Home
Who am I
Technology
EST Assembly
Contact

These datas are free for academic use only, please contact me for any other use.

Schistosoma mansoni
cluster # 1181 cluster # 1181       Sequences # 2       consensus # 1

see consensus multiple alignment with clustalw

Direct access to contigs :
consensus_1181#0 length = 479 sequences # 2  
consensusID : consensus_1181#0
NCBI blastX ! send the sequence to the NCBI site !
NCBI blastN ! send the sequence to the NCBI site !
Sequences nbr = 2
consensus length = 479
fasta sequence 
                              [ATATGGGATCATTGAGGTTATACCACGTATGTTCGAATTATAAAGAAATTATGATTTCTTACTTGTAATGTTTTGTAGTCATTTAACTTATGTATAAAATACTAAACGTTTACTGAATCCGAAGAACAATAGGGAGGACATAATAAATACAACAGTTTCCCCTTATTCTGATGACATTAAACATACTTTATTGTATTAAGTCTTAATTCTTTACAATCCTGAATTTAAATTCAGGCTGACTGACACCTAACTGATGTTAATTACTATAATCTTCAGGTATTTCATTTGAATCTTAACTTTATGAAATTAACCTACTACTTAATTTTGTGTAGGGTATTTGCCTACAGCGACTTCAGAGTTTTATGAAATTTATCTGAATCGCTATAGTACTAGGAGGACACATTTAATTTCGCCTAACTTTACTTGCTTGAGTATGTCAAACATCATTTGCAATTGTAATCTNTAAATATTATAGCCCG]

[+] EMBL CD140802             [ATATGGGATCATTGAGGTTATACCACGTATGTTCGAATTATAAAGAAATTATGATTTCTTACTTGTAATGTTTTGTAGTCATTTAACTTATGTATAAAATACTAAACGTTTACTGAATCCGAAGAACAATAGGGAGGACATAATAAATACAACAGTTTCCCCTTATTCTGATGACATTAAACATACTTTATTGTATTAAGTCTTAATTCTTTACAATCCTGAATTTAAATTCAGGCTGACTGACACCTAACTGATGTTAATTACTATAATCTTCAGGTATTTCATTTGAATCTTAACTTTATGAAATTAACCTACTACTTAATTTTGTGTAGGGTATTTGCCTACAGCGACTTCAGAGTTTTATGAAATTTATCTGAATCGCTATAGTACTAGGAGGACACATTTAATTTCGCCTAACTTTACTTGCTTGAGTATGTC                                         ]
[+] EMBL CD140777             [                     ACCACGTATGTTCGAATTATAAAGAAATTATGATTTCTTACTTGTAATGTTTTGTAGTCATTTAACTTATGTAT AAATACTAAACGTTTACTGAATCCGAAGAACAATAGGGAGGACATAATAAATACGACAGTTTCCCCTTATTCTGATGACATTAAACATACTTTATTGTATTAAGTCTTAATTCTTTACAATCCTGAATTTAAATTCAGGCTGACTGACACCTAACTGATGTTAATTACTATAATCTTCAGGTATTTCATTTGAATCTTAACTTTATGAAATTAACCTACTACTTAATTTTGTGTAGGGCATTTGCCTACAGCGACTTCAGAGTTTTATGAAATTTATTTGAATCGCTATAGTACTAGGAGGACACATTTAATTTCGCCTAACTTTACTTGCTTGAGTATGTCAAACATCATTTGCAATTGTAATCTNTAAATATTATAGCCCG]




>consensus_1181#0
ATATGGGATCATTGAGGTTATACCACGTATGTTCGAATTATAAAGAAATTATGATTTCTT
ACTTGTAATGTTTTGTAGTCATTTAACTTATGTATAAAATACTAAACGTTTACTGAATCC
GAAGAACAATAGGGAGGACATAATAAATACAACAGTTTCCCCTTATTCTGATGACATTAA
ACATACTTTATTGTATTAAGTCTTAATTCTTTACAATCCTGAATTTAAATTCAGGCTGAC
TGACACCTAACTGATGTTAATTACTATAATCTTCAGGTATTTCATTTGAATCTTAACTTT
ATGAAATTAACCTACTACTTAATTTTGTGTAGGGTATTTGCCTACAGCGACTTCAGAGTT
TTATGAAATTTATCTGAATCGCTATAGTACTAGGAGGACACATTTAATTTCGCCTAACTT
TACTTGCTTGAGTATGTCAAACATCATTTGCAATTGTAATCTNTAAATATTATAGCCCG

clustalw multiple alignements is not computed in this case
Copyright Thu Nov 6 12:32:27 CET 2003 Hubert Wassner    (hubert.wassner@noos.fr)