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Schistosoma mansoni
cluster # 1277 cluster # 1277       Sequences # 2       consensus # 1


see consensus multiple alignment with clustalw

Direct access to contigs :
consensus_1277#0 length = 575 sequences # 2  

consensusID : consensus_1277#0
NCBI blastX ! send the sequence to the NCBI site !
NCBI blastN ! send the sequence to the NCBI site !
Sequences nbr = 2
consensus length = 575
fasta sequence
                              [AACAAGTATTTATTTATATAATTGTTTACATGTTAATAGGCACATTGATGATTAGCAATACTACTAATAATAATACTAATAGTCATAGCAACAAAGGTAGTAATAATAATTGTAATGATAATTATAGAAATTGGGATTAACAACCCGGAGAACAAAAACATAAAATGGATTTAAAATGGACAGACATACATCACATACTTGACAAATCAAAAATTGAGAAAAAAAATAGGCATAATTGGGTATGAAGTATACACTAGTTACTAAATAACCAGTAACTAAATCTAGATGTATTTGTCTATAGTAAAATCAAAAAGTAGACAAGTTAAATAAAACAGCAATTAAAACAGTTAATGTTAATAAATGAACTCTACCTACAGATGTAGATGAGCCGTATTTTTCAAGTATGTGTGTAAGAGAAATAAAGATTAAGAGACCTGTTGATAGTACTAAATTTATTTCAAGGCAAACAATAGCCTTATTGTCAGTATCAATGTCCACATGGCTAAAGAGGCACTGATAATTCATTCATTGATTTTCTT--AAGGAAAAATAGAGTTGTGTGCATGCAGTATTTATA]

[+] EMBL CD076388             [AACAAGTATTTATTTATATAATTGTTTACATGTTAATAGGCACATTGATGATTAGCAATACTACTAATAATAATACTAATAGTCATAGCAACAAAGGTAGTAATAATAATTGTAATGATAATTATAGAAATTGGGATTAACAACCCGGAGAACAAAAACATAAAATGGATTTAAAATGGACAGACATACATCACATACTTGACAAATCAAAAATTGAGAAAAAAAATAGGCATAATTGGGTATGAAGTATACACTAGTTACTAAATAACCAGTAACTAAATCTAGATGTATTTGTCTATAGTAAAATCAAAAAGTAGACAAGTTAAATAAAACAGCAATTAAAACAGTTAATGTTAATAAATGAACTCTACCTACAGATGTAGATGAGCCGTATTTTTCAAGTATGTGTGTAAGAGAAATAAAGATTAAGAGACCTGTTGATAGTACTAAATTTATTTCAAGGCAAACAATAGCCTTATTGTCAGTATCAATGTCCACATGGCTAAAGAGGCACTGATAATTCATTCATTGATTTTCTT  AAGGAAAAATAGAGTTGTGTGCATGCAGTATTTATA]
[+] EMBL CD134806             [                                                       CAATACTACTAATAATAATACTAATAGTCATAGCAACAAAGGTAGTAATAATAATTGTAATGATAATTATAGAAATTGGGATTAACAACCCGGAGAACAAAAACATAAAATGGATTTAAAATGGACAGACATACATCACTTACTTGACAAATCAAAAATTGAGAAAAAAAATAGGCATAATTGGGTATGAAGTATACACTAGTTACTAAATAACCAGTAACTAAATCTAGATGTATTTGTCTATAGTAAAATCAAAAAGTAGACAAGTTAAATAAAACAGCAATTAAAACAGTTAATGTTAATAAATGAACTCTACCTACAGATGTAGATGAGCCGTATTTTTCAAGTATGTGTGTAAGAGAAATAAAGATTAAGAGACCTGTTGATAGTACTAAATTTATTTCAAGGCAAACAATAGCCTTATTGTCAGTATCAATGTCCACATGGCTAAAGAAGCACTGATAATTCATTCATTGATTTTCTTACAAAGAAAAATAG                        ]


>consensus_1277#0 AACAAGTATTTATTTATATAATTGTTTACATGTTAATAGGCACATTGATGATTAGCAATA CTACTAATAATAATACTAATAGTCATAGCAACAAAGGTAGTAATAATAATTGTAATGATA ATTATAGAAATTGGGATTAACAACCCGGAGAACAAAAACATAAAATGGATTTAAAATGGA CAGACATACATCACATACTTGACAAATCAAAAATTGAGAAAAAAAATAGGCATAATTGGG TATGAAGTATACACTAGTTACTAAATAACCAGTAACTAAATCTAGATGTATTTGTCTATA GTAAAATCAAAAAGTAGACAAGTTAAATAAAACAGCAATTAAAACAGTTAATGTTAATAA ATGAACTCTACCTACAGATGTAGATGAGCCGTATTTTTCAAGTATGTGTGTAAGAGAAAT AAAGATTAAGAGACCTGTTGATAGTACTAAATTTATTTCAAGGCAAACAATAGCCTTATT GTCAGTATCAATGTCCACATGGCTAAAGAGGCACTGATAATTCATTCATTGATTTTCTTA AGGAAAAATAGAGTTGTGTGCATGCAGTATTTATA



clustalw multiple alignements is not computed in this case


Copyright Thu Nov 6 12:32:27 CET 2003 Hubert Wassner    (hubert.wassner@noos.fr)