cluster # 1306

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Schistosoma mansoni
cluster # 1306 cluster # 1306 Sequences # 2 consensus # 1

see consensus multiple alignment with clustalw

Direct access to contigs :

consensus_1306#0 length = 722 sequences # 2

consensusID : consensus_1306#0
NCBI blastX ! send the sequence to the NCBI site !
NCBI blastN ! send the sequence to the NCBI site !
Sequences nbr = 2
consensus length = 722
fasta sequence

                              [ATGAGAAAGATAATATTAAACCTGGAAACAAATTAGTTGATATAATAAAAAAGGTAGATACTTACCGAATAATAAACATGTTATTATTGTTTCTTTATAATAAAAAAACGTTTAATTATTATTCCATTTGAAACATTCACCGAACATGAATATATCCTTTTTTAAGGGAGACTTTTATAATCCGGTATTCAGTTGAAGTAATTGAGAAAGTACTAAAGGATTAAGTAAATATCGGGGCGCATAAACTTTTTTGTACTGCTATTTTTTTTTTAATTAAGCAATGTTGTACAGATGATCAGTGAATACATAGAAACAAAAATCATATTTCCGATTGTTTAATGGACTAATAATAATAATAATATGGTGTGTATGTGAAATTTGTTTGATGGAGCGATATATATATCGTTAAAATCACAGGGGGCCTAGTAACAAATTACTATATATGTAAATTTAATATATACAATCTATTGGTTAATTAAAACAAAAATTTATGCATACATTATCTGAGATTATTGAATTGTGAAGAGTTATACAAAGGGAAATAGGAGAGATGGAAAACANAATACTTTTCTTTGAATGTAGTATAAATGTTATATTGTTGTATTTTTGAATAACGAGATGGGAACAAATTAGCTCATACTGTGTCACCCCTATGTTTATAATGTAACTAGAGTTACAATTATAGAAAATGTAGCCATTAAGATAAACAGACTTGAATAGTT]

[+] EMBL CD201520             [ATGAGAAAGATAATATTAAACCTGGAAACAAATTAGTTGATATAATAAAAAAGGTAGATACTTACCGAATAATAAACATGTTATTATTGTTTCTTTATAATAAAAAAACGTTTAATTATTATTCCATTTGAAACATTCACCGAACATGAATATATCCTTTTTTAAGGGAGACTTTTATAATCCGGTATTCAGTTGAAGTAATTGAGAAAGTACTAAAGGATTAAGTAAATATCGGGGCGCATAAACTTTTTTGTACTGCTATTTTTTTTTTAATTAAGCAATGTTGTACAGATGATCAGTGAATACATAGAAACAAAAATCATATTTCCGATTGTTTAATGGACTAATAATAATAATAATATGGTGTGTATGTGAAATTTGTTTGATGGAGCGATATATATATCGTTAAAATCACAGGGGGCCTAGTAACAAATTACTATATATGTAAATTTAATATATACAATCTATTGGTTAATTAAAACAAAAATTTATGCATACATTATCTGAGATTATTGAATTGTGAAGAGTTATACAAAGGGAAATAGGAGAGATGGAAAACANAATACTTTTCTTTGAATGTAGTATAAATGTTATATTGTTGTATTTTTGAATAA                                                                                                            ]
[-] EMBL CD161419             [                                                                                                                                                                                                                                                         TTTGTACTGCTATTTTTTTTTTAATTAAGCAATGTTGTACAGATGATCAGTGAATACATAGAAACAAAAATCATATTTCCGATTGTTTAATGGACTAATAATAATAATAATATGGTGTGTATGTGAAATTTGTTTGATGGAGCGATATATATATCGTTAAAATCACAGGGGGCCTAGTAACAAATTACTATATATGTAAATTTAATATATACAATCTATTGGTTAATTAAAACAAAGATTTATGCATACATTATCTGAGATTATTGAATTGTGAAGAGTTATACAAAGGGAAATAGGAGAGATGGAAAACAAAATACTTTTCTTTGAATGTAGTATAAATGTTATATTGTTGTATTTTTGAATAACGAGATGGGAACAAATTAGCTCATACTGTGTCACCCCTATGTTTATAATGTAACTAGAGTTACAATTATAGAAAATGTAGCCATTAAGATAAACAGACTTGAATAGTT]




>consensus_1306#0
ATGAGAAAGATAATATTAAACCTGGAAACAAATTAGTTGATATAATAAAAAAGGTAGATA
CTTACCGAATAATAAACATGTTATTATTGTTTCTTTATAATAAAAAAACGTTTAATTATT
ATTCCATTTGAAACATTCACCGAACATGAATATATCCTTTTTTAAGGGAGACTTTTATAA
TCCGGTATTCAGTTGAAGTAATTGAGAAAGTACTAAAGGATTAAGTAAATATCGGGGCGC
ATAAACTTTTTTGTACTGCTATTTTTTTTTTAATTAAGCAATGTTGTACAGATGATCAGT
GAATACATAGAAACAAAAATCATATTTCCGATTGTTTAATGGACTAATAATAATAATAAT
ATGGTGTGTATGTGAAATTTGTTTGATGGAGCGATATATATATCGTTAAAATCACAGGGG
GCCTAGTAACAAATTACTATATATGTAAATTTAATATATACAATCTATTGGTTAATTAAA
ACAAAAATTTATGCATACATTATCTGAGATTATTGAATTGTGAAGAGTTATACAAAGGGA
AATAGGAGAGATGGAAAACANAATACTTTTCTTTGAATGTAGTATAAATGTTATATTGTT
GTATTTTTGAATAACGAGATGGGAACAAATTAGCTCATACTGTGTCACCCCTATGTTTAT
AATGTAACTAGAGTTACAATTATAGAAAATGTAGCCATTAAGATAAACAGACTTGAATAG
TT

clustalw multiple alignements is not computed in this case