These datas are free for academic use only, please contact me for any other use. Schistosoma mansoni see consensus multiple alignment with clustalw Direct access to contigs :
consensusID : consensus_11508#0 NCBI blastX ! send the sequence to the NCBI site ! NCBI blastN ! send the sequence to the NCBI site ! Sequences nbr = 8 consensus length = 405 fasta sequence [GTCACCTGGATCTTCAATGGCTAGAGTGCTCACTCTGAAGTATTTGCCACACGCAGTCCCAAGATCGCGGTTGGTTCCGTTGTAGTGATGAACTCCAGTTTTTGACAACATCGCATAGTATTCTATTTCAGTTTTCCTAAACATGATTTAATAACATACTCCGTTAATAATATCTAACTAATAGAAATATTATCTTATGTCTTCGTAACCCTTACTGGGCTCAGACAGAAGCAAACCAACATACCTTAACGGCGGAGCATTGTTGGCAATGATTATCAATCTTGCTCCACCTTTGCGTAAAAGACGAAGTGTTTGCCGTAATCCAATAGAACATTTCCCACTTTTCATCACCAGAGCTAAGCAACTATTAATGGATTCCAAAGCTTTAGCTTTTTTACATCCAGT] [+] EMBL CD093142 [GTCACCTGGATCTTCAATGGCTAGAGTGCTCACTCTGAAGTATTTGCCACACGCAGTCCCAAGATCGCGGTTGGTTCCGTTGTAGTGATGAACTCCAGTTTTTGACAACATCGCATAGTATTCTATTTCAGTTTTCCTAAACATGATTTAATAACATACTCCGTTAATAATATCTAACTAATAGAAATATTATCTTATGTCTTCGTAACCCTTACTGGGCTCAGACAGAAGCAAACCAACATACCTTAACGGCGGAGCATTGTTGGCAATGATTATCAATCTTGCTCCACCTTTGCGTAAAAGACGAAGTGTTTGCCGTAATCCAATAGAACATTTCCCACTTTTCATCACCAGAGCTAAGCAACTATTAATGGATTCCAAAGCTTTA ] [+] EMBL CD093334 [ CTTCAATGGCTAGAGTGCTCACTCTGAAGTATTTGCCACACGCAGTCCCAAGATCGCGGTTGGTTCCGTTGTAGTGATGAACTCCAGTTTTTGACAACATCGCATAGTATTCTATTTCAGTTTTCCTAAACATGATTTAATAACATACTCCGTTGATAATATCTAACTAATAGAAATATTATCTTATGTCTTCGTAACCCTTACTGGGCTCAGACAGAAGCAAACCAACATACCTTAACGGCGGAGCATTGTTGGCAATGATTATCAATCTTGCTCCACCTTTGCGTAAAAGACGAAGTGTTTGCCGTAATCCAATAGAACATTTCCCACTTTTCATCACCAGAGCTAAGCAACTATTAATGGATTCCAAAGCTTTA ] [+] EMBL CD093206 [ CTAGAGTGCTCACTCTGAAGTATTTGCCACACGCAGTCCCAAGATCGCGGTTGGTTCCGTTGTAGTGATGAACTCCAGTTTTTGACAACATCGCATAGTATTCTATTTCAGTTTTCCTAAACATGATTTAATAACATACTCCGTTAATAATATCTAACTAATAGAAATATTATCTTATGTCTTCGTAACCCTTACTGGGCTCAGACAGAAGCAAACCAACATACCTTAACGGCGGAGCATTGTTGGCAATGATTATCAATCTTGCTCCACCTTTGCGTAAAAGACGAAGTGTTTGCCGTAATCCAATAGAACATTTCCCACTTTTCATCACCAGAGCTAAGCAACTATTAATGGATTCCAAAGCTTTA ] [+] EMBL CD093247 [ CTAGAGTGCTCACTCTGAAGTATTTGCCACACGCAGTCCCAAGATCGCGGTTGGTCCCGTTGTAGTGATGAACTCCAGTTTTTGACAACATCGCATAGTATTCTATTTCAGTTTTCCTAAACATGATTTAATAACATACTCCGTTAATAATATCTAACTAATAGAAATATTATCTTATGTCTTCGTAACCCTTACTGGGCTCAGACAGAAGCAAACCAACATACCTTAACGGCGGAGCATTGTTGGCAATGATTATCAATCTTGCTCCACCTTTGCGTAAAAGACGAAGTGTTTGCCGTAATCCAATAGAACATTTCCCACTTTTCATCACCAGAGCTAAGCAACTATTAATGGATTCCAAAGCTTTA ] [+] EMBL CD093155 [ CTAGAGTGCTCACTCTGAAGTATTTGCCACACGCAGTCCCAAGATCGCGGTTGGTTCCGTTGTAGTGATGAACTCCAGTTTTTGACAACATCGCTTAGTATTCTATTTCAGTTTTCCTAAACATGATTTAATAACATACTCCGTTAATAATATCTAACTAATAGAAATATTATCTTATGTCTTCGTAACCCTTACTGGGCTCAGACAGAAGCAAACCAACATACCTTAACGGCGGAGCATTGTTGGCAATGATTATCAATCTTGCTCCACCTTTGCGTAAAAGACGAAGTGTTTGCCGTAATCCAATAGAACATTTCCCACTTTTCATCACCAGAGCTAAGCAACTATTAATGGATTCCAAAGCTTTA ] [+] EMBL CD181924 [ CTAGAGTGCTCACTCTGAAGTATTTGCCACACGCAGTCCCAAGATCGCGGTTGGTTCCGTTGTAGTGATGAACTCCAGTTTTTGACAACATCGCATAGTATTCTATTTCAGTTTTCCTAAACATGATTTAATAACATACTCCGTTAATAATATCTAACTAATAGAAATATTATCTTATGTCTTCGTAACCCTTACTGGGCTCAGACAGAAGCAAACCAACATACCTTAACGGCGGAGCATTGTTGGCAATGATTATCAATCTTGCTCCACCTTTGCGTANAAGACGAAGTGTT ] [+] EMBL CD133267 [ CCACACGCAGCCCCAATATCGCGGGTGGCTCCGGTGTAGAGATGAACTCCAGTTTTTGACAACATCGCATAGTATTCTATTTCAGTTTTCCTAAACATGATTTAATAACATACTCCGTTAATAATATCTAACTAATAGAAATATTATCTTATGTCTTCGTAACCCTTATTGGGCTCAGACAGAAGCAAACCAACATACCTTAACGGCGGAGCATTGTTGGCAATGATTATCAATCTTGCTCCACCTTTGCGTAAAAGACGAAGTGTTTGCCGTAATCCAATAGAACATTTCCCACTTTTCATCACCAGAGCTAAGCAACTATTAATGGATTCCAAAGCTTTAGCTTTTTTACATCCAGT] [-] EMBL CD181966 [ ACATCGCATAGTATTCTATTTCAGTTTTCCTAAACATGATTTAATAACATACTCCGTTAATAATATCTAACTAATAGAAATATTATCTTATGTCTTCGTAACCCTTACTGGGCTCAGACAGAAGCAAACCAACATACCTTAACGGCGGAGCATTGTTGGCAATGATAATCAATCTTGCTCCACCTTTGCGTAAAAGACGAAGTGTTTGCCGTAATCCAATAGAACATTTCCCACTTTTCATCACCAGAGCTAAGCAACTATTAATGGATTCCAAAGCTTTAG ] consensusID : consensus_11508#1 NCBI blastX ! send the sequence to the NCBI site ! NCBI blastN ! send the sequence to the NCBI site ! Sequences nbr = 32 consensus length = 404 fasta sequence [AAAATGATTTATTGAGTTATTACCTTTGTCCCTNCCTCGTGTGGCGCAGAACGGATGATGTCGGAGTCACCTGGATCTTCAATGGCTAGAGTGCTCACTCTGAAGTATTTGCCACACGCAGTCCCAAGATCGCGGTTGGTTCC-GTTGTAGTGATGA-ACTCCAGTTTTTGACAACATCGCATAGTATTCTATTT-CAGTTTTCCTTAACGGCGGAGCA-TTGTTGGCAATGATTATCAATCTTGCTCCACCTTTGCGTAAAAGACGAAGTGTTTGCCGTAATCCAATAGAACATTTCCCACTTTTCATCACCAGAGCTAAGCAACTATTAATGGATTCCAAAGCTTTAGCTTTTTTACATCCAGTTGCTGACTTCGCAGTCGGAGCCATCTCAAGCGTGACAAATTA] [-] EMBL SM603 [AAAATGATTTATTGAGTTATTACCTTTGTCCCTNCCTCGTGTGGCGCAGAACGGATGATGTCGGAGTCACCTGGATCTTCAATGGCTAGAGTGCTCACTCTGAAGTATTTGCCACACGCAGTCCCAAGATCGCGGTTGGTTCC GTTGTAGTGATGA ACTCCAGTTTTTGACAACATCGCATAGTATTCTATTT CAGTTTTCCTTAACGGCGGAGCA TTGTTGNCAATGATTATCAATCTTGCTCCACCTTTGCGTAAAAGACGAAGTGTTTGCCGTAANCCAATAGAACATTTCCCACTTTTCATCACCAGAGCTAAGCAACTATTAATGGATTCC ] [+] EMBL SMAA25689 [ ATGATTTATTGAGTTATTA CTTTGTCCCTGCCTCGTGTGGCGCAGAACGGATGATGTCGGAGTCACCTGGATCTTCAATGGCTAGAGTGCTCACTCTGAAGTATTTGCCACACGCAGTCCCAAGATCGCGGTTGGTTCC 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NCBI blastN ! send the sequence to the NCBI site ! Sequences nbr = 5 consensus length = 282 fasta sequence [TAGAGTGCTCACTCTGAAGTATTTGCCACACGCAGTCCCAAGATCGCGGTTGGTTCCGTTGTAGTGATGAACTCCAGTTTTTGACAACATCGCATAGTATTCTATTTCAGTTTTCCTAAACATGATTTAATAACATACTTAACG-GCGGAGCATTGTTGGCAATGATTATCAATCTTGCTCCACC-TTTGCGTAAAAGACGAAGTGTTTGCCGTAATCCAATAGAACATTTCCCACTTTTCATCACCAGAGCTAAGCAACTATTAATGGATTCCAAAGCTTTAG] [-] EMBL CD164107 [TAGAGTGCTCACTCTGAAGTATTTGCCACACGCAGTCCCAAGATCGCGGTTGGTTCCGTTGTAGTGATGAACTCCAGTTTTTGACAACATCGCATAGTATTCTATTTCAGTTTTCCTAAACATGATTTAATAACATACTTAACG GCGGAGCATTGTTGGCAATGATTATCAATCTTGCTCCACC TTTGCGTAAAAGACGAAGTGTTTGCCGTAATCCAATAGAACATTTCCCACTTTTCATCACCAGAGCTAAGCAACTATTAATGGATTCCAAAGCTTTAG] [-] EMBL CD138447 [ nncTAACGCGGGGAGCATTGTGNGCAATGATTATCAATCTTGCTCCACC TTTGCGTAAAAGACGAAGTGTTTGCCGTAATCCAATAGAACATTTCCCACTTTTCATCACCAGAGCTAAGCAACTATTAATGGATTCCAAAGCTTTAG] [-] EMBL CD138520 [ AATC TGCTCCACCNNTTGCGTAAAAGACGAAGTGTCTGCCGTAATCCAATAGAACATTTCCCACTTTTCATCACCAGAGCTAAGCAACTATTAATGGATTCCAAAGCTTTAG] [-] EMBL CD138458 [ TGCTCCACC 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Copyright Thu Nov 6 12:32:27 CET 2003 Hubert Wassner (hubert.wassner@noos.fr) | ||||