cluster # 1196

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Schistosoma mansoni
cluster # 1196 cluster # 1196 Sequences # 2 consensus # 1

see consensus multiple alignment with clustalw

Direct access to contigs :

consensus_1196#0 length = 787 sequences # 2

consensusID : consensus_1196#0
NCBI blastX ! send the sequence to the NCBI site !
NCBI blastN ! send the sequence to the NCBI site !
Sequences nbr = 2
consensus length = 787
fasta sequence

                              [TATGTATGTATCACAATGTATAATATACAACCTAAATAACAGAACAGCTGATACTTATAATATATCTGGAAAGATATTAGGCAACATGAACTGGAGTCAGTCAGAGACGTGGATGAATTTACTGTTTATCTTCTTTTGAATTCTAAGTTTTGATATTACCGTATATTTTTCTTTTTTTTCTTTTAAACGGTATCCATCATATTTAACTTACCAATCCAGTTGGAATTATAATTTCTACTCGTTTACTTTATGTCATATAGTATTATGTTCGTGTAAATGGTGAGGCTTTGGACAAACTCATATTTACGCCGTACTCTACGCCGTTTGCGACTATGATAATCCGGATGTACTCAAAGGAGTAGGATGTCTACTAGTAGGTTGATGGCTTTACTAACGAGAACATATCATAATACAAGTGTAATTTTCATTCCCAAAGGAAAGTGCTTACTTCCATTGTTAACCCATGTCCTCGAATAAAATATCCACCAAAAATAATTCGTGTAAGGCTATGCTGTTTAGCGTACAGACAAGCTAATTGGCCTATATTACTGTAAATATTAATCAAGAAAAATGTTAGTTAATATATATACATAACATAGTTTTAAGCATGAAAGATTTCGTTCTTCATGGAATCAGAACAAAATGAAGTTGGTGGGTTAAGAACAGATCTGAAACAACTGTTTAGGGCTCACTGGATATTAATAGTTTTCCATTTAAAATCAGTTTACGGTGAGAATTATCTTAGGACTGGGTGACTTTGTGGAAACCAAGATGGAGGACAGCCGCT]

[+] EMBL CD195393             [TATGTATGTATCACAATGTATAATATACAACCTAAATAACAGAACAGCTGATACTTATAATATATCTGGAAAGATATTAGGCAACATGAACTGGAGTCAGTCAGAGACGTGGATGAATTTACTGTTTATCTTCTTTTGAATTCTAAGTTTTGATATTACCGTATATTTTTCTTTTTTTTCTTTTAAACGGTATCCATCATATTTAACTTACCAATCCAGTTGGAATTATAATTTCTACTCGTTTACTTTATGTCATATAGTATTATGTTCGTGTAAATGGTGAGGCTTTGGACAAACTCATA                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                     ]
[+] EMBL CD076188             [                                                                                                                                                                                                 CCATCATATTTAACTTACCAATCCAGTTGGAATTATAATTTCTACTCGTTTACTTTATGTCATATAGTATTATGTTCGTGTAAATGGTGAGGCTTTGGACAAACTCATATTTACGCCGTACTCTACGCCGTTTGCGACTATGATAATCCGGATGTACTCAAAGGAGTAGGATGTCTACTAGTAGGTTGATGGCTTTACTAACGAGAACATATCATAATACAAGTGTAATTTTCATTCCCAAAGGAAAGTGCTTACTTCCATTGTTAACCCATGTCCTCGAATAAAATATCCACCAAAAATAATTCGTGTAAGGCTATGCTGTTTAGCGTACAGACAAGCTAATTGGCCTATATTACTGTAAATATTAATCAAGAAAAATGTTAGTTAATATATATACATAACATAGTTTTAAGCATGAAAGATTTCGTTCTTCATGGAATCAGAACAAAATGAAGTTGGTGGGTTAAGAACAGATCTGAAACAACTGTTTAGGGCTCACTGGATATTAATAGTTTTCCATTTAAAATCAGTTTACGGTGAGAATTATCTTAGGACTGGGTGACTTTGTGGAAACCAAGATGGAGGACAGCCGCT]




>consensus_1196#0
TATGTATGTATCACAATGTATAATATACAACCTAAATAACAGAACAGCTGATACTTATAA
TATATCTGGAAAGATATTAGGCAACATGAACTGGAGTCAGTCAGAGACGTGGATGAATTT
ACTGTTTATCTTCTTTTGAATTCTAAGTTTTGATATTACCGTATATTTTTCTTTTTTTTC
TTTTAAACGGTATCCATCATATTTAACTTACCAATCCAGTTGGAATTATAATTTCTACTC
GTTTACTTTATGTCATATAGTATTATGTTCGTGTAAATGGTGAGGCTTTGGACAAACTCA
TATTTACGCCGTACTCTACGCCGTTTGCGACTATGATAATCCGGATGTACTCAAAGGAGT
AGGATGTCTACTAGTAGGTTGATGGCTTTACTAACGAGAACATATCATAATACAAGTGTA
ATTTTCATTCCCAAAGGAAAGTGCTTACTTCCATTGTTAACCCATGTCCTCGAATAAAAT
ATCCACCAAAAATAATTCGTGTAAGGCTATGCTGTTTAGCGTACAGACAAGCTAATTGGC
CTATATTACTGTAAATATTAATCAAGAAAAATGTTAGTTAATATATATACATAACATAGT
TTTAAGCATGAAAGATTTCGTTCTTCATGGAATCAGAACAAAATGAAGTTGGTGGGTTAA
GAACAGATCTGAAACAACTGTTTAGGGCTCACTGGATATTAATAGTTTTCCATTTAAAAT
CAGTTTACGGTGAGAATTATCTTAGGACTGGGTGACTTTGTGGAAACCAAGATGGAGGAC
AGCCGCT

clustalw multiple alignements is not computed in this case