These datas are free for academic use only, please contact me for any other use. Schistosoma mansoni see consensus multiple alignment with clustalw Direct access to contigs :
consensusID : consensus_11450#0 NCBI blastX ! send the sequence to the NCBI site ! NCBI blastN ! send the sequence to the NCBI site ! Sequences nbr = 71 consensus length = 1347 fasta sequence 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NCBI blastN ! send the sequence to the NCBI site ! Sequences nbr = 1 consensus length = 131 fasta sequence [AATCAACTTTATCAATTATGAGGCCAATACGACTTGGAAAGCCGCCCCTACTACAAGATTTAGGACAGTTTCTGATATTCGTAGGATGTTAGGTGCACTTCCAGATCCAAATGGGAACAAGGGTACCGGGC] [-] EMBL CD168888 [AATCAACTTTATCAATTATGAGGCCAATACGACTTGGAAAGCCGCCCCTACTACAAGATTTAGGACAGTTTCTGATATTCGTAGGATGTTAGGTGCACTTCCAGATCCAAATGGGAACAAGGGTACCGGGC] consensus multiple alignement with clustalw CLUSTAL W (1.82) multiple sequence alignment consensus_11450#0 TCGGCACTACAGTTGTTACTTATTACAACTTTACATAATCATTTTACTGAGTTATGGGAC 60 consensus_11450#1 ------------------------------------------------------------ consensus_11450#2 ------------------------------------------------------------ consensus_11450#0 TTTAAATGAAATTGATGCTAGACGACATAAACGTATGTACCAACCTCTCTCAATGGAACT 120 consensus_11450#1 ------------------------------------------------------------ consensus_11450#2 ------------------------------------------------------------ consensus_11450#0 AATCAACTTTATCAATTATGAGGCCAATACGACTTGGAAAGCCGCCCCTACTACAAGATT 180 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ACACGTTAGTGGTGCCCTACTTGGTGGACATGCGGNGCGTTTACTTGGTTGGGGTGAAGA 121 consensus_11450#2 ------------------------------------------------------------ consensus_11450#0 GAATAATGTACCCTACTGGTTAATTGCGAATTCATGGAATAGTGATTGGGGTGATAAAGG 960 consensus_11450#1 GAATAATGTNCCCTACTGGTTAATTGCGAATTCATGGAATAGTGATTGGGGTGATAAAGG 181 consensus_11450#2 ------------------------------------------------------------ consensus_11450#0 TTATTTTAAAATAGTTCGTGGTAAAAATGAATGCGGGATTGAAAGTGATGTCAATGCTGG 1020 consensus_11450#1 TTATTTTAAAATAGTTCGTGGTAAAAATGAATGCGGGATTGAAAGTGATGTCAATGCTGG 241 consensus_11450#2 ---AATCAACTTTATCAATTATGAGGCC-AATACGACTTGGAAAGC--CGCCCCTACTAC 54 * ** * * * * * *** ** * ***** * * * ** consensus_11450#0 AATACCAAAAATAAAAAACTAGACATTTCGGTAAAATATT---TTTATTTG-TACATCTA 1076 consensus_11450#1 AATACCAAAAATAAAAAACTAGACATTTCGGTAAAATATT---TTTATTTGGTACATCTA 298 consensus_11450#2 AAGATTTAGGACAGTT--TCTGATATTC--GTAGGATGTTAGGTGCACTTC-CAGATCCA 109 ** * * * * ** *** *** ** ** * * ** * *** * consensus_11450#0 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Copyright Thu Nov 6 12:32:27 CET 2003 Hubert Wassner (hubert.wassner@noos.fr) | ||||