119
consensus_11365#3 -CTTGTGAAACAGGATACATT----GTAAAAC-TAGT--TTGAAACATCCATGT----CT 53
consensus_11365#0 TCTCATGGTTTCCACCATACTCCTGGAAGGGCATGGTAATTTTAGGGTGAAGATAGCGCT 180
consensus_11365#2 TCTCATGGTTTCCACCATACTCCTGGAAGGGCATGGTAATTTTAGGGTGAAGATAGCGCT 99
* ** * * * * * * ** * **
consensus_11365#1 CAACAAAAATCGATATTCAGAAACGTGGTGTATATCCTGGTGGCGGGGGTGAAGTGTTGT 179
consensus_11365#3 GAATGTAAAT-----TTAGCAAGCTCACTGTCTA--CTGGT--TTGAATTAGATCAATCT 104
consensus_11365#0 CAGTCTAA-TCAGCTGTAAAAAACTTGTTTTAAAACGTATT--CGTCACAAAAACGATAG 237
consensus_11365#2 CAGTCTAA-TCAGCTGTAAAAAACTTGTTTTTTT-TGTATT--CGTCACAAAAACGATAG 155
* ** * * ** * * * * * * *
consensus_11365#1 TTTCTTCCAGGCCTTGTAGTGGAGTTGTTCCT--A------TTGACAAGATTGATGTTGG 231
consensus_11365#3 CCCACGATGAATTAAATTTTTCAAATGCTTCTTAA------TTCACTC-ACTCAGAACGA 157
consensus_11365#0 TCCAGGAGTCGATAATGCTGAGGTCTGCTTATTGAAGCTTGCCGACAAAATATCGAATGG 297
consensus_11365#2 TCCAGGAGTCGATAATGCTGAGGTCTGCTTATTGAAGCTTGCCGACAAAATATCGAATGG 215
** * * * ** * *
consensus_11365#1 AAAAGTTTATAGAGTTCGTGGTATTTCATGGAGCTGTCGTGTTAGCTCCTCGTACGGACA 291
consensus_11365#3 ATAATTTTTCAGAGTTCGTGGTATTTCATGGAGCTGTCGTGTTAGCTCCTCGTACGGACA 217
consensus_11365#0 GACAGCAATCAAAATTAACGATACA----GGTACTATTGTGTCTGTTTCCC-CGGGGACT 352
consensus_11365#2 GACAGCAATCAAAATTAACGATACA----GGTACTATTGTGTCTGTTTCCC-CGGGGACT 270
* * * ** * ** ** ** * **** * * * * ****
consensus_11365#1 ATCCTTAGTGTCTGGTGCAAAATCGGTT-CTCAATCAATTTCTAAGTGATGTATACTTTA 350
consensus_11365#3 ATCCTTAGTGTCTGGTGCAAAATCGGTT-CTCAATCAATTTCTAAGTGATGTATACTTTA 276
consensus_11365#0 CTGATTGGAGGCAGTTTCAGCCTCGAATGTTCAAATGATCGAGGTATCGGTTATTATTTG 412
consensus_11365#2 CTGATTGGAGGCAGTTTCAGCCTCGAATGTTCAAATGATCGAGGTATCGGGTATTATTTG 330
* ** * * * * * ** *** * **** ** * *** ***
consensus_11365#1 CAATCGATCATCGAAAGGGTCAATATGCAGGCAAAAGCCCTGGATTTGGTCTGACTCTGT 410
consensus_11365#3 CAATCGATCATCGAAAGGGTCAATATGCAGGCAAAAGCCCTGGATTT------------- 323
consensus_11365#0 GAATTCCTGCTC--ATGGTTGCACCGTTTTGTAAAACTCCTATTGAAGCAACACTAGTCG 470
consensus_11365#2 GAATTCCTGCTC--ATGGTTGCACCGTTTTGTAAAACTCC-------------------- 368
*** * ** * ** * * * **** **
consensus_11365#1 GGGCGGAACGTAAAGACGGTGGTGTTTATTCTGCAGAAGCAATGTCGGAACCTGAAGGGA 470
consensus_11365#3 ------------------------------------------------------------
consensus_11365#0 GGGTTTCGAATGTTCCTTATGATCCGTCTGTAGACATGATCGTACATTCGTGGTTACCTA 530
consensus_11365#2 ------------------------------------------------------------
consensus_11365#1 GTGATAATGTTCTTATGGATGCGGAAACCATAGGAAAATTAGCAGCACACCGACTATTAG 530
consensus_11365#3 ------------------------------------------------------------
consensus_11365#0 TCTACCGCAGCTCTATTGGTTTAAGTGCTGGCGCCTCAACAAAAATCGATATTCAGAAAC 590
consensus_11365#2 ------------------------------------------------------------
consensus_11365#1 ATCAGATTTACAGAGGGGGCTTCATTGATTCGGGAACCCAATCGTTGGCTTTCGTCCTGA 590
consensus_11365#3 ------------------------------------------------------------
consensus_11365#0 GTGGTGTATATCCTGGTGGCGGGGGTGAAGTGTTGTTTTCTTCCAGGCCTTGTAGTGGAG 650
consensus_11365#2 ------------------------------------------------------------
consensus_11365#1 TGGCTTGTGAAAGTGGACGTAATGCTAGCC------------------------------ 620
consensus_11365#3 ------------------------------------------------------------
consensus_11365#0 TTGTTCCTATTGACAAGATTGATGTTGGAAAAGTTTATAGAGTTCGTGGTATTTCATGGA 710
consensus_11365#2 ------------------------------------------------------------
consensus_11365#1 ------------------------------------------------------------
consensus_11365#3 ------------------------------------------------------------
consensus_11365#0 GCTGTCGTGTTAGCTCCTCGTACGGACAATCCTTAGTGTCTGGTGCAAAATCGGTTCTCA 770
consensus_11365#2 ------------------------------------------------------------
consensus_11365#1 ------------------------------------------------------------
consensus_11365#3 ------------------------------------------------------------
consensus_11365#0 ATCAATTTCTAAGTGATGTATACTTTACAATCGATCATCGCAAGGGTCAATAAGCAGGCA 830
consensus_11365#2 ------------------------------------------------------------
consensus_11365#1 ------------------------------------------------------------
consensus_11365#3 ------------------------------------------------------------
consensus_11365#0 AAAGCCCTGGATTTGGTCTGACTCTGTGGGCGGAACGTAAAGACGGTGGTGTTTATTCTG 890
consensus_11365#2 ------------------------------------------------------------
consensus_11365#1 ------------------------------------------------------------
consensus_11365#3 ------------------------------------------------------------
consensus_11365#0 CAGAAGCAATGTCGGAACCTGAAGGGAGTGATAATGTTTTTATGGATGCGGAAACCATAG 950
consensus_11365#2 ------------------------------------------------------------
consensus_11365#1 -----------------------------
consensus_11365#3 -----------------------------
consensus_11365#0 GAAAATTAGCAGCACACCGACTATTAGAT 979
consensus_11365#2 -----------------------------
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| Copyright Thu Nov 6 12:32:27 CET 2003 Hubert Wassner (hubert.wassner@noos.fr) | ||||