cluster # 1182

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Schistosoma mansoni
cluster # 1182 cluster # 1182 Sequences # 2 consensus # 1

see consensus multiple alignment with clustalw

Direct access to contigs :

consensus_1182#0 length = 796 sequences # 2

consensusID : consensus_1182#0
NCBI blastX ! send the sequence to the NCBI site !
NCBI blastN ! send the sequence to the NCBI site !
Sequences nbr = 2
consensus length = 796
fasta sequence

                              [TGTCCAGGAAAGTTCTGGTCATAGTGGTGACCGTCATCGTCATCATGATGATAATAATAACAATCATGATAATTTACACAACAAAGTTAATTCAAATTCAACTAACCATTTATATAACGACCAAGAGAATAAAAATGATTGTTCGAAAGTAGTGCCTGATGAAGTCAACACGATGTTTTCCACGAAATCATTCAATACGGCAGGGTCAAATCAATCGAATGAAGTTTATGTACTATCAGGGTTGACAGATCCACCTTATATTGCTGGTGGTGTTATTAGTGATGATACTCACCATAACAGTATTACTAATGATAGCGAAAAATCTATGGATTCCGATAATCCAACAATAGAGAAATCAGCGGATCCAATAAATGAAGATCATTTGAAGGAATTAATTGTCACAAATGAGCAAACGCGTCGACCTATTCACTATACAAGTTTACTATTTTTTCCACATATTCCATTCAATATATTCAAACGAGATTTAATCTCTGTACTTTCCACTTGTCCACATTTCTTACGCTTAGCTATCTTAGATCCTGTTATCATGCCGGATACAATGTCATCAATAACAGATGATCAAATATTCGGTAGGGTAAAAAATCCTATGCCTAAAATTTTACTAAAACGTATGGGATGGGCATCGTTTACTTCACAATACATAGATGATGTTAACAATAAGTGGATTAATATAGATTTAATCTCTATAAAAAGTAAATTAATTGGGCATGCGGTTGATCATGAAGCTTCAAGTGATTTAATTGAGTGTCTTCGTTTATCGCGACCAATTTTGGAT]

[-] EMBL CD059679             [TGTCCAGGAAAGTTCTGGTCATAGTGGTGACCGTCATCGTCATCATGATGATAATAATAACAATCATGATAATTTACACAACAAAGTTAATTCAAATTCAACTAACCATTTATATAACGACCAAGAGAATAAAAATGATTGTTCGAAAGTAGTGCCTGATGAAGTCAACACGATGTTTTCCACGAAATCATTCAATACGGCAGGGTCAAATCAATCGAATGAAGTTTATGTACTATCAGGGTTGACAGATCCACCTTATATTGCTGGTGGTGTTATTAGTGATGATACTCACCATAACAGTATTACTAATGATAGCGAAAAATCTATGGATTCCGATAATCCAACAATAGAGAAATCAGCGGATCCAATAAATGAAGATCATTTGAAGGAATTAATTGTCACAAAT                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                      ]
[+] EMBL CD126334             [                                                                                                                                                                                                                                 TTATGTACTATCAGGGTTGACAGATCCACCTTATATTGCTGGTGGTGTTATTAGTGATGATACTCACCATAACAGTATTACTAATGATAGCGAAAAATCTATGGATTCCGATAATCCAACAATAGAGAAATCAGCGGATCCAATAAATGAAGATCATTTGAAGGAATTAATTGTCACAAATGAGCAAACGCGTCGACCTATTCACTATACAAGTTTACTATTTTTTCCACATATTCCATTCAATATATTCAAACGAGATTTAATCTCTGTACTTTCCACTTGTCCACATTTCTTACGCTTAGCTATCTTAGATCCTGTTATCATGCCGGATACAATGTCATCAATAACAGATGATCAAATATTCGGTAGGGTAAAAAATCCTATGCCTAAAATTTTACTAAAACGTATGGGATGGGCATCGTTTACTTCACAATACATAGATGATGTTAACAATAAGTGGATTAATATAGATTTAATCTCTATAAAAAGTAAATTAATTGGGCATGCGGTTGATCATGAAGCTTCAAGTGATTTAATTGAGTGTCTTCGTTTATCGCGACCAATTTTGGAT]




>consensus_1182#0
TGTCCAGGAAAGTTCTGGTCATAGTGGTGACCGTCATCGTCATCATGATGATAATAATAA
CAATCATGATAATTTACACAACAAAGTTAATTCAAATTCAACTAACCATTTATATAACGA
CCAAGAGAATAAAAATGATTGTTCGAAAGTAGTGCCTGATGAAGTCAACACGATGTTTTC
CACGAAATCATTCAATACGGCAGGGTCAAATCAATCGAATGAAGTTTATGTACTATCAGG
GTTGACAGATCCACCTTATATTGCTGGTGGTGTTATTAGTGATGATACTCACCATAACAG
TATTACTAATGATAGCGAAAAATCTATGGATTCCGATAATCCAACAATAGAGAAATCAGC
GGATCCAATAAATGAAGATCATTTGAAGGAATTAATTGTCACAAATGAGCAAACGCGTCG
ACCTATTCACTATACAAGTTTACTATTTTTTCCACATATTCCATTCAATATATTCAAACG
AGATTTAATCTCTGTACTTTCCACTTGTCCACATTTCTTACGCTTAGCTATCTTAGATCC
TGTTATCATGCCGGATACAATGTCATCAATAACAGATGATCAAATATTCGGTAGGGTAAA
AAATCCTATGCCTAAAATTTTACTAAAACGTATGGGATGGGCATCGTTTACTTCACAATA
CATAGATGATGTTAACAATAAGTGGATTAATATAGATTTAATCTCTATAAAAAGTAAATT
AATTGGGCATGCGGTTGATCATGAAGCTTCAAGTGATTTAATTGAGTGTCTTCGTTTATC
GCGACCAATTTTGGAT

clustalw multiple alignements is not computed in this case