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Schistosoma mansoni
cluster # 1250 cluster # 1250       Sequences # 2       consensus # 1


see consensus multiple alignment with clustalw

Direct access to contigs :
consensus_1250#0 length = 532 sequences # 2  

consensusID : consensus_1250#0
NCBI blastX ! send the sequence to the NCBI site !
NCBI blastN ! send the sequence to the NCBI site !
Sequences nbr = 2
consensus length = 532
fasta sequence
                              [TCATCGAATTTATTATTTATGTCTTAACATTTTGAAAAAAAGAACAATTTCAGACTAGAAAAGAACAGAAACATTAAATAAATGACAAAAACACTAGATTGTCAAAATTTTACAATATTTATATCTTCTTAAGACTAACACTGAAAAATAGAAGTTTTTTTTTAATAAAGAAGCAATGGTTAACACGTATATTTGTGCTCAAAAAAAAAAGATCCGTCAATCCAATAAAGTCCTAAATATTTGAAGAAATATATTCAAAAGCAGCCTAACACAAATATGTTATAGTATGAATATGCAAGCCCCCCTTAATGTTTATTTCTTTCATTGACTGACTTGAGGGGTGGGCATATTGAACACTCAGTTAATAGTTAGCAAAACCTTTAACTGTAGTAATTATTATAATAAAATCAGTGAATATGTATATATTTAGAATAAAGATAAATTCAAAAATTTGCTATTTTTAANATTGGGTATTTGGGTAAATTATGAAGTAGTTGGCTTTAAGAAAAAAGTTTTCAACATAATATTATAT]

[+] EMBL AI977259             [TCATCGAATTTATTATTTATGTCTTAACATTTTGAAAAAAAGAACAATTTCAGACTAGAAAAGAACAGAAACATTAAATAAATGACAAAAACACTAGATTGTCAAAATTTTACAATATTTATATCTTCTTAAGACTAACACTGAAAAATAGAAGTTTTTTTTTAATAAAGAAGCAATGGTTAACACGTATATTTGTGCTCAAAAAAAAAAGATCCGTCAATCCAATAAAGTCCTAAATATTTGAAGAAATATATTCAAAAGCAGCCTAACACAAATATGTTATAGTATGAATATGCAAGCCCCCCTTAATGTTTATTTCTTTCATTGACTGACTTGAGGGGTGGGCATATTGAACACTCAGTTAATAGTTAGCAAAACCTTTAACTGTAGTAATTATTATAATAAAATCAGTGAATATGTATATATTTAGAATAAAGATAAATTCAAAAATTTGCTATTTTTAANATTGGGTATTTGGGTAAATTATGAAGTAGTTGGCTTTAAGAAAAAAGTTTTCAACATAATATTATAT]
[+] EMBL CD076319             [TCATCGAATTTATTATTTATGTCTTAACATTTTGAAAAAAAGAACAATTTCAGACTAGAAAAGAACAGAAACATTAAATAAATGACAAAAACCCTAGATGGGCAAAATTTTACAATATTTATATCTTCTTAAGACTAACACTGAAAAATAAAAGTTTTTTTTTAATAAAGAAGCAAGGGTTAACACGTATATTTGGGCTCAAAAAAAAAAGATCCGGCAATCCAATAAAGTCCTAAATATTTGAAAAAATATATTCAAAAGCAGCCTAACACAAATATGTTATAGTATGAATATGCAAGCCCCCCTTAAGGGTTATTTCTTTCATTGACTGACTTGGGGGGGGGGCATATTGAACACTCAGTTAATAGTTAGCAAAACCTTTAACTGGGGTAATTATTATAATAAAATCAGGGAATATGTATATATTTAAAATAAAGATAAATTCAAAAATTTGCTATTT                                                                        ]


>consensus_1250#0 TCATCGAATTTATTATTTATGTCTTAACATTTTGAAAAAAAGAACAATTTCAGACTAGAA AAGAACAGAAACATTAAATAAATGACAAAAACACTAGATTGTCAAAATTTTACAATATTT ATATCTTCTTAAGACTAACACTGAAAAATAGAAGTTTTTTTTTAATAAAGAAGCAATGGT TAACACGTATATTTGTGCTCAAAAAAAAAAGATCCGTCAATCCAATAAAGTCCTAAATAT TTGAAGAAATATATTCAAAAGCAGCCTAACACAAATATGTTATAGTATGAATATGCAAGC CCCCCTTAATGTTTATTTCTTTCATTGACTGACTTGAGGGGTGGGCATATTGAACACTCA GTTAATAGTTAGCAAAACCTTTAACTGTAGTAATTATTATAATAAAATCAGTGAATATGT ATATATTTAGAATAAAGATAAATTCAAAAATTTGCTATTTTTAANATTGGGTATTTGGGT AAATTATGAAGTAGTTGGCTTTAAGAAAAAAGTTTTCAACATAATATTATAT



clustalw multiple alignements is not computed in this case


Copyright Thu Nov 6 12:32:27 CET 2003 Hubert Wassner    (hubert.wassner@noos.fr)